1Z7RA

Solution structure of reduced glutaredoxin c1 from populus tremula x tremuloides
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
MASKQELDAALKKAKELASSAPVVVFSKTYCGYCNRVKQLLTQVGASYKVVELDELSDGSQLQSALAHWTGRGTVPNVFIGGKQIGGCDTVVEKHQRNELLPLLQDAAATAKNPAQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Insight into Poplar Glutaredoxin C1 with a Bridging Iron-Sulfur Cluster at the Active Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutaredoxin
source organism Populus tremula x populus tremuloides
molecule tags Electron transport
total genus 39
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1z7rA00
3WT1A 1NHOA 5CO3A 5J5NA 2HSHA 1DE1A 1U3IA 2NBSA 3M0FA 4ZBDA 2DIZA 1R5AA 1WRYA 1G7EA 1OKTA 4KX4A 5DDLA 5HR2A 1SK2A 5ECQB 6GSWA 3EMPA 1ZGNA 3P2AA 4JEDA 1Z9HA 1B48A 1V40A 2GQLA 4EDYA 5DJLA 5A5KA 1SK0A 2MZCA 1Z3EA 4MH3A 2B5EA 3UL3A 2AYTA 1G6YA 2JZSA 1V2AA 3QPMA 2B5XA 3IHQA 4ZL7A 2BMXA 2HXKA 2VL9A 1JZRA 4GQFA 1DE2A 1A2LA 3FEUA 5IOXA 2VM1A 5IQYA 4QQ7A 6GSUA 5ELGA 4D73B 4KDUA 2TIRA 2FCHA 4FH8A 5JWOB 2L4QA 5H5SA 4EUYA 1XWBA 4L0UA 1SJIA 3UIWA 4V1Ag 5G5FA 4AJ6A 3UBLA 2C3TA 4K7OA 4HZ4A 1T4ZA 1Z7PA 1BAYA 2RUFA 1Q98A 1G0TA 2QSIA 3KJYA 5IIZA 4XS4B 2LTKA 2ALBA 2OBIA 2C3NA 5J4UA 1HNAA 4MCUA 3GFKA 3QCPA 4DSSB 4ZBBA 2H76A 3UEMA 1YZXA 12GSA 2YCDA 4E8EA 2FD3A 2YNXA 3TJFA 2CT6A 4K7NA 1B8XA 1MDKA 1V57A 3GMFA 3IC4A 4KW6A 2HT9A 1OC8A 1BYEA 4OFNA 3QDNA 3M9KA 1BJXA 4IJ3A 2B3SA 3EVIA 4TR1B 1M2AA 1O85A 1SENA 2CV4A 3D4TA 2ON7A 3U5RE 4ACSA 3IE3A 4NXIA 1EOHA 3L9UA 3QFBC 1LJRA 3ZVJA 1CQGA 1K0NA 2CX3A 1ZYQB 5KN1A 4D73A 1LBKA 3LYKA 2LRCA 1K0DA 3ZTLA 2GSTA 2L57A 3ZFLA 3AY8A 4HU9A 3MDKA 1U6TA 4DSSA 1MD3A 3BCIA 1PL1A 1GTBA 2YZUA 3QAWA 1K0CA 3L4NA 3WYWA 2FWFA 1R5PA 3HZ8A 4IN0A 2IIYA 3APOA 2X8GA 4HDEA 2MMZA 5C04A 3IAS2 1X9SB 2RM5A 2YP6A 2HFDA 5IO0A 2DMMA 1H75A 3L9VA 4I6XA 2AV4A 4XS6A 1C72A 1W4VA 1ZYEA 3HVVA 4HEA2 2KLXA 1PRXA 2FUG2 2FWGA 4MZWA 1SYRA 2LUSA 1WIKA 2LJRA 1SK1A 2JU5A 4MMMA 3CXGA 3F63A 3DXBA 4ZL9A 1THXA 1OC9B 1V98A 1M2BA 