1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
4U4XA 3WAEA 1ZKBA 1Y9UA 3KN8A 3KEIA 5A5XA 4NF8B 4NF4B 5DYHA 3CI8A 1UQWA 4NF5B 4GL0A 3S9MC 3VDFA 1QULA 5FHOA 1AOVA 4YB6A 3RLFE 3SETA 5BUUA 3CFLA 3MVZA 1OLCA 1VFEA 2GHAA 2Y7PA 1MXZA 4YMBA 4PQJA 1OIBA 2G29A 3EF7A 4PE5B 2GH9A 1B46A 4GL8A 4X1BA 1NFTA 3O6IA 1AH5A 5K2XA 2AL5A 3PD8A 2XXYA 2ZNUA 4RPNA 4POXA 3Q29A 3GZGA 4R75A 1D9YA 3OSRA 1NKXA 1GV8A 3KOTA 3TTMA 2DSFA 3MW0A 3U93A 3GXAA 2ZNTA 1MH3A 1N84A 1QUIA 3DP8A 4R74A 3KSXA 4ZZEA 3D4CA 4LA9A 5ISUA 2LAOA 1Y3PA 4RXLA 4GRKA 4G2ZA 1Y3QA 4U22A 3KOSA 1YTVA 1NH8A 1B1XA 1A40A 1ZLQA 3FASA 3E9XA 2ZYOA 3MZ1A 3A3UA 2XXIA 4YKKA 3G3FA 3VVEA 2RKMA 3H6WA 3DLNA 1CB6A 1POTA 4U21A 2RC7A 3TPAA 2B3FA 1B58A 3OMBA 4NWCA 1B0LA 4KYEA 1NH7A 5CRYA 4QFKA 4YB7A 2Z8FA 4U4SA 3JV9A 2O51A 5DEXA 1B3FA 2RCAA 4HS7A 4QFNA 1P1NA 1LGBC 3ECRA 4DE8A 3CSBA 1P1UA 5HBCA 4JBZA 4DXCA 3HSTA 3LC8A 3PPRA 1H45A 1URSA 3TYHA 3SEXA 1PEBA 1UIUA 1ZU0A 3FV1A 1QVSA 1PB9A 1MM7A 3C4MA 1B32A 2Q89A 2DYXA 1H44A 3FXRA 2XD2A 3QUFA 1LAXA 4N6PA 3UA8A 5H8NB 3M3LA 3RY3A 3VV5A 1US5A 4QFOA 3QSLA 3EN3A 5IAIA 1YPNA 2QMXA 4I8CA 2I48A 1OVTA 2B3BA 2QPQA 3Q25A 1B7HA 3V5AA 5ICQA 2I0BA 3HHFA 1M5CA 2NXOA 1FQFA 1B0HA 5I2KA 1NNPA 2HEUA 4FORA 1N04A 3O2AA 2F34A 3ZS6A 3ILTB 1VSOA 5KZTA 5I2KB 5JTYA 2Q8JA 2QL3A 3BBRA 1MXUA 1LCTA 3IOTA 1P1OA 4Q30B 2DP8A 4ELOA 4H6DA 5JTYB 2I49A 1N3WA 4G68C 4YKJA 4R73A 3E13X 2DE2A 4P0IA 4ISUA 1ZJLA 5DVFA 2H98A 4NE4A 1OVBA 4IB2A 1HSEA 3K4UA 5M2VA 4H0WA 3O6HA 4G68B 3I6VA 1MG1A 2O1MA 4IY6A 4YZZA 2DOJA 3VVDA 3WAFA 2FNCA 1D3KA 3SERA 3MJNA 2Z22A 2AIXA 4JWYA 1POY1 1IUDA 2YLNA 4U2RA 1TFAA 3UGWA 3QK6A 2A5TA 4ZE8A 2DE4A 3S4UA 4UA8A 4OEVA 4NMYA 4ONYA 1B52A 1B40A 2UVHA 1IXGA 3TCGA 3TTNA 3PGFA 2A5TB 5AA4A 3T9XB 2RC8A 4LQ2A 4FECA 1PDAA 5B70A 3IB2A 3KBRA 1MDP1 2QS4A 5JEIA 3H4ZA 3IJXB 2ANJA 3DP4A 1XOCA 1LFHA 2QS3A 5H8FA 