The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
ENKVLYAYVQKDDDEITITPGDKISLVARDTGSGWTKINNDTTGETGLVPTTYIRI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| molecule tags |
Unknown function
|
| molecule keywords |
BZZ1 protein
|
| total genus |
13
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UTI A; 1VYV A; 4HVW A; 3VRZ A; 1SHF A; 2NUZ A; 1K76 A; 1RLP C; 4J9C A; 1SSH A; 5GJV B; 3EG0 A; 4RTX A; 4F17 A; 2C0O A; 2F2X A; 5FWB A; 1UHC A; 1SEM A; 2DVJ A; 1K9A A; 2CT3 A; 2CUD A; 2DA9 A; 5FWC A; 3RBB B; 2AKK A; 1KIK A; 2ED0 A; 1PRM C; 4RTU A; 5I22 A; 2KT8 A; 2LJ0 A; 3KFV A; 2DNU A; 4DEY A; 2EGA A; 2HEQ A; 2K9G A; 2EKH A; 1U06 A; 3NHN A; 1T3S A; 1H92 A; 1AWO A; 1NYF A; 2LMJ A; 2SRC A; 3ULR B; 1UEC A; 1WXU A; 4D8K A; 2RN8 A; 2CSQ A; 2JS0 A; 2FG0 A; 5GJW B; 2RQR A; 3PVL A; 4OMQ A; 1VYT A; 2PTK A; 2RQV A; 4JZ4 A; 2EGC A; 2J05 A; 1AOJ A; 2J7I A; 2A08 A; 4JJB A; 5FW9 A; 3VS4 A; 1I1J A; 1VA7 A; 4J9B A; 1GFC A; 1UUE A; 1Z9Z A; 2LX7 A; 4AG2 C; 3TVT A; 4OMP A; 3VS0 A; 1GRI A; 1PRL C; 4CC7 A; 1AZG B; 2LCS A; 4FSS A; 1MUZ A; 3NMZ C; 1AEY A; 1QCF A; 1S1N A; 5IXB A; 2O9S A; 1W70 A; 4RTT A; 1AVZ C; 1OEB A; 4CC3 A; 3REB B; 1ZSG A; 2FPE A; 3TSW A; 2EW3 A; 2FRW A; 2H8H A; 1RI9 A; 1X6G A; 2BZY A; 1AWW A; 2GQI A; 1WX6 A; 3I5S A; 1G2B A; 2D8J A; 2G6F X; 1AWX A; 2HCK A; 2QDL A; 4LE9 A; 4HVU A; 1H3H A; 2A28 A; 2CSI A; 3SEM A; 2O88 A; 2RPN A; 1M30 A; 1TUC A; 2KGT A; 2X3W D; 1E6H A; 4R0K A; 1JXM A; 2D8H A; 1ABO A; 1IO6 A; 1K4U S; 2L0A A; 1QKW A; 2YUO A; 2EYY A; 1WYX A; 2A37 A; 2W10 A; 1UG1 A; 2RQT A; 2OAW A; 1W6X A; 2DLP A; 2OI3 A; 1X43 A; 2LQW A; 2JXB A; 1HD3 A; 1OV3 A; 5L23 A; 2EYW A; 2E5K A; 1YP5 A; 1SRM A; 2M0Y A; 3M0R A; 4J9G A; 4RTZ A; 2HBW A; 4AFS C; 1WXB A; 4JPB W; 1JU5 C; 4F14 A; 2AZV A; 2DRK A; 3QWX X; 2ED1 A; 1M8M A; 1GCQ C; 2KYM A; 2OJ2 A; 2KRN A; 4LN2 A; 4LUE A; 1KFZ A; 4F16 A; 2PNI A; 4EIK A; 1CSK A; 1X2Q A; 2C0T A; 2DMO A; 3EHQ A; 1JXO A; 