4Q5FA 1XVQA 6GSXA 16GSA 2X8HA 2EIOA 4J56E 4K0GA 3TRXA 3VI7A 5DALB 2XBQA 1HD2A 5A4UA 5IOWA 3CTGA 3VI5A 2WGRA 5ECPB 2FY6A 4FIWA 4MF5A 2F3MA 2FA8A 4ECCA 1FW1A 1EP8A 3CBUA 4MJAA 3VFIA 3TJGA 1TJDA 3FR6A 1USBA 4WR5A 2CAQA 4EE0A 3EURA 1TDIA 2IMDA 4KNDA 3EU4A 4IS0A 1YQ1A 4KCAA 1ZCPA 3G7IA 3KMNA 2DMLA 5DJMA 2GZYA 3HY2A 5HR0A 2K8SA 1XXUA 1F3AA 1T1VA 3UOMA 2YN1A 5D96A 3EE2A 1XZOA 1GLQA 2AB6A 2VCVA 5KEJA 3VWVA 3LORA 2VD1A 3F9UA 4GCIA 4H86A 3DD3A 2JZTA 5F0GA 2VL2A 3WGEA 4O7HA 1WWJA 3G7YA 1K0OA 4PNGA 4YH2A 3IV4A 4F0BA 2DJJA 1JZWA 1Q4JA 4TR0A 5IMCA 4PUFC 5F07A 3F3QA 3DRNA 3D4MA 5INYA 1PQNA 2JADA 3UAPA 3QAGA 14GSA 2JSZA 3APQA 2ZCTA 2B1LA 3LFLA 5B7CA 4WF5A 4L5OA 1TRSA 1NHYA 1SJZA 4AF2A 3GKNA 4EL1A 3TKSE 2KUCA 2WB9A 4V2MA 3I6AA 1BEDA 4ZILA 3FY7A 5GSSA 1O8XA 2LRNA 1JHBA 4XHMA 3R2QA 4XTSA 3E3EA 2YANA 4OFMA 3KTLA 1X5DA 5A4WA 4N11A 1M99A 2OADA 4GF0A 5KN2A 1EV9A 4KA0A 3H79A 1TK5B 2GS3A 3RBTA 2H19A 4ID0A 4KSOA 1Y6EA 3QMXA 4NAXA 3FKFA 3KH7A 1S3DA 1TRVA 2CVDA 2E2MA 3I69A 3RDWA 1DBYA 1GSDA 3G9BA 1FVKA 1QFNA 2WJUA 2DJKA 2H0GA 1JZDA 2FGXA 1O6JA 3W8JA 2FWEA 19GSA 2IMIA 5F06A 4PQIA 3VWWA 4JBBA 3LEFA 4RUVA 4PUAA 3FZ5A 2L5LA 4PNFA 3TKSA 3IR4A 2HRFA 2PGTA 2LRTA 9GSSA 2LNSA 3PH9A 2L6CA 3TUEA 4POKA 4HQSA 4JE1A 4DEJA 3KP9A 2OE3A 1VGLA 3IRAA 2YPMA 1TXXA 4I2UA 1N8JA 1HYUA 4JZQA 2AHEA 3ME7A 2NVLA 4G9HA 4JR6A 1XWAA 1MD4A 5D9TA 2HLSA 3Q18A 5D9WA 2H66A 4HS1A 2IMFA 2RIIA 2YOIA 2QC7A 4FO5A 2I3YA 3KMOA 2R4VA 2L5OA 1I9DA 3DIEA 1UC7A 2HRNA 4IGJA 5F8BA 1A0FA 3K8NA 2N5FA 2VIMA 1U87A 1E6BA 1WJKA 1KBNA 3EYTA 3UBKA 2WFCA 4WF4A 2Z9SA 2HZFA 4EVMA 2CVBA 4XS1A 2K6VA 4CHSA 1VF1A 4N30A 3BJ5A 2KP1A 2O8VB 1OE7A 3PGTA 1YKCA 5IMFA 3Q6OA 2GT5A 2PN8A 1ZZYA 4OCEA 3UJ1A 4ML6A 1F6MC 1GNWA 3UVTA 3GIXA 1RQMA 18GSA 1EV4A 4N0ZA 2HSYA 1TRUA 1TTZA 1G6WA 5FWGA 2OBKA 5G31A 2VL2C 2LQOA 3FR9A 1CQHA 2CAIA 3TOTA 1TP9A 1AQWA 4PGTA 1PMTA 2X99A 5DAKB 1GSQA 4HJ2A 3UVHA 5EL8A 1BX9A 2YWOA 3DVXA 3GX0A 1ERTA 2X8CA 3DYRA 3ZIVA 2RLIA 5ECIB 1QUWA 4G2EA 4NWYA 2CQ9A 1UN2A 4XRAA 3HVXA 2JZRA 2ON5A 