1ZJLA

Crystal structure of zinc-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 129
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zjlA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zjlA01
4LZ7A 3U94A 1PB8A 3FJGA 2CZLA 1LFIA 4AB5A 5CI5A 2DWJA 5DVIA 1N76A 3G3IA 1B6HA 1JW5A 2XXPA 4H67A 1B3FA 4AB6A 4N07A 3T66A 4NWDA 1AIVA 2VP1A 1N3XA 1O7TA 2V3TA 1LFGA 1JEUA 4XKQA 2ONSA 1J1NA 1MY1A 1B7UA 1XC1A 3MQ9A 1POY1 2YLNA 1LGBC 3LR1A 3TTKA 1LBCA 2DVCA 4NF6B 4G8HA 1D9VA 1PBQA 3KSXA 3B6TA 5FHMA 5H8HA 2YJPA 4O3CA 2GHAA 4ECFA 1Y4TA 1NL5A 3B6WA 3N5LA 3MP6A 2F6PA 3MBPA 2FYIA 2Q2CA 3S2VA 3FXUA 2UYFA 3VVDA 3TQWA 3PPRA 5KDTA 4OFJA 1MY0A 4QFKA 2OCUA 1GV8A 1LCFA 1LAFE 3QYTA 1S50A 1NFTA 3LSFB 5IAIA 1US4A 4G8MA 1JW4A 5I58B 5I56A 3QUJA 3PUVE 3BFTA 1FQAA 3M3FA 2ZMBA 1N04A 3FVNA 4OTEA 5I84A 4F31B 4R6YA 3GLBA 1QVSA 4BDNA 4BLAA 3V8XB 2XD3A 3SEVA 1Y1ZA 3QIMA 2VD2A 1SI1A 3VE1B 3ILUB 1UTHB 2XXHA 5JTYB 1URGA 5AA2A 1EU8A 3SESA 3Q27A 4DCYA 1ZLQA 2R9JA 3ZS6A 2RKMA 2DSFA 3VDFA 1B1XA 3S9EA 4WEPA 3MZ9A 1H76A 3LUYA 2UVHA 2H99A 1MPBA 3K00A 3MP1A 4MBPA 4GLIA 1S9TA 3UORA 2DWAA 1TFDA 3DP6A 4NWCA 4F3PA 4POWA 1A8FA 3H6VA 1OVTA 1OLCA 5L9MA 2WKYA 3UP9A 5EHSA 4BDQA 4F39A 1A54A 1JVXA 2XXTA 4XTCQ 2AL5A 1MS7A 5K2YA 3TEPA 3FGSA 4F2OA 1WODA 4FAJA 1QULA 3A3CA 3OOAA 2OJTA 4F3BA 3FATA 4EXKA 2O1LA 3MP8A 2F7AA 2D5WA 1JNFA 3IX1A 1TXFA 1PB7A 4DE8A 2NXOA 1O63A 2H9BA 2Z8DA 3UIFA 2REJA 4XXUA 1M5CA 1MM7A 1EH3A 5I59A 1ZKBA 5ITPA 3BBRA 3DP4A 1FTMA 3TMGA 3VFJA 5ISUA 4U1OA 5I58A 2H25A 2HAVA 2VGQA 2VHAA 4RXLA 3O29A 4HCWA 3SEXA 4Z7EA 4Q5TA 3K1NA 2FNCA 4NF8B 4OEUA 1LAHE 3T9UA 2QMWA 1US5A 4EF1A 4DZ1A 5BUUA 1IZ1A 3IO4A 1TFAA 2RC8A 4FORA 1Y3NA 3TUSA 3ILTB 4IO7A 1USYE 2I4CA 3DM0A 3C34A 5JTYA 1AOVA 4QFPA 4N6PA 5DEXA 1P99A 3H6WA 3R7XA 1SD3A 3R26A 2A5SA 2ZXTA 3MW0A 2Z8FA 5LOMA 3PMWA 3VXCA 2PVUA 3IORA 3TQLA 2XXXA 4ZECA 1FTKA 1N84A 4MFIA 1MXVA 