The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
EVQQPDPMRKNWIMENMDSGVIYLLESWLKAKSQETGKEISDIFANAVEFNIVLKDWGKEKLEETNTEYQNQQRKLRKTYIEYYDR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of hypothetical protein NE0241 from Nitrosomonas europaea.
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein NE0241
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| source organism |
Nitrosomonas europaea
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| total genus |
29
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | NE0241-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Q67 A; 1M1K W; 1QNM A; 2W6I G; 4X62 B; 3ABL C; 3ZN1 A; 5KA5 A; 4I0X A; 4JYB A; 3GVM A; 2YEV B; 1IBL O; 4IGG A; 3CCE V; 5EBM C; 2M6Y A; 4TV9 A; 5CBF A; 1GN2 A; 4DV0 O; 5IYD O; 5JH7 B; 5IE9 A; 1XHZ A; 1KKC A; 2UXB B; 4GKK O; 3ZX6 A; 1Q8I A; 2DOS A; 3JAR A; 3RYI A; 1AB3 A; 1KC8 W; 1RPO A; 2ETN A; 1XRE A; 1YJ9 V; 1CPY A; 4D6T H; 3FYI B; 4MSW C; 2GUZ A; 2UXX A; 3JAT B; 4X1K B; 5IYZ A; 3I55 V; 4FM1 A; 5E1A C; 1M56 C; 1QLE C; 2F93 B; 2PY5 A; 1KUQ A; 1EZJ A; 2JGD B; 4X89 A; 4QE7 A; 2QTS A; 3ZN0 A; 3CS5 A; 4UCS A; 1N8R W; 2XAJ A; 3CC2 V; 1K4C C; 1XL6 A; 2QEX V; 4DR7 B; 1B3Q A; 1JPX A; 2YS8 A; 2Q7H A; 3UO3 A; 1K5S A; 3ZHT A; 1B6Q A; 1OJH A; 4O4J A; 4LF9 O; 1R6T A; 2H8P C; 3TET A; 3FAV B; 4CBC A; 3UO2 A; 2HEP A; 4FLW A; 2NNU A; 2CE4 A; 1GO3 F; 2EBO A; 1M93 A; 5IT9 N; 4DR2 O; 5CA1 A; 1GAX A; 5IDJ A; 3LDC A; 2GTA A; 2Q5Z A; 2FB5 A; 1GM9 A; 1XIL A; 1S5H C; 2VWK A; 2Y48 A; 2FL4 A; 4HNA B; 3QNE A; 1WA8 A; 1JFF A; 3RWR D; 1WB7 A; 1TA8 A; 5LMN B; 1Q86 W; 2ZNI A; 3T4Z A; 3UM7 A; 5KHG A; 4JTC B; 1UPG A; 1I08 A; 3ML0 A; 4JYC A; 1N34 B; 5EYP B; 3L72 H; 4WFH A; 4ZHQ A; 2YIC A; 3OAA G; 3SGI A; 4H37 A; 2E5L B; 4U3F H; 2ADP A; 1FS0 G; 3RYH A; 4TWK A; 1P49 A; 4O4H