1ZZYA

Crystal structure of thioredoxin mutant l7v
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
KIIHVTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
molecule keywords Thioredoxin 1
publication title Crystal Structure of Thioredoxin Mutant L7V
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 27
structure length 106
sequence length 106
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1zzyA00
1O81A 2GT6A 4WF4A 5C04A 4FYUA 3ZLPA 1BJXA 1R5PA 4KDXA 4CHSA 1PKWA 4Q5RA 2IMKA 4KCAA 2I1UA 1WRYA 4I5QA 2P5QA 1QXHA 4IJ3A 2HE3A 1E6BA 5AIXA 2MMAA 1A2MA 2VOCA 3ZRDA 4MLYA 3WT1A 4AF2A 2XPDA 3LGCA 1GL8A 2MBTA 3GH6A 5ELAA 4ZILA 5E4WA 3H4KA 2LEGA 5FWGA 2V2GA 2IL3A 4WXTA 3RBTA 14GSA 3VK9A 2MMNA 1TU8A 3UJ1A 3HVSA 3L9VA 4N11A 2WB9A 1V9WA 2XBQA 2H0GA 4WBJA 2JU5A 1THOA 5G31A 1JFUA 2N5FA 4GCIA 1AW9A 4TR1B 4XS6A 4MABA 2VL2A 2JSYA 1EEMA 5IMFA 1TK5B 4HUAA 2L4CA 1GNWA 3APSA 4YQUA 3H79A 3TJJA 1XW5A 2XHFA 2F3MA 2GQKA 1UVZA 5CRDA 3UAPA 2R3XA 3M3MA 2H6XA 5D9WA 3VURA 5DQYA 1G7OA 2CAQA 2HRNA 3FR6A 5KN1A 4ML6A 3GX0A 2HNLA 4NPBA 1QMVA 3WGDA 2LRNA 2VUPA 2CZ3A 1BYEA 5LNKe 2L5LA 1K0OA 3QOUA 2F9SA 5IMZA 2J23A 1HYUA 4ZB8A 4YQMA 1PGTA 2V6KA 5ENUA 1A2JA 3NIVA 1HNBA 3IXRA 5CO3A 5IOXA 1ZCPA 1FO5A 3P8WA 4GXZA 2H76A 3SBCA 1K0AA 2A4VA 1Z6NA 1SJ6A 2PU9C 3O6TA 3ERWA 1FW1A 4MJCA 2CVBA 2HFDA 5H5QA 3HVXA 1GNEA 3KP8A 1XPVA 4MZCA 1GTIA 2R37A 1WE0A 3QMXA 4KDUA 1W89A 4YQVA 3K8NA 1WOUA 2REMA 5LD0A 3F8UA 1I5GA 5AN1A 3GL3A 5F06A 3C7MA 5IOWA 5HR2A 4WF5A 4JRRA 5D73A 2FWGA 1GSEA 5J5NA 2YOIA 4XS4A 1YY7A 2I9HA 3KZQA 4ZL7A 3Q74A 3GV1A 1PD21 3MAKA 3DYRA 1G0TA 2RM5A 2OBKA 4ULXA 2IFQA 1U6TA 2LS5A 2KOKA 3WT2A 2WRTA 3C1SA 4IP6A 3I69A 5JWOB 3FW2A 1M0UA 3CTFA 3IRAA 5CYYA 5IIZA 3GSTA 1QFNA 2YZHA 4TR4A 2L59A 1F3BA 4O7HA 3TCOA 1B4PA 1XW9A 3VPQA 2CV4A 3E0UA 4HZ4A 4BVYA 4GF0A 3FKFA 2R2JA 3O76A 2C3QA 4ZXGA 3P90A 2H72A 4J57E 2E0QA 3VWUA 2GDRA 3GTUA 4HS1A 2GZPA 2K8SA 1XIYA 5ECRB 2IMIA 2OACA 4WR4A 4L0WA 3BD2A 2HXKA 2GSSA 3M8NA 