1AIVA

Apo ovotransferrin
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
686
structure length
686
Chain Sequence
APPKSVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMRKDQLTPSPRENRIQWCAVGKDEKSKCDRWSVVSNGDVECTVVDETKDCIIKIMKGEADAVALDGGLVYTAGVCGLVPVMAERYDDESQCSKTDERPASYFAVAVARKDSNVNWNNLKGKKSCHTAVGRTAGWVIPMGLIHNRTGTCNFDEYFSEGCAPGSPPNSRLCQLCQGSGGIPPEKCVASSHEKYFGYTGALRCLVEKGDVAFIQHSTVEENTGGKNKADWAKNLQMDDFELLCTDGRRANVMDYRECNLAEVPTHAVVVRPEKANKIRDLLERQEKRFGVNGSEKSKFMMFESQNKDLLFKDLTKCLFKVREGTTYKEFLGDKFYTVISSLKTCNPSDILQMCSFLEGK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Iron transport protein
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
publication title Crystal structure of hen apo-ovotransferrin. Both lobes adopt an open conformation upon loss of iron
pubmed doi rcsb
total genus 135
structure length 686
sequence length 686
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1aivA03
4HCYA 2PBWA 4G8MA 1B0LA 5I2NB 3HHGA 1Q35A 4LVQA 5H8QB 3C4MA 3UN6A 5CMBA 4GXAA 1ATGA 5AA3A 3MC2A 3PPPA 4QF9A 4I8CA 1SVXB 3MWBA 5I2NA 3K4UA 3T9HB 5H8QA 2QS2A 1GVCA 2P0SA 2DVCA 4Z0IA 4UACA 4ZE9A 3PPRA 4G4PA 3QYTA 3CIJA 5K2XA 3TCFA 4OFJA 1JVYA 4JWXA 1LCFA 4THIA 3B7DA 1B4ZA 3IL1B 4ZECA 1PBQA 3RQTA 4N13A 3IO4A 3OEMA 1FQBA 4AB6A 4F1UA 1P1NA 4F3SA 3PPOA 2ZYMA 1LBCA 1UIUA 4OHNA 4KI0E 3CSGA 4ZEDA 5H8NB 3TUSA 2H9BA 3OO9A 5A5XB 4KYSA 2DYXA 1JETA 1USYE 5BWJA 1LGBC 5H8NA 1JEUA 5I56B 1F9BA 4U1ZA 4WEPA 4IO3A 4KR5A 3KN8A 5A5XA 4Q30B 2ZYNA 3MZBA 3SEYA 1MG1A 2D21A 3QXMA 5I58B 2ONSA 5FTHA 3CR9A 1Y9UA 2Q88A 5K2YA 1IIWA 3I5OA 5KZTA 1M5DA 2F8DA 3HN0A 3K6VA 4NTLA 4DCXA 4F31B 4JWOA 2V93A 4LQ5A 2F34A 5I58A 5AA4A 4POWA 4Z7EA 4OEVA 1JW5A 5FHOA 1A99A 1JW1A 1YTVA 4QSCA 1ZLQA 1MRPA 1B51A 1TWYA 4L17A 1WODA 2E1SA 3P7IA 4GF8A 2M8CA 2ONRA 3IK6B 3SEWA 3PUWE 1A40A 3KN3A 2GRVA 4QFPA 1MXYA 4BDLA 2NVUB 5ITPA 3D4GA 2H5YA 3ZSFA 3IB0A 2O1LA 4F3PA 3LR1A 4MBPA 1S7YA 1FQCA 4YU0A 1Y20A 1NNKA 1PC3A 2REJA 3KSJA 3OXNA 3VLUA 1OVBA 3SDFA 3DP8A 5TPAB 5I59B 1QUKA 1LLSA 