1ZE8A

Carbonic anhydrase ii in complex with a membrane-impermeant sulfonamide inhibitor
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase II
publication title Carbonic anhydrase inhibitors: stacking with Phe131 determines active site binding region of inhibitors as exemplified by the X-ray crystal structure of a membrane-impermeant antitumor sulfonamide complexed with isozyme II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ze8A00
5FNGA 3CAJA 5E2NA 1RAZA 3KWAA 3M98A 4E4AA 4TWLA 1G0FA 3RYZA 4HT2A 5BYIA 2AW1A 4QSAA 4ITOA 2NWPA 2VVBX 1I90A 3LXEA 3OKUA 1CNCA 4CNRA 1CNWA 2NNSA 4Q83A 3S71B 1G1DA 4QJOA 4IDRX 1RZDA 4YWPA 4BF1A 1UGGA 1BNUA 1BNTA 3HKTA 1I8ZA 3P55A 3V3FA 5EIJA 3W6IA 3D8WA 1TTMA 4E3GA 3PO6A 1FQRA 3S9TA 5EHEA 3HLJA 1TEQX 3FFPX 1CNBA 1CAIA 2Q1BA 1CNXA 3D9ZA 1V9IC 1AM6A 4HF3A 5AMLA 2HOCA 1HCBA 5SZ1A 4JSWA 1CVEA 1JV0A 1FSNA 3DD8A 5E5UA 5FNHA 1THKA 2CBEA 3MNAA 4R5AA 4KAPA 1ZSCA 3S75B 4LHIA 2FOYA 3P5AA 3S76A 1BZMA 3V3GB 8CA2A 2WEGA 4Q9YA 4K1QA 4N0XB 3MHLA 3UYQA 1ZSBA 3KKXA 3KNEA 4FPTA 4HBAA 4LU3A 5G0CA 1LG6A 3ZP9A 1UGCA 3DC9A 5JDVB 1AVNA 3U47A 4KP8A 4Q0LA 4Z1EA 5A6HA 3V2MA 1BNWA 2NXTA 3MWOA 3DCSA 5DOHA 2CA2A 3U3AX 3P4VA 1G4JA 3M1WA 1IF7A 4ZX1A 3RJ7A 3ML2A 4ZAOA 4HT0A 3M04A 5FNLA 4M2UA 5E2KA 4YGJA 1BCDA 1OKNA 1I9PA 3S72B 4K0ZA 4YX4A 3F8EA 1BNMA 1HEBA 5J8ZA 3S8XA 3D0NA 4YXOA 1YDCA 5CLUA 4R5BA 3OY0A 3P5LA 1XQ0A 3FW3A 3OILA 4MO8A 5DSOA 1CAJA 2FOVA 1XPZA 4CA2A 4QSJA 4RIUA 1KWQA 1HCAA 2FW4A 3DC3A 1CVDA 2NMXA 3W6HA 3BETA 5C8IA 3MHIA 3CYUA 4PYXA 2X7SA 3QYKA 2GD8A 1AZMA 4HEYA 4G7AA 3DAZA 3NB5A 1DMYA 2FNMA 4ETQC 1Z9YA 4PYYA 3HKNA 4Q81A 4RUZA 1CAMA 3DCCA 5CACA 2QO8A 4CNVA 2ZNCA 4Z1JA 3FE4A 3P3JA 1IF5A 3MNIA 3T85A 5DVXA 3OYQA 5BRVA 1MOOA 1A42A 3RYVB 3M2YA 4QJXA 4N16A 4Z1NA 2NXRA 4XZ5A 1RZAA 4Q87A 1BNQA 2CBAA 2Q38A 4QK1A 3N4BA 3V3HB 1CVCA 3RZ5A 3T5ZA 1CA3A 3HS4A 4QSBA 5SZ4A 2WD2A 3V3JA 1BNNA 3N2PA 4Q7SA 4M2WA 4XIXA 3JXGA 5FLSA 5BRUA 4X5SA 3DVDA 1IF9A 2EU3A 3RYXB 4L5WA 1CAOA 5FL6A 4E9OX 1HECA 3K2FA 1FR4A 2W2JA 3SBHA 1I9MA 5A25A 4UOVA 4Q07A 3M5EA 1TEUX 3ML5A 1CVHA 5EKHA 