3W15C 1IQ7A 3HO7A 1WDNA 4NF4A 3H6TA 1B7HA 2D3IA 3VLWA 1LCTA 3MUQA 3PD9A 2DWHA 1RYOA 5DTBA 4G68A 2XX9A 4OQOA 5DVJA 3K1PA 1POTA 2X26A 3M8UA 1N0TA 2PX1A 2V93A 3OD7A 2F35A 4R6HA 1UTBA 4F3SA 3C9HA 3OO7A 1LB9A 3KJ7A 1QKAA 5I2KA 1BTJA 1Y20A 4LUBA 5K2XA 3RY3A 3T9HB 2DE2A 1Y3PA 3MZBA 3FVKA 4YB5A 2ALUA 2H5YA 2Y7WA 4Q30B 2XHDA 2UVIA 4KCDA 3OMBA 2O1MA 1P1UA 5A5XB 3OSRA 2UXAA 2YPNA 3KBRA 3CG3A 3MPLA 1QW0A 4JXIA 3IR1A 4GIZA 2XXVA 3GZGA 4FIMA 5AA3A 1B3LA 2I58A 4EQ7A 4EQ9A 5L8DA 1FTOA 3B7DA 2X7QA 1SYIA 4H5GA 2ZNTA 4NF5B 4ELPA 3RNNA 1ZIUA 5AA4B 5AA1A 4X1DA 5ELVA 4POXA 4OFOA 4IY6A 4BDOA 5TPAB 4DXCA 2QS3A 3D4GA 4AQ4A 4XKPA 3G7WA 4ZEKA 4OENA 4YZZA 2NWJA 1B51A 4QRZA 2HAUA 4E0XA 2HXWA 3K1MA 4P0GA 4ZEIA 1FQBA 2UYEA 5CBRA 1GVCA 3DELB 3P7IA 1YPNA 1ZJLA 3H03A 3IJOB 1SDXA 3CFLA 5CMBA 3O6IA 3CR9A 3PMXA 2I3WA 3V5AA 4RPNA 3FIRA 1BP5A 4RK2A 2XXQA 4U4SA 1YTVA 4JWOA 5L9OA 4GWOA 1HSLA 4XKRA 2A5TA 4U21A 3TZAA 4ESXA 3PD8A 3C31A 3RUMA 4FE8A 4HCYA 4ELQA 2QJEA 5H8NA 3O97A 2Z8EA 3UA8A 2Z22A 1MH3A 4ZEFA 2RCBA 1MQIA 1XOCA 4ISUA 3I3VA 2HCAA 1QUJA 3E13X 2NVUB 3SKPA 2O51A 4DXBA 2GHBA 2R6GE 4ZDMA 3MPKA 3S9LC 1MXWA 1QUIA 4YMBA 1ZU0A 4ZE9A 3EHUA 3U8QA 2PYYA 3Q28A 3KJTA 3T96B 2HEUA 4U22A 3D4CA 3FASA 4EF2A 5HBCA 4YKIA 4LQ2A 4P0IA 3TYHA 5H8QA 1A55A 5A5XA 1B4HA 3VLVA 4PFUA 1FCKA 3MC2A 3PU5A 5HPQA 2G93A 2F36A 1LB8A 4MH5A 3JYRA 4IB2A 3FV2A 4U2RA 3PPPA 3QXMA 3IOTA 4WKMA 3M3KA 5L9SA 3E9XA 4KHZE 4R9GA 4OZ9A 3RLFE 1P1QA 1ZBMA 4R2BA 4G8NA 4YU0A 1B5HA 1H45A 2H98A 4KCCA 1LLSA 3K01A 3TCHA 3U72A 2OWTA 3G3FA 2O7UA 2HQ0A 5KCJA 1MG1A 1SQYA 4NTLA 1QKBA 4PFTA 3K6WA 4IO3A 1UQWA 3T9VA 3EQ1A 3MWBA 1SI0A 4JDFA 1MDQA 3LC8A 3K02A 4UA8A 4EQBA 3FZVA 5TP9B 4QSEA 4H8JA 1MY2A 4LZ5A 4R6KA 1B3GA 4LP2B 3KFMA 5ITOA 3PV0E 1MPDA 3MVXA 4ZEDA 3PPQA 1NH7A 3USDA 1DPPA 1I6BA 3KN3A 3GBAA 4U1ZA 3ONMA 2ZNUA 3KOSA 2RC9A 4UACA 4KFQA 4ZZEA 3BKIB 1OVBA 2I0BA 2F6GA 5I2NB 3HHFA 