1ZBMA

X-ray crystal structure of protein af1704 from archaeoglobus fulgidus. northeast structural genomics consortium target gr62a.
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
HHSHKIRVAHTPDADDAFMFYAMTHGKVDTWLEIEHVIEDIETLNRKAFNAEYEVTAISAHAYALLDDKYRILSAGASVGDGYGPVVVAKSEISLDGKRIAVPGRYTTANLLLKLAVEDFEPVEMPFDRIIQAVLDEEVDAGLLIHEGQITYADYGLKCVLDLWDWWSEQVKLPLPLGLNAIRRDLSVEVQEEFLRAMRESIAFAIENPDEAIEYAMKYSRGLDRERAKRFAMMYVNDYTYNMPESVDAALKKLYEMAEAKGLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule keywords hypothetical protein AF1704
total genus 86
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02621 VitK2_biosynth Menaquinone biosynthesis
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zbmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zbmA02
4HTGA 3IORA 1H45A 4GVOA 3O29A 1M5BA 1IXHA 1P1UA 1XOCA 2XXTA 2XXQA 3KN3A 2RC9A 3RT8A 2F35A 1GR2A 2Z8DA 3VLUA 4U21A 4POWA 1UTBB 2QS4A 5TP9A 2D21A 5LOMA 4Q8RA 1RKMA 3TEPA 4DIGA 5I2KB 1MDQA 3C4MA 1LBBA 2ZYNA 3VVFA 4EXKA 1FQEA 3IOVA 2DYXA 1QKAA 5F7VA 2QSXA 1PB9A 3DM0A 1JVXA 3VVEA 1M5CA 4R73A 3IB2A 3IOTA 2FYIA 2DWIA 1B3EA 4C0RA 2O1LA 1B0LA 3EHSA 2XX9A 5B70A 5CBSA 1USYH 3I3VA 2XD2A 3UA8A 4FATA 2RKMA 2Q88A 2ZNSA 5FTIA 1B58A 3TAJA 2XX8A 1IZ1A 3H06B 2AL4A 1FQAA 2A5TA 4HCYA 4ZEDA 3K01A 2Q9TA 4ZEIA 3ZKKA 4QSDA 1NKXA 1Y9UA 4F3SA 5I2NB 2I4CA 2RF1A 3JV9A 1Y4CA 2H98A 2VD2A 1A99A 3C33A 3D4GA 3PMXA 1NH7A 4IO5A 3T9UA 1SW1A 4GRKA 4OYVA 4DXUA 4KCCA 1H3DA 4GL8A 1B4HA 1TXFA 3GBBA 3Q27A 2Y7KA 3K02A 1IXIA 5H8QB 4KR5A 1FW0A 1FTJA 2XHDA 3FATA 4F1UA 4OFOA 4YMBA 3S9NC 1SW2A 4NF8B 1R1NA 4X48A 3QXMA 5I59A 4DCYA 2Y84A 1LSTA 3FXRA 1IQ7A 3HHFA 2THIA 1LAHE 5I56B 3TKDA 1VR5A 1FTLA 1US4A 3C31A 3PUYE 4X1DA 1VFEA 4GFRA 4XTCQ 3ILTB 1GV8A 3IX1A 2F5XA 4POXA 3C34A 2QPQA 