The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
KKPLPPTPEDNRRSFQEPEETLVIALYDYQTNDPQELALRCDEEYYLLDSSEIHWWRVQDKNGHEGYAPSSYLVEKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Regulatory intramolecular association in a tyrosine kinase of the Tec family.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Mus musculus
|
| molecule keywords |
ITK
|
| total genus |
5
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2LQN A; 1G2B A; 4RUG A; 3VS6 A; 3QWX X; 3REB B; 1NEB A; 1AWJ A; 2KXC A; 2ROL A; 4DEY A; 1YN8 A; 2LZ6 B; 1ZUY A; 3M0R A; 1A0N B; 4K11 A; 2A08 A; 2M51 A; 3GBQ A; 1E7O A; 5I22 A; 1UUE A; 1NYF A; 5IXB A; 2C0T A; 2EBP A; 1QWF A; 1AVZ C; 3SHW A; 2DLP A; 2J06 A; 4E6R A; 5L23 A; 2SEM A; 1X6G A; 2ROT A; 1SSH A; 1RUW A; 4LNP A; 4ESR A; 1KIK A; 1K4U S; 2K79 A; 2I0N A; 1S1N A; 4D8K A; 2KRS A; 1RLQ C; 4J9D A; 4HVU A; 2LJ3 A; 4J9G A; 4AFQ C; 2DF6 A; 1BBZ A; 1EFN A; 3H41 A; 4RTU A; 1WX6 A; 4RTX A; 1HJD A; 1W6X A; 2HDA A; 4Z88 A; 5I11 A; 1T0H A; 1X2Q A; 4IIM A; 1KFZ A; 2A37 A; 1UG1 A; 2L3S A; 3LH5 A; 1W70 A; 1JXO A; 2OI3 A; 2YSQ A; 5EC7 A; 1V1C A; 3TVT A; 1J3T A; 1AZG B; 4JJD A; 3U23 A; 4OMM A; 2W10 A; 3PVL A; 4J9I A; 3VS5 A; 2GNC A; 1UEC A; 4GLM A; 2CH4 W; 2CRE A; 4ZNX A; 5GJV B; 2VVK A; 4AFS C; 2EPD A; 1GFD A; 2FPE A; 1GCQ A; 1WXB A; 2KR3 A; 3EHR A; 1PNJ A; 2FO0 A; 2ESW A; 3I5S A; 1WA7 A; 1M3C A; 2LJ0 A; 5HCK A; 1NEG A; 2VWF A; 2KYM A; 2MIO A; 1PKS A; 2EYW A; 4GBQ A; 2DIL A; 1JEG A; 1M8M A; 2C0I A; 1SHF A; 3I5R A; 2QDL A; 3UAT A; 3IQL A; 4OMO A; 1JO8 A; 1UGV A; 4CC4 B; 4RTV A; 2CSQ A; 1ZUU A; 2DMO A; 1H92 A; 1ZSG A; 2CDT A; 2FRW A; 4HCK A; 2BZ8 A; 2JW4 A; 3H0H A; 1TG0 A; 2NUZ A; 5FWB A; 2J7I A; 4J9C A; 1YWO A; 1PKT A; 4LUE A; 1K76 A; 1SEM A; 1T3L A; 2EGE A; 3M0U A; 1GL5 A; 4F14 A; 4QT7 A; 1WDX A; 3VS7 A; 2CSI A; 2K7A A; 2LX7 A; 2X3W D; 3A98 A; 1Y57 A; 1GFC A; 2BZX A; 2KRN A; 2L0A A; 2XMF A; 2RN8 A; 1K0X A; 2EKH A; 1NYG A; 1GCQ C; 1NLP C; 2DVJ A; 2J6O A; 2E5K A; 