1MH4A 4I62A 1XVYA 3O2AA 5FHNA 3CRBA 2V3UA 2B3FA 3O28A 3G3GA 2QS4A 1TT1A 2F97A 3K6VA 2RC7A 4JB7A 1SYHA 4RK9A 2ZNSA 4DCXA 3QUFA 4JWYA 1A8EA 1CE2A 1URSA 1MM6A 3U92A 3KGCA 3OENA 3TCFA 4KI0E 3OXNA 4NF6A 5JK4A 1XT8A 1Z7NE 4C1TA 1FTLA 4JSDA 1B32A 4FJPA 4GFRA 3FJMA 4C0RA 1L5TA 3JV9A 3KSJA 2QMXA 1KWHA 2DE4A 2ABHA 4R74A 1OLAA 4GL0A 4YKJA 4GF8A 3LSLA 3MJNA 2V84A 1ATGA 2OLBA 3IOUA 3MAMA 3VV5A 2AL4A 4O3BA 3GBBA 2THIA 3SEWA 3EF7A 1MXZA 3O66A 5H8FB 3O9PA 3UGWA 4R9FA 1AH5A 4PETA 4F29A 2DP8A 1JQFA 3H3GA 4IO4A 4KPTA 1Y1MA 3HCQA 4ZZAA 4U23A 4O3AA 3IOVA 3BFUA 2V25A 3TELA 3CFXA 4FATA 3LSWA 3HN0A 4WXJA 3N6UA 4F3GA 1UTHA 5CMKA 2ZYOA 4EUOA 2QSXA 4RY1A 2PMSA 3CG1A 1N7WA 4YKKA 3G3KA 5BWJA 2F7BA 3UK4A 2RF1A 5AA2D 3HHGA 2E0SA 4PP0A 2KLFA 2O68A 2XXYA 2W7YA 3FVOA 3IL1B 4X48A 3VLUA 4OFLA 2BJJX 2ZYMA 4F22A 3RQTA 5I57B 4OETA 3CFZA 4G2ZA 3PUXE 3PMVA 2REGA 2QL3A 1D4NA 2PT2A 4H6DA 4QFLA 2I48A 3IB1A 1MXYA 3W9WA 3OO6A 1O64A 2OBGA 2DXYA 4I1DA 4MLVA 4IO2A 4YAHX 1QJMA 3MZ1A 5DVFA 5CM6A 2XX7A 4YB7A 3AXFA 4H1XA 2OZZA 2XXRA 4ESWA 3RTFB 4OEVA 1M5EA 4QHQA 1Q35A 3ODBA 2F7CA 4KYSA 4GD5A 1FQCA 3E4RA 2F34A 1YAEA 3C36A 3KN7A 3TTRA 4I8CA 4HW8A 1URDA 3M3LA 2DQVA 3KZGA 2QRYA 3SETA 1OIBA 2ONRA 1IEJA 3Q25A 2Q89A 2CMOA 1SBPA 5H8HB 3N26A 2GRVA 4LATA 1YCJA 2M8CA 3RT6B 3QAXA 1QUKA 5FTHA 4F1VA 3T93B 3N94A 1AMFA 2V3QA 1B3HA 2DS9A 1Y9UA 2QPQA 3CIJA 2P0SA 4IO6A 4RJZA 1XHYA 5KDTB 4LONB 1P1WA 4LQ5A 3THIA 1B40A 1PBPA 4NF8A 1JETA 4GQOA 4BDLA 4ND9A 5I56B 4PFYA 4G77A 1ELJA 3OEKA 2AIXA 1A7LA 2H4IA 3SEYA 3OO8A 4P11A 1P1OA 4RA1A 1R9QA 1M5DA 3CSBA 1FQFA 2B65A 1MDP1 3FUZA 2XX8A 3ZKKA 1M5FA 2DYXA 3W9VA 1B4ZA 2XXWA 4H0WA 1B46A 3O6GA 2Z23A 1MPCA 3K6UA 1IIWA 5AA2B 1II5A 4F1YA 2I3VA 3S4UA 3IAZA 3SDFA 2FA7A 1IXCA 1IITA 4M4GA 4F1UA 4R72A 3TTNA 3K4UA 2UVGA 1A99A 3IOWA 2IEEA 2OK2A 2GH9A 2Q9TA 1ZTYA 1D9YA 4NEDA 2HFBA 5CBSA 3HSTA 4Q0CA 2I49A 1JEVA 1BLFA 4OERA 