The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
b'ENKVLYAYVQKDDDEITITPGDKISLVARDTGSGWTKINNDTTGETGLVPTTYIRI'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
BZZ1 protein
|
| publication title |
Structural genomics of yeast SH3 domains
rcsb |
| source organism |
Saccharomyces cerevisiae
|
| molecule tags |
Unknown function
|
| total genus |
13
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| structure length |
56
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| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-01 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4IIM A; 1HD3 A; 2HBW A; 1AZG B; 1MUZ A; 2YUO A; 4LUD A; 2DF6 A; 2KT8 A; 1K1Z A; 2AKK A; 2FPD A; 1V1C A; 2CSQ A; 2PZ1 A; 2GGR A; 2GQI A; 4GLM A; 1JXO A; 1U5S A; 2BTT A; 2EVR A; 1K0X A; 2DE0 X; 1H92 A; 2XMF A; 1YP5 A; 4CC4 B; 4OMO A; 4ZNX A; 2KRO A; 2EYW A; 2CRE A; 1G2B A; 2EGA A; 2LQW A; 4CC3 A; 2L3Q A; 1Y57 A; 2EYZ A; 2JS2 A; 3EHQ A; 1WFW A; 1WA7 A; 2KE9 A; 2DL8 A; 1T3L A; 1MV0 B; 2JMC A; 1B07 A; 3EGU A; 1YNZ A; 2L3S A; 1BB9 A; 2ROT A; 2D8H A; 4J9H A; 1SHF A; 5FWC A; 5IHI A; 2EQI A; 3H0F A; 2ESW A; 2KXC A; 4RTV A; 2DL5 A; 1E6G A; 1SRL A; 1WXU A; 2J6O A; 2C0I A; 2C0O A; 1I1J A; 2OI3 A; 1OV3 A; 2DL7 A; 1OEB A; 2VKN A; 1GCQ C; 1IO6 A; 1UEC A; 2DRM A; 2IIM A; 1WX6 A; 2X3W D; 5FWB A; 2RN8 A; 4QT7 A; 1YCS B; 2EPD A; 1NLO C; 2D1X A; 2VWF A; 1ZUY A; 1NYF A; 1UJY A; 1K4U S; 1EFN A; 2I0N A; 1AEY A; 1RLP C; 2F2W A; 3PE0 A; 4J9E A; 3QWY A; 4KRT A; 4GBQ A; 1QKX A; 1T0J A; 5ECA A; 3EG1 A; 5IXF A; 1KFZ A; 4HVV A; 4J9G A; 1X43 A; 2KYM A; 4JJD A; 2GTO A; 4X1V A; 2AZS A; 2A37 A; 2E5K A; 3I5R A; 1W1F A; 1PKS A; 2CT3 A; 4HXJ A; 3THK A; 4RTU A; 2YT6 A; 4FSS A; 4OMQ A; 1KIK A; 2KBT A; 2HDA A; 4JJB A; 4RTY A; 2DLP A; 1K76 A; 1U06 A; 4HVU A; 4AFQ C; 1ARK A; 4AFU C; 1X6B A; 