1GCP A; 1WI7 A; 3FJ5 A; 2LQW A; 2JMC A; 1OPK A; 1X6B A; 2OAW A; 5GJW B; 2RQW A; 4KRT A; 2DYB A; 3VRY A; 1I0C A; 1GBR A; 3UF4 A; 5IHK A; 2OJ2 A; 2EYZ A; 4AG1 C; 2FEI A; 2F2V A; 4AG2 C; 2KNB B; 3PE0 A; 3RNJ A; 1ABQ A; 1OEB A; 1RLP C; 1WXU A; 4M4Z A; 2KE9 A; 2K2M A; 1K0S A; 2EVR A; 2ED0 A; 2D8J A; 4JZ4 A; 5IHI A; 2DRM A; 1T3S A; 2F2X A; 3H0F A; 4JZ3 A; 1ZUK A; 3I35 A; 1X27 A; 4J9B A; 1G83 A; 1VYV A; 3M0T A; 1M3A A; 2DL3 A; 2AKK A; 4LUD A; 1U06 A; 2D8H A; 4R0K A; 3UA6 A; 2AK5 A; 2DE0 X; 1X43 A; 1BB9 A; 1H8K A; 1E6H A; 1WXT A; 2PZ1 A; 1QCF A; 3EGU A; 2AKL A; 1M3B A; 2PTK A; 1B07 A; 2LP5 A; 2K3B A; 3PVQ A; 5IH2 A; 4JPB W; 1MV3 A; 1ARK A; 1SPK A; 1AWX A; 3THK A; 1JQQ A; 1PRM C; 2EQI A; 1X2K A; 1UE9 A; 2A28 A; 2LMJ A; 2YT6 A; 4RTW A; 1K9A A; 5FW9 A; 4DEX A; 2KT8 A; 1YCS B; 2C0O A; 2KEA A; 2K6D A; 1SHG A; 3QWY A; 1OPL A; 1VYT A; 1UDL A; 4JJC A; 3EG2 A; 1WYX A; 3TSW A; 3C0C A; 1AWO A; 2JMA A; 3ZL7 C; 3SEM A; 2EYY A; 1ZX6 A; 4RTT A; 4X1V A; 2KYB A; 1TUD A; 2HEQ A; 1ABO A; 1SRL A; 2LCS A; 3VRZ A; 4OMP A; 2FG0 A; 2ED1 A; 2DX1 A; 2DNU A; 1XOV A; 1VYU A; 3NHN A; 2MCN A; 1RI9 A; 2RMO A; 1YNZ A; 2GGR A; 2J6F A; 1ZLM A; 1KJW A; 3I9Q A; 1M30 A; 1Z9Z A; 4CC7 A; 2KBT A; 2RQR A; 2V1R A; 2G6F X; 2CT3 A; 4RTZ A; 3NGP A; 1U3O A; 1GBQ A; 2HBW A; 1KSW A; 1NG2 A; 1JU5 C; 1WFW A; 2KXD A; 2DA9 A; 3UA7 A; 4CC2 A; 3CQT A; 3M0P A; 4HXJ A; 1WIE A; 2KRM A; 2L3P A; 2LJ1 A; 3EG1 A; 2A36 A; 2ABL A; 1PRL C; 1CSK A; 1MV0 B; 2YUO A; 2L3Q A; 2NWM A; 2AZV A; 2RF0 A; 1PWT A; 2KRO A; 1I07 A; 2DBK A; 2BZY A; 2J6K A; 2K9G A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 1QKX A; 3NMZ C; 2CUD A; 2YUN A; 4AFZ C; 1CKA A; 3EG3 A; 2YUP A; 2EGC A; 3EHQ A; 4ORZ A; 2RQV A; 3R6N A; 2MOX A; 2AZS A; 1TUC A; 2DM1 A; 1QLY A; 2O31 A; 2GTJ A; 3H0I A; 1AWW A; 1CKB A; 2JS2 A; 2B86 A; 4OMQ A; 2CUB A; 2JS0 A; 4CC3 A; 1IO6 A; 3O5Z A; 3TSZ A; 2L2P A; 1X69 A; 2DBM A; 2JTE A; 2O9V A; 2EGA A; 3ULR B; 1NM7 A; 3RBB B; 2DL8 A; 1E6G A; 1YP5 