1ZBCA

Crystal structure of the porcine signalling protein liganded with the peptide trp-pro-trp (wpw) at 2.3 a resolution
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
361
structure length
361
Chain Sequence
YKLICYYTSWSQYREGDGSCFPDAIDPFLCTHVIYSFANISNNEIDTWEWNDVTLYDTLNTLKNRNPNLKTLLSVGGWNFGPQRFSKIASKTQSRRTFIKSVPPFLRTHGFDGLDLAWLYPGRRDKRHLTTLVKEMKAEFIREAQAGTEQLLLSAAVSAGKIAIDRGYDIAQISRHLDFISLLTYDFHGAWRQTVGHHSPLFRGQEDASSRFSNADYAVSYMLRLGAPANKLVMGIPTFGKSFTLASSKTDVGAPVSGPGIPGQFTKEKGILAYYEICDFLQGATTHRFRDQQVPYATKGNQWVAYDDQESVKNKARYLKNRQLAGAMVWALDLDDFRGTFCGQNLTFPLTSAVKDVLARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
publication title Crystal Structure of the porcine signalling protein liganded with the peptide Trp-Pro-Trp (WPW) at 2.3 A resolution
rcsb
molecule keywords signal processing protein
total genus 120
structure length 361
sequence length 361
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1zbcA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1zbcA01
3FXYA 3SCNA 1CDGA 4JCLA 2V5CA 5GNZA 2WWDA 4CU7A 1GZJA 3VD9A 3GBEA 1V6VA 4HMCA 4HA1A 1JZ5A 1TVPA 3PZTA 1H0IA 1G01A 1BQCA 4JZ5A 3BH4A 4D6HA 4X0NA 3W38A 2XUCA 3FHQA 2BNJA 4H04A 1CGWA 2GDVA 3POHA 2XFFA 2IXUA 2NSXA 3WUBA 2BY1A 2VVSA 1ITXA 4LX4A 3BAXA 4JKMA 2ZX9A 4U3CA 5M3WA 2PWFA 2WLYA 4ATWA 2UY2A 5AY7A 4TX8A 1EXPA 5A6KA 1WNOA 2XJ7A 1JG9A 1MQQA 3EDKA 3WBEA 4ZE5A 1C93A 4L4OA 1UD8A 2OYMA 2ZX6A 1ISXA 4PCTA 3NSMA 2J8GA 5E09A 5F7UA 2A3EA 1WO2A 5KEZA 1EO7A 3AZSA 4KRTA 3WD2A 1V3IA 2EPKX 2WHJA 1G0CA 2VI0A 1H09A 2Y2WA 1A3HA 3VMPA 3CZEA 3WIJA 4OBSA 2E40A 1ZL1A 1AMYA 3AMCA 4GZJA 2YA1A 1BYCA 4HOWA 1B30A 1CPUA 1V02A 2DIJA 2EPOA 1E72M 2WB5A 2DSUA 3WSUA 5BROA 3OG2A 2ZUUA 1WPCA 3VIPA 2ZXDA 4JL2A 1BPLB 4HZ8A 5I3DA 4J3WA 1JZ8A 4V2XA 3GZAA 3GYCA 2BVDA 2DH3A 1HJXA 5C70A 3AMDA 3UG3A 1PX4A 3PZNA 2J4GA 3ARYA 1HJSA 1ISWA 3VGGA 3PZIA 4AZCB 1CECA 1H4PA 2X8RA 1X6NA 4TVCA 1QOXA 4UFJA 3DYOA 1JD9A 3CTTA 2DSZA 5CJ5A 1VEOA 1GHSA 7CGTA 3WL0A 3WBAA 2CNCA 2ZWZA 1D7FA 3MV11 5EFDA 5FKYA 4RE4A 3K1DA 3OZOA 1R7AA 4OJYA 1DTUA 2ZIDA 3CH9A 2X05A 2YIHA 3HJEA 