4KDXA 20GSA 4YAVA 2GTUA 3KXOA 5ECHB 4CW9A 4BA7A 3HCZA 4JU5A 4EC0A 5G1KA 1ERWA 2QGVA 3HJPA 3ZIJA 2IWTA 2IJYA 1QMVA 2D2ZA 3GV1A 2GLRA 2PUKC 4K9ZA 1WPIA 1URMA 3L0HA 2DBCA 3N5OA 5JCGA 2GZZA 2WRTA 6GSYA 4PX1A 1PN9A 1BG5A 3ZLPA 3FZAA 1UA5A 4KAEA 1XOAA 4NV2A 4WKWA 1O81A 3BD2A 2E7PA 2YZHA 3ZMLA 4IHUA 2MMNA 3VK9A 3FHKA 2H74A 3U6VA 1PKWA 2MBSA 1GSEA 3FZ9A 2MMAA 5KN0A 2MBTA 3US3A 1T00A 1X5CA 5ECKB 1AUCA 2B7JA 4K6XA 4MF7A 1K3LA 3A2WA 3GHAA 3P7XA 4O5RA 5D9XA 1AAZA 2C4JA 5ECOB 2NTOA 4QL9A 5COHA 1ACVA 3LXTA 5LCZA 3IAM2 1MEKA 3LG6A 3QD9A 5AIXA 4WETA 2V1MA 2K18A 3IK9A 3WGDA 11GSA 3FRCA 1GSYA 2VAFA 4Q5QA 2I1UA 5HFGA 2PVQA 3HVSA 3G7JA 5J41A 2VD0A 4ML1A 3EINA 3FZ4A 1FOVA 2PMTA 1NSWA 3TGZA 5FT3A 3TB2A 1YEPA 4G10A 2WS2A 4K7IA 3CYNA 4ZXGA 3CSIA 3CTFA 1A8YA 2GGTA 2GQKA 1WE0A 3Q19A 1M9BA 3ME8A 3NOFA 4RI6A 5ENUA 1RK4A 4PQHA 5DCHA 2G2QA 1FHEA 4XS4A 4Z7XA 4HI7A 1X9MB 3WT2A 5A4VA 3ZZXA 1IYHA 2CX4A 2LEGA 5HFKA 2O7KA 2VCTA 5ABRA 1A0RP 3Q74A 5FHIA 2EIRA 2LNTA 4ZB6A 4L8EA 2VUPA 5IMDA 2J23A 1O73A 4IP6A 2DJ3A 2XPEA 4LA1A 1Z6NA 3HA9A 1MDIA 1EGRA 4TXVA 2AJQB 4TR3A 4Q5RA 1TI3A 4POLA 1M9AA 3LWAA 3F4TA 2P5QA 1ERUA 5LNKe 3ERFA 4KGIA 4EF0A 4TR1A 3L9SA 4GRFA 1V9WA 2H8LA 4PURA 1PD21 2IMEA 4KSMA 1UVZA 3TDGA 3RAZA 2LJKA 4ZBAA 1R26A 5ECNB 4I5QA 4J2FA 4EDZA 1PGTA 4RI7A 1QK8A 3GRXA 4MZBA 1O7UA 3KCMA 4MLYA 4POBA 5GAPD 4GLTA 5ID2B 3ERGA 2LV3A 2WDUA 2YWIA 5CRGA 5D73A 4OWYA 3C8EA 3O3TA 3UMAA 3KP8A 2H71A 4EKZA 3J7Yb 3HXSA 1H4OA 3RPNA 1RW1A 1U88A 3M9JA 3F4SA 3F6DA 3IBHA 4LMVA 4O32A 2YJ7A 1I5GA 4ZL8A 3KZQA 3A3TA 3HKRA 2GSRA 4BL7A 1TK8B 2H70A 4ECBA 1E2YA 2H0HA 1K0AA 1SYXA 1K0BA 7GSSA 1T8EB 3HDCA 4MPGA 4KB3A 4XRDA 2C1YA 1OC3A 2PPTA 4G19A 2FWHA 4TW5A 1OC9A 1SD9A 1R4WA 3GKKA 3TJJA 1SKRB 4BWQA 2EIQA 3DGQA 3P90A 2F8AA 3IPZA 2DSAA 1XFLA 3F8UA 2HYXA 1T4YA 5DALA 4YQMA 5ID2A 4F03A 3BCKA 3D0ZA 1FVJA 4TVEA 2H6YA 5IMVA 3GSSA 3RHBA 2A2RA 4OCFA 1A8LA 1K3YA 4N10A 1S3CA 2PVOC 2ES7A 4BVXA 2C0EA 4IKHA 2VLUA 5HR3A 3RHCA 1VF3A 4AJ7A 5B6MA 4MPFA 3ZVJD 4GWRA 2L59A 2GSSA 2VM2A 3VPQA 