4XCSA 2MMOA 1URMA 2MZCA 2PVQA 3GH9A 1M9BA 2ON7A 3JCML 2NTOA 1XXUA 3VI5A 4AGSA 2C0FA 2D2ZA 3D22A 4K7IA 3F6DA 1X0RA 1WP0A 3IK7A 1F3AA 1OKDA 1EOGA 5C00A 5J4UA 4DEJA 4NAXA 2QGVA 5ECPB 5JCWA 3DVWA 4POMA 5DDLA 3C1RA 3HKRA 1SYRA 5ELGA 1S3DA 2AAWA 3E3EA 3IBHA 4V1Ag 2MMZA 1VF4A 2ON5A 1DBYA 3UOMA 3ZFBA 2YV9A 1XWAA 2YANA 3TB2A 1PX6A 1YDKA 1A23A 2M80A 2N5BA 3TKSC 4JEDA 4V1Ap 4EF0A 5H5SA 17GSA 3Q18A 1SKSB 1TU7A 4OO4A 1T4ZA 3GHAA 1O7UA 4BWQA 5GAPD 2DIZA 4HQSA 4WEYA 5ID2A 1Y6EA 4QQ7A 4GTUA 3I9V2 3ZIVA 3TRXA 3RDWA 2L57A 2DJ0A 1RK4A 5COHA 2IMDA 5IMDA 1AXDA 1JHBA 4ECBA 2G0FA 1B9XC 4RI7A 3EMXA 5GSTA 4NV2A 3F3RA 2X8HA 2C0DA 3CRUA 2GS3A 4G10A 3P7XA 1TTZA 3G9BA 4IJIA 1F6MC 3L78A 4EO3A 2GSRA 4I97A 1GSYA 2YJHA 4PUFC 2E2MA 2M72A 3TOUA 4ECJA 1OC9A 4PX1A 3I43A 2DLXA 3SWLA 3F0IA 1RW1A 5F0GA 3KH9A 1TJDA 3ZMLA 3LYPA 2DBCA 2X99A 5G5FA 1FOVA 3TUEA 5DCGA 5E59A 1GUHA 2HZEB 1Q4JA 3PR8A 3ZFLA 4MPGA 4O92A 4EDYA 4XIHA 3TKSA 5JWRB 3ZREA 2DJKA 1PA3A 3GMFA 4ZBBA 4TXVA 4KE3A 2FGXA 4V2MA 2DMMA 5DALB 3MNGA 1S3AA 1Y25A 3ZTLA 3ZIJA 5AGYA 3H8QA 1JZWA 1XZOA 3DIEA 4G2EA 1DUGA 1THXA 4WBRD 5D93A 1TDIA 3D4MA 1WIKA 1FVKA 4AJ7A 9GSSA 1GULA 3GRXA 1ZYEA 2FNOA 1LU4A 5ECLB 2YWOA 2ZNMA 3C73A 5IMAA 3AY8A 3WD6A 1F9MA 1ACVA 4XHMA 4F0CA 2H0HA 4ID0A 3RHBA 10GSA 3A2WA 1BQ7A 2VL9A 2NDOA 3GNJA 1DSBA 6GSSA 1M2AA 1K0NA 2VCWA 2ZCTA 1XOBA 1OYJA 2J9HA 3CTGA 4GSSA 5H5RA 3I6AA 4XRAA 2H1DA 2R5GA 2WJUA 1TRVA 2GTUA 4NHWA 2LJAA 3F3QA 3LYKA 4XS4B 1SYXA 2ES7A 4TXOA 1T7PB 2O85A 4IHUA 4KGIA 4NMUA 3L4NA 1HQOA 3KXOA 5EY6A 3RAZA 4DSSA 2VLVA 3D4TA 3MSZA 4KW6A 3VFIA 5HR1A 4Q5FA 5DJLA 4YH2A 2CA8A 4KAEA 3H93A 5JCGA 6GSXA 3ERFA 5EPFA 3CMIA 4IBPA 4LMVA 3GKKA 4EKZA 1H75A 2E2GA 2K6VA 2IJYA 4MMMA 5ECMB 4PURA 2YCDA 4RQXA 3EU4A 4IKHA 2EIQA 2NVLA 1NW2A 1QGVA 4PNGA 3IDVA 5B8BA 3VPTA 2H6YA 5CREA 3DGQA 3GTUB 2OA7A 6GSVA 1Z5YE 2CX3A 2GZZA 5CP1A 3TKPA 3WYWA 3L9UA 5IQYA 1J9BA 1XWGA 3LXZA 4TKYA 1MDKA 3ME8A 4PQ1A 1MD4A 2VCXA 3BBYA 1GSSA 5A4VA 4H86A 3TRPA 2X8GA 4K6XA 