1HSEA 1GTKA 4GVOA 1WVJA 4KD5A 3SEUA 3VVEA 3TDJA 3PUZE 2ONKE 3TTLA 3FXQA 4E0WA 5CC2A 3S9MC 1VSOA 2XXUA 1SW4A 3H7MA 4JBZA 1MRPA 2VD3A 2PBWA 3UN6A 3Q29A 3IJXB 3F11A 3FV1A 1D3KA 3N6TA 3TODA 1EZOA 3E3KA 1BKAA 3PUYE 1Y3QA 3RN8A 1T0KA 4IY5A 1I6AA 3OSQA 3FJ7A 1FQDA 2E1SA 2RCAA 3WAFA 2VOZA 3CVGA 4ELRA 1MQDA 3WAEA 2P1SA 5JEIA 2D21A 4RNSA 3O6HA 4HS7A 2IA4A 2F8DA 5EYFA 5ICTA 3V83A 3JZJA 4OHNA 4FEDA 1UIVA 3LSXA 4NF5A 1MXUA 5I59B 5AA4A 2PT1A 2G29A 3V89B 2Y7PA 3ECRA 4C1UA 1LFHA 4L17A 3OO9A 5H8SA 2O69A 5TPAA 2GFEA 2F78A 1DOTA 1DTZA 2HZKA 3A09A 5M2VA 1SW5A 3IO6A 2ZYNA 3S9NC 2O7IA 3PUWE 4R73A 1SVXB 3IB2A 2NOOA 4G68C 3C32A 1IXIA 4OVJA 1IXGA 4NE4A 1USYH 4TLMB 1B2HA 3H6UA 4TOZA 1H3DA 1FTJA 1OQHA 1SW1A 3R6UA 3SERA 4OXVA 4PE5B 1B0LA 3MVWA 4FECA 1ANFA 4DIGA 3MVZA 2XD2A 3RPWA 2DOJA 4QFNA 1TWYA 1MY4A 1IUDA 3A3UA 4QSDA 4QFOA 4GOTA 5DEXB 4F18A 5DYHA 5HM4B 1LAGE 1B52A 4EXLA 1M5BA 3IK6B 3IB0A 5CMMA 3HPIA 1RYXA 3L6HA 2XXIA 1S7YA 1NH8A 4F19A 2LAOA 1Y4CA 3TAJA 1MQHA 3C4MA 4NF4B 3KN8A 4X1BA 5CRYA 2Q8JA 3H06B 1XS5A 1MXXA 5KZTA 5DT6A 5FHOA 3PPOA 4RYAA 4JSOA 3QK6A 4G68B 1FW0A 4H65A 1NNKA 3FD3A 1B3EA 2DE3A 3G3JA 2QS2A 1OQGA 2ANJA 5F7VA 3VVFA 1R1NA 1NNTA 1UTBB 4N13A 5I2KB 3DLNA 1UIUA 1R9LA 4TQUQ 4THIA 3T9XB 1BIYA 1PC3A 3CI8A 1IXHA 2P2AA 3L6GA 3TTMA 1PEBA 1B05A 2DVZA 1P1NA 2DWIA 4JWXA 3KEIA 2I4BA 2Y84A 5AE4A 3TFLA 4MF3A 4Z0IA 5ICQA 1LAXA 4LVQA 4IGRA 3OELA 2Q2AA 4ELOA 4EDPA 4U4XA 2O6AA 3KG2A 4H5FA 1EZPA 3TKDA 4ZEBA 3U93A 4WEDA 1VFEA 3ZKLA 3G3HA 3RTWB 1N7XA 3K2DA 5TP9A 1B5IA 3C35A 4QF9A 3K6XA 2ESNA 1OMPA 1LBBA 1B5JA 4XIGQ 3FVGA 3EHSA 1JW1A 5IKBA 2Y7IA 1R6ZA 1B0HA 1ZMGA 3C33A 5B70A 4FEBA 2RINA 5F1QA 4TLLB 3TPAA 2R71A 1HSJA 1N3WA 3PPNA 2Y7RA 1EZ9A 4MLQA 4KYDA 3I5OA 1I6QA 1JVYA 5I2NA 3QSLA 2HZLA 2QS1A 1LSTA 1Z7ME 1CB6A 2A5TB 4RPOA 3H4ZA 1RKMA 1F9BA 4YB6A 1VE4A 2I0CA 1B7ZA 2OWSA 4X9TA 5H8NB 4XKNA 2I6EA 3DP8A 3RGYA 3PGFA 2B3BA 