1Z6RA

Crystal structure of mlc from escherichia coli
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
395
structure length
382
Chain Sequence
QIKQTNAGAVYRLIDQLGPVSRIDLSRLAQLAPASITKIVHEMLEAHLVQELGLVVETEAWHYLSLRISRGEIFLALRDLSSKLVVEESQELALKDDLPLLDRIISHIDQFFIRHQKKLERLTSIAITLPGIIDTENGIVHRMPFYEDVKEMPLGEALEQHTGVPVYIQHDISAWTMAEALFGASRGARDVIQVVIDHNVGAGVITDGHLLHAGSSSLVEIGHTQVDPYGKRCYCGNHGCLETIASVDSILELAQLRLNQSMSSMLHGQPLTVDSLCQAALRGDLLAKDIITGVGAHVGRILAIMVNLFNPQKILIGSPLSKAADILFPVISDSIRQQALPAYSQHISVESTQFSNQGTMAGAALVKDAMYNGSLLIRLLQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Mlc protein
publication title The crystal structure of Mlc, a global regulator of sugar metabolism in Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 106
structure length 382
sequence length 395
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 1z6rA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1z6rA03
5CYVA 4MLHA 3LM9A 3KP4A 3FZVA 4A2UA 4BR9A 1O3TA 2MH2A 3EKSA 4F7ZA 4A0YA 5JMVA 2FF4A 4KMFA 3CJ7A 5AQYA 3ZN0A 4Q47A 4B1ZA 2BBYA 1Z05A 1QZ6A 3U9ZA 5ILUA 2F9WA 1RIOH 4I7HA 1U2VB 3PQJA 2COMA 4H0OA 4C23A 3FX3A 5AQOA 1OR7A 3HRSA 3F6VA 4UXNA 1S3JA 2Q0RA 1I6XA 4IJAA 3CQXA 5DEQA 4FO0A 4IXAA 2WTEA 2GTDA 2VE9A 5KVRA 3SJHA 1HX1A 3LM2A 5FFXA 1ZRCA 4MTEA 4MQVA 1KU9A 4CDGA 2GQQA 2JRTA 1E4FT 2HF3A 2FMLA 4FWNA 5LRRA 1RZ4A 2H94A 3F8NA 2Q2EA 5E1WA 5FLXK 3SK3A 2Z5UA 3JTHA 5FGMA 2VBYA 1I5ZA 3JSPA 2A40A 1QGPA 3MCPA 3FXUA 4IZ9A 3OHRA 5F2RA 5FD6A 1TUUA 5BMZA 3IKTA 4BRMA 1F1ZA 4U0YA 1YS7A 1R59O 1R7JA 3O2PE 5FO5A 4RCHA 3RJPA 3WXLA 2XGXA 1SMTA 2L3DA 1ZG5A 2LF7A 3V8JA 2P9IA 4ZYEA 1MDMA 3ENOA 4NB4A 1BC7C 1Q1HA 5TRDA 2Z3YA 2ACJA 4H03B 5BN9A 1ZLJA 1I1SA 4GNIA 3WTYC 1K6OA 3BY6A 3O6BB 2QZ8A 4I09A 1T6CA 3FMRA 3HIFA 4D0PA 2G7UA 2YSRA 3E5QA 3O6WA 1S3XA 4IHSA 1IRGA 3N4MA 3V4GA 1HQCA 3O3KA 1EH7A 2E88A 1HUXA 2RN7A 2O6GE 1DEJA 3ZX2A 