The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
b'ENKVLYAYVQKDDDEITITPGDKISLVARDTGSGWTKINNDTTGETGLVPTTYIRI'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BZZ1 protein
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| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
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| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| total genus |
13
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2J7I A; 4Y92 A; 2D8J A; 1H92 A; 3VRZ A; 1H3H A; 1RLQ C; 2CRE A; 1MV3 A; 2O9V A; 2LNH B; 4DEX A; 1YWP A; 2EYZ A; 3ULR B; 4CC2 A; 1YCS B; 1WFW A; 1VYT A; 2DYB A; 4F16 A; 1OOT A; 3M0U A; 2KBT A; 1OPL A; 4DEY A; 4AG2 C; 2RQW A; 3EG0 A; 4CC3 A; 4F17 A; 3IQL A; 1YP5 A; 2SEM A; 1FYN A; 1UHC A; 4F14 A; 1FMK A; 1WXT A; 2OJ2 A; 1K9A A; 3PE0 A; 1PRM C; 2DE0 X; 1B3Q A; 3I35 A; 4A63 B; 4KRT A; 1UTI A; 2DJQ A; 3QWY A; 2KEA A; 1BU1 A; 2K7A A; 2KYB A; 2FEI A; 2J6F A; 4CC4 B; 2EGA A; 1JEG A; 3ZL7 C; 3R6N A; 1AWO A; 1RUW A; 3PVQ A; 4LE9 A; 2X3W D; 2DRK A; 3GBQ A; 5I11 A; 3NHN A; 1T0H A; 1OPK A; 1JXM A; 2V1Q A; 2L3Q A; 4OML A; 2O9S A; 1GL5 A; 2RN8 A; 2GTJ A; 1W6X A; 2EYW A; 2NUZ A; 2FRW A; 3H41 A; 1AEY A; 4D8K A; 1HSQ A; 2EGE A; 2I0N A; 2PNI A; 2EBP A; 4HVV A; 1K4U S; 2E5K A; 1GRI A; 2HEQ A; 4HCK A; 1NLO C; 2JM9 A; 2ESW A; 1JXO A; 3NGP A; 1SHF A; 4HVW A; 5ECA A; 5IHN A; 1Z9Z A; 3EG3 A; 2EYX A; 2JTE A; 3RNJ A; 2QDL A; 2O31 A; 1AWW A; 1AZE A; 3VS3 A; 1NEG A; 3TSW A; 2MOX A; 4AG1 C; 1EFN A; 1M8M A; 1QWE A; 1H8K A; 4OMP A; 4OMO A; 1MUZ A; 2DX1 A; 1BB9 A; 1UE9 A; 4X1V A; 4CC7 A; 1ZUK A; 1JU5 C; 1S1N A; 2IIM A; 2KR3 A; 2CDT A; 2LP5 A; 1UJY A; 2HBW A; 1QKX A; 2P4R A; 1GFC A; 3VS1 A; 1NYF A; 5HCK A; 4AFU C; 5IH2 A; 5IHI A; 2GBQ A; 4LNP A; 1QLY A; 3M0T A; 2EYY A; 2FPF A; 3VS6 A; 1ZUU A; 1E6G A; 4IIM A; 3VS5 A; 2DLP A; 1ZX6 A; 3JV3 A; 1WDX A; 2O2O A; 3SEM A; 2KRN A; 1CKB A; 1T0J A; 2D8H A; 2ROT A; 1WI7 A; 4GLM A; 4JJD A; 1UJ0 A; 1KIK A; 1K76 