1ZIUA

Crystal structure of nickel-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA01
3KOTA 5DEXB 4OENA 1GVCA 1URDA 3ZS6A 1OVTA 4R6YA 2UYFA 3DP6A 3K4UA 3U8QA 1MXYA 3ZKLA 3CSGA 3ONMA 5JEIA 2ALUA 2DE4A 1D9VA 2P0SA 4F18A 4RYAA 2HCAA 1EU8A 2GHAA 2XXUA 4BDQA 3FVNA 2ZNUA 2IA4A 1MH3A 2ZMBA 3QUFA 2F36A 2GH9A 4TQUQ 3Q27A 3W9WA 3U93A 2D5WA 4LP2B 3V8XB 3H6UA 3QK6A 5AA2B 4DZ1A 4LQ2A 4KYEA 1WODA 4C1UA 4RY1A 2OWTA 3MZBA 4GWOA 5I57B 1UIUA 4U1OA 4ZE8A 1MXZA 3FZVA 1TWYA 4IO7A 5FHNA 1UIVA 3O97A 5CBRA 2AL5A 2BJJX 1HSEA 3TUSA 2XXPA 1LAHE 2QSXA 2DWJA 5DYHA 5AE4A 4P0GA 4IO6A 3FVGA 2DXYA 2REGA 1H3DA 2O6AA 5FHOA 4FAJA 3CR9A 3QYTA 4JWOA 2NWJA 4ELQA 1SBPA 3MVXA 3PV0E 1DOTA 1FTMA 2ONKE 4JWYA 3U94A 4NF4B 5KCJA 1B1HA 4R73A 5TPAB 3SEWA 3TDJA 1B32A 1JNFA 3KSXA 3QXMA 5CMCA 3R7XA 2R6GE 3SKPA 3EQ1A 4JBZA 4KCCA 3S2VA 1M5CA 4PFTA 4Z7EA 3L6GA 1MXXA 4Q5TA 2AL4A 4UA8A 2B3BA 2NOOA 4ZE9A 3K02A 4YB7A 4ISUA 1FTKA 5I2KA 3M3KA 3MUQA 1SDXA 1FTOA 3QAXA 1NFTA 2I6EA 2DS9A 1OMPA 2F8DA 3P7IA 4DDDA 3FD3A 2Y7WA 3V5AA 1LAFE 3KOSA 3FXRA 1D9YA 1P1UA 3EN3A 2F7CA 4NE4A 4Q30B 1XC1A 2X7PA 3VFJA 3MP1A 3RTFB 4GIZA 3RN8A 2QS1A 3K6VA 4KYDA 1US4A 4JDFA 1I6BA 1JW5A 4F1YA 5M2VA 3IORA 3O9PA 3MPLA 1FTLA 1IIWA 3U1OA 3TEPA 3RT6B 2ZNTA 1B1XA 3K6WA 4ZS9A 1LAGE 5B7DA 3OELA 4PFYA 4QRZA 1VSOA 2G93A 3CFLA 1MRPA 4G2ZA 4YB5A 3UORA 1UTHA 4EDPA 4WXJA 5A5XA 2VOZA 3TQLA 1H76A 3H3GA 2OLBA 2F7AA 2OK2A 3C4MA 1BP5A 4YKKA 3RGYA 5H8NB 4U4SA 2HAVA 4YU0A 2HXWA 5EYFA 3MZ9A 3KEIA 5I58B 2H5YA 2Q9TA 4DLDA 3TTMA 3OOAA 1BTJA 4BDRA 3U72A 2PVUA 2Z23A 1B05A 4DXCA 2X7QA 3VXBA 4PFUA 1ZJLA 4Q8RA 3GBBA 5KDTA 3TTNA 2Q89A 5H8QA 5TP9A 1MY3A 1D3KA 3FASA 2Y7KA 4F3GA 4RPOA 3OMBA 4YAHX 3VLUA 3MBPA 4OEUA 5CI5A 2RKMA 2QMXA 3FIRA 1MS7A 2PT1A 1OQHA 3FXUA 1FW0A 2I0BA 4MF3A 5AA3A 1PB7A 3MJNA 3PMVA 3VXCA 2F35A 1UTBB 3MP6A 3EHTA 2YPNA 1MQGA 3Q25A 5I56B 1B7ZA 2XXXA 2O1MA 