1ZAPA

Secreted aspartic protease from c. albicans
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
342
structure length
341
Chain Sequence
QAVPVTLHNEQVTYAADITVGSNNQKLNVIVDTGSSDLWVPDVNIDCQVTYSDQTADFCKQKGTYDPSGSSASQDLNTPFSIGYGDGSSSQGTLYKDTVGFGGVSIKNQVLADVDSTSIDQGILGVGYKTNEAGGSYDNVPVTLKKQGVIAKNAYSLYLNSPDSATGQIIFGGVDNAKYSGSLIALPVTSDRELRISLGSVEVSGKTINTDNVDVLLDSGTTITYLQQDLADQIIKAFNGKLTQDSNGNSYEVDCNLSGDVVFNFSKNAKISVPASDFAASTQGDDGQPYDKCQLLFDVNKANILGDNFLRSAYIVYDLDDNEISIAQVKYTSASSTSALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Aspartic protease
molecule keywords SECRETED ASPARTIC PROTEINASE
publication title Structure of a secreted aspartic protease from C. albicans complexed with a potent inhibitor: implications for the design of antifungal agents.
pubmed rcsb
total genus 90
structure length 341
sequence length 342
ec nomenclature ec 3.4.23.24: Candidapepsin.
pdb deposition date 1996-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1zapA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1zapA01
5P77A 4J1CA 3FSMA 3OUDB 3SQFA 1W6HA 5P23A 3OXWA 3R2FA 5P0FA 2NR6A 3SA9A 5ENKA 4B1CA 5P7VA 5P6WA 5F00A 4CPRA 5P5VA 5B18A 4YD6A 1PROA 4B05A 4J1KA 2AQUA 3QIHA 3NU5A 3IXJA 5OZ3A 1KJGA 5P8MA 3WZ8A 5P1NA 5P38A 4EJ8A 1LZQA 2Z4OA 5P6GA 2V0ZC 2FDEA 3LIVA 2VNNA 3K5GA 1MRXA 2J9KA 3T7XA 4Y38A 1HVCA 3PMUA 5P8BA 5P4SA 1XDHA 4YCKA 5P20A 4EQJA 1OEWA 1ME6A 4HVPA 3QRSA 1KJFA 3S53A 5P51A 2R9BA 1BBSA 1ZPKA 4I0FA 3INFA 5I3XA 5P5IA 3EKYA 3CKRA 4X7IA 5OZ8A 3CYWA 3MSJA 3VV8A 2BPVA 5P16A 4Y3TA 3TPRA 5P5WA 5P3QA 1EPOE 3GI6A 5HDUA 5P48A 4GJ8A 5P0XA 1CZIE 2IL2A 4Y3EA 4K4QA 3D1YA 2QK5A 1PSNA 1J71A 3LHGA 3OQAA 1TZSA 1ODYA 4YE3A 5P6MA 1AZ5A 1A8KA 4ZSPA 3PSYA 1M0BA 3NU9A 2Q15A 1META 2IS0A 3UDHA 1GNOA 3KDCA 5P2CA 2NTRA 1HPOA 5P0AA 1YX9A 1MIQA 2HPFA 3CIBA 4QJ8A 5P0YA 4L7JA 4RLDA 2OF0A 2WEZA 4N00A 1BIMA 3KMXA 5P2AA 4Y4BA 5P43A 5P7BA 2B60A 5KR0A 2QZKA 3IVHA 4HZTA 3NDUA 5OZUA 5AHAA 3NUOA 3EL9A 4CPQA 3BUGA 4QJ9A 1VIJA 5OZAA 5P85A 3UQXA 2ZJMA 3RTMA 5C9DA 4FM8A 3UQRA 2QMDA 1GVTA 2V11C 5P1TA 4Q1XA 4Y3SA 3KN0A 4Z4XA 5P86A 3PEPA 4H3GA 