3WH9A 1KGWA 1CLVA 1OM0A 1KB3A 5JIPA 1WDRA 1H2JA 3ZT6A 4B9ZA 3TONA 1HT6A 2WVVA 2OSWA 5I77A 1GOIA 3AISA 3QHMA 5A8OA 1UD3A 2WM0A 2PF0A 1E0WA 2VZOA 2WK2A 3AHYA 2G8ZA 4W5ZA 3OLIA 4A4AA 2VTFA 5DO8A 4KH2A 2BS9A 3OGVA 3WQ4A 4IISA 3B9AA 1HN1A 1B3YA 3VM7A 3MMUA 2YL8A 3WUEA 4HZ6A 4FLSA 2YA2A 3VD3A 3AIQA 4KGLA 2VQUA 1JYXA 4CCDA 1UH3A 4D6FA 1LWHA 1QHPA 1JZ4A 2IUZA 2C8NA 5A8MA 4BQ4A 3AYSA 3CZGA 4ZENA 1M7XA 3CZKA 3VDAA 5I23A 1UWIA 3SUWA 3SCOA 4PTVA 2XGBA 1CLXA 1TZ7A 4BCEA 3VGBA 1QW9A 2XWEA 1JFXA 1FHLA 4MB4A 1BG4A 3W53A 3GH5A 4MB1A 8CGTA 4UZUA 3WDIA 2J7EA 3SCVA 2ZXBA 1G94A 1EQCA 1GNXA 1OD0A 4ACYA 4GO9A 1TR1A 5CQ1A 2D3LA 4IPLA 2CBUA 2EO7A 4GQRA 1GOOA 7TAAA 4ACZA 4QLJA 4D6IA 1TA3B 3NIYA 1UQYA 5ABHA 1PX3A 1E4MM 4PMXA 2PBGA 2J7FA 4BS0A 1VEMA 5ECUA 1UYQA 1ZJAA 5A6BD 4W7VA 2TAAA 1Z32X 1V6WA 1B1YA 1NOWA 4PUDA 2Q8XA 3DECA 5HNNA 1K6AA 1VRXA 3WNMA 3WKZA 4CVUA 4JHZA 1J18A 3CO4A 5AYBA 3ARZA 1J0ZA 3GTNA 2WMFA 2XM2A 2W4XA 2E8YA 1W1PA 4EAMA 1OINA 2WSPA 2BY0A 3LPGA 2BVTA 2WVUA 2WSKA 3FHAA 1M53A 1H41A 2VR4A 1JYWA 4J3UA 1B2YA 2VZTA 1PEZA 3TTYA 5A6SA 5BXTA 5CPSA 1J0IA 3UR7A 1YQ2A 1WDPA 3DYMA 5A8QA 3W4RA 4ML4A 4NSBA 2QLYA 1CXLA 1UH4A 2OYKA 4Z2JA 3RIKA 4AW7A 4CCEA 5DEZA 1CYGA 3BAYA 1NP0A 4Q7NA 4JAWA 3NDZA 3RJYA 2UY5A 5EFFA 4UQAA 2WBGA 1KBBA 3I3DA 2WKGA 3VIIA 3IK2A 1V6UA 1D3CA 4OOUA 2CERA 1PBGA 1XH0A 2WMIB 1NOUA 3SCRA 3N12A 4HOZA 1SMDA 1KR0A 1CGTA 1PIFA 5A94A 1JZ3A 3FN9A 4D6DA 3W6LA 5CG0A 1QNSA 1JD7A 4J28A 3OIHA 1XCWA 1UWRA 1IT0A 3VNZA 6A3HA 3WDHA 3BMVA 4U2YA 1W9BM 2CETA 2QPUA 4CUCA 1OB0A 4QP0A 4XV0A 1GQKA 1Q6EA 3CHCA 2GSJA 2ZUTA 2O9RA 1KWGA 1KWKA 2D20A 3AIEA 2DH2A 3WFLA 4P7OA 1JNDA 1V0NA 2MANA 1EDQA 1GOQA 1LWJA 3BC9A 3SUUA 3W24A 1NWRA 4UOQA 1ZB5A 2FH6A 2VUYA 3VINA 5A8PA 1AQ0A 4W7UA 1XSIA 4B3KA 1VJZA 2YJQA 3ARQA 4LXFA 1XH2A 5E6ZA 4XB3A 2J77A 2GJXA 1ZBKA 1F4HA 5IDIA 4EANA 1WCGA 3EBVA 1JNEA 2O92A 2XVKA 3L2LA 4L4PA 3BCDA 5I5RA 1PJ9A 1UZ4A 2FHCA 5I0DA 4K68A 4XZBA 3VIKA 2OSXA 4CU6A 1C3FA 3M46A 3BXWA 2GJRA 3K4AA 3F5LA 1U2YA 2RGLA 4PMVA 1CZ1A 2F61A 2ZXQA 1E3XA 2V3DA 3ZSTA 3WNNA 2WMKA 3W82A 3HMCA 2OSYA 1EH9A 1GORA 4UFKA 1ECEA 