The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
57
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structure length |
57
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Chain Sequence |
KELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNGRQGFVPAAYVKKLD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Obligatory steps in protein folding and the conformational diversity of the transition state.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Sh3-domain
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| source organism |
Gallus gallus
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| molecule keywords |
A-SPECTRIN
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| total genus |
11
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| structure length |
57
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| sequence length |
57
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-07-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXO A; 1JEG A; 1KJW A; 2O2O A; 4RTZ A; 4D8D A; 4HVU A; 4OMO A; 4JPB W; 1JO8 A; 1UHF A; 2DL3 A; 4J9D A; 1VA7 A; 2JT4 A; 1A0N B; 2M51 A; 4ZNX A; 2ESW A; 2KGT A; 2K79 A; 1T3S A; 2ED1 A; 1CKB A; 4Z8A A; 2JM8 A; 3EHR A; 2AKL A; 2EQI A; 3NMZ C; 1UJ0 A; 1H3H A; 2KXC A; 2QDL A; 1G2B A; 2YUQ A; 1WIE A; 2HSP A; 1OPL A; 1MV0 B; 2OJ2 A; 3PVL A; 2C0T A; 3SEM A; 1N5Z A; 2EYW A; 2YT6 A; 1S1N A; 1ABO A; 2XMF A; 1K9A A; 3LH5 A; 1BK2 A; 2DBM A; 1GCQ A; 5L23 A; 2X3X D; 1MUZ A; 4D8K A; 2DRM A; 2GQI A; 4LUD A; 5I22 A; 3EG3 A; 1UEC A; 4HVW A; 4CC2 A; 1UDL A; 1T0J A; 2JXB A; 2KYM A; 1SPK A; 4OMN A; 3QWY A; 2EGA A; 5EC7 A; 4EIK A; 3VRY A; 2RQW A; 2RNA A; 1YP5 A; 1U3O A; 1UJY A; 4J9C A; 3EG0 A; 1YNZ A; 2YDL A; 1QCF A; 2E5K A; 2KYB A; 2AK5 A; 2LX7 A; 1YCS B; 3JV3 A; 2FRY A; 3I9Q A; 3CQT A; 4ORZ A; 2C0I A; 1WYX A; 4F17 A; 4ESR A; 2DX1 A; 1GFC A; 1VYV A; 2HCK A; 4HXJ A; 4OMQ A; 4X1V A; 4JJC A; 1EFN A; 4IIM A; 1NEB A; 3I5S A; 4AFQ C; 1BB9 A; 1MV3 A; 2KT1 A; 2LJ1 A; 2NUZ A; 2V1Q A; 4Z89 A; 1T3L A; 3EG2 A; 2L3Q A; 1TUD A; 3ULR B; 1PWT A; 1X6G A; 1WFW A; 3QWX X; 1KSW A; 1X6B A; 3VS5 A; 4RTX A; 4Z88 A; 4F16 A; 2LJ3 A; 2B86 A; 2FEI A; 4AG1 C; 2O9S A; 3M0U A; 3NPF A; 3NGP A; 1NM7 A; 3REA B; 5GJW B; 1GBR A; 1SEM A; 4OMM A; 1RUW A; 4DEX