The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
|
sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
ENKVLYAYVQKDDDEITITPGDKISLVARDTGSGWTKINNDTTGETGLVPTTYIRI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BZZ1 protein
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Unknown function
|
| total genus |
13
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3VRY A; 1AVZ C; 3RBB B; 2JM8 A; 2YDL A; 3M0R A; 1B3Q A; 4D8D A; 2K2M A; 2C0O A; 2LJ0 A; 2DBM A; 3VS2 A; 1GL5 A; 2RN8 A; 2K79 A; 1GCQ A; 1RLQ C; 1SHG A; 1UFF A; 1W1F A; 2DL3 A; 2EKH A; 2O31 A; 2LJ1 A; 1SSH A; 2LNH B; 2AKK A; 2RPN A; 1X2Q A; 2KR3 A; 1W70 A; 3PVQ A; 4M4Z A; 3KFV A; 1MUZ A; 2O9V A; 3REA B; 4HVU A; 1GRI A; 1FMK A; 2LMJ A; 1ZUK A; 2OAW A; 1M3A A; 2DNU A; 2J7I A; 1V1C A; 5FWC A; 4HVV A; 2BZX A; 2VVK A; 1PKS A; 3I35 A; 1ZUY A; 2K6D A; 1QWF A; 1ARK A; 4F17 A; 1UHC A; 2DX1 A; 1X27 A; 3REB B; 2GBQ A; 4RTW A; 3IQL A; 2P4R A; 4ZNX A; 1TG0 A; 2EQI A; 5FW9 A; 1SRM A; 1YCS B; 2A28 A; 3VS6 A; 1HD3 A; 4OML A; 1I1J A; 1YP5 A; 2EYW A; 3EG0 A; 4ORZ A; 4AG1 C; 1XOV A; 1PHT A; 5I22 A; 1N5Z A; 2SEM A; 4IIO A; 2YT6 A; 2OI3 A; 1E6H A; 1NYF A; 1HJD A; 2GGR A; 2DL8 A; 2ROL A; 1UJY A; 2A37 A; 2EYX A; 2K3B A; 2A08 A; 1WXT A; 2D8H A; 1GFC A; 3R6N A; 1SHF A; 1SRL A; 1UE9 A; 2SRC A; 1Z9Q A; 2LJ3 A; 3LH5 A; 2GTO A; 4JJB A; 3EG2 A; 3EG3 A; 1UTI A; 2V1Q A; 3H41 A; 3NMZ C; 2ABL A; 2L0A A; 3I9Q A; 1WFW A; 1OV3 A; 2A36 A; 4CC2 A; 3NGP A; 1VYT A; 5IXB A; 2FRY A; 5HCK A; 2KT8 A; 2J05 A; 1U06 A; 2RQR A; 3QWY A; 2DVJ A; 2ESW A; 2AZS A; 2HSP A; 2DYB A; 2F2V A; 1I0C A; 4E6R A; 2OJ2 A; 1E7O A; 3VS1 A; 2DBK A; 2KE9 A; 4OMQ A; 1SEM A; 1GCQ C; 2CSI A; 1JXO A; 2EVR A; 1AWJ A; 1M3B A; 3EGU A; 2ED0 A; 4J9C A; 3M0P A; 1JXM A; 2X3W D; 4OMN A; 2HBW A; 1H3H A; 1K9A A; 4HVW A; 2O2O A; 1W6X A; 3UA6 A; 2DL5 A; 5IXF A; 2EPD A; 2VWF A; 2CH4 A; 1U3O A; 1T3L A; 1OEB A; 1QLY A; 4OMP A; 2FEI A; 2LQN A; 1UEC A; 1Y57 A; 2X3X D; 4CC4 