1YTVA

Maltose-binding protein fusion to a c-terminal fragment of the v1a vasopressin receptor
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A C-terminal segment of the V1R vasopressin receptor is unstructured in the crystal structure of its chimera with the maltose-binding protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein, hormone receptor
total genus 117
structure length 366
sequence length 366
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ytvA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ytvA01
5TP9B 4GVOA 4NF8A 3S9LC 4ZEKA 3PUYE 1H44A 1BP5A 1IXCA 5TPAB 1PBQA 4POXA 2HAUA 5KZTA 1RYOA 2B3BA 1QULA 5J1DA 1QUIA 4YB7A 3EHUA 1HSEA 1WDNA 1A99A 2E0SA 3USDA 1MQDA 3OSRA 3VLVA 2Z23A 3FZVA 3O97A 4ZE9A 2A5TA 4ZDMA 1Y20A 4Q30B 3RT6B 1HSLA 4GLIA 2XXIA 5L9MA 4LZ8A 1QUKA 2HAVA 4HW8A 3VE1B 2PBWA 3SESA 1POTA 3CSBA 3MP1A 1Y1ZA 3IJOB 1YAEA 3FD3A 4R2BA 1O63A 1H3DA 1LAHE 1P1UA 4JWYA 4H5GA 2D5WA 3MWBA 1BTJA 1Y3PA 4GOTA 1KWHA 4DLDA 4DXCA 4EF1A 3TELA 1N84A 1H76A 3AXFA 4DZ1A 2RC7A 3MBPA 3A09A 4LP2B 2QS4A 3U72A 5EHSA 2DYXA 1XHYA 5ITOA 3UP9A 1N76A 2V3QA 3VLWA 2Q2AA 1GVCA 2F97A 4ECFA 1FQAA 4KCDA 3FATA 5DYHA 2F7BA 3K1MA 2X7PA 4YKPA 5H8NA 5L9OA 4BDQA 3SERA 5FHMA 3B6TA 3K0VA 4H1XA 2XD2A 4KQPA 1ZMGA 3LSWA 2ZYNA 4TQUQ 2QL3A 2Y7RA 1DTZA 1DOTA 3TCFA 4JWXA 3WAEA 1B4ZA 4I8CA 4JSDA 1Z7NE 2R9JA 1D3KA 3H6VA 3P7IA 3VVEA 1NL5A 2PT2A 2F7CA 1US4A 1VR5A 3LSLA 5ELVA 2Q88A 4IO3A 4ELOA 3JZJA 2I58A 4GXAA 1FTLA 4YKJA 2I6EA 1MM7A 2R6GE 3O6IA 1MPDA 3B6WA 3IL1B 1JEUA 5L8DA 3I3VA 2F34A 3KG2A 4KPTA 4C1UA 4NEDA 4KFQA 1J1NA 1R9QA 4OTEA 4PETA 4NF6A 3N94A 3MPKA 1A8FA 4QF9A 4GWOA 2QPQA 3MAMA 3ILTB 3GBBA 3KJ7A 2ESNA 2YJPA 1JNFA 5TP9A 1OQHA 4UACA 3DP8A 3G7WA 2O7UA 2XX8A 1FTMA 2X26A 4R74A 3K02A 2XXXA 4XIGQ 4BLAA 1LAGE 2NVUB 1PDAA 3CVGA 4XTCQ 2RF1A 1MQGA 2IEEA 4NWDA 3E3KA 1Q35A 2B3FA 4YKIA 3T9VA 3MVZA 3E13X 3S9EA 1VE4A 5H8HB 1LB9A 3FV1A 2QS3A 4Q0CA 2HZLA 1IXHA 3KOTA 1EZPA 