4F1VA 3ODBA 3PU5A 2PVUA 3CVGA 1H43A 2QS2A 4PFUA 3A3CA 4NF6A 3K6WA 3FD3A 1MY1A 2R6GE 2XHDA 1P99A 1DMBA 4BDRA 4R6YA 2VOZA 3MQ9A 1XC1A 4ZEFA 2QRYA 3KJTA 2WKYA 1ANFA 4NF6B 1Q1KA 4EQ7A 1SW1A 2Z8EA 4PP0A 1MPDA 3VLUA 3R26A 1PC3A 4JSOA 4DDDA 2V93A 3R7XA 4FJPA 4X1DA 3JYRA 4GOTA 4NEDA 3RTWB 3MP6A 3MC2A 1CE2A 1MXYA 3MPKA 2XX7A 3MZBA 3EQ1A 1UTBA 5IKBA 2A5SA 1L5TA 3IAZA 2ZMBA 4KR5A 5CBSA 4DIGA 2E0SA 3BFTA 3TQWA 2OZZA 3M8UA 2XXQA 3OEMA 1LB9A 4TLLB 1ZBMA 4OESA 1JEVA 4RA1A 2DXRA 2V3QA 4H65A 3LR1A 1UTHA 2KLFA 1SW5A 4POWA 2ONSA 3MP1A 3RNNA 1J1NA 1FTLA 1QJMA 2HAUA 3CG3A 1UTHB 3USDA 3VE1B 2I4BA 4OQOA 3TCFA 3PUWE 3T9UA 3UORA 1XHYA 2DQVA 4OFJA 1B6HA 3IB0A 5CMKA 3SEVA 2XXVA 5I57A 1Y1MA 4I9DA 3TTLA 3H6UA 1B7UA 2ZNSA 3E3KA 5A5XB 1M5EA 1QW0A 3K0VA 3TKDA 4R72A 1NMUA 4N07A 4TLMB 1NL5A 4EXKA 3SEWA 2F7BA 1M5DA 2VD3A 1I6BA 4GIZA 3C34A 2O7UA 5H8HA 2UVGA 2OK2A 3VFJA 3TQLA 4OVJA 3LSFB 3TCHA 3T22A 3EHUA 4WEDA 2NOOA 4GD5A 1SD3A 3D4GA 1SYIA 3H06B 2I6EA 2B65A 1JQFA 2OCUA 3IR1A 4OHNA 3N6TA 5H8HB 4YB5A 2XXPA 3TTKA 4IO6A 3PMVA 4G8HA 1GR2A 4N13A 2RCBA 2O68A 3SESA 1LCFA 4GLIA 3SDFA 1IXCA 1VR5A 2R9JA 2ONKE 4BDQA 1GGGA 1M5BA 2REJA 3IJOB 3DELB 4Q8RA 2HZKA 3RT8A 4U23A 4ESWA 3UIFA 3C35A 5TP9A 4EQBA 2NWJA 3V89B 1WODA 5CMMA 1FCKA 1VE4A 3Q27A 1R6ZA 5DT6A 2F7CA 1DPPA 3PPPA 2H4IA 5AE4A 5ITOA 3N26A 3ZKKA 4F22A 1P1QA 1ELJA 2XD3A 2W7YA 1ATGA 1B7ZA 4OTEA 3TODA 4ESXA 1MQIA 4PFWA 5DTBA 4XKQA 2THIA 3N6UA 2Z23A 4E0XA 4H8IA 2RC9A 1WDNA 2GRVA 3SEUA 1BLFA 1R9QA 4O3CA 3N94A 1R1NA 5L9SA 1SYHA 2DVZA 1FQCA 1I69A 2F7AA 1XVXA 3VLWA 1MH4A 3TFLA 1IITA 1OQHA 5AA1A 2O84X 5KDTA 1Y4CA 5CC2A 3Q26A 4EXLA 3T93B 1LBCA 1EZOA 5DEXB 1FQEA 2F6GA 1LAGE 1B3EA 1JEUA 1TT1A 3L6HA 2XX8A 3KSJA 3FXUA 1YAEA 2Q2CA 1Y1ZA 4NTLA 1KWHA 2HAVA 3UN6A 4WXJA 4QHQA 4P11A 1B1HA 4GXAA 1Y20A 2QS1A 1HSLA 3B6TA 4Q5TA 4GVOA 1AIVA 2XXXA 1TWYA 3C36A 2VD2A 1QUKA 