1Z6NA

1.5 a crystal structure of a protein of unknown function pa1234 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
MASYAELFDIGEDFAAFVGHGLATEQGAVARFRQKLESNGLPSALTERLQRIERRYRLLVAGEMWCPDCQINLAALDFAQRLQPNIELAIISKGRAEDDLRQRLALERIAIPLVLVLDEEFNLLGRFVERPQAVLDGGPQALAAYKAGDYLEHAIGDVLAIIEGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title 1.5A crystal structure of a hypothetical protein PA1234 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords hypothetical protein PA1234
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 57
structure length 166
sequence length 166
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14595 Thioredoxin_9 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6nA00
3GX8A 2VO4A 5ECHB 1TU7A 3ZMKA 2FWFA 1PL2A 1WRYA 2H19A 3HJOA 1ERWA 1PGTA 2FWEA 5ECLB 2E7PA 2PVQA 2WZ9A 3CRTA 2CV4A 1GLQA 3UBLA 1S3DA 1ZGNA 4MA9A 4JZQA 3LEFA 4RQXA 3GL5A 6GSWA 1GNWA 5CP1A 1WWJA 4POKA 3H93A 1LJRA 2H74A 2LEGA 3S9FA 2ES7A 2MZCA 1MEKA 1XFLA 4V2MA 3VURA 1GLPA 1Q4JA 5J3RA 1TP9A 2H1BA 2DIYA 3FZ9A 4MZCA 3HA9A 1SL1B 4I2TA 3GN3A 3GTUA 4OCFA 3D22A 5DCGA 3QR6A 2PWJA 2I3YA 3UMAA 2VLTA 4V1Ag 1A0RP 1ML6A 1XWKA 1EOGA 4EE0A 4K9ZA 1DSBA 4E8HA 4J2FA 2X8GA 5G5FA 4I8BA 3G7JA 3APSA 1SL2B 3U5RE 1SK1A 5IO2A 5CRHA 1HYUA 3ZFBA 3VLNA 5ID2A 3LXZA 4K2DA 4HZ4A 1SYRA 1FVJA 1OYJA 3W8JA 2YWIA 2YOIA 3RPNA 4IQ1A 4PGTA 3IAS2 2GGTA 5C00A 2WRTA 2B7KA 2V6OA 5A5KA 5DALA 3KEBA 5J41A 5HFIA 4GLTA 2BMXA 3RHCA 2DIZA 5CO3A 2GT5A 4X1UA 1V58A 2H1GA 4TN8A 5ECKB 2CAIA 2P5RA 1FAAA 3GH9A 2B5EA 4N11A 4MF7A 4DSQA 4ZL8A 3UEMA 4LL1B 5COHA 3HVXA 1F3BA 4KB3A 5DJLA 3C8EA 5HFGA 2Z9SA 5HR2A 8GSSA 3IR4A 3N5OA 2LJRA 1Z7PA 1SK2A 2L59A 2MBSA 1YKCA 2FNOA 2BJXA 2VCVA 4I97A 1S3AA 2GDRA 4ID0A 3LG6A 3APOA 2YNXA 2HI7A 14GSA 2LQQA 2XBQA 2CT6A 2MMNA 3ZZXA 3F6DA 3TKRA 1M9AA 4TOPA 4KDUA 1JFUA 4V2LA 1THOA 4NHWA 1TK5B 2LRTA 3LWAA 1XW5A 5ELAA 20GSA 4TKYA 3CSHA 3IDVA 4MPFA 17GSA 1GUMA 1F37A 4KAEA 5DDLA 4O92A 3RHBA 5F8BA 1BX9A 2GZYA 2X64A 3L9VA 1T4YA 4QL7A 2XPEA 2GZPA 5H5QA 1VF2A 