The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
47
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A new relaxed state in horse methemoglobin characterized by crystallographic studies.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chains
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| total genus |
47
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1QSI B; 1YE2 A; 2O5T X; 5F2A A; 4F6D A; 1RTE A; 2MGC A; 2R4X A; 3FS4 B; 1BZ6 A; 1FHJ A; 1CIO A; 3P5Q B; 1BIJ B; 1VXB A; 2ZT0 A; 1ITH A; 2HBE B; 1JL6 A; 1V9Q A; 2ZWJ A; 3LB3 A; 2DN1 B; 2LH3 A; 3G4V A; 1LFZ B; 2ZSY A; 1NS9 B; 3BJ2 A; 2HCO B; 1VXG A; 3DUT A; 1IOP A; 1HBB A; 2G0X A; 1UX8 A; 1JEB B; 3UHU A; 1YHU A; 3A0G B; 2D60 B; 3KMF A; 2MGM A; 4IRO A; 6HBW B; 1O1O A; 2HHE A; 2QFK A; 1MYH A; 1NS6 A; 5JDO F; 2BLH A; 1HAC A; 2KSC A; 1J41 A; 1T1N A; 1WMU B; 3ZHW A; 1A0Z A; 3MJU B; 1CLS B; 1M9P A; 3WCW A; 1J7W A; 2OH9 A; 3UHB A; 1J3Z A; 2ZT4 A; 3BOM B; 3PIA B; 3WCT B; 2SPN A; 1RPS B; 4MQI B; 3D1K A; 2D2N B; 2MYE A; 1G0A B; 4FWZ A; 2M6Z B; 1QSH A; 1GLI A; 4BJA A; 1V4W B; 4MQK A; 2QU0 A; 1MLF A; 5CNE A; 4ILZ A; 1Y4R A; 1BAB B; 3BCQ B; 5F0B A; 2H8F B; 3WCT C; 1A4F B; 3GOU A; 4JYQ A; 2H8D A; 1FSL A; 4PNJ A; 4YU3 A; 1N9X A; 1R1X A; 2D2N C; 1NZ5 A; 1Y31 A; 4H2L B; 1MOB A; 2BMM A; 1CH9 A; 3ZJR A; 1XZU B; 1YVT B; 4MQJ A; 2LH2 A; 3ECX A; 1GDL A; 1MYZ A; 1Y4B A; 3HEO A; 3UGZ A; 1Y4G B; 2HHD B; 2O5B X; 3P5Q A; 1NQP A; 1YMB A; 1Y7C A; 3MKB B; 1BVD A; 2HBE A; 1GDJ A; 1JW8 A; 1CBL A; 2HCO A; 1RVW A; 2O58 X; 2PEG A; 1DXU A; 1JWN A; 1AJ9 B; 1HJT A; 5E29 B; 1BZ0 A; 4WJG A; 1ASH A; 2H35 B; 3LR7 A; 4C0N A; 1GJN A; 1HDA B; 1Y8I B; 5CNG A; 1Y8H B; 3GQP A; 5KKK A; 1NEJ B; 5HAV A; 1CLS A; 1HGC A; 1SPE A; 2HBF B; 1AZI A; 3QQR A; 1XY0 B; 5CNB A; 2ZLW B; 3WCT A; 4MQI A; 4PQ6 A; 2D2N A; 3AQ7 A; 1DXC A; 1RQ4 A; 2QSP A; 3QJE B; 1IDR A; 1XZ4 B; 5E6E A; 1C7B A; 1MBO A; 3LB1 A; 2EVP A; 5D1V A; 2D2M C; 1Q1F A; 1XZU A; 1JY7 B; 3UHS A; 3QM9 A; 1OJ6 A; 1HDB B; 3IC0 A; 2GKN A; 3ZH0 A; 2VRY A; 1THB A; 1YEU A; 1J40 B; 5CN9 A; 4KJT A; 2HBG A; 2BLI A; 1NWN A; 3B75 A; 1XXT B; 1JDO A; 3NFE A; 2ZS1 D; 3G53 A; 1CBM A; 5JGG B; 1A6M A; 1NPG A; 3GYS