1XEGA 4ZWYA 1FQNA 1BN1A 4ILXA 3Q31A 1OKMA 2FNKA 3HFPA 4CNWA 3K34A 4RUYA 3F7UA 3MNUA 1CAHA 3RG3A 4PXXA 1YDDA 4JSSA 1FQMA 1CANA 1G0EA 3IBIA 1J9WA 4MLXA 3M2XA 5DSJA 4Q8XA 1CRMA 1HEAA 3OIMA 4MLTA 4GL1X 3B1BA 3JXFA 3GZ0A 3MHCA 5FL4A 5G03A 1OQ5A 1CRAA 3MYQA 3P3HA 3SBIA 1MUAA 5SZ6A 4CNXA 1YO0A 4K0SA 1I9LA 2NWZA 2QP6A 1UGAA 2O4ZA 1TG9A 3K7KA 4CQ0A 3PJJA 2NN1A 2ABEA 5DSPA 5DSIA 3M14A 1FR7A 3KONA 3MZCA 4WR7A 3CA2A 4MDGA 2NXSA 4XIWA 2POVA 1G54A 1H9QA 3HKUA 1G52A 1G6VA 4HEZA 1RAYA 3TVNX 2FOQA 1OKLA 3RG4A 3IBUA 1DMXA 2OSMA 1RJ5A 3MHOA 3NJ9A 4Q08A 1CIMA 1LZVA 2WEJA 1CZMA 2HNCA 3V2JA 4YGKA 5JEPB 1UGDA 1FSQA 4KP5A 5DSKA 1CNHA 4ZX0A 5FNKA 2WEHA 3SAPA 4E49A 1ZH9A 3U45X 2QOAA 5E2SA 4QY3A 4C3TA 4JSAA 4KNMA 3MHMA 5FLTA 5SZ5A 3IBLA 1ZGEA 3IEOA 3TMJA 4QIYA 4WL4A 2H4NA 7CA2A 1Z97A 3D92A 1H9NA 4MTYA 5FLQA 3M5TA 3MDZA 4Z0QA 3ZNCA 4DZ7A 3KOIA 3M1JA 4KV0A 5E2MA 3DVBA 1CCUA 5DSQA 4KNIA 4WUQA 3RZ0B 3NI5A 3M2NA 4YGLA 1BV3A 4FVNA 2WD3A 2AX2A 1CNYA 4YXUA 1BN3A 5G0BA 3PYKA 5FL5A 1HEDA 3N3JA 3M1KA 4Q78A 5SZ0A 4Q90A 4FRCA 4E5QA 4YHAA 1XEVA 1TH9A 1UGBA 4ZWZA 3P44A 2ILIA 5DSRA 3S73B 1G48A 4RFDA 3RZ8A 12CAA 3C7PA 5FNIA 1CNIA 1RZEA 3S74B 1CAYA 3IAIA 1CNKA 2Q1QA 3R16A 1HUGA 3KS3A 4FL7A 3DCWA 4QJWA 2NWYA 3DVCA 1TB0X 4TWMA 1LGDA 3S97A 1DCBA 3T5UA 1I9QA 1TG3A 4FVOA 4QSIA 1FLJA 4KNJA 4L5VA 4XE1A 4XFWA 3SAXA 5BNLA 4Q6DA 3OYSA 1Z93A 5FNJA 1IF4A 1ZE8A 1CCTA 2NN7A 4WW8A 3MNHA 3M96A 4JSZA 4Q7PA 1T9NA 5AMDA 4KUWA 4DZ9A 3OKVA 2EZ7A 2HFWA 4LP6A 5EOIA 1KWRA 1YDBA 3KOKA 3T84A 3BL0A 2POUA 4KUYA 4Q8ZA 3EFIA 1RZCA 2F14A 3KLDB 4MDLA 4RUXA 1G45A 2NWOA 4E3FA 5EKMA 4COQA 4E3DA 4R59A 4Z1KA 3RYJB 1KOQA 4QTLA 3RGEA 2NNVA 5EH7A 4BF6A 1BN4A 2CBBA 4RH2A 1BICA 4ZWXA 3TVOX 2X7TA 4Q6EA 1UGFA 5DSLA 5JG5B 1JCZA 3U7CA 1TE3X 1I9NA 2CBDA 5E5RA 6CA2A 2FMGA 3V3IB 5EHVA 9CA2A 5JG3B 5LMDA 1TBTX 5G01A 3DD0A 4M2RA 1ZGFA 3HKQA 1G46A 2HD6A 5CA2A 4HU1A 5FDIA 5JGTB 1FSRA 1I91A 3OIKA 4KUVA 4RIVA 1RZBA 5SZ2A 5E28A 3M3XA 5FNMA 4BCWA 2CBCA 2HL4A 3IBNA 1YDAA 5FLPA 1CCSA 2HKKA 3P58A 3DA2A 2POWA 4QEFA 1YO1A 5JESB 1F2WA 1ZFKA 1V9EA 5L3OA 5JQ0A 2FMZA 1EOUA 4E3HA 5SZ3A 