The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
18
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sequence length |
53
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structure length |
53
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Chain Sequence |
GSLNLERDVQRILELMEHVQKTGEVNNAKLASLQQVLQSEFFGAVREVYETVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
LIN-7
|
| publication title |
A General Model for Preferential Hetero-oligomerization of LIN-2/7 Domains: Mechanism Underlying Directed Assembly of Supramolecular Signaling Complexes
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Caenorhabditis elegans
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| molecule tags |
Protein binding
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| total genus |
18
|
| structure length |
53
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| sequence length |
53
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-05-05 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | L27 domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VF6 A; 1Y74 A; 1VF6 C; 1ZL8 B; 1ZL8 A; 3B40 A; 1RSO B; 1Y76 A; 1Y74 B; 1Y76 B; #chains in the Genus database with same CATH topology 1WPB A; 2HVJ C; 5KMG A; 4DR7 B; 3QVN A; 4I9W A; 2JDI G; 4LH6 A; 3SPC A; 3K57 A; 4BIO A; 2QEX V; 1GM7 A; 2ZE7 A; 3JD2 A; 5JCO C; 3I55 V; 3W7T A; 1CXZ B; 4FLY A; 4RQE A; 4K3A A; 4HNA B; 2LGQ A; 5IYD O; 2LP7 A; 1YIJ V; 4AI8 A; 4X62 B; 4ZIB A; 2UXB O; 5B66 Z; 1K34 A; 1TGO A; 4DV6 O; 4RAI A; 4JV5 B; 2G38 A; 4JI1 B; 3Q4H B; 4QGP A; 1KQS U; 5LOV B; 1GH6 A; 4IGG A; 2WSS G; 2HHH B; 1NTZ H; 4Z1V A; 3ABM B; 4U7N A; 4X1Y B; 1GMG A; 5L3E A; 1KD1 W; 1PD3 A; 2NNU A; 3GB7 C; 2CH7 A; 1VQ7 V; 4MT8 A; 4O2B B; 4FPP A; 4WFE A; 4IIJ A; 1ZL8 B; 3GWO A; 3FYI B; 3MDS A; 1SZX A; 5FPO A; 5KHG A; 1N0N A; 2YXL A; 1LR1 A; 4TOI A; 4O4L A; 1PV0 A; 3DXR B; 