The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
ENKVLYAYVQKDDDEITITPGDKISLVARDTGSGWTKINNDTTGETGLVPTTYIRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Unknown function
|
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| molecule keywords |
BZZ1 protein
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| total genus |
13
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LZ6 B; 1PKT A; 1K0S A; 4JZ3 A; 1VYV A; 2O9V A; 4LUD A; 3JV3 A; 4RTT A; 2GBQ A; 3I9Q A; 1KSW A; 2ROT A; 2J6K A; 4CC3 A; 2H8H A; 1U3O A; 4ZNX A; 2HDA A; 2DVJ A; 2DLP A; 2EYZ A; 2DM1 A; 1AWO A; 1T0J A; 2EQI A; 2KYB A; 3SHW A; 3QWX X; 2DMO A; 2F2X A; 2DJQ A; 5FWB A; 1AOJ A; 4OMQ A; 2FO0 A; 1OOT A; 1GL5 A; 1WYX A; 2DL7 A; 2DIL A; 1V1C A; 4CC4 B; 1M30 A; 4Y92 A; 3M0P A; 1U5S A; 1X6G A; 2KT8 A; 4LUE A; 1M3A A; 2EYY A; 4Z89 A; 2W0Z A; 2FPF A; 3UA7 A; 2O88 A; 3EHQ A; 2L3Q A; 2RQR A; 1JEG A; 2HCK A; 3VS3 A; 2JS2 A; 2BZ8 A; 1FYN A; 2DE0 X; 2EGC A; 2GQI A; 1JXO A; 3VRZ A; 2PNI A; 1M3B A; 3VRY A; 1NEB A; 1KIK A; 5I11 A; 1WI7 A; 4JJD A; 1B3Q A; 1Y0M A; 5IH2 A; 1M8M A; 1UG1 A; 1PKS A; 2K9G A; 2RQV A; 1Z9Q A; 1U06 A; 2VWF A; 2JMA A; 2CH4 W; 1KFZ A; 2LMJ A; 2EYW A; 3TSZ A; 1WIE A; 2KYM A; 2LQW A; 2L3S A; 2BZY A; 1UJ0 A; 1WXU A; 1MUZ A; 1M27 C; 2C0I A; 1YCS B; 2DL4 A; 3M0Q A; 5IXB A; 1MV0 B; 1GCP A; 1WLP B; 3FJ5 A; 2FPD A; 2YT6 A; 2D8H A; 2JS0 A; 3NHN A; 1X27 A; 1PHT A; 5EC7 A; 1AEY A; 2YUN A; 4GLM A; 2LJ0 A; 3GBQ A; 3TSW A; 2NWM A; 1UUE A; 4AFZ C; 2A08 A; 2W10 A; 1K1Z A; 2ROL A; 4OMP A; 1H3H A; 1A0N B; 3RNJ A; 2CUD A; 3M0T A; 5ECA A; 2FRW A; 1AWJ A; 4RUG A; 2LX7 A; 2M0Y A; 4Z8A A; 2C0O A; 2KR3 A; 1ARK A; 1X2Q A; 2EW3 A; 3U23 A; 1HD3 A; 2C0T A; 1HJD A; 3SEM A; 2K3B A; 2J7I A; 2D8J A; 2EGE A; 3H0F A; 2CT3 A; 1T3S A; 1ZSG A; 3CQT A; 1WX6 A; 4J9I A; 1UTI A; 1BK2 A; 2XMF A; 2B86 A; 4AG1 C; 4K11 A; 1RLP C; 2P4R A; 2GNC A; 1WA7 A; 5I22 A; 2LNH B; 2BTT A; 1UGV A; 2KRM A; 2JT4 A; 2AZV A; 4Z88 