1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, metal binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
3SEYA 1GTKA 1B7UA 3UK4A 1SBPA 3L6HA 3SEVA 3WAFA 3MQ9A 1XC1A 3MW0A 4AB6A 2GRVA 3SDFA 2ZNUA 4JWXA 5J1DA 2Y7KA 2XXRA 5I58B 2Q88A 3IORA 2XXTA 2GFEA 2O1LA 3O6HA 1UTHA 4GD5A 5ITOA 4RJZA 2Z23A 3CRBA 3KFMA 3K6UA 2F8DA 3B7DA 2D3IA 3H03A 4LZ7A 2DWIA 2DE4A 3TTLA 1MY1A 1EZPA 3CG1A 1NH7A 1ANFA 5FHMA 1US5A 3PPRA 1LLSA 3U8QA 1BP5A 1Y9UA 2UVJA 3KOTA 5BWJA 3U94A 1R1NA 4TQUQ 5I2NB 2PBWA 3OO8A 3Q29A 4G68B 5L8DA 4DLDA 4IO6A 2FNCA 2F7BA 2H9BA 4PETA 3M3FA 4RPNA 1IEJA 1SD3A 1B0HA 1B1XA 4BDLA 4NF5A 2VGQA 3PUZE 4FJPA 3HV1A 1FTLA 3EN3A 4BLAA 2H25A 4ZDMA 3EF7A 1AIVA 3OO9A 3A3UA 4KR5A 3O97A 4WEPA 5AA3A 4R9FA 2ZYOA 4JBZA 4L17A 3MVYA 3C4MA 3VLWA 4WXJA 2DE3A 1B05A 3HPIA 4YMBA 4LZ8A 1OMPA 4OERA 3IJXB 4QF9A 2DVCA 4G68C 4TOZA 1P1OA 3MPLA 3O28A 3R6UA 1POY1 2ZNSA 1FQDA 1H3DA 2DQVA 2YLNA 4FEDA 3ECRA 4DDDA 4NWDA 4R75A 4H1XA 4F39A 1I69A 2R71A 2Y7RA 1TT1A 2AL4A 4KQPA 2V3TA 3CFXA 1M5DA 1ZJLA 4DXCA 1J1NA 3HHGA 3FD3A 2XXXA 1UIVA 3O2AA 1JVXA 3K6XA 4ZEFA 1P1NA 1YAEA 3E13X 4C1TA 4R6KA 4GXSB 3IX1A 3ZSFA 5KCJB 5AA4B 4FECA 3H3GA 4UA8A 5CMCA 5I2KA 1JEVA 4JWYA 4AQ4A 1URGA 1EH3A 2D5WA 3SEXA 2HQ0A 4EQ9A 3UIFA 1B3FA 1P1UA 4YB5A 4ZE8A 1B5IA 3FV2A 5EHMA 3MVXA 5F7VA 4FE8A 4RYAA 5I57B 2FA7A 1B5HA 4FORA 1D3KA 5FHNA 5JK4A 2X7PA 4PFWA 4OYVA 1D9YA 3N6UA 1N04A 3TPAA 2RC7A 1LFGA 1MXYA 3M8UA 1H45A 4MLQA 1FQFA 4ZECA 4ISUA 4JWOA 3PPOA 5I56B 4ZEIA 3OSRA 1Y4CA 2O6AA 3H6TA 4RPOA 1SW5A 4QFLA 5TU0A 5AA1A 3SESA 2UYFA 1A8EA 3R26A 1MXWA 2RCBA 5A5XB 4NE4A 2HZKA 3FUZA 3RUMA 1BKAA 4F2OA 4R2FA 2P1SA 3GBAA 3DELB 4GVOA 4R2BA 4OFOA 1MG1A 1XHYA 3EHSA 2ONRA 2QPQA 5ISUA 2ONSA 3ONMA 2QSXA 5CBSA 5KCJA 1S50A 3IJOB 3S9NC 1FW0A 2B65A 3FV1A 3CFLA 2QS3A 2XD3A 3PMVA 4OENA 1MPDA 3LSXA 3T96B 4Z7EA 1TWYA 3C34A 4ELOA 4THIA 4GF8A 4U22A 3MJNA 