5BRQA 3W27A 3BLPX 4JCMA 1R85A 1XSJA 2YL9A 3B8SA 3M7SA 1A47A 1GQJA 5D4YA 1E6XM 3WNKA 3G6LA 1W9VA 2WNWA 3O2LA 3T2PA 1MFVA 3FY1A 1FA2A 3ZOAA 3VMOA 4TVDA 2OYLA 3AIBA 1WZMA 2VJXA 1HJWA 1JZ2A 1DWJM 3K8MA 3FNDA 1GQLA 4OZOA 1JGIA 5IFTA 3U5UA 1HJQA 3GDBA 3NJ3A 2V38A 1VJSA 4NF7A 5HXMA 5CSYA 3VM5A 1Q6GA 3WELA 4AY1A 2JIWA 3VILA 2VZVA 4DWSC 1ZBVA 4MJ2A 1UG6A 1QVBA 1VENA 1W9UA 3UERA 1VFFA 1NWSA 3WENA 4AZ6A 4D71A 1XC6A 2QMKA 2B31A 4AEFA 3DYPA 4OBRA 3UEQA 2JFEX 1K9DA 4ZE4A 3BLKA 5HPCA 2YOCA 4J27A 1NWUA 2JEPA 2FGLA 1J0JA 2J7CA 2ZX8A 4PMOA 1JXKA 4J3SA 3AXHA 3MKKA 3IJ7A 4BQ3A 4DWSB 3EDJA 4CD7A 2ZUMA 1GCYA 1UD5A 3KL5A 4D6JA 1V08A 1GVIA 4UTFA 5A8NA 1J01A 1LG1A 2PWHA 5IXEA 4NRRA 3ZR5A 2PWDA 3VOCA 4QAWA 3N18A 1L8NA 1K9TA 3LMYA 4J3TA 4P8XA 2WMGA 2NT1A 3CUHA 4GQQA 3AZTA 3T0DA 4WKHA 1LL7A 2FGZA 1O6IA 2XFRA 3F4VA 2EBNA 2XIIA 1UHVA 2G3IA 2WC4A 1LL4A 1U33A 4DUWA 4GO8A 4M24A 1QBBA 4TTUA 2XWDA 1JDDA 5DT5A 2V3EA 3KL3A 1JIBA 2XVLA 4D6EA 4M82A 1QHOA 4P8WA 1TUXA 1VIWA 3WUGA 3GXMA 1CNVA 4QCFA 3TTSA 1Q6DA 1WZAA 2AAAA 1R8LA 3UR8A 2Y8VA 3VO0A 1RD6A 4FLRA 2FDMA 4UZSA 1JF5A 3VPLA 4CN4A 2CESA 4ZXLA 3GNOA 2HVMA 1J11A 1E43A 2Z1KA 4Q22A 1W3LA 1E5JA 2VRJA 4B16A 2WXDM 1H49A 2CBIA 2E9MA 1MW1A 4PMZA 3A4XA 4UQCA 1V6YA 1QI0A 2OLHA 2J75A 3OGRA 5E6YA 5A6LA 1UOKA 1B0IA 2VOTA 5CGMA 4UFMA 1E6SM 2BXZA 2ZX5A 4UR9A 1HIZA 1UR9A 1UR2A 1G1YA 3WMBA 2PBOA 3AOFA 1ZBCA 1CXKA 2J7GA 4MPKA 4WK9A 3AS3A 2D22A 2CITA 4U33A 1DWFM 5JH8A 4BA0A 2D0FA 2DT0A 1E4IA 1BHGA 1RH9A 1QBAA 2WYSA 3II1A 3CPUA 1B90A 1WZKA 4PYSA 3CHEA 4UFLA 1SYTA 4JKLA 1E0VA 4HOXA 2BHYA 3GH4A 1BGGA 1QI3A 3OZPA 3TP4A 1OBAA 4Z2GA 3T08A 1HL9A 3ARTA 1FH7A 4J7RA 4Z2LA 4AIEA 1MW3A 4XX6A 5CPTA 4M29A 4P8UA 4D1IA 4FF5A 1W3KA 1TA3A 4QCEA 1H0GA 3WNLA 2XVGA 3SUTA 4NRSA 3AHVA 3U57A 1OIMA 3BSGA 2WC7A 2QV4A 3L4UA 3RPMA 1M04A 5AC4A 4UFIA 4Y7EA 1V02E 1B3WA 4ZFMA 2E4TA 2WW5A 3MO4A 7A3HA 4MJ4A 8A3HA 1J0HA 4X0VA 1VEPA 3BAJA 4AD1A 1GONA 2F8QA 2GK1B 3EMQA 3N11A 2E8ZA 1BGAA 1DHKA 1KQYA 1CXFA 3L4VA 5EBAA 2VRKA 1GOWA 3WFZA 1B9ZA 1VFOA 4IUGA 2WAGA 3OLGA 2CYGA 1DP0A 2OWCA 4IM4A 3MSDA 3QGVA 2CBJA 1EO5A 4PMDA 3EYPA 