B; 5HU6 B; 5CN5 A; 2FRJ X; 2Z6N B; 4ODC B; 1UFJ A; 2H35 A; 2PGH A; 1U7R A; 3R5I B; 1VRF A; 1YMC A; 1G9V B; 1Y5J B; 1KD2 B; 1J7S A; 4OOD A; 3NL7 B; 1A3O B; 1HLM A; 1RQA B; 3AQ8 A; 2SPL A; 3D1A B; 1ABW B; 1HLB A; 2QMB A; 4FH6 A; 1O1J A; 4JAC A; 1HDS B; 4DC7 A; 2D2M A; 1V5H A; 1LH6 A; 3OO5 A; 1PBX B; 5C6Y A; 5JDO E; 4HSX A; 5AZQ A; 2R80 B; 3PI3 A; 2HHB A; 101M A; 1BZZ A; 3ZJH A; 1Y46 B; 1YIE B; 2QFN A; 1YMA A; 3LB4 A; 3NMM B; 1H1X A; 1A3N B; 1Y4P B; 1HSY A; 3D4X B; 3M38 A; 1HBI A; 2QSS A; 1YEQ A; 3E5O A; 1FDH A; 3R0G A; 1MLG A; 1O1P B; 1MOC A; 1TES A; 3QJB B; 4OF9 A; 1HBA A; 1DO7 A; 1HGA B; 2ZLU B; 3HF4 B; 1C7C B; 2DN3 B; 3UHG A; 3UHC A; 3GK9 A; 3PT7 B; 1HHO B; 1K1K A; 1LH2 A; 1MKO A; 1MLK A; 1YH9 B; 3W4U B; 1TU9 A; 4G1B A; 1Y5K A; 2CMM A; 3FH9 A; 1CG5 A; 1MOA A; 1IWH A; 3G4R A; 3ZJQ A; 1BBB A; 2D5Z A; 1JF3 A; 2DXM B; 3UBC A; 1G09 A; 3UHR A; 2BW9 M; 3OZU A; 3ZJM A; 1NWI A; 1VWT A; 4F6G A; 2ZSZ A; 1LFL B; 3EDB A; 1V4X B; 1Y7G A; 1FLP A; 1NZ2 A; 2O5M X; 1LA6 A; 103M A; 4O35 A; 4NI1 B; 1CG8 A; 3D1A A; 3PI9 A; 1O1M B; 3CY5 B; 4DWT A; 4G51 B; 1A6N A; 3UGY A; 2W72 A; 3S65 A; 107M A; 3UHY A; 1I3E A; 1JZM A; 1HAB B; 4MBA A; 3WCU C; 3EU1 B; 4AVE A; 2GTL C; 3PI2 A; 2GL3 A; 2MGD A; 3NMM A; 4ESA A; 4XDI A; 4WCH D; 3GKT A; 1Y5F B; 1VXD A; 1B86 B; 3PT8 B; 4MQC A; 1MNO A; 104M A; 2HBC A; 5M3S A; 1CP5 A; 2ZLV A; 3BJ3 A; 4HHB A; 3M3B A; 1HGB B; 3PEL B; 1SI4 B; 2MBW A; 1Y4F B; 2GNV A; 4X0L B; 1A00 B; 3PT7 A; 1HHO A; 2AV0 A; 111M A; 3QJD B; 3UH6 A; 1A6K A; 3OZW A; 5AB8 A; 3UHV A; 4O4Z A; 3EOK A; 4YU4 A; 1N9I A; 3A59 B; 2AUQ A; 2ZT1 A; 3G4Q A; 1LFY B; 1HRM A; 3GKV B; 3WCV C; 1SHR A; 3G4U A; 1YHE B; 5HLU A; 3PI8 A; 2HZ1 A; 4MQH A; 3ONZ A; 3VRF A; 3SZK B; 1MWD A; 1JP6 A; 4SDH A; 3ZJS A; 3WCU A; 1DO3 A; 1LH1 A; 1MBN A; 2GTL A; 1MOH A; 1J3Y B; 1S5Y B; 3GQR A; 1BUW A; 102M A; 3UH5 A; 2ZSS A; 1SDL B; 1DXT A; 4G51 A; 2G0Z A; 1NXF A; 2VYY A; 3DHT A; 3WFW A; 1FDH G; 1XZ7 B; 1MBS A; 3OO4 A; 1YEO B; 2HBS B; 2ZFO D; 3HC9 A; 4U8U B; 3VHB A; 1OUU A; 3S1I A; 3G4Y A; 4ROL B; 1YE0 A; 2AA1 A; 2O5S X; 1FSX B; 1X9F D; 1MYF A; 1JF4 A; 1AJH A; 1S6A A; 2MYD A; 1PMB A; 5E83 A; 3PT8 A; 1MWB A; 2VYZ A; 2W6X A; 4NI0 A; 