1ZWNA

Crystal structure of spin labeled t4 lysozyme (v131r1b)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAACNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Crystal structure of spin labeled T4 Lysozyme (V131R1B)
rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2005-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1zwnA00
1CU5A 1P64A 1QTVA 137LA 1LYGA 1L94A 3SB9A 4GRVA 1L16A 1ZURA 1C60A 216LA 4I7JA 1L30A 218LA 141LA 1C68A 259LA 114LA 2RBPA 236LA 3C81A 4IAPA 1L02A 1KW7A 1L79A 3DMXA 169LA 3JR6A 235LA 1CV3A 3HT8A 1C6BA 1KS3A 254LA 1D3MA 4I7QA 253LA 3ODUA 2B72A 4I7PA 4I7MA 1C63A 1CU0A 257LA 4PJZA 1CUPA 1QTCA 1KY1A 1L28A 3RZEA 1L22A 2QARC 229LA 1L70A 2HULA 256LA 1C6HA 1OWYA 1OV7A 1P37A 213LA 1PQMA 227LA 4DKLA 4ARMA 109LA 4I7NA 2RBNA 3V2WA 7LZMA 1LYDA 1D3NA 198LA 1DYCA 1L91A 1P6YA 1C62A 4W59A 1L08A 255LA 181LA 2ANVA 1L76A 1LPYA 1L60A 1QTHA 1QUHA 3OE9A 1L11A 3HDEA 1QT7A 3D4SA 1L35A 249LA 4W58A 217LA 1T97A 1C61A 214LA 252LA 1C6NA 1C6TA 142LA 164LA 127LA 3C83A 1C69A 1L48A 1L29A 4W52A 151LA 3HWLA 1QTBA 2RBQA 4YXCA 4EPIA 4I7SA 205LA 1L0JA 1C6JA 1G0JA 1JTNA 120LA 1QS9A 2F32A 1C6IA 3DNAA 3VW7A 3C8SA 191LA 3GULA 2CUUA 2L78A 1OVKA 4I7RA 177LA 4EKSA 104LA 1QT3A 226LA 1L64A 1LYFA 113LA 3CDTA 3DN4A 2HUKA 1TLAA 4I7TA 2RB1X 1L00A 3HTDA 3DN2A 4ARQB 260LA 1C6QA 1L47A 143LA 4ARMB 130LA 3CDRA 3QAKA 2Q9EA 180LA 1LGXA 3DN3A 1L38A 1L13A 3NYAA 187LA 1L93A 188LA 1C6PA 3HTFA 1L24A 103LA 1LYJA 1L10A 3C80A 1L43A 1C6FA 3HTBA 1L74A 3HH4A 1L05A 1D2YA 3PDSA 1G1WA 1LLHA 1CV1A 1XJTA 2RH1A 2B6YA 241LA 3UONA 2B6TA 4I7OA 110LA 210LA 138LA 1G0LA 1L26A 261LA 126LA 102LA 3HH3A 1C6DA 224LA 2Z6BA 1L58A 3SB7A 1L77A 2HUMA 4YX7C 1C6GA 243LA 1CV6A 1SSWA 3DN1A 2OU8A 196LA 4W53A 2A4TA 244LA 1G06A 1L62A 1L83A 1DYDA 240LA 1L14A 215LA 4EJ4A 3SBAA 3L2XA 1JQUA 140LA 1L34A 165LA 239LA 1L57A 1D2WA 195LA 3FI5A 258LA 4EKPA 4ARJA 1CUQA 4EPFA 108LA 1EPYA 3HH5A 1L54A 2OTYX 1L63A 4ARQA 230LA 2F2QA 2RBOA 1KNIA 1L41A 201LA 1LI2A 1L73A 1NHBA 3OE8A 1OYUA 3V2YA 1XJUA 3C8RA 1PQIA 4W51A 1C6AA 1OVJA 231LA 1G0KA 4W57A 4W55A 178LA 1ZYTA 1L52A 3FADA 172LA 4DJHA 5LZMA 1L09A 2B73A 