A; 2CRE A; 2E5K A; 1MV3 A; 2BZX A; 4ORZ A; 1SSH A; 1IO6 A; 3QWY A; 2K79 A; 1I1J A; 4QT7 A; 2KRO A; 4HXJ A; 1WFW A; 4J9G A; 1WDX A; 1PRL C; 4JJC A; 1SHF A; 2DL3 A; 1TUC A; 2LJ3 A; 5IHN A; 4RTZ A; 1JQQ A; 1I07 A; 1S1N A; 2VVK A; 3UAT A; 2V1R A; 1M3C A; 3C0C A; 2GTO A; 2RPN A; 2J05 A; 2SEM A; 2JM8 A; 2VKN A; 2RQU A; 2X3W D; 2G6F X; 4J9F A; 2K2M A; 4CC2 A; 4IIM A; 2SRC A; 2FEI A; 3LH5 A; 4J9B A; 1OEB A; 1WXT A; 2EKH A; 2HBW A; 4EIK A; 1N5Z A; 4E6R A; 2YSQ A; 1LCK A; 1E6H A; 4GBQ A; 4X1V A; 2K6D A; 1YP5 A; 3ZL7 C; 2RN8 A; 2OJ2 A; 2F2V A; 1AZG B; 1SRM A; 2V1Q A; 4J9C A; 2DBK A; 2KRN A; 4ESR A; 1H8K A; 1CKA A; 1G83 A; 1K4U S; 5GJW B; 2MIO A; 4HCK A; 1UEC A; 1UE9 A; 2YDL A; 2RMO A; 4JZ4 A; 4HVW A; 2A37 A; 2CUB A; 2KXC A; 1AWX A; 1QLY A; 1VA7 A; 2FRY A; 1ZX6 A; 1GRI A; 2L2P A; 2F2W A; 3A98 A; 5GJV B; 2LQN A; 2KBT A; 2CH4 A; 4RTU A; 1BB9 A; 4DEX A; 1ABO A; 2ED1 A; 2J06 A; 3TVT A; 3VS5 A; 2KE9 A; 2DL8 A; 1TUD A; 1FMK A; 2QDL A; 3UA6 A; 4OMM A; 2DA9 A; 2PTK A; 1GBQ A; 3EG0 A; 1HSQ A; 3H0I A; 3O5Z A; 1X69 A; 1NYF A; 1XOV A; 1BBZ A; 1RLQ C; 3EGU A; 1BU1 A; 2ABL A; 2RNA A; 2OI3 A; 1NYG A; 1K76 A; 2O9S A; 1UDL A; 1AD5 A; 1JXM A; 1PWT A; 1UHF A; 2L3P A; 1QWF A; 4LE9 A; 2A36 A; 2DYB A; 4HVV A; 1SEM A; 2GGR A; 2DL5 A; 3VS4 A; 1K0X A; 1AVZ C; 4R0K A; 1VYU A; 4OMN A; 1NG2 A; 2EGA A; 1T0H A; 4WCI A; 1OPL A; 4F14 A; 1PNJ A; 2YUP A; 1ZLM A; 1OV3 A; 2D0N A; 1OPK A; 2DX1 A; 4IIO A; 3NMZ C; 1RI9 A; 4LN2 A; 2KT1 A; 4J9E A; 2YUQ A; 1YN8 A; 3THK A; 3R6N A; 1YWP A; 2KEA A; 1GFD A; 2JTE A; 1ZUY A; 3PVQ A; 1GBR A; 1QKW A; 1AZE A; 4RTX A; 1CSK A; 1ZUK A; 1E7O A; 2EVR A; 1JU5 C; 5FWC A; 2PZ1 A; 3UF4 A; 1UHC A; 2X3X D; 1W1F A; 2HEQ A; 2EYX A; 1B07 A; 1Z9Z A; 2IIM A; 3RBB B; 1YNZ A; 1QKX A; 3I5S A; 2ED0 A; 3M0S A; 1GCQ C; 4OMO A; 1ABQ A; 1SHG A; 3REA B; 1Y57 A; 1NEG A; 1QWE A; 3VS2 A; 2MOX A; 1ZUU A; 3PE0 A; 1X2K A; 3NPF A; 5IHI A; 2CT4 A; 1CKB A; 1K9A A; 1PRM C; 4OML A; 3VS1 A; 3EG3 A; 1I0C A; 