The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
86
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structure length |
86
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Chain Sequence |
EVQQPDPMRKNWIMENMDSGVIYLLESWLKAKSQETGKEISDIFANAVEFNIVLKDWGKEKLEETNTEYQNQQRKLRKTYIEYYDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
X-ray crystal structure of hypothetical protein NE0241 from Nitrosomonas europaea.
rcsb |
| molecule keywords |
hypothetical protein NE0241
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| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
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| source organism |
Nitrosomonas europaea
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| total genus |
29
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| structure length |
86
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| sequence length |
86
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-06-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | NE0241-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1ZX3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 5H6Q A; 1NKD A; 2Y0I A; 4CH6 A; 3E83 A; 2WA4 A; 1IUR A; 1WB7 A; 4X62 O; 4EKW A; 1SZX A; 1H8H G; 4E2L A; 4LH6 A; 1R6N A; 5CA0 B; 2WLI A; 2CUG A; 3ML0 A; 2EIM C; 1QBZ A; 3UKM A; 3RN4 A; 1MSD A; 4DW0 A; 4UVA A; 3FAV A; 4ZIB A; 1N34 O; 3CCL V; 3AG4 B; 3ASO B; 4C7U A; 3ABT A; 2QEX V; 3EVK A; 2E5L B; 3CRQ A; 1AP5 A; 2F95 B; 2XAQ A; 1K7D A; 3ABM B; 1R73 A; 4EB6 B; 4DR3 O; 3F7V C; 4KL1 A; 4JI6 B; 3SYC A; 1Q7Y W; 3JAS A; 3KZI Z; 4RWU A; 1KMI Z; 2GUZ A; 1OCC C; 5ITZ A; 1BE3 H; 2WLL A; 1XMO O; 1ZTE A; 1HNZ B; 4NTY A; 3HKB A; 5D5Q A; 4PHZ A; 2A0L A; 2CGO A; 2AZ0 A; 1YVW A; 5BY1 A; 2P7T C; 4PI2 A; 3ZRW B; 1VQL V; 4EEQ A; 4EFE A; 4LF5 B; 3D3Q A; 4PDR A; 3ZMZ A; 3OMA B; 2F23 A; 4UCU A; 5GTH Z; 1Y76 B; 3AK1 A; 