1LFV B; 3ECL A; 2EB8 A; 3VRG B; 1G0B B; 1A01 B; 1K0Y A; 2FRK X; 4X0L A; 1MLQ A; 1ECN A; 1Y8K B; 1A00 A; 3H57 A; 1S0H B; 3HXN B; 1HV4 B; 4XS0 B; 2Z8A A; 3WCV A; 1Y45 B; 3QJD A; 3UH3 A; 3DHR B; 3GQG B; 2ZFB B; 5EV5 A; 5EUI A; 1XQ5 B; 3QJC B; 1JP8 A; 5ILM A; 4PQC A; 4FH7 A; 1C7D A; 1MLL A; 3ASE A; 4WJG 1; 4F6I A; 2MHB A; 2D5X A; 5C6E B; 4ROM A; 112M A; 3G46 A; 4U8U D; 1Y7D B; 1YHE A; 3WR1 B; 1YEV B; 1Y7Z A; 2R1H A; 1EMY A; 5KDQ B; 1S5X B; 1Y0D B; 1DKE B; 1VXF A; 2GRH A; 4L7Y A; 1IRD B; 4N7P B; 1S5Y A; 1NPF A; 2YRS A; 2G0V A; 1CH1 A; 3ED9 A; 1CMY B; 2WY4 A; 1Y0C B; 3U3E A; 1YZI A; 1HBG A; 3IXF A; 1CO9 A; 1G08 A; 3ZJP A; 1IRC A; 4O4T A; 1GBV A; 3UHK A; 1MBD A; 3TM3 A; 1GCV B; 5SW7 A; 1IT2 A; 3VRE B; 3K8B A; 2MYB A; 2VEB A; 3A5G A; 4M4B B; 3NML A; 3ZOM A; 1QXE B; 1COH A; 1LHS A; 1OFK A; 1Y4V A; 3UHN A; 3S66 B; 2VLY A; 4HRR A; 4N7O A; 1YEN B; 1V75 A; 2XYK A; 1F5P A; 1Y35 A; 5CHR A; 1ECD A; 2ZS0 D; 3QMA A; 1QSI A; 3ODQ B; 1O1K B; 5HY8 B; 2FAL A; 3FS4 A; 3SDN A; 3DHR A; 1QPW B; 4TWU A; 2MGK A; 1DWR A; 1I3D A; 1YCB A; 1BIJ A; 1R1Y B; 3RJ6 A; 2MGG A; 1Y01 B; 2Z85 A; 1FAW B; 2QLS B; 2LH6 A; 1WVP A; 2DN1 A; 1Y83 B; 2R4Y A; 1LFZ A; 4G1V A; 4N7N B; 3UHD A; 5C6E A; 1NS9 A; 3EDA A; 106M A; 1LFT B; 2NRM A; 3D17 B; 1V4U B; 2B7H B; 1HBR B; 5MBN A; 1JEB A; 4F4O B; 5KER B; 3A0G A; 1YVQ B; 2IN4 A; 4F6J A; 2D60 A; 6HBW A; 4M4A B; 5JOM A; 1YOG A; 1M6M A; 1YOH A; 1WMU A; 1XCH A; 3MJU A; 3QM7 A; 1XZV B; 2ZLT B; 3A5B A; 3UHZ A; 2ZS1 B; 3NG6 B; 2WTH A; 2ZSX A; 1A0U B; 3BOM A; 3PIA A; 1RPS A; 3WI8 A; 2W6W A; 2M6Z A; 1G0A A; 1JZL A; 1MLO A; 1MZ0 A; 3AT6 B; 5ILP A; 1V4W A; 1GZX B; 1CH5 A; 2ZS1 C; 1BAB A; 3BJ1 B; 3BCQ A; 2H8F A; 1A4F A; 1CIK A; 1DTI A; 2RI4 B; 1CQX A; 4H2L A; 3TLD A; 3QM8 A; 1Y22 B; 1RQ3 B; 1Y2Z B; 1UIW B; 1YVT A; 2W31 A; 1IBE B; 1AJG A; 1DUO A; 4KN3 A; 2DHB B; 3ORD A; 1QI8 B; 1Y4G A; 2HHD A; 2GLN A; 1B0B A; 4FWY A; 2GRF A; 3MKB A; 2MGH A; 2EKT A; 1DWT A; 109M A; 1MLS A; 1YDZ B; 1VRE A; 1OUT B; 5CN8 A; 2B7H A; 2G0R A; 4MPM A; 3MJP B; 1YIH B; 1AJ9 A; 1VXH A; 4DC8 A; 5ILR A; 5E29 A; 1LJW B; 3WFX A; 3MVC A; 1FCS A; 1HDA A; 1Y8I A; 2G14 A; 3ARL A; 3WTG B; 1Y4Q B; 1Y8H A; 1YGD B; 3MYN A; 1NEJ A; 5CNF A; 2MYA A; 2HBF A; 1SPG B; 3RGK A; 2DN2 B; 1LFQ B; 2ZS1 A; 3D7O B; 1XY0 A; 2ZLW A; 1GCW B; 1Z8U B; 7HBI A; 5EE4 D; 1S56 A; 3G4W A; 4LPI A; 5EYS A; 4NK1 A; 3QZZ A; 1GBU B; 1MLJ A; 1GZX A; 1MBC A; 3QJE A; 1HCO B; 3WHM B; 1YG5 B; 1XZ4 A; 1IT3 A; 1OFJ A; 1UT0 A; 1YHR B; 1MCY A; 5CN6 A; 3UHE A; 1Y2Z A; 1UIW A; 1ABS A; 1JY7 A; 1MLM A; 1XYE B; 1HDB A; 3WFU A; 3ZOL A; 1Y09 B; 1J40 A; 1DXV B; 2V1J A; 4N8T B; 3TM9 A; 2C0K A; 1XXT A; 2ZLX B; 4HRT B; 2GKM A; 2DC3 A; 1BZR A; 1D8U A; 5JGG A; 2OIF A; 1YFF B; 3UHT A; 4NK2 A; 4UUR A; 3GYS A; 5HU6 A; 3E55 A; 3AG0 A; 2Z6N A; 2V1H A; 4ODC A; 1LJW A; 3WCP B; 2HBD B; 3R5I A; 1GDK A; 1G9V A; 2V1F A; 1Y5J A; 1Y4Q A; 1MLU A; 4NXA A; 1KD2 A; 1O1L B; 3NL7 A; 1A3O A; 2RAO B; 1RQA A; 1QXD B; 1Y8W B; 1UC3 A; 1ABW A; 5ILE A; 1MYI A; 1HDS A; 1Y0W B; 1FN3 B; 1PBX A; 5CMV A; 2ZST A; 3HRW B; 1GBU A; 2R80 A; 3ZJJ A; 4FC3 B; 3DR9 A; 3IC2 B; 5JDO D; 3GDJ B; 4KMV A; 1VHB A; 1Y46 A; 2O5L X; 1YIE A; 4PQB A; 1A3N A; 1Y4P A; 5D5R A; 3D4X A; 4MXK A; 2IG3 A; 1NIH B; 1ECO A; 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1SDK A; 1C40 A; 1MDN A; 1Y4R B; 1Y0A A; 1O1N B; 3GOU B; 2H8D B; 4YU3 B; 3M39 A; 3A9M A; 1R1X B; 1SWM A; 2LH7 A; 1Y31 B; 3K9Z A; 2AV3 A; 1YHU D; 3A59 A; 1O1I B; 1LFY A; 4MQJ B; 3GKV A; 1Y4B B; 2OHA A; 1W92 A; 1MNJ A; 1NQP B; 1Y7C B; 2ZS0 B; 1DM1 A; 3SZK A; 2XKH A; 3WCW D; 1RVW B; 2GRZ A; 1J3Y A; 5EOH A; 2W6V A; 1LHT A; 1SDL A; 1DXU B; 2PEG B; 2ZS0 C; 3AT5 B; 1JL7 A; 3HYU B; 1XZ7 A; 1DTM A; 1YEO A; 2HBS A; 3ARJ A; 4U8U A; 1BZ0 B; 3HHB A; 3OJ1 A; 3ZJI A; 4MU5 A; 4ROL A; 1FSX A; 3E5I A; 3GQP B; 2EVK A; 1HGC B; 2SPO A; 4F6B A; 4MQG A; 3MN0 A; 5CHQ A; 2FRI X; 4DWU A; 2V1I A; 4NXC A; 3UI0 A; 5EYJ A; 1LFV A; 4ZVB A; 3VRG A; 1G0B A; 5HLX A; 1A01 A; 2G10 A; 3UHQ A; 3OVU C; 2LH1 A; 1RQ4 B; 2QSP B; 1Y8K A; 1S0H A; 3HXN A; 1HV4 A; 4XS0 A; 1Y45 A; 3GQG A; 2ZFB A; 1O1N A; 1XQ5 A; 3QJC A; 3AQ6 A; 5E6E B; 4UIQ A; 1C7B B; 2Z6T A; 1BVC A; 2G11 A; 2MGJ A; 1JPB A; 3QM5 A; 1GVH A; 4L2M A; 108M A; 2HZ3 A; 1O1I A; 3OGB A; 4F6F A; 2AUR A; 1Y7D A; 3IC0 B; 3WR1 A; 1YEV A; 1THB B; 1YEU B; 5KDQ A; 2ZS0 A; 1S5X A; 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