3UFNA 1HPXA 3EL5A 4Y5PA 4Q5MA 4Y3LA 5DR4A 2O4KA 1JLDA 5P6XA 5P7RA 3R0YA 5P19A 3UDQA 5P1UA 1MESA 5HDVA 1A94A 5P47A 5P0JA 3RSXA 5P0IA 4F76A 5P64A 5OZBA 3BRAA 5P8FA 6UPJA 1HTEA 2F3FA 2IKOA 2EWYA 5P6PA 1B5FB 6APRE 3ZKXA 2QZXA 1XN2A 1B6KA 1AM5A 4DQGA 1FMUA 1HRNA 4X2LA 5COPA 5OZCA 4A4QA 3EKTA 3GI5A 4ZPEA 5P3IA 2I4WA 4ZE6A 4GJAA 2QD6A 5P5AA 5P1QA 4Y5GA 2ZJHA 4OBZA 2IENA 2FDDA 2WEBA 3D20A 3TTPA 3DCKA 5P7OA 2V16C 1YTJA 3WZ6A 3DOXA 5P1AA 2WEAA 3PWMA 5P2QA 5SY2A 1RQ9A 3EM6A 2PH8A 4RVJA 2QU3A 3UPJA 3K5CA 4B72A 4ER1E 3BVBA 3IGBA 3O99A 4ZIPA 5P2HA 2Z54A 3SA3A 3D91A 4LXAA 4Y50A 4BELA 2G21A 1LF3A 2PMAA 3EKPA 2AZ9A 5P02A 3FNTA 5AH6A 2ZJJA 1NPAA 3I7EA 4RRNA 5OZHA 5DR3A 2BB9A 3QN8A 4LXMA 4EHCA 4HEGA 2V00A 5P4XA 5P1IA 5SZ9A 3OUAA 4DQFA 5P4QA 2ZYEA 4TVHA 4AA8A 5P70A 5P6UA 3RU1A 4TRZA 3PLDA 5P26A 3WB5A 2HC0A 5DR1A 2WF3A 4Y39A 1HVRA 5P1MA 4K4PA 5P17A 1U8GA 2P3AA 4R93A 3UTLA 3OAGA 4PEPA 3IN3A 2PH6A 3OUDA 1T6EX 2Q63A 2NMYA 5P7FA 3T7PA 3BUFA 3HW1A 1HVLA 2SAMA 1FQ7A 4HLAA 3KYRA 5P7JA 4E43A 4B1DA 2HPEA 5P12A 2JE4A 5P1JA 3T6IA 1UH8A 3ZL7A 5P39A 4ZSQA 1LS5A 4B00A 3NDXA 1TSQA 5OZPA 5P8KA 1KJ7A 4GJ7A 5P4IA 4I0GA 5P6EA 3LITA 5CONA 2BJUA 4RCDA 2PK6A 4Y44A 5SY3A 2AOIA 3L5CA 5IVSA 2QI1A 2F3KA 5P6IA 3CYXA 3VYEA 5OYUA 1B6JA 5OYRA 1HTRB 5P34A 5P01A 3QROA 3GGXA 3A2OA 1IZEA 5P7IA 5P7AA 2ASIA 4GIDA 3SA8A 5P14A 5P2UA 3U6AA 1APTE 3OQKA 3K1WA 4RROA 3ZKQA 3U71A 4F74A 5P2VA 5SXNA 4K8SA 4LHHA 1APVE 5P2XA 5P5QA 1GNNA 5P5PA 3L5DA 2WF1A 1BVEA 5P89A 5PEPA 4H3FA 5P0TA 3Q70A 1FG8C 3KDBA 5P3XA 5OYTA 3EMYA 5P3WA 2JYSA 3GGAA 5P13A 4Y5AA 3NDTA 4YBIA 3VYDA 1BWAA 1K1TA 5P44A 1B6LA 5P61A 5HE7A 4YOAA 4YCTA 4WY6A 2Q64A 2I0DA 2HM1A 4FCOA 2AVVA 2PSVA 3LINA 3NUJA 3JVYA 4OBDA 2HB3A 5P8OA 2PWRA 4COEA 4Y4ZA 5P2DA 1B11A 1RV7A 1C6ZA 1GNMA 1GVXA 3N4LA 3BVAA 1ZSRA 5P2ZA 2QHCA 1ZP8A 2PQZA 5P04A 5P2JA 1D4HA 3PRSA 1RPIA 3K4VA 2IDWA 3INDA 4A6CA 4DV9A 5KR8A 3PM4A 3DV1A 5P1XA 3L38A 3ZPUA 3DCRA 5HDXA 3LZSA 5P5BA 4D88A 2FNSA 5OYXA 4KE0A 3QVCA 2R8NA 5P7NA 3VF7A 5P2WA 4I12A 4NPUA 4I10A 4Y5EA 1HTFA 1IZIA 3S56A 4EJKA 5P4DA 4L7GA 1EAGA 2IQGA 5P4OA 3UDJA 5P1BA 1OHRA 4FRSA 2G26A 2VIYA 