4L5LA 1NHOA 2HSYA 2XC2A 2YWMA 1K0DA 4GWRA 2EIOA 3QAGA 4HZ2A 3GL5A 3D21A 2YWNA 1B48A 3WGEA 3J7Yb 5HFIA 1GP1A 5KEJA 2RM6A 5D8IA 4JU5A 2AYTA 3KTLA 2N5AA 2R6KA 4FYCA 2AUVA 4PQHA 3FEUA 1X9SB 3FZ5A 5LCZA 1HNAA 2OADA 3GURA 3QAVA 1Z6MA 2LKUA 4JZQA 1WPIA 4XRDA 4FO5A 2LJKA 3W8JA 5KN2A 4ZBAA 3DRNA 1TW9A 2I3YA 4IVFA 4EVMA 3ZYWA 4NV5A 1GTAA 2PMTA 6GSTA 3G7JA 2OBIA 3HJMA 2L6CA 4ZB9A 2AV4A 4HI7A 2H30A 2TIRA 3S9FA 2VM2A 1F37A 3UVTA 1I9DA 1SL0B 1OKTA 5IM9A 1M7TA 3A5WA 2XBIA 1UA5A 2KP2A 3LORA 3M1GA 3MWHA 4HOJA 2VCZA 3UMAA 1O8WA 1XVWA 5KN3A 5ECQB 3L9SA 5ECSA 1J08A 3D0ZA 3RPNA 3APOA 2RIIA 4Q5QA 1A0FA 2O8VB 3KM6A 2CZ2A 1CQHA 4GQFA 2HLSA 5IO0A 1Q98A 3R2QA 4GSTA 3EU3A 1EEJA 1FB0A 4DSRA 3HY2A 1K0CA 2L6DA 4POLA 4Q5NA 3U6VA 1SK0A 4MJAA 3PGTA 3EWLA 1XW6A 4KSMA 3IR4A 4ZL8A 1V57A 1MDJA 4JR4A 2VCTA 3KEBA 3RHCA 3F4TA 22GSA 4OWYA 3IHQA 1EOHA 1ZGNA 2C0EA 4LL1B 4I8BA 2YJ7A 3HD5A 1PMTA 2P0GA 2WZ9A 1B8XA 1G7EA 3ZL5A 4X1UA 1RQMA 2EC4A 3W6GA 1YQ1A 1OAZA 1MDIA 2I81A 4EUYA 1EZKA 1GRXA 2E7PA 2XPEA 4N10A 4OFTA 2JADA 2H1BA 3KTBA 1Z9HA 4F9ZA 5GSSA 5DAKA 2R4VA 5J9BA 4F82A 2TRCP 1R4WA 1T8EB 2PVOC 4TR0A 2RLIA 5B8AA 3UBKA 3LSZA 4IELA 1KEBA 2A2SA 4YAVA 1T3BA 4KUNA 1XWKA 1OE7A 3KH7A 4TN8A 4AJ8A 4MPFA 3QCPA 2RUFA 1USBA 4NXIA 3GKXA 4WKWA 3BCIA 7GSSA 3DMLA 4MJEA 4K0NA 4TXOB 5CRHA 4ZIJA 2GSQA 1T1VA 2DJJA 4TR3A 4ACSA 2RUEA 2H1GA 1YJ6A 4V2LA 3CRTA 5F05A 4X0XA 1U3AA 2IMEA 5G5EA 2FWEA 1QK8A 4AJ6A 1ERWA 1O6JA 2YZUA 1GWCA 1SU9A 3QFAC 1SL1B 2BJXA 4MF5A 4WETA 4ECIA 3EMPA 2HT9A 2H19A 2FUG2 2JACA 1W4VA 4D73A 1N2AA 4RUVA 1SKWB 3M9KA 2AB6A 5FHIA 4MF7A 3HDCA 5HR0A 4O32A 4TR1A 1O73A 1GSDA 4GRFA 1K3OA 5CNWA 1E2YA 5FT3A 2VIMA 3L0HA 4IP1A 2H70A 5CRWA 2H6ZA 3HZ8A 3CSJA 3TJKA 1EV9A 1DE2A 2V1MA 2IWTA 4OMVA 4K0GA 1EWXA 5DQSA 1ZYQB 2C4JA 1YKAA 4GQCA 3TKQA 4XTSA 1TI3A 4I2UA 1FAAA 4L0UA 2WFCA 1AAZA 3LEFA 1A8LA 2VAFA 2V32A 3ERGA 2YN1A 3LWAA 4GSNA 2K9FA 1AQXA 4TOPA 5J9CA 4HU9A 1GTBA 1TKDB 2H73A 1O8XA 2P5RA 3F4SA 2V41A 1U3IA 5D9VA 4KH7A 3KJYA 