A; 2JEU A; 3HKD A; 5B1A C; 3QO5 A; 5DED A; 1DLB A; 3ABK C; 1I94 B; 1FJG O; 5LYJ A; 3ZIA G; 3UQ8 A; 3DSQ A; 3QTC A; 3RBZ A; 3T4D A; 3OEH G; 3JD4 A; 5BZB A; 2QWN B; 2ZXW B; 2CK3 G; 2EIL B; 4KXR A; 3AG3 B; 3ZJZ A; 4YHH B; 1GH6 A; 4PD4 F; 1GTO A; 3JD2 A; 2BOB C; 3GWK C; 1S77 D; 2BTQ B; 4CS4 A; 3JCZ A; 5C93 A; 5H5N A; 3EFF K; 2ARH A; 5FPO A; 2A7W A; 1VEW A; 1VIB A; 4AI8 A; 5LOV B; 5J2T A; 4LF5 B; 4W4L A; 1TUB A; 2WLL A; 4YJ3 A; 5DN6 G; 5IYB O; 2R72 A; 1NVP D; 3JAK B; 3BPZ A; 1IBK O; 4FZ0 A; 2A3Q A; 4UB6 Z; 1F23 A; 4PI2 A; 1XMQ O; 5JJE B; 4R7C A; 4B3R B; 4JI8 O; 5EC2 C; 4JI3 O; 4LF7 O; 1ZL8 B; 3TCU A; 1Y66 A; 4LFB B; 1VF6 A; 1VF5 B; 3AG1 C; 3O65 A; 2K9P A; 2CTP A; 1GK9 A; 4F6R B; 4DR4 B; 1K5Q A; 3X2Q B; 4DR1 B; 5B1B C; 2L6L A; 4CH5 A; 4I9W A; 3ZRX A; 3K59 A; 1G6U A; 1XNR O; 2Y69 C; 5LBQ A; 1N0N A; 3LSQ A; 3CJH A; 1NH2 D; 2IJJ A; 1F51 A; 4DRX A; 2OIE A; 1PD3 A; 2E3C A; 3IFX A; 2W6J G; 1AR5 A; 4TV8 A; 1H8H G; 1H2L A; 5CBH A; 3SYC A; 4CC5 A; 1MA1 A; 4F6E A; 2N04 A; 2WPD G; 3LNN A; 2OYQ A; 4O4L A; 1R3J C; 4DV0 B; 3K06 A; 5IJ9 A; 1VQL V; 1LNQ A; 4MTX A; 4X1I A; 1AJN A; 4GKK B; 1P84 F; 3F5W C; 4PA9 A; 1FD9 A; 1NVP B; 4JTD B; 1S5J A; 1G4Y B; 3JAL A; 1MZE A; 3H9V A; 3C3T A; 5EBL C; 3ASN B; 2RDC A; 2EIN B; 1QLN A; 4JI4 B; 4J7J A; 4K8X A; 3B8M A; 2QWO B; 5B3S B; 4J41 A; 2DMX A; 4DV4 B; 5FPR A; 3G6E V; 3G4S V; 5LGU A; 2ITC C; 4R50 A; 1J5E O; 1RSO B; 1XQ8 A; 4XDJ A; 2BSK B; 4Z1M G; 2JS5 A; 2A0L A; 1GRJ A; 2HLD G; 1NH2 B; 3OMN B; 3E22 A; 3CE2 A; 1O9G A; 4LF9 B; 3L9D A; 5JQG A; 4KHP O; 5C8Y B; 4J11 A; 4LCU C; 2Q6A A; 4UXN A; 4DR2 B; 1M57 C; 3L73 H; 1K9M W; 4TUY B; 1AI5 A; 2L35 A; 2RMK B; 2WLM A; 3AK2 A; 1P7G A; 3JAK A; 4EB6 A; 3TJT A; 2A79 B; 1QCE A; 2IU3 A; 3JSL A; 1WP7 A; 4AIL C; 2VQF B; 3ETQ A; 2YIB A; 2Q0O C; 3JAS B; 1SQF A; 2Z5U A; 4NXN O; 