The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
EVQQPDPMRKNWIMENMDSGVIYLLESWLKAKSQETGKEISDIFANAVEFNIVLKDWGKEKLEETNTEYQNQQRKLRKTYIEYYDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of hypothetical protein NE0241 from Nitrosomonas europaea.
rcsb |
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| source organism |
Nitrosomonas europaea
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| molecule keywords |
hypothetical protein NE0241
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| total genus |
29
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | NE0241-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QA4 V; 4DR1 B; 2OTL V; 1D2D A; 3SPI A; 1ZUQ A; 1N34 B; 1YXB A; 2EX3 A; 4B08 A; 3ABL B; 2L35 A; 1Q6U A; 2PTM A; 2DE0 X; 4K8Z A; 2PZS A; 2L6L A; 1FAF A; 2DQ0 A; 4LF9 O; 5TIS Z; 3CC2 V; 4X64 O; 3MDS A; 2PF4 E; 1SA0 B; 4X65 B; 3K5N A; 5IYZ B; 1GM8 A; 4LNU A; 5BXZ A; 3ABU A; 3K5L A; 1H2L A; 2HG5 C; 3JD3 A; 2CTP A; 4Q6G A; 3JAL A; 4G28 B; 2P67 A; 3FYI B; 4GKJ B; 2YIA A; 3UT5 B; 4QJF B; 5L3C A; 4CH3 A; 4EEQ A; 2HJF C; 2DWD C; 4FIP C; 1EN4 A; 2MW2 B; 2B9Z A; 1YCI A; 1S5J A; 3WU2 Z; 1QLE B; 1FXK C; 2GTS A; 2ZR3 A; 5B1O A; 1L8D A; 1YJN V; 2ARH A; 2ZE6 A; 4DR5 B; 5EYP A; 5J2U B; 4ASU G; 1B3Q A; 3QO8 A; 2XAQ A; 3OTO O; 4DV1 B; 4LF8 O; 1W59 A; 4HAM A; 2F43 G; 4LF7 B; 4GX5 A; 3IAY A; 5IE9 A; 1BSM A; 1TUB A; 2Z3Y A; 3CSX A; 3W7X A; 1VQP V; 1KMI Z; 1KP2 A; 1AIL A; 3RYC B; 2BE3 A; 1SQX H; 2F66 C; 2NN4 A; 4CS2 A; 4WFE A; 3CCJ V; 4B3T B; 4D7T A; 3T4D A; 3HKB B; 4UVB A; 4DR3 O; 4LBE C; 4TQD A; 1XUQ A; 2ZM6 O; 1YTF D; 4JAU A; 3ZS8 C; 5IJ9 A; 3AG2 B; 1VQ4 V; 1K5Q A; 2HVK C; 2W6J G; 2UXD B; 3LDC A; 4QGP A; 2WLL B; 3GWK C; 1NKD A; 1JJO A; 4D6T H; 1LUW A; 4DUZ B; 4JAS A; 4E4E A; 2ZQM A; 2DYS B; 3APQ A; 3OE7 G; 1XL6 A; 3JCU Z; 