The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
12
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
GMERGIVQYDFMAESQDELTIKSGDKVYILDDKKSKDWWMCQLVDSGKSGLVPAQFIEPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Yeast SH3 domain three-dimensional proteome
rcsb |
| molecule keywords |
Cytoskeleton assembly control protein SLA1
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Structural protein
|
| total genus |
12
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-04-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CSK A; 2KT8 A; 1M27 C; 4OML A; 4RTT A; 1E6G A; 3H41 A; 4J9E A; 1KJW A; 2P4R A; 2ED1 A; 1TUD A; 2FRY A; 1GFC A; 2FRW A; 1M3A A; 3VS5 A; 2FPF A; 3H0I A; 2A08 A; 1G2B A; 1UHC A; 2DA9 A; 4CC7 A; 2ROT A; 4FSS A; 4R0K A; 2J06 A; 1SHG A; 2K79 A; 3PVL A; 2JS0 A; 2LCS A; 4LUD A; 1HJD A; 1AVZ C; 1K0S A; 2J6O A; 4HVU A; 2VVK A; 4GBQ A; 1NG2 A; 1NYF A; 1LCK A; 4IIM A; 1X2K A; 4J9I A; 4ZNX A; 3C0C A; 4JJD A; 2LZ6 B; 2L3Q A; 3PVQ A; 4J9G A; 1U06 A; 2GGR A; 1KIK A; 2CRE A; 1ABO A; 2O9S A; 1SSH A; 2DRM A; 4RTW A; 3EG0 A; 1X6G A; 2DJQ A; 4RTZ A; 4HVV A; 2K3B A; 3M0P A; 1YP5 A; 2OI3 A; 2AZV A; 2ECZ A; 2JTE A; 4F16 A; 2HBW A; 1WLP B; 2K7A A; 2DX1 A; 2E5K A; 2LQW A; 2ESW A; 4AFS C; 2MCN A; 1XOV A; 2BZX A; 1CKB A; 1IO6 A; 1JQQ A; 2J6K A; 4HXJ A; 1GCQ A; 3REB B; 2DE0 X; 2L0A A; 2D8H A; 2CSQ A; 4RUG A; 1PRM C; 3VS7 A; 4E6R A; 2C0I A; 3M0Q A; 2DBM A; 3THK A; 3EG2 A; 1T0J A; 1AEY A; 2YUO A; 1UG1 A; 2YSQ A; 1BU1 A; 2I0N A; 4AFU C; 2NWM A; 1UFF A; 1UJ0 A; 1WYX A; 1WIE A; 2C0O A; 1RI9 A; 1ARK A; 2GNC A; 3EHR A; 1X43 A; 2JS2 A; 3M0U A; 4Y92 A; 2GTO A; 3PE0 A; 4K11 A; 1EFN A; 1OPL A; 2J6F A; 3NGP A; 1UDL A; 1X69 A; 3RNJ A; 2RF0 A; 1PNJ A; 1U3O A; 2LP5 A; 1UTI A; 3VS2 A; 1VYT A; 3O5Z A; 3UA6 A; 4AFQ C; 2SRC A; 1UEC A; 3M0R