A; 3VS0 A; 2DM1 A; 2P4R A; 4K11 A; 2EW3 A; 3UA7 A; 2AZS A; 2EGE A; 4AFU C; 1H92 A; 2DIL A; 2ROL A; 2OAW A; 1QWF A; 3M0S A; 1QWE A; 2PNI A; 2BZ8 A; 2PTK A; 1UGV A; 5FWC A; 2EKH A; 3VS2 A; 1NLO C; 3UF4 A; 3IQL A; 1M8M A; 2JTE A; 1JQQ A; 1K76 A; 4AG2 C; 2JMA A; 2RQR A; 2FG0 A; 2L0A A; 1AWO A; 1AWX A; 1ZX6 A; 2YSQ A; 1E6G A; 1ZUY A; 2EYY A; 4RTT A; 1PRM C; 2CSI A; 2M0Y A; 1IO6 A; 2EVR A; 1GL5 A; 1X2Q A; 1QLY A; 2K7A A; 1AEY A; 2ECZ A; 1WXT A; 5HCK A; 1YWO A; 2CT3 A; 2DL8 A; 2J05 A; 5IH2 A; 1PNJ A; 2EPD A; 2JMC A; 5FW9 A; 2K9G A; 3U23 A; 4QT7 A; 1QKW A; 4LE9 A; 1GFD A; 2EYX A; 2NWM A; 2DL7 A; 5IHK A; 3NHN A; 2H8H A; 4OMP A; 4JJB A; 1OV3 A; 1AOJ A; 4E6R A; 2SRC A; 1Y0M A; 4LUE A; 1GBQ A; 4HCK A; 2FPD A; 2A36 A; 1HD3 A; 5GJV B; 4R0K A; 2HBW A; 3M0P A; 2LZ6 B; 2MOX A; 3O5Z A; 2DLP A; 2ED0 A; 2LQN A; 2CRE A; 4KRT A; 5ECA A; 1U06 A; 1WDX A; 1SRL A; 1K1Z A; 2CH4 A; 2L2P A; 4J9I A; 4J9B A; 4A63 B; 2YUP A; 1AVZ C; 2CUD A; 1OPK A; 2J7I A; 2D0N A; 2RF0 A; 1KFZ A; 1TG0 A; 1X27 A; 3RNJ A; 2J06 A; 2EBP A; 2KRS A; 4J9G A; 3TVT A; 1SHG A; 4WCI A; 2X3W D; 1X43 A; 1Z9Z A; 1VYT A; 2DNU A; 3I35 A; 4GLM A; 1I1J A; 2MIO A; 4Y92 A; 1HJD A; 2RQU A; 2J6K A; 2DRK A; 4RTY A; 3FJ5 A; 4J9H A; 3GBQ A; 2AKK A; 2JM9 A; 2KT8 A; 1ZLM A; 1BU1 A; 2YUN A; 1FYN A; 1W70 A; 1E6H A; 2JS0 A; 4J9E A; 2KNB B; 2W10 A; 3VRZ A; 2GGR A; 2LCS A; 1ZUU A; 2DE0 X; 2CUB A; 1RI9 A; 1SHF A; 1ARK A; 2W0Z A; 1J3T A; 1ZUK A; 2LMJ A; 2VWF A; 3H0I A; 1PHT A; 2RPN A; 1M27 C; 1I07 A; 2DJQ A; 2YUO A; 2L3P A; 3H0H A; 1YN8 A; 4LN2 A; 2DF6 A; 3M0R A; 3PE0 A; 1PKT A; 2KRO A; 1HSQ A; 3EGU A; 2CT4 A; 1JU5 C; 2FRW A; 1LCK A; 4RTV A; 4FSS A; 1M3C A; 1UG1 A; 2BZY A; 1B3Q A; 2I0N A; 1GCQ C; 4AFZ C; 2CH4 W; 2GBQ A; 2JW4 A; 1UUE A; 2JS2 A; 1RLP C; 1QKX A; 1H8K A; 1UFF A; 2D1X A; 3I5R A; 2J6F A; 1XOV A; 3VS7 A; 3ZL7 C; 1JXM A; 1UHC A; 2FPE A; 2LJ0 A; 4CC4 B; 4AFS C; 1M30 A; 2CDT A; 1WX6 A; 3KFV A; 3UAT A; 2RN8 A; 2KRN A; 2VKN A; 4F14 A; 2GNC A; 2RQT A; 2L3S A; 1SRM A; 2DMO A; 3H41 A; 5IXB A; 2O9V A; 2LQW A; 2V1R A; 1NLP C; 1UE9 A; 3R6N A; 2IIM A; 3RBB B; 2AZV A; 4JJD A; 2ABL A; 1YWP A; 1PKS A; 4J9F A; 3UA6 A; 3VS6 A; 2O88 A; 2DA9 A; 2FPF A; 2DL5 A; 1WXU A; 2D8H A; 2ENM A; 1PRL C; 3M0T A; 1AWW A; 1KIK A; 1NEG A; 4IIO A; 2RMO A; 1WXB A; 1ZBJ A; 2ROT A; 