1Z6NA

1.5 a crystal structure of a protein of unknown function pa1234 from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
MASYAELFDIGEDFAAFVGHGLATEQGAVARFRQKLESNGLPSALTERLQRIERRYRLLVAGEMWCPDCQINLAALDFAQRLQPNIELAIISKGRAEDDLRQRLALERIAIPLVLVLDEEFNLLGRFVERPQAVLDGGPQALAAYKAGDYLEHAIGDVLAIIEGAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title 1.5A crystal structure of a hypothetical protein PA1234 from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords hypothetical protein PA1234
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 57
structure length 166
sequence length 166
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14595 Thioredoxin_9 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z6nA00
2LSTA 2OKAA 4ZB8A 4OWYA 1PQNA 1EOGA 1M7TA 2VCVA 1X5DA 3G7JA 1XCCA 4KAEA 1A2MA 2PERA 4G9HA 4EC0A 1PL2A 2O89A 3CSHA 2HFDA 1B9XC 2H01A 2HZEA 4MPGA 1THOA 3A2VA 4PQ1A 5COHA 1DE1A 3V1WA 3GUSA 1PD21 5ECSA 2CA8A 4EUYA 1F9MA 2FUG2 1NW2A 2C0EA 3GL5A 2JZSA 1AC1A 4RI6A 3VI5A 1T3BA 1JZOA 4JE1A 2F9SA 2FWGA 2BMXA 2P5RA 2N5BA 4HDEA 1PN9A 1OE7A 2MMOA 2JSZA 2H71A 1OKDA 1AXDA 1FG4A 1Z9HA 3KP9A 1O6JA 5DJLA 3QPMA 6GSWA 2D2ZA 2AUVA 2WDUA 5J4UA 1NSWA 4JEDA 3GYKA 3J7Yb 3EINA 1K0OA 3H1NA 4PURA 4TKYA 2LS5A 5ECQB 5KEJA 3N9JA 4LA1A 2AJQB 3HDCA 3KP8A 16GSA 4DSRA 5GSSA 3VPQA 4MDCA 1JZRA 1U88A 4BWQA 3NOFA 1WE0A 2AAWA 4IQAA 1PGTA 4KDXA 3VWWA 1TTZA 2K8SA 4GTUA 3LXZA 3HXSA 3M1GA 3VWXA 1Y6EA 5ELGA 3A2XA 4OMVA 2ZUPA 3EWLA 2QKEA 2HSYA 5ECMB 5F8BA 4RQXA 2GSTA 2WCIA 2YCDA 2CV4A 3ZVJA 4DSQA 2GTUA 2WGRA 2VAFA 5G5EA 3MWHA 4GWRA 3LFLA 1B9YC 3F9UA 5G1LA 2X99A 2B7JA 6GSUA 3LYKA 4JU5A 3C1RA 1ZCPA 2KP2A 1M9BA 3LWAA 4MCUA 1BX9A 1TK0B 4ACSA 3DYRA 3GH6A 3TRPA 3DKSA 1YKCA 1XXUA 4J57E 4TXOA 2FA8A 5D8IA 2GSRA 2E0QA 1SKSB 1ILOA 3IE3A 6GSSA 2VD1A 2VOCA 4AJ8A 4ZBDA 4F2IA 5GAPD 2YWMA 2WB9A 3SBCA 1JLVA 1GLPA 2OADA 2LEGA 2OBIA 3F4SA 2PU9C 1K0MA 4V2NA 5CP1A 2V41A 4FYCA 4HEA2 5ENUA 4K7OA 1GWCA 4AGSA 4ML6A 5HQPA 3LSZA 4JZQA 2KHPA 1FVKA 3M8NA 1PA3A 4G10A 3E9JB 5HR2A 2B1LA 