1YXWA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tetanus toxin (Tentoxylysin)
molecule tags Hydrolase
total genus 115
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yxwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yxwA02
4YGBA 4OWJA 3C9ZA 2VUAA 5DZUA 4Q27A 5GZEA 1JT4A 1FNYA 1S0IA 3PG0A 3AX4A 2VW2A 1WBLA 3ZXFA 4X39A 2E6VA 1SR4A 4YGCA 2EXIA 4ZOTA 2PHXA 1OQLB 4FPCA 2ZMNA 1KJLA 1W6PB 2ZKNA 3P6JA 2D6MA 3TAYA 5T5LA 3M3CA 4Y1VA 1M2TB 4BQ1A 2D22A 4I4XA 3IM0A 4D0ZA 3O3QA 4JCKA 4WVWA 1D2SA 3BAGA 3VKFC 3CRGA 3FJIA 1G9BA 4FOVA 1MS0A 1TEIA 1QNWA 1FMMS 1YXWA 1GLHA 1AJOA 4ZGRB 1JLXA 4XJAA 4KEJA 4XBLA 3WHUA 3T1LA 3HR9A 3AKFA 4I3NA 4I0YA 1DQ6A 3NV1A 2DTWA 2JJ6A 4PBOA 3I8TA 3M3QA 2JDZA 1WLWA 3BAOA 1LOEA 1L2HA 2LIEA 5AVAA 3FJBA 3ILNA 1DFQA 3VWCA 1CVSA 1SLBA 4FQ4A 2NMNA 4QD2C 5GALA 1RMLA 5F5QA 2FDBM 4IZEA 4Z8BA 1FAYA 3FJFA 2AGSA 3OGFA 4QBCA 2QYIB 4GOVA 1LOGA 2GMEA 1CONA 2OW4A 4LBOA 1I1EA 4XIOA 4H04A 4YW2A 4I7IA 3BRGC 3BODA 3T2TA 4UW3A 4YG3A 1N1VA 2DU1A 3BRDA 4FQZA 4U36A 1HLCA 5CAZA 2EF6A 1DQGA 1DFCA 3UJ4A 1DQ2A 2P3JA 2DYCA 3O0XA 2PHWA 1BFBA 4QKSA 1V6KA 4CJMA 3QYDA 4LO8B 3M1HA 1SBEA 3BAQA 4LO7C 1U0AA 1AX2A 4IONA 1UN1A 1TWMA 2RQ9A 2YY1A 5EHAA 3N3HA 4ISRA 1XQNA 2A6XA 2JECA 1WBFA 4LBQA 5EWSA 3KQRA 3NWKA 3M3EA 1FWUA 2FGFA 1XZZA 2ARBA 3CA4A 1BA7A 1P63A 1AXZA 1S0CA 2DVBA 1HKNA 3BA7A 5EXOA 2BEBA 2D6LX 3RRDA 3O4CA 3IM5A 4ZFWB 4AN7B 1H30A 4BMEA 2F2FC 3WINC 1OFSA 2ARXA 1YYNA 2J3PA 3UJ0A 5I1BA 1MS9A 2R0FA 1SZ6B 3GALA 4I37A 2IHOA 4XTMA 2LIQA 5JLVA 1LU2A 2K4AB 2RSTA 4YZ3A 4BMBA 3AJZA 4K1ZA 3H6RA 1Q8SA 2DREA 2E4MA 2FO1A 3ZSMA 4I1EA 2KM2A 4XFSA 2ET2A 5EYXA 4AVSA 1SLIA 31BIA 2ERMA 2VSEA 4QKRA 4I6IA 5H9QA 4UW5A 3AK0A 5H9SA 1TFMB 5IK8A 4LBQD 4Y1YA 1GNHA 4ZBVB 1H9WA 4P9XA 5GZFA 2V5YA 1G82A 4P6AA 4GXLA 5FZYA 3ASIA 2Q5TA 4J2SA 1TTUA 4WV8A 1N1TA 4GP0A 2D44A 4YW4A 3DGTA 1PC8B 4Z8SB 3HN1A 2JE9A 2YV8A 4BOWA 4CRQA 4XHXA 1JOJA 2OUJA 1AJKA 2UUSA 1N4KA 5JVVA 