4GL0A 2THIA 2DE2A 5JK4A 1I69A 4YAHX 1DPPA 1O64A 3FVOA 1AIVA 5K2XA 2QMXA 3QUFA 1OLAA 3M3LA 1Y9UA 4OQOA 1MG1A 3TEPA 4QFOA 4OERA 2ZYMA 1FQCA 2DSFA 4U23A 1N04A 1P1WA 3KN7A 4U1OA 1SBPA 2ZYOA 2DWAA 1GR2A 1IZ1A 1NNKA 2GFEA 3QSLA 4ZE8A 3KEIA 4GQOA 4O3CA 2Y7WA 1N3XA 4O3BA 2PYYA 2I4CA 1MY4A 2PMSA 5ITPA 2QSXA 3CFXA 4N6PA 4JSOA 1AMFA 2H4IA 1IITA 2HZKA 1A40A 3CI8A 3QYTA 2XXTA 1CE2A 4GIZA 3CIJA 3PMXA 4KYDA 2XHDA 3PPPA 4K3FA 5A5XB 1FQDA 3SEXA 4E0WA 2H5YA 5HM4B 2A5TB 3V83A 4YB6A 3V89B 1P1NA 3CSGA 1FTOA 4EXLA 4LUBA 2DE3A 3O29A 4ESWA 1QVSA 1MPBA 5CI5A 4ZEBA 3G3IA 1MY2A 1UTHB 1OMPA 2HXWA 1NKXA 3O28A 4H0WA 4JWOA 2O51A 3H6UA 4AB5A 2HFBA 3N6TA 1RYXA 1B46A 5K2YA 1LFHA 2AIXA 3IOVA 4DDDA 3PPQA 3PD9A 4ZECA 4QFNA 1OVBA 1B3FA 1ZBMA 4KD5A 2VHAA 1L5TA 4WXJA 5I59A 4YB5A 3SETA 2Q9TA 3H6WA 2I49A 4PFTA 1B5HA 1Z7ME 1PBPA 2H99A 3IOTA 3FGSA 1Y3QA 1Y1MA 3C35A 4R2FA 1AH5A 4H67A 1PC3A 1SYHA 4PQJA 4THIA 3I5OA 1H43A 3K1NA 4LA9A 2I0CA 4ELRA 5LOMA 3OSQA 3RNNA 3RLFE 3IB1A 2ALUA 4OENA 4R9FA 2G93A 3CFZA 5DEXB 4JXIA 1NMUA 1B5IA 4I9DA 3ZS6A 3LC8A 5H8QB 3V5AA 5H8HA 4FEDA 4WKMA 1ZJLA 3RQTA 1IQ7A 3FVNA 3PMVA 3KN8A 4TLMB 2ZNSA 4RA1A 4QFLA 4H5FA 3BFTA 2QS2A 2V84A 5I84A 1P99A 3CG1A 4U1ZA 1XC1A 2OK2A 2XXVA 1P1OA 4NF6B 1N7WA 3QUJA 3EF7A 3MVWA 1OVTA 3MJNA 2E1SA 4JB7A 5HPQA 5FTIA 4OYVA 3K6WA 5CMMA 3VXBA 2RC9A 1XOCA 3O6HA 2GH9A 2I0BA 1GV8A 2AYSA 1MXZA 2D21A 4R6HA 3FASA 4RPOA 1IIWA 4PFWA 1D9VA 1SW4A 3KZGA 1JW1A 3SEWA 3DLNA 1M5CA 2CMOA 4N07A 1SW1A 3TDJA 4KCCA 4G8NA 3TFLA 3Q28A 5A5XA 1DTGA 2XXWA 4EQ9A 4NWCA 5CC2A 4EF2A 4BDLA 1LAFE 2H25A 3TAJA 5TU0A 1UTBA 4RPNA 3IJXB 1B0HA 4FECA 1POY1 4C0RA 1UTHA 3N5LA 1GGGA 4JDFA 4IO4A 4HS7A 2DVCA 4F39A 1II5A 2RKMA 2VD3A 5I2KB 4UA8A 5B70A 1SDXA 1TFDA 3BFUA 5F7VA 3D4GA 4IO2A 2IA4A 3OEMA 3QAXA 1EU8A 1B5JA 2AL4A 1JW5A 4KI0E 5CMCA 3TKDA 2GRVA 2W7YA 2WKYA 3GLBA 4OMBA 3C36A 3F11A 5AA2B 2ZNUA 1SD3A 4GF8A 2NXOA 4ZEFA 4LVQA 2DWHA 3G3JA 4OFJA 4P0GA 3L6HA 4YZZA 1NNPA 4ONYA 3KN3A 3OO7A 