4KHZE 4WEDA 3MP8A 1B6HA 1IQ7A 4KYDA 2IA4A 2OK2A 3N5LA 1ZLQA 3T66A 3RTWB 5B7DA 4Q8RA 4ZZAA 1USYE 5H8NA 3N94A 3T93B 3VLVA 4LONB 3OOAA 4OWDA 3Q26A 2NXOA 5I59B 2XXQA 2QMXA 1Y1MA 3PD8A 1LAGE 4IO3A 3VVFA 3PV0E 1LSTA 1MM6A 2Z8FA 3TQLA 4JXIA 4F19A 5AA2A 1QULA 4F22A 1FQAA 2HAVA 2FYIA 3N26A 2HZLA 3VFJA 2XD2A 2DWAA 1JW4A 4OMBA 1VE4A 3UORA 3ZS6A 3PPQA 1ELJA 1VR5A 2RC9A 2DWJA 3HO7A 2DE2A 3IB2A 1VFDA 2XXPA 1A99A 1QUIA 2XX7A 1IUDA 3VV5A 2I6EA 1B3EA 1SW1A 4KD5A 2F7AA 4FIMA 4R73A 3ZKKA 4U21A 4F18A 2HFBA 3VDFA 2XX9A 3K01A 3W15C 4XTCQ 1MM7A 3UN6A 3KG2A 3G3JA 2Q8JA 3S9EA 4KFQA 5HBCA 5DTBA 1AL3A 4YB7A 5I84A 2RINA 4NTLA 3T22A 3KJTA 4F3BA 5H8HB 1MH4A 1LCFA 1PBQA 3RY3A 1MS7A 1QUKA 3F11A 3TELA 1POTA 2O7UA 1B58A 2F78A 2I0CA 4I62A 1TFDA 5CM6A 3LSFB 2B3FA 1ZTYA 3G3GA 5CMMA 3TDJA 1LGBC 3GZGA 4LUBA 3UA8A 2ZYMA 4DXBA 1NL5A 3QK6A 3ILUB 3O29A 3KJ7A 3MZ9A 2O7IA 2UYEA 1MQDA 2NOOA 3CFZA 1ZIUA 3FGSA 1B32A 3IAZA 3MZ1A 3S9LC 4O3CA 4QSEA 1M5BA 1Z7ME 1Y20A 4HTGA 3HN0A 1CE2A 4F2QA 4F31B 3K02A 3IB1A 3V5AA 1PB8A 1Z7NE 2H4IA 5BUUA 4LA9A 3IB0A 4N07A 2PT1A 4OVJA 2R6GE 4IGRA 4OZ9A 2ZYKA 3LR1A 2OJTA 5CMBA 4F3SA 2GH9A 1ZKBA 3LUYA 4IB2A 4GXAA 3H4ZA 4RNSA 1T0KA 1DPPA 1QKAA 1JW5A 1SVXB 1SW2A 5IKBA 2Q9TA 1DPEA 2Q2CA 1MPBA 1A55A 2UVHA 4ZEKA 2NWJA 1OIBA 2HCAA 4X48A 2QS2A 4Q5TA 4R74A 3FJGA 5EYFA 4PFYA 5JTYB 1MY4A 1O7TA 1GGGA 5H8HA 5KDTA 2PT2A 3SEWA 4C0RA 1A8FA 1TFAA 3C36A 4AB5A 1L5TA 1JEUA 3KSXA 4R9GA 2O68A 2M8CA 2HXWA 3U92A 2W7YA 5DVFA 4FAJA 1LAXA 3G3FA 3QXMA 4X1BA 4QFKA 3H6VA 5H8FA 3FASA 3D4CA 4YZZA 1H44A 4KYEA 4NF8A 3KN3A 2AIXA 1H76A 2QJEA 3TKDA 1OVBA 4ELRA 1B46A 3MP6A 2DXRA 3DP8A 1S7YA 1BIYA 3CVGA 3IOTA 4QFNA 3DM0A 1NNPA 3PGFA 1M5CA 3BFUA 4G8HA 1SYHA 1GV8A 4LQ2A 5TPAB 1P99A 1Q35A 1R9LA 4XKQA 5B70A 1SDXA 4N6PA 1WODA 1DMBA 2F36A 4P11A 1B3GA 2I3WA 4LVQA 5I58A 4RA1A 4QFPA 2OCUA 5DEXB 2VP1A 4G8MA 4IO7A 5L9OA 4JB7A 1VFEA 