1A8DA

Tetanus toxin c fragment
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The 1.61 Angstrom Structure of the Tetanus Toxin Ganglioside Binding Region: Solved by MAD and Mir Phase Combination
pubmed rcsb
molecule tags Neurotoxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS NEUROTOXIN
total genus 113
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1998-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1a8dA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1a8dA02
4FP2A 2F2FA 5GJ6A 3IPVB 1J1TA 1BZWA 1QQKA 4YM2A 3UJOA 3WHUA 2NMOA 5CB7A 3AP6A 2JDZA 2D6MA 2R16A 3JU9A 1AFCA 4ENDA 3A23A 4Y24A 2FMDA 1W6MB 4A7YA 4XJWA 1X50A 5JOWA 1CN1A 4Q2FA 3ZXKA 5BP5C 4FPLA 3CA6A 2PHFA 3VT1A 4LO1A 4DEPA 3FJHA 4YW1A 2DUQA 1KNMA 2VW1A 3D6EA 4BLJA 4EFRA 1LOGA 1HCEA 2F8XC 2GN7A 4Y22B 3RQ0A 3INAA 1TFMB 3MEPA 3WINC 4ZA3B 2A75A 4YW4A 5FZYA 4XFSA 3ENRA 2R1DA 3PVOA 3AXDA 2J3PA 2CTVA 1NUNA 2FFVA 3I4IA 4Y20A 2KLLA 4FPYA 2ZGRA 1VLNA 3KQRA 3WMVA 2A71A 1LU1A 3FUQA 3NBEA 3SH4A 2F2FC 3MW3A 4R9DA 3USUB 5HPZA 3POSA 3WDVA 1QGLA 1CPNA 4Q27A 3OBTA 3BX1C 1UAIA 1JT4A 5GZGA 4W65A 2R0FA 1AXYA 2DS0A 1QDOA 4XILA 1SFYA 2DVBA 3SH5A 1WW4A 1FQ9A 5LK5A 3POYA 1DQ6A 2ZGKA 2ZGSA 1MS8A 2GNMA 1P63A 1DBNA 5DZFA 1PUUB 4P0LA 1Z2VA 3V0BA 3PVEA 1UZYA 3CQAA 1FV3A 5DUWA 3ZXGA 5BQUC 5T5OA 1IOAA 2BQPA 5E24E 5IK4A 1SACA 2VXRA 4AGRA 2ZHMA 1CR7A 5B2HA 2EXIA 4EB2B 4LBJA 2ENRA 3LLPA 5CA6A 2FDBM 4G6JA 2SBAA 1I3HA 4XJ9A 3E8LC 3CA5A 1RINA 3W59A 4XIKA 1R1ZA 3ZC8A 3VWCA 5BXTA 5E89A 2LIEA 1WBFA 1NXD1 1ISWA 5GLZA 3N0KA 1ENSA 2VLCA 1GYKA 2DVDA 2GZBA 3PVNA 4IHZA 2D24A 1LHNA 2EAKA 4X39A 4YGCA 1MS1A 3RTIB 3A07A 3WG3A 4XIOA 1S0LA 5FZZA 4WZFA 1JY0A 2ZA9A 4DS0A 1AVXB 5EG6C 4M00A 1MR5A 2WLQA 4U36A 2VSEA 2EXJA 1IRAX 1ULCA 3LSDA 2P2KA 4FPGA 3AH1A 4M3CA 4LO2C 3N7LA 4HL0A 3OYWB 5E8AA 2RQ9A 3V0AB 2WKKA 1JXNA 3N35A 1UL9A 2ZGMA 4JKXB 1G9BA 3O3QA 5JOYA 1T4QA 5EYYA 3O0VA 3FJBA 2D6NA 2ZGLA 3VSZA 3VT2A 1GGPB 4X38A 2V73A 1OFSA 4J2YA 5GLTA 1CIWA 1AVBA 