3JAW B; 1AVM A; 4B3M O; 1WA8 B; 4J7K A; 4U3F H; 2Q7H A; 1N32 B; 2WLH A; 3PJS K; 5ITZ A; 5JCO A; 2WPD G; 2WLI A; 5LGN A; 3STZ C; 3CP1 A; 2OT5 A; 1DF4 A; 1OV9 A; 4DR7 O; 1XEQ A; 5GON B; 3OR7 C; 2BOC C; 2DOS A; 3KCY A; 4LR3 A; 2RJZ A; 5CN0 A; 3CXH F; 2A79 B; 3K9A A; 3CCL V; 2YUA A; 2A0L A; 2UUC O; 2E75 B; 1AJQ A; 3RVY A; 2F93 B; 4I55 B; 1EM1 A; 2OCC C; 4RQF A; 5CA3 A; 5LP6 A; 3RYF A; 1OZ0 A; 2EJR A; 3MD0 A; 2VS0 A; 4NXN B; 1O9G A; 4DV3 O; 3P3P A; 5IDJ A; 5KHG A; 2BSK A; 4X1I A; 1G4Y B; 1K9M W; 3AG4 C; 1PM9 A; 3HKC A; 2KSD A; 5JH7 A; 3OGI B; 1JJ2 U; 4X62 O; 1YJ9 V; 3U0Z A; 1XNQ B; 3ZMT A; 5CBF A; 2CDY A; 3CCM V; 3SYC A; 1JCH A; 2CH7 A; 1SC5 B; 3BRC A; 4PJ0 Z; 1IX9 A; 4OPA A; 4RUF A; 1JQ0 A; 5L3G A; 4DV6 O; 1S5L Z; 5GW7 A; 4ZOL B; 2YXH A; 5L3D A; 4TV9 A; 3ZED A; 2NNU A; 1QLN A; 5H5N A; 1HNX B; 2QWO B; 5KLV H; 4UCR A; 3APO A; 3E8G A; 4O4H A; 2AZ2 A; 3VQX A; 4LFA B; 2JVD A; 1VEW A; 5EC1 C; 4B7E A; 4IIJ B; 1SQV H; 5C8Y B; 1IBM B; 1IBK B; 4DR6 B; 1TUE B; 1PD3 A; 3D36 C; 1NBM G; 2DYR C; 2F1M A; 1SRY A; 2W0F C; 3PN1 A; 3RYI A; 4KL1 A; 1H38 A; 2V7Q G; 1N0J A; 1WB7 A; 3JAK A; 4F6R B; 2OWO A; 5LGT A; 2IH3 C; 1E1Q G; 3ZRW B; 3R65 A; 4LFC B; 4CH6 A; 3OMI B; 3D3I A; 1YIT V; 2RN9 A; 2JIZ G; 4JTD B; 4GZR B; 2AZ0 A; 4BR6 A; 2JGD B; 1MG1 A; 4LFB B; 3CEI A; 4X66 B; 4MSW C; 4CH5 A; 1OCC B; 1KQS U; 2QR4 A; 5J2T A; 3ABK C; 2UXB O; 1OJH A; 4EFB A; 3E22 B; 3ABT A; 1G6U A; 3OMA B; 3WB0 A; 1OCR C; 2IJK A; 5IYC O; 1XRE A; 4Z1V A; 4J7Z A; 3HKD B; 1H2S B; 4CZZ A; 1YZB A; 4H37 A; 1F7Y A; 1AB3 A; 4ZIB A; 1HNW O; 1S76 D; 2Z5U A; 5CA0 A; 2EZO A; 1KD1 W; 3LNN A; 1K8A W; 5EIB C; 1K4D C; 3SGI A; 2P5O A; 4MTF A; 4DV2 B; 1NTZ H; 4H44 B; 3K59 A; 3ZHV A; 3CC4 V; 1Y76 B; 1WA8 A; 2E5L O; 1SQP H; 1VQK V; 4MVR A; 5LGU A; 2IM9 A; 4PI2 A; 3OW2 U; 3ASO C; 4PDL A; 2ZXW B; 1AR4 A; 1V55 