B; 1RUW A; 4F16 A; 4LN2 A; 4LUD A; 2KBT A; 2YUP A; 3H0I A; 2EW3 A; 2JM9 A; 5L23 A; 2KNB B; 2IIM A; 2JW4 A; 1J3T A; 4J9I A; 2BZ8 A; 2PZ1 A; 3JV3 A; 1WXB A; 2L3Q A; 1HSQ A; 4LE9 A; 3VS7 A; 4JZ3 A; 2AKL A; 1CKB A; 2EYZ A; 1GBQ A; 1KJW A; 2AZV A; 1MV3 A; 2L3S A; 3VS4 A; 1H92 A; 4AFZ C; 1GFD A; 1WA7 A; 2I0N A; 4RTY A; 1UGV A; 2MIO A; 1VYU A; 1OPL A; 1H8K A; 2B86 A; 2PTK A; 2DA9 A; 4AFS C; 2DL4 A; 1ZSG A; 1NG2 A; 3VS5 A; 1M8M A; 4J9E A; 2E5K A; 2RQW A; 2QDL A; 2LCS A; 1BB9 A; 4LUE A; 3PVL A; 3UF4 A; 1ZBJ A; 5ECA A; 2RMO A; 1M27 C; 1T0H A; 3NHN A; 2CT3 A; 4Z88 A; 2M0Y A; 1AD5 A; 2KRM A; 1JO8 A; 1X6G A; 2KXC A; 4F14 A; 2O9S A; 2J06 A; 1VA7 A; 1CSK A; 2JMC A; 3ULR B; 2DLP A; 1U5S A; 2KGT A; 1WDX A; 3EHR A; 2M51 A; 4IIM A; 2JTE A; 2DJQ A; 3UAT A; 1EFN A; 5GJV B; 2K7A A; 2GNC A; 1ABQ A; 1NEB A; 3I5S A; 1X2K A; 1AZE A; 1BK2 A; 1JU5 C; 4Z89 A; 3O5Z A; 4Z8A A; 1WXU A; 1PWT A; 2LQW A; 3TSW A; 1TUD A; 1NM7 A; 1M30 A; 2W0Z A; 2FPE A; 1RLP C; 2EGA A; 5IHN A; 1S1N A; 1YWP A; 2O88 A; 1NLP C; 2GQI A; 2ED1 A; 4CC7 A; 4CC3 A; 4RTT A; 2JS0 A; 1AWW A; 1A0N B; 1Z9Z A; 1BBZ A; 3H0H A; 3THK A; 2JXB A; 2D0N A; 3EG1 A; 3VRZ A; 3M0Q A; 1K4U S; 2LX7 A; 2KYM A; 1JEG A; 3A98 A; 3FJ5 A; 3ZL7 C; 2YUO A; 2J6O A; 1AEY A; 3TSZ A; 1AWO A; 4DEX A; 1KFZ A; 2CT4 A; 4RUG A; 2CUD A; 2HCK A; 4FSS A; 1RI9 A; 1CKA A; 4J9G A; 4RTU A; 4EIK A; 1BU1 A; 4GLM A; 4J9B A; 2C0I A; 2YUQ A; 1NLO C; 1WYX A; 1G2B A; 5GJW B; 2KXD A; 2YUN A; 2AK5 A; 1YWO A; 5IHI A; 3U23 A; 2V1R A; 1ZX6 A; 2H8H A; 3NPF A; 2DL7 A; 1I07 A; 4QT7 A; 4RTX A; 1WLP B; 1WIE A; 1UUE A; 1NYG A; 2DIL A; 3RNJ A; 4AG2 C; 1ZUU A; 2KT1 A; 1K76 A; 3CQT A; 2RQT A; 1QKW A; 4Y92 A; 2FO0 A; 1LCK A; 4AFQ C; 4KRT A; 1IO6 A; 1NEG A; 1M3C A; 1UHF A; 2EGE A; 1YN8 A; 4DEY A; 2MOX A; 4J9F A; 1K1Z A; 4K11 A; 2RQV A; 4LNP A; 4OMM A; 3TVT A; 1T0J A; 2VKN A; 2CH4 W; 2CUB A; 4JZ4 A; 3M0T A; 4HXJ A; 3VS3 A; 2D1X A; 2G6F X; 2J6K A; 2C0T A; 3EHQ A; 1YNZ A; 4X1V A; 