3IR1A 1QUJA 5AA2D 4FAJA 3LSXA 3H7MA 1D4NA 2P1SA 4F2OA 3MP6A 3CRBA 5DEXA 3K1PA 1NNFA 4EQBA 4POWA 5H8FA 2UVIA 3MVXA 5DVFA 3OXNA 4F22A 4X1BA 2I4BA 5CMBA 3IB0A 3PUWE 5H8QA 3H03A 3DM0A 1FTJA 2M8CA 3HO7A 1EH3A 1SQYA 2XX7A 4I62A 3W9VA 2RCAA 3Q25A 4IY6A 2R71A 4F1YA 3UA8A 4FORA 2F78A 4PFYA 4H8IA 1TWYA 5I59B 2PVUA 4P11A 3HHFA 3IB2A 1MDP1 3S4UA 5AA1A 2F35A 2I48A 3MP8A 4O3AA 2F8DA 5JTYB 2RC8A 4HTGA 4DIGA 4YU0A 4OHNA 2OWTA 4ND9A 1TT1A 3OO9A 2OJTA 4Q8RA 1Y3NA 3MPLA 1I6AA 3EPEA 5AA3A 4MBPA 4IO6A 2F36A 3Q27A 5I2NA 2DOJA 1SW5A 2REJA 4GRKA 2DS9A 4F31B 3TTMA 3TMGA 1MY0A 1P1QA 4F3BA 5AA4A 4GD5A 3BBRA 5FTHA 3C4MA 4F3PA 2ONKE 1JVYA 2ZMBA 3TTLA 4G4PA 2O1LA 3C32A 4QHQA 2RINA 4NMYA 2XX9A 1ATGA 5H8SA 3WAFA 1VFDA 2ZNTA 3G3FA 4DXBA 3EHSA 3FXUA 4LONB 4F18A 4X48A 3H06B 1M5BA 4R72A 2DXRA 4ELQA 1GTKA 4PE5B 4F3SA 1B40A 2YPNA 4IO5A 1S50A 5I2KA 3I6VA 1JVXA 1VFEA 5DTBA 5ISUA 4MFIA 1IEJA 2OWSA 1WVJA 1YCJA 4EDPA 3PD8A 1JQFA 2Y7IA 4MF3A 5CMKA 4QSDA 2I3VA 2QS1A 4ZS9A 1B4HA 4QSEA 4EQ7A 3PUXE 5AA2A 4M1VA 3HV1A 2V3UA 4U2RA 4DXUA 3Q29A 1A8EA 3MZ1A 3ZKKA 2H9BA 4RJZA 2VD2A 4NF5A 5ICQA 5IKBA 5I57A 2Z8FA 2OCUA 4QSCA 1UTBB 4U4SA 1N0TA 3R6UA 2QMWA 3OEKA 2NWJA 4R6YA 3VLUA 3KGCA 2UVJA 4YMAA 1MRPA 1JETA 1LBCA 3QXMA 2BJJX 1MY3A 3OO8A 3IOUA 4OXVA 2F6PA 3S2VA 2CZLA 3U1OA 2DQVA 1XVXA 3K6VA 1CB6A 2B65A 1Y4TA 1DSNA 1B58A 2XXPA 5EHMA 2NUVA 3K6XA 2PT1A 2F7AA 2VOZA 2X7QA 4Q5TA 1B9JA 3HCQA 4U21A 3CR9A 1TFAA 4BDNA 4FJPA 3T93B 3GBAA 2DVZA 2DP8A 4KHZE 3TZAA 4DCXA 4KYEA 5ICTA 4MLQA 3G3HA 1AL3A 1PB8A 3MUQA 2HEUA 5JTYA 1MXUA 1UQWA 1MXYA 4EXKA 3FUZA 2FNCA 1IXIA 1BIYA 1FTKA 1LBBA 2OLBA 1QW0A 4YKKA 3RT8A 3KOSA 4ELPA 1MH3A 1I6BA 3OELA 4NE4A 5H8FB 3N26A 4F1UA 4RYAA 3T96B 5KDTB 4P0IA 2F5XA 4F29A 3K2DA 1LFGA 4NF4B 2F6GA 1EZOA 3FJGA 4GXSB 1B7ZA 4Z7EA 3C9HA 3O66A 3HN0A 4IY5A 1B3HA 4H8JA 1MPCA 4DE8A 4OZ9A 5IAIA 4AQ4A 2UYEA 1HSJA 4KYSA 4XKQA 3UGWA 2Y7PA 3CG3A 4H65A 3W15C 1LFIA 4OWDA 4G8HA 5BUUA 5CBSA 1USYE 1B05A 2XXUA 2Y7KA 