3QUJA 4OENA 1P1NA 3FXQA 1DPEA 4JB7A 5L9SA 4F3BA 3IJOB 1LCFA 4QFPA 4I9DA 4JWXA 1TWYA 2XD3A 3LSLA 1ZKBA 4U1OA 3SETA 4OQOA 5CRYA 3GLBA 1NH8A 3O2AA 2QJEA 3THIA 4U22A 1TFDA 2P2AA 4E0WA 3G3KA 5H8HA 3IB1A 4IGTA 1MS7A 2F6PA 3LBSA 3VE1B 3PPOA 5CC2A 3ZSFA 4R6YA 3K4UA 1PBQA 1SD3A 1OLCA 3PV0E 1DOTA 2B3BA 3E9XA 3OSRA 3KSXA 4YMAA 1I69A 2E0SA 3N94A 4F22A 1MXXA 3OXNA 2VP1A 5DT6A 2ONKE 3FZVA 4U4SA 1FTKA 2XXPA 4TQUQ 4UA8A 1WODA 1ZBMA 5A5XA 3FGSA 4H65A 4F3GA 3MPKA 3TUSA 3TZAA 2F6GA 4OERA 2V25A 1JVYA 2Z8FA 3MPLA 2DQVA 5AE4A 1N3WA 5J1DA 1QW0A 1O7TA 2V3QA 3CG3A 2PT1A 2V3TA 1B3HA 2O84X 1NMUA 1B51A 4OEVA 4M4GA 2FNCA 3RN8A 2E1SA 4YB5A 2NXOA 4GL0A 4F19A 3RTFB 3CFZA 4XKNA 3H4ZA 5F1QA 2X7PA 3LSXA 3TCGA 1MY0A 3O6GA 3V8XB 3G3GA 1AH5A 1QUKA 4G77A 5KDTA 3QIMA 3G3HA 1Z7ME 1SYIA 1S7YA 3MVWA 2ANJA 4Q0CA 3B6WA 3C32A 1MY3A 2F36A 4OWDA 2ALUA 5I84A 2GHBA 1QUIA 4BDNA 3ZS6A 3PPPA 1JNFA 2ZYKA 4X1BA 4EQ7A 4QHQA 4MH5A 1MDP1 3N26A 1N0TA 3OOAA 1BIYA 1S50A 1NNKA 2B65A 3MVZA 3H6TA 4YAHX 2OWTA 2QL3A 1A7LA 5CBRA 1MM7A 3QSLA 4F2QA 2KLFA 4RPNA 1PEBA 2A5SA 2HZLA 4G8NA 4F1VA 5KCJB 4HS7A 2IA4A 1HSLA 2DOJA 5JEIA 2RC8A 1II5A 3C35A 4OXVA 4TOZA 3LSFB 1OQHA 3N6UA 1XVXA 5H8FB 2REJA 1B7UA 1B5HA 1URGA 4ELOA 5JK4A 2BJJX 5I57A 4NWCA 1MQHA 4JWOA 4PP0A 4WKMA 4XKPA 1YAEA 4C1TA 3T9XB 4NF5A 4E0XA 1B5JA 4G8HA 1CE2A 2OLBA 3IK6B 5AA4A 2PX1A 1IXCA 3MP8A 2OCUA 1ZU0A 3CVGA 5I58A 1GVCA 3TQLA 4QRZA 1UQWA 1AMFA 3K2DA 2V84A 4OVJA 3FVKA 2I4BA 1B05A 2F34A 4DCXA 5HM4B 3OEKA 5TP9B 3LUYA 3U92A 3MWBA 4OESA 1NNTA 3FIRA 5JTYA 1PB8A 3JZJA 4R75A 1EZOA 2ONRA 4RPOA 4KD5A 2V93A 4RA1A 4PFUA 4NE4A 1I6QA 3VXBA 3TTNA 3VFJA 4C1UA 1HSJA 1URDA 1TT1A 4ZZAA 1LAGE 2O7IA 4ISUA 3S9MC 3TCFA 1NNPA 1SW4A 4BDRA 3S9EA 3TFLA 4GD5A 4LATA 4EQBA 4H5GA 2H25A 2O6AA 4JSOA 4Z0IA 4LZ5A 3L6HA 3MP6A 