A; 2L3S A; 1SHF A; 4D8K A; 1X2Q A; 1VA7 A; 5IXB A; 3EG3 A; 3H0F A; 5I11 A; 1UE9 A; 1OV3 A; 1AZE A; 2K6D A; 2A36 A; 2DL8 A; 2VWF A; 4ORZ A; 1NYG A; 1E7O A; 4M4Z A; 1PWT A; 3UAT A; 1FMK A; 1WI7 A; 1AWO A; 2EW3 A; 4DEY A; 1NEG A; 2DMO A; 2IIM A; 2DF6 A; 3R6N A; 2YUN A; 2YUQ A; 4JZ4 A; 5IH2 A; 2LNH B; 3IQL A; 1MUZ A; 4AG2 C; 1AWW A; 2OAW A; 2EQI A; 3CQT A; 5HCK A; 1PKT A; 1QWF A; 2KRO A; 1SRM A; 2A28 A; 2KXD A; 2ROL A; 2SEM A; 1PKS A; 1V1C A; 2MOX A; 2CUB A; 3I5S A; 1YWO A; 2RQV A; 4Z88 A; 2H8H A; 1H92 A; 4HCK A; 2PTK A; 3TSZ A; 1T3S A; 1ABQ A; 2X3W D; 4JPB W; 3VRY A; 2EBP A; 2G6F X; 1ZBJ A; 4X1V A; 2EGA A; 3VRZ A; 2LJ0 A; 1SRL A; 1E6H A; 1WXB A; 1WX6 A; 5FWC A; 2RN8 A; 2EPD A; 2V1Q A; 4JJC A; 1NLP C; 1Y57 A; 3ULR B; 4J9F A; 2FO0 A; 4OMQ A; 1VYU A; 2EGE A; 4LE9 A; 4F14 A; 3UF4 A; 3REA B; 5IHI A; 2DM1 A; 2AZS A; 1MV3 A; 4J9C A; 2EGC A; 2CH4 W; 2HSP A; 1K1Z A; 4ESR A; 5I22 A; 1K76 A; 2HCK A; 2BZY A; 2LX7 A; 1PHT A; 4Z89 A; 2YT6 A; 2KE9 A; 1HD3 A; 1N5Z A; 1A0N B; 3VS6 A; 3UA7 A; 1HSQ A; 4OMO A; 2GTJ A; 2CT4 A; 1B07 A; 4AG1 C; 1AWJ A; 4JZ3 A; 1Y0M A; 2DBK A; 2VKN A; 2W0Z A; 1W70 A; 1K4U S; 2F2V A; 2PZ1 A; 2DIL A; 2JM8 A; 3SEM A; 3EHQ A; 3I35 A; 1ZLM A; 1I07 A; 2DVJ A; 3FJ5 A; 3JV3 A; 1RUW A; 5GJV B; 4RTY A; 1GRI A; 2LMJ A; 2KR3 A; 5L23 A; 1MV0 B; 4RTV A; 1OOT A; 2QDL A; 2X3X D; 1BK2 A; 2M0Y A; 1GCP A; 4Z8A A; 4RTX A; 1GL5 A; 1ZUU A; 1S1N A; 1KFZ A; 2J05 A; 3NHN A; 2KRS A; 4KRT A; 4J9B A; 1PRL C; 1ZSG A; 1T0H A; 3KFV A; 1H8K A; 2KEA A; 2XMF A; 2JT4 A; 2F2W A; 1GBR A; 2LQN A; 2M51 A; 1YN8 A; 2HDA A; 2DRK A; 2AK5 A; 4AFZ C; 1K0X A; 3TVT A; 1X6B A; 2EYY A; 1QCF A; 2B86 A; 2CH4 A; 3NPF A; 2DL4 A; 2DLP A; 3VS4 A; 5IHK A; 3I5R A; 2RNA A; 5ECA A; 1I0C A; 4J9H A; 2YUP A; 3EGU A; 2GQI A; 1RLQ C; 1GBQ A; 1SEM A; 1TG0 A; 1JXM A; 1KSW A; 2KRM A; 