A; 2DRK A; 4J9F A; 2HSP A; 2ECZ A; 1ZBJ A; 1GRI A; 1T0J A; 4HVW A; 1B3Q A; 1UTI A; 2H8H A; 2JXB A; 2FPF A; 2JT4 A; 2LNH B; 2X3X D; 4D8D A; 1MUZ A; 2YDL A; 2ENM A; 5IHN A; 1HD3 A; 2RNA A; 2RQT A; 1OOT A; 1UJY A; 2F2W A; 1BU1 A; 3VS2 A; 2W0Z A; 4OML A; 1BK2 A; 2J05 A; 2D1X A; 4EIK A; 3M0S A; 2VKN A; 3KFV A; 2O9S A; 2RQU A; 2DL7 A; 2DL5 A; 1K1Z A; 1W1F A; 1LCK A; 5IXF A; 1AZE A; 4Y92 A; 2CH4 A; 4WCI A; 2GTO A; 2D0N A; 1UHF A; 2O2O A; 3VS1 A; 2CT4 A; 4A63 B; 3JV3 A; 5ECA A; 1FMK A; 1QKW A; 4HVV A; 3REA B; 2FPD A; 1SRM A; 2HCK A; 4J9H A; 4JJB A; 1UJ0 A; 2JM9 A; 1Y0M A; 1HSQ A; 2RPN A; 4RTY A; 4F16 A; 3EG0 A; 1OV3 A; 2GQI A; 2V1Q A; 1VA7 A; 1PHT A; 2M0Y A; 4IIO A; 1NLO C; 3NPF A; 2YUQ A; 4FSS A; 1U5S A; 4Z8A A; 2IIM A; 2P4R A; 1H3H A; 4LN2 A; 2KGT A; 1N5Z A; 2EYX A; 2EW3 A; 2JM8 A; 4AFU C; 1WLP B; 4J9E A; 1YWP A; 4LE9 A; 2DJQ A; 4F17 A; 1AOJ A; 1UFF A; 2BTT A; 3VS3 A; 2KT1 A; 1QWE A; 1AEY A; 2O88 A; 3M0Q A; 1AD5 A; 2SRC A; 1FYN A; 3VS0 A; 2PNI A; 2DL4 A; 4OMN A; 1UHC A; 4Z89 A; 1I1J A; 2FRY A; 2GBQ A; 5FWC A; 1JXM A; 1M27 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 5FU6 B; 1G2B A; 4OGC A; 4PJM A; 4RUG A; 1VQ6 A; 3EGX B; 2MWO A; 3REB B; 4C8Q A; 1AWJ A; 4JRK A; 3CBO A; 4FW2 A; 1R8O B; 2LZ6 B; 2KI7 A; 2RJF A; 3MJX A; 4XTW A; 1E7O A; 3I56 T; 1I8F A; 1NYF A; 1VQK A; 3TEE A; 5IXB A; 3RES A; 3CCQ A; 2PU9 B; 3RKY A; 3CCE Q; 4PJO G; 3SWN C; 1QVG S; 1SSH A; 1UGP B; 1N27 A; 2JN0 A; 1M90 R; 4HCZ A; 1VQM A; 3DLL A; 1KHI A; 4NL2 A; 1K4U S; 4WTO B; 1LPL A; 2LJ3 A; 4J9G A; 1BCM A; 2EQU A; 1HJD A; 5KYX B; 1W6X A; 2DTO A; 2OTL T; 1X01 A; 1IHV A; 2LNV A; 2QAS A; 1LJO A; 5D7U A; 3CCV A; 1G8X A; 3CD6 A; 1UG1 A; 2HQH A; 5LJ3 e; 2CYZ B; 2QI2 A; 2YSQ A; 5EC7 A; 5M9O A; 3HPW A; 4XU1 A; 4M75 F; 1J3T A; 3U23 A; 4A4G A; 3I55 A; 5GAO p; 2X35 A; 2DXB A; 3PVL A; 3VS5 A; 2BUD A; 4JS4 A; 1UEC A; 1WJS A; 1VQ9 T; 1WQW A; 4GLM A; 2CH4 W; 4M7A C; 2VVK A; 2M1H A; 1WXB A; 3C94 A; 3JAM E; 3G6E A; 2KR3 A; 