2LW7 A; 1EM1 A; 4IHJ B; 5LGT A; 4F6R A; 2Z3Y A; 4JI5 O; 5CB4 A; 4IIJ B; 5K1P A; 1Q82 W; 1V55 B; 2ZQM A; 1YDX A; 3DTU B; 3EFF K; 1SQQ H; 4WFA V; 2V4D A; 4LF9 B; 3A2F A; 4X66 B; 1N32 O; 4DK0 A; 2QJ1 A; 1M9N A; 4HNA A; 1NT2 B; 1TVK B; 4X8A A; 4YIP A; 4RQF A; 1N34 B; 3BVO A; 4LF8 O; 1YF2 A; 1NU1 H; 4L8J A; 1AVM A; 4CC6 A; 1ZSP A; 4TWK A; 3MHH C; 5EYP B; 1BHA A; 4DR4 O; 1Q86 W; 4FJC C; 1XNR B; 4DR3 B; 3HKE A; 4AIL C; 4Q6G A; 3K04 A; 4J9Y B; 2F4V O; 2RNB A; 3D8C A; 1K9M W; 3OMN B; 4HZ3 A; 3E8H A; 2KG7 B; 5GW7 A; 4OPA A; 2D3O W; 3JAR B; 3OR6 C; 2DW4 A; 4NB5 A; 1JX9 A; 4X1Y A; 4FIP C; 1WPB A; 1PV0 A; 2IU3 A; 3JAW B; 2ZCE A; 1FXH A; 1WP7 A; 1AR5 A; 1K92 A; 2PZS A; 2ZDI A; 3JD4 A; 2WLK A; 4I50 A; 1KD1 W; 2GTA A; 1FFX A; 3CX5 F; 3MHS C; 3ZMU A; 2M7W A; 3IGA C; 4JGS A; 4K35 A; 4O4J B; 4J7K A; 3VQY A; 5EK0 A; 3E8B A; 4LFA O; 3B40 A; 5LXT B; 4MVQ A; 3GVM A; 2WLN A; 3EHB B; 2HJF C; 3I55 V; 3HKD B; 2E75 B; 4W4K A; 1GKF A; 4QPK A; 3UM7 A; 3JAK A; 1VQO V; 2BOC C; 1PNM A; 1RPR A; 4JYB A; 1KUQ A; 3HB3 B; 1IVS A; 2R72 A; 1DF4 A; 1EFR G; 4NYK A; 4DR2 O; 2E76 B; 3JD0 A; 1ZLZ A; 2YIA A; 1Y74 B; 2LP7 A; 1K33 A; 4FZ0 A; 1W0K G; 3DSQ A; 1K73 W; 2HJD A; 4MSW C; 1FXK A; 1H2K A; 4B7K A; 4TUY A; 3ABL C; 1N0N A; 3C3T A; 3CEI A; 4TV9 B; 3ZX6 A; 2PGG A; 4FZ1 A; 1VF6 A; 1R3I C; 3KCX A; 4O4I B; 3IJ4 A; 3FFQ A; 4DV6 B; 1YCI A; 3RWR D; 3CCS V; 3CCU V; 1FXK C; 2E74 B; 4J11 A; 3K5O A; 4FLT A; 1S77 D; 1I08 A; 4WF9 V; 5BMV B; 1VP7 A; 3CME V; 1WA8 B; 1H2N A; 4TV8 B; 4TT3 G; 5LP6 B; 1TUE B; 5JJN B; 3FYE B; 1M4U A; 4JPR A; 4JZ2 A; 1RP3 B; 5LHG A; 1L0L H; 3ABU A; 1WN7 A; 4QIW F; 2KKW A; 4LFA B; 4U3J A; 2HEP A; 2PTM A; 4FFB A; 2P5O A; 4DR5 O; 2DWD C; 4D6T H; 2YXY A; 2L35 A; 3SPC A; 1BGY H; 3TXQ A; 4ZBM A; 5EZY A; 2DYR C; 4CZZ A; 2EIN B; 1XUQ A; 5E79 Z; 4JV5 B; 5C8Y A; 4YJ2 A; 3AK2 A; 4JI4 B; 3KCY A; 2DYS B; 3WG7 B; 5KAF Z; 4DUY O; 4JI8 B; 1CPY A; 5JH7 A; 3OM3 B; 