1ZJLA

Crystal structure of zinc-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
total genus 129
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zjlA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zjlA01
3QSLA 4F22A 3VV5A 3Q27A 4MFIA 5I2KA 1SW5A 3CSGA 2ZNTA 1O7TA 1US4A 3MZ9A 1B40A 1IITA 3MQ9A 2DE3A 4YKKA 3KEIA 4OVJA 1BTJA 5CBRA 1MQHA 1FQDA 5FHNA 2GHAA 1AIVA 1FTKA 4C0RA 4ZEFA 5KCJA 5TPAA 2ZNSA 4H65A 1UQWA 2YPNA 3LSXA 3T9UA 5I2NB 2PVUA 2FNCA 3KOTA 1Y1MA 5AA2B 1FTJA 2OCUA 1JEUA 4YU0A 1H76A 2UXAA 3O6HA 5L9SA 3C35A 2DYXA 1I6BA 2I58A 1SYHA 4OENA 4ISUA 3MVXA 4IO7A 3E9XA 4FIMA 4QFPA 1M5CA 1VE4A 2I3VA 4R9GA 3JV9A 3IR1A 4QHQA 1OIBA 2Q2AA 3KJTA 2XXYA 3B6TA 3PPPA 2CZLA 1QUIA 5A5XB 4F18A 1MH4A 2XD3A 1VFEA 3QK6A 3ODBA 3L6HA 4LZ7A 3W9WA 1LFHA 2F7AA 1JW4A 4F1YA 2I4BA 2O1LA 3HCQA 3VVDA 4YZZA 2V93A 3RNNA 5AA2A 4R73A 4RNSA 2QL3A 1P99A 1NNTA 4NF5B 5ICQA 1IQ7A 1DPEA 2XXUA 2O1MA 4ONYA 1P1WA 1MXXA 3ZS6A 3TAJA 1FW0A 5I59B 3TEPA 5J1DA 2ZYOA 2QSXA 5FTHA 4X1DA 2QJEA 4R6KA 1JVXA 1BIYA 3SEUA 3MVZA 1XHYA 4QSCA 1O63A 1LFGA 5JTYB 3F11A 4YKIA 4LVQA 2R6GE 1M5DA 3O6GA 4PFTA 2DWIA 2ABHA 3ILTB 3O66A 3EF7A 4HW8A 2OJTA 1SYIA 3DLNA 3K1MA 4KCDA 1R9QA 1TFAA 4NF5A 3TCFA 1DSNA 4FE8A 3ECRA 5DVJA 1IXCA 3QUJA 4KPTA 3KSJA 5I59A 2UVJA 1N3WA 5TP9A 2QMXA 2DVCA 2XXTA 4X1BA 4OEUA 1B6HA 1CE2A 4G4PA 3EPEA 4E0WA 4G8NA 4PE5B 1Z7ME 4KQPA 4F39A 3CG3A 2F6PA 3FJGA 3GXAA 4G68C 5FTIA 5I57B 3GLBA 1I69A 4C1UA 1AOVA 3TTNA 4RK2A 3CVGA 1YTVA 5DEXB 3K6UA 2VHAA 1LBCA 3OOAA 1B05A 3H4ZA 1EZPA 4M1VA 2F5XA 5AA3A 3DP6A 1B7HA 2XXXA 4OQOA 3U93A 3ONMA 3Q26A 1ZTYA 5KDTA 3V89B 4WEPA 3QUFA 4ELRA 5H8QA 3IB2A 5HBCA 4YB6A 3FUZA 5FHOA 5AA1A 4MLVA 3VLUA 2F6GA 4R9FA 2HZLA 3OELA 2RCAA 2RKMA 3S2VA 2NOOA 3K02A 2HAVA 1YPNA 5AA4A 3QAXA 2HXWA 2QPQA 3CFXA 5I57A 5H8SA 3LSWA 2Y7IA 2DQVA 2D3IA 1MXVA 4LZ5A 4JXIA 3GBAA 1J1NA 1XVYA 4P0IA 3M3KA 3K2DA 1A40A 2FYIA 4H0WA 4MF3A 1FTLA 4GXSB 1DPPA 1S50A 2OZZA 4GD5A 1O64A 2NUVA 4KHZE 4QSDA 4ZDMA 2LAOA 2PX1A 2O6AA 3CSBA 2I0CA 3MP8A 1NNKA 2V3QA 4DCXA 4N13A 1MS7A 3FVGA 4F1UA 3VLVA 1IIWA 3E4RA 2O7UA 3PPOA 1ANFA 3SEWA 4ZE8A 4QFKA 3PPNA 1JVYA 3C31A 3B7DA 1IEJA 3N6UA 4ND9A 1D9YA 4IGRA 1Z7NE 1JNFA 3O28A 3OSQA 3I3VA 4PFYA 1LAFE 1B0LA 3M3LA 2BJJX 3H6TA 4YB5A 5CM6A 1BKAA 1MY2A 4G77A 3TUSA 3WAEA 4GLIA 4EF1A 1PB8A 3UIFA 3TCGA 3TKDA 2O68A 3TFLA 4IGTA 3TZAA 4LQ2A 3FVOA 2A5TB 1OMPA 2ALUA 3B6WA 1WVJA 3O6IA 4NWDA 2Z22A 3G3IA 3PPRA 2E1SA 4NMYA 3GZGA 3KSXA 4H6DA 1N76A 5I56B 4F1VA 3O29A 4FAJA 2XXVA 4BDMA 4DDDA 4DXUA 3U72A 4GWOA 4I9DA 2VD2A 1M5BA 2XXWA 4Q5TA 1LBBA 5BUUA 5I2KB 3PV0E 1R9LA 4JWXA 2ZNUA 2VOZA 3VXBA 1MDQA 1DMBA 5CMBA 3IOVA 1POY1 4E0XA 2O51A 1MQDA 3TELA 2XD2A 1GV8A 2VP1A 1URSA 5B7DA 2B65A 3TTKA 4ESWA 5KCJB 5TPAB 5M2VA 1MM7A 1LCTA 1LGBC 3FATA 1MPBA 3S9LC 1MXZA 5CMMA 3RGYA 1JW1A 2H4IA 3OXNA 4O3CA 4BLAA 1PB9A 4EQ9A 3BFUA 3N5LA 4NEDA 4OHNA 1FTOA 3FV2A 4YKPA 5H8FA 3C32A 3MVYA 4F3SA 5CBSA 1B3HA 3I5OA 2O7IA 1ZLQA 4OXVA 4KFQA 1B3EA 3OO9A 4LQ5A 4WEDA 1SVXB 3MWBA 4PFUA 1URGA 1MY3A 1EU8A 4G68A 4R75A 4BDQA 3DP4A 3E13X 3OMBA 3G3JA 1USYE 3UA8A 2HCAA 5DTBA 3TDJA 1MXYA 4ZZAA 1JW5A 3HHFA 3IB1A 5H8NA 3H6WA 4IY5A 3K6VA 4UA8A 5IKBA 1FCKA 2DXRA 1RYXA 5IAIA 3I6VA 1SDXA 1WDNA 3CG1A 1B51A 1OVBA 3TQWA 2P0SA 3IAZA 3T93B 3MVWA 2Z8FA 4OESA 3HHGA 3FZVA 4BDNA 2O69A 4F2OA 3E3KA 1UTBA 1QULA 1KWHA 4NF4A 2HAUA 3S9MC 2NWJA 1ZIUA 4K3FA 5ITOA 1MG1A 2F97A 3DM0A 4DCYA 3OO8A 3FIRA 3TTLA 4H67A 4WKMA 1SW1A 2F34A 2ZXTA 1SBPA 3A3CA 3RT8A 2Z8EA 4FEBA 3EHSA 4MLQA 3D4CA 3FGSA 3SDFA 3RPWA 4MH5A 2QS2A 1DTGA 1A55A 5EYFA 3MPKA 1YAEA 2QS1A 3RTWB 3IO6A 4QRZA 3ZKKA 1LSTA 2UYEA 5CRYA 4DZ1A 4N6PA 4YB7A 4QSEA 4Q30B 4C1TA 4GQOA 4Q8RA 2P2AA 4XIGQ 3RTFB 5TP9B 3HN0A 2OK2A 4RK9A 4F3BA 2DS9A 2XXHA 4X9TA 4DLDA 1P1OA 3TTRA 1JQFA 5ISUA 4YICA 2RF1A 3T9HB 1B7UA 4NF6A 3RLFE 3IORA 