A; 3M0S A; 1M3B A; 2SRC A; 2W0Z A; 3VS4 A; 3THK A; 2JW4 A; 2YUP A; 1PKS A; 2EQI A; 1ARK A; 4J9D A; 2CH4 A; 2GTO A; 1E7O A; 2AZV A; 1GFD A; 3EHR A; 2JMA A; 3REB B; 1X43 A; 2KT8 A; 2ED0 A; 2ENM A; 2DBM A; 1ABO A; 4EIK A; 3LH5 A; 2KXD A; 1AVZ C; 3M0Q A; 3EGU A; 3H0I A; 2L2P A; 1AOJ A; 2JS2 A; 3CQT A; 2OI3 A; 2J6O A; 4Z89 A; 1ZSG A; 2CT4 A; 2C0T A; 3I5S A; 1RI9 A; 2KXC A; 2HCK A; 1GCQ A; 2VKN A; 5GJV B; 1X6B A; 1NEB A; 1JQQ A; 1WIE A; 1T3S A; 4J9B A; 2DM1 A; 2J06 A; 2JM8 A; 3EG1 A; 1WXB A; 1N5Z A; 3C0C A; 5FWB A; 4JZ3 A; 2MIO A; 2K9G A; 3EHQ A; 1CSK A; 2EPD A; 4K11 A; 2CUD A; 5FWC A; 4J9E A; 1ZBJ A; 2YUN A; 1M3A A; 2DRM A; 4J9G A; 2A36 A; 3UF4 A; 1J3T A; 2DNU A; 2KGT A; 2YUQ A; 3TVT A; 2DVJ A; 2RMO A; 1TUC A; 2F2X A; 1NG2 A; 4RTT A; 4D8D A; 3VS0 A; 1IO6 A; 1NLP C; 1SPK A; 2BZY A; 5GJW B; 1G2B A; 1WYX A; 2LJ0 A; 4J9F A; 2D1X A; 1AWJ A; 5L23 A; 2RNA A; 1UDL A; 3SHW A; 2LCS A; 1PRL C; 2L3P A; 1B07 A; 1KSW A; 2L0A A; 2KRM A; 1UG1 A; 2AKK A; 2LQN A; 2MCN A; 1KJW A; 2D0N A; 4AFS C; 1Y0M A; 4OMQ A; 1YNZ A; 1PHT A; 1W1F A; 2K6D A; 2DL7 A; 1U5S A; 2M51 A; 1WA7 A; 3H0F A; 1K0X A; 2LQW A; 1I07 A; 4LN2 A; 3REA B; 4QT7 A; 3PVL A; 2JMC A; 4ESR A; 3UA6 A; 1M27 C; 4AFZ C; 2LJ3 A; 2RQV A; 1JO8 A; 4E6R A; 1UGV A; 1WXU A; 4R0K A; 5IHK A; 1I0C A; 4OMN A; 2LZ6 B; 2X3X D; 2FO0 A; 2ABL A; 2K3B A; 1PWT A; 1SHG A; 1VA7 A; 1PKT A; 1M30 A; 4IIO A; 4RTV A; 1RLP C; 1YWO A; 4JJC A; 2J6K A; 2J05 A; 5IXF A; 2LX7 A; 2HSP A; 3U23 A; 1HD3 A; 1SEM A; 1WLP B; 2DBK A; 2M0Y A; 2JT4 A; 1OEB A; 1QWF A; 3EG2 A; 3I9Q A; 4M4Z A; 4Z88 A; 1AZG B; 1X6G A; 2EKH A; 2RQR A; 2DA9 A; 4AFQ C; 2BTT A; 3O5Z A; 2KRS A; 1GBR A; 4J9H A; 1ZLM A; 4WCI A; 3VRY A; 2DMO A; 4JZ4 A; 4J9I A; 2DL3 A; 1QKW A; 2FG0 A; 1M3C A; 2KNB B; 2G6F X; 2BZ8 A; 1U3O A; 3VS7 A; 2RQU A; 3RBB B; 1GCQ C; 2V1R A; 1NYG A; 2NWM A; 1Y57 A; 1VYV A; 3KFV A; 4HXJ A; 1UHF A; 1G83 A; 1UUE A; 2YT6 A; 2K2M A; 2YDL A; 2W10 A; 4LUD A; 5IXB A; 2DL4 A; 1TG0 A; 2GQI A; 4Z8A