1MXUA 2Q89A 2F97A 1L5TA 1ZJLA 1O63A 2D3IA 3O66A 1Y3QA 1B9JA 4GXAA 1US5A 3RT6B 1USYE 3PU5A 4PETA 2A5TB 3DP6A 3T96B 5DVFA 4F2OA 3VLWA 1JW1A 3CFLA 4ZS9A 1DPPA 3IOUA 3MC2A 5H8NA 3CR9A 1MM6A 1D9VA 1LB8A 4I1DA 2I58A 4G68A 2XXWA 3N5LA 3PUXE 3M3KA 3H6WA 3OO7A 4JWYA 1ATGA 4O3BA 1EZ9A 2V3UA 4ELQA 4KFQA 2OBGA 5ITOA 3P7IA 3T93B 4ESXA 1JW4A 5AA1A 4WEPA 3O28A 3BFUA 3CFXA 1DTGA 1Y1ZA 3KGCA 1B6HA 4H1XA 4MBPA 3T66A 4EUOA 5BWJA 4ND9A 1UIVA 5CMMA 1BP5A 2QS2A 4NF4A 1POTA 4NF6A 4ZZEA 1JEUA 5FHNA 4F18A 3RNNA 4N07A 3GXAA 2XXXA 5ICQA 5ELVA 1B5IA 5I59B 3MZ1A 3K1MA 4GWOA 4MFIA 2NOOA 3E4RA 1SI1A 2I0BA 2OJTA 1H76A 3KJ7A 2X7QA 2PMSA 3EHUA 5I2KA 3Q26A 2LAOA 4EF1A 4PFYA 1FQDA 5HBCA 3E3KA 2ONSA 2NVUB 4NWDA 1SDXA 3H6UA 1N3XA 3O9PA 3KZGA 4IB2A 3VVDA 1Q1KA 3K6WA 3IO4A 4AB5A 3AXFA 3B7DA 4QSCA 2DXYA 1LLSA 4H8JA 4LUBA 3KOSA 3OENA 5AA2D 1T0KA 1B1XA 2DE4A 3CI8A 4H5FA 1D3KA 3FASA 4N13A 3O6HA 1DMBA 1P1QA 4RYAA 2O51A 4I62A 1LFGA 2Z23A 3M8UA 3I6VA 2Z22A 2P0SA 4MF3A 4XKRA 3CIJA 1NL5A 3UORA 2HAVA 4LZ8A 3FJ7A 5H8HB 4U4XA 4YKKA 2RC7A 4R9FA 4BDLA 3S2VA 1O64A 3QUFA 4QFLA 4GIZA 3UP9A 2PBWA 2UVJA 4IO7A 4IY6A 3GZGA 1FCKA 1VE4A 4RK2A 3CSGA 1VFDA 3FD3A 5L8DA 2UVGA 2Q2CA 3OEMA 3T9HB 1NFTA 5K2XA 1LB9A 4F1YA 2HQ0A 3F11A 4NMYA 1M5FA 4JSDA 3MQ9A 5A5XB 4PE5B 1FQFA 2I0CA 4RK9A 3PPNA 4DDDA 4FORA 3VDFA 2UVHA 1B3FA 1MG1A 1N7WA 1ANFA 4BLAA 3FV1A 1EZPA 4LA9A 2H5YA 3FV2A 4F3PA 3GBAA 4YKPA 4DE8A 2XX7A 3TCHA 2DE3A 4KQPA 4THIA 2VGQA 5DEXA 4TLMB 3VXCA 4DXBA 2DVZA 4G2ZA 1P99A 3JYRA 5FHMA 2UXAA 3BKIB 4EXLA 3TTKA 1SBPA 2DS9A 5KDTB 4LONB 5CM6A 2ZYMA 3K1PA 4YU0A 2ZNTA 1GGGA 2Y7IA 1LCTA 4IO3A 5IKBA 2DWHA 5L9OA 5ISUA 1MPDA 3VLVA 4F39A 2F78A 1B3LA 1Z7NE 1LBCA 4OZ9A 5AA2A 4K3FA 2VOZA 3WAEA 1Q35A 2I3VA 3W15C 3RY3A 3SKPA 3V89B 4BDOA 3LSWA 1AOVA 1R9QA 4H0WA 1AIVA 5B7DA 