2I81A 2HSHA 1YEXA 2OBKA 2PPTA 2GQKA 4DSSB 2HI7A 1MEKA 1XVQA 2H6YA 4XHMA 2IWTA 2YOIA 2LTKA 5DQSA 1UC7A 4GSTA 4F82A 2GZZA 3DEXA 3GL3A 3O6TA 3D4TA 1ABAA 2XC2A 2YV9A 3TCOA 3UL3A 2V6KA 2YZHA 3LQ7A 4V1Ap 3APSA 3DVWA 3Q6OA 1O85A 2IMIA 3L0HA 4MMMA 1AUCA 2CAIA 2IFQB 3KH9A 1WRYA 1GSUA 5B8AA 4IP6A 3GIXA 3GKMA 1YQ1A 3TRQA 1A23A 4HU9A 1VF2A 2B5EA 3JCML 4MZCA 2DMLA 4TW5A 1PMTA 1TXXA 2L5LA 3NZNA 1X5EA 5IM9A 2V6OA 1GNEA 1RW1A 3KJYA 2HRFA 3D4MA 4IJ3A 4MJAA 1YKAA 5DCGA 4MABA 5IO2A 3QDNA 3QR6A 5DAKB 2GQMA 4NHWA 2YPMA 1Q4JA 4WEYA 4RQRA 2BJXA 1NM3A 4BA7A 5A4UA 3IV4A 5D9VA 1V98A 1BYEA 4XS4B 5B8BA 1TOFA 3IAS2 5D73A 2NVLA 4AJ6A 4Q5FA 3ZLPA 5C04A 1KBNA 4QQ7A 2LQQA 1U3AA 1T4ZA 1J9BA 4IQ1A 5KN0A 4P3YB 4HQZA 2M80A 4Z7XA 4HOJA 3ZMKA 2REMA 4L5LA 1K0NA 2C0FA 1F3BA 2YZUA 1VF3A 1XWCA 2E2MA 3D6IA 4GSSA 4WR4A 2HLSA 2IMKA 2H1BA 5D9XA 4X1UA 4TVEA 4J56E 2VLVA 5H5RA 4D73A 1K3LA 2L6CA 4N10A 5CRGA 14GSA 1SK1A 4OCEA 4XTSA 2CVBA 3P8WA 1HNAA 2RM6A 1JHBA 3FYGA 1EV4A 2O85A 3TB2A 5CAXA 5J5NA 1V58A 6GSTA 4YQMA 1EP8A 4PNFA 5ECHB 5DVBA 18GSA 1EZKA 4NV5A 1IYHA 3F4TA 1ST9A 1C72A 3L78A 4K6XA 1A2LA 4KCEA 3GURA 2YJ7A 3GMFA 1VF1A 1Z6MA 4KGIA 5CNWA 4O5RA 1FHEA 3UBLA 1XWBA 1M99A 2MZCA 2GZPA 2LUSA 2TRCP 1AAZA 4IN0A 4ECIA 1XW6A 5EY6A 3UIWA 3ZMLA 3H8QA 1B48A 1GH2A 4KB3A 3TKRA 2CX4A 4V2MA 1YDKA 4OCFA 5CREA 3APOA 4ZL8A 3KMNA 1OE8A 2N5FA 1EP7A 1QXHA 4V2LA 1ERUA 3IBHA 2PN8A 2BTOT 4HJ2A 2F51A 1G6WA 2GGTA 1ZYEA 2GSSA 3G7IA 4BVXA 3A5WA 5IMZA 4KNDA 4WBJA 1MDKA 4HU7A 1J08A 1ERWA 2LRTA 3FR3A 3UMAA 4ZL7A 4YH2A 4L5OA 2RUFA 4POMA 3P2AA 1OC9A 4MZBA 4HQSA 1VF4A 3RDWA 2FHEA 4TR1A 1T4YA 3DWVA 1F37A 4K9ZA 2H19A 5LNKe 3SWLA 3KD0A 2J9HA 3QOUA 2X8GA 5GSTA 3WT2A 5DBQA 5H5QA 5JWRB 5HFKA 3FY7A 6GSVA 2H8LA 2L57A 3EU4A 3L9SA 3TDGA 3HJOA 4JBBA 4RUVA 1YF0A 3Q18A 2PGTA 3DVXA 1B4PA 4QL9A 4ZIJA 4DVCA 4MJCA 2C80A 2DJ2A 4IGJA 1QFNA 5ECLB 4K8MA 2G2QA 1N2AA 3GKNA 3WGDA 5F05A 4O92A 1GTBA 4ZL9A 2C0DA 2PUKC 1X5CA 2GT5A 3F6FA 1XIYA 4HZ2A 2NBSA 3EMPA 1WP0A 5CRHA 3ZL5A 3CBUA 6GSXA 3EE2A 3CRTA 1R26A 3VWVA 2DIZA 1SJ6A 3D5JA 1EEMA 