1XHBA 4I4SA 3VKOA 4WVVA 2A70A 3H0OA 3OJ2A 5H9SA 1C1FA 1RZOB 1U0AA 2Y9GA 1G9CA 1IKPA 3ILFA 5EYXA 5HCBA 3HMYA 3T1MA 1C4RA 5T50A 3AJ6A 2DRYA 4JKQA 5F9TA 3AH2A 3BAVA 4ISQA 4I4VA 3RRDA 2Y9FA 1N3OA 1DFQA 4I3NA 3ATGA 2XG3A 3D5OA 2FHRA 3H6SE 4EFPA 5FZUA 1Q03A 1ILR1 1W6OB 3VV1A 3Q9OA 1SLCA 3ZXEA 1JLXA 2JE9A 1PC8B 3ZSMA 1HWNB 1W6PB 4I96A 1GZWA 1S0JA 1WD4A 3R4SA 2C5DA 2EIGA 3SH3A 1FX5A 1MS4A 2YUGA 2JJ6A 1AX2A 4XJ8A 4X3AA 3HOMA 4L8QA 2Y9XE 4JP0A 5IK7A 1G9AA 1YO8A 1CESA 3ILAA 1CJPA 4Y1UA 3BRGC 2D7RA 1S0GA 2Z48A 1D0HA 4PF5A 3O44A 2X2TA 3WDWA 5GM0A 4ZFWB 1DQ0A 1DQ4A 4TLPA 3AKFA 4XE9A 5G00A 1HWMB 3P6JA 2OUJA 3VKLA 5GZDA 4I2SA 2ZGPA 1FYUA 1BARA 2DREA 1BLDA 1JLYA 1TWEA 1FATA 3CRGA 1LJ7A 1DGLA 1TWMA 3N3HA 4Q91A 5JOZA 2Q9XA 2D7FA 1FWVA 1A78A 3I2AA 3IN9A 3WCRA 4P9WA 5JLVA 1FGAA 4K21A 1VAMA 4G6MA 1FMMS 3ZSJA 2KH2A 3SITA 1LOBA 4I37A 1ENQA 4Y1VA 3SNMA 1Z78A 4P0JA 3VEQA 1ISYA 3WDXA 4GWMA 1ZA4A 1IKQA 1V6UA 1EPWA 2NYYA 1YXWA 1JUIA 4K1ZA 1O4YA 1AXZA 1EV2A 4YZ2A 3VKNA 5D63A 4Z9WB 2WSUA 3WDTA 2E4MC 4M3CE 4YFWA 3CRIA 4YGDA 5KXEA 1QOOA 5T5PA 3BA4A 3BODA 1LEDA 2VUAA 1H9PA 2NP0A 3WUDA 5I1BA 4I4OA 1GV9A 4P14A 2IWTB 1HWOB 1S0FA 2E6VA 1RMLA 2D6OX 4USOA 4QKRA 2GNTA 1I1BA 3S8KA 1SLBA 2P3KA 4FVVA 3WVJA 1FWUA 4XJUA 1WLWA 3FJIA 2L5XA 4Y1ZA 1BLAA 1W6NA 1JQZA 1JT3A 4H04A 3Q7WA 3AZVA 3S8JA 2ZQOA 4MYEA 1DFCA 1QKQA 4J2SA 4F83A 2ZGOA 3FJAA 3USUA 2QYIB 1YI7A 5FNXA 1IS5A 1S0DA 5IT6A 5E88A 1ENRA 1WBCA 1SCRA 1VCLA 5BP5A 4IY8A 1V00A 4R9BA 3P53A 1Q8PA 4PC4A 4FQ4A 1DZCA 4SLIA 3UJ0A 3F62B 3IIRA 2CL2A 1ISVA 1LOCA 5D62A 2K4AB 1JOJA 2DVAA 2WQZC 5T5LA 1XG6A 5BXPA 1V6NA 3WINA 3D4KA 3AP7A 3RSJA 4FQZA 1LU2A 4R6UB 1SLTA 3GNEA 2K43A 5GALA 5GLWA 2ZHNA 4KC3A 4F34A 3WDYA 1WUVA 2VH9A 2LTNA 1VIWB 1DQ5A 2IHOA 4YW2A 3MALA 3PMEA 1IOBA 3PUBA 1RY7A 4GWNA 5JVVA 3NV3A 4DRVA 1Q04A 5L73A 2WJSA 3TC2A 3C2UA 5EC5A 4YZ4A 1TP0A 1DZDA 4BMEA 3NBNA 4QBVA 1DQGA 2D3SA 4BOWA 1SBDA 4FPOB 4QBCA 2K8RA 2D22A 5DUXA 1N1VA 1QDCA 3WOGA 5DZGA 3A0NA 3NV1A 4GXLA 5BQUA 3BRDA 3AK0A 