2JS3 A; 1HNX O; 3QF7 A; 1SQB H; 4ZKI A; 2IM9 A; 2UU9 O; 2ZDI A; 5EZY B; 1RP3 B; 5L3B A; 4MVQ A; 4JYA O; 1DF5 A; 1S3J A; 1BQ0 A; 3BAB A; 3ETG A; 4JYY A; 3MHS C; 3WB0 A; 1YIJ V; 4GLX A; 2R70 A; 1F7Y A; 1FJG B; 2YIA A; 5GW7 A; 1PKX A; 2PI5 A; 2PTM A; 4YIO A; 5CB4 B; 3OD4 A; 2YUA A; 4NXM O; 1K8A W; 1FXK B; 1EN4 A; 3M8A A; 2FYU H; 2UXC O; 5EBW C; 4LF4 B; 5BY1 A; 4RUE A; 1AR4 A; 1IBM B; 1Y76 A; 2BCC H; 4B7E A; 1WB8 A; 1Y67 A; 3Q4H B; 4DV7 B; 4O2A A; 1NR7 A; 4H0L B; 3WU2 Z; 3OUS A; 1N33 B; 4YJ2 A; 2EIM B; 3M99 B; 2JIZ G; 2EIK C; 4PDM A; 5GTI Z; 5IJ0 B; 4FIP C; 4WFB V; 4DV1 O; 3JCU Z; 4J42 A; 4BIU A; 1IBK B; 1V54 B; 1AI4 A; 1E1Q G; 3LSU A; 2K1E A; 1XMQ B; 1KEC A; 3BA8 A; 1BQZ A; 1YVW A; 4ZOL B; 1OCC B; 4JI8 B; 4JI3 B; 3VQY A; 4K3A A; 1XBL A; 1XNQ O; 4LF7 B; 4GX2 A; 3ZHQ A; 1O9H A; 2ZKO A; 3A0R A; 1K97 A; 5LHG A; 2LP7 A; 1OCR C; 1XL4 A; 1IVS A; 5A2Q N; 2P4K A; 3STZ C; 4MVO A; 2E75 B; 1RM1 B; 2F1M A; 1WPX A; 4YY3 O; 3K5L A; 3CRR A; 5B66 Z; 2QKA A; 1P7B A; 4NKG B; 1JOY A; 4OPA A; 4MTF A; 4LFA B; 1K7D A; 4MS2 A; 5LMU O; 5H6R A; 3ZRW B; 1K33 A; 1THZ A; 2LGQ A; 5K1X A; 3I56 V; 2X6A A; 3N2K B; 1GM8 A; 3DXR B; 2OCC C; 4NB5 A; 1TGO A; 2HP8 A; 3RYF A; 1XDC A; 4MVR A; 2GTS A; 3W7U A; 1W0K G; 3IC7 A; 3T1H O; 3EVK A; 3HKB A; 1UJW B; 1H2S B; 4FFB A; 3SPJ A; 4FLY A; 4MVS A; 1VF7 A; 1SQQ H; 4FLU A; 2Y4T A; 2IH3 C; 2P90 A; 3ZRS A; 4CH4 A; 5JJN B; 1A32 A; 1XEQ A; 3HPL C; 3JAW A; 1CXZ B; 2Q73 A; 4JI1 O; 2EJR A; 3L74 H; 3OTF A; 1J5E B; 1Q3E A; 3R65 A; 4Q20 A; 2EZP A; 2XUM A; 2HVK C; 1ORQ C; 4DUY B; 3UT5 B; 3ZS8 C; 2PF4 E; 5JVD B; 4IL6 Z; 5JJJ B; 3N2G A; 2Y4U A; 1HW7 A; 4PA7 A; 2QM4 A; 3DC6 A; 1WN7 A; 2KB1 A; 3N27 A; 4GT1 A; 3RYC B; 1Q81 W; 4BW9 A; 1NS1 A; 2XND G; 4IT5 A; 1HWY A; 4JI5 O; 2KG7 A; 5J2U B; 3UCS C; 2QTO A; 4NTY A; 2UUA O; 4AQY O; 4JI0 B; 4AHC