1ZS5A

Structure-based evaluation of selective and non-selective small molecules that block hiv-1 tat and pcaf association
Total Genus 28
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
28
sequence length
118
structure length
118
Chain Sequence
GSHMSKEPRDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLIDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Histone acetyltransferase PCAF
publication title Structure-based evaluation of selective nad non-selective small molecules that block hiv-1 tat and pcaf association
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 28
structure length 118
sequence length 118
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2005-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1zs5A00
5ENFA 5CFWA 5A5SA 5F1LA 4X2IA 4Z93A 5FFWA 3I3JA 4LDFA 5DBMA 5CUDA 4WIVA 4BHWA 5D7XA 4F3IA 5KU3A 3U5PA 4QSRA 4E96A 5D3NA 2RNWA 5DX4A 5CQ5A 4A9NA 5L97A 4NQMA 5FE7A 5I1QA 2WP2A 4FLPA 4O75A 5TB6A 5EWCA 5DKDA 4HXOA 4HBXA 4BW2A 4NS5A 4N4FA 5E0RA 5FG5A 4NRAA 4QC1A 5E9VA 4LRGA 5E73A 4O71A 5ENIA 1JM4B 4BJXA 3SVFA 5F5ZA 4HBWA 3S92A 5IBNA 5A85A 4YBTA 5FE3A 4YYMA 4YC9A 2LSPB 3DWYA 4QSPA 4QSVA 5CPEA 1E6IA 4IR4A 3S91A 4PS5A 3IU5A 4PCEA 3U5OA 5FFYA 4NQNA 5H1VA 1F68A 5I29A 4O7BA 5KO4A 4PTBA 3O35A 5EQ1A 4XY9A 5IG6A 3O33A 4CUTA 4NRCA 5EPBA 2RS9B 2F6NA 4O76A 5DW1A 5K29A 4Q0NA 5FBXA 2D82A 5I88A 4TZ8A 5DFCA 4NUCA 4QUUA 4ZW1A 5CQ6A 4QR3A 5E7DA 4O7AA 3NXBA 5LVQA 1N72A 3QZTA 5ENCA 4HXMA 4NUDA 5HQ7A 5IGNA 5L99A 3U5MA 4CUUA 4N4IA 5EICA 4PCIA 5E74A 4HXRA 4UIXA 4WHWA 5FH6A 5HELA 4YYNA 5F62A 4A9HA 5H1TA 5L98A 4YY6A 5LKXA 5DYXA 3P1EA 4UIYA 5F1HA 3D7CA 4LYWA 5G4SA 2YEKA 2E7OA 5I83A 5LJ1A 5LUUA 5JWMA 3MXFA 2DWWA 4J1PA 5I80A 4QY4A 4YYKA 4HXNA 5A5PA 1WUMA 5HM0A 5DLXA 2YQDA 4QSQA 3P1FA 5I7YA 4IORA 3U5JA 3HMHA 3P1DA 2KTBB 2RI7A 5FE1A 4UIZA 4Z6IA 2L84A 4UIUA 5D26A 4Z1SA 5F2PA 5HRXA 1EQFA 4KV4A 5CU8A 2DVRA 4IR5A 4YYHA 4NYWA 4Z6HA 2RNXA 4UIVA 5CQ4A 3U5LA 4OGIA 4NR7A 4TU6A 5H85A 5I40A 4UIWA 5F36A 4O7FA 4NRBA 4QYLA 4TYLA 3AQAA 4CL9A 5E9MA 