1E6G A; 2RF0 A; 2EBP A; 2I0N A; 3IQL A; 3VS6 A; 3H0H A; 1UFF A; 1WXB A; 1EFN A; 4KRT A; 1GFC A; 4F16 A; 2ENM A; 3KFV A; 2DBM A; 3PVL A; 1KJW A; 1SPK A; 2RQW A; 2FPE A; 4AFS C; 3EG2 A; 3EG1 A; 2FG0 A; 4LNP A; 2M51 A; 3I35 A; 4CC7 A; 1AWW A; 1W70 A; 2NUZ A; 4J9H A; 3EHR A; 1X6B A; 2J6O A; 2MCN A; 2JW4 A; 2LCS A; 4J9D A; 1NLP C; 3VS0 A; 2A28 A; 2DF6 A; 2YUO A; 5HCK A; 3M0R A; 4RTY A; 1G2B A; 2KXD A; 1NLO C; 2KNB B; 1J3T A; 3NGP A; 4A63 B; 2CDT A; 4F17 A; 2HSP A; 1GCQ A; 2OAW A; 4DEY A; 5L23 A; 1ZBJ A; 1YWO A; 2AKL A; 2AK5 A; 1SRL A; 2L0A A; 4RTV A; 2RQT A; 4RTW A; 2D1X A; 4AFQ C; 2J6F A; 4AG2 C; 3REB B; 3I5R A; 2AKK A; 1H92 A; 1NM7 A; 2JMC A; 2DNU A; 4HVU A; 5IHK A; 1X43 A; 3M0U A; 2KGT A; 1VYT A; 4M4Z A; 4JPB W; 2JXB A; 4D8D A; 2ESW A; 2LJ1 A; 3VS7 A; 4AFU C; 2DRM A; 2K7A A; 1RUW A; 1TG0 A; 1T3L A; 3H41 A; 4D8K A; 1JO8 A; 1QCF A; 2LP5 A; 2O31 A; 1UJY A; 4JJB A; 2JM9 A; 2GTJ A; 1W6X A; 2KRS A; 2CSI A; 2DRK A; 2O2O A; 3ULR B; 5IXF A; 2ECZ A; 2CSQ A; 5FW9 A; 2AZS A; 4FSS A; 2EPD A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LZ6 B; 2O9V A; 2K5L A; 3JV3 A; 1LPL A; 3I9Q A; 2DKG A; 4CC3 A; 2MPX C; 1O75 A; 3SD4 A; 1U3O A; 4ZNX A; 2EYZ A; 2EQI A; 4E7Z A; 3CME A; 2RJF A; 2DMO A; 3QBY A; 1QVG P; 2GFA A; 3CPW A; 1GL5 A; 1RI0 A; 1WYX A; 3PT9 A; 1FMV A; 3URG A; 1D1A A; 2KT8 A; 3J81 E; 4LUE A; 2DEU A; 3QJY A; 2EKO A; 3UA7 A; 4EMK B; 3AHU A; 3FJP A; 2RQR A; 3RES A; 1KQ1 A; 3H8Z A; 2A3L A; 2BZ8 A; 1FYN A; 1Y7X A; 2QK0 A; 3VRZ A; 1ZSZ B; 3RKX A; 2PNI A; 2LQ8 A; 3NTK A; 3JCM X; 3CCE Q; 1MND A; 2QEX Q; 1KHC A; 1RAE B; 3CCJ A; 3SWN C; 1NEB A; 5L8R E; 5I11 A; 1QCO A; 4TVR A; 4F7U A; 1M1G A; 4QKU A; 1YHQ A; 5LJ3 d; 3CCL T; 1B7T A; 2RQV A; 3QUI A; 1VQ8 A; 2GF7 A; 1QVG A; 4LD6 A; 2DO3 A; 3MCA B; 3OB9 A; 3OYN A; 3OSS C; 4HCB A; 1YIT T; 1Q81 R; 1VUB A; 2BZY A; 4EPC A; 3OS5 A; 3CD6 Q; 2OTJ Q; 5GAN 6; 1GCP A; 3FJ5 A; 2OAU A; 3OYL A; 4O5V A; 2X4X A; 1UUE A; 3QYH B; 4AFZ C; 2W10 A; 