4I2TA 4ML1A 5ECNB 4EDZA 1S3CA 3CBUA 3BCKA 1F2EA 4CW9A 1YF0A 1KTEA 4O5RA 2BTOT 3H1NA 1PX7A 2FD3A 3CSHA 3UL3A 5DVBA 2GSTA 1SL2B 2VL3A 3E9JB 1V58A 2JSZA 3GN3A 2PN8A 3TGZA 3GKMA 2QSIA 2B5YA 1N8JA 3LFLA 3A2VA 1SD8A 3GIXA 2B5XA 4KSOA 1B9YC 3Q6OA 1XCCA 3HJOA 5DCHA 1LJRA 4BA7A 4MA9A 1SD9A 3IA1A 1IYHA 1EGRA 2AHEA 1ILOA 1ABAA 4LLRA 1PSQA 3ZZXA 1R26A 3UARA 1U88A 5IMVA 1JZRA 2B1LA 2BMXA 2FCHA 2KUCA 3DKSA 2FWFA 3IOSA 5A4UA 2AJQB 1ZZYA 1A0RP 5D9TA 2IIYA 3MDKA 2WDUA 2H01A 2O7KA 4OD7A 1SKRB 2IN3A 4LMWA 2VCQA 5JCUA 3HJPA 3HA9A 1M9AA 2KLXA 1BG5A 3IE3A 1MEKA 5INYA 5IMCA 2B3SA 4MH2A 2YP6A 3RPPA 3EURA 3KMNA 4OFMA 4PQIA 1ST9A 3EYTA 3QDNA 4IN0A 2DJ1A 5DBQA 2QC7A 1OE8A 3GKNA 1YZXA 5ECIB 3UEMA 2PBJA 2NBSA 4KA0A 1TRUA 1OC8A 4KB3A 5IPGA 2IMFA 4DSQA 3TRQA 2LV3A 2IFQB 5D96A 2F8FA 3KD0A 1XWBA 4ISDA 4EE0A 4YAPA 1GTUA 3FY7A 3D5JA 2B7JA 1GLPA 1YKCA 4L5OA 4J2FA 3IC4A 4MJBA 2VLUA 1TK0B 4JBBA 1SJZA 2I4AA 2DSAA 3F6FA 1VGLA 1MTCA 4RQRA 5IPHA 2B5EA 5GAND 5G30A 2VM1A 4BVXA 1LBKA 2G2QA 1JZOA 3LG6A 4HJ2A 2LUSA 2YNXA 2LNSA 2WS2A 3A2XA 2C0GA 1H4OA 3VLNA 1T4YA 1BEDA 2K8VA 2VLTA 3APQA 3GX8A 3QAWA 4QL9A 2EIRA 1Z7RA 2B1KA 1X5CA 1C72A 2CVKA 2HSHA 4CDOA 1MD3A 3CYNA 4E8EA 2H75A 3DVXA 4BL7A 4TVEA 4QL7A 11GSA 4XS1A 3DEXA 4K2DA 6GSYA 1GH2A 5F8BA 4K9ZA 4D73B 3P2AA 4HJMA 4POKA 2LNTA 2PWJA 4EL1A 3FZ4A 3F4RA 4TRXA 1M99A 2DMLA 4GLTA 1M2DA 3G7YA 4F2IA 1FVJA 2CQ9A 2VCVA 1EP7A 2HRFA 3Q19A 1PN9A 5ECOB 4FH8A 2GLRA 1IYIA 3ZITA 3LQ7A 2FHEA 1A24A 4PNFA 2PUKC 2HI7A 3HZ4A 5EL8A 2FWHA 3OR5A 1YEPA 2V6OA 4JE1A 3M9JA 6GSWA 4HEA2 5L71A 3IAS2 2DIYA 1DE1A 2IPAA 5ABRA 4MDCA 3KCMA 2Z9SA 3VWXA 4N0ZA 1QQ2A 3ZVJD 5G1KA 4OCFA 6GSUA 2VD1A 3HYPA 3HXSA 5J3RA 4MK3A 5ID2B 4IW9A 4MZWA 3EC3A 1PQNA 3GUSA 1ERUA 2LRCA 2KP1A 1V2AA 3ZVJA 4IS0A 2FA4A 1BAYA 1U87A 2X64A 1ZL9A 1PL2A 1FHEA 3UBLA 2HZEA 2PERA 1WJKA 1WWJA 1CQGA 1K0BA 1R7HA 1UC7A 1GUKA 1UN2A 2ALBA 1XWCA 2B7KA 2X8CA 4IGJA 1NHYA 1V40A 4LA1A 4G19A 5A4WA 3ME7A 5DALA 2H71A 1OC9B 1QUWA 2C8UA 5CRGA 1TXXA 