4BDQA 1SI0A 4H0WA 3H6WA 4BDNA 3GLBA 3IO4A 4MH5A 3FATA 3PPPA 1F9BA 1WDNA 1MDP1 3U93A 2Z8DA 2AL5A 2A5SA 5I2NA 1YPNA 4G68A 5FHOA 3C32A 3C31A 4ZS9A 4DZ1A 1UTBB 4DE8A 3FJMA 3OEMA 1LB8A 5DT6A 5L9MA 1A40A 4BDOA 4BDRA 2VHAA 2DXYA 4TLLB 4EXLA 1FCKA 1NKXA 3A3CA 2YPNA 3O9PA 2QMWA 2F6GA 5L9SA 3BFTA 4XKRA 4UACA 4OESA 2XXUA 2ONKE 5HM4B 1NMUA 5EHSA 4GWOA 3B6WA 3D4GA 1S9TA 2NVUB 1I6AA 2VD3A 3UGWA 3MVWA 1FQCA 4QRZA 2PVUA 4R6YA 4IY6A 1N3WA 4FEBA 1FQBA 1DTGA 4Q0CA 3ZKLA 5FTHA 1B3HA 3RQTA 4LQ5A 3B6QA 2F7CA 1IZ1A 5K2YA 2UVGA 3E9XA 4RY1A 2V93A 3TTRA 5AA4A 3FIRA 2XXVA 2Z22A 4OFJA 1US4A 2I0BA 1ZU0A 2F34A 3MZBA 1LBBA 1QUJA 2PYYA 2ALUA 4KPTA 1B5JA 2H98A 1CB6A 1VSOA 2XXHA 4POWA 2AYSA 2D21A 1UQWA 1FTMA 1UTBA 5I57A 3H06B 4YKJA 3PUYE 1OVTA 3K00A 1LFHA 2LAOA 3TCGA 1Y4TA 3GXAA 3USDA 4NF6B 3O6GA 1P1QA 3IK6B 4F1YA 4JSDA 4KI0E 5ITPA 3IOWA 3O66A 3TFLA 5HPQA 5DYHA 3SEUA 3CG3A 3E3KA 3OENA 2RCAA 4QSCA 4XKNA 3MPKA 4YB6A 4F3GA 4GIZA 3GBBA 5I56A 3KN8A 2REGA 4F1VA 3FXUA 2O1MA 1JETA 4XXUA 3AXFA 1ATGA 3TCFA 1R6ZA 4OTEA 3LBSA 2ZMBA 3RTFB 1JQFA 4EQ7A 2DYXA 3K6WA 5A5XA 4RXLA 1BLFA 1MXZA 1EZ9A 2F5XA 1EZOA 2GHBA 4ND9A 1FTOA 1IXHA 3RT6B 2Q89A 4LP2B 2F35A 4WKMA 3OEKA 3EHTA 4I8CA 1DOTA 4GQOA 1HSEA 1XOCA 1MY2A 3IOUA 4NEDA 2KLFA 1B7HA 3N6TA 4TLMB 3V8XB 3FVGA 5JEIA 1O64A 4QHQA 4EXKA 3CSBA 4YICA 1ZMGA 1YTVA 3H6UA 3P7IA 1JVYA 1UTHB 4F1UA 4GLIA 1GR2A 1B9JA 1AMFA 3LSLA 3K0VA 2DOJA 1OLCA 4ELQA 4OEUA 3VXCA 2O51A 3IOVA 4DCXA 2QS1A 4IO5A 3S4UA 4GL0A 2B3BA 1OLAA 3ODBA 5I59A 1PC3A 3M3LA 3DP6A 3MVZA 5DVJA 2P0SA 4G4PA 4LZ5A 2I48A 1MY3A 3G7WA 4IGTA 3I6VA 1RYOA 1Y3NA 4NF5B 2G93A 2XX8A 4LATA 3V83A 4OHNA 1MXXA 4X9TA 2G29A 5TP9B 3KEIA 4G8NA 2OLBA 3SKPA 2NUVA 4KYSA 3K6VA 1N0TA 3RLFE 1USYH 3QAXA 3C35A 3LC8A 3CSGA 4K3FA 1OQHA 4EDPA 1JW1A 1MQGA 4GOTA 3TZAA 4F3PA 1TXFA 3JV9A 3FVNA 1MXVA 3OD7A 3T9HB 2Y7IA 4O3BA 4H8JA 1N3XA 1A54A 4C1UA 