1YXIA

R-state amp complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DTNIVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title R-state AMP complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Sus scrofa
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase
total genus 109
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2005-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1yxiA01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1yxiA02
4GWYA 1FPGA 2HHMA 2WBDA 4H46A 1K9ZA 4QXDA 4FBPA 2WEFA 3RYDA 2JJKA 3RPLA 3QMFA 3T0JA 1KZ8A 1NUZA 1FJ9A 4GX4A 1D9QA 1IMCA 2FIXA 1QGXA 5EYHA 3A29A 2OX3A 1NV4A 2P3NA 3KC1A 2FBPA 5T3JA 1YZ0A 2PCRA 1FBGA 3IFAA 2DDKA 4GBVA 3BIHA 4PTKA 1FPKA 1NV0A 4KXPA 5EQ7A 5ET5A 1LBYA 1YYZA 1RDZA 3BIGA 1LBZA 4GWWA 1FPFA 4GBWA 1FTAA 3D1RA 4G61A 1EYKA 2QVVA 5I3SA 5EQ9A 1NUYA 4O7IA 1RDXA 3FBPA 4H45A 1K9YA 4GX6A 4MJOA 2GQ1A 1FBHA 1FPJA 2F3DA 4HXVA 3IFCA 1IMFA 2BJIA 1DBZA 1KA0A 4N81A 1FBDA 5F24A 3LV0A 2FIEA 5LDZA 1SPIA 2CZKA 5ESYA 2R8TA 4HE2A 5IZ3B 5EQ8A 5ET7A 2Q8MA 1LBWA 1NUXA 5ET6A 2VT5A 5J16A 1NV5A 2F3BA 1Q9DA 1FSAA 1NV3A 2WBBA 3ROJA 1NUWA 1NV2A 1JP4A 4I40A 1FJ6A 1FBPA 1EYJA 1LBXA 3RPLB 1NV6A 2FHYA 2CZIA 4HE1A 1LEVA 1CNQA 2Y5KA 1KA1A 4I3YA 1FBFA 1INPA 1FBCA 1G0IA 1VDWA 4GWUA 5DW8A 1LBVA 2OWZA 1FPEA 4IR8A 3LUZA 2P3VA 1YXIA 5EQAA 1FPDA 1EYIA 1IMDA 2FVZA 1FPLA 3KC0A 4HE0A 5FBPA 4GWXA 1XI6A 2Y5LA 1NV1A 3KBZA 1IMBA 1RDYA 4I3EA 1DCUA 3B8BA 2QVUA 4GWSA 2QVRA 1IMAA 5A5LA 2QFLA 1FRPA 5IZ1A 2CZHA 4GX3A 1NV7A 2Q74A 5EYGA 5ET8A 1BK4A 1FPBA 1DK4A 4GWZA 1NI9A 4AS5A 4AS4A 1AWBA 1IMEA 1G0HA 5IZ3A 1FPIA 1FBEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K1MA 3AXFA 5BUUA 1B40A 5EYFA 4N6DA 2OPDA 2UVHA 4FBPA 3IR1A 2V93A 3PD9A 2WEFA 4HCWA 4QF9A 2XXWA 3ISPA 3UIFA 4N8YA 4R74A 2QPQA 4UA8A 4Z7EA 5ISUA 4OVRA 4GWWA 1N7WA 1SW2A 5EQ9A 4G2ZA 1DPEA 4AB6A 1VSOA 1FTMA 4O3AA 3RT8A 4KFQA 4PFRA 3LV0A 4OVTA 4PGPA 3TELA 2H4IA 4GFRA 4LUBA 1Q9DA 5CM6A 1B5HA 2VOZA 3HO7A 3FGSA 1FQAA 4OFOA 