A; 4RTY A; 2ED1 A; 1OV3 A; 3A98 A; 1I1J A; 2KRO A; 1E6H A; 1UFF A; 3TSZ A; 2AK5 A; 2F2W A; 3FJ5 A; 2DL5 A; 2FPD A; 1AWX A; 2KE9 A; 4JJB A; 4J9C A; 2AZS A; 2JS0 A; 1AD5 A; 2C0O A; 2PTK A; 2LJ1 A; 2FRY A; 4ZNX A; 2LMJ A; 2JXB A; 2B86 A; 5EC7 A; 4JPB W; 5FW9 A; 2RQT A; 2A08 A; 1HJD A; 2GGR A; 2EGC A; 4GBQ A; 3VS2 A; 1GBQ A; 1ABQ A; 1X69 A; 1MV0 B; 1A0N B; 2EVR A; 2PZ1 A; 1NM7 A; 1VYU A; 1XOV A; 1YN8 A; 2ECZ A; 2OAW A; 2EW3 A; 4RTZ A; 1X2Q A; 4RTX A; 2CSI A; 5I22 A; 2RPN A; 1SSH A; 4OMM A; 2O88 A; 2DF6 A; 3UAT A; 1BBZ A; 1U06 A; 2KT1 A; 3NMZ C; 2DIL A; 1K1Z A; 2F2V A; 2KYM A; 1Z9Q A; 2FPE A; 3M0P A; 1WX6 A; 2CSQ A; 2YUO A; 1TUD A; 2L3S A; 3NPF A; 1UEC A; 2GNC A; 4RTU A; 1CKA A; 1SRL A; 1QCF A; 1KFZ A; 2RF0 A; 4RUG A; 2C0I A; 1SRM A; 1ZUY A; 1K0S A; 2A37 A; 2CH4 W; 4LUE A; 1X2K A; 2ROL A; 2VVK A; 3UA7 A; 2CT3 A; 4RTW A; 1BK2 A; 3QWX X; 2H8H A; 3H0H A; 4HVU A; 2A28 A; 2AKL A; 1LCK A; 1PNJ A; 2VWF A; 1W70 A; 4FSS A; 2DL8 A; 2K79 A; 1X27 A; 3M0R A; 3I5R A; 2YSQ A; 1GCP A; 1T3L A; 1V1C A; 2HDA A; 2XMF A; 2BZX A; 2CUB A; 4ORZ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2J7I A; 5GMK e; 2LTO A; 2X51 A; 1Y07 A; 2CRE A; 1ZSZ B; 1VQO T; 2LNH B; 4DEX A; 4NL2 A; 4C0D B; 4IUT A; 1B34 A; 4JDS A; 2DAQ A; 1WFW A; 3RES A; 1YJW Q; 2YRD A; 3E1S A; 3ME9 A; 1OOT A; 2KK4 A; 2V26 A; 3OYG A; 2KBT A; 4M7A E; 5KE3 A; 2RQW A; 4CC3 A; 1Y7X A; 2K3Y A; 5J39 A; 2SEM A; 4F7U A; 2QEX Q; 1N8R C; 1UHC A; 1VQ6 A; 3NFC A; 1ZQ1 A; 3CBO A; 3I35 A; 3RMQ A; 4A63 B; 1BU1 A; 4XU0 A; 3G71 T; 2EGA A; 3ZL7 C; 2E3H A; 5A0G A; 1BI3 A; 2MI6 A; 2DRK A; 4PFZ A; 4EMK A; 2XDP A; 3JCM e; 5I11 A; 3CC4 T; 2OTL T; 3JB9 H; 2V1Q A; 3HRS A; 4DBH A; 2L3Q A; 3GIB A; 1KC8 U; 1WHJ A; 3L1A A; 3VYG A; 2CZ0 B; 4C8Q E; 3A1P A; 3CCV T; 2HZY A; 1WHL A; 1WJQ A; 1QVF S; 2RO0 A; 2PNI A; 4F7U E; 4MZP A; 3V8K A; 2GQV A; 3CC2 Q; 2XU8 A; 2CP2 A; 1D1A A; 1N9S A; 5FU7 B; 2JM9 A; 3HSB A; 2ESW A; 4HVW A; 1SHF A; 2XIC A; 2RB6 A; 1Z9Z A; 1ZA2 B; 3PNW C; 2QDL A; 4PL6 A; 1VQ4 A; 1G3W A; 2ZZD A; 1M1K R; 1QWE A; 4OMP A; 1M1F A; 2DX1 A; 1BB9 A; 4X1V A; 1ZUK A; 1JU5 C; 2IIM A; 1G5V A; 3MEU A; 1OU8 A; 1UJY A; 2LP5 A; 2HBW A; 1QKX A; 2RI5 A; 1GFC A; 4M78 B; 1NYF A; 5HCK A; 4AFU C; 5CVI A; 5IH2 A; 4QW2 A; 3UPU A; 2JN0 A; 4RCB A; 5IAY A; 2ATC B; 4PLI A; 2FPF A; 2RHU A; 5CK9 A; 4E7S A; 1VQP A; 2O4X A; 1ZX6 A; 2LCC A; 4N0A C; 2AT1 B; 2RK2 A; 5GAO q; 2HSE B; 2ROT A; 1WI7 A; 3M53 A; 3MHX A; 2JUF A; 4E47 A; 3M58 A; 2XK0 A; 2SRC A; 1M2O A; 3VS4 A; 2YUP A; 2EFI A; 3CCL T; 2EQI A; 2QQB A; 4M78 E; 3CXC P; 1PSF A; 2DIQ A; 2F5T X; 2GTO A; 4J9D A; 1E7O A; 5IN1 A; 4ZN3 A; 1IHW A; 1QP2 A; 5EG2 A; 3EHR A; 2VYT A; 3KBG A; 4C8Q F; 4KBM B; 4A4G A; 4QQD A; 2PVG B; 2RHY A; 4FYX B; 3M0Q A; 4C8Q A; 3EGU A; 2DK3 A; 1RAA B; 2JS2 A; 1MMG A; 2OI3 A; 4Z89 A; 4M7D G; 3CCU Q; 3I5S A; 3SDZ A; 1N8R R; 2LC4 A; 3QDF A; 5GJV B; 1X6B A; 2R58 A; 4QQG A; 4M77 E; 3HTR A; 4RG2 A; 3FRN A; 4KUL A; 2M16 A; 2CP5 A; 2X35 A; 1YJW A; 4J9B A; 2J06 A; 3QII A; 3CC7 Q; 1K73 U; 2M9U A; 3C94 A; 3I55 Q; 4ZGE B; 1N5Z A; 3L2Q A; 3EHQ A; 1VQK Q; 1WHH A; 3CCM A; 4BI3 A; 3G4S T; 4RG8 A; 4E2F B; 4L6V 5; 1VQ4 T; 1VQ7 T; 4PJL A; 2YUN A; 2DRM A; 3RKY A; 1J3T A; 4O6J A; 2KGT A; 1VQ8 Q; 2DVJ A; 4IKF A; 1NPP A; 3EG9 B; 4RTT A; 5GJW B; 1BCO A; 4J6X A; 1UDL A; 2YHT A; 2V8I A; 2LCS A; 1PRL C; 2KRM A; 1KJW A; 2QG9 B; 2E65 A; 4AFS C; 2CP7 A; 4ME7 A; 1Q82 C; 1W1F A; 1U5S A; 1VIE A; 4Z02 A; 1WA7 A; 4M77 D; 4LN2 A; 3JB9 I; 2HQX A; 3EGX B; 3PVL A; 2JMC A; 3C4S A; 3DLM A; 4AFZ C; 1G3T A; 5LJ5 j; 4ZTJ A; 1D0Y A; 4R0K A; 4CI0 C; 3CME T; 1Q81 R; 5CO7 A; 2FO0 A; 4XTU A; 1WJS A; 1SHG A; 3EH2 A; 2QQS A; 1YI2 Q; 1HK9 A; 2VUB A; 4N4I A; 3MP6 A; 1X75 C; 4KGV B; 3CCV A; 2DIG A; 1XQH A; 1FXX A; 3JCM J; 3U23 A; 4B9X A; 1SEM A; 2LVM A; 2HL5 C; 2DBK A; 2QA4 T; 4A53 A; 3I56 A; 1UB4 A; 5DLQ E; 3A8L B; 1QWF A; 4M4Z A; 3LWI A; 4BUG A; 2JTF A; 5I2M A; 5DM7 R; 4AFQ C; 1VQ9 T; 2VXF A; 4TVR A; 1ZLM A; 3C12 A; 4ELZ C; 