1GFC A; 2LJ0 A; 1T0H A; 2CT4 A; 3CQT A; 2RQW A; 2PNI A; 4ORZ A; 2A08 A; 2KRM A; 2CSI A; 2AKL A; 1K0S A; 3TSW A; 1M30 A; 4ESR A; 2V1Q A; 1UTI A; 1UG1 A; 2QDL A; 1UFF A; 2CH4 A; 1TG0 A; 1W70 A; 1B3Q A; 2MCN A; 3I9Q A; 2JMA A; 1M8M A; 2ED0 A; 3UA6 A; 3QWX X; 1LCK A; 2DMO A; 2J6F A; 4LN2 A; 2F2V A; 2DNU A; 3VS6 A; 1CKA A; 4EIK A; 3EHR A; 1CSK A; 3EG2 A; 1SHG A; 2YDL A; 2KRN A; 4HVW A; 2HEQ A; 2LNH B; 2K3B A; 3REB B; 1SPK A; 1GCQ A; 4E6R A; 1E7O A; 4AFS C; 4CC7 A; 4JZ4 A; 1UGV A; 1X2Q A; 5IH2 A; 3H0I A; 2LJ1 A; 2K2M A; 2DBM A; 1NLP C; 3U23 A; 2ABL A; 2W0Z A; 4J9C A; 2V1R A; 1HJD A; 2EGE A; 4HCK A; 1GRI A; 2JT4 A; 1PHT A; 1X69 A; 3RBB B; 2RMO A; 4F14 A; 1RUW A; 1GCP A; 2PTK A; 2OJ2 A; 1X2K A; 2RQU A; 2O9S A; 1UE9 A; 2EYY A; 4J9B A; 1NEG A; 3PVQ A; 2KEA A; 1UDL A; 2KYB A; 2MIO A; 5IHN A; 4CC2 A; 1BU1 A; 1JU5 C; 2CUD A; 2ECZ A; 1ZUK A; 2B86 A; 4JPB W; 2LCS A; 2J05 A; 1OPL A; 2GBQ A; 4LNP A; 3M0R A; 1GBR A; 1I0C A; 1TUC A; 2M0Y A; 1WIE A; 1NM7 A; 2EW3 A; 5HCK A; 3A98 A; 2KGT A; 1NEB A; 3O5Z A; 1MV3 A; 4RUG A; 1K9A A; 1WLP B; 4JJC A; 1QCF A; 1QWF A; 4RTT A; 1AWJ A; 1TUD A; 1UHC A; 2JM9 A; 1GBQ A; 2EYX A; 2YUP A; 2H8H A; 1AWX A; 2YUQ A; 4K11 A; 2X3X D; 3ZL7 C; 2JTE A; 2OAW A; 2DRK A; 2YUN A; 1AZE A; 2HSP A; 2L2P A; 4J9F A; 1NYG A; 2L3P A; 1WXT A; 1E6H A; 5GJV B; 1WYX A; 2FPE A; 4LUE A; 3H41 A; 1ZX6 A; 1PRM C; 3NHN A; 3H0H A; 3UAT A; 2JM8 A; 1AOJ A; 3VS3 A; 2CH4 W; 2GNC A; 1M27 C; 3GBQ A; 2ROL A; 1QWE A; 2BZY A; 5IXB A; 1UHF A; 4DEX A; 1Z9Z A; 1M3C A; 2SEM A; 2LX7 A; 2K79 A; 5I22 A; 2ED1 A; 2JS0 A; 2RQV A; 3EG0 A; 3R6N A; 2FRY A; 2K9G A; 4DEY A; 1Y0M A; 2AK5 A; 1T3S A; 1HSQ A; 3M0P A; 3SHW A; 3C0C A; 1AD5 A; 4A63 B; 2M51 A; 1VYT A; 1RLQ C; 1XOV A; 3LH5 A; 4OMP A; 1N5Z A; 2DVJ A; 4J9D A; 2JXB A; 1X27 A; 2HCK A; 1AWO A; 4Z89 A; 2A28 A; 4AFZ C; 1SRM