3EHR A; 2DVE A; 3VKI A; 5GAM j; 2OX7 A; 4M7D D; 2MK5 A; 2VWF A; 2KYM A; 4J8O A; 4NL3 A; 2C0I A; 2QDL A; 5GAO q; 4OMO A; 2HL5 C; 3HFO A; 1ZBX A; 2XD0 A; 1UB4 A; 2OTL A; 3QPH A; 1G3Y A; 2P4T A; 3A1P A; 4O6J A; 3JCM h; 3OBY A; 3JCM J; 2K3X A; 1WPY A; 2BKD N; 2XG8 D; 3CC4 A; 2NUP B; 4PJO E; 4OB3 B; 1WDX A; 3VU3 C; 4M7A F; 3VS7 A; 2FZC B; 2KMT A; 4BY6 C; 3A8H B; 1K8A U; 1GFC A; 2BZX A; 2XMF A; 1VQ9 A; 4Y91 A; 4DBF A; 1B34 B; 1AHJ B; 2E5K A; 6AT1 B; 2KK4 A; 4JRP A; 1N9R A; 1X6B A; 1PSE A; 2OAW A; 3QUI A; 4KRT A; 3SWN B; 4HT8 A; 3VRY A; 1I0C A; 1N8R U; 4PFP A; 3UF4 A; 4M7A A; 1AT1 B; 5IHK A; 1Q81 C; 1QCO A; 1YJ9 T; 4AG1 C; 2KVQ G; 4C5G A; 1YFN A; 4PLL A; 1ABQ A; 2GQV A; 3V8J A; 2NLU A; 5I2M A; 5GAN h; 5GAM e; 2DXT A; 2ED0 A; 4JZ4 A; 5IHI A; 3X28 B; 1T3S A; 2F2X A; 2EIF A; 1QVP A; 1G83 A; 1VYV A; 3M0T A; 4B6M A; 1NJI C; 2DL3 A; 2RHX A; 3UA6 A; 2AK5 A; 2MWP A; 1X43 A; 1QCF A; 3LGF A; 1M3B A; 4MZM A; 3OB9 A; 2QXF A; 2LP5 A; 5J3B A; 2K3B A; 1KD1 C; 3A5Z B; 1W4S A; 2PVG B; 3MPU B; 3FEO A; 1PRM C; 4M7A B; 1X2K A; 2LMJ A; 1C1A A; 5FW9 A; 2ZPB B; 1OPL A; 1VYT A; 3ME9 A; 3DB4 A; 1WYX A; 2CGH A; 3EG9 B; 1AWO A; 4QQ6 A; 1YJ9 A; 2OTJ A; 2H3J A; 5LJ3 d; 4ZTJ A; 5LJ3 g; 3DKM A; 1M1K C; 4FU6 A; 4P5N A; 1MNE A; 2FG0 A; 3RMS A; 5CKF A; 3PT9 A; 2E3I A; 3M54 A; 2RMO A; 1Y96 A; 2DKG A; 2GGR A; 2DK3 A; 2YRV A; 4F04 B; 4LD6 A; 1ZLM A; 1O9S A; 3L2Q A; 1O75 A; 1QP3 A; 3NGP A; 2HBW A; 4KUL A; 2HNI A; 3MEW A; 1M90 U; 3C4S A; 4C8Q G; 3NFC A; 1FMW A; 4XTX A; 5HK0 A; 4Q5W A; 4KUD K; 3CMA Q; 3MCA B; 1OYX A; 1QVF A; 3CPW S; 2XI9 A; 2R5A A; 1VQ6 Q; 2ABL A; 2QG9 B; 1MV0 B; 2O01 E; 2NWM A; 3UDC A; 2VXF A; 3CCR T; 3PGG A; 2RD1 A; 2AZV A; 1PWT A; 2P0Q A; 2COZ A; 1Y96 B; 2BZY A; 2K9G A; 3H9N A; 1Z9Q A; 3VS4 A; 1QKX A; 1R0C B; 1BI1 A; 2YHT A; 4ZN3 A; 4FIB A; 5LJ3 f; 5GMK m; 5LJ5 h; 1SSF A; 3QDR B; 1WNL A; 2RQV A; 3R6N A; 1XNI A; 3C95 A; 2BE9 B; 2LCC A; 1WHL A; 2DM1 A; 1AWW A; 4J7F A; 1QW1 A; 3RR6 A; 5CK9 A; 2VV5 A; 