1WJR A; 2VGM A; 2CUD A; 1AWJ A; 4RUG A; 2LX7 A; 2M0Y A; 2KR3 A; 2MF2 A; 1X2Q A; 3CCV A; 5CKE A; 3SEM A; 3EG9 B; 2J7I A; 4C0F A; 5A2Q E; 4JLG A; 4E7L A; 2IG0 A; 4J9I A; 1I5O B; 1VQK Q; 4K11 A; 1RLP C; 4WF2 A; 2GNC A; 1UGV A; 1R8O B; 5CO7 A; 1Q7Y U; 2DZC A; 2L3R A; 2E5K A; 4C92 F; 1MV3 A; 3CXC A; 4XTW A; 2G3R A; 2K79 A; 1I1J A; 1UGP B; 4J9G A; 1Q82 U; 1S72 Q; 2V8K A; 5I2S A; 4M7A F; 3V7R A; 5GAM g; 4KBM B; 1QW1 A; 4NL3 A; 3I56 A; 1VQ4 Q; 2RQU A; 3CCR T; 2X3W D; 2P84 A; 3G71 A; 5FRM A; 4IIM A; 1KD1 U; 2PU9 B; 2SRC A; 1WJQ A; 2FEI A; 2LCC A; 2ZZD A; 3LH5 A; 3M4Y A; 2PUO B; 1OEB A; 1KQS A; 4BI3 A; 4EIK A; 3ER0 A; 3R6O A; 4OMF B; 4FT2 A; 3HHT B; 3PIP A; 3WVD B; 2OJ2 A; 2F2V A; 5D6W A; 1YJW A; 1VQP T; 1SRM A; 4J9C A; 4RMO A; 2HAX A; 1H3Z A; 4ESR A; 1H8K A; 2K5I A; 1NJI U; 1H64 1; 1ZBX A; 1YBY A; 4Z02 A; 1QMC A; 4PNO A; 1UE9 A; 5C6S A; 2YDL A; 3HKS A; 5GAN 2; 2M0O A; 3FB9 A; 4DBF A; 1VQ6 A; 1Q81 C; 2KXC A; 4WTO B; 4C8Q A; 1QLY A; 4PJO F; 1VA7 A; 3OYD A; 1TU0 B; 1VQ7 A; 3JB9 D; 1NPR A; 4RTU A; 5GAN j; 1ABO A; 3CC2 T; 3HTR A; 3X28 B; 4FW2 A; 2DL8 A; 3JRZ A; 4M75 D; 2QDL A; 3UA6 A; 1PSE A; 2DA9 A; 2H3J A; 4M7D C; 4F7U G; 4ZGE B; 3ZFJ A; 1HSQ A; 3H0I A; 1X69 A; 4RKU E; 3VU3 C; 1WNL A; 1TWB A; 1XOV A; 5LJ5 g; 1K8A U; 1RLQ C; 3EGU A; 2Y4X A; 1BU1 A; 2RNA A; 4FCY A; 1EZZ B; 4OB0 B; 5KYX A; 3AT1 B; 3L2Z A; 5GMK m; 2QA4 T; 3A8O B; 1D3B B; 3JCM b; 2V26 A; 3OYG A; 3JSC A; 2EYQ A; 2DYB A; 1K0X A; 1Q95 G; 4II1 A; 2RHI A; 3V8K A; 3E9F A; 2E1H A; 3KUF A; 1YIJ T; 1ZLM A; 1OZ3 A; 2D0N A; 4IIO A; 5LL6 S; 3QHS A; 4LN2 A; 1RI9 A; 2JTM A; 4XTU A; 4J9E A; 4VUB A; 3S3N A; 2O4X B; 3QDR B; 1M2V A; 4PJO D; 2HD0 A; 3M4G A; 1WHL A; 2JOY A; 4M75 B; 3PVQ A; 1YJN Q; 3C94 A; 1G5V A; 1AZE A; 4RTX A; 1RAB B; 2MYS A; 3MP6 A; 3UF4 A; 2PZ1 A; 1UHC A; 4M78 D; 3A8L B; 3ZEH A; 2F5T X; 3OYJ A; 5CQY A; 4LDY A; 4M77 D; 2EYX A; 1Z9Z A; 4KGV B; 2QAZ A; 3I5S A; 3M0S A; 1GCQ C; 1ABQ A; 2DIQ A; 4DA4 A; 5CIU A; 