4CFKA 5D3PA 4O7CA 5DY7A 5A7CA 5FH8A 2DVSA 3MULA 4TT2A 4NR5A 4LZSA 5FE4A 3G0JA 2YW5A 5F25A 4CUSA 3AADA 4QC3A 5BT3A 4A9FA 2R0SA 5C4QA 5EWHA 5D25A 5D3TA 5COIA 2FSAA 4QR5A 4MEQA 4C67A 5E3GA 5EV9A 2OO1A 3UV5A 4YH3A 4ZC9A 5F63A 3IU6A 4C66A 3LXJA 3UV4A 4TTEA 5CQ3A 5KTUA 4QZSA 5J0DA 4O7EA 4CUQA 3RCWA 2GRCA 4UYFB 4HBYA 5HRVA 4QSSA 4HBVA 2YYNA 3SVHA 4A9MA 4LYIA 5ENGA 5CY9A 2NXBA 3LQHA 2DKWA 2L85A 4YYGA 4QB3A 5LKTA 3K2JA 4QSUA 3MB3A 5CUBA 4QEWA 4HXPA 3SVGA 4UYFA 2MJVB 5LKUA 4WHUA 2G4AA 5EPRA 5A5NA 4ZQLA 4J0SA 4MEPA 2OUOA 5AD3A 5FFVA 4IOOA 5AMEA 4A9KA 5IGKA 5ETDA 3HMFA 5II1A 2DVQA 5EU1A 5BT4A 5DKHA 3P5OA 2OSSA 3HMEA 5IGMA 4N3WA 4PKLA 3Q2FA 4LR6A 5CQ8A 5HQ5A 4YABA 5EGUA 4QYDA 4BW4A 4UYDA 3UV2A 5ENHA 4TT4A 3ONIA 5FE5A 5II2A 5DW2A 4YBMA 4O70A 5D3JA 2WP1A 5C85A 5E9IA 5DKCA 5CTLA 4NYXA 5E9YA 3GG3A 4LZRA 4NXJA 4UYHA 4QR4A 5L8TA 5CZGA 1WUGA 4YBSA 5FG6A 5EWDA 5EWWA 5A5OA 4YYIA 5A5QA 4HXKA 4NYVA 2YDWA 5CQ7A 4O77A 5F61A 4MEOA 4MR5A 4ALHA 5C7NA 3O37A 5HJCA 4HXSA 5FE9A 3QZSA 5ENEA 4XYAA 5DYAA 5E9LA 5D3SA 2N9GA 4QEVA 4QNSA 5HEMA 5E3DA 4MR6A 5LJ0A 2I8NA 4AKNA 5HFRA 3DAIA 3Q2EA 4CUPA 4LYSA 2RO1A 4A9IA 4BW1A 5CP5A 5AMFA 3O34A 3QZVA 5A5RA 5HLSA 4XUAA 4A9OA 2R10A 4IOQA 4IR3A 5C89A 4J0RA 2YELA 5FG4A 4TS8A 4YADA 2I7KA 3JVJA 3FKMX 2L5EA 3TLPA 4XUBA 4YY4A 5ACYA 5C8GA 5E9KA 5EA1A 5CQAA 5HFQA 2E7NA 2RFJA 5FE8A 2DVVA 5A81A 5HRWA 5LVRA 5L96A 5LKZA 5CUAA 4O72A 5CQTA 3U5KA 5C87A 4GPJA 3UVXA 5F60A 3G0LA 4YH4A 5AD2A 3UVWA 5JI8A 5CRZA 4XY8A 3UVYA 5DYCA 2F6JA 5EVAA 5HENA 5EK9A 5FB0A 4Z1QA 3LJWA 5D3HA 5DYUA 3UVDA 5CGPA 5IGLA 4OGJA 5EI4A 4Y03A 2H60A 4A9LA 5D3LA 3LQJA 5KHMA 4NR9A 5DFDA 4TU4A 5CS8A 4YYDA 4TZ2A 5I7XA 1ZS5A 5FDZA 4CFLA 4N4GA 4HXLA 4YYJA 5L8UA 5HCLA 4LZ2A 4MR4A 5KTWA 3MUKA 4QBMA 5TCMA 4KCXA 3UW9A 4QSWA 3JVLA 1JSPB 4DONA 4CURA 4RVRA 4UITA 5DLZA 5A82A 5H1UA 3MQMA 3JVMA 4PY6A 4NR8A 4MENA 4BW3A 5FB1A 5EISA 4YATA 4QSTA 4CLBA 3O36A 4YK0A 2YEMA 2R0YA 5CUGA 4J3IA 4O78A 4MR3A 5EWVA 5ETBA 5F3AA 3ZYUA 5FH7A 4QEUA 4O74A 5CUEA 5A83A 4KV1A 5EPSA 4UYGA 5G4RA 5CRMA 5LJ2A 5D24A 5KTXA 