1ZMAA

Crystal structure of the bacterocin transport accessory protein from streptococcus pneumoniae
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
b'SNAMEQFLDNIKDLEVTTVVRAQEALDKKETATFFIGRKTCPYCRKFAGTLSGVVAETKAHIYFINSEEPSQLNDLQAFRSRYGIPTVPGFVHITDGQINVRCDSSMSAQEIKDFAGL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The Crystal Structure of the Bacterocin Transport Accessory Protein from Streptococcus pneumoniae
rcsb
molecule keywords bacterocin transport accessory protein
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transport protein
total genus 38
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zmaA00
4O5RA 4XS6A 1Z6NA 2CX4A 4WEYA 4DSQA 3LSZA 4BWSA 1FAAA 3CRTA 3TKQA 2CZ3A 3KMOA 1YKAA 3QDNA 2GSQA 1K3YA 2LS5A 3A2VA 2ON5A 3ZFBA 2K9FA 2EIQA 14GSA 1OVNA 1FVKA 3TJJA 1MDJA 5CNWA 2YJHA 4J2FA 4PQ1A 1GLPA 3IR4A 5B6NA 1ACVA 3HZ4A 4JE1A 4DVCA 1ZYQB 2VLTA 3TDGA 2FLSA 4LL4B 2H0HA 3UOMA 2IN3A 3FEUA 2H76A 1SL1B 5IOWA 3IAS2 1PD21 4MPFA 2LV3A 5H5SA 3I9V2 4GSNA 4KSMA 3OR5A 4F9ZA 3PR8A 4D73B 1V57A 4FO5A 3GNJA 5L71A 3C7MA 5ELAA 4GSTA 1VF4A 3HXSA 5ECHB 3LWAA 2A4VA 4EDYA 2AV4A 5HFKA 1WMJA 4FYUA 2DSAA 1RQMA 4HZ2A 8GSSA 4K8MA 1V58A 5IM9A 2WB9A 3KXOA 1X9WB 2RIIA 18GSA 2HZEB 3G7IA 3BD2A 1JZDA 4NHWA 4MH2A 3FR9A 4MK3A 1YF0A 3FR3A 1BG5A 1YDKA 3DIEA 1TRUA 4TVEA 3F3RA 1NHOA 2GZYA 3F8UA 2C8UA 3GUSA 1FB0A 2ZCTA 5CRHA 3KD0A 2LJAA 5AISA 3O76A 3FW2A 4Q5NA 1N8JA 4F0CA 2JSZA 2VM1A 3LJRA 1XOBA 2FCHA 5DJMA 1GUMA 2GT5A 4CW9A 2R37A 3CMIA 1OC3A 1X5EA 3APOA 4NAXA 4AJ7A 2JSYA 5C04A 2DMMA 1EP7A 2BMXA 2CAIA 1XXUA 4OO4A 3ERFA 4GTUA 1ZGNA 5EY6A 4MMMA 3DKSA 1TK5B 3E3EA 5EPFA 1NM3A 1R5PA 4O92A 4RQXA 2C0EA 1ZL9A 3J7Yk 1F6MC 2DJ3A 