3O5Z A; 1IRX A; 3UPU A; 2L2P A; 1QP2 A; 3WVE B; 3CCE A; 2O9V A; 3CD6 Q; 1E6G A; 1TXQ A; 1OI1 A; 2RM4 A; 1YP5 A; 1BIB A; 4KGV B; 1D3B A; 5C6S A; 8AT1 B; 2L8D A; 5GAM d; 4HVW A; 1RAG B; 1B3Q A; 1RAH B; 1G3W A; 1UTI A; 5GAM g; 2JXB A; 4E7Z A; 4X9D A; 3MEV A; 2JT4 A; 4M75 G; 4OB0 B; 2YDL A; 5IN1 A; 1YJW Q; 3I56 Q; 3L2W A; 1HD3 A; 2RQT A; 1OOT A; 1UJY A; 2QAZ A; 4M7D F; 2XK0 A; 2A0F B; 2QQR A; 2D1X A; 4OF1 A; 4EIK A; 1IHW A; 1KG1 A; 2VKN A; 1PG5 B; 5DY9 A; 2DL5 A; 2IG0 A; 3HFN A; 2CH4 A; 4C8Q E; 1V76 A; 4A4E A; 1UHF A; 3CCU T; 3VS1 A; 4M7D A; 1QKW A; 2X4J A; 1D3B B; 3HRS A; 3BDU A; 1SRM A; 4C0D B; 4F16 A; 2P0P A; 5J39 A; 4PJO B; 4LD9 K; 3RKW A; 2V1Q A; 2LCL A; 1PHT A; 5D6W A; 1NLO C; 3NPF A; 2IIM A; 2P4R A; 3G4S T; 3QG1 A; 4ME7 A; 3DLM A; 4LN2 A; 5GAM f; 1TU0 B; 2MI6 A; 3TU4 K; 3CC2 Q; 3JCM P; 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1BI0 A; 1GFD A; 1M5Q 1; 3ER0 A; 5KE2 A; 2FO0 A; 2JTM A; 2ESW A; 2AHJ B; 2F1L A; 1M3C A; 5HCK A; 2E41 A; 2PQW A; 4M77 D; 4FM4 B; 1PKS A; 4RG8 A; 2DIL A; 5GAN j; 1M8M A; 3X24 B; 4HKE A; 3I5R A; 4JLI A; 1Q82 C; 4E7J A; 3IQL A; 4XQ3 A; 1JO8 A; 1M1K R; 3EFS A; 1UGV A; 4RTV A; 4MZT A; 2E12 A; 1ZUU A; 2P84 A; 2CDT A; 2RK1 A; 2JW4 A; 1D09 B; 4LDU A; 1HK9 A; 2WSC E; 3X26 B; 5FWB A; 3JB9 H; 1LOJ A; 1WHJ A; 2JOY A; 4J9C A; 1YWO A; 3S3O A; 2QGF B; 3JCM e; 3GIB A; 1SEM A; 2EGE A; 5KYU B; 1GL5 A; 2CSI A; 2K7A A; 2LX7 A; 2QQ9 A; 3CMA A; 5FRO A; 2KRN A; 2COY A; 4PJN A; 1NYG A; 1G5V A; 2KY9 A; 3CC7 Q; 2JJ9 A; 3VYG A; 4M75 C; 1WI7 A; 2RI3 A; 1KC8 U; 1PD0 A; 4JJN K; 1OPK A; 4OB2 B; 1YJW T; 2RQW A; 2DYB A; 1IGU A; 1GBR A; 2OJ2 A; 3OQ5 A; 1UGR B; 5CAI A; 3JB9 J; 4KH1 B; 4AG2 C; 4CRI A; 1G3S A; 3PE0 A; 2QTV A; 1RLP C; 3HSB A; 4M4Z A; 3G71 Q; 3BW1 A; 2K2M A; 2D8J A; 1NE8 A; 3CCR Q; 3WVD B; 2DRM A; 3H0F A; 3I35 A; 4J9B A; 5GAN e; 4BAC A; 2AKK A; 1IGQ A; 2KAF A; 2MMP A; 2D8H A; 4FT4 A; 4R0K A; 4IUR A; 5C0M A; 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