A; 2KT1 A; 3UA7 A; 3FJ5 A; 3ULR B; 2O31 A; 5GJW B; 4LE9 A; 3UF4 A; 3NPF A; 2D8J A; 2JW4 A; 2LP5 A; 2RQT A; 1PNJ A; 2DL3 A; 1ABQ A; 2FEI A; 2BZX A; 1FYN A; 2F2X A; 2W10 A; 1I07 A; 4D8K A; 4WCI A; 2CDT A; 2DX1 A; 1M3A A; 3M0Q A; 2AZV A; 4AG1 C; 3EG3 A; 2NUZ A; 2DIL A; 2KXD A; 4RTX A; 2RPN A; 2FO0 A; 3SEM A; 2RNA A; 1ABO A; 1J3T A; 4Z8A A; 1U3O A; 2ENM A; 2FG0 A; 1VYV A; 3VS7 A; 1YWO A; 5FW9 A; 2LMJ A; 4AG2 C; 2C0T A; 2LZ6 B; 2RQR A; 1A0N B; 1UJ0 A; 4M4Z A; 1GFD A; 2A36 A; 1KJW A; 1SEM A; 2KNB B; 1OOT A; 2K6D A; 3NGP A; 2VVK A; 2J6K A; 4OML A; 1H3H A; 3RNJ A; 1WI7 A; 2P4R A; 1ZSG A; 3VS2 A; 2G6F X; 2K7A A; 2DL4 A; 1UUE A; 1JEG A; 3KFV A; 2LQN A; 2DBK A; 4F17 A; 1CKB A; 1VYU A; 1YN8 A; 1WXB A; 4JZ3 A; 1AVZ C; 3M0S A; 1H8K A; 3M0U A; 1G83 A; 3IQL A; 3PVL A; 2FPF A; 4Y92 A; 2DJQ A; 3I35 A; 1PKT A; 1BBZ A; 1Z9Q A; 4IIO A; 3VS4 A; 1PWT A; 1AWW A; 5IHK A; 1JO8 A; 2D0N A; 1RI9 A; 2O2O A; 1M3B A; 4Z88 A; 3VS0 A; 2DYB A; 1VA7 A; 2KRS A; 3VS5 A; 1FMK A; 1BK2 A; 4R0K A; 1OPK A; 4RTW A; 1QKW A; 3M0T A; 1YWP A; 1GL5 A; 1X6G A; 3NMZ C; 2L0A A; 5I11 A; 5L23 A; 2EGC A; 4J9I A; 2J06 A; 3TVT A; 2RF0 A; 2KR3 A; 2O9V A; 3TSZ A; 2YSQ A; 1JQQ A; 2EKH A; 2NWM A; 4RTZ A; 1S1N A; 3I5S A; 4OMM A; 1NG2 A; 2FRW A; 1W6X A; 1PRL C; 2DM1 A; 2GTJ A; 1QLY A; 2LJ3 A; 4D8D A; 1ZBJ A; 2J7I A; 2BZ8 A; 2CUB A; 2MOX A; 2EBP A; 3JV3 A; 3REA B; 4OMN A; 1SSH A; 1KSW A; 3VRZ A; 4F16 A; 3VRY A; 1JXM A; 1WDX A; 2SRC A; 5EC7 A; 1ZUU A; 3VS1 A; 1ZLM A; 2DA9 A; 2O88 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1AZG B; 2ZGW A; 2DF6 A; 3PT9 A; 2RI5 A; 2P0P A; 2ZCF B; 3NTI A; 2COY A; 2FPD A; 4LXC A; 1OU8 A; 1MMG A; 1N9R A; 2P84 A; 2XMF A; 4F7U A; 2NUT B; 4M78 C; 3L42 A; 2KRO A; 4C8Q F; 2CRE A; 1G2B A; 3CCM Q; 2LQW A; 3CPW S; 1Q81 R; 3FRN A; 2JS2 A; 4IUP A; 1VQO Q; 1WA7 A; 4AT1 B; 