4ZYDA 2PMHA 1Z6TA 1O7LA 3GDQA 3W6KB 1RI7A 2IJLA 3WTTC 3SMSA 3C0BA 2ESNA 4I6MB 1NGGA 2L4AA 3V8KA 2O61A 1Z9CA 1R58A 5K5QA 1ATSA 3VODA 3FZLA 1P4AA 4NQWA 4P5OA 3D5LA 1R1VA 1DKGD 1STZA 1QO0D 2JT1A 4EM0B 4I02A 1DP7P 3I5UA 4QS9A 5BOXA 2KIFA 2CGLA 2W40A 1USTA 4WXHA 1YO5C 2BTFA 5AQQA 4BC5A 2DFIA 2ZCWA 3I0TA 2XROA 4L9JA 1BIBA 5HDGA 3HHHA 3MK6A 2DO7A 4Y0WA 3LL3A 2V1XA 4K2EA 1R00A 1BN5A 3DEUA 3H3UA 5D6FA 2FSJA 1KGSA 4YIFA 1REPC 1O7FA 2LKPA 2NYXA 1MD0A 3FXQA 5DD4A 1DPRA 2YCHA 5AQPA 3DFGA 1XGSA 2FSWA 2XAHA 4BGAA 1GLJO 4G7HF 2QWRA 5AIPA 3E97A 4MTDA 2ZBKA 2LF8A 4BR0A 3O8MA 4PKGA 1JGSA 4CZIA 2D4WA 2IT0A 3P4IA 3TO6A 4HF0A 4BRQA 2QW9A 2OZ6A 3QICA 1FZPB 3WQUA 1U2VA 3D2EB 2X4HA 3DXKB 4LD5A 4M63C 3LWFA 2GWRA 2H3GX 3F8FA 1SD5A 3IFRA 2FRHA 2NZTA 4DQ8A 2FXUA 5L3DA 3KLNA 1YQAA 1HKGA 4A0ZA 1SAZA 3KZBA 3KE2A 3WODF 1QQIA 1A04A 1MDUB 4ZH4F 2F5EA 1XSDA 4YDUA 4ESJA 2P9PA 2J4RA 2CO5A 3DPLC 3CJ9A 3H92A 4U7DA 5LHHA 2PG4A 1K78B 3R0JA 3O80A 4U7BA 2KKOA 4ASNA 1K8KA 2OANA 5ADXH 2ETHA 5CVVA 4EVIA 4RGRA 1QHAA 3LAJA 1WKMA 3LDQA 2LSOA 1U6GA 2PQ8A 3F8CA 1Y0UA 2FEZA 1J75A 4K43A 2NAZA 4YIIA 4G6DA 3VF2A 3GEZA 4KMUX 3A5LC 3DWLA 2P7VB 3KP6A 1W4MA 2H27A 2EK5A 5JHUA 3JXUA 1D4XA 4CD3A 1LCUA 1FLIA 3HRTA 3UKRB 4EJOA 1SMYF 3VETA 5JICA 2PMUA 4FOEA 2ZGYA 2QWWA 5E26A 2CSOA 2HZTA 5D5VB 4GCVA 2A61A 5EEHA 5FD5A 2V79A 1F5TA 2V7YA 4FPBA 2HOEA 4CICA 3GFMA 2OU2A 1GVJA 5HVQC 1H9TA 2HKOA 2EWNA 3QFUA 3JAMK 1NGCA 3VEPA 5D8LB 3ZMUA 1P92A 1XCVA 2OZUA 3CETA 1SD6A 2QBYB 2VBWA 1R5GA 3MAJA 3M8EA 3RKXA 1U8RA 2P9KB 1ATRA 4HOBA 2ZGZA 1NGBA 1FX7A 3A8YA 5LGTA 3FZFA 4OOIA 1NMDA 4MLEA 2PFBA 4BGBA 3E6MA 3HRMA 1G3YA 2EWSA 3FWEA 5HS7A 1HXDA 4BC4A 4FSVA 4KN7X 5CVIA 4KT5C 2ASOA 1FP2A 2JSCA 4ISGA 3MZHA 5AQVA 2HYGD 1XMAA 2ISYA 4IWVA 3WGIA 5AQLA 4CZJA 1V4RA 4RGSA 1PP8F 3KP7A 2UXXA 2IP2A 4WWCA 3DJCA 3CJBA 1Z6RA 1HKQA 3IWZA 3WE3A 5ICFA 2DQLA 5AQSA 4FX4A 5LJVA 3VB2A 