3MAMA 1SVXB 4YKIA 2D5WA 4H8JA 3JZJA 1H3DA 2PMSA 1Q35A 2F6PA 2ALUA 1EZ9A 2P2AA 3IO6A 4F29A 3LBSA 3IB1A 3W9WA 1Y3NA 2O1LA 1SW4A 2UYFA 1MQGA 3MVXA 2O6AA 3THIA 1QUJA 5EYFA 5FHNA 3OO6A 4HCYA 4F1YA 4KI0E 1AL3A 4JB7A 4XXUA 4OMBA 2XXWA 2HCAA 3IOWA 4BDNA 4MBPA 3TELA 3OOAA 4ELQA 4DLDA 4Z0IA 4KPTA 3K02A 3RPWA 3LSLA 1XT8A 3PUXE 3G3JA 3FJ7A 3MUQA 3ILUB 2CMOA 2ABHA 1SDXA 3FVOA 3VLVA 3T9VA 4RK9A 5L9MA 5I58A 4MH5A 3T96B 1Z7ME 5TPAA 4QSCA 2F35A 1FQAA 4GF8A 2Y7IA 3O97A 3K1PA 3DM0A 1BP5A 3G3KA 3C9HA 5I58B 4H67A 2F5XA 5AA2D 3QIMA 2DWIA 1B5HA 3FXQA 1JVXA 2X7QA 3B6WA 3M3FA 2YJPA 2RINA 3H7MA 2Y7RA 4X48A 5KCJA 3PUZE 4F2QA 4DCXA 1D4NA 3RN8A 1B4ZA 2V3TA 1XS5A 1OLAA 2E1SA 1JW5A 4LATA 4ECFA 2HXWA 1JW4A 1JVYA 4BLAA 5KCJB 2NUVA 1NNFA 4M1VA 3RUMA 1EH3A 2UXAA 2DXYA 1I6QA 1N0TA 4ZE9A 2V25A 4FEBA 3TTRA 3U8QA 1QKBA 3TZAA 3V83A 3LSXA 5AA4B 4R6HA 2FYIA 4OENA 5FHMA 3G3GA 1IXIA 2Y84A 4HCWA 4ELPA 1FTKA 4F18A 1P1WA 3MBPA 5JK4A 1MXXA 3A09A 5H8FB 4NWDA 4TQUQ 5AA2A 3EHTA 4AB6A 3CG1A 4U1ZA 5K2YA 5ITPA 1XVYA 4F3SA 3G7WA 3U94A 5I59A 1DTGA 2YPNA 3C32A 4UACA 4DXBA 3HCQA 4EF2A 4OERA 3VVFA 5I84A 2QJEA 3QUJA 5BWJA 4F3GA 2DS9A 1LFIA 4F3PA 4R2BA 3OSQA 1LLSA 2XXRA 3CSGA 1LSTA 4THIA 2I58A 4YAHX 2ZYMA 3TEPA 4IO4A 3T9HB 4IO2A 3P7IA 2GHBA 1MM6A 1UTBB 2F8DA 2UYEA 4EUOA 4KHZE 1WVJA 3BFUA 3K6XA 1PBPA 1B3GA 1PB7A 5B7DA 4ZZAA 4BDOA 4R2FA 1MY0A 3UK4A 3TDJA 3MZ9A 4M4GA 3FVGA 2R71A 4F31B 5CBRA 3HPIA 1B05A 4ELRA 2X26A 2PYYA 1SW2A 1MXVA 4U1OA 3G3HA 5CM6A 2RF1A 3S9EA 3PUVE 2AYSA 1PB8A 3FATA 4OFLA 4BDMA 1OMPA 4G8NA 3U72A 3RGYA 1S7YA 4MLQA 1EU8A 1LBBA 3K00A 4KCCA 1PBQA 1N7WA 4OWDA 1ZTYA 3SKPA 2DWJA 4WEPA 2PT2A 5HPQA 4PFTA 2UVJA 4QFLA 4NF4A 3PMWA 1IQ7A 3HO7A 3F11A 3PPOA 4NF5A 2NVUB 1MPCA 1ZIUA 5ICTA 5J1DA 3IORA 4JWOA 3MPLA 4ZEBA 4EQ9A 4GFRA 2I0CA 3O6GA 4R9GA 3TAJA 5AA3A 3MVYA 1GVCA 3MWBA 1MDQA 2V3UA 3KZGA 2DWAA 4XKPA 2P1SA 