1MPDA 1ZMGA 2F8DA 2Q8JA 2XXIA 2AIXA 3WAFA 5KZTA 3C36A 3THIA 4O3AA 4DXCA 2HZKA 4BDRA 3AXFA 1HSEA 1MDP1 4I8CA 4HCWA 1B1XA 2F7CA 1TT1A 4EQBA 3KN7A 1N84A 2WKYA 2UYFA 2QS3A 1NMUA 1NKXA 3G3KA 2QS4A 4R6HA 5KDTB 4LUBA 3N94A 2Q88A 3VDFA 2V3UA 5H8QB 4OETA 2O84X 3CIJA 2Z23A 4JWYA 2DOJA 3N26A 1RYOA 1I6QA 2IA4A 3CR9A 3R7XA 4KR5A 5AA4B 1SW2A 2ZMBA 3TQLA 1DTZA 3B6QA 1A7LA 1D3KA 4JSDA 3SEYA 3QIMA 3MP1A 3R6UA 4ECFA 4EQ7A 1SQYA 4U2RA 1B5HA 2H9BA 5ITPA 2DE2A 1PBQA 5H8HB 1WODA 1B5JA 1MY4A 1PBPA 5DYHA 4U21A 3TPAA 2IEEA 3EQ1A 4XKNA 5EHSA 3FXQA 3H3GA 5HM4B 1Y1ZA 2A5SA 4OZ9A 1FQCA 3C34A 3VVEA 3C33A 4F19A 1B0HA 3C9HA 2UVHA 3CI8A 3FXRA 3IB0A 3UK4A 1QW0A 2H25A 1QVSA 4I62A 3K6WA 1CB6A 2XXPA 1IXGA 3P7IA 3HO7A 1SI0A 1MXUA 4JB7A 3DELB 1I6AA 1N3XA 3LSLA 3TMGA 5H8HA 4EDPA 3H06B 3SEXA 1B3LA 4QFNA 4GL8A 4P0GA 1LAXA 1Y3NA 2RINA 2ONSA 3PMXA 4IO3A 1PDAA 1MH3A 3PUXE 3TCHA 4NF8A 4HS7A 3G7WA 2HQ0A 1OLCA 3RQTA 2V84A 2VD3A 4QF9A 5ELVA 3MJNA 4RPNA 3KJ7A 3UN6A 1OLAA 3K1NA 3TYHA 5DVIA 3CFLA 2UVIA 4IO5A 3RT6B 1AMFA 4GRKA 2OBGA 3KBRA 4EXKA 2XHDA 2UVGA 2PYYA 3O97A 5K2YA 4R6YA 2B3FA 3VLWA 5AA2D 4X48A 3SEVA 3PUVE 3PGFA 3IO4A 4GF8A 1A8EA 3QXMA 1N7WA 5CC2A 4R72A 5CMCA 4JSOA 5FHMA 2I49A 2I48A 4TOZA 1H43A 1ATGA 3FJ7A 3T96B 4RA1A 3H7MA 1B46A 4XKQA 2Y84A 3MBPA 3PUZE 3KZGA 2XXQA 2V25A 3LBSA 2GRVA 4TQUQ 1S9TA 2F36A 3TTMA 1MQJA 4HCYA 3PPQA 5H8FB 1GR2A 1RKMA 1H45A 1JEVA 3MC2A 4FECA 1QUKA 5JEIA 2Z8DA 4ZEIA 4OFJA 3PMVA 3V83A 1OQGA 3A09A 2G93A 1B52A 1S7YA 3BBRA 1Y4TA 1SI1A 3S9EA 4U1ZA 1NFTA 1T0KA 4G68B 3OO6A 4OYVA 4ESXA 4U22A 1HSJA 3A3UA 1MXWA 4JWOA 5TU0A 5K2XA 5I58A 5H8NB 1PC3A 2B3BA 4P11A 3V5AA 4Q0CA 1OVTA 4LP2B 2REJA 4ZZEA 1P1NA 3VXCA 3T9XB 4ELQA 4U23A 3G3FA 4IB2A 2D5WA 2QRYA 3FXUA 4RYAA 1B1HA 4EUOA 2X26A 2DSFA 3MZBA 4GL0A 3OSRA 1IZ1A 4KD5A 5L9MA 3MZ1A 3PUYE 3U92A 1XS5A 3Q28A 3R26A 1XC1A 4DE8A 1UTBB 3RUMA 4NE4A 4NF4B 3T9VA 2DP8A 2I4CA 1AH5A 