4FP3A 4ASMB 3UD7A 2TEPA 1H9WA 1GNHA 4YFZA 2Z49A 5H9QA 2RSTA 4FPHA 2HWAA 3ZXDA 1V6IA 1YIFA 4OEFA 1ONAA 1ZM1A 3O4DA 1HQLA 1BJQA 4LBQB 3CRHA 3RS6A 4NO4A 3O12A 4WVWA 1IT0A 3ZVXA 4QD2B 5EXOA 1MC9A 3LTQA 1C1LA 5EHAA 1AXKA 3WCSA 1GBGA 1UN1A 4GALA 1Q1UA 3FLTA 2YY1A 2E7TA 2DWRA 2PHXA 5DUYA 2P34A 4OEEA 1ULEA 2GNBA 1HWPB 4JC1A 4FPCA 1G9FA 3IM7A 1AXMA 2B7YA 2Y9WC 4QO3A 1MVQA 1LHVA 1D2SA 2I2SA 3T1LA 2WNEA 2D6LX 1LHOA 2D6KA 4WV8A 2Q3NB 4C1WA 4RL7A 1AVUA 1YBIA 4XFTA 5DVHA 3OY8B 4AWDA 2DVFA 2ET2A 1CQ9A 3NBCA 4FOQA 4GA9A 1LTEA 3BAHA 4LBLA 4LO2A 3O5WB 2UURA 3AKGA 5IUQA 2D3RA 4YM0A 2DVGA 4PBOA 4OZXA 3Q7XA 2VY0A 5HCAA 3P6IA 4J23B 1W6OA 2R1BA 1Q56A 1QNYA 3AP9A 1GKBA 1W6PA 3M3QA 1HLCA 3UJQA 5DUVA 1QXMA 4CZSA 2D3PA 2P39A 1V6KA 2BEAA 1LOAA 1WBLA 3O4AA 2DV9A 4YM3A 4P6AA 4AVSA 5HCFA 1QU0A 1SZ6B 5FREA 3O4BA 3FBYA 2ZQNA 1PZ9A 4BM8A 1S1AA 1HIBA 3H6RB 1CE7B 4Q8LA 4LO7C 4NOTA 4Y1XA 4BPZA 2KI4A 2NMNA 3ZYPA 2OVUA 1CVSA 2DU1A 4ZOTA 4IYBA 4D8HA 1AZDA 1V6XA 3MPPG 1W0OA 3M3OA 3DGTA 3GALA 4XFUA 4CRQA 4I8MA 3N7JA 2W39A 4DCKC 1Z4SA 1AX1A 4Y20B 1EYLA 1LOFC 4XMAA 1FMZA 2E7QA 4IQPA 4I4XA 4K1YA 4Q1RA 2DYCA 5DG2A 3WV6A 3OBRA 2VXTI 3ZYRA 2E53A 4LO7B 1W0PA 1URXA 1HKDA 3EF2A 1LHUA 5BVPI 2UWAA 1JTCA 4AVTA 4OWLA 1N1YA 2XB6C 1APNA 2EXKA 4D69A 4HA2A 1SLAA 5T54A 1G8WA 1OQLB 2PHRA 2ZHKA 2PHTA 4I6IA 4XDQA 2NM1A 1XZZA 4YW3A 3JUUA 4OWKA 2CWSA 5DUUA 1ISXA 3UD9A 4YLZA 1SBEA 3AJZA 4DFSA 5F8WA 2AUYA 1JW6A 4XBQA 4ZXKA 5JMCA 3B69A 3BA5A 1LECA 3CA1A 3O5SA 1MS0A 2DRZA 1Q8OA 2LALA 4LBOA 1LESA 3AKIA 2VW2A 4USPA 3I2XA 3BB2A 3VKMA 1QOSA 1V6OA 2MLLB 5BYNA 1SCSA 1GZCA 3SISA 3Q7YA 4HANA 2E4MA 3ZC9A 2WT2A 3T2TA 3AFKA 3I29B 3O0WA 4ATEA 2AXMA 4PCRA 1NLSA 2WBCA 2UU8A 4R9CA 4BMBA 3PJQA 1R8NA 2VW0A 1ULGA 2OUHA 3OJMA 3TAYA 1WLCA 1W6QA 1WD3A 1LGBA 2YXSA 1FV2A 1GSLA 1CONA 1YRZA 4H55A 3AYAA 4FPJA 3N7MA 2LIQA 5KXDA 4P9XA 4PBPA 5FRAA 4XXAA 4II0A 1DZQA 2A6ZA 2DU0A 3AP5A 4M01A 1XYFA 3ASIA 1DIWA 2VU9A 2WT1A 4Q9GA 3PG0A 41BIA 3WZ1A 1Y7BA 3UDAA 2UUSA 3FLRA 2AR6A 5GZFA 