1ZMGA

Crystal structure of copper-bound engineered maltose binding protein
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWHHDHFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVMALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPEFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFEYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural studies of an engineered zinc biosensor reveal an unanticipated mode of zinc binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding, metal binding protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 115
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1zmgA01
5EHSA 2Q8JA 1A99A 1PBPA 2QPQA 2DVZA 4JBZA 4U4SA 4R72A 3DM0A 2CZLA 3TQWA 4GL8A 4P0IA 1AIVA 4KPTA 2F5XA 2O6AA 1MY0A 2HXWA 2I4BA 3PD9A 4LQ2A 1N0TA 2ALUA 2GH9A 3O6GA 1ZLQA 2PYYA 3T9XB 4LATA 2A5TA 3PPPA 3TZAA 1FTMA 2P1SA 2ABHA 3MP8A 4GF8A 3RLFE 3CRBA 4MF3A 1LSTA 1QUIA 3UP9A 3LSFB 1P1QA 3QIMA 3E9XA 1SVXB 1DSNA 2ANJA 1L5TA 5DYHA 1ZMGA 1XVXA 4JSDA 4QSDA 3QUFA 1FTJA 4FAJA 2XXPA 4RA1A 4ELPA 1AMFA 1LFHA 3I6VA 4P0GA 2FNCA 4YB7A 1B5HA 3OO7A 1NH8A 3MP1A 3UN6A 4FATA 3EHTA 4M4GA 5I58A 3MP6A 1AOVA 5FHOA 1HSEA 1XT8A 4GRKA 3RQTA 1FTKA 4OESA 3SKPA 5CBRA 3S9NC 4ZS9A 2Z8EA 2DP8A 1Y20A 3H6TA 4NF5A 3MZBA 1Y3NA 1FW0A 1FQAA 2DYXA 2H98A 2V3QA 4R73A 4RYAA 4IO3A 3U94A 4DXBA 5I56B 3BFTA 2QS4A 3P7IA 3WAFA 4OWDA 3HN0A 4POWA 4RY1A 3O6HA 3ILUB 4H1XA 3PPNA 3UORA 1SW2A 1UTHA 1YCJA 3CFLA 2H99A 3V83A 4O3CA 4X1BA 1I69A 4KHZE 1NMUA 1MY4A 2UYFA 3R7XA 5H8FA 5L9SA 1PDAA 2OZZA 3M3LA 4OERA 1NNKA 2DQVA 4QFNA 1LBBA 4EDPA 4QSEA 4EQBA 1ATGA 2Y7RA 3T9VA 2P2AA 5I2NA 1B7ZA 1VFEA 1Y9UA 2Y84A 2DE2A 3IORA 1LAHE 1EH3A 2A5SA 4KYEA 4TLLB 2DE4A 4WEPA 4YZZA 5ICQA 4GFRA 4ZEFA 4Q5TA 4LA9A 1IXIA 5AA1A 3U92A 3K2DA 5ICTA 1MQJA 2Y7IA 1H76A 2QL3A 4IO7A 5DEXB 1A54A 2I4CA 1OQGA 2M8CA 5LOMA 3V89B 3AXFA 3OSQA 4BDMA 5TU0A 1URGA 4I8CA 1R6ZA 2XXUA 3IO6A 3K0VA 3IOVA 4G68C 4E0WA 1WODA 1Y1ZA 2RC8A 4H0WA 1NNFA 1N84A 