1QKBA 3OMBA 3UP9A 2OWSA 1D4NA 3G3IA 3TTMA 2UVIA 3MWBA 4F29A 4RK2A 4PE5B 2Y7PA 2CZLA 4ZZEA 4FATA 4YKIA 4PQJA 4QFOA 4YMAA 2I4CA 2ANJA 2ABHA 2F6PA 3C33A 5I2KB 5M2VA 4XIGQ 5CC2A 5H8QB 3K1PA 1N7XA 2O84X 4H8IA 4JDFA 3CR9A 3PPNA 3U72A 1URSA 2VOZA 3FVOA 4OQOA 3OSQA 3RNNA 4GRKA 4MFIA 4ONYA 4ZE9A 3LSWA 2Y84A 2DS9A 4X1DA 2XXIA 3FXQA 1Q1KA 4GFRA 1XT8A 3FXRA 4NWCA 4U2RA 5AE4A 1MPCA 3K4UA 1LAHE 4NF4B 2XHDA 3MC2A 5TP9A 3QYTA 3TAJA 1Y1ZA 2P2AA 4KCCA 1PB7A 1PB9A 3G3HA 4H65A 1B40A 1N7WA 1RYXA 1M5FA 4DIGA 5CRYA 3S9MC 2X7QA 4Q30B 2HAUA 3TTKA 3O6IA 2RC8A 3A09A 3SETA 3KBRA 5ELVA 3MBPA 1I6BA 3W9WA 1XS5A 4U4SA 1DTZA 3PUVE 4GL8A 2ZNTA 3OO6A 1UIUA 3T9UA 2THIA 3VE1B 1NFTA 2E1SA 1BTJA 4HS7A 2Y7WA 3U1OA 3TCHA 1HSJA 2OBGA 4PFUA 1LAFE 1SQYA 3TQWA 2A5TB 3THIA 1MQIA 5KZTA 2R9JA 1Y3QA 1O63A 3KZGA 1MRPA 5JTYA 5FTIA 1IXCA 2GHAA 4OXVA 3PUWE 2PX1A 2QS4A 3EPEA 4OETA 2WKYA 1NH8A 3G3KA 1A7LA 5H8QA 3MAMA 3RT8A 2ZYNA 2DP8A 4P0IA 1WVJA 1SW4A 3T9XB 4RK9A 3VVDA 5H8SA 1YCJA 1B51A 1JNFA 3IR1A 1SYIA 3I3VA 4R6HA 3Q28A 2ESNA 1LBCA 3HSTA 3RPWA 3SERA 4IY5A 4H5GA 3VLUA 3M3KA 5H8NB 3HHFA 4NF4A 4I9DA 4YU0A 2YJPA 1MQJA 4EQBA 3DLNA 4E0WA 2DWHA 1B52A 3ILTB 5ICQA 1LFIA 3T9VA 4EF2A 1HSLA 4E0XA 2H5YA 1AH5A 1XVXA 3TUSA 3Q25A 4I1DA 3PU5A 1MY0A 3TTNA 1B1HA 4PFTA 5TPAA 3QIMA 4YKPA 1EU8A 4EUOA 2RF1A 5AA2B 3K1MA 4ZEDA 1RKMA 1R9QA 1GVCA 1I6QA 3RGYA 3QUFA 5CBRA 5DEXA 2H99A 3KOSA 4HCWA 1IXGA 1NNFA 5CI5A 2O69A 4HW8A 2BJJX 4R72A 3VXBA 4M1VA 1FTKA 3TODA 2A5TA 2E0SA 1M5EA 4QSDA 3BKIB 1LB9A 2V25A 4N13A 1N76A 1B4HA 4M4GA 3MUQA 4ECFA 3Q27A 5CMKA 5F1QA 1MXUA 1AOVA 2I4BA 1B0LA 4HCYA 3PD9A 2V3UA 3H7MA 1FTJA 3S2VA 3OO7A 2REJA 3FZVA 3QUJA 4KCDA 5IAIA 3B6TA 1MDQA 4ESXA 1QW0A 2OWTA 3IO6A 2UXAA 2DSFA 3TYHA 2ZXTA 1B7ZA 2I49A 1OQGA 1N84A 1NNTA 3V89B 3L6GA 4U1ZA 2OZZA 4BDMA 3EHUA 3HCQA 5ICTA 1B3LA 1LCTA 3PMXA 3JYRA 3WAEA 3EQ1A 3KSJA 3DP4A 5K2XA 4Z0IA 