4H6DA 3FJGA 3G3KA 4JB7A 2XD2A 3VXCA 5JK4A 2ONKE 5I59A 4YKKA 4NF4B 3PMVA 1SI1A 1N76A 1KWHA 3FASA 3E4RA 3K00A 4XKRA 3EHSA 3TFLA 2Q89A 4GQOA 4AQ4A 3FGSA 4XKNA 3TTKA 4NF5B 1DPEA 1I6QA 2ZXTA 3PPNA 5L8DA 4KPTA 1B9JA 4IGTA 1RYXA 4ELQA 4TLMB 4NF5A 3N94A 3CFLA 2VD2A 4NWCA 3N6UA 4OERA 5TP9B 1US5A 2UVGA 3KJTA 1O64A 2YJPA 3HV1A 1YAEA 1GGGA 2VHAA 3TELA 1MY0A 1IEJA 1NNTA 1YCJA 4OETA 3MQ9A 1N3XA 4R9FA 3KOTA 3H4ZA 1N0TA 3C36A 3PD8A 2RC7A 3JYRA 1H76A 1JW4A 1QKAA 5FTIA 4PE5B 3A3CA 4QFLA 3CVGA 4LQ2A 2Q9TA 4MFIA 1JQFA 4LZ8A 3ODBA 4BLAA 1B46A 2R9JA 1HSEA 1ZBMA 5FHMA 1DTZA 1SDXA 1YPNA 3OELA 2F7AA 1TT1A 1ELJA 2O1MA 3H3GA 1B1HA 2QMXA 2XXXA 4YMAA 3FJ7A 3MBPA 5DVFA 1ZTYA 3U72A 1B52A 3OSQA 3S9MC 4DXCA 2Z22A 3MPLA 5H8SA 4IO7A 3G3GA 2Q8JA 1PB7A 1SYIA 2Q2CA 3FVNA 1L5TA 1R6ZA 3GXAA 2I0CA 2RINA 3R26A 4RJZA 1B2HA 2F7BA 4DLDA 4OFOA 1AL3A 3RPWA 1QUJA 4IGRA 4RPNA 1PB9A 5I2KB 3SKPA 2QS1A 2Y7WA 1FQEA 3UIFA 1MXWA 1MY1A 4R74A 4ELPA 4OYVA 3OOAA 4DCYA 3EF7A 5HPQA 4M1VA 1Y4TA 3EHUA 3V89B 1T0KA 1LB9A 2B65A 2HCAA 3A09A 5CMMA 1QKBA 4FE8A 3JV9A 3Q25A 3S4UA 3PUXE 1XOCA 1FTLA 1TFAA 5ISUA 4ZEFA 3O6HA 4YKJA 3K1PA 5H8HB 1XVXA 1LFGA 2Q2AA 4F22A 3OO6A 1B7HA 2DOJA 3BKIB 2XHDA 3FIRA 4LONB 4FATA 3RT8A 3C33A 1VE4A 1M5BA 4E0WA 3N26A 1EZ9A 1JEVA 3KBRA 1D4NA 1OVTA 4R6KA 3O6IA 4ESWA 3TQLA 3K01A 5B7DA 4LA9A 2FNCA 3CG3A 4OEUA 2F6PA 3TPAA 2Y7IA 1UTHA 4YKIA 1LSTA 4H0WA 3PUZE 3IJXB 5CI5A 4GD5A 2DE4A 1N84A 1URDA 1POY1 4G68B 4BDNA 2W7YA 3H6WA 2OWTA 1MXZA 4G8HA 2QJEA 4TLLB 1MY2A 3KEIA 4R75A 2X7PA 5EYFA 2AIXA 4EQ7A 4KHZE 4XTCQ 3SEVA 4ESXA 5TU0A 1ANFA 3PGFA 2ZYKA 1ZU0A 4YKPA 2DXYA 3C31A 3VLWA 4EF1A 4FJPA 2XXPA 2IA4A 4FAJA 5CM6A 2F97A 4TOZA 3VE1B 1B3GA 1WDNA 3ILUB 3IOWA 3U93A 1B5JA 3EQ1A 5DVJA 1XS5A 1M5FA 1POTA 3VDFA 3U92A 1PBPA 1NNFA 4QSDA 4R2FA 1MPCA 4NE4A 4RK2A 4MLQA 5JTYA 4EQ9A 2QS4A 4FECA 4QRZA 3MVZA 4PP0A 3QIMA 2AYSA 2FYIA 3TMGA 3W9WA 3MUQA 2DSFA 5I84A 4KFQA 3A3UA 2QMWA 2H99A 1XVYA 3CSBA 3K6WA 4DXUA 2XXYA 2XXIA 3KN7A 2DWHA 3IAZA 4DZ1A 4U22A 1SD3A 3HO7A 4ISUA 1PEBA 1B5IA 4JXIA 3LSLA 2V3QA 