5AQGA 1WRJA 2A5XA 1D5VA 1IRFA 4ESFA 1JHHA 3KVGA 1V3FA 2P9UB 3RYRA 4U0VA 5ICCA 2I7NA 4GGGA 2QWNA 3CUQC 1SFEA 2EFPA 3ZETB 2JPBA 2DPUA 4A6DA 4OMZA 5AZIA 5DYMA 3C7JA 4PZJA 3ZMZA 1HKCA 3BJOA 2V1UA 2M30A 3E6DA 3D2EA 3GLXA 4ETSA 4M7YA 2H6BA 2YU3A 3L9FA 3WTZA 3VOEA 4ZZLA 5L3EA 5JI6A 4B1XB 3AARA 4JD2A 2ESHA 4JHDB 1QZ5A 4MGRA 1X9JA 2FA5A 3WGHA 2JPCA 3RKWA 2W84A 5ICGA 2HEOA 1WWXA 1FSHA 3WXIA 3QP5A 3DKWA 4CZZA 4B1UB 2Z9OA 3WU0A 1I27A 3H3ZA 3FF5A 1TW2A 3KHYA 1OMIA 1EQYA 2VXZA 3F9MA 1J6ZA 3ERED 3M1EA 2IW5A 1QNTA 4ENJA 1WI9A 1QZYA 3VERA 1U6ZA 4UV8A 5FPMA 2P6SA 2D1HA 4S05A 1GLCG 2CH6A 5TJJA 4UV9A 1CGPA 3MQ0A 4IF4A 1OPCA 2FXAA 3I71A 2A6AA 2GA2A 2PBDA 4L5JA 4IHTA 5ILVA 2QUFA 4LJZF 4WX9A 3DXMB 4PL7A 1B4AA 3ABUA 5BPNA 5KPRA 5IT9Z 1TBXA 1XN7A 3H46O 2VBZA 1HW1A 3L00A 5AR0A 2L02A 3R61A 3L0QA 2DLLA 4CZHA 2P9IB 1MDMB 3L2CA 1P6RA 2E2PA 2AXLA 2VOPA 1B59A 2QWPA 5EX5A 2HYFA 2JTVA 3WE2A 3RKYA 2W41A 2HF4A 2VONA 1XUPO 4IXCA 4MNUA 4HF1A 3HZ6A 2GEMA 4KBOA 5ICEA 4HX7A 2CGKA 5AQIA 4KYWA 2HQNA 4FL9A 1IF1A 2VBXA 1B9MA 1P4WA 3ZEUB 4H0YB 2O0YA 5H6RA 2V9VA 3KP2A 3R6SA 4R8HA 5A2QZ 4CGZA 3RPQA 5HLIA 3JSOA 2ZXJA 3ULQB 5DCFA 4XLNF 3TO9A 3WTUC 4CO8A 2DQRA 4N9IA 4L9TA 1QPMA 4MEYF 2E20A 3DV8A 5JVTA 1RFQA 3K9TA 1ZREA 5IT3A 4YFNF 5AQHA 4EHTA 1ON2A 4M6XA 2Y48A 3KP3A 3WEEB 5HDKA 3HTSB 3ZMVA 2P6TA 2P5LC 3F8MA 2UYTA 1UB9A 1MA9B 3H1QA 2RNJA 4PGGA 4BQZA 2ZO4A 4A5NA 2GA1A 2A07F 4BRFA 2UWMA 2P9UA 4FHTA 2E1ZA 1YIOA 3WTWC 1XD7A 2YHYA 1NBWA 3T8TA 1HKTA 1ZAOA 3ZMTA 2P8TA 1XGMA 4EIAA 4XRFA 1T38A 2QWMA 1L0OC 2XAFA 2E2OA 4AWXB 3BZ6A 3ECOA 2FF6A 5J8CA 2R7DA 3P9IA 1JXSA 1B6AA 4HQMA 5AQXA 2ASMA 1X3NA 1BI0A 2H09A 2AP1A 2XVCA 1YAGA 4JHDA 4HYEA 3IKVA 3GX4X 3CDHA 4WQ4C 3DAWA 1D3YA 5FFZA 2ADUA 4IRIA 2VYPA 1GXQA 4I98B 3S2WA 5KQDA 2K27A 1FC3A 3LDOA 4AM7A 2FSKA 2PJPA 4JNEA 1FOKA 1NM1A 3FXRA 3CI5A 1O3QA 1IN7A 3JW4A 3NRVA 1FSEA 3T8RA 2OQRA 3HTUA 3LQRA 