4WIWA 3CGTA 4AISA 2EQDA 3UG5A 1E9LA 2YDRA 4GIAA 3RM4A 1VBRA 1HP5A 3SCWA 1LQ0A 2XVNA 1EGZA 2X09A 3AMKA 1PZ2A 1M03A 1R86A 3ALGA 4FLQA 4PRWA 3VIGA 3RM9A 3BCFA 3FAWA 2J7DA 2ESCA 3VX0A 3PHAA 3WD0A 4U31A 4N0RA 1G5AA 4PMYA 3RJXA 5DT7A 4GINA 2WMIA 3EMZA 3AS1A 4WLCA 2UWFA 1DWHM 2ZUWA 4AMCA 2D24A 1UR8A 2O9TA 3K8LA 3A3HA 1BYDA 4TX6A 2Y8KA 5DF0A 3BGAA 1QHZA 1W3HA 5M03A 4CU8A 4H2CA 4AD0A 3CZ8A 1V6XA 2GJPA 4P8VA 3F5KA 1LF1A 3ZJ6A 2D0HA 4PUEA 4PSPA 3PZMA 1WDQA 2YLAA 5A69A 1WZLA 2DIEA 5GNXA 1E5NA 4V27A 4WF7A 3WEZA 2VX5A 5I24A 3AZRA 1FH9A 1GPFA 1VF8A 1PPIA 1ZU8A 4A3YA 3A4WA 2WCGA 3MSGA 4KRUA 1HKJA 1B3ZA 4C7DA 1V03A 4ATLA 3WQ6A 3AXXA 3W25A 1JDAA 3CIVA 4BQ5A 4F66A 1TFVA 4P7QA 4PN2A 2GFTA 2VQTA 3HU7A 1WAWA 2QMJA 3IAPA 4UQBA 2QPSA 3WH7A 1J10A 1CBGA 2XYLA 3BMWA 1R7OA 2WVVB 1E6ZA 1E0XA 3VVGA 1V3LA 4HMDA 3MUZ1 2VVNA 4PMRA 4UQEA 3VIJA 2VCCA 2VCAA 5FD0A 2PWGA 3PZUA 4CN6A 1MFUA 3WEMA 2VRQA 4Z2IA 3ARPA 3PBGA 1UZ1A 2DT2A 3WNPA 3WUFA 1IV8A 3WQWA 1WE5A 1OCQA 4DM1A 1W3JA 4E8CA 1UR4A 1BVZA 3U5YA 3KEHA 3ARSA 1XYZA 4HU0A 3RCNA 3AHZA 1YHTA 1ZS2A 3GNPA 3SCUA 1E6QM 1GUVA 1E40A 5A6JA 1KXQA 1OD8A 3BAWA 3PZ9A 4WJXA 2CBVA 2J7BA 5E9AA 5CLTA 4AEEA 3ARXA 1C7TA 2BHZA 3NUKA 4QLKA 3TA9A 3EMCA 4HPHA 4J3XA 3L4YA 5HOSA 4H7VA 5HPOA 1XH1A 3D3AA 1BTCA 5A6MA 5A2AA 5FL0A 4C7FA 2XPKA 1W2PA 2VX7A 4RE3A 3ZO9A 5M17A 4KWUA 2VX6A 2CHNA 4W84A 1V3KA 1PZ3A 1RP8A 2ZWYA 1J0KA 1MQPA 2VCBA 2WC3A 5TD4A 1MXDA 1V0LA 2UY4A 4AZBA 4MAVA 4M81A 4WSJA 1UKSA 4MDPA 2E9LA 1C8YA 2D3NA 4W86A 1X6LA 5JIWA 2G41A 3WNOA 3ZM8A 1P6WA 1KXTA 4R27A 1NQ6A 1NOFA 1RPKA 3WD4A 2WZHA 1C7SA 4W85A 5FOOA 2WVSA 4GI6A 3ZIZA 1EQPA 3SCQA 4OOZA 2WZIA 3CUGA 4EE9A 3EDFA 4TXEA 3WH8A 3MU7A 4N42A 3WD1A 4KGJA 1KFWA 1E6RA 3AHTA 4IPNB 3SURA 4AD4A 1OT2A 5KZ6A 2CIPA 3T0BA 1OGSA 1E55A 4QLLA 1E15A 1SR0A 1HKIA 3W29A 1HL8A 2E3ZA 1NARA 3AROA 1B3VA 3IJ9A 5A2BA 1O7AA 5FL1A 2ZICA 3N04A 3WQ8A 4DWSA 2XFYA 3VDBA 3CMJA 3L4TA 1E4LA 1KGUA 4CGTA 3W81A 2VR5A 2A3CA 3GXDA 3VIOA 2EPLX 2J25A 5JBDA 4HP5A 2J78A 2YBUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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