1KBNA 1B48A 3UBLA 3DYRA 3RDWA 4BPYA 4ML1A 5F06A 4L0WA 2R3XA 2EIRA 5D93A 2J9HA 3MNGA 1LBKA 3KCMA 2LQOA 1VRSD 1QFNA 6GSVA 1AXDA 6GSWA 4PNFA 4KH7A 2H6XA 2LRNA 4RI6A 3D4TA 4ZL8A 2H74A 1GP1A 3KGKA 1S3AA 4TXOB 1K0DA 3ZMKA 2BJXA 2B5XA 3VK9A 1KTEA 2WS2A 2A2RA 2ES7A 1Z9HA 3LFLA 1Y25A 1GSEA 1C72A 1FW1A 4POLA 4MZBA 4ZIJA 3D4MA 1XOAA 3LORA 5IMAA 3RPNA 2LUSA 4ZB6A 2NTOA 1Q4JA 2XBIA 1GLQA 5CP1A 5A4UA 2H01A 1A0FA 3HKRA 4ECCA 3L78A 4RI7A 4HU7A 1QXHA 5B7CA 4IHUA 2HNLA 5CREA 4L0UA 4F0BA 1YEXA 2J23A 4MF6A 1M0UA 4KDXA 2CAQA 3H8QA 2MZCA 3I43A 3NIVA 4IN0A 2C3NA 2H0IA 5H5RA 3WT1A 1PX6A 4ZBDA 1FO5A 4K2DA 4FYBA 3UL3A 5HQPA 3VWVA 2F51A 4HUAA 5CRDA 1DBYA 4V1Ap 5F07A 3IC4A 1T8EB 1XW5A 1FHEA 3IK9A 3ME7A 2QC7A 3F4RA 2XPEA 1AAZA 3GSSA 1JLVA 5CO3A 1FVJA 1CQGA 4QL7A 4YQMA 2A2SA 2VCVA 5D96A 3GN3A 3RHCA 2YV9A 3TRQA 3WGDA 2GSTA 2AJQB 2KOKA 3GL5A 3GIXA 1FG4A 5LD0A 4V1Ag 3EVIA 5DQYA 5DCHA 4OFNA 2XBQA 1ON4A 2KP1A 4WXTA 1SD8A 3FZ9A 17GSA 1MD3A 3G7JA 4TW5A 3ZFLA 2H75A 4MJEA 1M2BA 1YF1A 4I2UA 5G31A 1WP0A 3L9SA 1TOFA 5AIXA 4EVMA 2V41A 1O8XA 2CVKA 3GKNA 2GSRA 3IE3A 3Q18A 2FHEA 5JWQB 1OKDA 3QCPA 4NMUA 3UBKA 1YJ6A 3HYPA 3HJMA 3TRPA 3KJYA 4IP6A 2IMFA 3GTUB 1WE0A 4JRRA 4Z7XA 3L0HA 1U3IA 1F3BA 2OBIA 4EUYA 3UVTA 3EMXA 1K0MA 5CRWA 1ABAA 2LTKA 2TRXA 5KN3A 1QGVA 1ZYEA 1FOVA 2NVLA 1PSQA 3LG6A 3WGXA 2LSTA 2TRCP 3IPZA 4J57E 5GAPD 2PWJA 5JWOB 4TR0A 1K0OA 3DWVA 3ZVJA 3UMAA 1X5DA 1HNBA 4FYCA 1M99A 2YWNA 3Q6OA 4IJIA 3TKPA 1XBSA 3F4TA 1SJ6A 2I81A 1X9SB 3HCZA 4OMVA 1OC9A 4E8EA 2AB6A 1AW9A 3RAZA 1Z7RA 4KDYA 1X5CA 2K6VA 2F9SA 3ZREA 4TR4A 1TU7A 2R4VA 3F9UA 3KZQA 2HFDA 4FIWA 2B1KA 2HE3A 4KNDA 4WETA 2VAFA 2VCXA 1JZOA 1M2DA 1J9BA 2FY6A 3FYGA 4CHSA 2R6KA 5DCGA 2LEGA 4IQAA 