1Q35A 1SI0A 2R6GE 4NMYA 4XKQA 5I2KB 3SEVA 3W9WA 5HM4B 5AA4B 4ELQA 1Z7NE 1FTLA 2O7UA 1B05A 3G7WA 3RGYA 3KN8A 5CMKA 4R2BA 3ZKKA 1MPDA 2G29A 4Q30B 4LZ7A 5DT6A 3TMGA 1XC1A 3TKDA 4IY5A 1PB9A 4C0RA 2AIXA 2F8DA 4QHQA 5ITOA 2ONSA 1II5A 4H5FA 1PB7A 3VV5A 2VOZA 3RTWB 4EXKA 4NWCA 3PPQA 4HTGA 3IO4A 3LSWA 4I9DA 5FTIA 5KDTA 1B6HA 2O7IA 4DCYA 3A3UA 3K4UA 5I56A 2GHBA 2O84X 3PUYE 3O97A 2F7BA 1DTGA 1QJMA 2R9JA 2THIA 3I5OA 1LFIA 3KG2A 3OENA 4N07A 4X1DA 4YKIA 3MPKA 1H44A 2QSXA 3OELA 2UVJA 4G2ZA 4EF1A 1M5BA 3MUQA 4ZEKA 3CIJA 3FZVA 2XX9A 3VVFA 4NF6B 1MXXA 2VP1A 1VSOA 5CRYA 1GGGA 3LSXA 2XX7A 1QUKA 4HCWA 4FEDA 3N6UA 3T93B 3FVOA 3GBAA 3TPAA 1TFAA 3PD8A 3V5AA 4F2QA 2I48A 3KBRA 3KEIA 1TXFA 1LBCA 1UIUA 2PX1A 4F3SA 1RYXA 3H7MA 5KZTA 3OEKA 1FQBA 3Q27A 4GXAA 3CSGA 4KCCA 3SEUA 3DLNA 1ZTYA 2HZKA 1I6BA 2QJEA 1MM6A 4PFUA 4JDFA 4OVJA 4ZE9A 1JVYA 1MXZA 5DEXA 1DTZA 4NF6A 2XX8A 1MQIA 4F29A 4R74A 1MH3A 2F6GA 2XXXA 4IO6A 4P11A 1B32A 3TTLA 3H6WA 3K01A 3V8XB 2XXIA 2RCAA 3RNNA 2Y7WA 2DWJA 4PETA 1I6QA 3ZSFA 2WKYA 2F35A 3N26A 1YPNA 1QKBA 4GQOA 3SERA 3KZGA 4BDRA 3H03A 3KGCA 4GIZA 3FV1A 1B5JA 2RF1A 3M3FA 4BDLA 4LP2B 4I1DA 1B7HA 1AH5A 1SDXA 4ONYA 2QS3A 2IEEA 4ZE8A 3TYHA 4DLDA 5B7DA 4EQ9A 1JW5A 1GV8A 2B65A 2OWSA 3PGFA 3TODA 3CR9A 4YB6A 5L9OA 4ZZEA 1WDNA 4EXLA 1ZBMA 2I0CA 4QSCA 2UVHA 5HBCA 1HSLA 2DWAA 2FA7A 3PPOA 3EPEA 4LQ5A 4F1YA 1MY3A 1B58A 1Y3PA 2V84A 2ZYKA 3MW0A 4XTCQ 3CFXA 3TEPA 3K6XA 3MWBA 3K00A 4WKMA 3RPWA 4G68A 3CG1A 1FQEA 3FV2A 4U21A 1LB8A 1B9JA 1JETA 2AL5A 4L17A 2DSFA 1B51A 3UGWA 4YMBA 1FQCA 4GOTA 1D9YA 3FUZA 1M5EA 2QS1A 1TWYA 1N7XA 4LZ5A 4LZ8A 3O6IA 2CMOA 3TTKA 1EZOA 2G93A 1A7LA 3LSLA 4QFKA 1KWHA 4JWXA 1IZ1A 1NNTA 1YTVA 2HZLA 3OSRA 4JXIA 4MLQA 2O69A 2XXRA 1OQHA 4ZECA 5I59A 5FHNA 1IXGA 2XXWA 4YICA 1POTA 4R9GA 3PUWE 3E4RA 3FJMA 1VE4A 4NF8A 3S9EA 4NEDA 1MRPA 2B3BA 3S9LC 4KI0E 4RPOA 3C32A 2VD3A 4N13A 3EHSA 3HV1A 3B6QA 4O3AA 1B0HA 3VXCA 3IOWA 3JZJA 4QFLA 1NFTA 1RYOA 2ZXTA 4ECFA 1B46A 1BLFA 4RJZA 1N3WA 2O51A 