1R8OA 5E88A 4FPOB 5GLVA 1CJPA 1AX0A 3A22A 4LBQB 3HOMA 1EVTA 1ZM1A 1CR7A 3W59A 1WLDA 2W08A 1ILR1 1LOCA 3ZX7A 1ULEA 4OEGA 4USOA 4YZ5A 4LO0A 2P23A 1F9KA 1ENRA 3AZWA 1CPMA 4FPJA 2NN8A 5IK5A 3UDAA 4ZXKA 1JT5A 1LGCA 4FPEA 1V6XA 1JXNA 1DZDA 2ZGNA 1FATA 4II0A 3UJOA 1DYKA 4P0KA 3IN9A 3SLIA 4M3CF 4PQ9A 3H6RB 3FJEA 1T4QA 5BXSA 1O4ZA 4ZA3B 4K20A 3V0AB 3KM5A 4W65A 3A0NA 1UZYA 1QOOA 2AAIB 2IWTB 1JLYA 2CWSA 1H9PA 1QGLA 1LEDA 2VLCA 3UD8A 3A0KA 1LHVA 4DS0A 1O4YA 4BM8A 3P53A 2DU0A 4Q1RA 4YM3A 1W6QB 2GZBA 4ASMB 4FOQA 3ZXLA 3WO4A 3RTJB 4HR6C 1BFFA 4Q26A 1D0HA 3ZPYA 1JYIA 2G4IA 1WBAA 1LOAA 1QNYA 1ULDA 1GGPB 4YM2A 3V0BA 1W6PA 3CAHA 2Z48A 5F8WA 1IILA 3CA3A 3AYDA 2CNAA 3LSDA 2FFVA 1SCRA 3ZC9A 4XZPA 3PVNA 5DZGA 4SLIA 1ISZA 1K5VA 1HQWA 1ITBA 1HCDA 5EC5A 1RITA 2E51A 3BAUA 2ZR1B 4KBBA 5EG6C 3ZXGA 3AP6A 1BJQA 3A07A 3MEPA 4LO3A 3V65A 4TLPA 2WSVA 3S8JA 1MS8A 2DRZA 3FJJA 3V64A 3ATGA 4J2XA 2MC2A 2VSAA 3SNMA 3VKMA 4OEFA 1FQ9A 5DG1A 3ZXKA 3AP7A 3WUDA 4FPHA 2DRYA 3VT1A 1PUUB 1LGBA 4R9CA 4LBKA 3WMVA 1HWPB 5BP5A 3ZSLA 3WO3A 4XJZA 6I1BA 2ZGLA 5KXCA 4XJWA 1Q8VA 1LEMA 1UX6A 5F8YA 4XE9A 3AZVA 1Z0HA 2A70A 4I8MA 3ENRA 3RMYA 3D5OA 3M3OA 3KMVA 2D7RA 4OWKA 4QO3A 3WDWA 1LOFA 4YZ1A 4XBQA 4UW4A 3I29B 2A6ZA 3JUUA 4GWMA 3OJBA 4PCRA 1T9FA 4YGEA 2P2KA 1BXHA 3NBNA 4LBJA 1MZ5A 4KC3A 5BYNA 4GOYA 4JQ0A 1DBNA 5L73A 2Q9XA 1IS5A 3SH3A 4PC4A 3UD9A 2FFUA 5DUVA 2RG9B 5HCFA 1FV3A 4ISQA 4JC1A 3SH4A 1HWMB 3NBEA 3R4UA 3E8LC 2E4MC 1SBFA 2FHRA 3BADA 1W6NA 2VY0A 3V0BB 4PF5A 2CYFA 3O4OA 1DQ0A 4KEKA 5CNAA 2PHUA 3WCRA 2W68A 4GKXA 4JPZA 1QDOA 4L4HA 4LO1A 5DUXA 2KLLA 2I2SA 3AH1A 3CA1A 1N3OA 3INAA 4TYSA 4AYUA 1GZCA 3ILRA 3FGMA 2EALA 2ZA9A 5E89A 3SISA 1V6IA 1QXMA 5BQUA 3V79C 3HMYA 4H55A 1V6MA 1AZDA 4Y26A 4Q8LA 3RSJA 4G9MA 1C57A 3AH4A 1G7YA 2F8XC 2A3YA 1G86A 2AYHA 1W0PA 3FLRA 2X2TA 4K21A 4YGDA 2ZQOA 4WBCA 1AFCA 4LBLA 5GZGA 1APNA 1SLTA 2KH2A 1E0OA 1DLLA 2K8RA 2D6OX 1AF9A 3NJ5A 5IK7A 2GMPA 5T5OA 5BVPI 5BXPA 