2FPD A; 1AWX A; 1G83 A; 2KRN A; 4RTV A; 1UG1 A; 1AZG B; 2DRK A; 3QWX X; 2DE0 X; 4HCK A; 1KSW A; 2NUZ A; 1Y0M A; 2XMF A; 1UJ0 A; 1E6G A; 2F2W A; 5IH2 A; 1PNJ A; 2MCN A; 2CDT A; 1PRL C; 4D8K A; 2NWM A; 4RTZ A; 5FWB A; 3VS0 A; 4OMO A; 3SHW A; 2L3P A; 2KRO A; 2RF0 A; 2LP5 A; 1FYN A; 2BTT A; 4ESR A; 2L2P A; 2JT4 A; 1ABO A; 1PRM C; 2RNA A; 2PNI A; 1T3S A; 2DMO A; 2J6F A; 2KRS A; 4JJD A; 1PKT A; 3C0C A; 3M0S A; 3UA7 A; 1MV0 B; 1AOJ A; 1WI7 A; 2DM1 A; 2LZ6 B; 1UDL A; 2RQU A; 1X43 A; 2KYB A; 1B07 A; 2D8J A; 4JPB W; 2ROT A; 2DRM A; 1K0X A; 1KIK A; 2KEA A; 1QWE A; 2CSQ A; 1SPK A; 3I5R A; 1QCF A; 2FG0 A; 5EC7 A; 2EYY A; 2JMA A; 1WX6 A; 4AFU C; 4WCI A; 1VYV A; 2GTJ A; 4R0K A; 1OOT A; 4J9H A; 2K9G A; 1GCP A; 3PE0 A; 3SEM A; 1X69 A; 1QKX A; 5IHK A; 2ECZ A; 3H0F A; 2CRE A; 3M0U A; 4JJC A; 2EGC A; 2EBP A; 1OPK A; 2BZY A; 2F2X A; 2YSQ A; 1GBR A; 2HDA A; 2ENM A; 1ZLM A; 2DF6 A; 1X6B A; 2HEQ A; 1TUC A; 4J9D A; 2FPF A; 4GBQ A; 4A63 B; 5I11 A; 1K0S A; 2W10 A; 2FRW A; 2JS2 A; 3GBQ A; 1JQQ A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3MKD A; 3RBB B; 3BE3 A; 1KC8 U; 2P84 A; 3L2Q A; 4AMC A; 4DBR A; 2LJ0 A; 1YBY A; 4X9D A; 4BAC A; 2DBM A; 1ZSZ A; 4L6V 5; 3CC7 T; 1GCQ A; 2EKH A; 1UFF A; 1W70 A; 1AT1 B; 3VU3 C; 3BY7 A; 2FZG B; 4HVU A; 2DTI A; 3OYD A; 4IUQ A; 1GRI A; 1ZUK A; 4PFP A; 5GAO p; 4C5G A; 1V1C A; 4PJO C; 4HVV A; 5GMK e; 1WQW A; 2OX7 A; 2XG8 D; 1BI3 A; 1ZHI A; 3KBG A; 3REB B; 2GBQ A; 4RTW A; 3IQL A; 4PJO F; 1Q7Y R; 1VQO T; 1K9M C; 3OYB A; 1YCS B; 4E7I A; 3VS6 A; 2CKK A; 4OML A; 3HFN A; 4ORZ A; 3LGL A; 3CCQ A; 3CC2 T; 2G3R A; 2QTV A; 4J6X A; 2YT6 A; 1D09 B; 4KH0 B; 4E7Z A; 2OI3 A; 2GGR A; 2D6F A; 2A37 A; 3UPU A; 3CMA T; 4C8Q C; 2RHI A; 3R6N A; 2YRC A; 1VQL Q; 2SRC A; 2HL5 C; 4O6J A; 3HL8 A; 2GTO A; 1LVK A; 3EG3 A; 2V1Q A; 5HK0 A; 1RAH B; 4C92 E; 4C8Q F; 1WFW A; 3G71 A; 4RCB A; 1KQS P; 5M9O A; 2A36 A; 3NGP A; 4B6M A; 3A8H B; 2DXC A; 3RDV A; 3T9N A; 5IXB A; 2KT8 A; 1MGQ A; 1BIB A; 2VXE A; 1U06 A; 3MEW A; 3QWY A; 1VQ9 T; 5CKB A; 3AT1 B; 2AZS A; 3GPL A; 2DFU A; 2HSP A; 3CC7 A; 3GNG A; 2QEX T; 1I0C A; 1Q82 U; 4J7I A; 3SWN B; 4EMG A; 1E7O A; 4M77 G; 5LJ3 d; 3OYA A; 3V8L A; 1SEM A; 2DK3 A; 4BY6 B; 2CSI A; 4WTO B; 3QDR B; 1JJ2 A; 3CD6 Q; 3QJ6 A; 2ED0 A; 2LCL A; 4J9C A; 2EAY A; 2RA2 A; 1JXM A; 1H3Z A; 4Z02 A; 4OMN A; 3G6E T; 2QAS A; 5GMK h; 4FSX A; 4DOV A; 1G3T A; 1VQO A; 1RAE B; 2EPD A; 1T3L A; 2MI6 A; 1OEB A; 2XKO C; 3CC2 A; 4OGC A; 4OMP A; 3EFO B; 1Y57 A; 4F16 A; 1UEB A; 1SSF A; 2QQA A; 2KBT A; 1N8R R; 2EW3 A; 1MHN A; 5L23 A; 3CC4 A; 5FRM A; 2PZ1 A; 2KMT A; 4C0D B; 2L3Q A; 2KQW A; 1HSQ A; 4II1 A; 1DJ7 B; 3M55 A; 5FU7 B; 3VS7 A; 5C6S A; 3CCV Q; 4XU3 A; 4L5G A; 3EG9 A; 3VS4 A; 1F1B B; 2LT1 A; 4F7U A; 3CCS Q; 2PVO B; 2EQK A; 2K3X A; 2B86 A; 2CP7 A; 2KK4 A; 1KD1 C; 4PJO G; 5GAM d; 3HRS A; 3MCA B; 2E5K A; 2ZCF B; 4M75 A; 3GP8 A; 1VQ6 T; 4J8O A; 2BIV A; 2LQ8 A; 2LCS A; 3UF4 A; 2JTF A; 2EYQ A; 4IUP A; 5KYU A; 3P8H A; 1M27 C; 1T0H A; 2K2V A; 2A3L A; 2CT3 A; 2QEX A; 1RL2 A; 3OMG A; 1PD0 A; 1AD5 A; 1JO8 A; 3E1S A; 3EH1 A; 1VA7 A; 2VYT A; 1U5S A; 5FLX E; 4IIM A; 1HK9 A; 3I55 T; 2DVE A; 4IUT A; 2DJQ A; 4FYY B; 2LRQ A; 2HMA A; 5EG2 A; 2CP6 A; 3UAT A; 2OAU A; 4M7D B; 2M02 A; 3QYH B; 3G6E A; 5GJV B; 5AT1 B; 4C8Q G; 1ABQ A; 1NEB A; 3OYL A; 3EGD B; 1AZE A; 4HCB A; 3QZ9 B; 1RAF B; 2XD0 A; 4XTZ A; 1RAD B; 4Z89 A; 5A0G A; 3M53 A; 1SG5 A; 3CME A; 3CXC P; 3QSU A; 3O8V A; 3TSW A; 3M54 A; 4Q5W A; 2W0Z A; 2Y4Y A; 5IHN A; 4FCY A; 3OSV A; 1YWP A; 1JRI A; 2GQI A; 2CZ1 B; 2ED1 A; 2VUB A; 2QA4 T; 1QVF A; 2IG0 A; 1D1A A; 3H0H A; 2XDB A; 1RAI B; 4PJM A; 5CQX A; 3GF5 A; 1K4U S; 2V8K A; 4KUD K; 1QCN A; 3JB9 F; 1JEG A; 2ZPH B; 3ZBD A; 3A98 A; 3FJ5 A; 3G4S Q; 3E9F A; 3J81 E; 3TSZ A; 2YHT A; 2CT4 A; 1OUL A; 2LC4 A; 1RI9 A; 1VQ6 A; 1JB0 E; 4J9G A; 1YIT T; 4GLM A; 2C0I A; 3X26 B; 1VQ5 A; 3G1J A; 1G2B A; 1VQ4 Q; 4PL6 A; 3CCL T; 5IHI A; 3U23 A; 2V1R A; 3VUZ A; 3M57 