2RQ6 A; 1FD9 A; 2PUS A; 3E89 A; 3T4D A; 5KUM A; 1EN6 A; 4FM2 A; 4AQY B; 4CS3 A; 2UXX A; 3F5T A; 3TET A; 2YSU B; 4LF5 B; 1W0J G; 3RYC A; 3JSN A; 1RPO A; 5EIB C; 5EZY A; 1D5N A; 3HPL C; 3F7V C; 1FFX A; 1VQL V; 2P6J A; 2CE4 A; 2UUA O; 3ETQ A; 3FB7 C; 1IX9 A; 4FM1 A; 1PNK A; 1SER A; 3LUT B; 4ZI7 A; 4DR4 B; 2VQF B; 2WPD G; 3HR0 A; 1S5L Z; 2YI8 A; 1Q90 D; 2N05 A; 4HYO A; 4IYI A; 1N34 B; 2KB1 A; 3U11 A; 2IBZ H; 3BEH A; 3K03 A; 2LFS A; 3FB5 C; 3L70 H; 2L35 A; 2YEV B; 1GAX A; 1Z5V A; 1JR9 A; 1DTO A; 2K1E A; 4TV8 A; 3STZ C; 1E1R G; 3FX7 A; 1TUE B; 4NXM B; 2DQ3 A; 2YIB D; 3JD4 A; 2Z5U A; 2LW7 A; 3CME V; 3MHH C; 5JVD B; 4GKK O; 4O4J A; 1LUW A; 2FL4 A; 3LDE A; 1PNM A; 1M56 B; 4J7K A; 2QGN A; 1SQV H; 2Q7E A; 2EIJ B; 1AI7 A; 5B1A C; 5FPR A; 1QR9 A; 1MSW D; 3LDC A; 1YF2 A; 3HKE B; 5BR8 O; 1XL4 A; 1HNX O; 1H8H G; 1AJP A; 4JI3 O; 4ABM A; 1F4M A; 4QE7 A; 4RUF A; 3CRM A; 1GN2 A; 4N23 A; 1SQB H; 1KUQ A; 3R65 A; 1FS0 G; 1BSM A; 4LBE C; 2YS8 A; 3ABT A; 3LSU A; 1L8D A; 4KHP O; 2UXB B; 5CBG A; 3AG2 B; 3W7U A; 3UT5 B; 1URF A; 4J7Z A; 4DV6 B; 1JJ2 U; 4BIU A; 4LWS A; 2Q67 A; 4RUE A; 4JI2 O; 4TQF A; 3GVM A; 4B3R O; 5KMG B; 2A3Q A; 1VQ9 V; 3M8A A; 2JEU A; 4K0K O; 1Q86 W; 3X2Q C; 3TK1 A; 2EIK B; 4MS2 A; 1V9P A; 2H94 A; 3ZN0 A; 2ADP A; 3F7Y C; 4UCU A; 3ETE A; 2ODM A; 5LGT A; 4DXW A; 3CCQ V; 3E8B A; 3B40 A; 4FFB A; 2YUA A; 2EZO A; 3T2M A; 5JQG A; 2EIN B; 3K9S A; 4PA6 A; 3ETD A; 4GCZ A; 3CMA V; 4YXW G; 4BW5 A; 3THO A; 3E8G A; 1UFI A; 4YJ3 A; 4L8J A; 1KKD A; 4TUY A; 1WPX A; 1SET A; 2Q6A A; 4F6E A; 5JCO A; 3ZN1 A; 3M7M X; 4MVQ A; 3K5N A; 4E4E A; 1AP5 A; 1VP7 A; 1HNZ O; 1UJW B; 4GX2 A; 4TT3 G; 3JCU Z; 3FYE B; 1X59 A; 1DF5 A; 3OAA G; 4JAU A; 1ORQ C; 3UO2 A; 4DV4 O; 4B3T O; 3P30 A; 1Z2G A; 4JI6 O; 1J95 A; 2DYS B; 5EBL C; 1I08 A; 2CH7 B; 2P06 A; 2ZR3 A; 3SPJ A; 1I0H A; 1ZTE A; 2UUA B; 4IIJ B; 1S3J A; 3CC7 V; 3FB8 C; 1XIL A; 3CEI A; 4OPA A; 1M90 W; 2JK5 C; 