1VSOA 1ZIUA 1MXUA 2Z8DA 1MXVA 3SESA 3U1OA 1RYOA 5AA4B 2Y7KA 1B58A 2IEEA 4QFOA 4JWYA 4DIGA 1O63A 1LAGE 4XXUA 3KSXA 4R6YA 3GLBA 2I48A 3M8UA 1FTOA 3IB1A 4NF8B 3TTLA 1MQIA 5F7VA 3H06B 3RGYA 4ZS9A 1M5CA 3BBRA 5KCJA 4NF8A 1MY4A 1SW4A 1NNPA 1N7XA 1EZPA 4M4GA 2X26A 4GFRA 1DOTA 1OIBA 1D3KA 4F39A 1PDAA 3OO7A 3OMBA 4OZ9A 4C0RA 5EHMA 2YPNA 1LFIA 2DWJA 1NL5A 1Y3PA 3R6UA 4G2ZA 3T96B 4U1OA 4OTEA 5CMKA 1NKXA 4RA1A 3H6VA 2FA7A 2O51A 3Q28A 3FV2A 4U4SA 2ZNTA 2P2AA 4RYAA 5EHSA 3TTMA 5I57A 4IO5A 3QUJA 2DE2A 1AH5A 3V83A 3MVXA 1IITA 3PUYE 4EUOA 1OMPA 1B7ZA 4LATA 3G7WA 3MJNA 1Y3NA 4OENA 3U8QA 3G3FA 4WEDA 4IB2A 3WAFA 3M3FA 3G3IA 1EU8A 3S2VA 3MP6A 2OBGA 4NEDA 3T9VA 1SYHA 4F1VA 3FXUA 4HTGA 3K1MA 3CFZA 4IY6A 1R9QA 2ZNSA 2DWAA 4YICA 2AL5A 2XX7A 4ZEBA 4F1YA 5CC2A 1MDP1 4HS7A 4QFNA 2LAOA 2PMSA 4OWDA 3KFMA 4XIGQ 3V5AA 3TEPA 2NWJA 3O97A 3TAJA 4E0XA 3S9EA 5AA2D 4ONYA 3Q27A 3C32A 3SEUA 4YAHX 1LAHE 2I6EA 3EPEA 2H25A 3T9UA 2GHBA 5DTBA 2I4CA 3PUVE 3FD3A 2V3UA 3E13X 1AOVA 1JNFA 2Y7RA 1N7WA 4KD5A 4QFKA 4OFLA 1B0HA 1AMFA 3QSLA 1QVSA 3DM0A 4YZZA 1I6BA 4POXA 5DEXA 1CE2A 1EZOA 2Y84A 4X48A 4RPOA 1FTJA 1Z7NE 3THIA 1R9LA 4RNSA 3FJMA 3IOTA 3OSRA 1P99A 4WXJA 4X1BA 3B6TA 3WAEA 4FEDA 2HAUA 1GV8A 3TZAA 4YB6A 2R6GE 2DWIA 3MP1A 5JEIA 5H8FA 5CMCA 3LSXA 2H98A 2OWSA 4N07A 1ZJLA 4NF6A 2OLBA 4TQUQ 5AA1A 1B40A 2VD3A 3C35A 3O2AA 4N6PA 2PT1A 3UA8A 4JDFA 2I3WA 1MQDA 3VVDA 4GL0A 3I3VA 4U23A 4ZE8A 2GFEA 1VFEA 3GBAA 2Y7PA 2V25A 5L9SA 4ECFA 1B1XA 1IXIA 3VV5A 3K0VA 2G93A 5KDTB 2HAVA 3K1NA 5M2VA 3Q29A 2AL4A 4G77A 2RCBA 3O28A 1A54A 1EH3A 1LFHA 3DELB 3U94A 1QUIA 3KZGA 2F35A 5KDTA 3SEXA 5IAIA 3C9HA 5FHNA 4H8JA 1NH8A 3O66A 3M3KA 3I6VA 3B6WA 4P11A 4ZDMA 3N5LA 1Q1KA 1MH4A 2XX8A 1UTHB 4OVJA 4F3GA 2RF1A 1HSLA 4MLVA 2I49A 4F29A 3ZKKA 1FQDA 2XD3A 4U21A 3GZGA 2OK2A 4NMYA 3TTRA 3RY3A 2H4IA 3DP6A 3T22A 2GHAA 3R7XA 5AE4A 1FCKA 3VFJA 4ZZAA 4GVOA 1MM7A 4PFWA 2NXOA 2ABHA 3DLNA 4LZ5A 2E0SA 3ZKLA 1USYH 3K02A 3FVOA 4GWOA 3PMWA 1SBPA 3G3JA 1MPBA 1MS7A 4HCWA 5J1DA 3TCGA 1BTJA 2X7QA 3W9VA 4PFYA 5CBRA 4MF3A 