4WKMA 2O51A 4NTLA 2ZXTA 3BKIB 2A5SA 5ELVA 2FYIA 2P1SA 3SERA 5IKBA 4R9GA 3ECRA 3U92A 4ZEIA 2DWAA 3M8UA 4LZ5A 1MQIA 1AL3A 3G3IA 2XXWA 5EHSA 1USYE 3RPWA 3B7DA 1FQFA 3UK4A 3KN3A 2Y84A 1O7TA 4GFRA 4F2OA 3FJ7A 1LFHA 4QFNA 4L17A 3DELB 1Q1KA 4PFWA 3T93B 2XX7A 2GRVA 4R9FA 4YKJA 5DVJA 4IGRA 4ZECA 1A54A 4NF6B 1WVJA 4F2QA 4GQOA 3TTKA 1OQGA 3KN8A 4ZEDA 4RA1A 2B3FA 5HM4B 4GVOA 1Y3PA 3DP8A 1PBQA 1LLSA 3VLVA 3RQTA 2DE2A 3LC8A 1DPPA 1NKXA 2DE3A 3TCFA 4G77A 5LOMA 3LR1A 4XXUA 1II5A 1B5JA 1IXCA 2O1LA 5AA4A 2HQ0A 1SW2A 3A3CA 5L9SA 1QJMA 2I3VA 1NNFA 3Q28A 3HPIA 4FJPA 5DT6A 5H8HA 1R9LA 4JWXA 4H8JA 3T22A 4JB7A 4G68C 2XXIA 3HO7A 4OMBA 4BDNA 2ONSA 4QHQA 4DXBA 2GHBA 1Z7NE 3PPOA 1D4NA 4ZEFA 2GFEA 1MM7A 2REJA 2XX9A 1EZ9A 3H7MA 5L9OA 1DSNA 2I58A 1POY1 1B3GA 2ESNA 1N0TA 3LUYA 3F11A 5IAIA 4KFQA 3IOVA 4QFOA 3G7WA 1Y3NA 2XD2A 1WDNA 2RCAA 5H8FB 1B4HA 2VGQA 1Q35A 1SYHA 4H65A 1JW4A 1POTA 2Z8DA 1N3WA 1SQYA 3K1PA 4FIMA 4RJZA 2R9JA 4E0WA 5CM6A 1SI1A 1JETA 1BLFA 2NVUB 4F3BA 1CB6A 4MH5A 3M3LA 3D4CA 4IO3A 1MPDA 3FV2A 4POWA 3IB1A 2AIXA 5I59A 1GGGA 3MVWA 3JZJA 1MQDA 2D3IA 3JYRA 3LSFB 1P1QA 4OQOA 3JV9A 1A8EA 4NF5A 1A55A 1TT1A 4ELPA 5CBSA 1Y1MA 4QSDA 3IJXB 3O6HA 2UVJA 4IO2A 1URSA 3FVOA 4POXA 2YLNA 4PQJA 4ESXA 1MG1A 3N5LA 1OVBA 2I4BA 2ZYKA 2F6PA 2XXHA 3A09A 4GXAA 5JTYB 2XXVA 1R6ZA 2DVCA 4HS7A 1DMBA 3TELA 4KI0E 2RC7A 4R2BA 1FQAA 4OEVA 2D21A 4H1XA 3VLWA 3K1MA 1MDP1 4IO4A 4TOZA 4GOTA 1SD3A 1USYH 2Y7IA 3DM0A 4MFIA 4IO5A 4RK9A 1B3HA 1P1OA 3GBAA 4AQ4A 3PD8A 1IXGA 5L8DA 3E3KA 2H25A 3IOUA 3FGSA 1Z7ME 2A5TB 3H6VA 1B0HA 4LQ5A 2XD3A 1I69A 1VFEA 3HN0A 3G3HA 2H98A 1LBCA 4YMAA 2OWSA 4G4PA 1GV8A 1DTZA 1MY1A 1URGA 1AOVA 2THIA 5ISUA 3USDA 1ELJA 4N13A 1AMFA 1RKMA 4OTEA 1GTKA 4GL0A 2HZLA 4MBPA 5DEXA 4LZ8A 2W7YA 4R75A 1AIVA 3O29A 1MQHA 2XXYA 2PBWA 4R2FA 4FEBA 1JVXA 3N6UA 4G68B 2XXRA 1NH7A 4JXIA 4HCYA 3HHFA 5EHMA 3OO6A 