3OGGA 3IM0A 2A6YA 4I1EA 1GLHA 1BFFA 3OJVA 3IPVA 3H6QA 1IS4A 1N1TA 4ISRA 2ZHLA 5GLUA 2D23A 4ZFUB 4JCKA 2ESUA 2V5YA 1Q8SA 1W6MA 1K5UA 3NBDA 2BEBA 4YZ5A 2AYHA 1SR4A 4LBMA 4YM1A 4LO3C 3HN1A 1BASA 3WO2A 3A22A 3NWKA 1V6WA 4K20A 1N47A 2KM2A 3W58A 1VAVA 2JD4A 4XJZA 3K1XA 1LOEA 3BRFA 2I1BA 4I0YA 4KEKA 4YZ3A 4Y22A 1PZZA 5IK5A 1VALA 3FJ8A 1HDKA 4G9NA 1GZWB 1IHKA 4LBQA 2NVHA 1GICA 1QQLA 3VKFC 3ZSLA 1BFCA 2AREA 3VT0A 4YGEA 1ABRB 3M3EA 1K5VA 4GP3A 1CPMA 4XHBA 1LHWA 2ZGNA 8I1BA 3ILRA 2QN4A 1RITA 4JRAA 3B9CA 3O4OA 4ZKTB 1LGCA 4KEJA 4YG0A 1OQ1A 3IM6A 5KXCA 3WO4A 4UW3A 5GLVA 5T52A 1SR4C 2ZMNA 4YW5A 4EEEB 2HYKA 2JE7A 2ZAAA 2ES3A 4I4YA 5DSSB 1DYPA 2A6VA 5T55A 4I4PA 3OGFA 1UZZA 3AZXA 2AFGA 3HBWA 2C9AA 5CBLA 5CAZA 5SV8A 5KXBA 3ZXLA 2JECA 1DQ2A 4DPNA 3QCWA 2YZ4A 2M49A 3W9TA 1F31A 1WW5A 1DLLA 21BIA 3AJ5A 1ULFA 1NZKA 5F90A 2W08A 4YG6A 5GZEA 4FOYA 4XYXA 2A6WA 3KMVA 1BYHA 4QD2C 1HCDA 4LBKA 4FOVA 1LULA 1JYIA 5IK8A 4ZBVB 4C1XA 1QNWA 2ZMKA 3R05A 1M2TB 1HKNA 3LCPA 2DTYA 4YZ1A 3M2MA 1G9DA 3UJ4A 1FNZA 1ISZA 4Q1PA 3BAQA 4P0KA 1CVNA 3CA3A 2A3YA 5JOXA 1N3QA 3POWA 1J0SA 7I1BA 1KITA 3M3CA 2ZGTA 3H6RA 3JRRA 2P3JA 1ITBA 3HALA 1PWAA 4XKIA 3WO3A 2PHUA 1LCLA 1DYKA 4I7IA 3T8SA 4OW4A 2A5ZA 5F8SA 2R9KB 3HSMA 2AGSA 2MC2A 4AN6A 5DXDA 1A3KA 3V79C 4I4UA 2ERFA 3BTAA 4LO0C 3V0AA 2GALA 3OYWA 2AAIB 3ZX7A 1YYNA 1N4KA 1W6NB 3O49A 1H30A 4KBBA 4EKXB 1BA7A 4AGVA 2W68A 3RMXA 3ZXJA 1F9KA 1V6LA 4CTEA 1L2HA 1HQWA 4XBLA 3O0XA 1PUMB 3RG0A 1AVAC 3AJYA 5JDBA 1GANA 2X2SA 2VSAA 6I1BA 4X37A 3KM5A 1QMJA 4P9YA 4Z8SB 4GKXA 3FLPA 3AYEA 5H9RA 3WA1A 2D43A 3U4XA 4G9MA 3WUCA 4FPEA 3UL2A 2WT0A 2YROA 4YGBA 4Y26A 3A21A 4XJAA 3RTJB 3VUOA 1R8OA 3FFZA 1MS3A 4L4HA 2P37A 2EXHA 4TZDA 1RIRA 1N1SA 3FJKA 3WMUA 5BXRA 4ZFYB 4Z8BA 4LO1C 4M3CF 1DJSB 3NV4A 3HR9A 1EVTA 4YG3A 3CAHA 3RMYA 2YV8A 1UKGA 3MW2A 2DTWA 2D7IA 3D7WB 2W52A 1IJTA 1S0IA 1LOFA 4XMIA 4GAIA 2P23A 5FNWA 3POKA 1LODA 2DUPA 1QOTA 2Z42A 1G7YA 3ZXFA 1W3AA 1FNYA 1UPSA 2EALA 1PZ7A 3WDUA 3AZZA 4RA0A 4DENA 4LBQD 1ONKB 