3U92A 4QFLA 4ESXA 5I5PA 3QIMA 3CG1A 3MW0A 2A5TB 3OMBA 4ZEIA 4NMYA 2XX7A 4X9TA 3PUZE 3H7MA 4WKMA 3O66A 1NNKA 4RXLA 1SD3A 3E3KA 1B3LA 4NF5B 1MXVA 3FATA 1B46A 1GR2A 2I3VA 3MZ1A 4BDLA 1FPBA 3CVGA 4G8HA 1NI9A 4H1XA 4ECFA 4E0WA 1FPIA 3H6TA 3LSLA 3B6WA 4LQ5A 1B5JA 1EZ9A 1BIYA 2B3FA 1EU8A 4YICA 3Q27A 3VFJA 3V5AA 2GFEA 5ET5A 3ILTB 1YYZA 2XD2A 1FPFA 3M3LA 2WYPA 3MVWA 3QXMA 3LUYA 3D1RA 4TLMB 3UA8A 4OANA 4ELRA 4LZ8A 1A7LA 4OVSA 3HHGA 4P47A 2F5XA 4YKJA 4U4XA 3RQTA 2AYSA 3PTYA 4F39A 5B70A 1LBWA 4G77A 5ET6A 1JW1A 4GWOA 3GBAA 3PGFA 3N6UA 2X26A 3O6HA 4EQBA 5LOMA 4F1VA 3CIJA 4R6HA 3EHUA 2HXWA 1B4ZA 1B2HA 4BLAA 2ZNTA 1P1OA 1XI6A 3KEIA 1JQFA 1DCUA 3KZGA 5H8FB 4H5GA 5DVFA 3ZKKA 5DEXA 3SERA 1QJMA 4YMBA 3C32A 3ILUB 4IGRA 1MQDA 3KN8A 2QS3A 4AS4A 1MPCA 3C35A 1B7ZA 5AA2B 4DXUA 3IB2A 3CG3A 5A5XB 4O94A 5JTYA 1RYOA 4PBQA 1NUZA 2D21A 4OWDA 4H8JA 1IITA 1IMCA 1LCFA 3KBRA 2I3WA 2P3NA 1LFHA 2FBPA 3PV0E 1FBGA 4PAFA 2I4CA 3RT6B 2HAUA 2QJEA 1RKMA 5F1QA 1Q1KA 2XWIA 3FVNA 3EPEA 5IGAA 4X8RA 3S9MC 1NNTA 3IOTA 1LFGA 1KWHA 4QFKA 2NWJA 5AA4B 4LN5A 3DLNA 1DBZA 5F24A 1PBPA 1QW0A 2F6GA 2XXKA 4LZ7A 5ESYA 5IAIA 4F3BA 4OHNA 4KQPA 4EQ7A 4FAJA 3M8UA 2B4MA 4XTCQ 4LVQA 1NV3A 2L5VA 3OEMA 1QUKA 5DYHA 5TPAA 3OSQA 1B3GA 3RPWA 3TTLA 1SBPA 3N6TA 4EDPA 4IO4A 1Z7NE 3U93A 4U22A 1LBVA 2OWZA 2FYIA 3QSLA 1MY4A 2Y7IA 4N13A 2P3VA 2DXRA 1EYIA 2Y7WA 4PAIA 2Q89A 4ELPA 2ZZVA 4O7MA 5A5LA 2I48A 3EQ1A 5AA2D 5F7VA 3JV9A 1OIBA 3HSTA 5AE4A 1DK4A 2V25A 4GWZA 1EH3A 2HZLA 4H67A 1AWBA 4YU0A 4Z0IA 4NHBA 1B1HA 3MP1A 4PAKA 1K9ZA 2DE2A 5KCJA 2O7IA 3G3FA 3RPLA 3QMFA 3QYTA 1VR5A 4RY1A 1B58A 2PT1A 4PTKA 1FPKA 1B1XA 1ZKBA 1ZJLA 3K1PA 3VXBA 2REJA 1RDZA 3IL1B 3WAEA 5I2NA 4MH5A 3SEWA 4GL0A 5L9SA 1MXXA 2DYXA 1XC1A 4GX6A 4I62A 1IMFA 4GXAA 4G68B 2VD3A 3TUSA 3FV2A 1OVTA 1R1NA 2UXAA 2Q8JA 1Y9UA 4IGTA 3I6VA 3G3HA 3MSTA 1R9LA 4TOZA 1B0LA 2R71A 1QKAA 4M1VA 5CMBA 2CEYA 2XX9A 1B52A 5DW8A 5L9OA 1CE2A 3RGYA 3E13X 1B5IA 1UTHB 1ZBMA 4IR8A 2ONSA 1IXCA 4MNCA 1A99A 4OTEA 3OO8A 1OMPA 1SI1A 1S9TA 4MNPA 