5TU0A 4QSEA 3PPNA 3VXBA 4RYAA 5I57B 2I3VA 1JNFA 3FIRA 4YMAA 3IO4A 1BIYA 3B7DA 3FVKA 4KFQA 1NNKA 1MPBA 1FTJA 2Y7KA 3RTFB 2O69A 1B51A 4G4PA 3KN3A 5FTIA 1MQJA 3DP6A 4ZDMA 3W15C 3FJMA 3I3VA 4C1UA 1ZMGA 3KJ7A 3S9LC 3FUZA 4KD5A 3FVNA 3OELA 5DVIA 2OLBA 1N7XA 3IX1A 1URGA 4ZEDA 4LZ7A 1SQYA 2VHAA 2Q9TA 2H25A 4RK2A 4G8MA 3K1NA 3H03A 3FJGA 2D3IA 1S9TA 4IY5A 5H8SA 1USYE 4K3FA 4HTGA 4XTCQ 4IO3A 4RY1A 2PX1A 3QAXA 5ELVA 4F2OA 2REGA 3L6GA 1N76A 3S9NC 3S2VA 1FW0A 2P0SA 1IXHA 2DE3A 2GFEA 4QF9A 4FATA 4JWXA 4TOZA 5TP9B 2HZLA 4IGTA 3CR9A 5F7VA 2UVIA 4XKNA 4KYSA 4RNSA 1QKAA 3QYTA 4JSDA 4MFIA 1F9BA 3KG2A 4JDFA 3Q28A 3OO9A 3UP9A 3TMGA 3ZSFA 4I62A 3H3GA 2BJJX 4IO7A 3CFXA 4F3BA 3VXCA 3PD9A 4FE8A 1DPEA 3H6TA 4OETA 1DTZA 3O28A 3K6VA 3C33A 3HHGA 4GQOA 2VP1A 2Q2AA 1BTJA 4GWOA 1B3HA 5KDTB 1O63A 4YICA 3G3IA 1FTMA 4QSDA 1B9JA 5FTHA 5I2NA 1BKAA 3PMXA 3H6VA 3PUYE 5H8QA 4LZ8A 5H8NA 4ND9A 5L8DA 2F78A 1LAHE 4Z7EA 2D21A 3LSWA 2Y7WA 3QXMA 4OEUA 4H5GA 5I2NB 2F97A 5H8QB 4XKRA 2I3WA 4ZECA 1US4A 2XXHA 4RPOA 3K01A 2FA7A 1RYOA 4EDPA 4C0RA 1MY4A 2AL4A 3BKIB 3OXNA 1JETA 4FIMA 4AQ4A 1B5JA 1HSJA 1RKMA 4FEDA 2IA4A 3C31A 1AMFA 2HFBA 1OQGA 1SI1A 3RT6B 4EF1A 2I4CA 4XIGQ 4E0WA 3KGCA 4R9FA 3K6UA 1N3XA 5DVJA 1MQHA 1DSNA 3GLBA 1IZ1A 4JXIA 1UIVA 4DZ1A 3HN0A 3TUSA 5I56A 3FV2A 3OD7A 1SBPA 1A7LA 3IK6B 3E4RA 4GXSB 3K1MA 2PBWA 3KN7A 5I56B 3V8XB 4YKPA 3GBAA 4ZEKA 1FQDA 2OBGA 4OFOA 1GTKA 1B3LA 4ZS9A 1FQBA 5TPAB 1LB8A 4LONB 4G68A 3MVWA 3LUYA 2ESNA 5LOMA 1MY3A 3W9VA 1JW1A 1I6AA 3N5LA 2Q88A 4MLVA 5L9OA 2OWTA 1URDA 4LUBA 1H76A 2O7IA 4F19A 1EZPA 3M3KA 4AB5A 3O9PA 5CMBA 1O7TA 4H5FA 4LP2B 2ONRA 3PV0E 4QFPA 5EHSA 1D9VA 1FTOA 1T0KA 4DCYA 3EPEA 5CI5A 2IEEA 3I5OA 4O3BA 4R6KA 4IO5A 1YCJA 4KCDA 1A54A 1II5A 2OJTA 1VFDA 3GBBA 2DWHA 5F1QA 2VGQA 1LAFE 2PT1A 3OENA 4LZ5A 1A8FA 3B6QA 3CIJA 3KFMA 1MRPA 4PETA 3PPQA 3O29A 1TFDA 1MXWA 