3NMZ C; 1WFW A; 4EIK A; 1B3Q A; 2YDL A; 2L3P A; 2KT1 A; 1JXO A; 4GLM A; 2EYX A; 2O31 A; 1VYV A; 4RTU A; 1JO8 A; 3ZL7 C; 2GBQ A; 2JMC A; 1WXU A; 2DL5 A; 2EYW A; 2K9G A; 2JW4 A; 2RPN A; 2D1X A; 3GBQ A; 1Z9Z A; 1NEB A; 3LH5 A; 1M30 A; 3EG1 A; 1RLP C; 2JM9 A; 3U23 A; 2C0T A; 1BB9 A; 1CKA A; 2L2P A; 4LN2 A; 4OMM A; 1ZUK A; 2O2O A; 1YWP A; 1J3T A; 2CUD A; 2ED0 A; 2J7I A; 2RQU A; 3VS1 A; 4J9D A; 1U5S A; 5FW9 A; 1H3H A; 2O9V A; 2JXB A; 1AOJ A; 5IHN A; 2CT3 A; 1NLO C; 2JMA A; 1WDX A; 1M8M A; 1UHF A; 2CDT A; 2LJ1 A; 1M3B A; 1X27 A; 2KXC A; 2PNI A; 1W1F A; 2NUZ A; 5IXF A; 1AD5 A; 4CC3 A; 4JJB A; 1NM7 A; 2W10 A; 2RQT A; 3M0T A; 1OPK A; 4QT7 A; 4OMN A; 2D8J A; 1QKX A; 1K9A A; 3I9Q A; 1I1J A; 1UJY A; 3M0S A; 1WXT A; 2MIO A; 4D8D A; 3VS0 A; 4F17 A; 1OEB A; 4CC4 B; 2HEQ A; 4IIO A; 4CC2 A; 2FEI A; 2ENM A; 1SPK A; 1AWX A; 4DEX A; 4LUE A; 1UUE A; 2ABL A; 2KBT A; 2K2M A; 2FPE A; 1GCQ C; 1QLY A; 1BBZ A; 4OMP A; 1YNZ A; 2DNU A; 4HVW A; 5FWB A; 4WCI A; 2BTT A; 1QWE A; 2RQW A; 4LNP A; 1ZUY A; 1ZX6 A; 2EKH A; 2OJ2 A; 2AKK A; 2LJ3 A; 2KGT A; 2A37 A; 1W6X A; 1UGV A; 1QKW A; 2FG0 A; 2KYM A; 2KNB B; 1Z9Q A; 5EC7 A; 3QWX X; 3TSW A; 2AKL A; 3QWY A; 2DL3 A; 2F2X A; 1WA7 A; 1TUC A; 2EYZ A; 2BZ8 A; 2CSI A; 2RMO A; 3RBB B; 1GFD A; 1T3L A; 1M3C A; 2DYB A; 3SHW A; 1JEG A; 2KRN A; 1AZG B; 4A63 B; 2O88 A; 1JU5 C; 2KYB A; 3H0H A; 2D0N A; 3A98 A; 1FYN A; 2RQR A; 1G83 A; 2FPD A; 5GJW B; 3VS3 A; 1YCS B; 2V1R A; 2EVR A; 2DL7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M7D D; 1KQ2 A; 2P4R A; 2VV5 A; 3QG1 A; 2AHJ B; 1TSF A; 5AYF A; 2YRD A; 1VOM A; 3JCM c; 4MDX A; 4XU0 A; 3CCL T; 1M1K R; 1VQ8 Q; 4CC7 A; 4FSS A; 5LJ3 g; 2J06 A; 3N5B B; 1M4Z A; 2K79 A; 2JS0 A; 1NZ9 A; 3VUZ A; 4BDY A; 1M8V A; 1O9S A; 2QQA A; 5LJ3 e; 3JCM J; 4GBQ A; 3CCV Q; 4IIM A; 4WF2 A; 1Q82 U; 3EFR