3CSIA 6GSYA 4YH2A 1XWAA 1MDKA 4OCFA 1FB6A 1SL2B 4ML6A 3TGZA 4KGIA 1VF3A 1YQ1A 4AGSA 2ON7A 1ZCPA 3G9BA 3HD5A 1J0FA 5GSSA 4K7NA 3QD9A 3J7Yb 4HDEA 3CXGA 1J08A 5COHA 3QMXA 3UVHA 1OE8A 3GH9A 1XVWA 4I5QA 1DE1A 3GFKA 1B4QA 1SKSB 4GCIA 2OE1A 4N11A 3ERGA 5IOXA 2H70A 5DAKA 1TK0B 1H4OA 2IFQA 3M0FA 4EDZA 5DALB 5HR2A 4PQIA 3R2QA 1BAYA 5JCGA 2NBSA 3IAM2 3O6TA 1GULA 20GSA 1EZKA 1LJRA 2GQKA 1GSSA 2GT6A 2RM6A 3GL3A 3EURA 1ZOFA 2L5OA 3BCIA 12GSA 3FHKA 1TK8B 1KNGA 1M2AA 3BOAA 4PQHA 1HNAA 3EC3A 1TXXA 2NDOA 1A24A 2L59A 1SYXA 5ECSA 1ML6A 2HT9A 4EXJA 3M9KA 4PGTA 1HD2A 3CBUA 3ED3A 3TKSC 4KAEA 5JCWA 2YPMA 3PH9A 1A8LA 2VL3A 5J9CA 5G5EA 2KHPA 3HJOA 3HVVA 2IMEA 2WZ9A 4ZBAA 3UAPA 3O3TA 2I1UA 2HRFA 4OFTA 5J4UA 3LGCA 2VCWA 3LXTA 2QSIA 5G1LA 4XCSA 4WR5A 4MA9A 1GWCA 2DJJA 3D21A 3GKMA 2VIMA 3C73A 1OAZA 2WJUA 3ZIVA 2CVBA 1ZMAA 3IOSA 4ECBA 16GSA 1U88A 5A5KA 2IJYA 1T00A 1ERUA 1BQ7A 3F6FA 2B7JA 3E9JB 1GSQA 4ZL9A 2MMAA 13GSA 1WRYA 2OE3A 2L5LA 3C71A 3Q74A 2VD1A 3TKRA 4L8EA 1PMTA 2B5EA 3GX0A 4KB3A 4DSSA 1X0RA 1GTAA 2FWEA 4BVYA 4NV2A 2X8GA 3FZ5A 2MMZA 1Z3EA 1PRXA 2F8FA 4TR1B 2RM5A 4GRFA 5ECLB 1AIUA 3HA9A 2K18A 4ZB8A 2I4AA 3M3MA 5C00A 4GWRA 2LJRA 2B5YA 1JFUA 5ECKB 3M1GA 1K0AA 1GTUA 3IV4A 4GXZA 1MTCA 5IQYA 2XPDA 3C1SA 5IPHA 3C1RA 1G6WA 5CYYA 3A5WA 4ZL7A 5D73A 3DRNA 1IYHA 2YN1A 1R4WA 3P7XA 1GTIA 3FR6A 1UN2A 1XVQA 2L4QA 3KIJA 3LEFA 1PKZA 1V9WA 2WULA 1B8XA 1R26A 3EU3A 1BYEA 4TN8A 2IMIA 3CYNA 2H0GA 4IELA 3ISOA 3WGEA 4POBA 2H72A 2XHFA 3HVXA 2GSSA 1MDIA 2V2GA 3HHVA 2DJ2A 4NV5A 1GH2A 2CX3A 5HR3A 1XWCA 4G9HA 4OO5A 4F03A 1G0TA 4F82A 5G30A 3F3QA 1XFLA 4JU5A 1EEMA 1S3DA 9GSSA 5F8BA 1QUWA 4RUVA 4POKA 2VD0A 3TKSE 2H1BA 2JADA 1SL0B 1EEJA 2YCDA 5FWGA 5GSTA 4V2MA 