1ZURA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (v131r1f)
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAACNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Crystal structure of spin labeled T4 Lysozyme (V131R1F)
rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1zurA00
3DN8A 1L34A 1CV3A 1KW7A 1L44A 1L99A 4AQNA 1L51A 1LYFA 152LA 1L32A 1LYHA 3DN2A 4W54A 1G0MA 130LA 1L52A 140LA 1C61A 4DAJA 1CU5A 1OWZA 139LA 127LA 3HT7A 3DMVA 141LA 2B6WA 2Z6BA 3HUAA 2OE9X 1L23A 3C81A 3HDEA 3L64A 1L76A 4W55A 2B6XA 3DN6A 1DYCA 201LA 1SX2A 1L85A 1LYEA 1LI6A 1L15A 251LA 2O7AA 246LA 1L72A 112LA 1L02A 3C7YA 1L10A 1C6IA 145LA 1L53A 1OVJA 103LA 170LA 1PQMA 160LA 3OE8A 3PBLA 1CX7A 5I14A 4PK0A 3HH4A 3SB8A 231LA 1L74A 247LA 253LA 1L75A 114LA 123LA 150LA 1C6EA 1QT4A 3G3XA 2A4TA 1QS9A 1L27A 4DJHA 1G0QA 1L0JA 1L45A 2RB2X 1L57A 1SSYA 2RB1X 1T6HA 1XJTA 1SWZA 4W56A 126LA 166LA 1C6MA 1P37A 1L55A 1L03A 2RB0X 1OVHA 4W59A 125LA 1L33A 237LA 1D2YA 196LA 1T8AA 1L07A 3SB9A 1L68A 1LWGA 3CDVA 1G07A 1ZYTA 1EPYA 1G1VA 1QUDA 1ZURA 3HUQA 1L86A 148LE 1D2WA 261LA 4W53A 1L41A 1L62A 1L59A 4ARMA 1DYAA 191LA 224LA 2F2QA 1L05A 2RBQA 1C6PA 1L90A 3LZMA 107LA 175LA 158LA 2F47A 1PQKA 4I7PA 149LA 3GULA 1KY0A 1L00A 1DYEA 1KNIA 1L96A 1CV6A 3HTFA 1NHBA 1L36A 3HDFA 147LA 1L19A 1SWYA 1D3MA 2B6YA 1L01A 205LA 3OE6A 1C69A 3F9LA 1C67A 1L42A 1L88A 1I6SA 180LA 1KW5A 226LA 221LA 1C6FA 122LA 2OTYX 209LA 7LZMA 1C6DA 228LA 3GUKA 3L2XA 3C8QA 1L12A 3SB5A 4EPIA 3HTDA 1L04A 2HUMA 1LPYA 2OU8A 1QUOA 1L48A 1PQDA 4DKLA 1QUHA 1C6HA 1L43A 157LA 3G3VA 214LA 1QTCA 110LA 1L18A 2Q9DA 1G0PA 1L58A 2Q9EA 1C62A 242LA 259LA 2B7XA 182LA 118LA 1KY1A 131LA 235LA 1CX6A 161LA 1L81A 192LA 1L38A 1P64A 1L94A 3GUNA 3DKEX 128LA 4ARQB 2OU0X 216LA 4LDOA 1G0GA 4PJZA 195LA 3OE9A 1XEPA 240LA 243LA 3JR6A 176LA 2L78A 218LA 1L93A 236LA 4EKPA 3HT9A 162LA 1QTBA 3CDTA 2B6ZA 4ARLA 4EPFA 115LA 1QT7A 1B6IA 1L0KA 