3T83A 4Q49A 2GEHA 1IF8A 2IT4A 1RJ6A 4Q7VA 1CVFA 4CACA 3L14A 1ZNCA 2CABA 4QJMA 1CINA 3DV7A 5DRSA 1FQLA 1I9OA 1CVAA 4Q7WA 1HVAA 1URTA 5EH8A 5L6KA 1CNJA 4G0CA 3M5SA 3M40A 2FOUA 3M67A 5EKJA 5EH5A 4ZWIA 3JXHC 3D93A 4KNNA 5DSMA 4Q06A 1LUGA 3VBDA 3V5GA 3CZVA 4L5UA 4QK3A 4JS6A 4Q8YA 1KOPA 3F7BA 5DSNA 3UYNA 4FIKA 4MDMA 1CILA 2VVAX 4YVYA 4WUPA 4RFCA 1CVBA 1LG5A 4PZHA 5FLOA 3S78B 3M1QA 2NNOA 5FLRA 4WW6A 5BRWA 4FU5A 4QK2A 4K13A 5FDCA 3RYYA 5CJFA 3T82A 5JGSB 1CA2A 1KEQA 1UGEA 4ITPA 5IPZA 2WEOA 2FNNA 3N0NA 3RZ1B 5HPJA 3MNKA 3R17B 3B4FA 5JEHB 1CAZA 5JEGB 3RLDA 1ZSAA 5JQTA 2H15A 3M2ZA 3KIGA 4PQ7A 1IF6A 1ZFQA 3MNJA 4K0TA 4YGFA 2X7UA 4QJ0A 3V7XA 4YYTA 1JD0A 3MMFA 1YO2A 4RN4A 5EHWA 4QIZA 4Y0JA 4YXIA 1H4NA 4QJPA 3RZ7A 5EZTX 3S77B 4HEWA 4Q09A 2FOSA 4IWZA 3BL1A 1G3ZA 1HUHA 5DOGA 3IGPA 1CAKA 2OSFA 5SZ7A 4M2VA 1CNGA 5E2RA 1CALA 5AMGA 3EFTA 4YGNA 1DCAA 1G53A 1Y7WA 4Q99A 3F4XA 2EU2A 1BNVA 3DBUA 1G4OA 2NNGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5FNG A;  3CAJ A;  5E2N A;  1RAZ A;  3KWA A;  3M98 A;  4E4A A;  4TWL A;  1G0F A;  3RYZ A;  4HT2 A;  5BYI A;  2AW1 A;  4QSA A;  4ITO A;  2NWP A;  2VVB X;  1I90 A;  3LXE A;  3OKU A;  1CNC A;  4CNR A;  1CNW A;  2NNS A;  4Q83 A;  3S71 B;  1G1D A;  4QJO A;  4IDR X;  1RZD A;  4YWP A;  4BF1 A;  1UGG A;  1BNU A;  1BNT A;  3HKT A;  1I8Z A;  3P55 A;  3V3F A;  5EIJ A;  3W6I A;  3D8W A;  1TTM A;  4E3G A;  3PO6 A;  1FQR A;  3S9T A;  5EHE A;  3HLJ A;  1TEQ X;  3FFP X;  1CNB A;  1CAI A;  2Q1B A;  1CNX A;  3D9Z A;  1V9I C;  1AM6 A;  4HF3 A;  5AML A;  2HOC A;  1HCB A;  5SZ1 A;  4JSW A;  1CVE A;  1JV0 A;  1FSN A;  3DD8 A;  5E5U A;  5FNH A;  1THK A;  2CBE A;  3MNA A;  4R5A A;  4KAP A;  1ZSC A;  3S75 B;  4LHI A;  2FOY A;  3P5A A;  3S76 A;  1BZM A;  3V3G B;  8CA2 A;  2WEG A;  4Q9Y A;  4K1Q A;  4N0X B;  3MHL A;  3UYQ A;  1ZSB A;  3KKX A;  3KNE A;  4FPT A;  4HBA A;  4LU3 A;  5G0C A;  1LG6 A;  3ZP9 A;  1UGC A;  3DC9 A;  5JDV B;  1AVN A;  3U47 A;  4KP8 A;  4Q0L A;  4Z1E A;  5A6H A;  3V2M A;  1BNW A;  2NXT A;  3MWO A; 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