4O4L B; 1EN5 A; 2Y69 C; 3OR6 C; 2WLN A; 4JI8 O; 2OCC C; 2IJH A; 4X1I A; 1GN6 A; 3K5M A; 3JAL A; 2JS5 A; 3CWB H; 3ZMV A; 2P4K A; 1TA8 A; 3OFN G; 3RYC B; 5EBM C; 2Q68 A; 5GON A; 3BHP A; 5EZY B; 4K8X A; 4MTX A; 4LFB O; 1BQZ A; 3A2F A; 5E79 Z; 1FFX B; 1W0K G; 3ZHR A; 2QM8 A; 4QNH B; 3CCM V; 2EIM B; 3RVY A; 1ARO P; 2IM9 A; 1FKA O; 3ZIA G; 1K92 A; 1M4U A; 1OCO C; 4DR2 O; 3OE7 G; 2VWJ A; 3C90 A; 4CH3 A; 1I5Y A; 3GWK C; 4JI4 O; 3SJQ C; 5BR8 B; 2X6B A; 1FJG O; 1X4T A; 1HNX B; 4JI3 B; 5EK0 A; 3K59 A; 2UUC O; 4TV8 B; 3RGB A; 3IFX A; 4CS2 A; 5AG2 A; 3KCY A; 1QVF U; 2ZXW C; 3BRC A; 3CXH F; 4UV8 A; 2F4V O; 1M9N A; 5CBH A; 4EFE A; 1NT2 B; 4O4J B; 3ZS8 C; 5KHH A; 2BOB C; 4PV1 B; 3FD9 A; 4JI2 B; 1Q6U A; 2GUZ A; 1R1B A; 2XND G; 4B3R B; 2F66 C; 5IYZ A; 2YC0 A; 2UXN A; 4HBN A; 4EKW A; 1RM1 C; 1W59 A; 1JX9 A; 2KKW A; 4K0K B; 2XUM A; 1VQ8 V; 5BXZ A; 1QU7 A; 3A0B Z; 3CSX A; 3QTC A; 3ZMZ A; 1IBL O; 1V54 C; 1YJ9 V; 1BGY H; 2OIE A; 2YIA A; 3DC6 A; 4QJF B; 3L71 H; 4WFH A; 3BY6 A; 2QWP B; 4LWS B; 1KEC A; 3K58 A; 1K8A W; 2QM7 A; 2B1G A; 3T1C A; 2P22 C; 1VEW A; 1K5S A; 4JYY A; 3NR7 A; 1HNZ B; 5CB4 A; 3QF7 A; 1AB3 A; 4DV4 B; 1BHB A; 3BAA A; 1FYJ A; 1KBH A; 3SYP A; 4B3T B; 4JYA O; 4NTW A; 4JI6 B; 3K04 A; 1OHH G; 4X9Q A; 1NS1 A; 3ZMT A; 2Q7G A; 3J81 N; 1XHX A; 1VQK V; 4KL1 A; 4FFB B; 3RYF A; 5JQG B; 1M57 B; 3EVK A; 4OXS A; 3ICX A; 3NXS A; 4LC1 A; 3FKS G; 4YJ3 B; 2UXD O; 4TUY B; 4JI8 B; 3E35 A; 4RO2 A; 4UXN A; 1KP2 A; 4G28 B; 1JMK C; 1Y76 A; 4KP4 A; 2E76 B; 4OGQ B; 2CTR A; 3SGI A; 1MAB G; 1S76 D; 1MNG A; 4LFB B; 4WCE V; 4PDR A; 1E79 G; 5B1B C; 4NXN O; 1K3E A; 4O4H A; 2K9P A; 2EJR A; 3AG4 B; 3J7A U; 1XUQ A; 1AR1 B; 4DRX A; 2QDO A; 3TJT A; 1YXB A; 5LYJ A; 2OTJ V; 2WWW A; 4DR2 B; 1TVK A; 2W0X A; 4J10 A; 4X1I B; 2ZNJ A; 3OW2 U; 4OPH A; 1S77 D; 4PHZ A; 1XMQ O; 4FK5 C; 2PYL A; 4JI4 B; 1FJG B; 2A06 H; 5D5P A; 3WB0 A; 3K06 A; 5GON B; 2UUC B; 3OTO B; 4JI5 O; 