A; 4NYK A; 5F2V O; 3SR2 C; 3OUF A; 2KKW A; 3ZCC A; 2WSS G; 1HNX B; 2DN9 A; 3A0H Z; 1YDX A; 2UU9 B; 3WG7 B; 2IBZ H; 1ZX3 A; 4IIJ A; 2Y0I A; 2EIK B; 1PL0 A; 2AXT Z; 1CP9 A; 2ATK C; 4PJ0 Z; 1H2M A; 4K35 A; 4EFB A; 1MOF A; 1ARO P; 1YCI A; 1EM1 A; 4JAV A; 1VP7 A; 1KD1 W; 2UUC B; 5KLV H; 2LFS A; 4X66 O; 2XTA A; 1UFI A; 1F4N A; 1IDS A; 3LNM B; 1R3I C; 2HKO A; 4IHJ B; 1VQ7 V; 4XDL A; 2B9Z A; 4NXM B; 2HG5 C; 5GTH Z; 3BVO A; 1KBH A; 3RN4 A; 3FFQ A; 4WBN B; 4ZI7 A; 4X88 A; 2JEX A; 3K0D A; 3IAY A; 1TVK A; 1Z5V A; 4G2K A; 2YDE A; 4BW5 A; 3KCX A; 4MW3 A; 5GON B; 1Q5O A; 3OGI B; 4L87 A; 3CRQ A; 5IWA B; 3CWB H; 1HP8 A; 4E4E A; 2WLI B; 4CC6 A; 4DV3 O; 1I5X A; 4BAY A; 3E86 A; 4DV1 B; 1V55 C; 4B08 A; 4C7U A; 4P9O A; 4G28 B; 1VQ8 V; 3APQ A; 3KCY A; 2X6B A; 4GKJ O; 3CCS V; 1XNQ B; 1TUE B; 3SYA A; 4RAI A; 4U3J B; 5FLX N; 1XMO O; 5AG2 A; 2HFE C; 1KB9 F; 2QWP B; 4FLZ A; 5KX5 A; 4JZ2 A; 3ZHU A; 2EX3 A; 3KKY A; 1AR1 B; 1PL4 A; 1HNW O; 3ZMS A; 3BY6 A; 1FFX B; 2CUG A; 1JA8 A; 4DV2 O; 2QM7 A; 2WLJ A; 5ITZ B; 4YXW G; 1WJZ A; 4DK0 A; 2Q7E A; 4I9Q A; 3H01 A; 1AP6 A; 5LMU B; 1GKF A; 4O4I B; 1VQM V; 1IXB A; 3IC9 A; 1MAB G; 4JI6 O; 4CH3 A; 2X0L A; 2F4V O; 4X64 O; 1MZF A; 4JI2 O; 4KP4 A; 2ZR3 A; 3AG4 B; 4PA6 A; 5L3C A; 3JD1 A; 4LWS A; 3SYP A; 5CBG A; 4KFM A; 4I5S A; 4LH7 A; 5HFM A; 2PI4 A; 1DTO A; 1YJN V; 2B1I A; 1Q43 A; 1JJO A; 4JAS A; 2FTK A; 1D5A A; 3CEI A; 3ASO C; 4I4T B; 1KU9 A; 4U7N A; 2Q0A A; 4PA4 A; 2YID A; 3G67 A; 1VQ9 V; 2P22 C; 2WLH A; 5EK0 A; 1ENV A; 4TQD A; 1U96 A; 3U11 A; 5KA6 A; 2LJ2 A; 2YEV A; 4MVU A; 2CTQ A; 1BSM A; 2W0F C; 3BEH A; 3DTU B; 4R8C A; 5JH7 A; 1AJP A; 2EZO A; 2G38 A; 3T1Y O; 5LXT B; 4XBF A; 5E79 Z; 1SA0 B; 4JGS A; 3ABL B; 1E79 G; 4K0K B; 3P3N A; 4KL1 A; 2GSM B; 4H33 A; 3JAT A; 3ZHV A; 4X1K A; 1Y6X A; 2N05 A; 4O2B B; 2DYR C; 3HR0 A; 3HKC