2Z23A 3IB2A 4H65A 1ZKBA 4F19A 3FXQA 2ZYOA 3FVKA 2VGQA 4H67A 1P1OA 1IQ7A 5CBSA 1MPDA 4U2RA 3E3KA 3CRBA 3T66A 3UGWA 5AA2B 1IXHA 1MQJA 4G8NA 4C1UA 2PX1A 2O7UA 5JTYB 2A5TA 3USDA 2RC8A 1HSJA 2QL3A 4KYEA 3RLFE 1WVJA 3OD7A 5AA2A 3VVEA 4BDQA 3IORA 2UVJA 1RKMA 1R1NA 1A7LA 4ZEKA 1B6HA 4O3AA 2F6GA 1PB8A 2R71A 1N04A 3LBSA 3S9LC 4Q0CA 2RCAA 3KGCA 5IKBA 5DYHA 4G68C 3HCQA 4GLIA 2PVUA 3V8XB 1IUDA 1LAXA 2UVHA 4EXLA 4R2BA 4QHQA 1TFDA 4H5GA 4JBZA 4YB7A 4EF2A 4GOTA 1Y4CA 2XX9A 2I0BA 2UYFA 1SQYA 4K3FA 3FVGA 1OLCA 5L9OA 3T93B 3UP9A 2ZMBA 3ECRA 3T9XB 4BDRA 2QPQA 2PYYA 4UA8A 1B3LA 1MXXA 1LBBA 2VOZA 4H1XA 1Y1ZA 3EHTA 5I56A 5KCJB 3OEKA 3HHFA 2I4BA 3MPKA 1S9TA 1A8FA 3MVYA 2THIA 4EXKA 2YLNA 4BDMA 2P1SA 1S50A 3O29A 1QULA 3L6HA 1NMUA 4NWDA 2NOOA 3SETA 4IO4A 2XXWA 1NFTA 5ICTA 2QSXA 3B6QA 3RN8A 4XKQA 3TCHA 3FXRA 4P0GA 4KQPA 1UIVA 2ESNA 4DE8A 4OESA 1SI0A 2B3BA 3VLVA 3ILTB 2A5SA 2Z8FA 4U4XA 1H44A 3IX1A 2D5WA 3HPIA 4BDOA 3O6GA 5I57B 5HM4B 1FTKA 1NH7A 1DTGA 4IO6A 1IZ1A 3EN3A 3PV0E 3K6UA 3HSTA 2F78A 5CRYA 1N3WA 3OENA 2DXRA 2I58A 3TDJA 2F7CA 2O84X 3D4CA 2O7IA 2RKMA 1A55A 2HZKA 3PPQA 4LZ7A 3PMXA 1BP5A 3H03A 1MDQA 4O3CA 1MH3A 5B70A 1LCTA 3IO6A 5TPAA 3GBBA 3BFUA 1I69A 2ANJA 4X9TA 4OMBA 3RTFB 4F18A 3Q26A 2KLFA 2HQ0A 1DPPA 1MM6A 3TYHA 1DSNA 4NF4A 1QW0A 3IJOB 4OQOA 5ELVA 3IOUA 4GXSB 1Z7ME 4I1DA 5ICQA 2V3TA 1BIYA 1B7UA 2Z8EA 1A8EA 1D9YA 3MW0A 2RC9A 2ZNUA 3QUFA 3VXBA 1US4A 4LP2B 3CI8A 4KCCA 2HFBA 5ITOA 4R73A 4ELOA 2F36A 1JVXA 5TP9A 2WKYA 4H8IA 1GR2A 4H5FA 3E9XA 4I9DA 4QSEA 1OLAA 5DEXB 3KOSA 1J1NA 1B32A 3TTNA 1BLFA 1LAFE 2HEUA 1P1WA 4DDDA 3F11A 2XXUA 1H3DA 2HXWA 4FEBA 3H7MA 2B3FA 1FQAA 4RXLA 3MZ1A 3PD9A 4ELRA 1Y3QA 1B3HA 3H6UA 4R9GA 4IY5A 1I6AA 4O3BA 4I62A 3QAXA 3MZ9A 4FIMA 1DMBA 2UXAA 3OO8A 3FZVA 5HBCA 3N6TA 4JSOA 5H8FB 1IXCA 4OXVA 2XXTA 2DVZA 4NF6B 4YB5A 4C1TA 1B05A 1OQGA 2XXHA 1B5HA 1VR5A 4ZZEA 2DQVA 5DT6A 4WKMA 4EQBA 1II5A 2OJTA 1XT8A 4IO2A 3DP4A 1FTMA 4Q5TA 1P1QA 1MY3A 5BUUA 3CFXA 2QRYA 4LUBA 4HW8A 2GH9A 4R72A 2ALUA 3FATA 1H45A 2XXQA 2O6AA 3LSFB 1B4HA 3KG2A 4ND9A 