4DV4 B; 1B3Q A; 2NNU A; 1TA8 A; 1BMF G; 3CJH A; 4DV3 B; 4WCE V; 1AI4 A; 4GYC B; 3GWO A; 4WFG A; 4ZI7 B; 2BCC H; 4LC1 A; 5EC2 C; 1IX9 A; 3SDL A; 1LUW A; 4UCR A; 2EZP A; 3ZHQ A; 3A0H Z; 5L3B A; 1QR8 A; 2ITC C; 2Q6A A; 1YZB A; 3SJQ C; 3H1H H; 2LFR A; 2ZIM A; 1T5E A; 5DEC A; 2BTQ A; 2QGN A; 4UCO A; 1WNS A; 4AQY O; 2JK5 C; 2YUA A; 1UPG A; 1JFF A; 4UFZ A; 2IM9 A; 2IJK A; 1E79 G; 1UJW B; 4GCZ A; 5KMG B; 2IW5 A; 4PD4 F; 1MAB G; 2K1E A; 1AP6 A; 4DR5 B; 1IBL O; 4GX0 A; 3OTO B; 2VS0 A; 2Q7G A; 4ZHQ A; 4JI7 O; 1RSO B; 1XNQ O; 4WBN A; 4Z1V A; 3G4S V; 2W6I G; 1AIL A; 1ORQ C; 3N2G B; 2QTO A; 1Y67 A; 2GBO A; 3RW0 A; 2QWP B; 2QWN B; 3O65 A; 1D5A A; 1M1K W; 1DTO A; 3RYF A; 1W59 A; 4PJ0 Z; 1K3E A; 3BAA A; 1H2M A; 3H01 A; 5LP6 C; 4ABM A; 4IL6 Z; 2CGN A; 2EX3 A; 5H6R A; 2R9A A; 3STL C; 5KX5 B; 4H13 B; 4X9Q A; 1NS1 A; 4FK5 C; 4IT5 A; 4U7N A; 1YTF B; 4KFM A; 4FM2 A; 2QKC A; 1NR1 A; 4LH7 A; 3CRR A; 3RGB A; 2MW2 B; 5CBH A; 3I56 V; 4R7C A; 5LBQ A; 4YXW G; 2YEV B; 3W7S A; 2Q0A A; 1J5E O; 3APO A; 1BQZ A; 1JPX A; 3RYI B; 3PJS K; 3A0R A; 2E3C A; 3G71 V; 1XL4 A; 1H2G A; 4B3R B; 4JAA A; 5CA1 A; 3E35 A; 2ZNI A; 4QJF B; 5LOV A; 1I94 B; 1W0J G; 2JS3 A; 2DYS C; 3WG7 C; 3ASN B; 2N04 A; 4AQY B; 4NR1 A; 4MT8 A; 3T1Y O; 1GN6 A; 5IJ9 A; 3VQX A; 3I5D A; 2HR3 A; 2WLI B; 1L1F A; 3QVN A; 3UQ8 A; 3FAV B; 2B1I A; 5BZB A; 5LL6 Y; 1YJ9 V; 1F4M A; 1OCC B; 2Z5U A; 5D5P A; 4J7J A; 2P4K A; 4U7O A; 3AK3 A; 1QR9 A; 3FKS G; 1G6U A; 3LSQ A; 3VBB A; 1SA0 A; 5DED A; 1NTM H; 4B7E A; 1P7B A; 2X6B A; 3P32 A; 2Q7H A; 2VRZ A; 3JAS B; 2RCV A; 3K5N A; 1EN6 A; 5ITZ B; 1MSW D; 1Q90 D; 3CCE V; 1OCO B; 3H1L H; 2W0X A; 3HKB B; 2HG5 C; 2DE0 X; 4J41 A; 1KP3 A; 5IWA B; 2E5L O; 1GAX A; 4UVC A; 3UO2 A; 2UXN A; 2EIJ C; 2YSU B; 2EJR A; 1NVP B; 1Q43 A; 2OIE A; 5IYD O; 4UB6 Z; 3E22 A; 4TQD A; 5IYZ A; 1VQP V; 1SQP H; 3RYC A; 4JI6 O; 4NTX A; 1J5E B; 4ZKI A; 1OHH G; 5L3G A; 4N21 A; 1ZUQ A; 2ZT9 B; 