2GBQ A; 1PWT A; 2FPF A; 2K79 A; 2J6F A; 3SHW A; 1TUD A; 1K0X A; 3M0T A; 3GBQ A; 4Z89 A; 3I35 A; 1NM7 A; 1QWE A; 1XOV A; 2KE9 A; 2PZ1 A; 2DBM A; 4RUG A; 2YSQ A; 4Y92 A; 3RNJ A; 1UFF A; 1Y57 A; 2JS2 A; 3PE0 A; 1YCS B; 2JM8 A; 2RF0 A; 3H41 A; 1TG0 A; 3UAT A; 2LZ6 B; 3M0S A; 2K2M A; 1I0C A; 2DL8 A; 2DYB A; 2DE0 X; 1UJ0 A; 2JT4 A; 2BTT A; 2BZ8 A; 2A36 A; 2CH4 W; 3REA B; 2L2P A; 2LQN A; 2C0I A; 3VS6 A; 4J9H A; 4IIM A; 5EC7 A; 2K6D A; 2CDT A; 1HSQ A; 4HXJ A; 1SRL A; 2AK5 A; 2DL5 A; 3VRY A; 1OPK A; 1UGV A; 2YDL A; 4JJD A; 1W1F A; 1ZUU A; 2J06 A; 1GBQ A; 2MOX A; 4CC4 B; 1PKS A; 1NYG A; 4AFU C; 1LCK A; 3THK A; 2RQU A; 3M0U A; 3EG3 A; 4Z88 A; 1CKA A; 5IHI A; 5IXF A; 1SPK A; 1MV3 A; 4DEX A; 5ECA A; 2DL7 A; 1GL5 A; 2LNH B; 3VS3 A; 2KNB B; 3ZL7 C; 4JJC A; 5IHN A; 4J9I A; 3VS1 A; 5IHK A; 2DL4 A; 2D0N A; 2DF6 A; 2KR3 A; 1YWO A; 1NEB A; 2HDA A; 4RTW A; 4OMO A; 2MCN A; 1QLY A; 3NPF A; 4AFQ C; 2F2W A; 1ZLM A; 2EBP A; 2W0Z A; 4ESR A; 2EYZ A; 1AWJ A; 1SHG A; 2DRM A; 2LJ1 A; 1K0S A; 1N5Z A; 1CKB A; 4IIO A; 1NLP C; 1RLQ C; 2LJ3 A; 1UJY A; 2O31 A; 2DL3 A; 2FPD A; 1GBR A; 2EQI A; 1V1C A; 1JO8 A; 2RQW A; 2VWF A; 4KRT A; 4HCK A; 1WDX A; 1YNZ A; 2MIO A; 3TSZ A; 5IH2 A; 2EYX A; 3NGP A; 4OMN A; 2EGE A; 4A63 B; 1NLO C; 2FO0 A; 3U23 A; 2DJQ A; 3I9Q A; 3VS7 A; 1U3O A; 2KXC A; 3A98 A; 2KRS A; 1EFN A; 4E6R A; 2EPD A; 1WI7 A; 3UA7 A; 4X1V A; 2ROL A; 4OML A; 2O9V A; 4HVV A; 3M0P A; 2JM9 A; 2KBT A; 2ROT A; 1Z9Q A; 2GGR A; 1GFD A; 4QT7 A; 1KJW A; 1E7O A; 2YT6 A; 3EHR A; 2YUQ A; 2GNC A; 2SEM A; 2VVK A; 5I11 A; 2KRO A; 1RUW A; 2KEA A; 3VS2 A; 1YN8 A; 3VS5 A; 1T3L A; 2IIM A; 2CUB A; 1X2K A; 1BK2 A; 2KYB A; 2ESW A; 4CC2 A; 3H0I A; 1M3B A; 1BB9 A; 4ZNX A; 1WA7 A; 1ZX6 A; 2K3B A; 1K1Z A; 2JMC A; 2NWM A; 1JEG A; 1GCQ A; 1GCP A; 1NG2 A; 2DIL A; 2V1R A; 1X6B A; 3IQL A; 2KXD A; 4GBQ A; 1A0N B; 1BBZ A; 1NEG A; 1WLP B; 1HJD A; 4LNP A; 1BU1 A; 4K11 A; 1WIE A; 3PVQ A; 2D1X A; 2L3P A; 4AFZ C; 