2R0VA 3P1CA 4QUTA 5DFBA 3JVKA 4NR6A 5FE6A 4TT6A 5IIDA 1X0JA 4OUFA 4A9JA 5FE0A 5ENBA 3U5NA 4NUEA 5D0CA 4YAXA 2E3KA 4ALGA 5HQ6A 4QSXA 5I86A 2RNYA 5D3RA 4LC2A 5ENJA 4TQNA 5I89A 5EP7A 2DATA 3MB4A 4N4HA 5CUCA 3LQIA 4NR4A 4IR6A 2D9EA 5EM3A 4A9EA 5FE2A 4Q0OA 4UYEA 5BT5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENFA 5CFWA 5A5SA 5F1LA 4X2IA 4Z93A 5FFWA 3I3JA 4LDFA 5DBMA 5CUDA 4WIVA 4BHWA 3D1DA 5D7XA 4F3IA 5KU3A 3U5PA 4QSRA 4E96A 5D3NA 2RNWA 5DX4A 5CQ5A 4A9NA 5L97A 4NQMA 5FE7A 5I1QA 2WP2A 4FLPA 4O75A 5TB6A 5EWCA 5DKDA 3D1BA 4HXOA 4HBXA 4BW2A 4NS5A 4N4FA 5E0RA 5FG5A 4NRAA 4QC1A 5E9VA 4LRGA 5E73A 4O71A 5ENIA 1JM4B 4BJXA 3SVFA 5F5ZA 4HBWA 3S92A 5IBNA 5A85A 4YBTA 5FE3A 4YYMA 4YC9A 2LSPB 3DWYA 4QSPA 4QSVA 5CPEA 1E6IA 4IR4A 3S91A 4PS5A 3IU5A 4PCEA 3U5OA 5FFYA 4NQNA 5H1VA 1F68A 5I29A 4O7BA 5KO4A 4PTBA 3O35A 5EQ1A 4XY9A 5IG6A 3O33A 4CUTA 4NRCA 5EPBA 2RS9B 2F6NA 4O76A 5DW1A 5K29A 4Q0NA 5FBXA 2D82A 5I88A 4TZ8A 5DFCA 4NUCA 4QUUA 4ZW1A 5CQ6A 4QR3A 5E7DA 4O7AA 3NXBA 5LVQA 1N72A 3QZTA 5ENCA 4HXMA 4NUDA 5HQ7A 5IGNA 5L99A 1ZKRA 3U5MA 4CUUA 4N4IA 5EICA 4PCIA 5E74A 4HXRA 4UIXA 4WHWA 5FH6A 5HELA 4YYNA 5F62A 4A9HA 5H1TA 5L98A 4YY6A 5LKXA 5DYXA 3P1EA 4UIYA 5F1HA 3D7CA 2EJNA 4LYWA 5G4SA 2YEKA 2E7OA 5I83A 5LJ1A 5LUUA 5JWMA 3MXFA 2DWWA 4J1PA 5I80A 4QY4A 4YYKA 4HXNA 5A5PA 1WUMA 5HM0A 5DLXA 2YQDA 4AKGA 4QSQA 3P1FA 5I7YA 4IORA 3U5JA 3HMHA 3P1DA 2KTBB 2RI7A 5FE1A 4UIZA 4Z6IA 2L84A 4UIUA 5D26A 4Z1SA 5F2PA 5HRXA 1EQFA 4KV4A 5CU8A 4AKIA 2DVRA 4IR5A 4AI6A 4YYHA 4NYWA 4Z6HA 2RNXA 4UIVA 5CQ4A 3U5LA 4OGIA 4NR7A 4TU6A 5H85A 5I40A 4UIWA 5F36A 4O7FA 4NRBA 4QYLA 4TYLA 3AQAA 4CL9A 5E9MA 4CFKA 5D3PA 4O7CA 5DY7A 5A7CA 5FH8A 2DVSA 3MULA 4TT2A 4NR5A 4LZSA 5FE4A 3G0JA 2YW5A 5F25A 4CUSA 3AADA 4QC3A 5BT3A 4A9FA 2R0SA 5C4QA 5EWHA 5D25A 5D3TA 5COIA 2FSAA 4QR5A 4MEQA 4C67A 5E3GA 5EV9A 2OO1A 3UV5A 4YH3A 4ZC9A 5F63A 3IU6A 4C66A 3LXJA 3UV4A 4TTEA 5CQ3A 5KTUA 4QZSA 5J0DA 4O7EA 4CUQA 3RCWA 2GRCA 4UYFB 4HBYA 5HRVA 4QSSA 4HBVA 2YYNA 3SVHA 4A9MA 4LYIA 5ENGA 5CY9A 2NXBA 1PUOA 3LQHA 3VKHA 2DKWA 