4KD5A 4E0XA 1ATGA 3PPPA 4I8CA 4KR5A 2E1SA 2DP8A 3E4RA 3ZSFA 1B9JA 4EQ9A 5BUUA 4F29A 3GZGA 5DTBA 4O3CA 3TFLA 2HZKA 1B4ZA 3TPAA 3W9VA 3KJTA 4ZZEA 1B7UA 1N7XA 3OEKA 4F3PA 3PGFA 1A40A 3FUZA 4EF2A 4FATA 2PX1A 1QKBA 4M1VA 5I57A 2RF1A 1MPCA 3PUYE 2OZZA 4P11A 2UVHA 4FORA 5FTIA 4BDLA 3KJ7A 2V25A 4IY5A 3R26A 2ABHA 4KHZE 3B6QA 5DVFA 3IOWA 1KWHA 3QIMA 3OO9A 3MP8A 3K00A 3TCGA 3UA8A 2DWHA 4GRKA 3OENA 4ZDMA 4YMBA 4BDOA 1PBPA 3KN7A 3IAZA 2P2AA 4R74A 2PMSA 5F1QA 2QJEA 1JEUA 3S4UA 3T9UA 2F5XA 4QSEA 5TPAA 1MH4A 3T9XB 5AA4B 5I2NA 1DTGA 3IB2A 3OSRA 1Y20A 3O6GA 2LAOA 4NF8A 1FTJA 3FJGA 4U23A 3LBSA 2UXAA 1HSLA 3M3FA 1P99A 2QS4A 2UVIA 4WEPA 1OIBA 5H8HB 4BLAA 2KLFA 3A3UA 5ICQA 3H6TA 2V3UA 3VVFA 4X48A 3K6UA 1HSJA 4FEDA 4ZZAA 1EZPA 2XXTA 4QSCA 4OERA 5F7VA 3K01A 4F39A 4FECA 4LONB 1N84A 5FHMA 1R1NA 1JVYA 4P0IA 3SEUA 4F1VA 1N76A 1QKAA 3E13X 3PPNA 3O28A 1L5TA 4ZEBA 2DOJA 3G3FA 2Q88A 1IQ7A 4O3AA 3ILUB 5CMBA 1LSTA 1R9QA 4ELRA 1PB8A 3E9XA 3MVZA 3K1NA 4IGTA 2NXOA 1B51A 4FE8A 5CRYA 4PP0A 1ANFA 4C0RA 3PMXA 4OXVA 4O3BA 2ONRA 2H4IA 3THIA 1ZTYA 5L9MA 1I6AA 1O63A 2ZNSA 1H45A 3I3VA 2V84A 3O2AA 1O64A 1XT8A 2DWIA 4OHNA 2F7BA 4AB6A 3C32A 3TTLA 3IL1B 1M5FA 4PE5B 1ZKBA 4DXUA 2QS2A 3VV5A 1A7LA 4G8HA 3GLBA 3OO8A 3ZKKA 2I4CA 2OCUA 3B6WA 4QF9A 4NF5B 4KYSA 2O68A 3MWBA 1H43A 1RYXA 1SW5A 1MQJA 5CMKA 2CZLA 1ZMGA 1GR2A 4ELOA 5H8NA 2DXRA 1MXVA 5AA2D 4OESA 1LBBA 5I58A 4U21A 3PMWA 2I48A 5HBCA 4RNSA 3KFMA 3QUJA 5AA1A 3EF7A 1S7YA 1PEBA 4R6KA 4OFLA 4UACA 1RYOA 3PUZE 3K0VA 2UYEA 1S50A 1PC3A 3S9LC 1AH5A 2Y7PA 1MXUA 5ICTA 3PU5A 1FQCA 3T96B 5KCJB 4NMYA 4K3FA 1XOCA 3RTWB 3PUWE 2RC9A 1SW4A 4NEDA 2XXQA 4ESWA 3SEVA 3WAEA 4DCXA 3CG1A 2FA7A 1UTBA 3R6UA 4X9TA 3IOTA 1LFGA 4H5GA 5TU0A 5I56A 1TXFA 4OVJA 2QL3A 1B7HA 3CFZA 3TYHA 3WAFA 1NL5A 3MPKA 1SVXB 3C33A 4EQBA 1P1WA 4BDMA 3EHSA 2Q8JA 5I2KB 4X1DA 3PPQA 3TTRA 3LSWA 1US5A 2M8CA 3TCHA 