3OXNA 3VLUA 3WAEA 3LUYA 2QMWA 3G3JA 1A8EA 1SD3A 1ZIUA 3IJXB 4UACA 4F2OA 2I49A 5AA2D 2X7PA 3H6UA 5A5XA 1XHYA 1BTJA 4XIGQ 3U72A 4H8IA 4G8HA 2ZYNA 1EZPA 2RKMA 1EZ9A 5TP9A 2RC7A 1BIYA 1VFDA 4ND9A 4G77A 2D21A 1URSA 1ZKBA 3HPIA 1SW5A 3T66A 5TP9B 5AA4A 4KQPA 1DPEA 4M1VA 4OFJA 3EQ1A 3H06B 5BUUA 1B3GA 1MQHA 3FVGA 1MQGA 3B7DA 2XHDA 3QSLA 5I58B 4GVOA 3MZ9A 3PUXE 2HEUA 5H8NA 1MXUA 4HCYA 3B6TA 5DVFA 5DVJA 3L6HA 1QKAA 3KJTA 3IOUA 1B52A 1SYIA 1USYE 4EUOA 2Q88A 4LUBA 2HFBA 3B6WA 3FXQA 4OEUA 4KFQA 1MXWA 4ZZAA 1A40A 3IB1A 3ONMA 4DIGA 4EF2A 3M8UA 4JSOA 3S9MC 4F3PA 1N04A 3D4CA 4N6PA 1LAXA 4GD5A 1LLSA 5KCJB 4MBPA 2OWTA 3CFZA 3FJGA 1LB9A 4PQJA 3E3KA 3N6TA 3VVDA 4F3GA 4ELRA 5AA2B 4G8MA 5JTYA 3I3VA 4GL0A 5DVIA 1SQYA 3N94A 3MVZA 4DDDA 1MH4A 1OIBA 2PT1A 2RCBA 4FE8A 1P1NA 2NVUB 3MC2A 3O66A 5I2KA 4ESXA 3TFLA 1A55A 1IQ7A 3DELB 2DWIA 2VD2A 1M5DA 3MPLA 1CB6A 4NF8B 4WEDA 5F7VA 4ZEBA 4AB5A 2ZMBA 3EN3A 2I3VA 3PUZE 3K6VA 5HPQA 2I6EA 5CI5A 3K1PA 4NF4A 1B4ZA 3FASA 4JWOA 4HW8A 1UTHB 2OK2A 4GLIA 4JB7A 5AE4A 1MPCA 3G3HA 3IAZA 5CBSA 2IA4A 3IX1A 4OEVA 3FIRA 3UK4A 3C31A 2UVIA 4C1TA 4F1VA 2ZYOA 1O7TA 1O64A 3DP6A 1NNPA 3G3KA 3SETA 1P1UA 3MVYA 3PUVE 4OETA 4G4PA 2HAVA 2W7YA 1QVSA 3CSBA 4POXA 3C35A 4G68B 2HQ0A 3PMVA 1FQFA 1FQDA 1FCKA 1MS7A 4OHNA 4DXCA 1SW1A 1D4NA 3HCQA 1JW1A 3IR1A 1IUDA 4IB2A 5H8QA 4XKNA 2E1SA 3UIFA 2UYEA 3Q29A 4UA8A 3TTRA 2GRVA 4DZ1A 1B0LA 3BBRA 1B40A 1GTKA 4QFPA 2DXRA 2F78A 1UIVA 2ZNTA 1ZJLA 2Q89A 2E0SA 4G8NA 5M2VA 4O3BA 2PMSA 2O68A 4OQOA 4Z0IA 3A3CA 3QUJA 4OZ9A 1URDA 2DXYA 3D4GA 4MFIA 5FHMA 2H25A 2PVUA 4U22A 3T22A 1IITA 4BDQA 2LAOA 2DOJA 4IGRA 2F7CA 2QS2A 1EU8A 3TDJA 1QUJA 3PPRA 2DS9A 3O2AA 3LC8A 3HSTA 3PMXA 5TPAB 3GLBA 1US4A 1OMPA 2Z8FA 1MG1A 4OXVA 5JTYB 3F11A 3U93A 5AA2A 2Q2AA 1RKMA 2XXTA 2YJPA 3FATA 3H3GA 3IJOB 3GZGA 3VLWA 3K6UA 1S50A 2X26A 3BFUA 3DP4A 1ANFA 1XOCA 1H43A 4NF5B 1B3HA 1D9VA 3Q26A 5FTHA 3TELA 3TUSA 3L6GA 4F18A 2GFEA 4E0XA 2Y7KA 3K1NA 4OMBA 3C9HA 4RK9A 4R75A 3OEMA 3TCHA 3UA8A 