223LA 188LA 1G1WA 151LA 2RBOA 2B70A 2RBPA 1P6YA 3NY9A 137LA 3EMLA 3C8RA 3D4SA 2B75A 1L89A 143LA 4I7KA 245LA 1L54A 3RZEA 1G0JA 1KS3A 260LA 2QARC 1D3FA 1QT3A 3HTBA 2B72A 4I7TA 1C6GA 198LA 4LZMA 3GUMA 4K5YA 1L28A 1L21A 3RUNA 1L56A 1P56A 200LA 3OE0A 1L30A 3K2RA 1QT8A 177LA 3V2YA 3DN3A 1D3JA 1C66A 2RBSA 2O4WA 164LA 1SX7A 1L22A 1LI3A 3NYAA 4W52A 113LA 4I7MA 3NY8A 178LA 2OE7X 2LCBA 2RAZX 3SB6A 3C7ZA 2NTHA 1OV7A 1L91A 3CDRA 4EXMA 3DMXA 3HU8A 1CV1A 2ANXA 146LA 4I7QA 1L31A 1LYJA 1P36A 1L49A 3C82A 1C6JA 219LA 1CUPA 190LA 4EJ4A 159LA 1P2LA 230LA 102LA 1QTHA 210LA 1CU0A 1L79A 220LA 2OEAX 234LA 1P7SA 3HU9A 144LA 1QTZA 1XJUA 1P3NA 3SBAA 169LA 1PQOA 3ODUA 1T8FA 1C6LA 5LZMA 1L24A 4E97A 1L37A 3DMZA 4IAPA 4YX7C 1WTHA 2OTZX 109LA 1LW9A 3C8SA 4W57A 1P2RA 184LA 1JTMA 1LYDA 2IGCA 2RH1A 4YXAC 1D3NA 1C6BA 1L50A 212LA 255LA 1OWYA 4LDEA 1C6KA 4W51A 173LA 3HTGA 111LA 1C65A 1CV4A 1QS5A 1CV5A 1CUQA 1DYBA 1JTNA 1CU3A 1PQIA 2ANVA 2RBRA 1QSQA 167LA 211LA 165LA 248LA 163LA 3GUPA 104LA 129LA 1L95A 3HT8A 3SBBC 1OVKA 1CU6A 1L40A 174LA 120LA 1L20A 3CDQA 1L47A 199LA 250LA 1D9WA 4EKRA 3F8VA 256LA 1CV0A 3C80A 1LGUA 3HH6A 4YXCA 1LWKA 2LC9A 1L06A 189LA 1QUGA 254LA 2LZMA 238LA 1DYDA 206LA 1L39A 3GUOA 4ARQA 4GRVA 1L69A 4LDLA 1L71A 2HUKA 3GUIA 1G0KA 1L64A 1L84A 1C6QA 1L87A 227LA 1LGWA 1C63A 3HT6A 1C6TA 1L09A 1L77A 2B6TA 172LA 3DN1A 1L97A 1DYGA 1DYFA 3SB7A 3HH3A 3C83A 222LA 1G0LA 258LA 4I7OA 156LA 3QAKA 3FADA 1L80A 168LA 217LA 3DN0A 4I7JA 138LA 3HH5A 4EKQA 4S0WA 155LA 1L35A 1ZWNA 1L63A 239LA 4ZPUA 3G3WA 1L92A 1L26A 1TLAA 4ARMB 4ARJA 3SN6R 1C68A 1QTVA 225LA 1L67A 1L73A 213LA 3V2WA 4I7NA 4I7RA 187LA 185LA 3CDOA 1L60A 4ARPA 3GUJA 1T8GA 3DN4A 1L13A 1C6NA 1L82A 1C64A 1LGXA 1L25A 1LI2A 1PQJA 1C6CA 1CVKA 252LA 1LYIA 1C6AA 2RAYX 1G06A 2B74A 4GBRB 4I7SA 233LA 2OE4X 1CTWA 4OO9A 1L17A 1L14A 1QT6A 119LA 108LA 1LLHA 2CUUA 1T97A 1L65A 1P46A 181LA 3PDSA 3FI5A 2F32A 1QTDA 1CU2A 2NTGA 