4RK9A 1D9VA 1M5EA 4KYDA 4Q8RA 3ZS6A 1UTBB 1URGA 2DE3A 3PU5A 3UK4A 2DS9A 3RT6B 2VP1A 2XXVA 3LSWA 3TODA 1LB8A 4R6HA 1BKAA 3M3LA 3MP8A 1UTBA 2O68A 5I2KA 3C34A 1FQFA 1TXFA 3FV1A 1GTKA 2OZZA 1B3FA 2NUVA 1AIVA 3G3HA 3IR1A 4ZEIA 3ONMA 2G29A 2OCUA 1XHYA 1CB6A 3IOVA 3TQWA 1URSA 3K6XA 2PT2A 1SW5A 3FUZA 3AXFA 4AB5A 4PQJA 3QK6A 1MQHA 3UORA 4FORA 4YMBA 1B3EA 4GRKA 3SERA 3S9NC 4DXBA 4PFTA 1QJMA 1OQHA 3KJ7A 3VVFA 3L6GA 4X1DA 5H8HA 3JZJA 2V84A 4GL8A 3W15C 1SW2A 4XKPA 4JSDA 2QS3A 2O69A 4F3BA 3TKDA 3O9PA 1FW0A 1O7TA 5F1QA 2BJJX 4EDPA 1SW1A 1MQGA 5L9MA 3LUYA 3RNNA 1VFDA 4PETA 3LC8A 1IXGA 3MAMA 2HZLA 2REGA 2F5XA 3RUMA 2DP8A 4P0IA 4RY1A 4F2QA 1Y1MA 5DVIA 1UQWA 4GIZA 1H43A 3CG1A 1P1UA 3RTWB 4PFUA 4MH5A 3MVWA 4G68A 5LOMA 1XC1A 2CMOA 1ZMGA 2A5TB 3K2DA 3BFTA 3H6TA 2UVIA 2CZLA 2I3VA 4F2OA 2XXRA 2D3IA 2UYEA 4KCDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HCYA 4I3YA 2PBWA 2XWKA 4G8MA 1B0LA 3ROJA 3HHGA 5I2NB 1EYKA 1LBVA 1Q35A 4LVQA 5H8QB 3C4MA 3UN6A 3FBPA 4GXAA 5CMBA 1ATGA 5AA3A 3MC2A 3PPPA 4QF9A 4I8CA 4PAIA 1SVXB 3MWBA 5I2NA 3K4UA 5DW8A 3KC0A 3T9HB 5H8QA 2QS2A 1GVCA 1EYJA 2P0SA 2DVCA 4Z0IA 4UACA 4ZE9A 3PPRA 4G4PA 4O7IA 3QYTA 3CIJA 5K2XA 3TCFA 4OFJA 1JVYA 4I40A 4JWXA 1LCFA 4THIA 3B7DA 1G0HA 1B4ZA 3IL1B 4ZECA 1PBQA 3RQTA 4N13A 3IO4A 4N8YA 3OEMA 1KA1A 1FQBA 4AB6A 4F1UA 4N17A 1IMFA 1P1NA 4F3SA 3PPOA 1DK4A 2ZYMA 1LBCA 1UIUA 4OHNA 4KI0E 3CSGA 4HE1A 2CZIA 4ZEDA 5H8NB 3TUSA 2H9BA 3OO9A 5EQ9A 5A5XB 4KYSA 2DYXA 1JETA 1USYE 5BWJA 1LGBC 2P3NA 5H8NA 1JEUA 5I56B 1F9BA 4U1ZA 4WEPA 4IO3A 4KR5A 3KN8A 5A5XA 4Q30B 2ZYNA 3MZBA 3SEYA 1MG1A 2D21A 3QXMA 2Q8MA 2GQ1A 5I58B 2ONSA 5FTHA 3CR9A 3GYYA 1Y9UA 2VPOA 1RDYA 2Q88A 5K2YA 1IIWA 3I5OA 5KZTA 1M5DA 2F8DA 3HN0A 3K6VA 4N81A 4NTLA 4DCXA 4F31B 4JWOA 2V93A 4LQ5A 2F34A 5I58A 5AA4A 4POWA 4Z7EA 4OEVA 1JW5A 5FHOA 1NV7A 1A99A 1JW1A 1YTVA 4QSCA 1ZLQA 1MRPA 1B51A 1TWYA 4L17A 1WODA 2E1SA 3P7IA 4GF8A 2M8CA 2ONRA 3IK6B 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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