3HZ8A 4YQVA 2GTUA 2PN8A 1SD9A 5KEJA 2FA4A 1WJKA 5EVOA 1PN9A 4XIHA 4XRDA 3GYKA 2P5QA 3TOUA 4JR4A 3I6AA 4BWQA 3MSZA 5ECOB 3QAGA 1TI3A 5F0GA 1WIKA 4MABA 5J41A 4BL7A 2GDRA 1F3AA 3Q19A 3IBHA 1NSWA 22GSA 4YAVA 1V98A 1EGRA 3APSA 2OJLA 2GQMA 5G1KA 1XCCA 1O8WA 2B6MA 2JZRA 3MDKA 4WKWA 5IMFA 1SK1A 4AJ8A 1BEDA 5LCZA 5EL8A 5J5NA 4MLYA 5D9VA 1M7TA 2WDUA 4KUNA 3QAWA 1TRSA 2R2JA 1GSFA 2L4CA 2LKUA 3EU4A 2E0QA 3TJFA 2FA8A 3GA4A 4F2IA 4IP1A 3QFBC 2YNXA 19GSA 4L5OA 1SJZA 2VCQA 1Q98A 1JZRA 2VLVA 1A2LA 1O85A 1SKRB 1TP9A 2DJ1A 5ECQB 3D0ZA 5IMDA 1GNWA 3VI7A 4KSOA 3UARA 3LYPA 1GUKA 2E7PA 2YWIA 3KEBA 5IMVA 2DMLA 2X64A 3RPPA 3VFIA 3UEMA 4QQ7A 3A2XA 3IDVA 1AQVA 4EF0A 4G10A 3H79A 2H30A 2L6DA 1F9MA 5JCUA 2OKAA 1SU9A 5CAXA 2CVDA 3BJ5A 4XS1A 2M72A 2RLIA 2K8SA 2P31A 1EWXA 5ENUA 3PINA 4TOPA 4XS4A 4MCUA 1N2AA 4POMA 4MDCA 3IXRA 2H8LA 4HOJA 3KP8A 2FUG2 2VL2A 4OD7A 4HZ4A 2I9HA 3KH7A 2LRCA 2PU9C 3NOFA 2DLXA 5INYA 2FGXA 3RBTA 1TJDA 3GMFA 1XZOA 2MBTA 4JEDA 4EC0A 3P2AA 2AUVA 6GSXA 1URMA 5ECIB 3H93A 1GSDA 5FHIA 4MJCA 3VWXA 1H75A 5IMZA 2PUKC 3P8WA 4E8HA 3L4NA 4MF5A 2MMOA 4PUAA 2CA8A 4N30A 1XWGA 3M8NA 1RW1A 3DXBA 3SBCA 1TTZA 5ELGA 2H66A 2YZUA 4JBBA 1U87A 1VF2A 3W8SA 3ZLPA 1F37A 11GSA 1ZZYA 5ECRB 2L6CA 1PL2A 4PUFC 2KUCA 1ERVA 4X1UA 1Z7PA 5D9TA 4D73A 2B3SA 3KTBA 2CQ9A 4ZB9A 2HXKA 5DBQA 3ZITA 4NWYA 2DJKA 5E4WA 5HR0A 1T4YA 3QR6A 5ID2B 1X9MB 2VOCA 2PMTA 3ME8A 3S9FA 1GL8A 2P5RA 4AF2A 1PGTA 4OFMA 3BBYA 1SKWB 3FRCA 1T4ZA 4O7HA 2O87A 1TRWA 3KM6A 4O32A 4IJ3A 4NHZA 2HZEA 2FWFA 5D8IA 1TI1A 2H19A 2LQQA 5LNKe 4TR1A 3EMPA 4MH3A 3K8NA 3FZAA 5DJLA 2C1YA 4KE3A 4XHMA 4BVXA 1HYUA 6GSUA 4HS1A 4IW9A 1YEPA 2H1AA 5ABRA 4IS0A 1A2MA 4V2NA 4G2EA 4WF4A 2VM2A 1G7OA 3APQA 4L5LA 