B; 2JGD A; 1NZ6 A; 2P6J A; 3KG2 A; 2UUA B; 5B1O A; 4P30 A; 1YZB A; 5KHJ A; 4KUM A; 3BA9 A; 2VWJ A; 1KQS U; 1JJ2 U; 4I7Z B; 1M5I A; 4BIO A; 4DUZ O; 1Z2G A; 3K03 A; 3CMA V; 4GUN A; 1AI6 A; 1VQ6 V; 1SZT A; 1SQV H; 1M56 B; 1QLE B; 3BFR A; 4LFC O; 1R73 A; 4RWU A; 3J80 N; 1BHB A; 5KMG B; 3E89 A; 3B4S A; 5LP6 C; 3FB8 C; 3K57 A; 4JI7 O; 4X66 B; 3FAV A; 3DGE A; 3HKE B; 2OCH A; 1G1X B; 1IBL B; 3ABM C; 1Q90 D; 2ZNJ A; 2CH7 B; 5BMV B; 2V4D A; 1IZ3 A; 1YI2 V; 3G80 A; 4WF9 V; 1SQX H; 2BTO A; 4MW8 A; 1HR0 O; 1ZAU A; 2VRZ A; 3H1I H; 4HNA A; 2BE3 A; 1VMG A; 3GWO A; 4OGQ B; 3PN1 A; 1SF9 A; 4P2Z A; 1L0N H; 1EN5 A; 5LGN A; 1PP9 H; 2UUB O; 5EYP A; 3SJB C; 2H94 A; 4FFK A; 4GCZ A; 2Q8V A; 4X20 B; 2A9H A; 5CA0 B; 4LNU B; 3F7V C; 4LF8 O; 4CS2 A; 3IGA C; 3CCM V; 4DV5 O; 4DYL A; 1NI8 A; 5IYC O; 1PNK A; 3F7Y C; 4GKJ B; 2B5U A; 2CGO A; 4N23 A; 2PZS A; 2QR4 A; 2R9A A; 3AG2 C; 2Y0P A; 1XMO B; 2WA3 A; 1OZ0 A; 5B1A B; 4GX0 A; 4YIP A; 2UXD O; 3ABK B; 2BTQ A; 3B2E E; 5EIB C; 1OV9 A; 4I50 B; 4WFA V; 4QGP A; 1RPR A; 4LF6 O; 4I55 B; 4RO2 A; 5LA6 B; 3A8T A; 4DV2 B; 5LOV A; 1SET A; 1YEW A; 4TT3 G; 4JV5 O; 2DWD C; 4NVP A; 2V1D A; 4Z1V A; 2KSD A; 2GBO A; 1BCC H; 3UKM A; 3GB7 C; 4HBN A; 2F4V B; 2B1G A; 3HKC A; 3RT3 C; 2F23 A; 3CHX A; 3OW2 U; 1W2B U; 1VQO V; 2EJ7 A; 1ZL8 A; 4JAU A; 5HFL A; 3SPG A; 1W0J G; 2PYL A; 3I5D A; 4R6Z A; 5H2F Z; 4F6R A; 1Y74 B; 4DR3 O; 1QHT A; 1N32 O; 2AGA A; 3CCJ V; 1OCZ C; 5CMU A; 4MTG A; 1R3L C; 3D3I A; 2Q68 A; 1J95 A; 2LQT A; 3P3P A; 3AG1 B; 4X62 O; 2AW9 A; 4N21 A; 1Q82 W; 2XAS A; 3LUT B; 5B1B B; 4PI0 A; 3OMA B; 2Y69 B; 3TXS A; 3CRM A; 5DEC A; 1NU1 H; 3T1Y B; 5LP6 B; 1NKD A; 1VQN V; 3CCL V; 1K34 A; 2ADQ B; 4K8Z A; 1FYJ A; 2Q9L A; 2AZ0 A; 1MMM A; 2QDO A; 1HNZ O; 3OTO O; 5KHI A; 1QR9 A; 3ZMV A; 5B1N A; 4GZR B; 3RVY A; 4X1Y B; 2AHY A; 2NR5 A; 