4DXCA 1A8EA 4R2BA 3BBRA 2DP8A 2QS1A 2GH9A 1I6BA 1QVSA 3PMVA 4KHZE 1MQJA 4ECFA 3W9VA 3G3JA 4GOTA 4RXLA 5L9MA 4AB6A 3Q28A 4HW8A 4KYEA 3MZBA 1XT8A 4LP2B 1IUDA 2ESNA 4NF5B 4HCWA 3KOTA 2R9JA 3TTLA 3H3GA 3EPEA 5AA4B 3C9HA 1EU8A 2XXRA 4KYDA 5I58B 3RPWA 2HCAA 1AL3A 4R74A 1B2HA 4WXJA 4IO2A 1P1OA 2GFEA 2Q8JA 5EYFA 4FECA 1XS5A 4ELPA 4ZECA 1B3GA 3OMBA 5JTYB 3TTMA 3PUWE 1B46A 3SDFA 3EQ1A 1Y3NA 4KCDA 1B40A 4TLLB 4FE8A 3DLNA 4JBZA 4KYSA 1ZIUA 3ECRA 3A3UA 4ZDMA 2ZXTA 3LC8A 2Y7PA 3TMGA 3R6UA 2XXVA 3TQWA 3K1NA 3K00A 2GHAA 2DWJA 1A55A 4G68C 2I3WA 4M1VA 4Q30B 2O68A 4Z7EA 3O97A 3RUMA 3HHGA 3KSJA 1OVBA 4MLVA 2B3FA 4G4PA 4KPTA 2ZYOA 2WKYA 4IY5A 1TFAA 3I5OA 5CMBA 1FQCA 3H7MA 1MXWA 1B4ZA 1D9YA 1DTZA 1S9TA 1PDAA 1R9LA 5H8NB 3OD7A 3UGWA 5CMKA 3HV1A 3QYTA 4G68B 2Q2AA 1YTVA 3TELA 2IEEA 4OFJA 4ZEBA 2HFBA 4QFOA 3IB0A 2VHAA 4OHNA 4R9GA 5CI5A 1H43A 2QMXA 3FUZA 3RGYA 4GF8A 2F7BA 4EQ9A 5TPAA 2X26A 4F31B 4R6KA 2AYSA 3T9VA 4MLQA 1MXVA 3L6GA 4NF4B 4NF6B 1FTOA 1JQFA 4LZ7A 1ELJA 2QMWA 1NNFA 4RNSA 3MUQA 2O1MA 3IJXB 4QFNA 4DLDA 1RYOA 1MRPA 1UTHA 3HSTA 3IL1B 2I48A 2HXWA 4GXSB 4H67A 1Y1MA 3IOWA 3MBPA 3MP1A 4YB6A 1SI0A 1A54A 4EF2A 2G29A 5FTHA 2CZLA 2R6GE 1YCJA 4PFWA 2F7CA 3KBRA 2I49A 4H6DA 5ITPA 1PBPA 1POY1 3PMWA 1SYHA 4XIGQ 2XXHA 3VV5A 1P1WA 4FAJA 5M2VA 1HSEA 5KZTA 1B7ZA 4F29A 2Y7WA 1UTBA 3PUZE 4R2FA 1SVXB 4X9TA 2PT2A 2RINA 2ABHA 2D5WA 3U8QA 1OIBA 3SEXA 3U72A 5DVJA 3SERA 2W7YA 1N04A 1N7XA 3OELA 1MQGA 1QJMA 4P11A 3TPAA 1GTKA 3UIFA 3SEUA 3IR1A 5CMCA 3Q25A 4JXIA 3OSQA 3M3FA 1LFHA 1M5DA 1Y20A 3M3LA 2HZKA 3A3CA 1OVTA 1EH3A 1QULA 2ZNUA 3G3FA 2UVIA 3KN8A 3FJGA 2PYYA 3PD8A 3N6TA 3USDA 3D4CA 3OO8A 2NUVA 1VSOA 1LFIA 4L17A 5H8SA 5I2NA 1JEVA 1QKBA 1YPNA 4FEDA 3E13X 3IO6A 1WVJA 4I8CA 1RYXA 2DWAA 1N84A 1LAFE 4YICA 2HEUA 5DEXB 2OZZA 4FIMA 1Y4TA 