1KD1 U; 1VQ7 A; 1FMW A; 1RAD B; 3J80 E; 5GMK m; 2QAZ A; 3A8H B; 2EKO A; 4M77 B; 1VIF A; 2KNB B; 3EFO B; 4OP0 A; 3RBB B; 2NWM A; 4MDW A; 2XKO C; 4UC4 A; 4PK4 A; 3CC2 A; 5GAM g; 2IVW A; 4DQ2 A; 3PGG A; 3M59 A; 1UUE A; 1KQS A; 5IXB A; 2KQW A; 5A2Q E; 3OYK A; 2DTI A; 1OX9 A; 2KRO A; 1OZ2 A; 1SKU B; 3TSZ A; 3FJ5 A; 2YXY A; 2KI7 A; 1R77 A; 4M7D F; 4JJB A; 4J9C A; 3FEO A; 2X9H A; 5GMK l; 2E64 A; 2LJ1 A; 2FRY A; 1YJ9 A; 3S3M A; 2JXB A; 2B86 A; 2PQW A; 2DO3 A; 5EC7 A; 5FRN A; 2P0K A; 5FW9 A; 3CCM T; 1GBQ A; 1ACM B; 4N4H A; 1ABQ A; 3JCM X; 1G3S A; 1X69 A; 1A0N B; 3OQ5 A; 2EVR A; 3FJP A; 4QQ6 A; 1YN8 A; 2OAW A; 5GAN 3; 3WVE B; 3VJP A; 5HK0 A; 4OMM A; 2DF6 A; 1BBZ A; 2KT1 A; 1YJ9 Q; 3PFS A; 1X6O A; 3D7S B; 2JNG A; 1KD1 R; 2F2V A; 2YLC A; 1Z9Q A; 3QPH A; 1VQP Q; 2HNI A; 1MMD A; 4BY6 C; 2CSQ A; 1VQ6 T; 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4M7A C; 4C0Z A; 1HSQ A; 4JUV A; 5GAN 4; 4MDX A; 1KC8 C; 4HVV A; 1YI2 T; 2OTL Q; 2P0P A; 2PUO B; 2JVV A; 5KYU A; 5CKH A; 4JRI A; 2RK1 A; 3GNF B; 2ZGW A; 4PKC C; 2HEQ A; 3JB9 F; 5LJ3 d; 5FU6 C; 5IT9 E; 2EWN A; 3RNJ A; 1K8A U; 1M1K C; 2O31 A; 4ZN1 A; 1NEG A; 2FVU A; 5LJ5 d; 3MP1 A; 3CXC S; 3OSV A; 1M8M A; 5GAN h; 1H8K A; 4OMO A; 1OU9 A; 1D3B B; 1UE9 A; 1U1S A; 3DB4 A; 1BI1 A; 1S1N A; 4OVA A; 1JB0 E; 4QKU A; 2ZAE A; 5IHI A; 3CPW P; 3P8H A; 3CC7 A; 4Y91 A; 1YJW T; 4XTZ A; 2EYY A; 4C92 C; 1M90 R; 4JRP A; 3VS6 A; 1E6G A; 3VS5 A; 3JCM f; 1YIT Q; 4LXC A; 3H8Z A; 3JV3 A; 5LJ5 g; 1VOM A; 2QGF B; 3NTK A; 3DB3 A; 4BD3 A; 2CZ7 B; 2E1H A; 1C6V X; 1YJ9 T; 2QQ9 A; 1OI1 A; 4GLM A; 4HCB A; 1Q81 C; 4Y28 E; 1UJ0 A; 1I81 A; 1KIK A; 3X24 B; 2CP6 A; 3M0S A; 4FIB A; 4NL3 A; 1G8X A; 1QVF A; 4OMF B; 3THK A; 1PKS A; 4FYV B; 4J5Y A; 1W2B S; 4HCC A; 2CH4 A; 3HPW A; 4M75 C; 4E7Z A; 1GFD A; 2JMA A; 1K9M R; 2CGH A; 2YRV A; 2ED0 A; 2DBM A; 4F7U G; 1KHC A; 4EIK A; 3PMI A; 2L3R A; 3OYJ A; 3BE3 A; 3H0I A; 2RM4 A; 2CT4 A; 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