2VWK A; 2AHY A; 3H9V A; 2ZIN A; 3H1J H; 2A79 B; 1AI5 A; 2F4V B; 5IJ0 A; 3D3I A; 4X66 O; 1K4C C; 5FL7 G; 3ZCC A; 2UU9 O; 3ZBH A; 1V55 C; 1YCI A; 3U0Z A; 3D36 C; 1WN7 A; 4NTX A; 3ZHS A; 3QO7 A; 4FZ0 A; 3G6E V; 1JQ0 A; 3CRR A; 3CXC U; 4TSF G; 2V7Q G; 3K79 A; 1VQP V; 4IHJ A; 1NBM G; 1VMG A; 1VQ5 V; 1TAE A; 4P9O A; 2Z3Y A; 3ZRV A; 1IBL B; 4AIL C; 4FMT A; 3SDL A; 2ZE8 A; 2CUG A; 4D7T A; 2RCV A; 1K4D C; 3H01 A; 4LFA O; 4FLZ A; 4P9P A; 3E8F A; 4GX5 A; 3KKY A; 3S3W A; 3VQX A; 1OV9 A; 4ICG A; 4ZBM A; 2Y4U A; 2GUZ B; 3AG3 C; 1GM8 A; 1R3J C; 4U3F H; 4QPK A; 4DW0 A; 1P7B A; 4FJC C; 1MZE A; 4JYA B; 4B7K A; 1BE3 H; 2DMX A; 2E74 B; 2KSD A; 2YIC A; 1KMI Z; 3MD0 A; 3JSL A; 2JGD A; 3CD6 V; 3UM7 A; 2VRZ A; 1JPX A; 3TXQ A; 5BY1 A; 3OMI B; 5K1P A; 1VQM V; 3ABK C; 5C93 A; 3G80 A; 2JS3 A; 2UXD B; 1QHT A; 4KUM A; 4YIP A; 2OT5 A; 4LCU C; 2X7R B; 1R3I C; 4UB6 Z; 5LA6 B; 1SES A; 2OYQ A; 5CB4 B; 1ROP A; 5F2V O; 4CH6 A; 4PDV A; 3ZHV A; 2W6I G; 3CX5 F; 2LJ2 A; 3CRQ A; 5KX5 A; 4DV5 O; 4NVP A; 4JYB A; 3EFF K; 3AG7 A; 3JD1 A; 1N33 O; 4NYK A; 1COW G; 1BL8 A; 4NXN B; 1ZLZ A; 5KHJ A; 1M1K W; 3RYF B; 2HVK C; 4J9Z B; 1G6U A; 3P3P A; 2AGA A; 3HKB A; 1QLE B; 2Z0A A; 1EBO A; 2QKS A; 1H2G A; 3X2Q B; 5JWP A; 3LSS A; 4IYH A; 1NKD A; 1AJN A; 1XMQ B; 1JOY A; 4GLX A; 1SQQ H; 1NH2 B; 2QWR B; 4BAY A; 4H44 B; 2DYR C; 1H2N A; 5LHH A; 5EYP A; 1H2M A; 2Q7H A; 5JJN B; 1AJQ A; 3AK3 A; 4JI5 B; 1WP8 A; 3E8H A; 1Y67 A; 4QPJ A; 3K9A A; 3MHS C; 5KAI Z; 4O4H B; 2LW1 A; 1S5J A; 2GV9 A; 3L74 H; 4X66 B; 4O4I B; 1NU1 H; 4FVM A; 1PPJ H; 2P90 A; 2UU9 B; 4JZ2 A; 1DGS A; 5L3G A; 1NVP D; 4DRX B; 3OGC C; 5LYJ B; 3E83 A; 1PL0 A; 3T4Z A; 1TVK B; 2P4V A; 5L3F A; 5E1A C; 2P67 A; 1Q7Y W; 4L87 A; 2ZD9 A; 2AZ2 A; 1OCZ B; 2YID A; 2BTQ A; 3U10 A; 1Q6I A; 5L3B A; 4ASU G; 3ZED A; 4I9Q A; 3D3Q A; 1NTM H; 2EBO A; 4UVC A; 4LFA B; 4A5U B; 4U3J A; 4J41 A; 3IAY A; 2Y4T A; 2Y69 B; 3VQV A; 4W4K A; 2OCC B; 