4IO2A 3KGCA 3BBRA 2V3QA 2X26A 2CMOA 3PMWA 3PUXE 4JSOA 4U1OA 2Q2AA 1SI1A 1B2HA 1MH3A 1IIWA 3E4RA 2QRYA 4ESWA 3JZJA 2V84A 4IO4A 3CIJA 1QVSA 2XXYA 3IL1B 4POXA 4MF3A 3KN7A 4ZEBA 1PDAA 4MBPA 3MP1A 1MQHA 1FQEA 2F97A 5LOMA 2RKMA 1P1WA 4XKPA 2HEUA 1DSNA 1NNKA 1IITA 3K2DA 1ZBMA 3OELA 3VVEA 4ELPA 4PP0A 2PMSA 3I5OA 4DCYA 4G2ZA 1PBPA 1KWHA 2I58A 4H5FA 4NF6A 2XXWA 4OEVA 3CI8A 1H43A 2VD2A 4EF1A 3R7XA 2I3VA 1Y3PA 3W9VA 1QJMA 1PEBA 2QL3A 1IXIA 5KDTB 3FVKA 1B4ZA 4NMYA 5DVIA 4U23A 4YKKA 4G77A 2Z8EA 4H6DA 3OXNA 3QSLA 4OFLA 3K1NA 4U4XA 5H8FB 4DXUA 5AA2D 4O3AA 2DVZA 3C9HA 4NF8B 3TEPA 1URDA 1II5A 4P0GA 2IEEA 4MLVA 4H67A 3FJ7A 3TMGA 1XVYA 4YAHX 3RN8A 1D9VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GX3A 3SEYA 1GTKA 1B7UA 3UK4A 1SBPA 1IMCA 3L6HA 3SEVA 3WAFA 3MQ9A 1XC1A 3MW0A 4AB6A 4N6KA 2GRVA 3SDFA 2ZNUA 4NG7A 4JWXA 5J1DA 2Y7KA 2XXRA 4NAPA 2QVUA 4PFBA 5I58B 2Q88A 3IORA 4XF5A 1LBYA 2XXTA 2GFEA 2O1LA 1NUZA 3O6HA 5IM2A 1UTHA 4GD5A 5ITOA 4RJZA 2Z23A 3CRBA 3KFMA 4OVPA 3K6UA 2F8DA 3B7DA 2D3IA 5IZ1A 5IZ3B 3H03A 1KA0A 4LZ7A 2DWIA 2DE4A 3TTLA 4OVSA 1MY1A 1EZPA 3CG1A 1NH7A 1ANFA 4MJOA 5FHMA 1US5A 4GWWA 3PPRA 1LLSA 3U8QA 2MKZA 1BP5A 1Y9UA 2UVJA 3KOTA 5BWJA 3U94A 1R1NA 4TQUQ 5I2NB 2PBWA 3OO8A 3Q29A 4G68B 5L8DA 4DLDA 4IO6A 2FNCA 2F7BA 2H9BA 4PETA 3M3FA 4RPNA 1IEJA 1SD3A 1B0HA 1B1XA 4JVCA 4BDLA 4NF5A 2VGQA 3PUZE 4FJPA 3HV1A 1D9QA 1FTLA 3EN3A 4BLAA 2H25A 4ZDMA 3EF7A 1AIVA 3OO9A 3A3UA 1NUWA 4KR5A 3O97A 4WEPA 5AA3A 4R9FA 3RYDA 2ZYOA 4JBZA 4L17A 3MVYA 3C4MA 3VLWA 4NGUA 4WXJA 2DE3A 1B05A 1FJ6A 3HPIA 4YMBA 4LZ8A 1OMPA 4PGNA 4OERA 3IJXB 4QF9A 2DVCA 4PTKA 1IMFA 4G68C 4TOZA 1P1OA 3MPLA 3O28A 4GX4A 3R6UA 1POY1 2ZNSA 1FQDA 1H3DA 2DQVA 1FTAA 1FBGA 3SZPA 1FPJA 2YLNA 4FEDA 1DK4A 3ECRA 4DDDA 4NWDA 4R75A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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