4TYSA 2ZBJA 4AYUA 2KKIA 1JHNA 2GMMA 1WBAA 3V64A 3AYCA 3FJEA 3ZSKA 1WCSA 2EF6A 3WG4A 1SBFA 4D0ZA 1BFBA 1ULDA 3C9ZA 1LENA 2GMEA 4QKSA 3IMNA 3FJCA 2UWCA 4XXPA 2UWBA 3CU1B 4IZEA 1JBCA 4L4IA 1W3GA 1V6MA 3L2YA 1LGNA 4BQ1A 1AJKA 4FOWA 3QR5A 1AX0A 4YOLA 2ERMA 3IKWA 1Q8QA 4I1BA 4XZPA 2RHPA 4CJMA 4J2KA 5D61A 1TEIA 1TIEA 3OPZA 3V65A 2XOAA 4H9WA 1WLDA 1TOOA 2ZABA 1XQNA 3FUOA 1IS6A 2OW4A 1LEMA 4LO8B 2NZ9A 4Y1YA 3B00A 3QYDA 1KDKA 2AQZA 2GDFA 4DQAA 3IAGC 3V0BB 5F8YA 4GOVA 1OKQA 2D1ZA 4ZLBB 3M1HA 5T5JA 1DHKB 4XTMA 4HJJA 4AN7B 2RG9B 2NN8A 3BOPA 1C57A 1SLLA 1BFGA 3WG2A 4D0TA 4IONA 1JT5A 1KDMA 3WHTA 5DZEA 2ZACA 2G4IA 2HZ9A 1MZ6A 3AZWA 3FJFA 1DQ1A 2AENA 4XBNA 4AVVA 1MD6A 1KRIA 3FGMA 4J2XA 1Q8VA 1T9FA 1S0BA 3ZPYA 4I30A 1AVWB 3AZYA 4JQ0A 1Z0HA 3NJ5A 2R49A 2ZKNA 1PZ8A 1V6JA 1UX6A 3FJDA 3I8TA 2YMZA 4LBNA 1MS9A 2ZGUA 3CA4A 3AX4A 3B01A 1FN0A 1YF8B 4UW4A 4Q8KA 1KQRA 1MZ5A 4LO3A 1MVEA 2A6XA 5BXSA 3MW4A 3PHZA 4PQ9A 1MS5A 4XHXA 4Q9PA 4OEGA 2D44A 2GO2A 2DURA 1N3PA 4G1RA 2PELA 2CY6A 5EWSA 4M3CB 3APBA 4FGFA 3BAUA 5AVAA 4KEIA 2CYFA 2NTDA 3A0KA 1WW6A 1BQPA 2CWMA 2Q5TA 2A3XA 3DUIA 3NV2A 3QLQA 2GN3A 4ZGRB 4DRRA 2FGFA 1YTOA 4GOYA 3CA0A 1G82A 5H9PA 1II4A 3WNXA 3B3QE 3SNVA 1DQOA 2D20A 3FJJA 4GAFA 2JKBA 2FFUA 4EFQA 1KJRA 5GAQA 3N7KA 3SLIA 2CNAA 4OWJA 4FPKA 1IRPA 4GP0A 3BIWE 5CNAA 2P3IA 3TB0A 3VSFA 2H0BA 1IILA 4Q26A 9ILBA 2A7AA 5BOWA 2ZR1B 1S0CA 3BAGA 2MIBA 3AP4A 5F5QA 3A4UA 4UW6A 3AXEA 4IZXA 4UW5A 4IY9A 2HWMA 1SLIA 3BA7A 4ITCA 2KI6B 1GNZA 4XOGA 4QALA 1G86A 1JYCA 3OJBA 1I1EA 4U2AA 3WG1A 1TTUA 3N36A 3BAOA 3AH4A 4JPZA 4I4QA 5DG1A 2ARBA 2GMPA 1W3FA 1E0OA 3UK9A 2D6PA 2R0HA 2GNDA 4XTPA 1O4ZA 1IS3A 1JT7A 1QF3A 3UD8A 1S0EA 1MACA 2FO1A 1KJLA 4ATFA 2AH2A 1AJOA 1AF9A 4HR6C 4QC4A 2PHWA 4FPFA 3JUTA 1A8DA 3AKHA 1WW7A 4BLIA 1JN2P 2WSVA 5DZUA 2ARXA 1BKZA 3BADA 1GZ9A 4AGGA 1W6QB 1BXHA 2WRYA 3ILNA 3CNAA 3WLUA 1B09A 3OY8A 2HW9A 2BFHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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