4PI0 A; 1K9M W; 3SJC C; 4X1K A; 5IJ0 B; 1F4N A; 4GT1 A; 3CS5 A; 4MTO A; 2BCC H; 2F43 G; 1JA8 A; 1XNR O; 1H2S B; 2PY5 A; 2CTQ A; 3W7S A; 3UQ8 A; 1UPG A; 2BE3 A; 1JVM A; 1JCH A; 4LH7 A; 4D6T H; 5BZB A; 3CRC A; 4IHJ B; 3LNM B; 1KC8 W; 4UVB A; 1H2K A; 5KA5 A; 1SRY A; 3H1K H; 2ZE6 A; 4FLV A; 4YY3 B; 3JAT B; 3VBB A; 4GKJ O; 1OCO B; 1G8M A; 1SQX H; 3AG1 C; 2GDS A; 2JVD A; 2GSM B; 2Y0I A; 1D2D A; 3WB2 A; 2ZE5 A; 2KG7 A; 2QTS A; 5H6R A; 3JAW B; 1VF7 A; 1XI1 A; 1SQG A; 3B77 A; 2F95 B; 4W4L A; 1Q82 W; 2LGW A; 1WJZ A; 4DV5 B; 3K5O A; 2ZXW B; 3SYA A; 1YTF D; 2F93 B; 1PM9 A; 1N33 B; 4DV1 O; 1K5Q A; 1IXB A; 1Y74 A; 2JGD B; 3CPW U; 4WF9 V; 2HFE C; 3SJB C; 3UO3 A; 3ZRS A; 2R9A A; 4IL6 Z; 1SF9 A; 2JJ1 G; 1HR0 O; 3CRA A; 4TV9 A; 1RM1 B; 4EB6 A; 3SYQ A; 3I5D A; 3WG7 C; 4LF8 O; 2RDC A; 4PDL A; 5JH7 A; 1DLB A; 4K8Z A; 1VAR A; 5FNV A; 2HLD G; 2NR5 A; 1KKC A; 1V54 B; 5KX5 B; 2DW4 A; 5KHK A; 1HDJ A; 2Q73 A; 2E5L O; 2IW5 A; 1EZJ A; 4X20 A; 3G67 A; 4MVS A; 1EN4 A; 5H5N A; 4R50 A; 3SR2 C; 1OCC B; 4D7S A; 2HP8 A; 4QIW F; 4LF9 O; 4Q6G A; 2OWO A; 1XMO O; 5C8Y A; 4PA9 A; 3T1H O; 1CEZ A; 4DV3 O; 5EYP B; 4DR1 O; 5FLX N; 1G1X B; 1JFF A; 3ZJZ A; 4GYC B; 3IJ4 A; 3ABL B; 3RWR D; 3O9O A; 1VIB A; 4KFM A; 4X64 O; 2YDE A; 2HEP A; 4PI2 A; 4DV7 O; 2ADQ B; 2LQT A; 4FLU A; 2XTA A; 1YI2 V; 3RT3 C; 4PDM A; 2Q5Z A; 4I55 A; 2DWD C; 5A9G A; 5L3D A; 5CBF A; 3EHB B; 1AVM A; 1PNL A; 3BA8 A; 3FAV A; 3B8M A; 3WB1 A; 1YZB A; 2BTQ B; 3H1H H; 4GKK B; 3JD3 A; 3UKM A; 4MTF A; 4ZI7 B; 2PTM A; 1P49 A; 2B1I A; 4GKJ B; 1FXH A; 4X1K B; 4J7J A; 4HZ3 A; 5LGN A; 5IT9 N; 1BHA A; 2Q4P A; 1GK9 A; 2BOC C; 2YIB A; 4ZOL A; 1Q6H A; 4R7C A; 5BMV A; 2ZM6 O; 2JJ2 G; 1GKF A; 1DK1 A; 1XQ8 A; 1U96 A; 1FFT B; 4KHP B; 2IJJ A; 1I7F A; 1RFY A; 4DV1 B; 1BT8 A; 3ZRX A; 4CC5 A; 3RW0 A; 3CCR V; 2EIL C; 4XDK A; 4O2A A; 1HR0 B; 1PP9 H; 1FAF A; 4CS4 A; 3CCJ V; 3LNN A; 5IE9 A; 2ARH A; 1HP8 A; 1OCR B; 2AW9 