3LXTA 1TRWA 5F07A 2HYXA 1PL1A 2QKEA 3BJ5A 5DJMA 2CT6A 1ON4A 2WULA 3FZAA 2LRTA 2PGTA 1FG4A 2JL4A 2KHPA 4HQZA 1X5EA 4BWSA 3D6IA 1ZOFA 2ZUPA 2WGRA 1JLWA 4WR5A 3CXGA 2H66A 3EVIA 5J41A 2GQMA 3LJRA 1AQWA 5CAXA 3KIJA 1FB6A 1TP9A 1XOAA 4F03A 3DWVA 19GSA 1GSFA 4ECCA 3C8EA 2L5OA 3FYGA 1OVNA 2OE0A 2PPTA 4RI6A 2L4QA 3US3A 4EC0A 4X43A 2FA8A 1VF1A 4IQ1A 1O85A 4OFNA 5G1LA 4DVCA 3QFBC 1SK1A 3BOAA 1K0MA 1GLQA 5ECHB 3HHVA 5GZZB 4KX4A 2YV7A 3EE2A 5A5KA 4ZBDA 1T00A 1JLVA 1G6YA 3EINA 3ED3A 4K7OA 4HU7A 2H74A 2O87A 4K8MA 3F63A 3QPMA 1EGOA 4N0VA 3F9UA 5D9XA 4J56E 3FR3A 1V98A 4DSSB 2HZFA 3N9JA 4F0BA 1VF3A 2M46A 2DJ2A 3QR6A 1YEXA 2OJLA 8GSSA 1XFLA 1X9WB 2WCIA 2B6MA 4PGTA 2GQLA 2JZSA 2C80A 1TK8B 1A8YA 1KBNA 3TJBA 1G6WA 1AQVA 4K1FA 2CX4A 3TKSE 1TRSA 5HR3A 3IPZA 20GSA 5B6MA 1ERVA 2F51A 2MYGA 4FIWA 3N5OA 4P3YB 2P31A 1WMJA 2CVDA 3TKRA 3V1WA 4Z7XA 3VI7A 4I6XA 1HNCA 13GSA 1KNGA 3O3TA 5IO2A 4TW5A 3TJGA 3QD9A 3DXBA 1PRXA 3A3TA 3CSIA 1K3YA 5KN0A 1NM3A 2H0IA 3KGKA 1M2BA 1A2LA 2K18A 1JZDA 4PUAA 2MBSA 2YPMA 5AISA 1HD2A 1GSQA 1AC1A 5AIVA 3HVVA 2F8AA 3IAM2 3UIWA 2A2RA 3DD3A 3FR9A 3M0FA 2GVPA 3IK9A 3VWWA 1OC3A 2LSTA 4JR6A 2CAIA 3IV4A 3UVHA 4BPYA 3GA4A 4N30A 4MF6A 4MP4A 2VD0A 2OE1A 3FRCA 2NPBA 2DC5A 3G7IA 4G9HA 4NHZA 1B4QA 4OCEA 1EV4A 4L8EA 3PINA 1TI1A 3NZNA 2DJ3A 3ISOA 5G2ZA 2H1AA 3HCZA 4K7NA 4KDYA 5ECKB 1SK2A 4MZBA 3U5RE 16GSA 1R5AA 5HFGA 1VF2A 2C1YA 2O89A 12GSA 3TDGA 5HFKA 3FK8A 3TJFA 3GYKA 1AUCA 4KCEA 3ZMKA 4ZB6A 3FZ9A 2GT5A 4ILFA 1XVQA 3PH9A 3J7Yk 18GSA 2C3TA 3TOTA 2OKAA 3KMOA 5EVOA 2LQOA 4MH3A 3WGXA 1X9MB 4PXOA 2JZRA 1BX9A 2OE3A 4LL4B 4HDEA 1Z3EA 2H8LA 4EXJA 3VWVA 1X5DA 2FY6A 1TOFA 4IQAA 3GSSA 4ZL9A 5HQPA 2GGTA 2VO4A 4NWYA 1K3LA 2YWIA 5B6NA 4POBA 2FLSA 1GUMA 2TRXA 4FYBA 1SENA 1SJIA 1Z7PA 2C3NA 2LTKA 3NOFA 1ZMAA 2LJRA 3C71A 4V2NA 5JWQB 3GFKA 3W8SA 4KNDA 1NSWA 5B7CA 1GSUA 4E8HA 1PKZA 1EP8A 4MCUA 2LQQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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