The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structures of CO Hemoglobin E (betaE26K) approaching physiological pH (pH 7.5)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQ7 A; 3V2Z A; 1J40 A; 2QLS B; 3ZOL A; 2EKU A; 1XQ5 A; 3D1A B; 3NMM A; 1R1Y B; 5MBA A; 2DN3 A; 3PI9 A; 4F6J A; 1HBA A; 1JWN A; 6HBI A; 4IRO A; 1XZ4 A; 1OBM A; 2LH1 A; 2ZSO A; 1BZ6 A; 1OUU B; 3WTG B; 3MVC A; 3QJC A; 2G10 A; 5AB8 A; 3QJB A; 3NG6 A; 1YG5 A; 1VXH A; 1O1P B; 1HGB A; 3GDJ B; 2FAL A; 3OZV A; 3DR9 A; 3QJE A; 1RVW A; 1Y4P B; 2ZFO C; 1JF4 A; 4O2G A; 3HYU A; 1J3F A; 1CBM A; 5ILM A; 3HHB A; 2ZS1 D; 1DWS A; 2AV0 A; 2V1J A; 1BBB B; 2HBE B; 4ZVA A; 1LFL B; 3IA3 B; 3A5A A; 1IRC A; 1MBS A; 1Y8K B; 2HHE A; 3UHE A; 1UX8 A; 1LFY B; 4FC3 B; 1MYT A; 1S5X B; 1XZ7 B; 4G1V A; 4N7N B; 3G4U A; 3ZJI A; 1LFQ B; 2V1H A; 2QFK A; 3K3U A; 1HBH B; 2AUP A; 2IG3 A; 3NML A; 1O1K A; 3LB2 A; 3UHI A; 2HHD B; 4HHB A; 1QXE A; 2MGL A; 1UT0 A; 1UVY A; 4M4A A; 1MOB A; 4JAC A; 4H07 A; 1V5H A; 2EB8 A; 3UHS A; 5E29 A; 1Y7C B; 4MQG B; 2RAO B; 1NQP B; 2ZLT B; 4NXC A; 5EE4 D; 2VHB A; 1I3D A; 3B75 B; 1LUE A; 1YE0 A; 1B86 A; 4UIQ A; 2ZSS A; 2ZLV B; 1Y0W B; 1QI8 A; 2BK9 A; 3UHZ A; 2OIF A; 1NAZ A; 1Y2Z B; 2FRK X; 1RQA A; 2XKH A; 1MNK A; 1Y4Q A; 3HEN A; 1CBL A; 1HV4 A; 3ASE A; 1X9F A; 1HGA B; 4UZV A; 3A9M A; 3ZJR A; 2HBC A; 1C7D A; 2EKT A; 3OZW A; 4ROL A; 2LH7 A; 2Z85 A; 3DHT B; 1OR6 A; 3KMF A; 1MOA A; 1AJ9 B; 1JDO A; 3MKB B; 2VLZ A; 5B84 A; 3GOU B; 1LJW A; 3NFE B; 2R1H A; 3WCU A; 2HBS B; 1MOC A; 4NZI A; 1SI4 B; 103M A; 101M A; 1Y7D B; 1DLY A; 1UIW B; 2MHB B; 1GDI A; 5E6E B; 3G53 A; 3UH7 A; 3UBC A; 3E55 A; 2BNL A; 3M39 A; 1YEU B; 2V1G A; 3TLD A; 2YRS A; 1MWC A; 1HAC A; 5F0B A; 2GRH A; 3PT7 A; 1Y4R A; 1THB B; 3HC9 A; 3RJ6 A; 3WCU C; 4MQH A; 1NS6 A; 1T1N A; 3S65 B; 2DC3 A; 2GL3 A; 3PI8 B; 1FN3 B; 3S48 C; 4F6B A; 1OR4 A; 2MGK A; 3HEP A; 2D2N B; 2WY4 A; 1Y35 A; 3GQR A; 3BOM B; 1RPS A; 2HBD A; 1Y5K B; 3WCP B; 1PBX A; 2D6C A; 1F5P A; 1CG8 B; 1YCB A; 2ZT1 A; 2DHB A; 5MBN A; 1J52 A; 1XYE A; 3UHW A; 1GBV B; 1GDL A; 3GK9 A; 1YGD A; 1MLM A; 3M38 A; 1ABY A; 4B4Y A; 1Y0A B; 3G4Q A; 1DO1 A; 