1L80A 1P2LA 3C8QA 2B70A 197LA 173LA 1L49A 4DAJA 1CX7A 1T8FA 200LA 171LA 107LA 1L98A 6LZMA 1L07A 162LA 1CVKA 232LA 4LDEA 233LA 1B6IA 1P36A 1P7SA 1QTZA 3F8VA 1QSQA 220LA 3CDVA 3HU9A 189LA 3FA0A 156LA 1L71A 1QT4A 3HTGA 2O7AA 4ARPA 237LA 1P46A 2O4WA 1L87A 1QTDA 3SB6A 1L69A 3OE0A 2RAZX 4ARLA 3GUJA 1CV4A 1L81A 1CU6A 3GUPA 2ANXA 1L0KA 1L20A 3K2RA 1L33A 1CV0A 1L39A 1L85A 1SWYA 3G3VA 125LA 2OE4X 1SWZA 1L99A 3CDOA 1WTHA 2OTZX 234LA 167LA 4K5YA 1C66A 1L17A 1K28A 1L53A 2RB2X 145LA 1DYBA 163LA 1L18A 221LA 2B75A 158LA 1C6KA 1L37A 1L19A 3C7WA 3CDQA 168LA 1SX2A 3DMZA 4PK0A 1OVHA 139LA 1G07A 1L90A 3GUOA 1G0MA 149LA 118LA 1L51A 2O79A 1KY0A 1L89A 4GBRB 3RUNA 5I14A 1L55A 1KW5A 3GUMA 2OE9X 3F9LA 1L45A 4EXMA 245LA 4ZPUA 1C64A 112LA 212LA 1C65A 2NTHA 115LA 3SB8A 1LYIA 1L61A 3HT6A 119LA 1L27A 1LW9A 211LA 170LA 2B6ZA 2LC9A 4E97A 223LA 1G1VA 1QT5A 3C7ZA 1L92A 250LA 1QT8A 155LA 1LWKA 1L21A 184LA 1QT6A 3DN6A 174LA 147LA 1C67A 1L59A 3EMLA 157LA 144LA 3HH6A 1LI6A 2OEAX 4W54A 2RBSA 111LA 209LA 238LA 3DN8A 1L23A 1L56A 4EKRA 1L66A 1P2RA 3GUKA 182LA 1CU3A 1LWGA 2OE7X 1JTMA 192LA 219LA 166LA 150LA 1L36A 1PQDA 1G0QA 1XEPA 159LA 1QUOA 1L88A 3C7YA 1L96A 3PBLA 1QS5A 1CV5A 1C6MA 129LA 1LI3A 146LA 1L31A 3SBBC 2LCBA 225LA 3G3WA 3LZMA 1T8GA 175LA 2OU0X 1L86A 4AQNA 3HUAA 2NTGA 123LA 131LA 3SN6R 1LGWA 1SSYA 1G0PA 2B6XA 1L95A 122LA 1P5CA 1PQJA 199LA 1L03A 3HT9A 3HU8A 1LGUA 2OU9A 4I7KA 3C82A 1L25A 4EKQA 1CTWA 1DYFA 1L72A 4OO9A 1OWZA 3HT7A 1I6SA 176LA 3L64A 1QUGA 4I7LA 160LA 1L97A 1L44A 186LA 190LA 1L04A 185LA 1SX7A 3HDFA 1ZWNA 242LA 1L46A 1L40A 1L68A 1DYEA 247LA 2RBRA 1L15A 4W56A 251LA 1D3JA 1OV5A 183LA 1C6EA 3DN0A 4LZMA 1CX6A 1L06A 2IGCA 1L82A 1QUDA 3HUQA 4LDOA 1L32A 1LYEA 128LA 1P56A 1DYGA 3GUIA 3HUKA 3NY8A 1P3NA 2RB0X 1DYAA 4S0WA 262LA 1L75A 1T6HA 1L84A 3G3XA 3DMVA 3GUNA 1C6CA 1L50A 2B7XA 3SB5A 1D9WA 161LA 1T8AA 2QB0B 246LA 228LA 1L67A 222LA 4YXAC 1D3FA 1LYHA 1L65A 1G0GA 1PQKA 3DKEX 3OE6A 1L01A 248LA 4LDLA 2B74A 1PQOA 2F47A 1C6LA 152LA 3NY9A 148LE 1QSBA 1L12A 2LZMA 2Q9DA 2RAYX 2B6WA 1L42A 1CU2A 206LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H91A 1IP7A 1QTVA 