2BZX A; 2YUP A; 4D8D A; 1AD5 A; 4JZ3 A; 1UE9 A; 2L3S A; 1FYN A; 2HSP A; 1G83 A; 1X27 A; 2AKL A; 3R6N A; 1J3T A; 3QWY A; 2LP5 A; 2ABL A; 1FMK A; 3EGU A; 2K7A A; 3EG2 A; 4AG1 C; 2AZS A; 1KSW A; 1QWF A; 4J9F A; 1PHT A; 1X69 A; 2B86 A; 1ZUK A; 1T0J A; 2EVR A; 3M0Q A; 3C0C A; 2CH4 A; 3H0H A; 3H0F A; 2GTO A; 1M3A A; 2ENM A; 1E6G A; 3UF4 A; 1ABQ A; 1YWP A; 3CQT A; 1B07 A; 2I0N A; 2VKN A; 2DM1 A; 1VYU A; 2L3Q A; 2CT4 A; 2KT1 A; 1WXT A; 2RMO A; 2ECZ A; 4GLM A; 2M51 A; 4WCI A; 3UA6 A; 4Z8A A; 2XMF A; 4ORZ A; 2P4R A; 2V1Q A; 3LH5 A; 1MV0 B; 2O2O A; 1AZE A; 1WFW A; 2CRE A; 4LUD A; 4M4Z A; 4J9D A; 1T0H A; 4OMM A; 2FRY A; 2JMA A; 2DX1 A; 1UHF A; 1PKT A; 1PNJ A; 1M3C A; 2X3X D; 1H8K A; 1M27 C; 2JTE A; 1I07 A; 1QKX A; 1JQQ A; 1Y0M A; 2DBK A; 4RTY A; 1ZUY A; 3FJ5 A; 4RTV A; 2GTJ A; 1UDL A; 4J9E A; 2J6K A; 2RNA A; 5HCK A; 2J6O A; 3JV3 A; 1ZBJ A; 1OOT A; 3EG1 A; 2KRM A; 2FEI A; 3O5Z A; 2YUN A; 3I5R A; 2F2V A; 2JW4 A; 1U5S A; 1ARK A; 1B3Q A; 1OPL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2RJF A; 5GMK e; 1VYV A; 4M78 C; 1SHF A; 2NUZ A; 4LDU A; 1KHC A; 2EFI A; 4J9C A; 2ZPG B; 4M7D G; 2EJG A; 2MWP A; 1WHH A; 4F7U A; 2C0O A; 4FSX A; 4VUB A; 3GNF B; 5FWB A; 1UHC A; 2DXC A; 5LJ3 f; 3D7S B; 1PD1 A; 2DIG A; 1BYM A; 3QG1 A; 2OTL A; 4MMK A; 1KIK A; 1VQ4 A; 1X75 C; 1YHQ Q; 5I22 A; 2KT8 A; 1ZA2 B; 2DNU A; 2EGA A; 2LDM A; 2IPO B; 4C0G A; 2EKH A; 3CBO A; 1H92 A; 7AT1 B; 2O01 E; 3ULR B; 1VQ7 A; 1UEC A; 1WXU A; 3S3M A; 1QVF A; 4M7A C; 2JS0 A; 4KGZ B; 1R0C B; 5CO7 A; 4OMQ A; 3VUB A; 1VQL T; 1IZ6 A; 1ZBX A; 1EIF A; 1Q86 C; 1LPL A; 1AOJ A; 2A08 A; 3RR6 A; 4C5E A; 1VQM Q; 1VA7 A; 1V29 B; 1OUL A; 4KUL A; 5AYF A; 2YWW A; 4CC7 A; 3T9N A; 2LCS A; 2HQX A; 3MEW A; 1UB4 A; 4DOV A; 2RHX A; 2O9S A; 3PFS A; 3CMA T; 5DLQ E; 1KC8 C; 3BW1 A; 1R0B G; 1SG5 A; 2O4X B; 2K3Y A; 3REB B; 4E7L A; 3TSW A; 3OYF A; 3G7Z A; 1ZA1 B; 4C0D C; 2CYZ B; 2P0Q A; 5GAN 6; 1JJ2 S; 2FRW A; 4R55 A; 3LWH A; 