B; 4XDJ A; 4K0K O; 2MK3 A; 4KFM A; 2KG7 A; 2RNB A; 4YIO A; 2XAF A; 3CRC A; 4J42 A; 2Q69 A; 4IL6 Z; 3RBZ A; 4P30 A; 5KHK A; 4DK0 A; 4I4T B; 4I55 A; 3SPJ A; 2WLK A; 2N04 A; 3UM7 A; 2QDO A; 2B5U A; 2UXC B; 2WLJ A; 1H8E G; 3CYO A; 1NT2 B; 2D3O W; 3ASN C; 5KAF Z; 3W7U A; 5BMV B; 2ITD C; 3L70 H; 2IBZ H; 2Q6A A; 1GKF A; 4X1Y A; 3E35 A; 1XMO O; 4QPJ A; 1Q6I A; 2EIJ C; 5KAI Z; 1FXK B; 5CB4 B; 1PPJ H; 4KHP O; 4O4L A; 1HNZ O; 4CBC A; 3RN4 A; 3IGA C; 2IH1 C; 1NTM H; 1CXZ B; 1IBL O; 1PNM A; 5JVD B; 2LGQ A; 1NZ6 A; 4FLV A; 3LSS A; 1XL4 A; 5KMG A; 1R3J C; 1URF A; 2VWK A; 3LDD A; 1NS1 A; 4PHZ A; 1BGY H; 1HP8 A; 1IXM A; 1ZL8 A; 1R1B A; 1WLE A; 4B3R B; 3H9V A; 2BTQ A; 4X20 A; 4IIJ A; 4JI7 O; 3A0R A; 1ZLZ A; 1XOU A; 3FD9 A; 2VQF O; 3DSQ A; 1SQB H; 1BS3 A; 3H1I H; 1LR1 A; 2RQ6 A; 3DC6 A; 1JVM A; 3ZRW A; 1KC8 W; 2UUB O; 2LW7 A; 1FFX B; 2BTO A; 3N2G B; 1I5Y A; 4YHH O; 3E89 A; 1XDC A; 3P32 A; 3A0B Z; 3QNE A; 3CME V; 2YEV A; 4LP8 A; 4KXR A; 5EZY A; 3X2Q C; 2WA3 A; 1K3E A; 2HFE C; 4BIU A; 3TGU H; 1QNM A; 4P9P A; 2Q0A A; 1I94 O; 2DJV A; 4FFB B; 1K73 W; 3K79 A; 1K34 A; 4LF9 B; 4DRX A; 4X64 B; 4MVM A; 3K03 A; 4BAY A; 1MNG A; 4MVZ A; 1YEW A; 1FD9 A; 1HR0 O; 2AGA A; 3JAT B; 1Y67 A; 3D3Q A; 4J7J A; 3OTF A; 1XNR O; 2GV9 A; 1GO3 F; 2XAG A; 3ZHQ A; 3SJB C; 2WSS G; 1YTF B; 3QO5 A; 4YXW G; 2FB5 A; 4I0X B; 2Z0A A; 1YJW V; 3ZJZ A; 3G4S V; 3LSU A; 2DWE C; 4DR4 O; 2OCC B; 3LUT B; 2UU9 B; 1UJW B; 3ICX A; 1Y76 A; 3ETD A; 4UV8 A; 1GM7 A; 3FX7 A; 1VF6 A; 4JAA A; 3ZN0 A; 2A9H A; 4JI6 O; 3JAS B; 3N27 A; 1NR1 A; 2YI8 A; 2YSU B; 3K5O A; 1H2N A; 4FJC C; 3AG4 B; 1S5H C; 3CX5 F; 1IUR A; 2ZKO A; 3OTO B; 3FKS G; 4LF8 B; 4X1K B; 1M57 C; 4DYL A; 2A06 H; 1XBL A; 3OEH G; 3TET A; 2IU3 A; 1N8R W; 4GX0 A; 1BHB A; 1R73 A; 5HFL A; 1JOY A; 3SYO A; 3WFV A; 2ZE5 A; 4IHJ B; 1ROP A; 2HKO A; 5KUK A; 