3G80 A; 3L70 H; 1M56 C; 2DWE C; 4JYC A; 3RYH A; 5CB4 B; 3ZJZ A; 1HNZ O; 3CB2 A; 3QG5 A; 2VWJ A; 2Q68 A; 1NR7 A; 4DV2 O; 4XDJ A; 3DXR A; 5J2T B; 3L74 H; 4DRX A; 2QM8 A; 3DGE A; 1TUB A; 5BR8 B; 4F4L A; 3MDS A; 1GH6 A; 5CBF A; 1JOY A; 1K4C C; 1R6K A; 2WSS G; 3JD2 A; 4IYI A; 3T1Y B; 2JDI G; 3CE2 A; 5CBG A; 3IAY A; 1ROP A; 1Z5V A; 4O2B A; 3S3X A; 5GTI Z; 1GTO A; 1U97 A; 3SPJ A; 1CEZ A; 2KB1 A; 4HYO A; 1PP9 H; 1VEW A; 2JJ2 G; 3BFR A; 5KA5 A; 4FLW A; 1MOF A; 4LF9 O; 1XHX A; 3Q4H B; 2ADQ B; 4X66 O; 3UO3 A; 3AG3 B; 4I0X A; 2QKS A; 3B4S A; 3OW2 U; 1YEW A; 3TXS A; 4X20 A; 2JVD A; 4MVM A; 3TGU H; 2FB5 A; 5DN6 G; 1ZL8 A; 2YC0 A; 4PI0 A; 4PA3 A; 1WP8 A; 1AI6 A; 3ASN C; 1QVG U; 2Q73 A; 4FLZ A; 1SQG A; 1BSM A; 3B09 A; 4CBC A; 3SJB C; 3SJA C; 3W7T A; 4X1Y B; 1XNR O; 3SGI A; 4DV7 O; 5CMU A; 2WLH A; 2QWQ B; 4DYL A; 1M90 W; 1S76 D; 2EUL A; 4I50 B; 4TSF G; 1FFX B; 1P7G A; 1PPJ H; 3ZED A; 2YIB D; 5FPR A; 4MW3 A; 4X1I A; 4DV2 B; 5DM6 V; 3BA8 A; 3JCZ A; 3E89 A; 1JJ2 U; 3P30 A; 4O2A A; 3FB6 C; 5B1A B; 4CS2 A; 1YI2 V; 4JI2 B; 2AGA A; 3ZBH A; 4B3T B; 2RMK B; 3APQ A; 1OCO C; 4QE7 A; 2ETN A; 3ETD A; 3BY6 A; 3ZCC A; 3CYO A; 4BW5 A; 1E1R G; 3JAK B; 2DQ0 A; 4PA7 A; 4ICG A; 3ABL B; 1AJP A; 2YI9 A; 2V1D A; 5B3S B; 1VQ6 V; 2HVJ C; 2DOS A; 1KBH A; 2ODM A; 1XEQ A; 5IJ0 A; 2OYQ A; 1K4D C; 1FXK B; 2CH7 A; 5AG2 A; 4X89 A; 5TIS Z; 4DXW A; 4TUY B; 4WFE A; 1XIL A; 1VQ5 V; 4RQE A; 5JVD A; 1JQ0 A; 1I5Y A; 5C93 A; 1X59 A; 4X88 A; 1Z2G A; 2JGU A; 3OEE G; 4LR3 A; 3ZRX A; 3A8T A; 4P2Z A; 4RUE A; 1YXB A; 3TCU A; 2XAS A; 2NR5 A; 4QPJ A; 1OCR C; 4QGP A; 4GZR B; 1FXV A; 1TGO A; 4DV7 B; 2B5U A; 1Q3E A; 5LHH A; 1PL0 A; 3HKC A; 3WB2 A; 4EFB A; 2CK3 G; 4BR6 A; 3FB7 C; 3K9A A; 3OUS A; 2XAF A; 3N27 A; 4DV6 O; 3AG3 C; 1QLE C; 3K5L A; 2OWO A; 3QO8 A; 4BW9 A; 1NBM G; 3QO5 A; 2DYR B; 4YJ3 A; 2Y69 C; 5LA6 A; 4B3S O; 3ABK B; 4U3J B; 4UCV A; 2Q7E A; 3K59 A; 2PI4 A; 5E1A C; 1SET A; 