3HO7A 1S9TA 1T0KA 1LAFE 2Y7PA 4R6KA 4F31B 2F7AA 4JWYA 4RK2A 4DCXA 1GVCA 1LCFA 1P1OA 2F36A 3K6WA 2A5TB 1B5IA 3CI8A 3TTMA 4EQ7A 2Z8DA 4YMAA 3CG3A 2UVGA 3C4MA 2I3WA 5EYFA 4F1UA 1H3DA 1DMBA 3FVKA 1PB8A 1JVXA 3FGSA 4FIMA 1IIWA 4KR5A 4LONB 4R6HA 4U2RA 4YKPA 3U1OA 5JEIA 2PT2A 4DE8A 4PFTA 2XXHA 4WXJA 3KOTA 3VLVA 4Q0CA 3H4ZA 3KSXA 1B3LA 5BWJA 4IGTA 4MLVA 2AYSA 3K1MA 2H5YA 4Z7EA 1JQFA 3GXAA 4YKKA 1B4HA 2Q9TA 2DE3A 5TPAA 3C34A 1XVYA 3GBBA 1I6AA 4I62A 5CMBA 4F3BA 1MXYA 2Q2CA 4MH5A 4TQUQ 1NH7A 3MZ1A 1OLAA 2ZYMA 3RUMA 4KCDA 4IO2A 3IB0A 3QAXA 5F1QA 3C33A 4BDNA 5KDTB 3DP8A 3IK6B 1B1HA 4THIA 5ISUA 3TAJA 2I0BA 5L9MA 3E13X 2P0SA 3PMWA 3S4UA 3TCGA 3TQLA 1LAGE 4OENA 3OOAA 4KYSA 3T96B 1SBPA 1US5A 3OO8A 3MJNA 1B1XA 3PV0E 2VGQA 3KJ7A 4QRZA 3N5LA 1IXHA 1MY2A 3T9UA 2REGA 1PBQA 2UXAA 3QK6A 4FORA 2O1MA 4BLAA 2I58A 3O9PA 2XXQA 5EHMA 3A09A 4ZEDA 5J1DA 3O28A 3KN7A 1R9QA 3G3GA 4OFOA 4PFWA 4U23A 2PBWA 5IKBA 4QFOA 4F39A 1N3XA 2YLNA 4IY6A 1DOTA 4U4XA 4OFLA 4FJPA 2HAUA 1B3FA 5JK4A 3RT8A 1LGBC 1AL3A 2ONKE 3BKIB 4DXUA 1B3EA 3FXUA 2QRYA 3KFMA 3TTNA 3OO6A 5AA3A 2BJJX 2DVCA 4RNSA 3QYTA 2H9BA 3VFJA 1JNFA 1QW0A 3H6VA 3RY3A 3ZKLA 2H4IA 4GXSB 1P1WA 3ECRA 2ONRA 3LBSA 3TCFA 2XD3A 3MQ9A 1ZU0A 5I57B 3OO9A 3U8QA 1OVBA 2NOOA 3KSJA 4PE5B 4XKRA 4F19A 1JW4A 3CVGA 3R26A 1J1NA 1N76A 3JYRA 1UTBB 4IO5A 4XKPA 1Y4CA 3IB2A 3RTFB 1A8FA 1BKAA 2B3FA 1JEUA 1OLCA 1S7YA 2X7QA 4YB5A 1NL5A 2XXVA 4NE4A 4ZEIA 3SDFA 1B7UA 2OCUA 3FD3A 4QF9A 5KCJA 2D5WA 1MY1A 3K02A 5I59B 1M5FA 2V25A 3SEYA 3W15C 5L8DA 3Q25A 1YAEA 1N7WA 1Y4TA 2V3TA 2ZNSA 2NWJA 1Y1MA 3MBPA 4Q8RA 4IO4A 4YAHX 3MVXA 5H8QB 3THIA 3VE1B 1IXCA 4HS7A 4YKJA 3O29A 5H8SA 4FECA 2DWHA 2AL4A 2FYIA 1SI1A 4R9FA 1HSJA 3JV9A 1P99A 1LCTA 2REJA 3OMBA 4KD5A 1FTOA 1MDQA 2YPNA 4LVQA 2O1LA 4NTLA 4RPNA 4XXUA 4U1OA 2XXYA 3USDA 2D3IA 1GR2A 5DTBA 1SYHA 2KLFA 4R6YA 1TT1A 5ITPA 1PC3A 3EF7A 5H8HB 2GHAA 1WVJA 2NUVA 2F34A 4AQ4A 5I2NB 5CC2A 4TOZA 4BDOA 4X48A 1H45A 4C1UA 4ESWA 4H8JA 4R2FA 4AB6A 1IEJA 4KYDA 