A; 2JN0 A; 3MEA A; 4JJD A; 2P4T A; 1DJ7 B; 2L3Q A; 4J9G A; 1U06 A; 4QW2 A; 3QJ6 A; 4NS5 A; 4C92 C; 2JTM A; 3EG0 A; 2QEX T; 1V76 A; 4HVV A; 2K3B A; 5D7U A; 3TCJ A; 2JVV A; 5D6W A; 2AZV A; 1WZO A; 4M75 E; 1WLP B; 5J3B A; 5HKC A; 3SWN A; 2DXB A; 3OQ5 A; 2RK1 A; 2ESW A; 4AFS C; 4PJO D; 2VXE A; 2BZX A; 1CKB A; 4KGV B; 2QQR A; 1VQ5 T; 2J6K A; 4L6V 5; 3M4G A; 3CBM A; 4C8Q A; 1VQL Q; 3L42 A; 2D6F A; 1PRM C; 4M7D C; 3VS7 A; 4E6R A; 3M0Q A; 2DBM A; 3EG2 A; 5GAM h; 1T0J A; 1D1B A; 1TS9 A; 1BU1 A; 2MI6 A; 3MEV A; 3H9N A; 4PFO A; 2EFI A; 3EHR A; 3J80 E; 3M0U A; 1XQH A; 1UGR B; 4K11 A; 2DTH A; 3NGP A; 1UDL A; 1X69 A; 3RNJ A; 5FRO A; 4XU1 A; 3VS2 A; 1VYT A; 2V8J A; 2FL7 A; 3QXE B; 3OYH A; 3SFM A; 3M0R A; 3CME Q; 4M77 E; 5IAY A; 2BIV A; 3HPW A; 1W2B P; 3MET A; 1UE9 A; 1OV3 A; 3EFO A; 2K6D A; 1NE8 A; 1VQ6 T; 1K8A U; 2RA2 A; 3JCM f; 2EWN A; 4ZGD B; 2M02 A; 1U1T A; 3ZFJ A; 1E7O A; 4L5G A; 2CP5 A; 1PWT A; 1YJW T; 1YHQ A; 3LWH A; 4QVZ A; 4PJO C; 1WHM A; 3OYL A; 4KBM B; 3FEO A; 3R6N A; 4MMK A; 1TXQ A; 4WTO B; 4HCB A; 2VAS A; 3JCM V; 1BI2 A; 2LNV A; 2LNH B; 3LGF A; 3IQL A; 4MDW A; 2QA4 T; 1AWW A; 2EQI A; 3I55 T; 2B8A A; 2MF2 A; 1R77 A; 3PTA A; 2SEM A; 5KYX B; 2YRC A; 3JB9 F; 2CUB A; 3HRU A; 5DY9 A; 4FIB A; 1VQ4 A; 4B6M A; 1WHJ A; 4HCK A; 2GFA A; 3VRY A; 3AHU A; 2EBP A; 2G6F X; 8ATC B; 4GLK A; 2LJ0 A; 4CRI A; 1WX6 A; 2RN8 A; 5KYY A; 4JJC A; 3CC4 A; 4EMK A; 1VYU A; 3JAM E; 4M78 E; 3GF5 A; 3REA B; 1MV3 A; 1MMN A; 3G71 A; 3S3M A; 4FSX A; 2R57 A; 4J9C A; 2EGC A; 4M75 F; 2XDP A; 3FIF A; 1K76 A; 2G3R A; 3BW1 A; 4LDU A; 5CQX A; 4M7D A; 3QYH B; 3V8J A; 2OX7 A; 5FU7 C; 1HD3 A; 2EIF A; 1N5Z A; 1VQO T; 1A0N B; 4CI0 C; 5LJ5 g; 2GTJ A; 4QQ6 A; 4N0A A; 1TU0 B; 3H8Z A; 1KD1 C; 3A8H B; 3DLM A; 4X9C A; 5LJ5 e; 1HK9 A; 1Y0M A; 5HY6 A; 4F04 B; 5AT1 B; 2QAS A; 4HT8 A; 3SEM