4K1FA 3QFBC 3W8JA 2OE3A 4POBA 2MBTA 1XBSA 3EC3A 3HYPA 3F4RA 1PL1A 1SENA 4KUNA 1GUMA 1ZGNA 2KP1A 3HD5A 5J3RA 2N5AA 5HFGA 1FB6A 3GFKA 4ZXGA 2LJKA 2PVQA 4O7HA 2VCQA 4N11A 5DCHA 3TKQA 1XW9A 3IAM2 3KZQA 4IBPA 3BJ5A 2CQ9A 1T8EB 2C3NA 2WFCA 1O8WA 2QC7A 3FZ9A 2H6XA 5ECOB 3RHBA 1GUKA 4PUAA 5IO0A 1GP1A 2L59A 2VCTA 4FYUA 2YWOA 4KSMA 4MJBA 3UVHA 2FLSA 1THXA 1ZZYA 1MTCA 2X64A 2DLXA 2EIOA 1FW1A 1NHOA 2H72A 5IMAA 4MK3A 4EDYA 1JLWA 4I8BA 1SKWB 1U3IA 3A3TA 2DC5A 3O3TA 3E3EA 1V9WA 4GXZA 1MD3A 5DALB 3TRXA 4AJ7A 4MJEA 4MF7A 1FOVA 4KH7A 2YV7A 5IOWA 2CT6A 3P7XA 2MMNA 3A2WA 1SJZA 3WGEA 4Q5RA 1A0FA 1XWKA 3CTFA 3E0UA 2VIMA 3O76A 2X8CA 5L71A 2DMMA 2J23A 3VFIA 1ZYQB 1GSEA 2GVPA 5A5KA 4MF5A 3D0ZA 4GQCA 1R4WA 3TGZA 3Q74A 2LJRA 3CTGA 4TR0A 4JR6A 1U6TA 4GCIA 5IMCA 2R37A 1TRUA 3HJMA 3GTUB 1TDIA 4ILFA 3IK7A 3I69A 3KH7A 2PBJA 1OC3A 4CHSA 5ECIB 5IMVA 4XRAA 5DDLA 2JACA 2PVOC 2GS3A 2C8UA 1I5GA 3NIVA 5GAND 3C71A 3C8EA 4K7IA 10GSA 1GUHA 3HVXA 2P0GA 3RPPA 4Q5NA 3GNJA 1TKDB 2O7KA 3MDKA 1FB0A 1X9SB 4PGTA 1S3DA 2WS2A 3IA1A 7GSSA 5E59A 2K8VA 4G2EA 1W89A 3HVVA 2TIRA 1A8LA 4NWYA 1IYIA 4N0ZA 3W6GA 4ID0A 5ABRA 5ELAA 2NDOA 3CRUA 3F0IA 2B3SA 1TU7A 1RQMA 3C73A 2IJYA 1F2EA 2VO4A 5ECKB 1O8XA 5EVOA 2LRCA 4K0GA 5JCGA 1CQHA 3DMLA 4EDZA 4FH8A 5JWQB 4TR3A 4WBRD 1BQ7A 4HZ4A 1TI1A 3LEFA 4TRXA 2FA4A 5ID2B 2LNSA 2R2JA 3UEMA 1VGLA 1QUWA 1K0BA 2O87A 1EV9A 1BEDA 2HNLA 4L0WA 4PXOA 2A2RA 1ACVA 4MF6A 4ZB9A 2VL2A 4IP1A 2JU5A 5IPGA 1AIUA 4WXTA 4G19A 3LXTA 1LJRA 5D9WA 2KOKA 4DSSA 2IN3A 4FYBA 4I5QA 3FK8A 2GSQA 4N0VA 2QSIA 4MP4A 1FVJA 3GX8A 2CZ3A 4XCSA 3U6VA 1GTIA 2DJKA 2NPBA 4K2DA 1F6MC 4GF0A 4I2TA 4LMVA 1USBA 1SD8A 3BD2A 2TRXA 2VCZA 3QAVA 4XS6A 4DEJA 2IFQA 3F3RA 1EOHA 4ZILA 2G0FA 3HZ4A 5IMDA 13GSA 1UA5A 4LL4B 2XPDA 3HHVA 2H66A 3BCKA 4CDOA 3I6AA 3MNGA 3WYWA 2F8FA 2FGXA 4TN8A 1M0UA 5KN1A 2ZCTA 4BWSA 1GSQA 1A2JA 2X8HA 3KXOA 2H1GA 3FZ4A 3U5RE 2C3QA 1TRSA 2DJJA 2OA7A 4I2UA 3HCZA 3KEBA 3M9JA 5AIVA 4ECCA 1YY7A 2AYTA 2M46A 1TI3A 4KX4A 1LU4A 1ZL9A 1ML6A 4E8HA 1Y25A 1RK4A 5DAKA 2CAQA 4I6XA 1FAAA 3PH9A 