3LPKA 4CKUA 4EXGA 2QMFA 1EC1A 5OZOA 5P6SA 4ACXA 1SP5A 1YM2A 4QJAA 1D4SA 4FM6A 5P2NA 1B5FA 3LNKA 3EL0A 3EL1A 4ZPFA 5P8TA 5P5KA 3VV6A 3ZKSA 4DQEA 5P1GA 3VSXA 4RYGA 5P41A 2F81A 1BXQA 2B8LA 5JG1A 1BAIA 2AOHA 4GJ5A 1BILA 3OADB 2IKUA 3Q4BA 3TKGA 5P4CA 1MT8A 5P88A 4EP2A 3GI4A 2P3CA 5P0BA 4Y5LA 3UDNA 3RSVA 4GJDA 3TNEA 4FAFA 1MVPA 3SO9A 4FRIA 5P30A 3ZKNA 3T7QA 2OHPA 5P72A 4DQCA 4Y4GA 1M43A 2VKMA 3PWWA 4Z50A 3HVGA 2BKSA 2ZHRA 5P0NA 1OEXA 3S7MA 4OBJA 3UDPA 1W5WA 1A30A 3HDKA 5P3RA 1BVGA 2ZHSA 3TPLA 4GB2A 5KQXA 5P1PA 4EJDA 2HAHA 1HIIA 4Y4TA 2ER0E 3R1GB 2XYFA 5P3VA 3SM2A 2FNTA 4Y36A 5OZJA 5P6ZA 1K2CA 5HVPA 1FIVA 3KDDA 5P2GA 1BDRA 2F80A 3UFLA 5P3BA 4TRWA 3QPJA 1GKTA 5P42A 4XXSA 2ANLA 4EJLA 4BEKA 5P25A 3I8WA 1FQ4A 2JJIA 5P5ZA 3KFNA 4I0EA 4YDFA 5P7MA 3D1XA 1IDAA 1EC3A 5P0VA 2NNPA 2ZJNA 5OYQA 1Z1RA 5AH9A 3MSKA 2AZCA 3LPJA 5P27A 1AIDA 2NXLA 4LP9A 2BPWA 3RTHA 4I0DA 3FNUA 3SLZA 2F8GA 3O9CA 2QMGA 4I1CA 4DPIA 1ZSFA 5P79A 2G20A 2APRA 3K5DA 3UHLA 5P1DA 4DJPA 1FFIC 4DQBA 3SACA 1AJXA 1A9MA 4PPHA 3I6OA 5P7WA 1EPQE 3SA4A 4IVSA 5P5LA 5P68A 1M4HA 1EPPE 1APUE 2O4PA 4APEA 1MT7A 2P8HA 5I70A 5OYYA 5AHBA 4I8WA 1PSOE 3IAWA 4CMSA 1IVPA 5UPJA 2NXDA 3JW2A 5FIVA 5P75A 3L59A 4YD4A 2G1YA 4U7QA 5I3YA 3FV3A 3EKXA 3OXXA 5IVQA 1T3RA 4Y54A 4MC2A 4QLHA 1MTBA 4Q1YA 4Y43A 3SAAA 5P5HA 4BFDA 4ZPGA 2FXDA 3CICA 3OU1B 2AOEA 1EPME 2PYNA 4F73A 2R5QA 4AA9A 5P7TA 3TPPA 4U8WA 1NPVA 2HIZA 4PZXA 5T4SA 1ZBGA 5OZMA 1HIVA 1SGZA 5P5DA 1D4IA 5P8UA 4DFGA 3QRVA 4PYVA 1SH9A 4Y5KA 1K6VA 5P6TA 4MC9A 1W6IA 1EEDP 1FQ6A 1YG9A 5P05A 5P5YA 3OXVA 4Y41A 4XX3A 4Y3ZA 1IIQA 2ZGAA 4HDBA 2FIVA 4B70A 1ZAPA 1TSUA 3NWXA 1RL8A 5P6CA 3G72A 4RRSA 5P4NA 4YOBA 1W5YA 5P53A 3OQ7A 4Y3GA 1CMSA 5P6KA 3DJKA 3K4VC 3SA7A 4FSEA 3LIXA 5P0CA 3AIDA 1LYBB 4HDPA 3UDKA 5P5NA 2WECA 5P3LA 3NWQA 2V13A 5P5FA 2VIJA 3O9HA 4Y4XA 1FMBA 5P58A 2VJ7A 5P3JA 5AH7A 2JJJA 3M9FA 5OZ6A 3APRE 1PPME 4I0IA 3LPIA 2OHTA 3OUBA 2MIPA 4OBGA 4CPXA 2QHYA 5KR1A 1MTRA 1AAQA 1PFZA 5P33A 3EM3A 1IVQA 4RVXA 5OZRA 2BKTA 3HLOA 4Y4WA 5P1HA 5P5EA 2O4LA 3KT5A 5P4WA 3IA9A 1FG6C 3L5BA 3OGQA 1UH9A 1LYWB 5P24A 1EBYA 4RCFA 2PK5A 3B7VA 4OBFA 1HVKA 