3PR8A 2F9SA 1SYXA 3IC4A 5INYA 4K7NA 3R2QA 3M0FA 3RBTA 4OO5A 4PUAA 1A2MA 1J08A 1R4WA 3HVVA 2KP2A 1U87A 4LMVA 4HI7A 1OAZA 1O81A 3DVXA 1M9BA 3FR9A 6GSSA 4YH2A 3GYKA 2JSYA 3EVIA 3WGXA 5B6NA 2FUG2 3BJ5A 2H72A 2R6KA 4ZB6A 3HJMA 3ZTLA 4KUNA 2WJUA 2YP6A 4EUYA 4GSNA 1WIKA 4BWQA 4ZB8A 1YEPA 1TOFA 3V1WA 1SJIA 3KMOA 1A23A 3D4MA 2LRNA 1U3IA 5DQSA 2VLUA 4PUFC 2XBIA 5H5RA 2L4QA 4ECCA 2JZTA 3GNJA 1QK8A 4KGIA 3QDNA 2J9HA 1X5DA 1Y6EA 6GSTA 5DAKA 3F4RA 4CDOA 4GWRA 4BWSA 4Q5RA 2N5AA 4Q5QA 2P31A 9GSSA 4TR1A 3CTFA 1WE0A 2IFQB 5JWQB 2O85A 4ACSA 4MLYA 1AC1A 1ZYQB 1TXXA 2L5OA 1UVZA 4PX1A 5CYYA 1JZRA 5EPFA 3C1RA 4MMMA 4EKZA 1OC8A 3HY2A 1T3BA 2MMOA 2DJJA 5HR3A 4F0CA 1K0DA 1BJXA 1FOVA 4JR4A 1Z7RA 4IS0A 2GQMA 2MMZA 1OVNA 2M72A 4N10A 2OE3A 5ELGA 1VF1A 2K9FA 3D0ZA 1NW2A 1JLWA 2NPBA 2C0EA 2AV4A 3P90A 4K0NA 3J7Yk 2DJ1A 2KUCA 1EP7A 1BG5A 4MJBA 19GSA 1ZYEA 1K0AA 4DSRA 4KSMA 1B9YC 4MH3A 2IL3A 1V57A 4LLRA 2X8HA 3CRUA 5LNKe 2OKAA 3TB2A 1K3YA 2VD0A 1JZOA 3EU4A 3TDGA 5D8IA 4IVFA 4F9ZA 2X99A 4KNDA 2I9HA 3F6FA 1SJ6A 2H30A 5IPHA 2PMTA 1B9XC 2OBIA 3IAM2 2FY6A 3A3TA 2H1DA 5CREA 3D4TA 1JHBA 1FB6A 3F4SA 3E0UA 3WD6A 1XVQA 4PXOA 1MD4A 3TOTA 5AIXA 1H4OA 2GQLA 4DVCA 3FEUA 2FLSA 4TXOA 1KTEA 3HXSA 4RI6A 3I6AA 3C71A 4G2EA 3ERFA 1GSEA 4HS1A 5CAXA 2LTKA 3DD3A 2LNTA 2NVLA 4KX4A 3FRCA 3TOUA 4HUAA 1R7HA 2C0DA 3G7YA 4L5OA 2F51A 4DSSA 5DBQA 2HZFA 1EV9A 2GS3A 4NPBA 3L9SA 5ID2B 3CSIA 1X5EA 3UL3A 2IMEA 1DBYA 3ED3A 3IXRA 2QC7A 2V41A 2VL9A 5B8BA 1V9WA 2H75A 3BCKA 3KP9A 4WBJA 5E59A 5IMZA 4AF2A 1ILOA 4EO3A 2WULA 1T8EB 1OKTA 3UVTA 4KA0A 2L6DA 3EU3A 1USBA 1AQXA 5DALB 2KHPA 4WEYA 2WS2A 4HQZA 4XCSA 4PURA 2VLVA 1YEXA 1X0RA 4LL4B 2YZHA 2H8LA 2ON7A 3DEXA 3MDKA 1T00A 1A24A 1TI3A 2P0GA 2ZUPA 4RUVA 2RM6A 2H76A 4TVEA 2AJQB 1T7PB 2VM1A 3GFKA 4L8EA 2OA7A 5C04A 3HDCA 3IBHA 3ME7A 4NXIA 1PKWA 4K7IA 2LV3A 3FZ4A 4ISDA 5J5NA 4WETA 2CVKA 1XZOA 3IPZA 2MYGA 1Z3EA 3QOUA 2CA8A 4MZWA 1G7OA 3UIWA 1IYHA 3GKKA 3QFAC 1ON4A 1TK8B 3LQ7A 1HNAA 2K8VA 4RI7A 1VGLA 1K3LA 1O6JA 1XPVA 1V40A 2HZEA 3EMXA 2RUFA 2VL3A 1PKZA 4POLA 4K1FA 