4JZ3 A; 3H0F A; 1X69 A; 2G6F X; 2VVK A; 3THK A; 2EYZ A; 4LNP A; 2LP5 A; 2LNH B; 2GTO A; 1GRI A; 3C0C A; 1X2K A; 1WLP B; 1WA7 A; 2A08 A; 3TSZ A; 1K0X A; 1RLQ C; 5IXF A; 1V1C A; 2C0O A; 2SEM A; 3VS4 A; 2KXD A; 3EG1 A; 2KR3 A; 2DBK A; 4GBQ A; 3SHW A; 2EGC A; 3VS1 A; 2A37 A; 2BTT A; 5IHN A; 1U5S A; 2KE9 A; 1I0C A; 3REB B; 3A98 A; 5I11 A; 2HDA A; 2J6O A; 4RTU A; 1NYF A; 1K0S A; 1TUC A; 2DYB A; 4JZ4 A; 1NYG A; 1T0H A; 3PVQ A; 1CKA A; 2F2V A; 1B07 A; 2PZ1 A; 2MCN A; 5FWB A; 2FO0 A; 2K3B A; 1K4U S; 1FMK A; 4CC3 A; 1AWJ A; 4HVV A; 2CSQ A; 3EHQ A; 1SSH A; 5IHI A; 2BZX A; 2HEQ A; 2KEA A; 2DVJ A; 1VYU A; 2GTJ A; 1G83 A; 1CSK A; 2KRM A; 1E7O A; 1M3A A; 1Y57 A; 2F2W A; 2D8J A; 2KBT A; 3VS3 A; 4DEY A; 1ABQ A; 3TSW A; 1W6X A; 1AD5 A; 1ZSG A; 2RQV A; 1OOT A; 4OML A; 1AZE A; 1OEB A; 1NG2 A; 2F2X A; 1W1F A; 2K6D A; 4RTW A; 1Z9Q A; 2O31 A; 1BBZ A; 1GCP A; 1WI7 A; 3M0Q A; 4CC7 A; 1AZG B; 2DL4 A; 4RUG A; 2K2M A; 2OI3 A; 2A28 A; 4M4Z A; 1M3B A; 1UTI A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JEG A; 4MMK A; 4D8D A; 1VQ5 A; 4J9D A; 1A0N B; 1ZA2 B; 3TEE A; 2QAS A; 2M51 A; 5CKF A; 1VQ8 Q; 4TVR A; 2X9H A; 2XK0 A; 2LX9 A; 2DFU A; 3PMT A; 2V8K A; 4E7L A; 4N4G A; 3H9N A; 2FYK A; 2E6N A; 3GOX A; 3S3O A; 1NJI R; 4C5G A; 2YUQ A; 2HSP A; 1OPL A; 1MV0 B; 1U8R A; 2OJ2 A; 1VQ9 Q; 2XG8 D; 3SEM A; 3QYH B; 2YT6 A; 2VAS A; 4OP0 A; 2L3R A; 2XMF A; 1K9A A; 4IUQ A; 1RL2 A; 1BK2 A; 2XDD A; 5L23 A; 2QEX A; 2X3X D; 5LJ3 g; 1B34 B; 1UEC A; 4HVW A; 2EJF A; 4ZTF A; 2HSE B; 4M77 A; 1BIA A; 4E7H A; 2VXF A; 1QMC A; 2VGM A; 2QXF A; 4KBM B; 4M7A A; 3OYG A; 2JNG A; 2RQW A; 4IUR A; 2P0K A; 4C8Q G; 1UJY A; 1IRX A; 5LJ5 e; 3OYB A; 5GAN 2; 2XD0 A; 2C0I A; 3SDZ A; 3OS0 A; 1GFC A; 2M1H A; 3QPH A; 4HXJ A; 2QTX A; 5GAN 6; 4IIM A; 4AFQ C; 1I4K 1; 1M90 U; 1M8V A; 1BB9 A; 2QEX T; 2LJ1 A; 1MMA A; 2NUZ A; 3KXT A; 4HCC A; 1VQM Q; 1T3L A; 5GAM d; 1N8R R; 4EMK A; 1C0M A; 3G71 A; 1ZA1 B; 4Z88 A; 4F16 A; 1JB0 E; 1N6A A; 1GBR A; 2CZ6 B; 1SEM A; 3AT1 B; 1NBE B; 2EW3 A; 2EGE A; 2DIL A; 4A54 A; 1VQ6 A; 3FEO A; 1KD1 U; 3QO3 A; 2HNI A; 2BZ8 A; 1UGV A; 5FWC A; 2BKD N; 4A4K A; 3VS2 A; 1YJW Q; 1D1A A; 1XTD A; 2JMA A; 3FB9 A; 2LRQ A; 4F04 B; 1D3B A; 2YSQ A; 3J81 E; 1IO6 A; 1TS9 A; 3VJP A; 1FXX A; 1YWO A; 4P5N A; 2CT3 A; 5D6Y A; 1V76 A; 1DJ7 B; 