4KUNA 4GSSA 3V1WA 4XIHA 1EEJA 1PSQA 1O8WA 3C71A 3FK8A 3JCML 1ERVA 4TXOB 5H5QA 3ZREA 2C8UA 1KTEA 3A5WA 5IM9A 5E59A 1JLVA 4MZCA 5IO2A 13GSA 2PWJA 1A24A 2AUVA 1T3BA 3GA4A 2VCZA 1MDJA 3ERWA 4ZB9A 1HNCA 2KP2A 3GURA 2H6ZA 2VCWA 1GH2A 2O87A 3PINA 4HJMA 3ZYWA 2EC4A 3LYPA 2H1GA 5DBQA 1AC1A 3F0IA 2YV7A 3GSTA 4JRRA 1DUGA 4MJBA 4WBJA 1QGVA 4K1FA 3TKRA 1GUMA 2H1AA 1J08A 2R3XA 3EWLA 4J57E 1TK0B 2G0FA 1B4QA 3LJRA 4MH2A 4JR4A 1ZOFA 5J9BA 3D21A 3L78A 3C7MA 4KE3A 3GX8A 4QL7A 1FB6A 2OE0A 5D9VA 1SL1B 1FO5A 3HD5A 3F6FA 5AGYA 1GNEA 2V32A 4L0WA 1QXHA 2PERA 3EC3A 3KD0A 4OMVA 5CAXA 4F82A 2H0IA 1U3AA 2RUEA 3KGKA 2M80A 1TKDB 1B9XC 1WOUA 2H30A 2GT6A 2H1DA 4TXOA 2B5YA 3F3RA 3VPTA 2WZ9A 3EU3A 1G7OA 1XWGA 2P5RA 2E0QA 3M8NA 1PKZA 4P3YB 4BPYA 2B1KA 1T7PB 2IPAA 1HNBA 2LSTA 5CNWA 1TW9A 3IDVA 4KH7A 4PQ1A 2GVPA 2VO4A 1EGOA 1SL0B 2HZEB 4KCEA 3ZMKA 2GSQA 3H8QA 2MMOA 3CRUA 4O92A 1K0MA 2DIYA 4GSNA 1GUHA 1GSUA 3KIJA 3GTUB 1XBSA 3C1SA 4IW9A 2DLXA 1GL8A 3LXZA 5IPHA 1J9BA 1SD8A 3HJMA 3TJBA 4WEYA 2CZ3A 2BTOT 1X0RA 3NIVA 1OYJA 1VF2A 4IQAA 3KEBA 1Z7RA 4OO4A 1GSFA 1AQVA 1TOFA 5DVBA 5EPFA 2DJ1A 5B6NA 1VF4A 3D22A 5ECMB 5G30A 3IK7A 5JCWA 5HR1A 2DJ0A 5G5EA 4GTUA 4F0CA 4MJEA 2R2JA 5GAND 4MDCA 2OKAA 1HQOA 3D5JA 5B8AA 4V2LA 1F2EA 3F4RA 1LU4A 4BWSA 3DEXA 2HZEA 4HU7A 4TN8A 3RPPA 1XW9A 1OAZA 3GN3A 2I81A 1F9MA 1GTUA 2OA7A 1GRXA 4TRXA 1JZOA 2O85A 5G1LA 5JWRB 1Z5YE 4WR4A 2K8VA 3GTUA 3C1RA 2JL4A 2C0FA 3VWUA 2M46A 4TR4A 4LL4B 1M2DA 3ZITA 2FA4A 3E0UA 3EMXA 4F9ZA 1ML6A 1NW2A 1PX6A 1GP1A 5DAKA 4POMA 3OR5A 5HFIA 4IBPA 2V6OA 1M0UA 3HHVA 2CVKA 4DSQA 3D6IA 4V2NA 17GSA 3CSJA 4WXTA 3TKSC 4NHZA 2C3QA 3MAKA 3MNGA 1XW6A 5JCUA 2VL3A 3WGXA 1SKWB 2R6KA 4LMWA 2X64A 1EEMA 1QQ2A 2VCQA 3M3MA 4X43A 4NPBA 2DC5A 1NM3A 5CRHA 3HJOA 3GUSA 4IP1A 3DWVA 4E8HA 10GSA 1GULA 4MJCA 4HQZA 3GYKA 3O6TA 3A2XA 4KDYA 1OE8A 4HOJA 1AXDA 1YJ6A 1ILOA 2LQQA 4ECJA 4N0VA 4HZ2A 4GQCA 2XC2A 3IA1A 3TOUA 1ABAA 4NHWA 3IOSA 4IELA 3TRQA 2BJXA 3J7Yk 4EO3A 2WCIA 5GSTA 1MTCA 1YF1A 1W89A 3APSA 2YWNA 3O76A 2H75A 3QFAC 1JLWA 