1ZIUA

Crystal structure of nickel-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ziuA01
3CG3A 4DXBA 1M5BA 3BKIB 1MDP1 3TDJA 4ZS9A 3EPEA 5DVJA 5JK4A 5DTBA 4AQ4A 5CMBA 3S9MC 3H4ZA 2GHAA 2XXPA 3EHTA 2THIA 1O63A 1JVXA 2E1SA 4ZEBA 2PYYA 1I6AA 2F7CA 4UA8A 4GXAA 4G68B 5AA1A 2O1MA 3LSFB 3DLNA 1LFGA 2Q8JA 3FVKA 3TEPA 2XD3A 4X1DA 5TP9A 3MAMA 2ONRA 1D9YA 1LFIA 3QXMA 2V25A 1RYOA 4H6DA 4LZ5A 4X48A 1EZPA 3SEWA 3UN6A 1LCTA 2RCBA 2CZLA 3ONMA 3DM0A 4DXCA 4BDRA 1QUIA 3P7IA 4O3AA 4WEDA 1MXZA 5BWJA 3BFUA 1ZBMA 4PFTA 2NWJA 4ELPA 5K2YA 3W9VA 4LZ8A 4YKPA 3K00A 4R75A 3KG2A 1N04A 3OO6A 1LCFA 3FATA 3KN8A 2DWJA 1CB6A 1JETA 4IY6A 3OSQA 3V8XB 3A3CA 1DPPA 4G68A 1MS7A 2GHBA 3CI8A 4IY5A 2AIXA 3T93B 2ALUA 4QFOA 4Z7EA 5EHSA 1B4HA 4IO5A 4OMBA 4FECA 4DIGA 2PT2A 1XVXA 1ZLQA 4PETA 4FIMA 3MVXA 3U8QA 1LAHE 2ZYOA 2O1LA 3KN3A 2PT1A 5DT6A 3TODA 3C33A 5TPAB 1CE2A 1POTA 4Q30B 2M8CA 1MXXA 3OEKA 4TLLB 1XVYA 1VFEA 5I84A 1OQGA 4EDPA 4BDLA 3I5OA 4F29A 3C32A 3M3KA 2F36A 4BDQA 1B3FA 4ZDMA 2XXXA 4EQ9A 1OMPA 4OXVA 3ZKLA 4F1VA 1D9VA 4KFQA 2XD2A 4DLDA 1A8FA 2VOZA 3MP6A 3RT8A 4RNSA 1LBBA 3TFLA 3KSXA 3EF7A 2AL5A 3SEYA 2FYIA 4U23A 4GVOA 2UVJA 2UXAA 1R9QA 3QIMA 1B52A 2ZYNA 1OLAA 3HHFA 5FHMA 3TELA 1PC3A 2XX9A 4JWOA 3HHGA 3OD7A 5FTHA 3SEUA 5K2XA 3N94A 4ZZEA 2XXTA 4NF5B 1N7XA 3G3GA 3PUVE 4QSDA 3FXQA 5TPAA 1BIYA 4Q8RA 2I4CA 4GRKA 1NNKA 3N5LA 1HSJA 1B5JA 3FJ7A 3H3GA 3PUYE 1O64A 2OWSA 1LB9A 2Z22A 1SW5A 3TQWA 3KEIA 4OQOA 2QS4A 5ITPA 4OVJA 4YMAA 3K01A 4F39A 3T96B 3A09A 1B3LA 2XX7A 3LSLA 1LLSA 1B3EA 2O7UA 1QUKA 4KD5A 3R7XA 1B7HA 3Q25A 4F2QA 3IJXB 3TUSA 1NH8A 4IO3A 4R9GA 1SW2A 3C4MA 1Q35A 3CRBA 4LONB 2OLBA 4WXJA 3KN7A 1DMBA 3SESA 4UACA 3MQ9A 4GFRA 2I6EA 4IB2A 1PDAA 1AIVA 3SERA 3O6HA 4HS7A 4NF5A 1MPDA 3K6VA 2O7IA 4O3CA 1J1NA 1FTOA 1BKAA 3QSLA 4FEDA 1MPCA 4JSDA 2RCAA 4I62A 2YLNA 1B0HA 2DQVA 2DYXA 3JV9A 5DVIA 3K6WA 1P1WA 