2OLBA 1USYH 2V93A 3HHGA 3RT6B 3S2VA 2OJTA 3SEXA 3T9HB 1MDP1 1MM7A 1MPBA 2HCAA 3M3KA 4H5GA 2XD2A 2F97A 4YU0A 5K2XA 1PEBA 5B70A 1QULA 4X9TA 5I57A 3W9VA 1F9BA 1NKXA 1POY1 3MVWA 4OYVA 4H6DA 1Z7ME 5H8HA 5CM6A 1ELJA 4NWDA 4K3FA 4ELOA 4H65A 3G3IA 1Y3QA 5CMCA 3RN8A 3EHUA 1UQWA 5I84A 1M5CA 1MQDA 5H8NB 3PU5A 3R6UA 3MAMA 4PFYA 1Q1KA 1OVTA 5CMMA 3LR1A 4RXLA 4F22A 3VXBA 3IOTA 1SW4A 1XS5A 3FXRA 1JEVA 3Q28A 4ZDMA 1MXVA 3IL1B 3KN3A 4TLMB 2QMXA 2Z22A 5IAIA 1UTBA 1D3KA 3SESA 4PP0A 1B2HA 1LFGA 2RINA 2ZNUA 4FEBA 3ZS6A 3C36A 1BP5A 4NF4B 1CE2A 5H8FB 3VDFA 3ILTB 1TFDA 3HHFA 4OTEA 2Z23A 2R71A 4ISUA 4U1ZA 3FJ7A 2F6PA 2RC9A 3SEWA 4H67A 3ODBA 5A5XB 3KOSA 2ESNA 2NXOA 3FVNA 3QXMA 3G3FA 3OD7A 5K2YA 1DPPA 4GWOA 1VR5A 3VVEA 2V3UA 1O63A 5ELVA 2VHAA 1R9LA 2OBGA 1R1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q8JA 5T3JA 2GQ1A 2I4BA 2GH9A 3T9XB 4MF3A 3QIMA 3E78A 4FAJA 4O94A 4MHFA 5J16A 3OO7A 1NH8A 4FATA 5I58A 3MP6A 4MX6A 3RYDA 3SKPA 1FTKA 3S9NC 2V3QA 4R73A 4IO3A 3BFTA 3WAFA 3UORA 4POWA 1YCJA 4X1BA 4KHZE 1NMUA 1PDAA 2OZZA 2Y5KA 4MAGA 1ATGA 5I2NA 1B7ZA 3IORA 2PFYA 4KYEA 2ZZXA 5ICQA 2XXKA 4NN3A 3K2DA 4IO7A 4OA4A 2I4CA 2M8CA 1URGA 4I8CA 4E0WA 3IO6A 1WODA 5I2KB 1FBDA 1SI0A 1N84A 3W9WA 1FBCA 4ELQA 1FTLA 2O7UA 5CMKA 2G29A 4Q30B 2VOZA 3IO4A 5LDZA 5KDTA 1B6HA 3A3UA 5I56A 2GHBA 3PUYE 5IGAA 1QJMA 2R9JA 2QSXA 4G2ZA 3CIJA 2XX9A 3ISPA 4NF6B 3VVFA 3U65A 3LSXA 4FEDA 3V5AA 2QFLA 2I48A 3KBRA 3KEIA 1TXFA 1LBCA 1FBHA 4P9KA 5F24A 4OVJA 1MQIA 4R74A 4P11A 3TTLA 4I3EA 3ZSFA 2F35A 1QKBA 4GQOA 3SERA 1B7HA 1AH5A 1SDXA 1INPA 4ONYA 4ZE8A 2OWSA 1YZ0A 4JVIA 1JP4A 1WDNA 2I0CA 4LQ5A 3MW0A 3CFXA 4WKMA 3K00A 2FIXA 3CG1A 2AL5A 1JETA 1B51A 4MNCA 3FUZA 2QS1A 1TWYA 4LZ5A 5DW8A 2G93A 1A7LA 1KWHA 5I59A 1IXGA 4YICA 1DBZA 4NF8A 3PTYA 5EYGA 2VD3A 4O3AA 1NFTA 1RYOA 4GX4A 2WBBA 1BLFA 3KC0A 2XWIA 2O51A 3VLUA 3WAEA 3H6UA 1XHYA 4XIGQ 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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