3TC2A 2P37A 8I1BA 1EPWA 3AJYA 1G9CA 3ZXEA 1WW6A 3FBYA 1J1TA 1GYKA 2AXMA 1IJTA 4DFSA 1IRPA 4LO0C 1AXMA 3AYEA 4I4SA 3LSEA 4F34A 4OWLA 4A7ZA 3M2MA 5DG2A 3VUOA 5CA6A 5DVHA 1PZ8A 1GNZA 1HIBA 4M3CB 4FP3A 4YG6A 1NZKA 4YW3A 1WW7A 5T5JA 2D43A 2PELA 1JT7A 2A5ZA 3QCWA 1W6NB 1WLCA 2C5DA 5H9RA 1DYPA 2D3RA 2EXHA 1UL9A 1V6JA 2NZ9A 1EYLA 2AFGA 1F31A 4X38A 2UURA 3IM7A 1WD3A 4P9WA 5FZUA 1AX1A 4YW5A 3B3QE 1MACA 1YBIA 1AVWB 1SACA 3AJ6A 1UZZA 1DGLA 1MR5A 5IUQA 4FPLA 2B7YA 2ZMKA 3UD7A 1W6OA 1S0GA 3BIWE 3WDYA 3N0KA 1CE7B 1UMZA 3VT0A 4HANA 2D20A 1FNZA 3JRRA 2D24A 4ZLBB 5FRAA 2BQPA 3WVJA 4XOGA 2W52A 2LALA 1DIWA 1IKQA 2WQZC 4HA2A 1S0BA 1BYHA 3JUTA 1ISWA 4I1BA 3BAVA 2D3SA 1DHKB 1II4A 3O12A 3POYA 3V0AA 3B00A 1ZA4A 3LCPA 1BARA 1V00A 5HPZA 4AVTA 4LO3C 5DXDA 3RG0A 4AN6A 5JOYA 4EFPA 2CTVA 2DWRA 3VKNA 3CA5A 1AXKA 4ATFA 1SCSA 1LU1A 3ZSKA 2WKKA 2YXSA 2MLLB 3RTIB 4C1XA 1W6QA 1J0SA 2W39A 3ZSJA 1LCLA 2JKBA 3HSMA 2GNMA 3BTAA 1KNMA 2L5XA 1IHKA 5GZDA 3BA4A 3Q7XA 4DCKC 4USPA 5BP5C 1LULA 3FFZA 4Q91A 3AZXA 1Q56A 1LHNA 1TOOA 2YZ4A 4Y20B 2ZAAA 3Q9OA 1MS4A 2ZGTA 1LOBA 3AKHA 1PZ7A 1RZOB 3BOPA 4YFWA 2EXJA 1LOFC 1QKQA 3ILFA 3PVOA 3B01A 3OBRA 3WV6A 4ZKTB 5B2HA 1WBCA 5F90A 2ENRA 4YM0A 2A6YA 1OQ1A 1YIFA 4LO2A 3AZZA 3WG3A 1C4RA 1GV9A 3WMUA 1ISVA 2ERFA 4LBMA 2RHPA 1N1YA 3N36A 4UW6A 1SR4C 2KI6B 1S0LA 3VKOA 2VW1A 5T5PA 5JDBA 1W6OB 5T55A 3L2YA 4FGFA 3FUOA 1PZZA 1IS4A 1LESA 1V6LA 2GN7A 4HL0A 4I4RA 5F9TA 2PHFA 4ITCA 1YO8A 4YZ2A 4CTEA 1AVXB 4LO1C 1MS1A 1S0DA 2WJSA 1W3AA 5CBLA 3WA1A 1CN1A 1W0OA 5BOWA 2AR6A 1RG8A 1WD4A 3WLUA 3USUA 1CIWA 1M16A 2Y9GA 5BQUC 1AVBA 1WW5A 3W9TA 1JBCA 4WVVA 2GNDA 1KRIA 3FUQA 2ZGKA 1UKGA 1RIRA 2NVHA 1XG6A 1GSLA 2DURA 1GZ9A 3ZXJA 2ZGOA 3QLQA 3JU9A 2FMDA 2ZHLA 2XOAA 1KITA 2UWAA 3WDXA 1NUNA 1DZQA 4L4IA 1Q8PA 1FX5A 5T54A 3OJMA 4OZXA 1QMJA 4R6UB 2ZQNA 3F62B 3MALA 2ZHNA 2R49A 3AKIA 3OPZA 1KJRA 2NTDA 1QDCA 4I4OA 3RMXA 1WCSA 3H0OA 5FNWA 4NOTA 5IT6A 5KXEA 2NMOA 2F2FA 3WINA 4FPGA 