4LL1B 3D22A 3FZAA 2OJLA 3HY2A 3TKSE 4KCAA 3ME7A 1K0AA 2OE0A 5HR0A 2YANA 1B8XA 4PX1A 4WR5A 2VL3A 3TKSA 4XS4A 2DBCA 2DJ0A 4MPFA 1AW9A 4ULXA 5ECNB 2JZTA 5JWOB 4GRFA 3IPZA 3UJ1A 2CVKA 1YJ6A 1ZOFA 2VL2C 3IDVA 3BOAA 1UN2A 2H6ZA 3FHKA 3K8NA 2JSYA 3C1SA 4KDYA 2I3YA 1Q98A 4IHUA 1O81A 3ZRDA 4YQUA 2VCWA 4IELA 2RIIA 1SKRB 2VL9A 2C1YA 2V1MA 4HJMA 2NTOA 1SL0B 3PINA 3G7YA 3CYNA 4TXVA 2R3XA 2YNXA 5ECRB 2HYXA 3IOSA 5AN1A 2IMDA 12GSA 1G7EA 1A24A 4ISDA 3IHQA 3US3A 1CQGA 3H4KA 4MA9A 2JL4A 1GSDA 2V2GA 2VD0A 3J7Yk 1UVZA 1TRVA 1HNCA 3GX0A 4EVMA 1M9AA 3KM6A 1I9DA 4ZB6A 3H79A 2F3MA 4JRRA 2B7KA 2E2GA 1A8YA 1MD4A 3CSIA 1DE2A 3I43A 1SJIA 1GTUA 4O32A 19GSA 3OR5A 2VUPA 1DUGA 2CZ2A 3M3MA 4ECBA 1OVNA 1Z3EA 1PX6A 3M0FA 3EURA 1K3YA 4LMWA 5J41A 5IPHA 5G5FA 3EMXA 2H0HA 3KTLA 1MDJA 2KLXA 5D96A 1GSSA 3KIJA 1A0RP 1SYXA 3TKSC 3KCMA 4BPYA 4OD7A 1EEJA 2V32A 2C4JA 3DRNA 5B6NA 3KGKA 4BVYA 1TU8A 5ECPB 2VM1A 2ES7A 4XS1A 1S3CA 3VLNA 3VI7A 1HNBA 3HVSA 4TOPA 5J9BA 3TJGA 3DIEA 2HZEB 4ZBBA 3CMIA 2H30A 2L6DA 2LV3A 4F03A 1GSYA 5B6MA 1K0CA 4L0UA 1LBKA 2E7PA 2H0GA 1M2BA 4WETA 3ZTLA 5G31A 3PR8A 1HQOA 5C00A 3KMOA 4IVFA 2ON5A 4WKWA 1SL1B 3BCIA 1EWXA 3TUEA 4YAPA 4PQIA 5A4VA 1OYJA 3QFAC 3FZ5A 2HE3A 2A4VA 2C0GA 4GLTA 3QCPA 2KUCA 3HA9A 1H4OA 2H73A 22GSA 1GNWA 3ED3A 2Z9SA 1TP9A 4NHZA 4F0CA 5LCZA 1QMVA 1XZOA 4Q5QA 2I1UA 3WGXA 1TK8B 2DJ1A 1M2DA 1GLQA 5IMFA 1XWAA 2B5XA 1YEPA 3F63A 2YN1A 2GQLA 2OACA 1V57A 1R5PA 1MDIA 4E8EA 1GTAA 5JCUA 2EIRA 4KSOA 1PRXA 4PNGA 3WT1A 2R4VA 1QGVA 5GZZB 2VLUA 4OFNA 3FKFA 1HYUA 3IXRA 2HT9A 5FWGA 3L4NA 3C7MA 4OFTA 6GSYA 5KN2A 1R7HA 5H5SA 1Z5YE 2DSAA 2P31A 1WJKA 4ECJA 4FO5A 1J0FA 2ALBA 4IS0A 3VURA 3DXBA 4AF2A 3UAPA 5FT3A 4EE0A 3ZITA 3LG6A 4KE3A 5HR1A 1JZWA 2VLTA 2WRTA 2ON7A 4MZWA 3PGTA 3LGCA 2K9FA 2F8AA 1BAYA 3EVIA 3RHCA 1SL2B 1JZDA 3ZIVA 1E6BA 2OE1A 2IMEA 3TKPA 2CVDA 3EU3A 2VCXA 3F6DA 1M2AA 4MLYA 1WMJA 4TXOB 3TOTA 5F07A 5DALA 1X0RA 4XIHA 3HJPA 4OO4A 5A4WA 2MYGA 5B7CA 2AHEA 1WWJA 3GA4A 2HZFA 4EXJA 1HD2A 2EC4A 3ZVJD 2IPAA 5LD0A 2VM2A 3P90A 1ERVA 3UARA 2H74A 1PKZA 1X9WB 