2R70 A; 4DR3 B; 5CA1 B; 2ZM6 B; 4DV5 O; 1PV0 A; 1YIJ V; 4PA9 A; 2GSM B; 3VQV A; 1JPX A; 2PY5 A; 4C7U A; 5BMV A; 3TK1 A; 4CC5 A; 3EXA A; 3ML0 A; 2DYR B; 3B8N A; 2R9R B; 3L75 H; 4B3M B; 2X0L A; 1VP7 A; 1FXK A; 4X8A A; 5CB4 A; 2NR5 A; 3ZCC A; 2GUZ B; 4DK1 A; 1IXB A; 4DV4 O; 4TOI A; 1VMG A; 4DR7 B; 3A8T A; 2EBO A; 4OX9 O; 3K0G A; 5LXT B; 1A32 A; 5LHG A; 1H2G A; 4U3J A; 3OT7 A; 5D5P A; 3AG1 C; 4I50 A; 5F2V O; 2UUC B; 2IJI A; 2YIB D; 1N0N A; 3CCR V; 5LHI A; 1VQO V; 3ABK B; 3K06 A; 1AP6 A; 3E2E A; 5B3S C; 5FLX N; 1OCR B; 2Q68 A; 3B77 A; 2AW9 A; 2VQE O; 1BZK A; 1Y74 A; 1YDX A; 4LF6 O; 1TVK B; 4PDR A; 5LBQ A; 3RYH B; 4DV3 B; 4YJ2 A; 1TA8 A; 1ZWI C; 2DQ3 A; 2LP7 A; 1Y66 A; 4JI0 O; 1FFX A; 4O2A B; 5FPO A; 3N2G A; 1LUV A; 3EVK A; 2CUG A; 3G6B A; 4JYC A; 3E8H A; 4X62 B; 4NXM O; 1KBH A; 4RQE A; 1XHZ A; 1M5I A; 1E1R G; 1PP9 H; 2FML A; 1FKA O; 4K8X A; 4DV6 B; 5H6Q A; 4I5S A; 4PA6 A; 2QWN B; 3U10 A; 1K4C C; 3ASO B; 3OMN B; 2Q4P A; 3RWR D; 1COW G; 3GB7 C; 1YSC A; 3T1H O; 1M4U A; 4GKK O; 2YXY A; 3CD6 V; 4JYY A; 1M1K W; 1AI4 A; 4TWK A; 3M7M X; 1VAR A; 4EB6 A; 2JJ2 G; 5AG2 A; 1Y6X A; 4I0X A; 1OHH G; 3ZN1 A; 3IC9 A; 1GTO A; 3QVN A; 2E76 B; 4FLW A; 1ORQ C; 1PKX A; 4RAI A; 3K9S A; 1KB9 F; 1SKV A; 3ETE A; 3ASN B; 4ABM A; 2XHB A; 4JYA O; 4LWS A; 2WLN A; 2Q8V A; 1BQ0 A; 1PL0 A; 3H01 A; 4TV8 A; 2QWR B; 3CC7 V; 1N36 O; 1P84 F; 2EIJ B; 1SQQ H; 4LF5 O; 1BE3 H; 3H1K H; 2UXB B; 1JX9 A; 2LFS A; 4JF3 A; 1US6 A; 2LW1 A; 3Q4H B; 5FPR A; 3TXS A; 3KZI Z; 5HFM A; 4PA3 A; 1RM1 C; 4DR2 O; 2ZE8 A; 4AIL C; 1PL4 A; 4NTW A; 4WFH A; 4ZI7 B; 1HNW B; 2JGU A; 2W0X A; 5A9G A; 1JA8 A; 3CJH A; 3JSL A; 1R3I C; 1Z5W A; 4QE7 A; 4MVO A; 3ZRS A; 4X9Q A; 3CPW U; 1F51 A; 4RO2 A; 5LYJ B; 5KX5 B; 2O57 A; 1VF7 A; 2QKS A; 4AQY O; 5BY1 A; 2E5L B; 3AG7 A; 4PV1 B; 1MZF A; 2A7W A; 4GYC B; 3LNM B; 2WAM