4EKSA 3FA0A 2QB0B 1L11A 1QT5A 186LA 1L46A 1L08A 257LA 1JQUA 249LA 1L70A 1L61A 1C60A 4W58A 1LYGA 4I7LA 3UONA 197LA 1L66A 2RBNA 3HWLA 2OU9A 1L98A 2B73A 6LZMA 2O79A 1L29A 1OYUA 262LA 1L83A 142LA 1SSWA 215LA 244LA 3DNAA 3HUKA 1K28A 183LA 1QSBA 1OV5A 241LA 2HULA 3C7WA 3VW7A 1L16A 232LA 171LA 229LA 1P5CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OWCA 4N0JA 1L34A 4GLVA 4AQNA 4CFOA 4FDYA 130LA 2ZILA 1XEJA 3CSZA 3HT7A 5KKJA 3DMVA 141LA 5KXKA 1RCMA 1IY3A 3HUAA 2OE9X 2B6XA 3DN6A 5LAGA 1GBZA 1SX2A 1DI5A 1LKSA 3D3DA 5E4PA 4KT3A 1NBYC 2O7AA 1IWYA 1LJIA 5J7CA 1GAZA 2GV0A 3WUNA 1OVJA 1LSPA 4NHTA 1PQMA 1DQJC 5LYMA 1CX7A 4PK0A 1B5UA 253LA 4WL6A 2BQHA 3WUMA 3LYZA 4DJHA 1G0QA 4DQ5A 4NHSA 166LA 4C5FA 4DWXA 1DPXA 1HEMA 1PS5A 1P37A 1L55A 1OUJA 1JKBA 1OVHA 3A92A 4W59A 1LZ9A 125LA 1GBSA 1DPWA 1JEFA 237LA 4WO6A 1L07A 3CDVA 1G1VA 1OUIA 1QUDA 3HUQA 1L86A 1D2WA 1KXYA 1WQOA 3LHMA 1L41A 5APCA 2N5ZA 4ARMA 1DYAA 4LGKA 4LT2A 1GF3A 4NGYA 1C6PA 1HSXA 1L90A 158LA 2F47A 3A67Y 1KIPC 4I7PA 149LA 3AZ4A 4NSGA 5IHGA 1KY0A 1DYEA 1KNIA 1L96A 5F81A 1GF6A 1LJKA 3HDFA 1ZMYL 4UWUA 205LA 4W96A 1CKCA 1UACY 1L88A 5FSTA 4ZEEA 3D9AC 3BKHA 1C6DA 228LA 3GUKA 3SB5A 1L04A 4HTNA 1UIEA 1L48A 3IJVA 1NWGA 1PQDA 1EQ4A 4DKLA 4ZFPA 3CT1A 1YAOA 1QTCA 1RE2A 1G0PA 1L58A 1O23A 3HFMY 182LA 1KY1A 235LA 1CX6A 4CGEA 1L81A 1P64A 2Z38A 3DKEX 4DD0A 1JIYA 1C10A 1IVMA 4GN3A 3CT0A 3N9EA 3ATOA 218LA 1L93A 2EQLA 3EBAB 115LA 2CDSA 3AB6A 1G1WA 2XBRA 2B70A 1BGIA 2ZQ4A 143LA 1F0WA 4NFVA 1L54A 4NEBA 1HELA 135LA 1LZYA 1JTOL 1IWWA 4BAFA 1LZEA 2B72A 4I7TA 2W1LA 4CFPA 5D5FA 1REZA 2LYMA 5LVKA 3K2RA 1D3JA 1NMMA 1YILA 2O4WA 1SX7A 4ETDA 1L22A 4W52A 2G4NA 2H9JA 3NY8A 2OE7X 1GFEA 4PRUA 1GB8A 4H9EA 4J0LA 2FBBA 3AJNA 3SB6A 5LAFA 1OV7A 4EXMA 1JWRA 1XGTC 1HSWA 1WQMA 2LZ2A 1CV1A 146LA 1L31A 1LYJA 3M3UA 190LA 2MEDA 159LA 4EJ4A 4NG8A 4LFXA 2BQOA 3F6ZA 3AYQA 234LA 1P7SA 144LA 4XJGA 1B7LA 3SBAA 1PQOA 1C6LA 2YBJA 