4DIGA 3FASA 1II5A 2DXYA 1F9BA 1FQBA 3FVNA 4R74A 1DOTA 3U8QA 3KG2A 4ZEBA 1FQAA 4R2FA 4PP0A 3FD3A 2HFBA 1XT8A 2DWHA 2RC9A 4U4SA 5L9OA 2I0BA 3W15C 1XVXA 3OENA 2ANJA 4OWDA 3USDA 4OFLA 3FJMA 3KGCA 1ZU0A 4G8MA 1UTHA 2RC8A 1H44A 1JETA 4F3PA 1SW4A 4L17A 3IJXB 1ELJA 3OEKA 4THIA 1ZBMA 1VSOA 4FJPA 2H98A 1EZOA 3UORA 1Y4CA 4H5FA 4IO2A 4NF6B 3IL1B 3PD9A 1XOCA 3ZKLA 2VGQA 2Y7RA 1N04A 1N7XA 1M5FA 3FV1A 1B7ZA 1VFDA 2ZYKA 2DWJA 4OERA 3U1OA 3EHUA 3LUYA 2NVUB 3EHTA 2I3WA 3O2AA 1NL5A 2YJPA 3T22A 2XXRA 5I2NA 3PU5A 2THIA 4LONB 3SESA 2ZYMA 3N6TA 3LC8A 1B4ZA 3K4UA 1YCJA 3SKPA 4XKRA 3H03A 3TODA 1IXIA 4U4XA 4M4GA 5ICTA 3SETA 4XTCQ 2PT2A 1FTMA 4PQJA 4QFOA 3W9VA 1PB7A 1Y3QA 1B32A 2Y7KA 4ELPA 1GVCA 2D21A 1QUJA 1H3DA 1TXFA 4GVOA 4H8IA 3PMWA 1A54A 4YMAA 1NH8A 1OQHA 5L8DA 3L6GA 1B5IA 4N07A 2XX8A 4UACA 3SERA 2ZYNA 3K6XA 4R2BA 4PETA 5A5XA 3LSFB 3VFJA 5LOMA 3QYTA 5CMKA 2RC7A 3IOWA 5BWJA 2PMSA 2YLNA 2PT1A 2OLBA 4OMBA 4ZEKA 1LCFA 4OEVA 2KLFA 3IX1A 4XXUA 2R71A 4F29A 3G3GA 4ZS9A 4F2QA 3DP8A 3KFMA 2CMOA 1N0TA 2Y7WA 2RCBA 4DXBA 4F3GA 1LAGE 3ILUB 4AQ4A 4YMBA 4MBPA 1LFIA 5DT6A 3EN3A 2ONKE 3ZSFA 2OWSA 1B4HA 2Q89A 5F1QA 1P1QA 3CFZA 5EHMA 1GTKA 1US5A 4BDLA 2H5YA 2XX7A 4TLMB 3D4GA 3C4MA 4KI0E 1MY0A 5JTYA 4AB6A 2REGA 1SD3A 3IJOB 1LAHE 4H1XA 3IK6B 4EF2A 4POXA 2P1SA 1TFDA 3Q29A 3H6VA 1A8FA 4WXJA 3HV1A 2Y7PA 4H8JA 4ELOA 4YAHX 1QKAA 1POTA 1VR5A 2DVZA 1MQGA 3U94A 4NF8B 3M8UA 4POWA 2OWTA 3OO7A 3VVFA 1B3GA 3MW0A 3BKIB 3IOUA 4F31B 5F7VA 2Q9TA 3H6UA 2GFEA 2GHBA 1L5TA 3KN8A 1GGGA 4JDFA 1EZ9A 3K00A 4KYSA 4NWCA 5I84A 1Q35A 1Q1KA 2ESNA 5CI5A 4RJZA 3JZJA 4RPOA 1IXHA 2GH9A 3HPIA 1USYH 3G3HA 4AB5A 2F7BA 3S4UA 3K0VA 4RXLA 4BDOA 4QFLA 3V8XB 4IO6A 5DVFA 4Z7EA 1MPCA 2F78A 5DEXA 4IO4A 1ZJLA 4PFWA 3T66A 3LR1A 3MUQA 4OFOA 2H99A 3MP6A 1NNPA 3O9PA 3UGWA 5B70A 4ZEDA 1B9JA 1FQEA 1MRPA 5JK4A 4KCCA 1R1NA 4YKJA 1B58A 1PEBA 3KOSA 1LLSA 2X7PA 3HSTA 4Z0IA 3Q25A 