137LA 2Z2FA 4LT2A 1IP2A 4J1BA 4BAPA 1GDWA 1A4VA 2D91A 1L30A 1GE3A 1DI5A 259LA 236LA 4NIJA 2CDSA 3JR6A 1LZTA 2EIZC 1GFKA 1J1PY 1C6BA 1LJ4A 3ODUA 1V7SA 4I7MA 1C63A 257LA 1ALCA 3RZEA 2QARC 256LA 1C6HA 1OWYA 1IP1A 1RCMA 1IY3A 1DPWA 1B7LA 1PQMA 2XBRA 4DKLA 1LZGA 3E3DA 109LA 3V2WA 5APDA 1DYCA 1L91A 4W59A 255LA 154LA 1L76A 1LPYA 249LA 217LA 1NBYC 1QTKA 1WVVA 5KKJA 1SQ2L 1T97A 1OUGA 4NGZA 4WO6A 3A34A 1W6ZA 164LA 1IP6A 4RLNA 4LT1A 1QTBA 1JKBA 4NHSA 205LA 3CSRA 4NGKA 1JTNA 1QS9A 1RI8B 2MEIA 1LJIA 191LA 1YAOA 3AJNA 3D9AC 5HNCA 2MECA 2L78A 1XSFA 2Z39A 1D6PA 2ZIKA 4I7RA 5K7OA 177LA 1GXV2 104LA 4OWEA 4WLYA 4WM1A 3DN4A 1WQOA 3HTDA 1DI4A 1C6QA 2DQGY 4ARMB 130LA 3CDRA 2Q9EA 1KXWA 180LA 4GN4A 4NSJA 5C6LA 4LYCA 3DN3A 1VAUA 5E9RA 2ZYCA 4CHXA 134LA 5ILCA 1WQPA 1UIFA 1LYJA 2BQEA 3C80A 1IR7A 5JENB 1YAQA 1L05A 1D2YA 4TWSA 3N9EA 3WPJA 4I0CA 1XGPC 241LA 1QTEA 1GF6A 1HEMA 4HTKA 3WU7A 4I7OA 1OQMA 138LA 2BQIA 126LA 3GXRA 102LA 1TCYA 5FDJA 1GB6A 3N9CA 224LA 3SB7A 2HUMA 3HFMY 4ZFPA 1SSWA 2A4TA 3RZ4A 1L83A 4H92A 1L14A 215LA 3L2XA 1WQRA 1JQUA 140LA 1YQVY 4RW2A 1L57A 1OUCA 2BAAA 4E3UA 1CUQA 108LA 1L63A 4ARQA 230LA 5LVJA 1ZVYB 4ETBA 4OOTA 4M4OA 3OE8A 3TXKA 4YEMA 5ILFA 1XJUA 1HNLA 1UIDA 2BLYA 3J4GA 1PQIA 1LYSA 3QE8A 4XJGA 1OVJA 231LA 4W55A 5EBHA 4DJHA 1GAZA 1L80A 3HBDA 2B70A 4QY9A 4H8XA 1GF8A 1GBWA 4GCEA 1LCNA 2ZNWY 1E8LA 1B7RA 1GBXA 2BQHA 1CVKA 4H8YA 1P7SA 3A93A 2EPEA 1GB5A 1NHEA 2BQNA 4ARPA 4BAFA 1CKFA 2H9KA 1FLQA 4II8A 5LVIA 1HFXA 1YANA 1WQMA 1IC5Y 5LYMA 4GCDA 4DD7A 4N0JA 1LJ3A 4MR1A 1K28A 2G4PA 4R6CA 3LYTA 1BB6A 4ANRA 5KXWA 1L18A 221LA 3RU5A 2HU3A 3CDQA 3A3RX 1SX2A 4WL6A 3P4ZA 1JJ0A 1YL0X 3CQLA 3P66A 3WVXA 1G0MA 149LA 1JKDA 1GFHA 1D9UA 5D5CA 3TXFA 1KW5A 2N5ZA 2OE9X 3WL2A 4NSIA 112LA 212LA 5B59A 1ZV5L 2XQOA 2NTHA 1L61A 1LYIA 2FYDA 2YBLA 4HPIA 223LA 1MLCE 1GE0A 4B1AA 3SP3A 1QT6A 2LZ2A 4LYMA 1CJ6A 147LA 3EXDA 4GN3A 144LA 2HEDA 1LMCA 2RBSA 238LA 1GB2A 2Y8PA 3CSZA 4EKRA 1P2RA 1CU3A 5FSTA 2Z19A 5APEA 166LA 1INUA 150LA 1PQDA 1QDTA 1XEPA 5HMJA 1QUOA 1OUFA 1GF3A 1L96A 3PBLA 1RFPA 1D0MA 1CV5A 1C6MA 129LA 1LI3A 146LA 1L31A 3B0IA 1B2KA 2Z37A 3W6FA 5I53A 4NHTA 131LA 4N8ZA 