3TQ7 P; 1QWE A; 3CCL A; 1VQM Q; 5FRO A; 5A0G A; 4PL6 A; 3NPF A; 1WQW A; 4LD9 K; 3OW2 P; 2XK0 A; 3OY9 A; 1OX9 A; 1QP2 A; 4EDU A; 4J83 A; 2EBP A; 1C0M A; 5GMK l; 1YIT A; 3CCM T; 3H0H A; 4KRT A; 3FDR A; 4ATO A; 4HT9 A; 1OUL A; 3TRE A; 2DK3 A; 1ZSZ A; 1M9S A; 1QQJ A; 3GOX A; 1KJW A; 4AFS C; 3OW2 S; 3PTA A; 5KYN A; 4DBH A; 3EG2 A; 4M7D E; 3QPH A; 4DOW A; 4R55 A; 1X75 C; 1AWW A; 2DER A; 2NUZ A; 4J9H A; 1SSF A; 2LCS A; 2LTO A; 3LX7 A; 2A28 A; 3OYY A; 4OF1 A; 2YUO A; 3M0R A; 4M78 B; 4LXC A; 3JCM W; 2KXD A; 5LJ3 g; 1NLO C; 4M77 B; 1VQL Q; 2HSP A; 1YI2 T; 2DEQ A; 2OAW A; 4DEY A; 5GAN e; 1YWO A; 3WXM B; 1KC8 C; 2AKL A; 3RIR A; 2QAS A; 4KGX B; 2EIF A; 3G4S A; 2E6N A; 3GF5 A; 4AFQ C; 4JRQ A; 2WAC A; 3REB B; 4NL2 A; 4JS4 A; 1PG5 B; 4C8Q G; 2EAY A; 1X43 A; 2OX7 A; 2DXU A; 2FZK B; 3OYF A; 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1Y96 A; 1P92 A; 3TSZ A; 3CC4 A; 2QA4 A; 1WIE A; 4OGC A; 1QVF S; 2DXT A; 1WXU A; 1MUZ A; 1M27 C; 2C0I A; 2COY A; 4OB1 B; 1YCS B; 2RI5 A; 3LWI A; 3M0Q A; 1W2B S; 4C0G A; 3OYC A; 2D8H A; 1AEY A; 3CPW P; 1EIF A; 1YIJ A; 2RJD A; 3JCM f; 2QGF B; 4OVA A; 5CVI A; 4XQ3 A; 5IN1 A; 5GMK i; 4OMP A; 1H3H A; 2VV5 A; 3M0T A; 5ECA A; 2DFU A; 2QTX A; 3OMC A; 5DY9 A; 4C0D C; 1ARK A; 4PFP A; 1QVF A; 3CPW S; 1M2V B; 2FZC B; 8AT1 B; 2KSS A; 1T3S A; 1ZSG A; 1BK2 A; 2KDS A; 1DJ7 B; 2BE7 D; 3JB9 J; 3A8G B; 4OB2 B; 2Y4Y A; 3PMT A; 1WA7 A; 3PMI A; 1X6O A; 2BTT A; 4FYW B; 2E10 A; 4C8Q E; 8ATC B; 4Z88 A; 2CRE A; 3QZ9 B; 2HMA A; 4EMK C; 4ORZ A; 3WVE B; 2CYZ B; 1V76 A; 1BI3 A; 4C92 A; 4J7I A; 2CP7 A; 4HXJ A; 2F1L A; 1PRL C; 2EQU A; 4JJC A; 4Y91 A; 4IUV A; 2LJ3 A; 3CME Q; 2O4X A; 1JQQ A; 5KCH A; 1I07 A; 2FB7 A; 1S1N A; 1M3C A; 4HCC A; 3CCM A; 4M75 A; 4M7A A; 2RPN A; 4N4G A; 2PVD B; 4E2F B; 3CC7 T; 1WGS A; 3F70 A; 3L2U A; 1TUG B; 4CC2 A; 2RH2 A; 3HRU A; 2XKO C; 1QVG S; 1JB0 E; 2DAQ A; 3UT1 A; 3C12 A; 4J9B A; 4PFZ A; 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