A; 5GAO q; 3SWN C; 3SFM A; 4M7A A; 4XTY A; 1R77 A; 1TS9 A; 4JJN K; 1KHC A; 4C0Z A; 5CVI A; 4BY6 C; 3RKW A; 2X9H A; 4FYX B; 1OX9 A; 1Q7Y U; 2EKO A; 1M8V A; 2RQT A; 2HQX A; 3JCM X; 2R57 A; 3PIO A; 4PJO D; 5LJ3 f; 1TWB A; 4JLI A; 1NEG A; 1M1K R; 2E64 A; 2EGE A; 3MET A; 3QZ5 B; 3OYC A; 1I4K 1; 2MOX A; 4FU6 A; 1K1Z A; 4K11 A; 4OMM A; 1VQP T; 3H6Z A; 3ME9 A; 8AT1 B; 2HNI A; 3CCR Q; 2F69 A; 3HKS A; 4LDY A; 3CPW A; 4BE2 A; 1TTH B; 3VS3 A; 3JB9 I; 3HSB A; 4MMK A; 4C0D C; 2C0T A; 3EHQ A; 1YNZ A; 3OS2 A; 1M4Z A; 5FU7 C; 3HRU A; 2FPD A; 1WHM A; 1G3W A; 4A4H A; 4RTV A; 3QWX X; 1ZA2 B; 4C8Q D; 4L59 A; 2NUZ A; 4DBQ A; 2XMF A; 3JAM E; 2F2W A; 4ZGJ B; 2EIF A; 3SD4 A; 1PNJ A; 4M77 B; 2CDT A; 1WZO A; 3DLL A; 4V2S A; 2DD5 A; 1YIT A; 2XU8 A; 4ESR A; 5CKH A; 1VQN Q; 1O75 A; 1PRM C; 1R0B G; 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3EG0 A; 3MP1 A; 5A0L A; 4PJJ A; 1N5Z A; 4IIO A; 1JJ2 P; 5HK3 A; 1E6H A; 3RKX A; 4M78 B; 2NUP B; 2ROL A; 1YIJ Q; 2EYX A; 2K3B A; 3FJP A; 3S3M A; 1ZA1 B; 5LJ5 j; 3CCM A; 2R5A A; 2KDS A; 4M7A E; 1YJW Q; 3NMZ C; 2AHJ B; 3MEV A; 1I5O B; 5HCK A; 1OX8 A; 4C5H A; 3QKJ A; 1S72 Q; 3NTI A; 3X28 B; 4IUR A; 3I56 A; 3CCQ T; 5CAI A; 4NL2 A; 1M1G A; 1U1S A; 2Y4X A; 4M7D G; 2WAC A; 4NL3 A; 1PM3 A; 4OMQ A; 4M77 F; 2IVW A; 1JXO A; 5FU6 C; 2EVR A; 1AWJ A; 2COY A; 4DQ2 A; 4BI3 A; 1NBE B; 4XAX B; 1W2B S; 4FIB A; 4KGV B; 4FL6 A; 2HBW A; 1K9A A; 3G71 T; 3CCS A; 1W4S A; 1M1K U; 5GAN h; 2NUT B; 2CH4 A; 2CP3 A; 2LQK A; 1QLY A; 1QW1 A; 2X3X D; 4M75 C; 3H0I A; 5LJ5 e; 3GNF B; 2NYS A; 2JW4 A; 2ZAE A; 1RAA B; 4DOW A; 4N0A A; 3JV3 A; 3NFC A; 2RM4 A; 4LE9 A; 4PLL A; 5KYY B; 5DLQ E; 5KE3 A; 2FYK A; 1YJ9 Q; 3EH2 A; 1KG1 A; 2L3S A; 3QHS A; 2RK2 A; 3BW1 A; 1H92 A; 4AFZ C; 1UB4 A; 1QP3 A; 1WA7 A; 1UGV A; 2R58 A; 5IAY A; 2MIO A; 1OPL A; 1H8K A; 1M5Q 1; 1M90 C; 4A54 A; 2DXU A; 2DL4 A; 1ZSG A; 1NG2 A; 1I8F A; 3NTK A; 3VYH B; 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