A; 4LF8 B; 2MW2 B; 4JGS A; 3W7W A; 5HFL A; 2KG7 B; 4E2L A; 2QA4 V; 4LF7 O; 1Y4M A; 2O57 A; 5GW7 A; 4XBF A; 2ATK C; 3QO8 A; 1F23 A; 1Y74 B; 2E5L B; 3B09 A; 2DJV A; 3J80 N; 4PEL A; 2RMK B; 1Q3E A; 4DV2 O; 2XAG A; 3R66 A; 2MK3 A; 3AG3 B; 4X8A A; 3STL C; 2JRI A; 4LF6 O; 2E3C A; 4DK1 A; 4EB6 B; 1GO3 F; 4WBN A; 1HW7 A; 4PA4 A; 3OUF A; 3ASN C; 4P30 A; 1XMO B; 1O9G A; 5JH7 B; 1MA1 A; 2D2C B; 1U97 A; 4PJ0 Z; 1YJW V; 5FNV B; 3T1H B; 2CDY A; 3BFR A; 1QVG U; 1NTK H; 4DV3 B; 3SPH A; 5ITZ A; 1P7G A; 3CC4 V; 2AZ0 A; 1WA8 A; 4CZZ A; 2LO1 A; 3JD0 A; 4DR1 B; 1Q5O A; 3ABK B; 4PA7 A; 1XOU A; 4UCR A; 1S0V A; 1BZK A; 3RBZ A; 4WFG A; 4DUY O; 4UB8 Z; 4X64 B; 1R6K A; 2CTW A; 2N74 A; 4DV7 B; 1KYO F; 3L72 H; 5LOV A; 2ITC C; 3JAM N; 5B3S C; 4H0L B; 5GTH Z; 4LNU A; 2XHB A; 2M6Y A; 3M99 B; 1K33 A; 2AXT Z; 4FLW A; 4I5S A; 4MVM A; 1BS3 A; 5C8Y B; 3SPI A; 5A2Q N; 2XAJ A; 4I50 A; 2DWE C; 1B04 A; 2ETN A; 4JAS A; 1MOF A; 3RYI A; 1IXM A; 2BSK A; 4B08 A; 2N04 A; 5K1X A; 2QKA A; 5LGU A; 1JFF B; 1N8R W; 1AR4 A; 2ILM A; 2R72 A; 4LF4 O; 3JAL B; 4J9Y B; 2FKX A; 1IBK O; 1SC5 B; 4DR6 O; 2UXC O; 2ZKO A; 2ZM6 B; 4CH4 A; 1E1Q G; 5L3C A; 3G4S V; 3JCZ A; 2R70 A; 3ZHT A; 2H3O A; 1Y66 A; 4H37 A; 2FML A; 2JIZ G; 3L75 H; 1HNW O; 1US6 A; 5H2F Z; 1I94 O; 1XEQ A; 1WAZ A; 4PA3 A; 1H2L A; 2Q8V A; 2V4D A; 1B6Q A; 1N0J A; 2D3O W; 4LFC O; 4MW3 A; 5EC2 C; 4DW1 A; 3D8C A; 2Q69 A; 4DV0 O; 4HAM A; 2OTL V; 4ZOL B; 4NKG B; 5BMV B; 2FB5 A; 1M5I A; 2F23 A; 4DYL A; 4J42 A; 2IH1 C; 1J5E O; 4LF7 B; 2IU3 A; 2XOK G; 5JJJ B; 3JAR A; 4JF3 A; 1AR5 A; 4X65 O; 4G27 B; 2ZCE A; 2E75 B; 4DV2 B; 5IYZ B; 2GBO A; 2P7T C; 2B5U A; 4O2A B; 2Y0P A; 4LF6 B; 4DUZ O; 3N2G A; 3MAQ A; 1ZSP A; 3OM3 B; 2ZIM A; 3ABU A; 4H13 B; 4EFB A; 2DE0 X; 1B06 A; 4YJ2 A; 4F6R A; 3FB6 C; 2WLL A; 4Q20 A; 2CGN A; 3WFV A; 1IVS A; 3ZMU A; 2KQX A; 4DR3 O; 3PJS K; 3H1L H; 3VQY A; 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