5KQ8A 1BM9A 2P9PB 1CF7B 1KQ8A 3RI4A 1T6SA 3I64A 3CJNA 3B02A 2XIGA 3A5MC 4HTLA 4YFKF 1BA0A 5LEKA 2F5CA 1K8KB 3MZYA 4WXDA 2V7ZA 2F5FA 3EYIA 1KXPA 5D4RA 2A3ZA 1EH8A 3DXMA 5FPDA 2KRFA 2Q0UA 1YW9A 4XBFA 5KPTA 4BRPA 3F72A 3UE5A 2FU4A 1R5HA 4EM1A 4CZEA 2V52B 5BN8A 1L3LA 1R36A 3EN9A 3LDNA 3FM3A 1LDKB 1RGIA 4Q4ZF 4FWKA 4XH1A 3O5BA 3RIRA 3BROA 2CQKA 1C0WA 4HBLA 1NGHA 4LLNA 3CERA 4AD9A 1RUNA 5D5WB 4EAHD 3NQOA 1JCFA 3VENA 3J81K 3UKUA 2RVCA 1ZC6A 2QLZA 3E6BA 5AQTA 4ENNA 3VGKA 2MH9A 2EJRA 1I1GA 4A6EA 3ZEUA 4O5FA 1GHCA 4BHCA 3A5NC 1TQMA 1KAZA 2NLXA 5E8IA 2I7PA 4HLXA 1J9IA 3J80Z 1TYQA 1LEAA 3FFKB 4RAZA 2AS5F 4JQFA 2QM3A 3DP7A 2IA1A 4O6JA 5AQWA 3LFKA 3VOVA 4KFCA 5E17F 4KICA 1ULYA 2ISZA 4MQ9F 2EA2A 1HKBA 1KYWA 4BRNA 4BXUA 4CYDA 4WXCA 2YX7A 3E5XA 2ZKZA 3WEEA 3WU1B 4B1YB 1NGDA 2W57A 4NHJA 3Q9VA 5JLHA 3TO7A 3TPQA 1LJ9A 4CZFA 4UHTA 1G3SA 5L3FA 3RDIA 1FYLA 2A6HF 2A69F 3COAC 5E8GA 2Q0OA 4KNYA 4CZLA 2Y0MA 5DCMA 1WUAA 2UXNA 3WUHA 1O57A 4BRGA 1NGIA 2D45A 4G8XA 2Z33A 4BC3A 5AZJA 4UVCA 3FR0A 3V7RA 2CH5A 1WQ2A 3HSCA 4ZYGA 3VESA 1AOYA 4UUVA 3CTAA 5AZIB 3RSEB 2FE3A 1F9NA 1RDWX 3BOQA 4HV6A 2NS0A 5HLGA 2A68F 2XAQA 1GXPA 4JD2B 1FBQA 4FT8A 4RB0A 2A6EF 2QWOA 4N0BA 1D8JA 2ZMEA 3W3DA 2QWLA 4EGZA 4Q5SF 2W24A 2MLKA 1J7KA 4M72A 5CVRA 4L9VA 5CE3A 1CF7A 3SLCA 3WTSC 1ZYRF 3H6EA 2M45A 4FWSA 5AQMA 3HBTA 3KEQA 1BG3A 2DPNA 3LA3A 3M7GA 1YS6A 3IWFA 1BA1A 4XEIA 4KA4A 1IN5A 2WWYA 2P5KA 3MN5A 3B8AX 2EFNA 1BUPA 4M9SA 4CXFA 2ZWHA 3ATVA 5AQKA 2YPRA 1U5TA 3VPZA 5D6EA 1X3MA 1ESVA 5AQFA 2GWJA 4ISEA 1IXSB 2PN6A 2XRNA 4BRCA 5BREA 5H6QA 2A5YB 2HMPA 4BRKA 4UVAA 2F2EA 2IA0A 4P9UA 5BRDA 1TQPA 3JS6A 1QZZA 4N9HA 2FNPA 3ENHA 4CBUA 3HM8A 3QU3A 3D0SA 1YW8A 2XASA 4FWMA 1RNLA 1UHWA 5LHGA 2PBIA 1X3UA 4LLGF 4AM6A 5F6FA 3EUHA 4PGHA 4EV0A 3ZPLA 1PDNC 1IW7F 4WQ5C 1AWCA 4BHBA 4S04A 2STWA 1SFXA 1BU6O 3TDZC 2VT2A 3GF2A 3VGMA 4WK8F 3FZKA 4JBAA 5LGNA 4LGWA 