2GLN A; 3AQ6 A; 4YU3 B; 1I3E A; 1YMA A; 4MBN A; 3ONZ A; 1Y0C B; 5CNE A; 3R0G A; 4NXA A; 3HRW B; 1Y8I B; 1DUK A; 1CP0 A; 1RQ3 A; 1VHB A; 3QQQ A; 4DWT A; 1O1O A; 3DHR A; 3OGB A; 4QAU A; 4BJA A; 1VWT B; 4C0N A; 1FAW B; 3D1K A; 4N8T B; 2G0Z A; 2ZS1 B; 4DC7 A; 1LHS A; 4L2M A; 1IRD A; 2D5Z B; 2LH5 A; 1RTE A; 3D17 B; 1WMU B; 4AVD A; 2VYZ A; 3W4U A; 1DXT B; 5JOM A; 1OJ6 A; 2H35 A; 4H2L B; 3QM5 A; 1SDL A; 4WCH D; 3G46 A; 1MZ0 A; 5JGG A; 2NSR A; 1Y5F A; 2VYY A; 4X0L A; 4F69 A; 1N9X A; 1S6A A; 1CO9 A; 2LH6 A; 1MLH A; 1Y09 B; 2V1F A; 3R5I B; 105M A; 4H0B A; 1Z8U B; 1YEO B; 1YDZ B; 7HBI A; 1LH1 A; 1MLJ A; 4MBA A; 3AQ8 A; 4MQJ B; 1F5O A; 2DN2 A; 3UBV A; 1O1I A; 1X46 A; 1K0Y A; 4HSX A; 2E2Y A; 1EMY A; 1YH9 B; 2DXM A; 3QM6 A; 1QPW A; 3DUT B; 4ESA B; 1HBB B; 1V07 A; 5EET A; 3KUN A; 3S1J A; 1YHE A; 5HAV A; 4YU4 A; 1ABW B; 1V9Q A; 1Y8W B; 1Y0T A; 2ZS0 C; 4FWZ A; 1FDH G; 1YMC A; 3UGZ A; 1YIH B; 1Y4V A; 3OO4 A; 1C7B A; 5ILP A; 1BAB A; 110M A; 1NIH A; 3EOK B; 1V4X B; 2HZ3 A; 5CHR A; 2Z6N B; 4MAX A; 1DM1 A; 3VRE A; 1MOD A; 3P5Q B; 111M A; 1YEV B; 2EB9 A; 1F65 A; 3AG0 A; 3UHY A; 4KJT A; 1G08 B; 1A0Z B; 1BZ1 A; 2MYA A; 4U8U A; 3WR1 A; 2ZSY A; 1Y85 A; 1A01 B; 1NEJ A; 2LH3 A; 1A3N A; 1DO7 A; 4MXK A; 1YVQ B; 4MQC A; 1LA6 A; 5B85 A; 1O1N A; 4GZG A; 2D60 A; 1CH9 A; 1GCW B; 1J7Y B; 3HF4 A; 1MNH A; 1XY0 B; 1Y8H B; 1Y45 B; 5CNB A; 4F6G A; 1DWR A; 2ZFB A; 1XZU B; 2GRF A; 2M6Z A; 3WCW B; 1QSI A; 2ZLU B; 2G0V A; 2FRF A; 3D4X B; 2BLI A; 4U8U C; 4HRR B; 2V1K A; 3K8B B; 5SW7 B; 1LH2 A; 3CY5 B; 1O16 A; 1XXT A; 5C6Y A; 2OH9 A; 1D8U A; 1N9F A; 1HGC A; 1URV A; 3H58 A; 3VRG A; 2D5X A; 1BZ0 B; 1FCS A; 2W72 B; 3E5I A; 1S0H A; 4MXL A; 3ZJP A; 1EWA A; 2QLS A; 4L7Y B; 1LH5 A; 1R1Y A; 4NI1 B; 3WHM B; 1SWM A; 1YIE B; 3MYM A; 3ARL A; 1G0A B; 3GKV B; 2RI4 B; 5HLU A; 1A6G A; 3FS4 B; 2HBF B; 1OUU A; 3WTG A; 3ECX A; 1CH7 A; 1DXU B; 1O1P A; 6HBW B; 1JY7 B; 1JPB A; 4ILZ A; 2NRM A; 2R80 B; 1YGF B; 3SZK A; 1Y4P A; 2PEG B; 3ECL A; 3BJ3 B; 1V75 B; 1OFJ A; 3H57 A; 1NPG A; 1M9P A; 4VHB A; 1GZX B; 1YHU A; 3BCQ B; 1BBB A; 1ABS A; 2HBE A; 3S66 A; 1J7S A; 4FWY A; 1LFL A; 3U3E A; 1HCO B; 1FSX