2BTOT 3L78A 4OFNA 1JZWA 4OO4A 2GTUA 4OMVA 2I1UA 2IMDA 3AY8A 1RQMA 5IO0A 3FW2A 4FO5A 2CZ2A 3P8WA 1ZCPA 4N0VA 4MH2A 4BVYA 4G9HA 4HZ2A 13GSA 4E8EA 4TRXA 2DLXA 4KCAA 5J9CA 3QCPA 1YKAA 3HZ8A 1SKRB 1QMVA 1TDIA 3FR6A 3DYRA 5D93A 3KP8A 5ECSA 1U3AA 2AYTA 2OE1A 1FG4A 3K8NA 2GSRA 2OBKA 2VCQA 4RQRA 1MTCA 2B5YA 3F9UA 3FR3A 3C73A 3M8NA 5IIZA 3ZFLA 1SL0B 1NHOA 2C4JA 4HU9A 2HT9A 1XW6A 4JE1A 3VI5A 1AQWA 1GUHA 2JACA 5CRWA 3WYWA 2K8SA 5IMCA 1FO5A 3LXTA 3GKXA 4F0BA 3KZQA 2VL2C 1GTBA 5EVOA 3QMXA 1SD8A 5B8AA 1ZL9A 1PX7A 3RDWA 11GSA 5DAKB 2B1KA 2H0HA 4CHSA 1N8JA 3DKSA 3ME8A 4L0UA 1PX6A 2H1AA 1U88A 5AN1A 4TR1B 4ZBBA 3QPMA 2ZCTA 1R26A 2M46A 3H4KA 3E3EA 3HCZA 2YJ7A 4HDEA 4O5RA 1Y25A 3CBUA 2YWNA 3IV4A 2QGVA 3KH7A 1PQNA 3GRXA 2YV9A 4JR6A 3TRXA 3WGEA 1EOHA 4CW9A 4ZIJA 2I81A 3LJRA 4FYCA 1M2DA 3TRQA 2DBCA 4IP6A 4J56E 2F8AA 5ECIB 3W6GA 2IPAA 3M9JA 5CNWA 3RAZA 2CQ9A 3Q19A 3D21A 18GSA 3BCIA 2ZNMA 5KN3A 4ILFA 4LA1A 3TGZA 2HE3A 3BD2A 2YN1A 1PMTA 2HYXA 3ZMLA 3EWLA 5D73A 4BL7A 2YJHA 1TRVA 4NV2A 22GSA 2YWOA 2XHFA 3LSZA 4MJEA 1W89A 3FYGA 2F3MA 1SK0A 3Q74A 1WMJA 2G2QA 3UBKA 3RPPA 2YCDA 1EGRA 5ECRB 4XTSA 4POBA 3WT2A 1WJKA 1YF0A 2RIIA 1F9MA 2DJ0A 4PNGA 4OCEA 1K0NA 2B6MA 1GSDA 5GZZB 2TIRA 1GH2A 4KW6A 1NHYA 5G5EA 4PNFA 2A4VA 1EP8A 2MBTA 2YANA 3PGTA 4POMA 5HR0A 1A0FA 3GKNA 1AAZA 3I9V2 4KE3A 6GSVA 5GAPD 4TXOB 1JZDA 1XW9A 4ZXGA 1PA3A 3QAVA 4GSTA 3TKSC 3ZL5A 2L6CA 1GP1A 4IHUA 3HYPA 5G2ZA 3MAKA 4MJCA 1HD2A 3ERWA 4FH8A 5HFKA 1JLVA 4Z7XA 2JL4A 4DSSB 1GUKA 5ABRA 5A4VA 3VWVA 1BAYA 5IQYA 1VF4A 1TRSA 1LU4A 4BPYA 3H79A 1XVWA 5EL8A 2C0GA 3D5JA 5F07A 1SD9A 5LCZA 2HFDA 1YF1A 2VL2A 5IOXA 1GTUA 2H71A 3HVSA 4IJ3A 3ERGA 3NIVA 1ERUA 5DQYA 3IHQA 3VWXA 4K6XA 4J57E 3C1SA 2VOCA 3ZIJA 3QD9A 2FD3A 4KDYA 4GCIA 1I5GA 2ALBA 4ECJA 3F3QA 5L71A 3J7Yb 2HSHA 1YDKA 3KMNA 4IN0A 2O87A 4EF0A 2FA8A 2J23A 4AJ8A 1X9WB 2GSQA 3D6IA 4F03A 4GTUA 2DJ2A 1Z5YE 5G30A 5J4UA 3F0IA 3DXBA 3UARA 1M2BA 2CAQA 12GSA 4K7OA 1KNGA 2EIOA 4YQVA 1GSFA 2LRCA 4JRRA 1FB0A 4QQ7A 4ZL9A 5ECNB 3NOFA 1TU8A 3GV1A 4F2IA 3KGKA 3TCOA 4IELA 