2UYFA 4ZZAA 3DP4A 4G68C 4RXLA 3ILUB 3DP6A 1B3LA 5I58A 1SI1A 1ELJA 1PB9A 4E0XA 2HQ0A 2Z8EA 1NFTA 3RTFB 5I2NB 3LR1A 1SI0A 2V25A 1B2HA 2AL5A 3U94A 2Q89A 5AA4B 1B1HA 4TOZA 4OEVA 2ABHA 2GHAA 4BDOA 4HCWA 3RGYA 5JEIA 4L17A 3U92A 5FHOA 4LQ5A 3VVFA 3ODBA 4XKPA 3TODA 4H6DA 1MXVA 3UK4A 4U4XA 3FJMA 1XVYA 3RPWA 2OBGA 2QJEA 3L6GA 4ISUA 2Q2CA 3U93A 3MC2A 1ZLQA 2ZXTA 1SYIA 1R6ZA 3K6UA 2VGQA 1OQGA 4M4GA 3Q26A 1IXGA 4Z0IA 3T22A 2XXHA 2Z8DA 3PMWA 4X9TA 5DVJA 3THIA 4JBZA 4WEDA 3K00A 4C1TA 1MM6A 2FYIA 1AOVA 5F1QA 3S9MC 3BKIB 3W9WA 3O9PA 4NTLA 4IO7A 1QJMA 4LZ7A 5BWJA 1MDQA 2UVHA 3ECRA 2LAOA 4NF5B 3SEVA 4OEUA 1FQBA 1LCTA 5I57B 1B7UA 4TLLB 1R9LA 3SEUA 4QFPA 3ZKLA 4RNSA 2XXQA 1I6QA 1MQHA 1NH8A 4MH5A 4KR5A 1URDA 3H4ZA 4FE8A 2ONRA 3ONMA 5KDTA 3DELB 1MQIA 1TXFA 1B6HA 2XXRA 3EN3A 4NF4A 3MW0A 3R26A 4OESA 1F9BA 3IX1A 4OVJA 3TTKA 3VV5A 3GXAA 4OETA 3FVGA 1R1NA 1M5EA 2REGA 1ZU0A 3O2AA 2O68A 1URGA 3TQLA 1JEVA 3MZ9A 3RY3A 3UN6A 3LSFB 2A5SA 3T9UA 5KCJB 1NH7A 3PPRA 4R6KA 4IGTA 1B32A 1MXXA 1QKAA 2ZYKA 3MVYA 4F1VA 1RKMA 1YTVA 1IUDA 1WODA 2O6AA 3JYRA 4X1DA 2P0SA 2XXYA 4IGRA 3SKPA 3M3KA 3VXCA 3M8UA 3PUZE 1A54A 1S7YA 4QFKA 1H45A 3GZGA 5CBRA 4R75A 1MY1A 4G68B 5TPAA 4EUOA 2QRYA 1USYH 3KJTA 3LBSA 2G29A 3FIRA 4HCYA 3CFLA 1N7XA 3TYHA 3ZSFA 1M5FA 4YICA 2UXAA 3K01A 5I56B 3RN8A 1MXWA 1B3EA 1FW0A 2DE4A 4RY1A 1SW2A 1MH4A 3JV9A 1EZ9A 1BLFA 3OMBA 2XD3A 2VP1A 4R73A 3R7XA 3UIFA 4PP0A 3KFMA 1MS7A 4GFRA 1B52A 3OO6A 3KSXA 1LSTA 3IK6B 5B7DA 2V93A 4ZEIA 4XXUA 4F3GA 3FJ7A 1BKAA 3T66A 3OD7A 1MQJA 1LAXA 2HCAA 3D4CA 3PV0E 4IB2A 1NNTA 1LLSA 2Y84A 5I58B 4BDMA 3UORA 1A7LA 4QRZA 4NF8B 3HPIA 3SEYA 3EHTA 5FHNA 2UVGA 3RTWB 1FQEA 3HSTA 1URSA 3SDFA 2O1MA 2NOOA 1PEBA 4YMBA 4OFLA 3T9HB 5L9SA 4LZ5A 1JW4A 2V3TA 1VSOA 4N13A 3C31A 4GL8A 2DWIA 3M3FA 1S9TA 3VFJA 3B7DA 1B51A 5CRYA 1N3WA 3PU5A 3IO6A 3KSJA 1B3GA 3PPOA 5HBCA 2DWJA 3IAZA 3E9XA 4LATA 4F19A 3PUVE 1XT8A 1D9YA 5EYFA 2O84X 3TQWA 4I1DA 3FV2A 3MZBA 2RCBA 4G8MA 2ANJA 