B; 2QMB B; 2D2N D; 4TWV A; 1JP9 A; 1CLS B; 2QFN A; 4OOD A; 1LFY A; 4FC3 A; 2ZT2 A; 1XZ7 A; 3PEL B; 4N7N A; 1LFQ A; 1HSY A; 3OJ1 A; 1HBH A; 1NPF A; 1Y4B B; 4PQB A; 2AA1 B; 2QSP B; 4F6F A; 1ASH A; 1DLW A; 2HHD A; 5D1V A; 1O1J B; 2D2M B; 1FLP A; 1YHU C; 3GYS B; 3LB4 A; 1Y7C A; 1MBD A; 2RAO A; 2GTL D; 2ZLT A; 1YEQ A; 1M6M A; 107M A; 3B75 A; 1Y7Z B; 3AT6 B; 3EU1 A; 4FH7 A; 1AJH A; 3GQG A; 1JW8 A; 1HBS B; 3UGY A; 1Y2Z A; 5ILE A; 3ZOM A; 5HY8 B; 1HBR A; 3QJD B; 3VAU A; 1O1L A; 1LFZ B; 1NS9 B; 1V4U B; 3UHB A; 3OO5 B; 3MOU A; 5F2A A; 1HDA B; 4ZVB A; 2ZFO B; 3MKB A; 1XZ5 B; 1GVH A; 3A59 B; 3NFE A; 2HBS A; 1Y4F A; 5JDO D; 1Y7D A; 1DXD A; 2MHB A; 2DN3 B; 3PI9 B; 5E6E A; 2GKM A; 1Y83 B; 4PQC A; 2Z8A A; 1MLR A; 1CH2 A; 3IC0 B; 2R4X A; 3G4V A; 2BMM A; 1SDK B; 3PT8 A; 1YEU A; 3QJC B; 2H8F A; 3PIA B; 3ZJS A; 3NG6 B; 1LH3 A; 4NK2 A; 2OHB A; 1RVW B; 1S61 A; 1YZI B; 1YFF B; 3WFU A; 5KER A; 1CO8 A; 4FWX A; 1THB A; 5HBI A; 1YEN A; 3SDH A; 3ED9 A; 3HHB B; 4HBI A; 3TM9 A; 4MQI B; 3TM3 A; 3BJ2 B; 3S65 A; 1S5Y B; 3UI0 A; 3PI8 A; 1FN3 A; 1A3O A; 4AVE A; 1CH4 A; 3RGK A; 2ZS0 D; 1G09 B; 1A6N A; 3EDB A; 2MGH A; 1Y5K A; 1CPW A; 3WCP A; 1MWD A; 1CG8 A; 1R1X B; 2AUO A; 2VM0 A; 2R4Y A; 1VXB A; 1YVT B; 1LTW A; 1GBV A; 1O1K B; 4NI0 A; 4O4Z A; 1BZR A; 1IT2 A; 1J41 A; 5HLQ A; 1QXE B; 3UHK A; 1X9F C; 1MBO A; 3WCW D; 1Y0A A; 2NRL A; 2H8D B; 2QRW A; 1W92 A; 1JZL A; 4YU3 A; 4F6I A; 1IBE B; 3G4W A; 1HDB A; 5ILR A; 3KMF C; 2MYC A; 1Y0C A; 2PGH A; 3UH3 A; 3HRW A; 1Y8I A; 5D5R A; 2GDM A; 2QSS A; 1J7W B; 1MLS A; 1MYH A; 2GNW A; 2ZLX A; 5AZR A; 1FAW A; 1KFR A; 4N8T A; 2B7H B; 3M3B A; 2ZS1 A; 2D5Z A; 1RQA B; 1UMO A; 3ZJO A; 3D17 A; 1MNO A; 2ZT3 A; 1Y46 B; 2OLP A; 4H2L A; 1ECA A; 4HRT A; 2MGD A; 2HHB B; 1RQ4 B; 3UHR A; 1Y7G A; 3D7O B; 1SPG B; 1MBN A; 1XCH A; 1DKE B; 1Y09 A; 2DN1 B; 1M6C A; 2ZSP A; 2G14 A; 1HHO A; 1YEO A; 1YDZ A; 1SHR B; 1XZ2 B; 5E83 B; 4MQJ A; 1A4F A; 1FHJ B; 1A0U B; 1YH9 A; 1BUW A; 1XZV B; 3A5B A; 2SPM A; 1VRE A; 3V2V A; 4ESA A; 4HSW A; 1HBB A; 1JP6 A; 1DTM A; 1ABW A; 1UFJ A; 2GTL B; 1CMY A; 1GBU B; 4UUR A; 4C44 A; 1J3Z B; 1BZZ A; 1YIH A; 4LPI A; 1O1M A; 