2YSSC 4WL7A 2BQKA 1GEZA 3DMZA 3QE8A 3WU9A 4YX7C 3SP3A 3CSRA 2MEBA 1QDTA 1JTMA 1LYDA 2BQNA 4YXAC 1LHHA 1JTTL 1C6KA 173LA 1LMAA 1J1OY 9LYZA 1QS5A 4H8YA 2DQHY 1QSWA 1RJCB 1PQIA 4NGJA 1JPOA 2ANVA 2RBRA 1GFAA 1LSYA 3A34A 1QSQA 2F30A 2MEGA 1WVVA 4NHPA 4M4OA 2HEFA 1CU6A 174LA 1GDWA 4H91A 3TXGA 3CDQA 4YOPA 1HENA 4N8ZA 250LA 132LA 4EKRA 2VB1A 3F8VA 4H90A 1CV0A 1LWKA 2Z12A 254LA 4HTQA 1DYDA 4ARQA 3GUOA 1SLYA 1UIBA 2FYCA 2XBSA 1LSNA 1L84A 3AZ6A 4P2EA 1B5WA 3HT6A 3AZ5A 5I4YA 4TSBA 1UBZA 4UWVA 1AKIA 1DYGA 2NWDX 1QSAA 4Z98A 4KL7A 5I54A 3SB7A 4LYMA 1YAQA 1YKZX 4N5RA 156LA 5LA5A 1L80A 168LA 1INUA 3E3DA 4S0WA 1FKVA 1IP1A 1QTEA 1L63A 1OUDA 1LZBA 1EQ5A 1JKDA 4KXIA 2BQDA 4ZPUA 1GF4A 1L92A 4ARMB 4HJYA 3B0OA 2BQAA 1L73A 1QIOA 213LA 4I7NA 3K3TA 5LIOA 3CDOA 1IOQA 5FEKA 4ARPA 1T8GA 1L13A 1BQLY 3HBHA 1C43A 1OQMA 1LYIA 2RAYX 4I7SA 1GBWA 1WTNA 3ATNA 1CTWA 4OO9A 1L17A 4HV2A 1QT6A 4XN6A 1CJ6A 4DDCA 4LYBA 108LA 4II8A 1GFHA 3ZVQA 1REXA 3W6DA 1WVUA 1LZTA 1TBYA 1IR9A 4XJFA 1CU2A 3WXTA 4EKSA 1ALCA 1B5ZA 186LA 1L46A 1FLQA 1D0LA 2RBNA 4QGZA 4HPIA 1L29A 4G4CA 142LA 1UIHA 2FBDA 4WLXA 4ANRA 4M6DA 241LA 1YAMA 4AXTA 4XJDA 1MLCE 1L99A 1OP9B 1L32A 1LYHA 3DN2A 3QY4A 1CJ7A 2H5ZA 3A6CY 194LA 139LA 1LJ3A 2XTHA 1GDXA 1L76A 4PPOA 4I8SA 1DYCA 3WU7A 1L85A 4HSFA 3QNGA 251LA 1L72A 1IR8A 4ETEA 112LA 4NSHA 4WO9A 4DDAA 1L53A 103LA 170LA 160LA 4G4BA 3PBLA 4OWEA 1JUGA 1L74A 247LA 1GXV2 1C6EA 3T6UA 3W6CA 1QS9A 5LVIA 1B5XA 1L45A 1L57A 1SSYA 1XJTA 1LZGA 1C6MA 2RB0X 1BWHA 4QY9A 4TX7A 196LA 4ET8A 1L68A 1LWGA 2F4GA 4H9AA 1LZ8A 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2OEAX 3HU9A 5F9UA 1P3NA 1VAUA 1T8FA 1L37A 2DQDY 4IAPA 1HEOA 3WVXA 1J1XY 3C8SA 1LJNA 1P2RA 5LVGA 3RT5X 2RH1A 1E8LA 3AGHA 111LA 1C65A 1B7MA 4ET9A 1CU3A 2BQJA 1VDQA 211LA 248LA 3GUPA 1L95A 2HEDA 5E9RA 1OVKA 1GE4A 120LA 1OUGA 1QDRA 2CWIA 4GCBA 1D9WA 3G3AB 1LSMA 256LA 3C80A 4YXCA 1GF0A 4TTDA 1CNSA 1LYSA 2LC9A 