4FFB B; 2RQ6 A; 3J7A U; 3VQV A; 2DMX A; 3C90 A; 2RJZ A; 3WFV A; 2LFS A; 1R6T A; 1DK1 A; 5EZY B; 1SQV H; 2AHZ A; 2HKO A; 4FVM A; 5IYC O; 5KAI Z; 4KP4 A; 5C8Y B; 3G67 A; 4YJ2 B; 3J80 N; 3B8M A; 3SYO A; 3SPG A; 3ETQ A; 3VOU A; 2YID A; 2ZDI C; 3N2K A; 1YHQ V; 4MVR A; 1IDS A; 1G1X B; 5JH7 B; 1IXM A; 1H2S B; 1SQB H; 5EC1 C; 3F5T A; 4AHC A; 1M93 A; 2YIC A; 1JVM A; 3CJH B; 1B06 A; 1F23 A; 1DLB A; 1K8A W; 3NR7 A; 2UXC O; 1AJQ A; 4LF6 O; 4MVS A; 5B1A C; 1L8D A; 1VQ8 V; 1MZF A; 5JCO A; 1BL8 A; 3BA9 A; 1PNK A; 4I5S A; 4JV5 O; 3G6B A; 3BAB A; 3B2E E; 3UT5 A; 2YS8 A; 1S5H C; 4LBE C; 1UFI A; 2VQE O; 4JI4 O; 3IC7 A; 1P4R A; 4CS4 A; 1HW7 A; 4JI8 O; 1SKV A; 4DV4 O; 5JCO C; 4JTC B; 1QQC A; 5KHK A; 3A0B Z; 4DV3 O; 3UCS C; 5B3S C; 5B1N A; 4QNH B; 2P06 A; 2DJV A; 2HFE C; 1VQ4 V; 3X2Q B; 2PYJ A; 1JMK C; 1O9H A; 2X0L A; 1MA1 A; 4JAV A; 4DR1 O; 3NXS A; 5KHI A; 1R3J C; 4GKK B; 3ZHT A; 2EZO A; 4B3S B; 5H2F Z; 1VF6 C; 2WPD G; 1RFY A; 2EIK B; 3CXC U; 1N0J A; 2A79 B; 4ZHQ B; 3OT7 A; 3LUT B; 2FKX A; 3CRA A; 4WBN B; 3RVY A; 2ZM6 B; 3WU2 Z; 1XL6 A; 4FM1 A; 1N33 O; 5BXZ A; 5K1X A; 2XAG A; 5EBL C; 4JAS A; 1PD3 A; 5LYJ A; 2QWO B; 1QNM A; 3RYF B; 4FM0 A; 3R66 A; 1BCC H; 4MS2 A; 1GRJ A; 3GB7 C; 2UUC O; 4JI0 B; 5LGN A; 3OTO O; 1H8E G; 4X1K B; 1XI1 A; 2N05 A; 2XAH A; 2QR4 A; 3F7Y C; 4O4H A; 2WLM A; 2UXC B; 4LF6 B; 1HDJ A; 3ABK C; 3CC2 V; 2R9R B; 3CSX A; 2ZE8 A; 2ZR3 A; 1MZE A; 3JAW A; 4BIU A; 2VQE B; 3OUF A; 1VQN V; 3K0G A; 5B66 Z; 2GDS A; 4HAM A; 2JGD A; 5KHH A; 3LSU A; 5CA1 B; 4MVU A; 3FD9 A; 1OCZ C; 4DUZ O; 3LDD A; 3CMA V; 4NXM B; 5LOV B; 2Q4P A; 5L3F A; 1N36 O; 1Q6U A; 4CH4 A; 4X65 O; 4B08 A; 4GKJ O; 4JF3 A; 4JI3 O; 4NTW A; 1I7F A; 3CCJ V; 4DR1 B; 5A2Q N; 5F2V O; 3CD6 V; 2BSK B; 4ZOL A; 3G6E V; 1V54 C; 5FLX N; 1VQ7 V; 1YJW V; 4B3R O; 1THZ A; 1P49 A; 2XT9 A; 4NKG B; 4OGQ B; 3TET A; 3AG2 C; 1HNX B; 4PA6 A; 1I94 O; 3LSS A; 2EIL B; 2P4V A; 1SA0 B; 2R9I