1MDQA 1S7YA 2DOJA 3G3HA 4XTCQ 2AYSA 1URSA 3OEMA 4HTGA 4EF2A 4AB6A 3UORA 2F8DA 1Y4CA 1MQGA 2REGA 1S50A 2F6GA 2X7PA 4HCWA 1SYHA 3S9NC 5I2NB 3VLVA 3PMVA 1NL5A 4NF6B 1Y3NA 5HM4B 5I2KB 3MJNA 3IK6B 5AE4A 3IX1A 4GIZA 4G68C 3TCHA 3H06B 1GGGA 2OBGA 4YMBA 1N3WA 2H98A 1B1HA 3O28A 4ZEKA 2F35A 5I56B 1Z7NE 4IO4A 3PMXA 1P1NA 1QKBA 4OESA 4ZEIA 3TCGA 5B70A 5EHMA 5HBCA 1XS5A 2VD3A 1MQDA 3DP4A 3OO9A 3CR9A 4F18A 4GL8A 3N26A 4YKJA 4LQ5A 2B3FA 1URDA 4IO7A 1A99A 3PPNA 1MXUA 4NE4A 2R71A 3PD8A 2ZNUA 3DP8A 4YU0A 5IKBA 2UVIA 3OENA 4DCXA 1PBPA 2HFBA 1WODA 3TYHA 4OZ9A 1NMUA 4QHQA 5ITOA 2NUVA 1FTJA 3LSXA 1USYE 1SI0A 4GWOA 1T0KA 4RA1A 3CFLA 2F5XA 4P11A 2F34A 3B6WA 1TFDA 5I2NA 4NF6A 2DXYA 4POXA 1DTGA 2H9BA 4K3FA 5I2KA 2X7QA 2ZNTA 5H8FB 3SEVA 4FEBA 3TTRA 3KBRA 1LAFE 1N0TA 1FTMA 2AL4A 2XXQA 3MBPA 2XXYA 1I6BA 1Y1MA 4G4PA 2PVUA 1IUDA 2XXWA 3FASA 4FE8A 3HO7A 4Q5TA 2V84A 3L6GA 1MG1A 5I56A 3O97A 3WAEA 1D3KA 2CMOA 1A40A 4ZE8A 3QK6A 1QUJA 3FUZA 3K4UA 1MY3A 2Y7RA 1F9BA 3IOVA 5L9OA 4GL0A 3G3FA 4LUBA 3OO8A 1B1XA 2DE3A 4KPTA 3S9EA 3RN8A 1JW4A 3IO6A 3TTMA 2V3QA 1B7ZA 3FVNA 1ANFA 3LSWA 3HPIA 3B6QA 3I3VA 2QJEA 3TTKA 3HSTA 4MFIA 4RXLA 4OERA 1MXWA 3CIJA 4MLVA 5L9SA 4U22A 1IXCA 2Z23A 3PUWE 1MY0A 4M1VA 3IAZA 4RPOA 2OWTA 3O6GA 4RK2A 4QFPA 5H8FA 3U1OA 1FCKA 1NFTA 2D5WA 2QPQA 1QJMA 3VVDA 4DCYA 1NKXA 1H43A 2LAOA 1ZMGA 3VLUA 3MVZA 4H1XA 3VXBA 2DWIA 3RNNA 3FGSA 1VFDA 3HV1A 1RYXA 4U1OA 3VDFA 2F97A 1PBQA 1TXFA 5ELVA 1MH4A 4E0WA 4I9DA 3IB1A 1FQCA 1N7WA 1JNFA 3CFXA 3G3IA 4U4SA 3F11A 3PPPA 4F2OA 4AB5A 1SYIA 1ZJLA 4PFUA 4ISUA 1MXYA 4YKIA 3RY3A 4KHZE 4ESWA 2Z8EA 1DSNA 4ZE9A 4KQPA 3VXCA 1YTVA 4RJZA 1OQHA 1OVBA 3IL1B 1O7TA 1LB8A 3M3FA 4YICA 4ELOA 1SW1A 1R1NA 2OZZA 5CBSA 1PEBA 1Q1KA 3FXUA 2XXRA 4EF1A 1QVSA 3KSJA 5I57B 2Q88A 1KWHA 1OIBA 5CRYA 2REJA 2UVHA 4N6PA 4U21A 2DE4A 1B2HA 1EZOA 2HAVA 3WAFA 3VVEA 1EZ9A 1Y20A 2Q2AA 2DWAA 