1VAMA 5EYYA 3OY8B 2DUOA 3VSFA 4WZFA 5FREA 4GKYA 4I4YA 3RQ0A 2E53A 2GDFA 3MW2A 4YFZA 5JOXA 2SLIA 2Z42A 3WUCA 3D4KA 2OVUA 3VV1A 2ES3A 4I4PA 2KKIA 5GM0A 1I3HA 1YI7A 4YW1A 4XMIA 1V6WA 3AXDA 1GBGA 2ZABA 4BLJA 1LENA 2DUQA 3WOGA 2ZHKA 2WBCA 7I1BA 2ESUA 3O44A 1ENSA 1VALA 2P3IA 1BLDA 4YOLA 4XXAA 5DUUA 4MYEA 4X3AA 3PUBA 1HDKA 4IY8A 3VSZA 1BLAA 2D6KA 3VT2A 2YMZA 3B9CA 3Q7YA 1CESA 3O49A 2TEPA 1LTEA 3POKA 3N7KA 1DQOA 4U2AA 2ZGPA 4QALA 3FJDA 4A7YA 1S0EA 1WUVA 2DUPA 1JN2P 2CWMA 4XXPA 3CNAA 3USUB 2ZGMA 1KQRA 1XYFA 3BX1C 1FN0A 2NYYA 3T8SA 5FZZA 4LO7B 3Q7WA 2R16A 2NP0A 1RINA 2VXRA 1R8NA 3AJ5A 3FLTA 3OYWA 2D6PA 2GALA 4XIKA 1AVUA 4M3CA 1N3PA 1ISYA 3AFKA 3H6SE 3MW3A 4HJJA 1Z4SA 1FV2A 4GA9A 3FJHA 4DRRA 5DZFA 3O4AA 1Y7BA 1Q8OA 1ULCA 4QC4A 3O0WA 1IS6A 1MS3A 3PJQA 3WG1A 1ONAA 1W6MA 4OW4A 1NXD1 1IRAX 1LJ7A 1G8WA 1Z78A 3C2UA 4FP2A 3WNXA 4XJUA 1JUIA 3OGGA 4AGGA 3WHTA 2P39A 3BB2A 3IM6A 4R9DA 2AENA 2DS0A 4YZ4A 4G6JA 4XYXA 2WT1A 1SLAA 2R9KB 1NLSA 1K5UA 3SH5A 1DZCA 4XDQA 3IIRA 1FGAA 4AVVA 4P0LA 1B09A 1SLCA 4M3CE 3GNEA 1JQZA 2VH9A 1S1AA 1G9AA 41BIA 1W3FA 1MS5A 2AREA 5JOZA 1QU0A 4J2KA 5H9PA 2XG3A 2WT2A 4AWDA 2AH2A 1PWAA 1Q04A 2GN3A 2D1ZA 4ENDA 3PHZA 3NV4A 5SV8A 1C1LA 2MIBA 1N47A 4XJ9A 2DV9A 4LO2C 4OEEA 1BZWA 4Q9GA 2HYKA 1JY0A 2YROA 3N35A 2HZ9A 4XFUA 1XHBA 3APBA 3O5WB 4IHZA 4Y1ZA 3CQAA 2ZGUA 1X50A 4Y1UA 3WG4A 4D69A 3MW4A 3ZC8A 2E7QA 3IPVB 4EFRA 1UPSA 3VEQA 2GO2A 2VXTI 4JRAA 1SLLA 5GAQA 3OYWB 1BFCA 3VKLA 4P0JA 1PUMB 1VCLA 3U4XA 1BFGA 3W58A 3RS6A 5DSSB 4PBPA 1CPNA 3WO2A 1JHNA 4Q2FA 2M49A 3CRIA 4JP0A 5GZCA 4Y20A 1IKPA 2WT0A 3MPPG 5JMCA 5LK5A 1V6OA 3WDTA 4J23B 1W6MB 2ZACA 3ZYPA 1VLNA 1V6NA 4Q9PA 3HBWA 3H6QA 2R1BA 5F8SA 1W3GA 3AYAA 2PHTA 1YTOA 3I2AA 3ZVXA 1S0FA 2VU9A 1DJSB 3HALA 2ZGRA 3FJ8A 2KI4A 2Y9FA 3AP4A 2R0HA 3O4DA 1HWOB 4JKXB 4GAFA 1IOAA 4JKQA 1FMZA 4BPZA 2DVDA 1MZ6A 2I1BA 4FOWA 2EIGA 4EEEB 4I30A 1R1ZA 2ZGQA 4J2YA 2QN4A 3BA5A 1PZ9A 3D6EA 1MC9A 4GAIA 5BXRA 4DEPA 