1MY1A 3OSRA 2RC8A 3TDJA 2ANJA 5L8DA 3K0VA 4I8CA 3FVKA 3IJOB 3TPAA 3UP9A 2RCBA 4U23A 2PFYA 4JXIA 4F19A 1CB6A 1MY2A 4QXDA 5KDTA 3PPQA 3PPPA 1B51A 3THIA 1LAGE 1GV8A 4U1ZA 1POY1 5FHNA 2ZMBA 5IKBA 4OEUA 4ND9A 1HSLA 2F7CA 4R9FA 4MBPA 1MXYA 4P1EA 1A8EA 3T9VA 5EHMA 1NKXA 1S7YA 1GVCA 3KGCA 4H65A 4NTLA 1NUYA 2D3IA 4N07A 5M2VA 4LATA 1FBDA 1B3FA 2DS9A 3VVDA 3E79A 4F29A 4GF8A 4DI4B 5IZ3B 3CRBA 3IOVA 3MBPA 4ESWA 1FSAA 3B7DA 3FXBA 1LBXA 3LSXA 2I0BA 2OPEA 4WEPA 2V3UA 3H6WA 3OELA 1J1NA 5H8HA 5ITOA 2V3TA 1FBFA 1URDA 1B32A 3MPKA 3CI8A 4QRZA 1MS7A 3EF7A 3TQWA 3PPOA 3V8XB 5CC2A 4XF5A 4GIZA 4ELQA 2OWSA 3S9NC 2ZZXA 2O6AA 4PE5B 2Y5LA 2Z23A 1IMBA 2QS1A 2HXRA 3B8BA 2QVUA 1MQIA 4MCOA 4TQUQ 3C31A 3GXAA 1MY3A 4N15A 2Q74A 1LAXA 4PGNA 4C1UA 4RA1A 1NMUA 1LAHE 3C4MA 4NF0A 1YPNA 4X04A 1P1WA 2Z8FA 2THIA 3VVEA 1IXGA 2VD2A 1WODA 5FTHA 4JDFA 1MQJA 4OVQA 3TEPA 2NXOA 4XFEA 4C1TA 4JVIA 3T96B 1P1NA 4OERA 1QGXA 3O97A 4XEQA 1NV4A 2QL3A 4GBVA 4KXPA 3K4UA 2F97A 3T9XB 3MZBA 3UORA 2QVVA 3VLVA 3MUQA 3HN0A 4EUOA 2GQ1A 2Z8EA 4MIJA 2XWOA 1SPIA 3H3GA 4LONB 1Y3PA 2PMSA 1NNPA 3MP8A 3PUVE 4EXLA 5HPQA 1POTA 2F3BA 5AA3A 5ICQA 4MEVA 1NV2A 1NH7A 2DVZA 4KR5A 3G3KA 5I59A 1LEVA 3QAXA 3NOHA 1LB9A 1FBCA 1JW4A 4NGUA 4RK2A 1Q35A 5BWJA 3LSFB 3MJNA 3FJMA 1LBCA 1FPDA 3HHFA 4ZZEA 4DE8A 1URGA 3SDFA 1SYIA 1B3HA 3FXUA 3H6VA 4X1BA 4P3LA 4RPNA 3O6GA 3KN3A 5ET8A 4ZE9A 2RC7A 2XHDA 4NWCA 1I6AA 3GLBA 3M3KA 2GRVA 3FXQA 1LB8A 1FBEA 1FTJA 4QHQA 2UYFA 4OEVA 4R75A 3OOAA 2XXRA 3UGWA 3N94A 4MNIA 5I56A 4ZS9A 3MVYA 3N5LA 4IY5A 1WVJA 1N84A 1B9JA 1NV0A 4EF2A 1SVXB 4XKQA 4GBWA 3HCQA 3H06B 3U1OA 4QSDA 2O51A 1K9YA 5DEXB 2ZXTA 2KQZA 1UQWA 1TFDA 1KA0A 1B0HA 1XT8A 1IZ1A 4LZ5A 4OFJA 4PCDA 2HAVA 5DVIA 3K6UA 4POWA 4IO6A 4K3FA 4GOTA 4POXA 1VFDA 2Z8DA 1FBPA 5JTYB 2F6PA 4DXBA 4F3PA 1SW5A 1Y4CA 3IOUA 1FPEA 3TZAA 5I57A 4GLIA 2QS4A 2QMWA 3Q26A 1ZLQA 3W15C 4P8BA 2Q2AA 3UK4A 2XXVA 2RF1A 1FRPA 2AIXA 4MLQA 1BTJA 2I58A 5EHSA 3ONMA 4MHFA 3Q25A 3L6GA 3O2AA 1AH5A 4NF8A 2F78A 5CMMA 3SEUA 3G7WA 3Q29A 4DZ1A 