2DL8 A; 2JMC A; 2EQU A; 1PSF A; 1YNZ A; 3CCM A; 2ROT A; 3OSS C; 2XK0 A; 5IHI A; 4C92 A; 5EG2 A; 1VQO A; 1KC8 C; 1OX9 A; 4RTV A; 1M2V B; 2CKK A; 1YI2 T; 2J6O A; 1FWZ A; 2C0O A; 2RHY A; 4E7H A; 3X28 B; 1OEB A; 4M7A D; 4XQ3 A; 4L6V 5; 1IO6 A; 1MND A; 3FIF A; 5FWB A; 1TSF A; 2DXU A; 1VIE A; 4QT7 A; 1NLO C; 3Q1J A; 2P0K A; 4ME7 A; 2VWF A; 1NYF A; 2JUF A; 1K4U S; 4C5G A; 2X4W A; 3A8O B; 2E4H A; 1EFN A; 3QKJ A; 3OS1 A; 1WHK A; 1HXD A; 3FEO A; 4B9X A; 4OB2 B; 4E7I A; 5IXF A; 5GAN 8; 4PNO A; 1X43 A; 1YHQ T; 1EX4 A; 2JNG A; 2DER A; 2AZS A; 2CZ1 B; 2L3R A; 1W1F A; 3L2R A; 2NLU A; 2DD4 A; 5CIU A; 4FSS A; 2OAU A; 2WSC E; 2PUO B; 1D1C A; 4UC4 A; 4JRP A; 4N4G A; 2DLP A; 3RMQ A; 2WSF E; 1XJW B; 2NUT A; 1TS9 A; 4AFU C; 1X6B A; 4BAC A; 1K9M C; 2K5L A; 4C8Q E; 1VQN T; 1OX8 A; 5DY9 A; 3C95 A; 5D6W A; 3LWI A; 3G6E Q; 2AKL A; 5GMK m; 5KYW B; 1YJN Q; 1TOV A; 1YJ9 T; 3OYL A; 2LCL A; 4ESR A; 4IUQ A; 1UG1 A; 1M2V A; 2CH4 A; 2AHJ B; 3G6E A; 5IAY A; 4M75 B; 2F2V A; 4KUI A; 5AYF A; 3VS6 A; 1CKA A; 5GAM f; 1SHG A; 2XID A; 2XKO C; 2KRN A; 4HVW A; 2LNH B; 1D0X A; 1Q81 C; 2EYQ A; 3CME T; 4FU6 A; 1M1K R; 1E7O A; 4KH0 B; 4AFS C; 1VQ4 T; 5FU7 C; 1VQM T; 1X01 A; 3A5Z B; 4PJO C; 3FDR A; 3CD6 Q; 3G1J A; 4M7D F; 2X9H A; 3OA6 A; 4J9C A; 1ACM B; 1ZSZ B; 1HJD A; 4C8Q G; 2QQS A; 2EJF A; 5GMK e; 3CCL Q; 2RJC A; 3CD6 A; 2O9S A; 5GAN 3; 3CC7 T; 2DXC A; 1NEG A; 1WZO A; 1UDL A; 3ZFJ A; 2KYB A; 3CCL A; 2MIO A; 5IHN A; 3I55 T; 1BU1 A; 2HZY A; 3CCE Q; 2ECZ A; 3OQ5 A; 1OPL A; 2F1L A; 1GBR A; 5LJ5 e; 4OB0 B; 1WIE A; 2DIG A; 4M78 D; 1BCO A; 1D0Y A; 3VV0 A; 4KGV B; 3CCE A; 1WLP B; 4E47 A; 5L8R E; 2E3I A; 3MET A; 2QQA A; 1AWJ A; 1TUD A; 5KYW A; 2JM9 A; 2EYX A; 2YUP A; 2DAQ A; 1AWX A; 1XTD A; 2YUQ A; 2XU8 A; 4GY5 A; 2X3X D; 4B9W A; 2M9U A; 5CQX A; 2AT1 B; 2I2L A; 3I56 T; 2OAW A; 3G4S Q; 1AZE A; 