4P0GA 3UGWA 3UK4A 4XIGQ 2HXWA 1NNTA 2O68A 3OMBA 4C0RA 1POY1 3O29A 1LGBC 1DPEA 3BBRA 1MH3A 2H5YA 4KYDA 4F3GA 3IB2A 3DELB 3C35A 3KFMA 1MQIA 3FJMA 4NF4B 3Q29A 1B3GA 1ATGA 3S4UA 4XKNA 2F7AA 1USYH 1M5DA 3RLFE 1BLFA 5HPQA 4HW8A 1IXIA 4LA9A 3PU5A 3VFJA 3FJGA 2F7BA 3UA8A 2ZYMA 1B58A 2HCAA 3KJ7A 1JEUA 5I57A 4QF9A 2H25A 5KZTA 1XOCA 3ZSFA 3PUZE 3LC8A 1L5TA 4LATA 4KR5A 1ZIUA 4JSOA 4JBZA 4QFLA 3CVGA 3MUQA 4C1TA 3JYRA 5EYFA 4RY1A 1II5A 3V5AA 4IO6A 4NTLA 3FXRA 2ZYKA 1B0LA 3ECRA 2I58A 1ZU0A 4DDDA 1UTHB 4PQJA 3T66A 3KOTA 1VSOA 4NF4A 2Y7IA 3O2AA 1M5CA 4F1UA 2GFEA 1UQWA 3TZAA 4MBPA 4O3BA 3PMWA 5AA2D 2DS9A 1Y9UA 3QUJA 5A5XB 2XXUA 2P2AA 4XKRA 4ELRA 4NF8B 5CMCA 3IOWA 4TOZA 5CMMA 1PB7A 1GV8A 3K1NA 1H44A 1TWYA 1XT8A 5JEIA 3H7MA 1EU8A 1US4A 2A5TB 3CG1A 2I3WA 4OFLA 4BDMA 3KGCA 4PFWA 2P0SA 2Q89A 3TTLA 3M8UA 4QFNA 4KCDA 3Q26A 2B3BA 4THIA 2P1SA 4EQ7A 3TTNA 5LOMA 1I6QA 2Y7KA 1DTZA 4F31B 3E4RA 4QRZA 1MY2A 1XC1A 1IQ7A 1US5A 2X26A 3VLWA 1UTHA 1QULA 1ZKBA 1TT1A 1SD3A 5L8DA 1B7UA 2UYFA 5ICQA 2G29A 4R6KA 3RUMA 4ESXA 4G8NA 1BP5A 2ZXTA 1A54A 5A5XA 1R9LA 2ABHA 1N76A 4LP2B 2O51A 2RF1A 4R6YA 4NF8A 4EQBA 4Q0CA 4OYVA 3TKDA 4KYEA 2F78A 3GBBA 2QS3A 1B05A 4H5FA 3LR1A 3EN3A 2Z8FA 4DE8A 1FQBA 2A5TA 3DP6A 2WKYA 5IAIA 3FV1A 1VR5A 4FAJA 1LAXA 2E0SA 1MXVA 3GBAA 1N3XA 3IOUA 3FVGA 4EXKA 4N13A 4ND9A 5BUUA 3UP9A 4G2ZA 4G77A 5KDTB 5AA2B 4YKKA 5TU0A 3R6UA 1FW0A 1QW0A 4IO2A 4WKMA 4F22A 3RTFB 2A5SA 5CMKA 3E3KA 3EHUA 2I3VA 2O6AA 3TPAA 3K1PA 1PB8A 3U94A 3GLBA 1SDXA 2DE2A 1XHYA 4X9TA 1MY4A 2KLFA 1WVJA 4G8HA 3PGFA 1A7LA 4IGTA 4OEUA 3HCQA 2IA4A 3O6IA 3CSGA 4U2RA 4R2BA 3G7WA 1YAEA 1VE4A 1B40A 1MQJA 3FVOA 1P1UA 4RYAA 2Q9TA 3D4GA 3KJTA 2Z8DA 4YB7A 4E0XA 2RC8A 3PPRA 3HN0A 1P1OA 4R6HA 1MM7A 3OXNA 4NWCA 1LAGE 1MRPA 4GLIA 4R73A 2B65A 3H6UA 4G8MA 5DYHA 3ODBA 5KDTA 5AA2A 3L6HA 1S9TA 1EH3A 1SQYA 1B5HA 2FA7A 1IXGA 3O66A 3K6UA 3C31A 