4V2LA 2GZPA 2B7KA 4EE0A 3GHAA 3V1WA 2WRTA 2WGRA 3EWLA 3GRXA 4ACSA 4N0VA 1R7HA 4LA1A 1W89A 2AYTA 2H71A 5ECNB 3UIWA 3GH6A 2VLUA 2E2MA 2VL9A 3ZZXA 4KDUA 1EGOA 1AC1A 3A2WA 5KN2A 1WPIA 1I9DA 1TU8A 2YJ7A 2FNOA 3ERWA 2YWOA 5CRGA 2DIZA 5D9WA 4MP4A 2FWHA 3CTGA 3L9UA 2L57A 1JZWA 2M46A 3D22A 3W8JA 4GSSA 4Q5FA 1SK0A 1EV4A 3N9JA 1TRVA 1V2AA 2ZNMA 2JZTA 1SJIA 4NPBA 5J3RA 3EE2A 3GKKA 1V40A 4RQRA 4TXOA 4XRAA 3TB2A 5HFGA 2QGVA 2IPAA 2OADA 4ULXA 5E59A 3ZVJD 1O81A 4MZCA 5J9BA 3GV1A 4MPGA 3LYKA 2EIOA 3VI5A 2IWTA 4KCAA 2MBSA 3KP9A 3ZYWA 2C80A 4I2TA 1XW9A 3WT2A 3EINA 3WD6A 2IL3A 4FH8A 1BX9A 2RUFA 3GURA 2N5FA 5B8BA 1A0RP 1M9BA 1XPVA 1MD4A 5JWRB 1WOUA 2O89A 1HNCA 1ERTA 6GSSA 3I69A 4LL1B 5D9XA 2LJKA 3D5JA 3FKFA 3CRUA 1OC9B 4ID0A 3CTFA 4ZBBA 4KX4A 4TR3A 3C8EA 2H73A 1VF1A 2JACA 4ECIA 2R5GA 2O85A 1M9AA 2YWMA 2H6ZA 3QFAC 4TKYA 3GKXA 2IMDA 1U3AA 4HEA2 4PNGA 4H86A 4IGJA 4MJBA 4QL9A 3FK8A 4X0XA 4ECJA 1K3OA 1QQ2A 2LNTA 1JLWA 1XIYA 3AY8A 4YQUA 2F3MA 1OC8A 2X8CA 1BJXA 4TRXA 1PX7A 3TCOA 1B9YC 4HI7A 2DIYA 1E2YA 2E2GA 4MZWA 1A8YA 3U5RE 1A23A 5DAKB 3L9VA 3BCKA 2IFQB 4BA7A 4IVFA 4I8BA 3LQ7A 4ISDA 5IO0A 5DVBA 4K6XA 3HJPA 2PBJA 4K9ZA 5H5QA 2C0FA 1USBA 5DQSA 1F2EA 2PVOC 3MWHA 2Z9SA 5AIVA 5ECMB 3A3TA 2H1GA 5ECPB 3SWLA 4EL1A 7GSSA 3PGTA 1AUCA 4WBJA 3F4SA 1W4VA 2X8HA 2VCZA 3DGQA 3DEXA 4GLTA 3NZNA 1THXA 3DD3A 1YY7A 1NW2A 3DMLA 2IMKA 3IHQA 3TRXA 1B4PA 1GRXA 1PKWA 3GTUA 2N5AA 1K3LA 3TJKA 3FY7A 4DEJA 3P90A 3H1NA 3KMNA 2HYXA 1O6JA 1ERWA 3VPQA 2P0GA 2OA7A 4WBRD 1K0NA 4K7IA 1LU4A 1Y6EA 4JR6A 4EO3A 3VPTA 2TIRA 5KN0A 3TJBA 2HSYA 2VCTA 2O7KA 1O7UA 1U6TA 1RK4A 1DE2A 3F63A 4HQSA 2N5BA 4TXVA 2DJ0A 1YKCA 2X99A 3E0UA 1GTBA 1AQXA 2IIYA 1TW9A 2WFCA 1T3BA 2QKEA 