4AQ4A 4IO3A 2OLBA 2WBDA 5TPAB 3BFTA 1S50A 3ZKLA 2P1SA 4N8GA 3R26A 4PC9A 3ODBA 4N17A 2QMXA 4NG7A 5AA1A 5H8QA 1N0TA 3TYHA 4FE8A 4GRKA 4QFPA 3TKDA 4Q5TA 1MDP1 4JBZA 5DVJA 3KN7A 4F2QA 3TAJA 2DP8A 1JEVA 3HPIA 4MJOA 2XXTA 2R6GE 3OD7A 4YAHX 4HXVA 5TP9A 1JVYA 1LGBC 2O1MA 1MG1A 5CMKA 5ET7A 3VLWA 3RTFB 2H9BA 4THIA 5B7DA 3G3JA 1MY0A 1NFTA 5KCJB 4KCDA 2Y7RA 3EN3A 4ZE8A 3RPLB 2A5SA 1NV6A 4Q0CA 2CZIA 1N3WA 2PT2A 4XXUA 1B4HA 3A3UA 2Y7KA 3RNNA 4MF3A 5I84A 1P1QA 5I2NB 2XXIA 4TLLB 4OZ9A 1O64A 2OCUA 1P99A 1AMFA 4KPTA 1R6ZA 4F1UA 5FTIA 4N91A 1SI0A 2F34A 2O7UA 4FEBA 3FZVA 3MZ9A 1MM6A 3LSWA 3E78A 2XWKA 2FNCA 2IEEA 3ECRA 2VGQA 1MPBA 1OQHA 3T22A 1LAFE 4BDQA 2PFZA 3KSJA 3JZJA 1Y1ZA 5ICTA 1B05A 3W9WA 4OESA 4XIGQ 3IB1A 2AL4A 3SEXA 1Y4TA 3CSBA 3CFXA 3VE1B 2PYYA 2ZYKA 4N6KA 2NOOA 5KZTA 2Z22A 2ALUA 1FTAA 4G61A 3MQ9A 2PVUA 2KR0A 3S2VA 1D9YA 2ONKE 2M8CA 3MAMA 2RKMA 1DTZA 4WXJA 2OK2A 2BJJX 5DTBA 4NE4A 1M5EA 3KOSA 4YKPA 3A3CA 3MWBA 3KG2A 3U8QA 3ROJA 3E4RA 4FJPA 5KDTB 2VHAA 1B7UA 1OLCA 2FHYA 4O3BA 4YB7A 4F2OA 1TWYA 1KA1A 4YKKA 4G4PA 3MYUA 2V84A 4I3YA 1R9QA 3PMXA 4RJZA 3K6XA 4JB7A 4PBHA 2XXUA 4L17A 3IORA 3F11A 3MPLA 4PDHA 1US4A 4HTGA 1MQHA 5HBCA 1YXIA 1DPPA 1SW4A 5FBPA 2B65A 4PQJA 1TFAA 2FA7A 3IO6A 1D3KA 2UVGA 1UIVA 3V89B 2DVCA 5JEIA 4GVOA 4MMPA 1ZTYA 5DT6A 3BFUA 1GTKA 3U72A 3FXRA 4PE3A 3FVOA 2YJPA 1FQBA 2D5WA 2DQVA 1TXFA 3H4ZA 2JJKA 2PBWA 3FVGA 5H8HB 3OENA 1I6BA 1A40A 3N26A 2F36A 3M3FA 2OX3A 2ESNA 1YZ0A 4R2FA 3W9VA 2HPGA 4QFOA 5EQ7A 2IA4A 3T9HB 4DDDA 4DCYA 1MH3A 1AIVA 3BIGA 3DP6A 2Y84A 4YB6A 1MXWA 2XXPA 1BKAA 5J1DA 1OVBA 3B50A 4PF8A 4NQ8A 4F1YA 3SETA 4GXSB 3CFZA 2E0SA 3I5OA 1T0KA 1A54A 3PUYE 5CI5A 3B6TA 3LBSA 1A8FA 1NV5A 4NF4A 2Y7PA 4O8MA 3VV5A 1PDAA 5IM2A 1N76A 3SEYA 3QK6A 5IZZA 2P2AA 1B3EA 1NL5A 4LA9A 1LBBA 1N3XA 5EQAA 2FVZA 4GWXA 4PFUA 3BBRA 4G8NA 3TMGA 4X48A 2QVRA 3GZGA 1M5FA 5IZ1A 5K2XA 2XWVA 1NV7A 2OZZA 2I4BA 3CFLA 2B4LA 3IO4A 4AS5A 4EF1A 5I7IA 3D4CA 4H46A 2HZKA 4DCXA 3I3VA 3VVFA 4JWOA 5I59B 1MRPA 2OBGA 4IO7A 4GX4A 1A55A 