2R2JA 2PUKC 3IOSA 4IQAA 1GSQA 2HZEB 5GSTA 1Z6NA 4F82A 2PBJA 1ERVA 4I5QA 4WR5A 3TRPA 5EY6A 3F4TA 1GSSA 1EV4A 1G7EA 1SU9A 2RLIA 2HSYA 1ST9A 4GQCA 2VCZA 5IM9A 1YQ1A 5HR1A 4HEA2 1O8XA 1HNCA 4MABA 5FT3A 3U6VA 3VI7A 2PPTA 2FGXA 4TR0A 1QUWA 1URMA 2IN3A 3APQA 2C8UA 1XWCA 2EIQA 1EGOA 1ZOFA 5D96A 2H0GA 3EE2A 4OWYA 1PN9A 2LS5A 5JWOB 1SKSB 4EVMA 5KEJA 3C7MA 4ZL7A 3PH9A 3BOAA 3LFLA 2GQKA 1G0TA 4V2NA 3EMPA 1CQHA 4TW5A 1PRXA 1VF3A 3QAWA 3DMLA 2FA4A 3HKRA 3IRAA 2PN8A 2B1LA 4GRFA 3CXGA 4HU7A 2H70A 1VRSD 2C3TA 3TKSA 3GSTA 2WDUA 5DVBA 5IMVA 2B5XA 3IK7A 3A2WA 3TJGA 4WF5A 2H73A 3EC3A 3ZVJD 4L0WA 1GNEA 2IMKA 1HQOA 1M99A 2HNLA 4EDYA 3GL3A 2PERA 3F63A 2ON5A 3HD5A 3UOMA 3EYTA 5D9XA 4WXTA 1TRWA 4K8MA 1FW1A 2WCIA 1TK0B 1O7UA 2RUEA 2OJLA 1BQ7A 1FVKA 2CVDA 4X0XA 2O8VB 4XS6A 2B3SA 1C72A 4D73B 2HXKA 5E4WA 2V1MA 2IWTA 3I43A 4WR4A 1IYIA 1A2JA 4XRAA 4HJMA 4MZBA 1Z6MA 1UN2A 7GSSA 1E6BA 1GSUA 3ZLPA 2AB6A 3DIEA 3Q18A 4AGSA 1OKDA 1R5PA 2B7JA 1YY7A 5LD0A 2NTOA 4KH7A 5H5SA 3DWVA 2R5GA 4MDCA 5GAND 1XWAA 1ACVA 2I4AA 4ZBDA 3GHAA 4MF6A 2C1YA 4OD7A 1KBNA 3P2AA 4FYBA 2GSTA 4EL1A 5CRGA 3WT1A 4L5LA 1QXHA 4YAPA 4N30A 1X9SB 4HQSA 2DJKA 4MK3A 2OE0A 4NHZA 1OC9A 5B7CA 6GSYA 1AIUA 3FZAA 5F05A 6GSUA 2KP1A 3OR5A 4G19A 4PQ1A 3KD0A 5GSSA 3TKQA 3GH6A 2YZUA 4KCEA 2YWMA 1KEBA 2IMFA 4LMWA 5IPGA 2O7KA 4H86A 5D9TA 5AISA 3MSZA 4YAVA 4IGJA 1W4VA 4NWYA 2V2GA 2XPDA 1QFNA 2REMA 3VWUA 3GUSA 3LORA 1K0CA 3GX0A 4JEDA 4MCUA 1A2LA 2C3QA 3W8SA 1A8LA 5D9VA 2VAFA 2CZ3A 3PINA 1BEDA 6GSXA 1RK4A 4AJ6A 5D9WA 2JU5A 5DJMA 3KH9A 4IJIA 2GVPA 5G31A 1H75A 2H6ZA 4ECIA 2R4VA 16GSA 1GRXA 5ECOB 1X5CA 1J9BA 4TR4A 1G6YA 2GT6A 2E2GA 2NDOA 3UVHA 2FHEA 3TJJA 3HJPA 1WP0A 4KSOA 1SKWB 4XIHA 1LBKA 2VUPA 4D73A 3VWWA 4OFTA 1K3OA 1EWXA 2PVOC 1K0BA 2V32A 1DUGA 4PQIA 3IA1A 5JCWA 1O85A 1ZZYA 1B4QA 1F6MC 1MDIA 1NM3A 1X9MB 4V1Ap 2HRFA 1EEJA 4XS1A 1E2YA 5F0GA 3A2XA 3TJKA 1TKDB 2TRXA 2RM5A 5JCGA 3UJ1A 1RW1A 5J9BA 2JADA 4NMUA 2FCHA 2NBSA 2AUVA 3P7XA 3L9UA 1XOBA 5JWRB 3CMIA 1GSYA 1XWBA 3G9BA 3DRNA 2K18A 3MWHA 2LNSA 1TTZA 3M9KA 1THXA 