4M77 D; 5I21 A; 2FZK B; 3MEA A; 3JB9 G; 2JUF A; 2BZY A; 4Z02 A; 2JZ2 A; 1QVG A; 1WHK A; 2GQI A; 1WX6 A; 4KUI A; 5LJ3 g; 3UT1 A; 3M59 A; 2QDL A; 4LE9 A; 5IN1 A; 3CCV T; 1YIJ T; 2A28 A; 2CSI A; 2M16 A; 5J26 A; 3SEM A; 5FU6 C; 1N8R R; 3M54 A; 3QKJ A; 2HAX A; 1KQ1 A; 1OQK A; 1TUC A; 4PJO C; 1RAB B; 1JJ2 A; 1QVG P; 1JXM A; 1JBM A; 2G3R A; 2GQV A; 2EYY A; 2NUT B; 2A37 A; 3OSV A; 4FU6 A; 2RQT A; 2OAW A; 1X43 A; 2JXB A; 1YFN A; 2QTX A; 1OV3 A; 5L23 A; 1SRM A; 3QDR B; 2M0Y A; 2K4Y A; 2RB6 A; 2E65 A; 1NZ9 A; 1WXB A; 2X9H A; 2AZV A; 1XQH A; 3OMC A; 2KYM A; 1WPY A; 5GMK j; 4MDW A; 4ME7 A; 1IB8 A; 5GAO l; 3OYI A; 2LQK A; 3NTI A; 4EIK A; 2NUP A; 3V8J A; 1TUD A; 3M0T A; 1Y07 A; 2KVQ G; 3CC2 A; 2QG9 B; 1Q81 R; 1PSE A; 1XOV A; 4FW1 A; 2E1H A; 1TU0 B; 2YSQ A; 2RI2 A; 1P92 A; 1Y57 A; 1LJO A; 1VQ8 Q; 2D0Q B; 3QYG B; 1R77 A; 2LZ6 B; 1I0C A; 2DL8 A; 2DYB A; 4QQD A; 2CP2 A; 3CC2 Q; 2CH4 W; 3REA B; 5GAN 8; 4J83 A; 3VS6 A; 2EJF A; 4XQ3 A; 1FMV A; 1YCY A; 2ZPH B; 4M7D D; 5CCA A; 2X4X A; 1UGV A; 4M75 B; 4A4F A; 3VUZ A; 3WXM B; 2MOX A; 4CC4 B; 4RCB A; 1VQN Q; 1R8O B; 1Q86 R; 1LCK A; 1JB0 E; 1VQP T; 3M0U A; 1VQ5 A; 3H6Z A; 5IAY A; 1RAI B; 4PNO A; 1SPK A; 3OA6 A; 5ECA A; 2VXF A; 4QQ6 A; 1MND A; 2HL5 C; 2LNH B; 1GL5 A; 3ZL7 C; 1BI1 A; 2XK0 A; 1QVP A; 3KXT A; 2D0N A; 2DF6 A; 2KR3 A; 2P4T A; 1NEB A; 4RG2 A; 3JCM g; 4OMO A; 1B34 B; 4FM4 B; 1VQO T; 3M57 A; 1OU9 A; 5GAO p; 4OP0 A; 4OVA A; 4IUQ A; 3LX7 A; 2QQB A; 2ZGW A; 3QDF A; 2QYZ A; 1CKB A; 5GAO n; 4IIO A; 1BI0 A; 1NLP C; 2EYQ A; 2RK1 A; 1UJY A; 2PQW A; 2OAU A; 2RQW A; 3JCM V; 4KRT A; 1OZ2 A; 3G71 T; 2MIO A; 3TSZ A; 1UGP B; 5IH2 A; 4PJJ A; 3OYN A; 2YLB A; 3VKI A; 4PFZ A; 2EGE A; 5FU7 C; 3VS7 A; 1SSF A; 1U3O A; 3A98 A; 5CVI A; 4JRK A; 4X1V A; 3NTK A; 3MP8 A; 4L6V 5; 4A53 A; 4C8Q B; 5HKC A; 3CCM T; 3BFM A; 3GNG A; 3M5A A; 1Z9Q A; 3A8M B; 3PIO A; 2QXF A; 2QQ9 A; 3V7C A; 4QT7 A; 1KJW A; 3EHR A; 2GNC A; 4OF1 A; 1N6A A; 5I11 A; 