3OEKA 2ZYKA 4I1DA 4P0GA 1B2HA 4O3AA 3IOVA 4KQPA 4H1XA 1IEJA 4L17A 1Y4TA 3OO7A 2X7PA 4QRZA 3IL1B 2XXTA 2V84A 5AA2B 3FZVA 2QSXA 4Q0CA 4OXVA 4KYDA 2H99A 3R6UA 1DOTA 2M8CA 1MS7A 5EHMA 4WKMA 5I59B 1B4HA 2HQ0A 2DVCA 3SEYA 4ZEIA 1Z7NE 4MF3A 2QMWA 1M5FA 3O66A 1TXFA 3ZKLA 1A99A 3HV1A 1O64A 3MP8A 4G77A 2F36A 3OO8A 3ONMA 5CMCA 1MQDA 4IGRA 2Z8DA 4FAJA 2ZXTA 1MY2A 1A8EA 3AXFA 2H9BA 4DXUA 4PFYA 4F1UA 3U92A 4RJZA 4F39A 4X9TA 1R9LA 1RYXA 2XX9A 1S50A 3U1OA 3IOUA 4HW8A 4LVQA 4LQ5A 1USYH 4C1TA 5HM4B 4BDLA 4OZ9A 1NNTA 4YU0A 2ZYNA 2OWSA 2CZLA 3EHSA 4OYVA 3CRBA 1A55A 2XXUA 1LFGA 1B5IA 3FGSA 2G93A 2H5YA 3K2DA 1SI0A 4NF8A 3RQTA 3T66A 3CFZA 1IIWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U4XA 3WAEA 1ZKBA 1Y9UA 3KN8A 3KEIA 1KZ8A 5A5XA 4PFBA 4NF8B 4NF4B 5DYHA 3CI8A 1UQWA 4NF5B 4GL0A 3S9MC 3VDFA 1QULA 5FHOA 1AOVA 4GWWA 2BJIA 4YB6A 3RLFE 3SETA 5BUUA 3CFLA 3MVZA 1OLCA 1VFEA 2GHAA 2Y7PA 1MXZA 4YMBA 1NV3A 4PQJA 1OIBA 4DI3D 2G29A 3EF7A 4PE5B 2GH9A 1B46A 4GL8A 4PCDA 4HE1A 4X1BA 1NFTA 3O6IA 1AH5A 5K2XA 2AL5A 5F24A 5EYGA 3PD8A 2XXYA 2ZNUA 4RPNA 4POXA 4GWXA 3Q29A 3GZGA 4R75A 1D9YA 1IMDA 3OSRA 1NKXA 1GV8A 3KOTA 3TTMA 2DSFA 3MW0A 3U93A 3GXAA 2ZNTA 1MH3A 1N84A 1QUIA 3DP8A 4R74A 3KSXA 4ZZEA 3D4CA 4LA9A 5ISUA 2LAOA 1Y3PA 4RXLA 4GRKA 4G2ZA 3EKIA 4N8YA 1Y3QA 4U22A 3KOSA 4OA4A 1YTVA 1NH8A 1B1XA 5ET5A 1A40A 3BIHA 1ZLQA 3FASA 3E9XA 4DI4B 2ZYOA 3MZ1A 3A3UA 2XXIA 4YKKA 3G3FA 3VVEA 2RKMA 3H6WA 3DLNA 1CB6A 5IGAA 1POTA 4PBHA 4KXPA 4U21A 2RC7A 3TPAA 2B3FA 1B58A 3OMBA 3SZPA 2XWVA 2B4MA 4NWCA 1B0LA 4KYEA 1NH7A 2Y5LA 4MNIA 5CRYA 4QFKA 1FBDA 4YB7A 2Z8FA 4U4SA 3JV9A 4XF5A 2O51A 4MNPA 5DEXA 1B3FA 2RCAA 3CHGA 4HS7A 4QFNA 4PF6A 1P1NA 1LGBC 3ECRA 4DE8A 3CSBA 2XWOA 1P1UA 5HBCA 4JBZA 4FBPA 4DXCA 3HSTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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