4DUZ B; 3H1L H; 5LHH A; 3K9A A; 1BMF G; 1Q6U A; 4H44 B; 2IW5 A; 4GX1 A; 1XNR B; 3APO A; 2WAM A; 1BT8 A; 1RSO A; 1F4M A; 1T5E A; 4LFC B; 4UCR A; 4DXW A; 4UFZ A; 4L8J A; 2BSK A; 3KZI Z; 2LW7 A; 3OGC C; 3JAM N; 4JI7 B; 1NTM H; 5LGT A; 1H2K A; 2ZE7 A; 4RQE A; 2Z0A A; 2OTJ V; 5C8Y A; 4I0X B; 4OX9 O; 1YIT V; 2GV9 A; 4FPP A; 4TV9 B; 2QKC A; 2ZE5 A; 5D5Q A; 4TUY A; 1HR0 B; 3SPH A; 1MG1 A; 4JZG A; 4XDK A; 2IH1 C; 1VF6 C; 3JAR B; 3RYI B; 3JAS A; 1KKD A; 1I0H A; 3AK1 A; 2GUZ B; 1M57 B; 5IYZ B; 5EZY A; 1BE3 H; 3D3Q A; 1K4D C; 1WP8 A; 3AK3 A; 3K0G A; 1JMK C; 1BHA A; 1DGS A; 2O57 A; 3K5N A; 4DV5 B; 3ZHS A; 4PEL A; 4HYO A; 5CB4 A; 3SJC C; 1FXK A; 1MNG A; 2WA4 A; 2CGN A; 4JTA B; 3FB5 C; 4QIW F; 3D8C A; 5JCO A; 1CEZ A; 4FJC C; 1R6K A; 2R9I A; 5D5P A; 1EFR G; 4O4J B; 4KHP B; 3BRC A; 2YXH A; 3Q4H A; 1EN6 A; 1PV0 A; 3OEE G; 2YXL A; 1YTF D; 2PUS A; 4LF6 B; 5CA1 B; 3IJ4 A; 4DR6 O; 4JV5 B; 4LF5 O; 5IJ0 A; 1JQ0 A; 4PDV A; 1WAZ A; 2ZE6 A; 5K1P A; 3E83 A; 2DQ0 A; 5KHH A; 1JFF B; 2ZT9 B; 2IJK A; 3LDD A; 4NXN B; 1Q6I A; 1QQC A; 3VBB A; 4ZOL A; 3FX7 A; 2DQ3 A; 3J7A U; 3TXQ A; 4DV6 O; 4JYA B; 4B3R O; 4ZHQ B; 3E8G A; 2V7Q G; 2YXY A; 2UXN A; 4QE9 A; 5BR8 O; 3W7W A; 2FML A; 3SYO A; 2ZXW C; 1NJI W; 2LGW A; 3RYH B; 2KQX A; 3B77 A; 4LFB O; 1ZSP A; 4O4H B; 1BL8 A; 2EIL C; 3AG3 C; 1K3E A; 1WNS A; 3HKD B; 3NR7 A; 4DR3 B; 4HZ3 A; 4DR4 O; 4FLV A; 4D7S A; 2QWQ B; 3EXA A; 3K5O A; 5LYJ B; 4RUF A; 4A5U B; 2ZR2 A; 2UXC B; 3OFN G; 2XAH A; 5A9G A; 1AIL A; 1SES A; 2WLN A; 2CAZ C; 4JAA A; 1H8E G; 4WFE A; 2LFR A; 5L3D A; 1OCR B; 3ZRW A; 1YTF B; 2RQ6 A; 1K73 W; 3ETE A; 3MDS A; 4UCV A; 4F4L A; 3N2K A; 3PJS K; 3ZED A; 3MAQ A; 2ZDI C; 4CZZ A; 5J2T B; 1NTZ H; 1TUB B; 2MK3 A; 2WLL B; 3DXR A; 2WLK A; 4YJ3 B; 2OWO A; 1OCO C; 2DE0 X; 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