1A00 B; 2YRS B; 3WFW A; 2XKI A; 1GJN A; 1Y22 B; 3EOK A; 1HAC B; 2Z6N A; 5CNG A; 3PT7 B; 1CH1 A; 3WCT D; 106M A; 1LFT B; 1YEV A; 1MOH A; 1QXD A; 2R4Z A; 4MQH B; 3IC2 B; 1G08 A; 3CIU B; 3WCV D; 3VRF B; 4M4B B; 2D2M D; 2ZLW A; 1X3K A; 3PI1 A; 1JP8 A; 1MLG A; 1VXG A; 1YVQ A; 4MU5 A; 4F4O B; 2HBD B; 1PBX B; 1Y31 A; 1JEB B; 1GCW A; 1J7Y A; 5CHQ A; 5KDQ B; 3K9Z A; 1XY0 A; 1Y8H A; 1Y45 A; 4IT8 A; 4FH6 A; 1CP5 A; 2AUQ A; 1YGD B; 1BZP A; 1MYI A; 1VXC A; 1EW6 A; 3BA2 A; 2ZLU A; 1J3Y B; 3D4X A; 1KD2 A; 5EUI A; 2WTH A; 1HJT A; 3K8B A; 3BJ1 B; 5SW7 A; 4DWU A; 2MYE A; 1WVP A; 4XS0 B; 1O1O B; 4N7O B; 2ZFO D; 1JL7 A; 1C40 B; 5EOH A; 1BZ0 A; 1K1K B; 2W72 A; 1G0B B; 3D1K B; 2EVP A; 1CQX A; 2O5O X; 4N7P B; 2W6V B; 3E5O A; 1YHR B; 3WHM A; 1NZ3 A; 5C6E B; 4WJG 1; 2ZS0 B; 2V1E A; 1G0A A; 1MBC A; 2RI4 A; 1GLI A; 102M A; 1YOG A; 3FS4 A; 1URY A; 1LFV B; 2O5L X; 1MKO B; 3MJU B; 2R50 A; 6HBW A; 1JY7 A; 2SPO A; 2W6Y A; 3A0G A; 5HU6 B; 3ZJM A; 2R80 A; 1YGF A; 2HZ1 A; 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3WCU D; 2O58 X; 2HCO B; 3WCV B; 2G0X A; 2BWH A; 1C7C B; 3HEO A; 2V1I A; 1Y83 A; 2FRI X; 4MQG A; 1RTX A; 3EDA A; 1NQP A; 3IC0 A; 4WJG A; 4KMW A; 1SDK A; 1HDS B; 1U7S A; 1YOH A; 1MTJ A; 2ZLV A; 1GCV B; 3HXN B; 1LH7 A; 3PIA A; 1Y0W A; 1Y0D B; 3LB1 A; 1MWB A; 2AUR A; 2W6X A; 1NXF A; 1YZI A; 3SZK B; 1YFF A; 1DXV B; 5CN7 A; 1UFP A; 1HGA A; 4KMV A; 3QMA A; 2AV3 A; 2C0K A; 1S69 A; 3LR7 A; 1BIJ B; 1M9P B; 1YHU B; 4MQI A; 3BJ2 A; 108M A; 1QSH B; 3S66 B; 1J7S B; 1S5Y A; 1Y5J B; 3DHT A; 1JF3 A; 1OFK A; 2XKG A; 3NL7 B; 1AJ9 A; 1G09 A; 1JZM A; 1V4W B; 3OZU A; 3UHU A; 3QM7 A; 3GOU A; 1J40 B; 3UHT A; 1FSL A; 2ZT0 A; 1XQ5 B; 5CNF A; 1SI4 A; 1EBT A; 3NMM B; 3AQ9 A; 1R1X A; 1UIW A; 1MGN A; 1HBA B; 1NWN A; 1YVT A; 4IRO B; 2VEB A; 1XZ4 B; 1MDN A; 4DC8 A; 1UX9 A; 1MLU A; 2MGI A; 3UH6 A; 1VXE A; 1PMB A; 1TU9 A; 2H8D A; 3QJB B; 3ZJL A; 2ZWJ A; 1YG5 B; 2SPL A; 2SPN A; 1CH3 A; 4JYQ A; 1HGB B; 3G4R A; 1IBE A; 3QJE B; 1YEQ B; 3GKT A; 3WI8 A; 3HYU B; 2G3H A; 3EU1 B; 1J7W A; 3GQG B; 3LR9 A; 2O5Q X; 2B7H A; 2ZSQ A; 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