5P8AA 1ENTE 4NJUA 2AODA 5OZWA 4J17A 5OZQA 5P3FA 1K6TA 3VCMA 1AXAA 2ZJLA 3IVIA 5DR8A 2VIZA 4EXHA 5P0OA 2Q55A 2QI3A 3ZPSA 5E5JA 2B7FA 4JP9A 3GW5A 1FEJC 1LEEA 5P31A 4FGXA 5KQFA 5P59A 3OTYA 3PSGA 1FQ5A 1SDTA 3OADA 4KE1A 1C6XA 5HD0A 5DPZA 3PGIA 4J0YA 4MC6A 1K6CA 2AOJA 1D4YA 2IRZA 4YD5A 4EWOA 4FAEA 5P3SA 3LZVA 5P4VA 2G1RA 4Y51A 5OZGA 3ST5A 1HSIA 3FX5A 5P63A 1HBVA 5C9BA 3HBOA 4DJRA 2ER6E 3QBHA 3O9FA 4R5NA 3VLAA 2RKFA 3T3CA 1YT9A 4PHVA 1HTGA 5OZTA 4DI2A 3TH9A 4RGHA 3N3IA 4DH6A 3OY4A 2G1OA 2J9JB 3S43B 4DQHA 1HSGA 5P81A 4ER2E 5P1ZA 4D83A 4JPCA 5F01A 5P6QA 3S54A 1YTIA 3PBZA 2AVOA 4LC7A 5P80A 3URIA 5IVTA 4Y3RA 3OHHA 1MPPA 4EYRA 3S7LA 1W5XA 2BPZA 5P22A 5P4JA 1AJVA 5OZIA 4OD9B 4WY1A 2P83A 2BPYA 3S2OA 3TPJA 1NH0A 5P1VA 1IZHA 5P7CA 3UDMA 3TKWA 3BGCA 2UY0A 5APRE 5AH8A 2QZLA 4KB9A 4Y5MA 5KQZA 2CEMA 3URLA 4B1EA 1HSHA 5DGUA 5P1SA 4L1AB 5P8GA 1BDLA 4Y3AA 4L6BA 3TOHA 3UQPA 4Y3XA 5ER2E 5P5RA 1C6YA 4QJ2A 8HVPA 5P1YA 3RVIA 5P65A 2HS1A 3KMYA 2UXZA 5BRYA 1G2KA 1HXWA 5ISKA 2FGVA 5P84A 2QI0A 4CPSA 2NXMA 2G24A 3OU3A 5HDZA 5P3NA 2QNPA 4Y48A 3SKGA 5HU0A 5KAOA 2WJOA 3K5FA 1UH7A 2QI5A 1ZTZA 5BS4A 3MSLA 3IXKA 2IGYA 4KUPA 4EPJA 2BQVA 1BV9A 2OHQA 3OU1A 4FM7A 3TLHA 5P8QA 5P36A 1GVVA 5P6AA 1K2BA 4LXKA 1T7JA 3O9LB 3R4BA 2CENA 5P52A 4QJ7A 3O9BA 4B77A 5OYVA 7UPJA 1QS8A 5P6RA 3I25A 3UDYA 3G70A 4RCEA 4DJQA 2B7ZA 3S8IA 5P0RA 1G35A 5P83A 1EBZA 5JFUA 4J1HA 2FLEA 5P7SA 5P5OA 3NYGA 1DW6C 5P3PA 1XL2A 1A8GA 4YHQA 5P7HA 2ZHVA 3H0BA 1SMEA 5P5JA 4D85A 5OYWA 5P8DA 5KR2A 4PZWA 4Y4UA 3EL4A 5P0PA 5P2IA 1ODWA 2AIDA 4DJYA 2CEJA 3ZMGA 5P2YA 1F7AA 2VA7A 1LV1A 5P08A 1LYBA 2I4UA 1F34A 4APRE 2HB4A 3SFCA 1EC0A 2OHLA 1QRPE 2QZWA 6FIVA 2BPXA 5P2BA 4Y3HA 2Q11A 3LIQA 5P10A 3S85A 5P60A 3EKVA 1ZPAA 1EPRE 1EC2A 3H5BA 4JPEA 3GI0A 5P4PA 2OHSA 2XFKA 3VG1A 1APWE 1HHPA 3FNSA 1LF2A 4Q1NA 5P5SA 1PPKE 1MSNA 4Y9WA 2B8VA 5IVRA 1TW7A 4Y5CA 4K4RA 1LYWA 3O9EA 4Y4DA 3L5EA 4AUCA 1YTGA 3PJ6A 2G27A 2I4XA 3L5FA 1QBRA 3DK1A 5P7PA 4Y5NA 5P5TA 1HVJA 1SIPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5P77 A;  4J1C A;  3FSM A;  3OUD B;  3SQF A;  1W6H A;  5P23 A;  3OXW A;  3R2F A;  5P0F