1XVYA 1XVXA 3T9VA 3PD9A 1B2HA 1YAEA 3L6HA 1Y1ZA 3FATA 2HFBA 5HPQA 4Q0CA 1YTVA 4XIGQ 4IY6A 4QFPA 1EZOA 3FJMA 4ECFA 4X1BA 3CIJA 1UQWA 3PUXE 4NF6A 4TLMB 3B6TA 3IR1A 3S9MC 4PETA 1M5BA 4ONYA 4OFOA 5ITPA 2UVGA 3I6VA 3TZAA 1B46A 5KZTA 5H8SA 4G8MA 5K2YA 4U2RA 4LVQA 3MZ1A 1F9BA 5ITOA 4HW8A 2F97A 3Q26A 1BIYA 4YICA 5BWJA 4GD5A 4RXLA 1VE4A 3N6TA 1LAXA 2YJPA 4HTGA 4F1UA 2I0CA 1OLAA 1ZLQA 2DSFA 3K6XA 2Z8EA 2CMOA 4AB5A 4OETA 1UTHB 3T66A 4GXSB 5A5XB 4OWDA 4XKNA 1IUDA 1LCTA 2ZYMA 4WEDA 1PDAA 2DYXA 2QPQA 2HAUA 2RCBA 2XHDA 3HSTA 1FQEA 4GLIA 4EXLA 3DP4A 1M5EA 1B3EA 2ZYOA 1LGBC 1MXWA 4DIGA 1I6QA 5KDTB 3VDFA 1LB8A 4XTCQ 4G8NA 5H8QB 1B3FA 5I2NB 2V3QA 2F6GA 5TP9B 4YKPA 4OZ9A 4JSDA 3G3GA 1N3XA 3C31A 1ZBMA 4NF8B 2QMWA 5JK4A 1XS5A 3C36A 2VP1A 1Y4CA 1J1NA 3UN6A 3H6WA 4U4XA 5H8FA 5I84A 2I3WA 2Q2AA 4EXKA 1NH8A 1NNTA 4N6PA 3LSLA 1IXHA 2G29A 2XX8A 3PPRA 3C35A 3BBRA 1TFAA 1LB9A 3KGCA 2PT2A 4YZZA 4YKIA 1BKAA 3VVDA 5AA2A 1MY0A 4F22A 3OEMA 4C1TA 4H8IA 2RC8A 3O6IA 4QFLA 5B70A 1SYIA 1FCKA 4QFKA 4U1ZA 1S9TA 5FTHA 2IEEA 4XKQA 3W15C 4F31B 2RINA 3K2DA 3VVEA 1CE2A 3CSBA 4F19A 2H99A 2F34A 3N94A 4KQPA 4GF8A 4RPNA 4LUBA 4I9DA 2PYYA 1Y3QA 1JQFA 1NMUA 3IO4A 3H06B 2VD3A 3EHUA 1XHYA 3UIFA 3V89B 5JTYA 2VD2A 1JEVA 1B0LA 4R72A 3TODA 3S9NC 1TFDA 1ZIUA 3SDFA 3H03A 3KSJA 3UP9A 3IJOB 3FVKA 1DPEA 3HHGA 1MY2A 3CVGA 3CI8A 3QSLA 4LATA 2F78A 4NF4A 3FXQA 3FV1A 3SETA 3GXAA 1LFIA 2WKYA 4I1DA 1P1NA 3O66A 4Z0IA 4M4GA 3IK6B 3MW0A 4RK2A 2A5TA 3G3JA 2DVZA 4OYVA 3G3KA 1MPBA 2O84X 1FQBA 1QUKA 1H44A 1QULA 1B52A 1IITA 1NNPA 3CRBA 3CFXA 1JW1A 3RLFE 2VHAA 2ANJA 2ZYNA 2NUVA 3AXFA 2HEUA 3RY3A 4OFJA 3MAMA 3Q29A 4GL8A 3VE1B 3ILTB 1T0KA 2V93A 4DE8A 5CMMA 3IB0A 5K2XA 1QUJA 4G68A 2QS3A 2V3TA 3RT8A 1A99A 1Y4TA 1YCJA 5CC2A 4MLQA 4XKPA 1IZ1A 4KCDA 3I5OA 3IX1A 1LCFA 4TLLB 4DCYA 4JSOA 4MLVA 2I49A 3MQ9A 1YPNA 2H9BA 3MVYA 1IEJA 3TAJA 1B40A 3H4ZA 