3WG2A 3LTQA 5GLWA 5E24E 4XILA 2NM1A 3DUIA 4M01A 3FJ9A 3AYCA 1MVQA 2HWMA 1TP0A 1G9DA 2UU8A 1BASA 5BXTA 2JE7A 1SBDA 3FJCA 2DVGA 4XJ8A 1VIWB 3SITA 3O4BA 2ZZJA 4DENA 1DQ5A 4Z9WB 4CZSA 4ZFYB 5KXDA 1KDMA 3R05A 4BLIA 2A71A 2A75A 2AUYA 4C1WA 4NO4A 5JOWA 1V6UA 3IKWA 3A4UA 2R1DA 2A3WA 2C9AA 2A7AA 4EFQA 3OJ2A 4FVVA 1LODA 1LGNA 1OKQA 3ZYRA 3I2XA 2PHRA 4XHBA 4RA0A 4M00A 2X2SA 4XFTA 1HQLA 2A6VA 2V73A 4GWNA 5T52A 3WCSA 4RL7A 1RY7A 4P14A 3EF2A 2WRYA 4FPYA 3QR5A 1S0JA 1N1SA 5G00A 3AZYA 5D63A 1ENQA 1SFYA 3N7LA 3OY8A 2WLQA 1QF3A 1DQ1A 5HCAA 1C1FA 4I4QA 4DPNA 1Q03A 1FWVA 2JD4A 3BRFA 1DQ4A 4YM1A 1QOTA 4H9WA 1IT0A 3POWA 4K1YA 1JYCA 3AH2A 2BFHA 1Q8QA 4XBNA 1FYUA 3UL2A 2D23A 1MD6A 1GKBA 1JTCA 4XMAA 3NV3A 4G1RA 2DVAA 1QOSA 5HCBA 1I1BA 1UAIA 3T1MA 3WDUA 2EAKA 3K1XA 4Q1PA 4GP3A 2HW9A 1HKDA 2A6WA 3P6IA 1YRZA 4Y22A 3ILAA 4QBVA 2WNEA 2HWAA 1GICA 4EKXB 4ATEA 3LLPA 2ZHMA 3POSA 1N3QA 3R4SA 2K43A 5GLTA 2GNBA 1GZWA 2CY6A 3CA6A 4G6MA 4YLZA 2XB6C 2ZMLA 1A78A 3N7JA 1AXYA 2UWBA 3TB0A 1IS3A 1LECA 2Y9WC 2OUHA 5D61A 1ULGA 1AVAC 4Y1XA 1ABRB 2P34A 4FOYA 3B69A 2Q3NB 4I4VA 2SBAA 1LHWA 2BEAA 1VAVA 3BAHA 2DVFA 1A8DA 3S8KA 4L8QA 3UK9A 2H0BA 2D6NA 3A21A 4X37A 2YUGA 4IY9A 3A23A 2UWCA 1WW4A 2ZBJA 2WSUA 1JW6A 1ONKB 1Q1UA 1CQ9A 5CB7A 1ULFA 4FPKA 1CVNA 3AKGA 1BQPA 4A7KA 4D0TA 3IAGC 3WDVA 2EXKA 1URXA 3CU1B 4FPFA 3WZ1A 2D3PA 3IMNA 4IYBA 5E8AA 4DRVA 3O5SA 3O0VA 2Z49A 1YF8B 3OJVA 2CL2A 4G9NA 3FJKA 3FJAA 3PMEA 4AGRA 3ZXDA 4I2SA 1JT3A 2LTNA 5DUWA 1QQLA 4QD2B 1IOBA 4OUJA 4EB2B 1EV2A 5IK4A 1HWNB 4I4UA 4ZFUB 5DUYA 5GJ6A 9ILBA 1G9FA 2AQZA 4XKIA 5D62A 3AP9A 2P3KA 2DTYA 4IQPA 1F5FA 3D7WB 2D7FA 1LHUA 3AXEA 1MVEA 4XTPA 2GMMA 1GANA 4AGVA 1LHOA 4Q8KA 3I4IA 3UJQA 4Y22B 1HCEA 4KEIA 2VW0A 4I96A 4R9AA 5GLZA 1BKZA 21BIA 1Z2VA 4Y24A 5DZEA 3NBDA 1ISXA 1GZWB 4GALA 2D7IA 5GLUA 1KDKA 1V6VA 4F83A 3B9UA 4LBNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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