1OQGA 3K0VA 3HN0A 1FQBA 3ONMA 3S4UA 2H4IA 1BKAA 1UIUA 4FJPA 5H8QA 2DVCA 3QAXA 1PC3A 4U23A 4YKIA 3PPRA 3R7XA 3HPIA 1B0HA 4UACA 2DSFA 4N6PA 1OMPA 4NF8A 2AL5A 3WAFA 3ZKLA 3B6TA 3EN3A 2DXRA 2Y7RA 3UK4A 5I56A 3T22A 4ONYA 4GLIA 1MPCA 2ZMBA 4YZZA 4ELRA 2O7UA 1XC1A 4R6HA 4OETA 4H8IA 3IAZA 2OWSA 4BDQA 1IXGA 3B6QA 3V5AA 5AA2B 2RCBA 5BUUA 3V83A 3KFMA 3QK6A 3DP8A 2R71A 1DSNA 3CRBA 3TYHA 1SQYA 4IO4A 4G8MA 2H99A 1MY4A 5IAIA 2QRYA 3K6UA 3R26A 4P0GA 4IGRA 3SEYA 2O69A 3PPQA 4RY1A 3A09A 3MJNA 1PB7A 3KG2A 3LR1A 1A40A 4R72A 1JETA 5EHSA 3FJMA 2UYEA 4P0IA 2NWJA 1I6AA 3MVYA 3TDJA 1ZLQA 2G93A 1MQDA 4QF9A 3CG1A 3W9WA 3KJTA 2Z8EA 3FVNA 3DP4A 1MXYA 3K6VA 2VD3A 3O6IA 3PUVE 1A8FA 3G7WA 2F8DA 3SEVA 3RQTA 3OO9A 4ZEKA 2M8CA 4PQJA 1ZTYA 4NEDA 3ODBA 3FVOA 2PVUA 4ZE9A 1BTJA 3RLFE 2CMOA 5TU0A 1OLAA 2P1SA 4O3AA 2GRVA 3Q29A 4JDFA 1XHYA 1J1NA 3DELB 3MW0A 3SESA 3FVGA 1R6ZA 3ILUB 1N76A 5I57B 1MH4A 1LAXA 2OK2A 2UYFA 1WDNA 4OTEA 1B32A 1MQIA 5FHOA 3KN7A 3RTWB 3EHTA 4DZ1A 1B1HA 3HO7A 4ZE8A 2F7AA 1KWHA 2XXIA 1B52A 1IEJA 3U94A 2YPNA 4OFLA 4OEUA 5AA3A 3H03A 5ICTA 4AQ4A 3G3IA 4XKQA 1ZMGA 2HAUA 4YB7A 2REGA 3FXUA 5DTBA 1MY2A 4Q5TA 3H6VA 4LQ5A 1IITA 3MAMA 5DVIA 4BDMA 3EF7A 1Y3PA 1CB6A 4PFTA 2YLNA 1H44A 5EHMA 1MXZA 4YKJA 1SW5A 5K2YA 1QUJA 2AIXA 3HCQA 3PGFA 1JW5A 3BFTA 3U1OA 1BLFA 5DYHA 4QFKA 1LGBC 4XXUA 2XXYA 4WEDA 4ZEFA 3S9LC 3C36A 5TPAB 1XVYA 3PD9A 3OO6A 4EDPA 4RJZA 2H9BA 4NTLA 1IIWA 4LVQA 4FEBA 2FA7A 1MY1A 3TODA 1MH3A 5KCJA 4U1ZA 5HPQA 1F9BA 1D4NA 4KI0E 5H8FA 3U93A 4ESWA 2I6EA 1UTHB 1M5EA 1MPBA 2XXUA 3TTRA 3SEWA 3MZ9A 3MVXA 3UN6A 2QS3A 4LQ2A 3CSBA 4OMBA 4U2RA 1B7HA 3K6XA 2RCAA 1FTMA 2YJPA 3KEIA 4O3CA 4QSEA 1URSA 4IO6A 4GQOA 2DE2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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