A; 4I4T A; 1YTF D; 1N33 B; 4WFB V; 1M57 C; 1N4C A; 4P9O A; 3WB0 A; 1Q81 W; 1KB9 F; 1PKX A; 2EIJ B; 3R65 A; 2JIZ G; 4GUN A; 3IFX A; 1SC5 B; 5EIB C; 1KQS U; 3K58 A; 1ARO P; 3X2Q C; 2UUC B; 1GN3 A; 4DV0 O; 3K0D A; 5J2U A; 1M56 B; 2Y4T A; 2IH1 C; 3LNN A; 2P22 C; 5B5E Z; 4H0L B; 3E22 B; 3OEH G; 4TQF A; 5IYZ B; 3RYC B; 5LHI A; 1VF7 A; 2EBO A; 2EIK C; 3ETG A; 3RYH B; 2UXB O; 1FFT B; 2M6Y A; 2ZXW C; 1NQT A; 5FPO A; 1HNW O; 2A3Q A; 4YIO A; 3OE7 G; 5GON A; 3DXR B; 4Z2W A; 3H1J H; 1KU9 A; 4DRX B; 5IWA O; 4DUZ B; 1LR1 A; 2ZNJ A; 3KKY A; 3OR7 C; 5JJE B; 4GT1 A; 2A7W A; 1N36 B; 2QM4 A; 1BT8 A; 1XBL A; 2ILM A; 4X65 B; 1YIJ V; 3W7W A; 3KG2 A; 2AW9 A; 4GKJ B; 4JI3 B; 2Z0A A; 4OX9 O; 4UV9 A; 1OZ0 A; 1IZ3 A; 4JTA B; 1S5J A; 5BR8 O; 1X4T A; 3ZHV A; 1SER A; 2UUA O; 1WLE A; 4I0X B; 1FYJ A; 1QCE A; 4X64 B; 3CXH F; 4X20 B; 4DV1 O; 1NVP D; 1VQ9 V; 1WPX A; 4J42 A; 1ZL8 B; 2XTA A; 3GWK C; 2X6C A; 5LMN B; 3B77 A; 3L72 H; 4I9Q A; 5IDJ A; 1SES A; 4YY3 O; 4PDM A; 4ZI7 A; 4DV0 B; 1AI7 A; 1VIB A; 1N8R W; 4JAU A; 2AHY A; 4RO2 A; 1K97 A; 3RT3 C; 4LCU C; 5IYB O; 1YSC A; 1ZWI C; 1IBK O; 1IBM O; 2XUM A; 2JRI A; 1FKA O; 1Y4M A; 2ZE6 A; 4KHP B; 5EBW C; 2GUZ B; 3M7M X; 2UXB B; 2WLL B; 5JWP A; 3CCR V; 1HNW B; 1B04 A; 4X1I B; 2EIL C; 1SZT A; 2ARH A; 1JA8 A; 3K03 A; 1MG1 A; 5KHG A; 4O2A B; 4FFK A; 1S0V A; 3JAL A; 4PV1 B; 2IH3 C; 2V7Q G; 4A5U B; 4XDL A; 1NZ6 A; 4I55 A; 4F6R B; 3CRC A; 4OX9 B; 3JAT A; 5HFL A; 4N23 A; 2UXD O; 3D36 A; 1AI5 A; 2UU9 O; 4FMT A; 1EZJ A; 2PUS A; 2GHY A; 4JI2 O; 3WB1 A; 2IBZ H; 2W0F C; 4JTD B; 4JZG A; 2UUA B; 4B3T O; 4LF4 B; 1Q5O A; 4UXN A; 1KKD A; 2AZ2 A; 5IJ0 B; 3D36 C; 4DV1 B; 2CH7 B; 4HNA B; 3K9S A; 3T4Z A; 5B1O A; 1OCR B; 5JVD B; 1RPO A; 3EXA A; 4PDV A; 4B3M O; 2YXH A; 1JJO A; 4YY3 B; 4CC5 A; 4GX1 A; 2LQT A; 1MNG A; 1QLE B; 1IBK B; 3HKE B; 1IBM B; 1V9P A; 3FB5 C; 3STZ C; 2JEX A; 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