4PJ2C 1QUGA 238LA 206LA 4TUNA 4BAPA 1YKYX 1L69A 3A3QA 5HMVA 3GUIA 3WPJA 1C45A 3CQLA 3A96A 227LA 1IP4A 1IIZA 1FKQA 1L09A 3ZEKA 5DM9A 2B6TA 3DN1A 1L97A 4GCCA 3B0IA 5C6IA 4NHIA 3P65A 4NWEA 4D9ZA 3HH3A 222LA 1G0LA 1PZYA 258LA 4H8ZA 4EOFA 1JSEA 1CJ8A 217LA 4I7JA 3HH5A 3CB7A 1QTKA 155LA 1L35A 1ZWNA 3WW5A 239LA 3A95A 4ARJA 1C68A 1QTVA 1GB6A 225LA 1HNLA 4XJHA 3V2WA 1BHZA 4I7RA 1C6NA 1LGXA 1HMKA 1LI2A 2C8OA 1PQJA 1CVKA 1C6AA 2Q0MX 1G06A 2B74A 1C7PA 4RDSA 1RFPA 119LA 1LLHA 1T97A 1LSBA 1P46A 181LA 1GE2A 4OW1A 1JTPL 3W3EA 2F32A 2NTGA 5C6JA 2D4JA 3FA0A 4AGAA 1L08A 4B49A 2I6ZA 249LA 1C60A 1LYGA 1GB0A 4I7LA 197LA 1L66A 1L98A 4B4EA 2HU1A 262LA 1SSWA 215LA 244LA 1IR7A 3DNAA 1K28A 1HERA 2MECA 1B2KA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4OWC A;  4N0J A;  1L34 A;  4GLV A;  4AQN A;  4CFO A;  4FDY A;  130L A;  2ZIL A;  1XEJ A;  3CSZ A;  3HT7 A;  5KKJ A;  3DMV A;  141L A;  5KXK A;  1RCM A;  1IY3 A;  3HUA A;  2OE9 X;  2B6X A;  3DN6 A;  5LAG A;  1GBZ A;  1SX2 A;  1DI5 A;  1LKS A;  3D3D A;  5E4P A;  4KT3 A;  1NBY C;  2O7A A;  1IWY A;  1LJI A;  5J7C A;  1GAZ A;  2GV0 A;  3WUN A;  1OVJ A;  1LSP A;  4NHT A;  1PQM A;  1DQJ C;  5LYM A;  1CX7 A;  4PK0 A;  1B5U A;  253L A;  4WL6 A;  2BQH A;  3WUM A;  3LYZ A;  4DJH A;  1G0Q A;  4DQ5 A;  4NHS A;  166L A;  4C5F A;  4DWX A;  1DPX A;  1HEM A;  1PS5 A;  1P37 A;  1L55 A;  1OUJ A;  1JKB A;  1OVH A;  3A92 A;  4W59 A;  1LZ9 A;  125L A;  1GBS A;  1DPW A;  1JEF A;  237L A;  4WO6 A;  1L07 A;  3CDV A;  1G1V A;  1OUI A;  1QUD A;  3HUQ A;  1L86 A;  1D2W A;  1KXY A;  1WQO A;  3LHM A;  1L41 A;  5APC A;  2N5Z A;  4ARM A;  1DYA A;  4LGK A;  4LT2 A;  1GF3 A;  4NGY A;  1C6P A;  1HSX A;  1L90 A;  158L A;  2F47 A;  3A67 Y;  1KIP C;  4I7P A;  149L A;  3AZ4 A;  4NSG A;  5IHG A;  1KY0 A;  1DYE A;  1KNI A;  1L96 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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