A; 3J80 N; 3P3N A; 4WFB V; 3EFF K; 2XOK G; 3QF7 A; 4K0K B; 4KP4 A; 5IT9 N; 5LXT A; 4J80 A; 4O2B B; 3X2Q B; 3WB1 A; 2ZCE A; 4JI3 O; 4YIP A; 4F6E A; 1P4R A; 1YVW A; 4J9Y B; 4FK5 C; 3A0H Z; 2ZT9 B; 2RDC A; 4I9Q A; 1Q7Y W; 1EN5 A; 3S3X A; 2B1I A; 3CWB H; 3VOU A; 1NH2 D; 3ZBH A; 4L87 A; 4O2A A; 3RVZ A; 2KKW A; 1SA0 A; 4HYO A; 4W4K A; 1XMO B; 5IYZ A; 2ADP A; 2EZP A; 1K5S A; 1JFF B; 4KHP B; 1HNZ B; 3I55 V; 2IU0 A; 4AHC A; 1IBL B; 1FS0 G; 3UT5 A; 3BVO A; 4QPK A; 4CH4 A; 3CB2 A; 5JCO C; 2Y0P A; 3H1J H; 2ZNI A; 1VIB A; 2OCH A; 3WB2 A; 1VQL V; 2JS5 A; 3OD4 A; 1M93 A; 1M57 B; 5J2U A; 4ZHQ B; 1XI1 A; 1HWY A; 4JYB A; 4JI7 B; 2X6C A; 3AK1 A; 2YXL A; 2P6J A; 2Y0I A; 2VQF B; 4HNA B; 3JAR B; 2ODM A; 2RMK B; 1YHQ V; 3ZMZ A; 1GN4 A; 3K57 A; 2AHY A; 5K1X A; 2UUB B; 3RYC A; 4TUY B; 1H8H G; 4JI1 O; 4YHH B; 4X89 A; 2YID A; 5KUM A; 3HKB A; 1Q90 D; 3B4S A; 1GMG A; 1VF5 B; 3K5M A; 5LMU O; 1NQT A; 3JAM N; 3HKE B; 2WLL A; 1I94 B; 1V9P A; 2KB1 A; 1QR8 A; 1QR9 A; 3HPL C; 4N21 A; 1KP3 A; 1TAE A; 3Q4H A; 3JAW A; 3CRQ A; 4XDL A; 2JRI A; 3AK2 A; 3BEH A; 1Y4M A; 2OTJ V; 4WFA V; 4UCO A; 4RWU A; 1HR0 B; 1FFT B; 3AG1 B; 2Q9L A; 1BCC H; 2VRZ A; 3K0D A; 1XNR B; 2R9A A; 3ABM C; 2CTQ A; 4YY3 O; 2PGG A; 5GON A; 1EFR G; 5B3S B; 2ITC C; 4IT5 A; 4DR4 B; 5A2Q N; 4QIW F; 4U7N A; 5KX5 A; 3N2K B; 1QVF U; 1MA1 A; 5FNV B; 2EIM C; 5C93 A; 4JI6 B; 4L8J A; 5LOV B; 3RT3 C; 4E2L A; 1AR5 A; 4LF4 O; 2Q67 A; 1XMQ O; 4H33 A; 1GN6 A; 3VBB A; 3L72 H; 1XIL A; 1ZAU A; 2IJH A; 4NR1 A; 1QVG U; 4PD4 F; 4JGS A; 1J5E O; 1CP9 A; 2PI4 A; 3T4Z A; 2V1D A; 1SZT A; 2Y4T A; 3JCZ A; 2Y4U A; 2QWP B; 4TSF G; 4GX1 A; 2M7W A; 4WFG A; 3EHB B; 1F4M A; 3S3W A; 4JTA B; 2BCC H; 1KYO F; 4YJ3 B; 4DV5 B; 4O4J B; 2P90 A; 1V54 C; 1K92 A; 4ZOL A; 1HNX O; 2IJJ A; 1PNL A; 3P30 A; 1P49 A; 4GT1 A; 1NJI W; 1Q3E A; 3E83 A; 2OIE A; 