3C34A 2Z22A 1UIUA 4RK2A 1A55A 3S9NC 3QIMA 3IOWA 1OLCA 4RK9A 4U22A 2ONSA 4FIMA 4XKRA 5DVIA 2KLFA 2D3IA 3IORA 3OENA 4MLVA 2PX1A 3H3GA 4LQ2A 1ZIUA 3IO4A 3KBRA 3N6UA 4ZZEA 1DPEA 1LGBC 5KCJA 3H6TA 4FEBA 1LCFA 1XS5A 1LB8A 3PPNA 2P2AA 3LUYA 3E4RA 4AB6A 2O7IA 4ZEDA 3TTRA 1ZTYA 1UIVA 4F2QA 5CM6A 5AE4A 2FA7A 3B6QA 3TTNA 2H98A 5M2VA 3HHGA 1ANFA 3C33A 1Q1KA 3TCHA 1OIBA 2GHBA 4ESXA 4DCYA 4G77A 3TUSA 1DMBA 3K4UA 3TPAA 3EQ1A 4OFOA 1B7HA 2Q8JA 3QK6A 4G68A 5H8NB 3FVKA 4PFUA 3U8QA 3FXQA 2YLNA 1ZKBA 2I3WA 1M5DA 1QKBA 3VVDA 3VDFA 3A3UA 5I56A 3A3CA 2OZZA 2O69A 3TCGA 3MQ9A 3G3KA 1FQFA 4FATA 1B1XA 3V8XB 1PB7A 1US5A 4WEPA 3T9XB 3O6GA 1T0KA 1YPNA 1O7TA 3G3GA 1B0LA 1FCKA 3FXRA 4R9GA 5DT6A 3RUMA 4BDRA 3OOAA 4XKNA 1Y4CA 2DXYA 1SVXB 4G2ZA 3PGFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5T3JA 4GX3A 5TP9B 2PCRA 4GVOA 4NF8A 3S9LC 4ZEKA 1FBEA 3PUYE 1H44A 1BP5A 1IXCA 5TPAB 5FBPA 1PBQA 4POXA 1FBFA 2HAUA 2ZZVA 1FPGA 5KZTA 4N8YA 1RYOA 4JVDA 2B3BA 4XFEA 1QULA 5J1DA 1QUIA 4YB7A 3EHUA 1HSEA 1WDNA 1A99A 2E0SA 3USDA 1MQDA 3OSRA 3VLVA 2Z23A 3FZVA 3O97A 4ZE9A 4O7IA 2A5TA 4ZDMA 1Y20A 1AWBA 4Q30B 3RT6B 1HSLA 4GLIA 2XXIA 5L9MA 4LZ8A 4AS5A 1QUKA 2XWOA 2HAVA 4HW8A 3VE1B 2PBWA 3SESA 5EQ9A 1POTA 3CSBA 3MP1A 1Y1ZA 2PFYA 3IJOB 3E78A 1YAEA 3FD3A 5DW8A 4R2BA 1O63A 1H3DA 1LAHE 4NHBA 5ET8A 1P1UA 4JWYA 1NV2A 4H5GA 2D5WA 4N8GA 3MWBA 1VDWA 5IZ3B 1BTJA 1Y3PA 2Q74A 4GOTA 1KWHA 3RPLA 4DLDA 3SZPA 4DXCA 4EF1A 3TELA 1N84A 1H76A 3AXFA 1FPLA 4DZ1A 2WBDA 3FXBA 2RC7A 3MBPA 3A09A 4LP2B 2QS4A 3U72A 5EHSA 2DYXA 1XHYA 2FBPA 5ITOA 3UP9A 1N76A 2V3QA 3VLWA 2Q2AA 1GVCA 2F97A 1NV0A 4ECFA 1FBDA 1FQAA 3MSTA 4KCDA 3FATA 5DYHA 2F7BA 1DCUA 3K1MA 4N6DA 2X7PA 4YKPA 1G0IA 5H8NA 5L9OA 4BDQA 3SERA 5FHMA 3B6TA 3K0VA 3GYYA 5EQ8A 5ET6A 4H1XA 2XD2A 4KQPA 1ZMGA 1IMCA 3LSWA 2ZYNA 4TQUQ 2QL3A 4GX4A 2Y7RA 1DTZA 1G0HA 1DOTA 3TCFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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