3RHBA 2HRNA 1HQOA 5IMCA 1THOA 2PERA 5IPGA 5ID2A 4G19A 1KEBA 3DVXA 4MJAA 1K0CA 4DSSB 4Q5QA 2LNSA 4N0ZA 1DSBA 3CSHA 1SK2A 1Z5YE 5G2ZA 1ILOA 1AQWA 4PXOA 4CDOA 2AAWA 2CV4A 4DSRA 3TJGA 1ST9A 10GSA 2FD3A 5IIZA 4WF5A 4AJ6A 4X43A 5DDLA 2YP6A 1EP8A 3HVSA 2KP2A 1T1VA 2VUPA 2GLRA 2RUEA 3ZRDA 4XTSA 3US3A 3IA1A 4J56E 4LLRA 1UA5A 4HJ2A 3WYWA 1QK8A 3W6GA 5A4WA 1GNEA 2K8VA 2HLSA 5B8AA 1CQHA 5IO2A 4OWYA 2YANA 4KW6A 2PVQA 4N10A 1PQNA 2M80A 4GQCA 4GF0A 5DALA 1O73A 2BTOT 1GSUA 3ZMLA 5AN1A 2OE0A 4IKHA 3H4KA 2JU5A 2OACA 2V6OA 2LRTA 3VLNA 1T7PB 3IK7A 5GAND 2XC2A 3VURA 2C3TA 3QOUA 4KA0A 4HU9A 3UJ1A 3DVWA 3GX8A 4IBPA 1UVZA 2JZSA 4I97A 4ZXGA 2WCIA 4PURA 3KTLA 1EOGA 3ZIJA 3IRAA 4K1FA 1WWJA 5B6MA 5A4VA 1S3CA 2GZZA 4JZQA 2H1DA 1OE7A 3QAVA 2G0FA 2VL2C 3N5OA 4MF7A 4K0NA 2NPBA 2AHEA 3LXZA 2ZUPA 4I6XA 4WR4A 2D2ZA 2PGTA 1PL1A 4P3YB 2CZ2A 1B9XC 1YZXA 2VO4A 2V1MA 1TDIA 5HFIA 2PPTA 3GSTA 3G7YA 3TOTA 2B1LA 2GVPA 4HQZA 5G5FA 1UC7A 3F0IA 5GZZB 2YOIA 2OBKA 1QMVA 1XW6A 2C3QA 1IYIA 3VWUA 2DBCA 2KLXA 3EYTA 2H6YA 2C4JA 5FT3A 2V6KA 2DC5A 1GSYA 2I3YA 3FZ4A 1OYJA 2YZHA 1I5GA 1K0BA 1A2JA 2O8VB 3ZTLA 6GSTA 1XWKA 3TUEA 2YV7A 4LMWA 1EOHA 5AGYA 5HR1A 1DUGA 2GGTA 2CT6A 5F05A 4OCEA 2F8AA 4HJMA 1SYRA 2ALBA 4ZILA 2HI7A 4KCEA 1VGLA 3VWWA 2EC4A 3M9JA 1SENA 4NXIA 4ILFA 1GUHA 2GQLA 1NHYA 2C0DA 3U6VA 3MAKA 1R5AA 2REMA 4EKZA 2HSHA 2MMNA 1G6YA 1XWBA 4IQ1A 1EV9A 1G7EA 3HDCA 4PX1A 3TKSA 4XS4B 1PA3A 4Q5RA 3CSJA 3KH9A 4YAPA 3JCML 1TKDB 3D6IA 3HY2A 2GS3A 2MYGA 2G2QA 2JL4A 2HZFA 2V32A 3QPMA 2C0GA 4GQFA 3F6DA 4K7OA 4K0GA 4LMVA 1JHBA 1MEKA 1Z6MA 1OKTA 2FWGA 5KN1A 1E6BA 3ZL5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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