1NU1 H; 4JI4 O; 1WJZ A; 5C8Y A; 1GN2 A; 3ZMV A; 2Y69 C; 4DV4 B; 4DV7 O; 2JS3 A; 2XT9 A; 1WN7 A; 2M6Y A; 3CRM A; 3CS5 A; 1KKC A; 3OUF A; 3TCU A; 4OX9 B; 3HR0 A; 2X7R B; 4F6R A; 1RSO B; 3K3W A; 3L9D A; 2ZDI A; 4FLT A; 2CTW A; 4JI2 O; 1AI6 A; 5BR8 O; 2UXN A; 1ENV A; 1AI7 A; 1KU9 A; 4UV9 A; 2P4V A; 5L3B A; 5B1B C; 3BFR A; 4UVC A; 2ETN A; 2UUA O; 2JK5 C; 2JGD A; 4ZKI A; 4HNA A; 1RM1 B; 4LF6 B; 2CK3 G; 3QTC A; 2JEX A; 4UFZ A; 3J7A U; 1M90 W; 3E22 A; 3T2M A; 2H3O A; 4JV5 O; 1WP8 A; 3RW0 A; 2QM8 A; 4FM2 A; 2JDI G; 4LNU B; 4JI0 B; 1DTO A; 1GN3 A; 2ILM A; 3H1H H; 3HKD A; 3ZHT A; 1N4C A; 3IJ4 A; 3JAL B; 4NXM B; 4JI8 O; 2K1E A; 3IFX A; 3FAV B; 3B8M A; 4AI8 A; 1VQ5 V; 4JZ2 A; 1MSD A; 1DK1 A; 3GWO A; 2EIN C; 3T1H B; 4W4L A; 4GKK B; 3CE2 A; 3T1C A; 2ATK C; 3HB3 B; 3ZRV A; 2H94 A; 1ARO P; 5B1N A; 1E79 G; 4OPH A; 4IYI A; 4MW3 A; 2F4V O; 1WP7 A; 2CGO A; 1GH6 A; 5GTI Z; 4FLZ A; 1VQ6 V; 3O9O A; 2ADQ B; 1Q8I A; 2DMX A; 2XND G; 3E86 A; 4UCV A; 5LOV A; 3GVM A; 3ZHS A; 3CXC U; 4JYA B; 1NR7 A; 2X6A A; 2B1G A; 5IJ9 B; 4I4T A; 2V4D A; 1YI2 V; 1N36 B; 3C3S A; 3SYQ A; 4BWA A; 3CRA A; 1QU7 A; 4LF5 B; 5LMN O; 3F5T A; 5IJ0 B; 3L71 H; 4FM0 A; 2WA4 A; 1SET A; 5KHJ A; 2ZNJ A; 2HLD G; 4EKW A; 2EIL C; 2WLI B; 3DTU B; 4DR2 B; 4NYK A; 3BPZ A; 2HJD A; 3T1Y O; 5JVD A; 1R6T A; 3JD0 A; 5KHH A; 2ZIO A; 1UPG A; 4G27 B; 1NH2 B; 4K3A A; 2Q5Z A; 4AQY B; 2F95 B; 2CAZ C; 5LA6 B; 4MTX A; 1O9H A; 3DXR B; 1DF5 A; 1RPR A; 1R6N A; 3STL C; 5IWA O; 5B1A C; 1FYJ A; 4FVM A; 1M56 C; 1H2K A; 4MVS A; 1I0H A; 1VF6 C; 1OCO C; 2BSK B; 5LHH A; 1SQF A; 4DUY O; 3VQY A; 1B6Q A; 1RSO A; 1VQN V; 4UVA A; 3HKC B; 4JI3 B; 5JH7 B; 5KA6 A; 5L3E A; 2HR3 A; 2GBO A; 3B2E E; 2LO1 A; 1Q81 W; 4GUN A; 1S77 D; 2CH7 B; 2YS8 A; 3CRR A; 2Q7G A; 1QBZ A; 3KCX A; 1FPO A; 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