4WEPA 3GXAA 1Z7ME 3TCFA 1M5EA 2YJPA 2DVZA 3MZ9A 4KYSA 1H76A 3MP1A 5H8SA 1FQFA 2FNCA 1ELJA 2VHAA 2PBWA 1UIVA 4YB6A 5AA3A 3FZVA 3SDFA 4GF8A 4BLAA 1JW1A 3G3JA 4XKPA 1YPNA 2D3IA 4KCCA 3V83A 2OCUA 3H6WA 3VV5A 3S2VA 3USDA 2O84X 2BJJX 4OWDA 5DVFA 1H45A 3U92A 4OEVA 4JDFA 4R2FA 2ESNA 3FIRA 4EUOA 1FQDA 4POWA 1FTKA 2Y7PA 2Y7WA 2NXOA 2QMWA 5CM6A 4RK9A 3LUYA 3VVFA 1B5IA 4C1UA 5FTIA 5CBRA 3KZGA 1ZTYA 2ZMBA 3OO7A 3N6UA 2DWHA 5KCJB 2NVUB 1SW4A 4DXUA 3FV2A 4JWYA 5B7DA 2YPNA 2DP8A 5M2VA 1FTLA 1B9JA 3G3KA 3C36A 4N07A 2V93A 4OENA 2OK2A 3V89B 4LQ2A 5FHNA 3K2DA 3SKPA 3ZKKA 2ZNSA 2DVCA 2G93A 4H8JA 5H8QB 4R72A 3BFTA 2XX8A 3MZBA 1LSTA 4H8IA 3PV0E 2W7YA 2HAUA 5H8HB 3H6TA 4LZ7A 1H3DA 3IORA 3R26A 2HEUA 3MZ1A 2UVGA 4MH5A 4JWXA 3PUXE 2ONKE 4Z0IA 1IZ1A 4F1YA 1GTKA 2O69A 1NH7A 2XXHA 3E13X 3ILUB 2DXRA 3K02A 4NEDA 1JVYA 4H67A 3MVYA 2VP1A 2OJTA 5KCJA 3K6XA 3D4CA 3B6TA 1HSEA 3ZS6A 2V3UA 2RC7A 5I59B 3MC2A 5ISUA 1Y1ZA 3MW0A 4F3SA 4KI0E 3QUFA 3EHSA 1AMFA 3S9LC 2RKMA 3AXFA 4LVQA 3TQLA 3FD3A 4ZZAA 2VD2A 2F6PA 4OETA 4X1BA 4MLQA 3U72A 3K0VA 5H8QA 1AL3A 1RKMA 3RT6B 1JW5A 3SETA 4FATA 5H8NB 3RPWA 5L9MA 4NMYA 3H03A 5CI5A 5H8HA 3K1MA 2QS2A 4ECFA 4U1ZA 3Q27A 1AOVA 3H6VA 5JTYB 3MVWA 2NOOA 1R6ZA 4P0IA 3U93A 3M3LA 1FQEA 1GR2A 3QAXA 1A55A 2QL3A 3VE1B 4OTEA 3IR1A 5AA4B 1SBPA 1MQHA 1QKAA 1GVCA 5DEXB 4YB5A 3OELA 1B6HA 3IJOB 5J1DA 1IXHA 4H65A 5I59A 3UIFA 1UTBB 4QSCA 4OHNA 4F3PA 4H0WA 1OVTA 3EQ1A 3RTWB 4OFJA 3Q28A 2VGQA 4R74A 4YAHX 4FORA 3T9XB 4ZEDA 1LBCA 2I0CA 4GXSB 1I69A 3T9VA 4XXUA 4I8CA 5H8NA 4H5GA 4IGRA 3ILTB 3I6VA 1B4ZA 1Y3PA 2H4IA 3QYTA 1Y4TA 4TLMB 2XHDA 3TMGA 2HQ0A 4PFYA 2RC9A 1HSLA 5JTYA 5I58B 4GQOA 1OLCA 3PPOA 2Q2CA 3THIA 4NWDA 4U4XA 5AA4A 2R6GE 4TQUQ 3GZGA 1MY1A 3PD9A 4R9FA 3MP8A 3LBSA 1M5FA 4GD5A 2HZKA 4GOTA 4EXLA 4XKQA 3TAJA 5DEXA 2QRYA 3SEXA 1MM6A 1Y3QA 3E9XA 2HZLA 5CC2A 2ANJA 1P1QA 1PB9A 1B3HA 1UTBA 