1A2JA 2JSYA 2FLSA 4YAPA 1WMJA 1GWCA 3DMLA 2ZUPA 1X5EA 1SL2B 4OFTA 2H01A 2N5AA 4K2DA 1R7HA 4LL1B 3IXRA 3P8WA 1A2MA 4XCSA 1GLPA 5LD0A 1V58A 3CMIA 2VLTA 2CA8A 3LGCA 4CDOA 3QAVA 1WP0A 1KNGA 3QR6A 2VCXA 3FW2A 2YWMA 5AN1A 2KHPA 3BBYA 3H93A 2LKUA 3TRPA 4MF6A 5E4WA 1TRWA 1GTAA 2OJLA 2N5BA 2LJAA 5ECLB 1JFUA 3QOUA 2PU9C 3I43A 3KH9A 4YQVA 4Q5NA 1GTIA 1ZL9A 3FYGA 3DKSA 3GH6A 2V41A 1XIYA 5IMAA 4MABA 2GQMA 2B6MA 1EOGA 2MYGA 1B9YC 1Z6MA 1IYIA 22GSA 1PA3A 3GH9A 1XVWA 3GL5A 1DSBA 3C73A 3FR3A 4BVYA 5EY6A 4EXJA 2K9FA 1XPVA 5GZZB 2ZNMA 1YF0A 2I9HA 2V6KA 4ILFA 2IMKA 2P31A 3MWHA 5D8IA 3GL3A 1GUKA 8GSSA 1SU9A 3E9JB 2WULA 3TJKA 3TKPA 3TCOA 4I8BA 3GKXA 4ZB8A 2C0DA 1XW5A 1EP7A 3ZL5A 3SWLA 3KM6A 4K8MA 1OKDA 4ISDA 4X0XA 1XWCA 5G2ZA 1XCCA 2O89A 4F2IA 2F9SA 1B4PA 4L5LA 2C0GA 4HUAA 4NV5A 3HZ4A 1Y25A 1TU7A 4IQ1A 5AIVA 5EVOA 5L71A 4IJIA 2J9HA 5IMZA 1PL2A 5CP1A 3LSZA 1OVNA 4IVFA 2JACA 4OO5A 3W8SA 1TI1A 3NZNA 5CREA 1EZKA 2L6DA 6GSSA 2XPDA 1XOBA 2KOKA 6GSTA 2P0GA 4PXOA 4TOPA 4GXZA 5DQSA 2H72A 3VWXA 4ECIA 3VLNA 1YKAA 1GSSA 4FYCA 1PX7A 1S3AA 1K3OA 1ZMAA 1AIUA 1M7TA 1YDKA 4DSRA 3HYPA 5JWQB 1YEXA 5ECRB 3CSHA 5DQYA 3A2VA 2IFQB 2R37A 2HI7A 2H6XA 3W6GA 3GKMA 3ISOA 4V1Ap 3H1NA 1VRSD 2FNOA 4MP4A 2REMA 4OD7A 4X1UA 2RM6A 1AW9A 5H5RA 2C80A 2FHEA 4GSTA 3TKQA 2A2SA 2GZPA 2QKEA 1F3BA 1SKSB 3BOAA 4I97A 3H4KA 3N9JA 4DVCA 4AGSA 4K0NA 4FYUA 5IPGA 1A23A 3GNJA 5CRDA 2XBIA 2H73A 5B8BA 2XHFA 1EWXA 3ZRDA 4TKYA 5KN3A 2LS5A 2F51A 2DJ2A 2M72A 4I2TA 2V2GA 1X9WB 1ST9A 2IL3A 3LQ7A 2H1BA 3ED3A 2YJHA 4YQUA 1J0FA 2VLVA 1THOA 3WD6A 2A4VA 5ELAA 4RQRA 4LLRA 3UARA 1FG4A 2PBJA 5F05A 4RQXA 1FAAA 3S9FA 2TRCP 3M1GA 3CRTA 1AQXA 2GDRA 2IFQA 2TRXA 5D93A 1FB0A 1YY7A 2E2GA 5DCGA 3ZFBA 3KTBA 2R5GA 5AISA 2I4AA 2HNLA 5J3RA 4MA9A 4FYBA 3PR8A 3I9V2 2YV9A 3VURA 6GSVA 5CYYA 4MK3A 2NDOA 5HQPA 2NPBA 4ULXA 2F8FA 2B7KA 1XWKA 2OACA 5C00A 1TU8A 2L4CA 4WBRD 4AJ8A 1SJ6A 2VOCA 5CRWA 1ON4A 3SBCA 1BQ7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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