A; 3WVE B; 4OMF B; 3EHQ A; 2KSS A; 3DLL A; 2FZK B; 1ZLM A; 4DA4 A; 1RUW A; 4XU3 A; 2LQ8 A; 1GRI A; 1PM3 A; 2LMJ A; 3L2W A; 5FLX E; 1MV0 B; 3FRN A; 3LYI A; 2QDL A; 1BK2 A; 4M77 F; 4Z8A A; 3RMS A; 1S1N A; 4KRT A; 1Y96 A; 1ZSG A; 3SWN B; 4C5I A; 3LW5 E; 5KYW B; 2EYQ A; 4OB0 B; 1U8R A; 2F2W A; 4UC4 A; 2KI7 A; 3L2U A; 3V7C A; 2BUD A; 4FYY B; 4C8Q B; 1Q7Y C; 2DLP A; 3VS4 A; 2CZ6 B; 4HCC A; 1Q86 R; 5J26 A; 1YJ9 T; 1GBQ A; 1B34 A; 1M9S A; 3QDF A; 4EIK A; 1W2B A; 1Y71 A; 5CIU A; 1XNI A; 1UGS B; 2DD4 A; 2X35 A; 4KUD K; 1RAG B; 1OX9 A; 3E9F A; 1S72 A; 2JMC A; 5GMK e; 2HL3 A; 3VJP A; 3CPW P; 2JW4 A; 4RMO A; 1K73 C; 5GAO m; 3CBO A; 2L5Q A; 3A1P A; 2QAZ A; 1M30 A; 1Q7Y R; 4XTZ A; 3CC4 Q; 2NYS A; 3P8B B; 1RLP C; 2JM9 A; 1YJN A; 2L2P A; 3GNF B; 2EJ9 A; 3LX7 A; 2QQS A; 1QVG P; 3JCM d; 4FW2 A; 3G71 Q; 1BI1 A; 3EFO B; 2J7I A; 3RDV A; 3CCE T; 3QJY A; 4M78 F; 2YRV A; 2NUT A; 5FW9 A; 4XTY A; 1AOJ A; 1WDX A; 2H3E B; 2P84 A; 2XID A; 1K73 R; 5IXF A; 1PC0 A; 5A0L A; 1X75 C; 1LOJ A; 4C92 G; 4OMN A; 2D8J A; 1K9A A; 1K9M U; 3I9Q A; 1M90 R; 1I1J A; 1NPP A; 4D8D A; 4F17 A; 1OEB A; 1VIE A; 2FZC B; 3I56 A; 3E1S A; 2ZGW A; 3RIR A; 1G3S A; 2HD0 A; 2VB6 A; 2ENM A; 3EG9 B; 3JCM e; 1VQP A; 4LUE A; 1UUE A; 3V8K A; 2KBT A; 2XU8 A; 3GIB A; 4QVC A; 5KYY B; 1N27 A; 1D09 B; 4EMK B; 1WJS A; 3M55 A; 3EH2 A; 4LNP A; 2RQW A; 2EKH A; 4GY5 A; 3PFS A; 1PG5 B; 5CKE A; 2COY A; 3O8V A; 3I56 T; 1D0X A; 1UGV A; 3HHT B; 5GAO p; 4M77 B; 1KQS A; 4DQ2 A; 2FG0 A; 4FM4 B; 2RO0 A; 5EC7 A; 3QWX X; 1SKU B; 3UPU A; 1OYX A; 5GAM g; 1W2B S; 1TUC A; 2CSI A; 1ZA2 B; 2MK5 A; 4LD6 A; 2QTX A; 5GAM j; 1T3L A; 2QI2 A; 1JEG A; 4X9D A; 2O88 A; 4OF1 A; 1VQ7 T; 2L8D A; 3H0H A; 4FW1 A; 1D3B A; 1KC8 C; 2D0N A; 1FYN A; 1G83 A; 4AMC A; 1YIT A; 2DZC A; 4XTU A; 3HFO A; 3X20 B; 1YJN Q; 1YCS B; 1TOV A; 1SSF A; 