5JLFA 1ZGAA 3R6MA 1MJ9A 4BRAA 1YFHA 1XMKA 4L3QA 1EH6A 4DB3A 2MC3A 3EZWA 3SZPA 5CVJA 2IVPA 3EKUA 4EJWA 1H0MA 4KIGA 1NWKA 4DHYA 5AQJA 3I58A 2DI3A 2KHOA 5CJ9A 4B1WB 2O3FA 3GG4A 2RKHA 4A61A 3DF8A 3O4WA 3HOSA 4G94A 4H5RA 2R3SA 5AQNA 3N97A 3U9DA 1T2KA 2GXGA 2LNBA 4LK0F 2YHWA 1W5SA 3MN9A 2HDCA 3GOIA 3ECHA 3BF3A 3M1FA 1SZ2A 1DPUA 5DUIA 5HS9A 3KZZA 4EQQA 1EV7A 1ZLKA 2K02A 1U78A 3MFKA 2Z99A 4M74A 3K1PA 4OU0A 2Q36A 3I4PA 5ILSA 4BREA 4FX0A 3L4IA 2ZNYA 2GZWA 3I54A 2FBHA 3RSEA 1ZG1A 2DK8A 3ELKA 4M6YA 3FE1A 4EFHA 2Q2RA 1KU2A 4CBWA 2AA4A 3VFZA 5L3GA 1BIAA 1H9GA 3DPTA 5F1RA 5AQRA 2VODA 3GXOA 4ENKA 1ATNA 3A5OC 3GE1A 5LHIA 1BI3A 1GLFO 1ODDA 3J8AA 3CO7C 1USSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5CYV A;  4MLH A;  3LM9 A;  3KP4 A;  3FZV A;  4A2U A;  4BR9 A;  1O3T A;  2MH2 A;  3EKS A;  4F7Z A;  4A0Y A;  5JMV A;  2FF4 A;  4KMF A;  3CJ7 A;  5AQY A;  3ZN0 A;  4Q47 A;  4B1Z A;  2BBY A;  1Z05 A;  1QZ6 A;  3U9Z A;  5ILU A;  2F9W A;  1RIO H;  4I7H A;  1U2V B;  3PQJ A;  2COM A;  4H0O A;  4C23 A;  3FX3 A;  5AQO A;  1OR7 A;  3HRS A;  3F6V A;  4UXN A;  1S3J A;  2Q0R A;  1I6X A;  4IJA A;  3CQX A;  5DEQ A;  4FO0 A;  4IXA A;  2WTE A;  2GTD A;  2VE9 A;  5KVR A;  3SJH A;  1HX1 A;  3LM2 A;  5FFX A;  1ZRC A;  4MTE A;  4MQV A;  1KU9 A;  4CDG A;  2GQQ A;  2JRT A;  1E4F T;  2HF3 A;  2FML A;  4FWN A;  5LRR A;  1RZ4 A;  2H94 A;  3F8N A;  2Q2E A;  5E1W A;  5FLX K;  3SK3 A;  2Z5U A;  3JTH A;  5FGM A;  2VBY A;  1I5Z A;  3JSP A;  2A40 A;  1QGP A;  3MCP A;  3FXU A;  4IZ9 A;  3OHR A;  5F2R A;  5FD6 A;  1TUU A;  5BMZ A;  3IKT A;  4BRM A;  1F1Z A;  4U0Y A;  1YS7 A;  1R59 O;  1R7J A;  3O2P E;  5FO5 A;  4RCH A;  3RJP A;  3WXL A;  2XGX A;  1SMT A;  2L3D A;  1ZG5 A;  2LF7 A;  3V8J A;  2P9I A;  4ZYE A;  1MDM A;  3ENO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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