1U1T A; 2MMP A; 1PG5 B; 1D1A A; 5GJV B; 1WYX A; 4M75 A; 1G5V A; 3H41 A; 2D0Q B; 1D3B B; 3LX7 A; 2HL3 A; 3UAT A; 3MEV A; 4LDV A; 2LCC A; 4FYV B; 3SWN C; 3G4S A; 2CGH A; 5LJ5 g; 1QWE A; 3OYI A; 1UHF A; 5GAM h; 1UGP B; 1FMW A; 2ED1 A; 3EG0 A; 3VJP A; 4IUV A; 2FRY A; 2KQW A; 4DBF A; 1W2B A; 3BDU A; 4DEY A; 4M7D E; 2AK5 A; 2DKG A; 1ZSZ A; 3M0P A; 1AD5 A; 4A63 B; 2M51 A; 2VGN A; 1N5Z A; 4FSX A; 5FRO A; 1QP2 A; 1R8O B; 1VQL T; 3MO8 A; 4J8O A; 4AFZ C; 1SRM A; 2KT1 A; 3FJ5 A; 3MKD A; 3NPF A; 3M55 A; 3JCM f; 3UDC A; 3L2Q A; 5GAO r; 1ABQ A; 4QQD A; 2F2X A; 4VUB A; 1UGQ B; 2CDT A; 1QVF A; 2VGM A; 2KXD A; 1H64 1; 5KYU A; 1PD1 A; 1J3T A; 2FZK B; 4OMF B; 1NJI U; 2QGG A; 5CKD A; 2LQK A; 3O8V A; 2ENM A; 4JS4 A; 1WJQ A; 4M7D G; 1M1G A; 1Q82 R; 1A0N B; 2A36 A; 4RG8 A; 3L2V A; 2JTF A; 3NGP A; 2CZ6 B; 4LD9 K; 3VS2 A; 1UUE A; 3WVE B; 1JEG A; 1CKB A; 4E7Z A; 3BW1 A; 1LNX A; 1YN8 A; 2E3H A; 5CKH A; 2DD5 A; 4PKC C; 1WXB A; 3OYY A; 3M0S A; 1H8K A; 2WAC A; 3HRU A; 3BE3 A; 2FPF A; 4KUD K; 2QTX A; 1VQK T; 1JJ2 S; 1Y96 B; 3VS4 A; 4PJO D; 2CZ7 B; 4PLL A; 3JB9 I; 5KE2 A; 2OTL A; 2D0N A; 1M3B A; 4Z88 A; 3VS0 A; 3S3M A; 2DYB A; 1VA7 A; 5GAO m; 3VS5 A; 1FMK A; 3NTK A; 4HCB A; 2HKN A; 1UEB A; 1QKW A; 3OYC A; 1YWP A; 1WGS A; 5GAN d; 1C0M A; 1X6G A; 2QAS A; 4OVA A; 1VQ5 Q; 4J9I A; 2RHU A; 3TVT A; 3JCM h; 1WJS A; 3OYH A; 3TSZ A; 2RO0 A; 2ZZD A; 3VU3 C; 2NWM A; 4RTZ A; 1AT1 B; 2HD0 A; 1TXQ A; 3GLX A; 2LJ3 A; 1VQ5 A; 1BYM A; 1OYX A; 2BZ8 A; 2CUB A; 1QP3 A; 2QYZ A; 3E19 A; 2FVU A; 2QEX Q; 2EBP A; 3VKI A; 3JV3 A; 4QQG A; 3M57 A; 4OMN A; 3T9N A; 4MZP A; 1NJI R; 5GAN f; 3VRZ A; 4C0D C; 4F16 A; 3VRY A; 2F5T X; 2QEX A; 1I5O B; 2RD1 A; 1ZLM A; 2DA9 A; 2CP2 A; 3MEA A; 3F70 A; 3CCV A; 3MEU A; 2LX9 A; 5FRN A; 5A0D A; 1MUZ A; 4LUD A; 3CCS A; 4BE0 A; 4M7A C; 4BD3 A; 1V1C A; 2PZ1 A; 2GGR A; 