3DVWA 4AJ7A 2F8FA 2X8CA 1MD3A 1YJ6A 3KM6A 2LJKA 3ZREA 3GSSA 3LGCA 4TXVA 5DCHA 1V98A 2JZSA 1B4PA 2EIRA 10GSA 2VD1A 2HRNA 1M7TA 4ECBA 2CVBA 3GIXA 2N5BA 3KTLA 4JBBA 1GWCA 4BA7A 1O73A 3TKPA 5B6MA 1AUCA 3O3TA 3HZ4A 3SBCA 5A4UA 2E2MA 5IMFA 3M1GA 3ZVJA 1NSWA 2KLXA 3ZRDA 4FYUA 3FY7A 3BBYA 1GULA 1XWGA 2R3XA 4YQUA 1R5AA 1TRUA 4Q5NA 1V2AA 2G0FA 5IMDA 1BYEA 4KDXA 3FHKA 3FK8A 3A2VA 1TI1A 1WPIA 3H8QA 4EDZA 1DE1A 2R37A 4GF0A 1YZXA 3ISOA 1PD21 1DE2A 1QGVA 1U6TA 3IK9A 3KCMA 1M2AA 4MJAA 2CX4A 2H6YA 4NAXA 4ML6A 3F3RA 4WBRD 1OE8A 2FWHA 2D2ZA 4ML1A 2LUSA 4I6XA 1MDJA 1QQ2A 4P3YB 3TJBA 2C0FA 3M3MA 2AHEA 3TJFA 1F3AA 5ECMB 3US3A 4O7HA 3O76A 3G7IA 1WOUA 4XS4B 2GSSA 4IW9A 3HHVA 3DGQA 1B48A 2L4CA 2P5QA 1PL1A 1GL8A 2YPMA 1G6WA 2H01A 3CSJA 2L5LA 3GKMA 1MDKA 1OC3A 3GMFA 3ZIVA 2DJ3A 1M0UA 2L57A 4IBPA 4TR3A 2M80A 3GA4A 2VM2A 4ZILA 1SENA 2XC2A 4GQFA 1ZMAA 3IE3A 5G1KA 5KN2A 1CQGA 2WFCA 3I69A 2H0IA 1HNBA 4GSSA 3QFBC 3FKFA 3QAGA 2H66A 4N0ZA 2VCWA 2QSIA 3VFIA 1XXUA 2DSAA 4HJ2A 3VK9A 3L0HA 2LQOA 2PGTA 3CTGA 3NZNA 2N5FA 5IMAA 3LYKA 2TRCP 1Z9HA 1UC7A 4O32A 2IJYA 2LSTA 3ZYWA 2A2SA 3MNGA 2EC4A 2E0QA 3KJYA 4K0GA 2GZZA 3EINA 4EXJA 5FHIA 2YV7A 2IMIA 1PSQA 1XOAA 2PU9C 3FZ5A 4EC0A 1XCCA 3WGDA 2GLRA 2WGRA 2WB9A 2KOKA 2OACA 3ZITA 1ERTA 4ZB9A 1TW9A 1I9DA 5AIVA 2DMLA 2K6VA 2DMMA 3KXOA 5IOWA 1XIYA 2A2RA 2VCTA 1SJZA 3F8UA 2JSZA 1GTAA 2JZRA 5KN0A 4XHMA 5KN1A 3Q6OA 2V6KA 3VPTA 1OC9B 4DEJA 1XBSA 3LYPA 4IP1A 4OFMA 2OADA 1AXDA 5HQPA 4ZBAA 3E9JB 1FHEA 4MF5A 5A4WA 1T1VA 5AGYA 4FIWA 3L4NA 4YQMA 3GURA 3O6TA 1AQVA 2VCXA 3GTUB 1T4ZA 1B8XA 3KTBA 4IKHA 1GTIA 1S3CA 1UA5A 4WF4A 4XS4A 2FWGA 3CYNA 1ABAA 4G10A 4MP4A 4JU5A 1EEMA 2MMAA 3EURA 1O8WA 2H6XA 1TJDA 1Q98A 5CRDA 2QKEA 4NV5A 5ECQB 5G1LA 3A5WA 2IIYA 4ULXA 3TUEA 3UAPA 5ECPB 2CX3A 4HOJA 2C3NA 2C80A 3SWLA 4Q5FA 2AAWA 4PQHA 4XRDA 1OE7A 4X43A 1EZKA 3KIJA 4GXZA 2O89A 2VIMA 2IFQA 5F06A 4BVXA 2LKUA 3JCML 3VPQA 5JCUA 1N2AA 4QL9A 1K0MA 1F2EA 3N9JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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