4C8Q A; 4R56 A; 3VS2 A; 1YN8 A; 1BCO A; 3OS0 A; 4A4H A; 1M8V A; 2CUB A; 3SWN C; 1X2K A; 1BK2 A; 2KYB A; 3I55 Q; 1M3B A; 1PG5 B; 4ZNX A; 1IRE B; 2PVO B; 1K1Z A; 1EZZ B; 1GCP A; 4X34 A; 4HKE A; 1JRI A; 3J80 E; 4PJL A; 2QQS A; 2V1R A; 1X6B A; 1BI2 A; 1HYO A; 1A0N B; 2FYK A; 2JNG A; 2BKD N; 3HRS A; 1Q86 U; 1MGQ A; 3MP1 A; 4E7K A; 4B9W A; 4N0A C; 4C5G A; 3CXC P; 4JZ3 A; 2JN0 A; 1W2B S; 2GF7 A; 3Q1J A; 1WGS A; 2L3R A; 2DAQ A; 1MMG A; 1FMK A; 4LD6 A; 3I55 A; 2K7A A; 3EG2 A; 3E9G A; 2JTM A; 3JCM J; 1KSW A; 3CCS Q; 3CCE A; 2DVE A; 3DLL A; 2B86 A; 4QVZ A; 3LYI A; 2RJD A; 1SKU B; 3JCM h; 3X25 B; 3CCQ Q; 2GTO A; 2LCL A; 2HQE A; 3CPW A; 2NYS A; 3JCM e; 2RO0 A; 1ABQ A; 3CQT A; 2DTI A; 4IUV A; 5L8R E; 4WTO B; 1Q7Y U; 2KT1 A; 2QEX T; 4WCI A; 4Z8A A; 2BUD A; 2O2O A; 1VUB A; 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4EDU A; 1RI9 A; 3VU3 C; 3I5S A; 3CME T; 2G6F X; 5GAN g; 3CPW S; 2HCK A; 3VJP A; 4DBF A; 1OZ3 A; 3V8L A; 3TCJ A; 4OMF B; 3CCR A; 2O88 A; 1VQ7 Q; 2RPN A; 2M9U A; 2E3I A; 4R0K A; 2D8H A; 1ABO A; 3JRZ A; 4C92 C; 1IO6 A; 2YUO A; 2FVU A; 2EJ9 A; 1MNE A; 3CC4 T; 1UG1 A; 5A0D A; 1HD3 A; 4C92 A; 4D6W A; 3HL8 A; 4OB2 B; 1IXD A; 4RTZ A; 1YI2 T; 4EPC A; 4AFS C; 4BE1 A; 1RAE B; 3PMI A; 4JPB W; 4M75 D; 2DRK A; 1H3Z A; 1C6V X; 1M8M A; 2OTL T; 4RMO A; 1OYX A; 2PUO B; 4LN2 A; 1D0X A; 3FLG A; 5A0G A; 3CD6 A; 2OX7 A; 3CXC A; 5KCO A; 4J7F A; 3HRU A; 1YIT T; 3E1S A; 2DMO A; 3EHQ A; 1UGR B; 2CGH A; 4J6Y A; 5LL6 S; 1QP2 A; 2FPF A; 2DJZ A; 4YTL A; 4A4E A; 4B9X A; 1OU8 A; 4E7Z A; 2ZCF B; 3GBQ A; 3CCR T; 3RMS A; 1QWE A; 2KE9 A; 3URG A; 2DBM A; 4RUG A; 5KYW B; 4BUG A; 4Y92 A; 4PFO A; 4C92 F; 1YJ9 Q; 1TG0 A; 3M0S A; 3CCV A; 2K2M A; 1UJ0 A; 4M78 A; 2JT4 A; 2BTT A; 4IUP A; 4F7U F; 1YJW Q; 5I2S A; 1OI1 A; 1ACM B; 4J6W A; 3WVD B; 4HXJ A; 1SRL A; 1VQ5 T; 1W1F A; 5KYU B; 1W2B P; 5GAM j; 4Q5W A; 3QPH A; 2J06 A; 2XD0 A; 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