4NSGA 1LGUA 1G7IC 4N5RA 1L25A 1IR8A 3QNGA 1OWZA 4J7VA 1JPOA 4XENA 176LA 1LZRA 1IOQA 4I8SA 160LA 4B0DA 1L44A 1BHZA 1CKHA 185LA 3M3UA 1SX7A 4H9IA 4LYBA 1B9OA 1QDRA 4XYYA 4B4JA 1L46A 247LA 4WLTA 2BQDA 3P65A 1D3JA 1HEQA 2Q0MX 5LINA 1IWXA 1B5UA 1CX6A 2IGCA 1L82A 1QUDA 1GF7A 4TX7A 1JWRA 1LYEA 3HUKA 4S0WA 1L75A 4WMGA 2DQEY 2B7XA 1T8AA 135LA 228LA 1L67A 4YXAC 3TXIA 1B0DA 2BQOA 1G0GA 1QSWA 5KXOA 1PQKA 3DKEX 248LA 2FYCA 2BLXA 152LA 2LZMA 4IASA 1NF5A 2Q9DA 4NGWA 2RAYX 3WXTA 1IWVA 1IWUA 1J1XY 1YKYX 4D9ZA 4XJBA 2ZILA 4YF2A 1CU5A 1P64A 3AZ6A 1GB0A 1IEEA 1L94A 5L3IA 4XJFA 3W6DA 1TDYA 5IDDA 1C60A 4I7JA 1REYA 1LZCA 1YILA 3DMXA 1CV3A 2MEBA 3TXHA 4PJZA 3LN2A 2DQAA 1LZ1A 4AGAA 1HSXA 229LA 2HULA 1OV7A 1REXA 1B7QA 227LA 7LZMA 1REZA 2RBNA 2ZWBA 4YOPA 4QDNA 2ANVA 3A6BY 1L11A 1QT7A 1C7PA 3P64A 1C61A 214LA 4LYTA 1KXXA 1T6VL 4WG7A 1GFJA 1NMMA 127LA 3C83A 4AXTA 4W52A 3B72A 3A92A 3HWLA 1A2YC 4I7SA 5LXWA 1C6JA 1G0JA 3DNAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4H91 A;  1IP7 A;  1QTV A;  137L A;  2Z2F A;  4LT2 A;  1IP2 A;  4J1B A;  4BAP A;  1GDW A;  1A4V A;  2D91 A;  1L30 A;  1GE3 A;  1DI5 A;  259L A;  236L A;  4NIJ A;  2CDS A;  3JR6 A;  1LZT A;  2EIZ C;  1GFK A;  1J1P Y;  1C6B A;  1LJ4 A;  3ODU A;  1V7S A;  4I7M A;  1C63 A;  257L A;  1ALC A;  3RZE A;  2QAR C;  256L A;  1C6H A;  1OWY A;  1IP1 A;  1RCM A;  1IY3 A;  1DPW A;  1B7L A;  1PQM A;  2XBR A;  4DKL A;  1LZG A;  3E3D A;  109L A;  3V2W A;  5APD A;  1DYC A;  1L91 A;  4W59 A;  255L A;  154L A;  1L76 A;  1LPY A;  249L A;  217L A;  1NBY C;  1QTK A;  1WVV A;  5KKJ A;  1SQ2 L;  1T97 A;  1OUG A;  4NGZ A;  4WO6 A;  3A34 A;  1W6Z A;  164L A;  1IP6 A;  4RLN A;  4LT1 A;  1QTB A;  1JKB A;  4NHS A;  205L A;  3CSR A;  4NGK A;  1JTN A;  1QS9 A;  1RI8 B;  2MEI A;  1LJI A;  191L A;  1YAO A;  3AJN A;  3D9A C;  5HNC A;  2MEC A;  2L78 A;  1XSF A;  2Z39 A;  1D6P A;  2ZIK A;  4I7R A;  5K7O A;  177L A;  1GXV 2;  104L A;  4OWE A;  4WLY A;  4WM1 A;  3DN4 A;  1WQO A;  3HTD A;  1DI4 A;  1C6Q A;  2DQG Y;  4ARM B;  130L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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