4J83 A; 2V1R A; 1WNL A; 1QVP A; 2KT8 A; 5DM7 R; 4RTT A; 1E6G A; 1Q81 R; 1U1S A; 4BUG A; 5FRN A; 3NFC A; 4C0D B; 4PJO G; 2LT1 A; 4C8Q D; 2RI3 A; 1M3A A; 2YHT A; 3VS5 A; 1PD1 A; 2XIC A; 1G2B A; 3DB3 A; 3HKS A; 2ROT A; 1Y96 B; 1SHG A; 3KUF A; 3QZ5 B; 1M1K U; 8AT1 B; 3X26 B; 4BE0 A; 3T9N A; 4FCY A; 2J6O A; 1NYF A; 2PVO B; 2KY9 A; 1X2K A; 3QYG B; 4J9I A; 1OU9 A; 1VQN T; 1YI2 T; 3C0C A; 3G6E A; 3ER0 A; 2LZ6 B; 4QQG A; 3PVQ A; 1VQ9 A; 3CPW A; 4AT1 B; 3F70 A; 2HQE A; 2RI2 A; 4NOY A; 1KIK A; 2O9S A; 4FU6 A; 1B34 B; 4RTW A; 1X6G A; 2DJQ A; 1K9M R; 4Y28 E; 3M0P A; 1NJI C; 1YP5 A; 9ATC B; 4MZP A; 3CD6 T; 2ECZ A; 5DLO A; 1VQ8 T; 1VQP Q; 2GQV A; 5GMK m; 2DX1 A; 3OSS C; 4RCB A; 2E5K A; 1WGS A; 2LQW A; 1PSE A; 3S3N A; 1XOV A; 3ZBD A; 1LVK A; 3CCJ Q; 3SWN C; 1QP3 A; 4PLL A; 2DE0 X; 3CCV T; 2L0A A; 1N6A A; 1LNX A; 3HFN A; 4RUG A; 2DIQ A; 1I8F A; 1RAF B; 3THK A; 3CXC P; 5CKD A; 1AEY A; 2YUO A; 4C8Q C; 1N9S A; 4M75 D; 2I0N A; 5CKB A; 2C0O A; 1WIE A; 3L1A A; 3CCR A; 2DJZ A; 1OUL A; 3MP6 A; 2JS2 A; 2VXF A; 4Y92 A; 1OPL A; 2V8I A; 2J6F A; 2JJ9 A; 2LP5 A; 5L8R E; 4J5Y A; 3CC2 A; 2CYZ B; 4XK8 E; 4XU2 A; 5GMK h; 2PUO B; 4Y91 A; 1D0Y A; 1UEC A; 4YTL A; 3CCQ A; 2L3S A; 4BE1 A; 1VQK Q; 2YLB A; 1M2V B; 3GNG A; 5IXB A; 3EG3 A; 4XTV A; 1VQL T; 1AZE A; 1YIT Q; 2DL8 A; 3DB4 A; 2F5T X; 2YLC A; 4ORZ A; 1NYG A; 1R0C B; 4C0F A; 4M4Z A; 2DFU A; 2K5I A; 3UAT A; 1WI7 A; 2EW3 A; 4DEY A; 3OYG A; 3M56 A; 1UEB A; 2LVM A; 2FB7 A; 4M77 D; 2YUN A; 1ZQ1 A; 3WXM B; 2HBP A; 1PD0 A; 1IHV A; 4JZ4 A; 5IH2 A; 4F7U E; 1MND A; 4X34 A; 1F1B B; 3GP8 A; 4LDV A; 3CQT A; 4J6Y A; 1QQJ A; 1MMG A; 4FT4 A; 2KRO A; 3CME T; 1SRM A; 2A28 A; 3E9G A; 2ROL A; 3CCS T; 1PKS A; 2MOX A; 3G6E Q; 1ZHI A; 4DOV A; 4Z88 A; 1VQ9 Q; 2R58 A; 5LJ3 j; 1H92 A; 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