2YRC A; 2GQI A; 4F7U E; 4KGX B; 3RMS A; 3OYD A; 1BCM A; 1K0X A; 2DE0 X; 1KHI A; 1Y96 A; 4MML A; 1H92 A; 2ZAE A; 3HHT B; 1WHM A; 5LJ3 e; 1M8V A; 3P8B B; 4CC4 B; 4OMO A; 4P5N A; 1Q7Y U; 2EYW A; 4M78 B; 2EYZ A; 1WFW A; 3L2W A; 2CP3 A; 5GMK l; 3SD4 A; 3CMA Q; 2M16 A; 4C92 E; 1B07 A; 2D8H A; 2QK0 A; 1SHF A; 3VYH B; 3H0F A; 3QII A; 4JLI A; 4JRK A; 3CMA A; 2PQW A; 1SRL A; 1WXU A; 1C1A A; 2MPX C; 1I1J A; 5I2M A; 2DL7 A; 4BDZ A; 1GCQ C; 1Q81 U; 3LGF A; 2BE7 D; 3PNW C; 1WX6 A; 4F7U G; 2RN8 A; 2IVW A; 2DET A; 2QGF B; 1UJY A; 2QG9 B; 3JCM J; 3EFS A; 1W2B P; 1VQ9 A; 5J39 A; 4HT9 A; 3L1A A; 2CP0 A; 2I0N A; 4MDW A; 3CC4 Q; 2F2W A; 3PE0 A; 5CKB A; 2ZPG B; 5GAN h; 3JB9 D; 1BIB A; 4GBQ A; 2RHX A; 3OYF A; 3RDV A; 3EG1 A; 3GPL A; 3KUF A; 1NPP A; 1KFZ A; 4J9G A; 4PLI A; 3A1P A; 5D6Y A; 3CC4 A; 4C92 G; 1SF9 A; 5A0L A; 2CT3 A; 1YIT T; 3THK A; 1R0B G; 1KQS A; 2L5Q A; 1VQ6 T; 4RTU A; 2KBT A; 2DZ9 A; 4RTY A; 3G71 T; 3S3O A; 5LJ3 d; 4L59 A; 2EIF A; 3EAE A; 5FRM A; 1GFC A; 1MMA A; 1NJI C; 2HQH A; 1T0H A; 2PVG B; 1QVF P; 2E41 A; 4M78 A; 3CQT A; 1N8R U; 1TWB A; 4D6W A; 2A08 A; 2KRM A; 2CSI A; 5KCO A; 1Q7Y R; 2RJD A; 1K0S A; 2PUK B; 3X25 B; 3JCM W; 5GAM j; 4X9C A; 1IGQ A; 4M75 F; 1X75 C; 2K5I A; 1UFF A; 3HSB A; 1W70 A; 1B3Q A; 4EMG A; 4X34 A; 1LCK A; 3AHU A; 1OZ3 A; 1CSK A; 3EG2 A; 4ATO A; 4AMC A; 3M54 A; 3MP6 A; 2DTI A; 3G7Z A; 1JB0 E; 4DBR A; 2K3Y A; 2EFI A; 3ME9 A; 4CC7 A; 3DLM A; 5A2Q E; 1X2Q A; 5IH2 A; 3H0I A; 4XAX B; 4FL6 A; 2P4T A; 2CP7 A; 1F1B B; 4LD6 A; 2GF7 A; 4PJM A; 2W0Z A; 2A0F B; 5FU7 B; 2EGE A; 3A8M B; 4PJO B; 4HCK A; 1GRI A; 2DTO A; 1PHT A; 3RBB B; 1VQO T; 1RUW A; 3JB9 J; 4QKU A; 1G8X A; 2PTK A; 1QVG S; 3HFO A; 3KXT A; 2LT1 A; 2EYY A; 5HKC A; 1IHW A; 2RHI A; 1M1K U; 4CC2 A; 2CUD A; 3M59 A; 1P92 A; 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