2L85A 4YYGA 4QB3A 5LKTA 3K2JA 4QSUA 3MB3A 5CUBA 3ERRA 4QEWA 4HXPA 3SVGA 4AKHA 4UYFA 2MJVB 5LKUA 4WHUA 2G4AA 5EPRA 5A5NA 4ZQLA 4J0SA 4MEPA 2OUOA 5AD3A 5FFVA 4IOOA 5AMEA 4A9KA 5IGKA 5ETDA 3HMFA 5II1A 2DVQA 5EU1A 5BT4A 5DKHA 3P5OA 2OSSA 3HMEA 5IGMA 4N3WA 4PKLA 3Q2FA 4LR6A 5CQ8A 5HQ5A 4YABA 5EGUA 4QYDA 4BW4A 4UYDA 3UV2A 5ENHA 4TT4A 3ONIA 5FE5A 5II2A 5DW2A 4YBMA 4O70A 5D3JA 2WP1A 5C85A 5E9IA 5DKCA 5CTLA 4NYXA 5E9YA 3GG3A 4LZRA 4NXJA 4UYHA 4QR4A 5L8TA 5CZGA 1WUGA 4YBSA 5FG6A 5EWDA 5EWWA 5A5OA 4YYIA 5A5QA 4HXKA 4NYVA 2YDWA 5CQ7A 4O77A 5F61A 4MEOA 4MR5A 4ALHA 5C7NA 3O37A 5HJCA 4HXSA 5FE9A 3QZSA 5ENEA 4XYAA 5DYAA 5E9LA 5D3SA 2N9GA 4QEVA 4QNSA 5HEMA 5E3DA 4MR6A 5LJ0A 2I8NA 4AKNA 5HFRA 3DAIA 3Q2EA 4CUPA 4LYSA 2RO1A 4A9IA 4BW1A 5CP5A 5AMFA 3VKGA 3O34A 3QZVA 5A5RA 5HLSA 4XUAA 4A9OA 2R10A 4IOQA 4IR3A 5C89A 4J0RA 2YELA 5FG4A 4TS8A 4YADA 2I7KA 3JVJA 3FKMX 2L5EA 3TLPA 4XUBA 4YY4A 5ACYA 5C8GA 5E9KA 5EA1A 5CQAA 5HFQA 2E7NA 2RFJA 5FE8A 2DVVA 5A81A 5HRWA 5LVRA 5L96A 5LKZA 5CUAA 4O72A 5CQTA 3U5KA 5C87A 4GPJA 3UVXA 5F60A 3G0LA 4YH4A 5AD2A 3UVWA 5JI8A 5CRZA 4XY8A 3UVYA 5DYCA 2F6JA 5EVAA 5HENA 5EK9A 5FB0A 4Z1QA 3LJWA 5D3HA 5DYUA 3UVDA 5CGPA 5IGLA 4OGJA 5EI4A 4Y03A 2H60A 4A9LA 5D3LA 3LQJA 5KHMA 4NR9A 5DFDA 4TU4A 5CS8A 4YYDA 4TZ2A 5I7XA 1ZS5A 5FDZA 4CFLA 4N4GA 4HXLA 4YYJA 5L8UA 5HCLA 4LZ2A 4MR4A 5KTWA 3MUKA 4QBMA 5TCMA 4KCXA 3UW9A 4QSWA 3JVLA 1JSPB 4DONA 4CURA 4RVRA 4UITA 5DLZA 5A82A 5H1UA 3MQMA 3JVMA 4PY6A 4NR8A 4MENA 4BW3A 5FB1A 5EISA 4YATA 4QSTA 4CLBA 3O36A 4YK0A 2YEMA 2R0YA 5CUGA 4J3IA 4O78A 4MR3A 5EWVA 5ETBA 5F3AA 3ZYUA 5FH7A 4QEUA 4O74A 5CUEA 5A83A 4KV1A 5EPSA 4UYGA 5G4RA 5CRMA 5LJ2A 5D24A 5KTXA 2R0VA 3P1CA 4QUTA 5DFBA 3JVKA 4NR6A 5FE6A 4TT6A 5IIDA 1X0JA 4OUFA 4A9JA 5FE0A 5ENBA 3U5NA 4NUEA 5D0CA 4YAXA 2E3KA 4ALGA 5HQ6A 4QSXA 5I86A 2RNYA 5D3RA 4LC2A 5ENJA 4TQNA 5I89A 5EP7A 2DATA 3MB4A 4N4HA 5CUCA 3LQIA 4NR4A 4IR6A 2D9EA 5EM3A 4A9EA 5FE2A 4Q0OA 4UYEA 5BT5A
chains in the Genus database with same CATH topology
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