A;  2NR6 A;  3SA9 A;  5ENK A;  4B1C A;  5P7V A;  5P6W A;  5F00 A;  4CPR A;  5P5V A;  5B18 A;  4YD6 A;  1PRO A;  4B05 A;  4J1K A;  2AQU A;  3QIH A;  3NU5 A;  3IXJ A;  5OZ3 A;  1KJG A;  5P8M A;  3WZ8 A;  5P1N A;  5P38 A;  4EJ8 A;  1LZQ A;  2Z4O A;  5P6G A;  2V0Z C;  2FDE A;  3LIV A;  2VNN A;  3K5G A;  1MRX A;  2J9K A;  3T7X A;  4Y38 A;  1HVC A;  3PMU A;  5P8B A;  5P4S A;  1XDH A;  4YCK A;  5P20 A;  4EQJ A;  1OEW A;  1ME6 A;  4HVP A;  3QRS A;  1KJF A;  3S53 A;  5P51 A;  2R9B A;  1BBS A;  1ZPK A;  4I0F A;  3INF A;  5I3X A;  5P5I A;  3EKY A;  3CKR A;  4X7I A;  5OZ8 A;  3CYW A;  3MSJ A;  3VV8 A;  2BPV A;  5P16 A;  4Y3T A;  3TPR A;  5P5W A;  5P3Q A;  1EPO E;  3GI6 A;  5HDU A;  5P48 A;  4GJ8 A;  5P0X A;  1CZI E;  2IL2 A;  4Y3E A;  4K4Q A;  3D1Y A;  2QK5 A;  1PSN A;  1J71 A;  3LHG A;  3OQA A;  1TZS A;  1ODY A;  4YE3 A;  5P6M A;  1AZ5 A;  1A8K A;  4ZSP A;  3PSY A;  1M0B A;  3NU9 A;  2Q15 A;  1MET A;  2IS0 A;  3UDH A;  1GNO A;  3KDC A;  5P2C A;  2NTR A;  1HPO A;  5P0A A;  1YX9 A;  1MIQ A;  2HPF A;  3CIB A;  4QJ8 A;  5P0Y A;  4L7J A;  4RLD A;  2OF0 A;  2WEZ A;  4N00 A;  1BIM A;  3KMX A;  5P2A A;  4Y4B A;  5P43 A;  5P7B A;  2B60 A;  5KR0 A;  2QZK A;  3IVH A;  4HZT A;  3NDU A;  5OZU A;  5AHA A;  3NUO A;  3EL9 A;  4CPQ A;  3BUG A;  4QJ9 A;  1VIJ A;  5OZA A;  5P85 A;  3UQX A;  2ZJM A;  3RTM A;  5C9D A;  4FM8 A;  3UQR A;  2QMD A;  1GVT A;  2V11 C;  5P1T A;  4Q1X A;  4Y3S A;  3KN0 A;  4Z4X A;  5P86 A;  3PEP A;  4H3G A;  3UFN A;  1HPX A;  3EL5 A;  4Y5P A;  4Q5M A;  4Y3L A;  5DR4 A;  2O4K A;  1JLD A;  5P6X A;  5P7R A;  3R0Y A;  5P19 A;  3UDQ A;  5P1U A;  1MES A;  5HDV A;  1A94 A;  5P47 A;  5P0J A;  3RSX A;  5P0I A;  4F76 A;  5P64 A;  5OZB A;  3BRA A;  5P8F A;  6UPJ A;  1HTE A;  2F3F A;  2IKO A;  2EWY A;  5P6P A;  1B5F B;  6APR E;  3ZKX A;  2QZX A;  1XN2 A;  1B6K A;  1AM5 A;  4DQG A;  1FMU A;  1HRN A;  4X2L A;  5COP A;  5OZC A;  4A4Q A;  3EKT A;  3GI5 A;  4ZPE A;  5P3I A;  2I4W A;  4ZE6 A;  4GJA A;  2QD6 A;  5P5A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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