4OFOA 4FJPA 2QMXA 1MPBA 3W9WA 1FQAA 2DSFA 3IOTA 2ONSA 3O9PA 1B51A 2GRVA 1B32A 1YCJA 1NNFA 4L17A 1URGA 5ICTA 2PMSA 4QSEA 1LFHA 1WDNA 4RPNA 2H99A 4YZZA 2XXIA 5F7VA 1IIWA 4PP0A 5I58A 3JZJA 3CFZA 1JQFA 1IEJA 3IB0A 5F1QA 5FHOA 4ZECA 4BDNA 3KOSA 1N84A 3T9UA 1BTJA 3PPQA 3N6TA 2R9JA 1SI1A 4M4GA 4F3BA 3B7DA 3CSBA 4JB7A 3C34A 3OSRA 4DZ1A 2V3TA 3C9HA 3A3UA 4QFKA 4BDOA 1A8EA 2D21A 4I1DA 4HCYA 4F19A 3MPKA 3RGYA 2QS1A 4ELQA 4MF3A 4PE5B 1SVXB 2I0BA 3OOAA 5TP9B 1AH5A 2IEEA 3RQTA 4ZEFA 4ONYA 2Y84A 3T22A 1UIUA 2I48A 3W15C 1D4NA 2I49A 1NNPA 3MWBA 2UYEA 2RINA 2GH9A 3MPLA 2PX1A 2XXVA 1B46A 1DOTA 2I4BA 3T9HB 4JXIA 1TFAA 1JEVA 1IITA 1P99A 2QSXA 3IO4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CG3A 4DXBA 1M5BA 3BKIB 1MDP1 4NQ8A 3TDJA 4ZS9A 3EPEA 5DVJA 5JK4A 1NV4A 5DTBA 4AQ4A 5CMBA 3S9MC 3H4ZA 2GHAA 2XXPA 3EHTA 2THIA 1O63A 1JVXA 2E1SA 4ZEBA 2PYYA 5ET6A 2GQ1A 1I6AA 2F7CA 4UA8A 4GXAA 4G68B 4XFEA 5AA1A 2O1MA 3LSFB 3DLNA 1LFGA 1LBYA 2Q8JA 3FVKA 3TEPA 2XD3A 4X1DA 5TP9A 3MAMA 2ONRA 1D9YA 2OWZA 1LFIA 3QXMA 2V25A 1RYOA 4H6DA 4LZ5A 4X48A 1EZPA 3SEWA 3UN6A 1LCTA 2RCBA 2CZLA 3ONMA 3DM0A 4DXCA 4BDRA 1QUIA 3P7IA 4HE1A 5LDZA 4O3AA 2HXRA 4WEDA 4KXPA 1MXZA 5BWJA 4I3EA 3BFUA 1ZBMA 5IZZA 4PFTA 2NWJA 4ELPA 1NV0A 5K2YA 3W9VA 4LZ8A 4YKPA 3K00A 2XA5A 4R75A 3KG2A 1N04A 3OO6A 1LCFA 3FATA 3KN8A 4N17A 2DWJA 1CB6A 1JETA 1NV3A 4IY6A 3OSQA 3V8XB 3A3CA 1DPPA 4G68A 1MS7A 2GHBA 3CI8A 4IY5A 2AIXA 3T93B 2ALUA 4QFOA 4Z7EA 5EHSA 1B4HA 3MSTA 4IO5A 4OMBA 4FECA 4DIGA 2PT2A 1XVXA 1ZLQA 4PETA 4FIMA 2VPOA 3MVXA 3U8QA 4PF6A 1LAHE 2ZYOA 2O1LA 5T3JA 3KN3A 2PT1A 5DT6A 3TODA 4QXDA 3C33A 1EYIA 4OVRA 5TPAB 5EQ8A 2CEYA 1CE2A 2B4MA 1POTA 4Q30B 2M8CA 1MXXA 3OEKA 4TLLB 1XVYA 1NV1A 1VFEA 5I84A 1OQGA 4EDPA 4BDLA 3I5OA 4F29A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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