1SD9A 3FRCA 2XHFA 1GULA 2EIQA 2H1AA 3ERFA 2QGVA 4WF4A 3APQA 3GRXA 1Z7PA 4TR4A 1XFLA 1AQXA 2AB6A 1DSBA 2I9HA 4K0NA 2H75A 3M9KA 1F3AA 3GSSA 5IIZA 4IKHA 1EGRA 3FEUA 3GTUA 5D9TA 3HZ8A 3TJJA 4XRDA 3G9BA 2GDRA 2PWJA 5F0GA 4HI7A 4ML1A 1XPVA 1R5AA 2P5QA 8GSSA 2B1KA 3UOMA 1XVWA 4F0BA 1Z7RA 3UBKA 1GSFA 4KW6A 4WF5A 1K0DA 5CRWA 2H70A 3HKRA 4FIWA 2A2SA 1AQVA 3S9FA 1WPIA 2LQOA 2O8VB 5CO3A 3GV1A 17GSA 1G0TA 4GSNA 4K7NA 2JADA 1ERTA 3FR9A 1YF1A 5EL8A 4HUAA 2FWHA 2FNOA 3QAWA 1EGOA 2FCHA 3GSTA 2B5YA 2GT6A 2R5GA 1OAZA 3ZFLA 3ZZXA 2XBQA 3QAGA 4V1Ag 2K6VA 3FW2A 2FWFA 2H1DA 4PUFC 3F3QA 2H76A 1TRWA 2LJAA 2MBSA 3BBYA 5ID2A 3ZIJA 3AY8A 1E2YA 4MH3A 4H86A 2LRNA 1AQWA 4CW9A 1KEBA 1KTEA 2MMAA 1O7UA 4J2FA 1SU9A 1TK5B 3UVTA 1N8JA 1T00A 3DGQA 4KA0A 3TJKA 3ERGA 2GLRA 4RI7A 3ZFBA 2WZ9A 1V40A 1KNGA 3IK9A 3L9UA 3ME8A 4NAXA 2FY6A 4X43A 5J9CA 5EPFA 3L9VA 4YQVA 3ZREA 2IIYA 4IW9A 1TJDA 1NHYA 1ON4A 3LORA 1SK2A 2XPEA 4OO5A 3IRAA 20GSA 2JZRA 2RUEA 1JFUA 3GH9A 3VK9A 4NV2A 4KDUA 3ISOA 4D73B 2YWIA 3FR6A 4ZBAA 3TOUA 11GSA 3TJFA 2WJUA 1V2AA 2RM5A 3MSZA 2LNTA 1G7OA 1T1VA 5HR3A 2FD3A 5E4WA 3GHAA 4EO3A 1GRXA 1SYRA 3LJRA 5IOXA 2R6KA 5KN3A 2PMTA 3QD9A 5CRDA 2IL3A 1URMA 5G30A 1ZMAA 2YJHA 1K3OA 1WIKA 2C3TA 3H93A 5G2ZA 2IMFA 3ERWA 3TJBA 1XWGA 4IJIA 1YZXA 1QQ2A 4N30A 4EKZA 4L8EA 2L4QA 3ZYWA 1Z6NA 2HXKA 1O73A 2MMZA 1TW9A 2AV4A 2GZYA 2FWEA 1SK0A 1B4QA 5INYA 2DIYA 2DJ3A 4BL7A 3N5OA 4QL7A 1QK8A 4NMUA 1PSQA 3LYPA 2H0IA 2K18A 1H75A 4I97A 2I4AA 5IQYA 4NPBA 4OFMA 3GKKA 2RLIA 2WULA 1BG5A 9GSSA 3IC4A 3WD6A 4GQFA 4POLA 4MH2A 4F9ZA 3Q19A 4PQHA 5HFIA 1G6YA 3QMXA 4POKA 3W8SA 5JCWA 4JR4A 5AISA 3RBTA 1X9MB 1T7PB 1OC9B 1XOBA 4TR1B 3GN3A 2L4CA 4NXIA 1XW5A 1OKTA 2XBIA 2L5OA 3R2QA 1PX7A 5DQYA 1U87A 3D21A 2LKUA 3VWUA 5G1KA 4LLRA 3KTBA 3VPTA 3IR4A 1DBYA 5DJMA 1S3AA 2B6MA 2YWNA 1W4VA 1WOUA 1VRSD 3CXGA 3F8UA 3CSJA 5AGYA 1XOAA 3MAKA 3RPNA 5CYYA 4EF0A 3RAZA 2HRNA 1PKWA 4HS1A 2ZNMA 1GL8A 1BJXA 5FHIA 2CX3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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