5FTIA 4KQPA 2O84X 1Q1KA 1NKXA 4GRKA 1B58A 2ZYKA 3EPEA 3VXBA 4YKPA 3ZSFA 2X7PA 1H43A 4DXUA 1DPEA 2Y7KA 4YICA 1NNFA 2DXRA 1NMUA 5EHMA 3B6QA 1H44A 3LBSA 4NMYA 1MQJA 4YMAA 1GGGA 5H8QB 1FQEA 4BDMA 5CMCA 4OWDA 4IGTA 4KR5A 3FXRA 3Q26A 4G4PA 4ZS9A 3EN3A 1B1HA 1MY3A 5H8FA 4I9DA 4QSCA 3MVYA 1DSNA 4K3FA 3KOTA 1VFDA 3OEMA 4F2QA 3TCGA 3GXAA 1AL3A 4DDDA 4R2FA 2UVJA 1B9JA 1DMBA 5J1DA 3HV1A 4LA9A 5KCJB 3EHTA 4KYEA 5TU0A 3U1OA 1VR5A 1DTGA 4M1VA 4ONYA 1PB9A 3K0VA 1GR2A 1PDAA 2Q88A 3CSGA 4ZE8A 4Q8RA 4GL8A 4OYVA 4IO5A 3I6VA 1NNPA 1A40A 4H8IA 3T22A 4HTGA 1MQGA 3RT8A 2NUVA 1I69A 4R75A 5I57A 4OMBA 4OESA 2AYSA 4PQJA 1SW2A 1XVXA 4GXSB 4LZ8A 5B7DA 4DLDA 2F5XA 4BDRA 4GXAA 4PFWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LZ7A 3U94A 1PB8A 5IZ3A 2PFZA 2FHYA 3FJGA 2CZLA 1LFIA 4AB5A 5CI5A 1IMCA 2DWJA 5DVIA 1N76A 1FJ6A 3G3IA 1B6HA 1JW5A 2XXPA 4H67A 1B3FA 1D9QA 4AB6A 4N07A 3T66A 4NWDA 1AIVA 2VP1A 1N3XA 1O7TA 4GX3A 2V3TA 4NN3A 1LFGA 1JEUA 4XKQA 2ONSA 1J1NA 1MY1A 1B7UA 1XC1A 3MQ9A 1NUWA 1POY1 2YLNA 1LGBC 3LR1A 3TTKA 1LBCA 2DVCA 1YZ0A 4NF6B 4G8HA 2QVVA 1D9VA 1PBQA 3KSXA 3B6TA 5FHMA 5H8HA 2YJPA 5IZZA 4O3CA 2GHAA 4ECFA 4OVQA 1Y4TA 1DCUA 1NL5A 3B6WA 3N5LA 3MP6A 2F6PA 3MBPA 1FPEA 2FYIA 2Q2CA 3S2VA 3FXUA 2UYFA 5ET5A 3VVDA 1FPLA 4LN5A 3TQWA 3PPRA 2PFYA 2FIXA 5KDTA 4OFJA 1MY0A 4QFKA 2OCUA 1GV8A 1LCFA 1LAFE 3QYTA 1S50A 1NFTA 3LSFB 1RDXA 5IAIA 1US4A 4G8MA 1JW4A 5I58B 5I56A 3QUJA 3PUVE 3BFTA 4UABA 1FQAA 4OVRA 3M3FA 1FPKA 2ZMBA 3MSTA 4PAKA 1N04A 4MX6A 3FVNA 4OTEA 5I84A 4F31B 3T0JA 4R6YA 3GLBA 1QVSA 4BDNA 4BLAA 2OX3A 3V8XB 2XD3A 3SEVA 1Y1ZA 3QIMA 2VD2A 1SI1A 3VE1B 3ILUB 1UTHB 2XXHA 5JTYB 1URGA 5AA2A 1EU8A 3SESA 3Q27A 4DCYA 1ZLQA 2R9JA 3ZS6A 2RKMA 2DSFA 3VDFA 4PBQA 4AS4A 1B1XA 3S9EA 4WEPA 3MZ9A 1H76A 3LUYA 2UVHA 2H99A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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