4XKNA 4YMAA 1D9QA 4JVCA 2FIXA 2H99A 5EYHA 3IJXB 3KC1A 1B6HA 4PETA 1M5DA 3USDA 3IX1A 3C36A 3MVXA 5JK4A 1LBYA 2XXXA 1DMBA 4KHZE 3TTMA 5CMCA 4R73A 2OWTA 4OFLA 1I69A 4O7IA 1H43A 3A09A 4GD5A 1O7TA 4KYSA 5K2YA 2BJIA 3PU5A 5H8NA 4KI0E 2X7PA 1D9VA 3TODA 4EQ9A 3TQLA 3GYYA 2WYKA 4OYVA 3RUMA 5I56B 3FD3A 2O69A 2ZNSA 3KSXA 3PMWA 3VLUA 4X1DA 1XVYA 4RYAA 2GHAA 3T66A 3LUZA 3PUXE 3KC0A 4JSOA 1TT1A 1MH4A 4U4SA 1NV1A 2GHBA 3IOWA 2H98A 3C34A 3PMVA 4QBAA 5EYGA 3RTWB 3U65A 4NF6B 3U94A 1G0HA 3G3GA 2Q9TA 2DWJA 1XVXA 5I58A 3FV1A 3RYDA 3HV1A 1KZ8A 5I2KA 2CEXA 4YZZA 3IB0A 2ZZWA 3A29A 5T3JA 3IFAA 3WAFA 2DXYA 5I57B 4BDMA 4PFWA 1ZU0A 1GGGA 4IO5A 4WEDA 4EXKA 2RCAA 2W7YA 3SEVA 3EHTA 4PFYA 1QULA 4G8MA 5HM4B 2I0CA 4FECA 3DM0A 4NF8B 4HE2A 1DTGA 5CBRA 1NUXA 1M5CA 1IXHA 4P56A 1H44A 1CNQA 1Y1MA 2NUVA 1PEBA 3O29A 1INPA 5H8QB 1G0IA 4G68C 1Z7ME 1XHYA 4C0RA 4NF6A 3DP8A 5H8SA 2B3BA 3C33A 3K01A 4F31B 5TP9B 3OO6A 2QFLA 4KYEA 2CZHA 4GX3A 4OVJA 2OJTA 1BK4A 4R6YA 3MC2A 1IMEA 3FASA 3TTKA 4GWYA 2MKZA 4IB2A 1FPGA 4ZEBA 2XD3A 1RYXA 2RC9A 3KFMA 3IAZA 3GBBA 4I9DA 3LC8A 4P1LA 4P9KA 1IIWA 4P11A 2O84X 1FW0A 3K6WA 3C9HA 5CRYA 4RK9A 1H3DA 3TCFA 1JVXA 3DELB 1HSEA 2PCRA 2A5TA 2F8DA 1B7HA 3PPNA 4F3GA 4ZEDA 4QSCA 1SW1A 3FJGA 4H45A 3TCGA 3KJTA 4BDNA 2F3DA 4NF5A 1SYHA 2XA5A 4DLDA 3QUJA 4QSEA 2VT5A 4ZZAA 1ELJA 4O3CA 1NUWA 1ANFA 1FQEA 1N7XA 1QUJA 4MX6A 4OETA 2Y5KA 2V4CA 5ITPA 1AOVA 3G3IA 3DP4A 2DOJA 1IUDA 1PBQA 2UVJA 4H5FA 3O28A 4H0WA 1MM7A 1QUIA 2ABHA 1NNFA 1EZPA 4FEDA 2XXHA 1FPLA 3KJ7A 3T9UA 4GL8A 4E0XA 4N6PA 2DE4A 3T1BA 4R72A 1O63A 3T93B 1F9BA 5L9MA 2V3QA 3BKIB 4MAGA 1US5A 4H6DA 2H25A 2H5YA 4OVPA 1FTKA 1FQDA 4UACA 1JNFA 3OO9A 4ZEFA 1M5BA 4IO2A 1JW5A 3VDFA 5CBSA 4PFIA 1OLAA 1L5TA 1JETA 3R6UA 1HSJA 1NH8A 4JVDA 1FJ9A 1MQGA 4XKRA 1AL3A 1WDNA 3H6UA 1Y20A 5ELVA 1PB8A 1USYH 4BDRA 2GH9A 4FATA 2F7BA 1ZMGA 1EYKA 2ZNUA 1LSTA 2F35A 4NEDA 3FBPA 3PPRA 4U21A 1IEJA 1QVSA 2VP1A 4PF6A 5H8FA 1FPJA 4NAPA 2DSFA 3K6VA 4BDOA 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