3S9EA 3T9HB 2DQVA 2E0SA 3OXNA 4U22A 1N04A 4H67A 4ZEKA 3OSQA 4H6DA 1N7WA 4KPTA 3C9HA 3PUVE 3RNNA 4N07A 3CG3A 1M5DA 3KG2A 5I59B 1ZU0A 3HV1A 4XKRA 2O7IA 1B3LA 2O69A 2FNCA 1VR5A 1SW1A 3KZGA 1MM6A 3RUMA 4LA9A 1VFDA 3SESA 4EUOA 3UGWA 1NNKA 1OLCA 1EH3A 1MDQA 3LSXA 5DVIA 2AYSA 2Q2CA 3N26A 4THIA 4LZ7A 4H5FA 4IB2A 4I62A 1IXIA 3OO7A 3SEXA 1MY4A 3OD7A 2B65A 3BFUA 3EPEA 2X26A 3V83A 3HCQA 3IO6A 2Z22A 1PB9A 1Y9UA 3KBRA 4NWCA 4YB6A 4R6HA 3DLNA 4NWDA 4H0WA 1B5HA 3TQWA 3ODBA 3D4GA 1FQDA 3TKDA 4EQ7A 1QUIA 4EF1A 1B6HA 1B5IA 2Z8FA 3SEYA 1SI0A 1QVSA 1QW0A 2O7UA 3BFTA 2OJTA 2OBGA 2QRYA 1A8FA 2R71A 1B58A 2Y7RA 5J1DA 4F3SA 4ND9A 3C34A 3MC2A 3TMGA 4HCWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1K9ZA 3KOTA 4OENA 5DEXB 1GVCA 1URDA 3ZS6A 1OVTA 4R6YA 2UYFA 3DP6A 2Q8MA 3K4UA 1EYIA 3U8QA 1MXYA 1FPDA 1G0HA 3ZKLA 3CSGA 3ONMA 5JEIA 2ALUA 2DE4A 1D9VA 2P0SA 4F18A 4RYAA 2HCAA 1EU8A 2GHAA 2XXUA 4XFEA 4BDQA 3FVNA 2ZNUA 2IA4A 1MH3A 2ZMBA 3QUFA 2F36A 2GH9A 4TQUQ 3Q27A 3W9WA 3U93A 2D5WA 4LP2B 3V8XB 3H6UA 3QK6A 5AA2B 4DZ1A 4LQ2A 4KYEA 1WODA 4C1UA 4RY1A 2OWTA 1NV1A 3MZBA 4GWOA 5I57B 2XWIA 4P1EA 1UIUA 1NUYA 4U1OA 2CZHA 4ZE8A 1MXZA 3FZVA 4HE2A 1TWYA 4IO7A 5FHNA 1UIVA 3O97A 4PFIA 5CBRA 2AL5A 2BJJX 1HSEA 3TUSA 2XXPA 1LAHE 2QSXA 2DWJA 5DYHA 5AE4A 4P0GA 4IO6A 3FVGA 2DXYA 2REGA 1H3DA 4PC9A 2O6AA 5FHOA 4FAJA 3CR9A 3QYTA 4JWOA 2NWJA 4ELQA 1SBPA 3MVXA 1IMBA 3U65A 3PV0E 1DOTA 1FTMA 2ONKE 4JWYA 3U94A 4NF4B 5KCJA 1B1HA 1EYKA 4R73A 5TPAB 3SEWA 4P56A 3TDJA 1B32A 1JNFA 4MMPA 4PDHA 3KSXA 3QXMA 3GYYA 5CMCA 4PGNA 3R7XA 2R6GE 3SKPA 3EQ1A 4JBZA 4KCCA 3S2VA 1M5CA 4PFTA 4Z7EA 3L6GA 1MXXA 1RDXA 4Q5TA 2AL4A 4UA8A 2B3BA 2NOOA 4ZE9A 3K02A 4YB7A 4ISUA 1FTKA 1FSAA 5I2KA 5ET8A 3M3KA 3MUQA 1SDXA 1FTOA 3QAXA 1NFTA 2I6EA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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