1AL3A 2AL4A 1BP5A 3RY3A 1MQIA 4TLLB 1Y9UA 1B3FA 1LB9A 2R9JA 3MAMA 1UIUA 4GOTA 3VE1B 2DWAA 2I6EA 4FATA 1HSLA 2DE4A 3CRBA 5AE4A 4EXLA 2V3TA 1D9VA 3GBBA 1P1UA 4XKPA 1M5EA 4KYEA 1D4NA 4H5GA 4FEDA 1QKBA 3IOTA 4GXAA 3KN3A 3BFTA 4IY6A 5I58B 1B2HA 3MPLA 4G2ZA 1Y20A 1ZKBA 4OTEA 1Y3PA 2FA7A 4GIZA 3UP9A 3RN8A 2HEUA 3K1PA 4LZ8A 2W7YA 3S9NC 3M3FA 1URDA 1LB8A 4U1OA 3JYRA 3K01A 5HPQA 2AYSA 4LATA 4I1DA 1R6ZA 2AL5A 4FORA 1QJMA 1FQFA 1TWYA 4LA9A 4JBZA 4GFRA 1MY1A 2F35A 2PBWA 2ONRA 1A99A 2E0SA 1NNFA 2XX9A 1NH7A 3FVKA 1MM6A 1EH3A 2A5TA 3OD7A 3OEMA 1BLFA 1UIVA 2NXOA 4HTGA 4NTLA 2M8CA 3PUWE 4ZECA 1IUDA 4G8HA 2QMWA 4RY1A 3PD8A 5I56A 2X7QA 2G29A 2Q2CA 1UTHB 4KYDA 4O3BA 4ZE9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QSLA 4F22A 3VV5A 3Q27A 4MFIA 5I2KA 1SW5A 3CSGA 2ZNTA 1O7TA 1US4A 3MZ9A 1B40A 1IITA 4MCOA 3MQ9A 2DE3A 4YKKA 3KEIA 4OVJA 1BTJA 5CBRA 5ESYA 1MQHA 1FQDA 5FHNA 2GHAA 1AIVA 1FTKA 4C0RA 4ZEFA 2FBPA 5KCJA 5TPAA 2ZNSA 4H65A 1UQWA 1Q9DA 2XWVA 2YPNA 3LSXA 3T9UA 5I2NB 2PVUA 2FNCA 2XXKA 3KOTA 1Y1MA 5AA2B 1FTJA 2OCUA 1JEUA 2WBBA 3MYUA 4YU0A 1H76A 2UXAA 3O6HA 5L9SA 3C35A 2DYXA 1I6BA 2I58A 1SYHA 4OENA 1EYJA 4ISUA 3MVXA 4IO7A 3E9XA 4FIMA 4QFPA 1M5CA 1VE4A 2I3VA 4R9GA 1FPFA 3JV9A 3IR1A 4QHQA 1OIBA 4PBQA 2Q2AA 2CEXA 4PBHA 3KJTA 2XXYA 3B6TA 3PPPA 2CZLA 1QUIA 5A5XB 4F18A 1MH4A 2XD3A 1VFEA 3QK6A 3ODBA 3L6HA 4LZ7A 3W9WA 1LFHA 2F7AA 1JW4A 4I3EA 4F1YA 2I4BA 2O1LA 3HCQA 3VVDA 4YZZA 2V93A 3RNNA 5AA2A 4R73A 4RNSA 2QL3A 1P99A 1NNTA 4NF5B 5ICQA 1IQ7A 1DPEA 1FBPA 1LBWA 2XXUA 2O1MA 4ONYA 1P1WA 1MXXA 3ZS6A 3TAJA 1IMBA 1FW0A 2PFYA 5I59B 3TEPA 5J1DA 2ZYOA 2QSXA 4PGNA 5FTHA 4X1DA 2QJEA 1RDZA 4R6KA 1JVXA 1BIYA 3SEUA 3MVZA 1XHYA 4QSCA 1O63A 1FPDA 5EQ8A 1IMAA 1LFGA 5JTYB 3F11A 4GWYA 4YKIA 4LVQA 2R6GE 1FJ6A 3RPLA 1M5DA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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