1JJ2 P; 3JCM Q; 3M58 A; 3RMS A; 1PNJ A; 3CD6 A; 4C0D C; 4L5G A; 1VQ6 T; 3M55 A; 3G7Z A; 5GAN f; 3OS2 A; 1WGS A; 3MJX A; 1GFD A; 3I56 Q; 3CCQ A; 2OTL Q; 4BY6 C; 2EKO A; 5KE3 A; 2YRD A; 3SWN B; 5LJ5 g; 3HRS A; 2QQS A; 2LVM A; 1BKB A; 1ZSZ A; 2COY A; 2K57 A; 1VUB A; 4PJL A; 2CZ7 B; 4LDX A; 3EFS A; 2VXE A; 1HD3 A; 5GJV B; 3A5Z B; 2LZ6 B; 2P84 A; 5KYU A; 2DLP A; 3CD6 T; 1OUL A; 1BI1 A; 2P0P A; 5ECA A; 3MPU B; 1FWZ A; 4J9I A; 7AT1 B; 1AVZ C; 2ZPG B; 5LJ5 h; 4FYX B; 1VQO Q; 4C92 E; 1OPK A; 2J7I A; 5CKH A; 3WVD B; 3QDF A; 2RHX A; 4J9G A; 3TVT A; 5LJ3 j; 1VQ5 Q; 2DK3 A; 4A4H A; 2JN0 A; 2K5F A; 3CPF A; 3L42 A; 1Q7Y C; 1IZ6 A; 1VYT A; 2RHZ A; 5GMK m; 4GLM A; 1SKU B; 2JJ9 A; 3P8B B; 4JS5 A; 2HMA A; 2E64 A; 3OYY A; 4M78 D; 3CCS Q; 3CCV T; 4BAC A; 1K73 R; 1QVF S; 1HJD A; 2RQU A; 2J6K A; 1QVF A; 4AT1 B; 3GF5 A; 1ZLM A; 3L2Z A; 5GAN 8; 1TU0 B; 1W70 A; 1E6H A; 5GAN j; 2EJG A; 2KNB B; 4PJO G; 2ZPI B; 2CP5 A; 2DE0 X; 5DLO A; 2E65 A; 2E1H A; 5CIU A; 2OTJ A; 1G3S A; 2FB7 A; 4A4E A; 2EQK A; 1VQP T; 3OYM A; 1M27 C; 1I07 A; 3M4Y A; 3H0H A; 1YN8 A; 2ZZD A; 5FRO A; 4JRK A; 3CCR Q; 1M90 R; 4JUV A; 3MEU A; 3HTR A; 2X51 A; 3EGU A; 1JU5 C; 3V8J A; 4M75 E; 3HRT A; 1VQL A; 4XU2 A; 2BZY A; 4ELY C; 4NOY A; 5GAO r; 1PC0 A; 2PVO B; 2CH4 W; 2JW4 A; 2JS2 A; 1H8K A; 2D1X A; 2OTJ T; 3PTA A; 4HCB A; 3CME T; 1OYX A; 4M77 D; 2FPE A; 2O4X B; 2LJ0 A; 5GAO m; 1YFN A; 3G71 Q; 4JRI A; 1ZQ1 A; 2KRN A; 3G6E Q; 2RQT A; 2RK1 A; 4ZGJ B; 1UGQ B; 2DMO A; 3X26 B; 4J6X A; 1P92 A; 5IXB A; 1N27 A; 2O9V A; 4OB2 B; 1K9M U; 3ME9 A; 2BUD A; 1YWP A; 1PKS A; 3QYG B; 3M56 A; 2DA9 A; 5KYW B; 5LL6 S; 1EIF A; 1WXU A; 3QZ5 B; 1YJN A; 2QK0 A; 1O75 A; 1R0B G; 4PK4 A; 1WXB A; 1ZBJ A; 2ROT A; 4FYW B; 3QHS A; 3OS5 A; 1MMG A; 1X69 A; 2L8D A; 3H0F A; 4DBH A; 2VVK A; 4DOW A; 4LNP A; 3OSS C; 2DTH A; 1FMW A; 2LNH B; 3C0C A; 1MMD A; 1MMN A; 6AT1 B; 2A08 A; 2VYT A; 1Y71 A; 4EMH A; 1K0X A; 5IXF A; 3CMA T; 1V1C A; 4MZM A; 2DIG A; 2HAX A; 4C92 B; 3BDU A; 2ZPF B; 3VS1 A; 5IT9 E; 1TXQ A; 4M78 C; 2QDY B; 5IHN A; 2VB6 A; 3ZEH A; 2KE9 A; 4C92 F; 1IRE B; 4GLK A; 1YJN T; 1NYF A; 3TU4 K; 2DYB A; 1Q7Y U; 2DTI A; 3E9G A; 1YHQ A; 1VQK T; 2FO0 A; 3UDC A; 1AHJ B; 4FL6 A; 4M7D B; 2NUP B; 3CCQ Q; 5FRN A; 3MEV A; 1S72 A; 2BZX A; 2HEQ A; 2ZPH B; 4M7D F; 2F5T X; 3JCM J; 1M3A A; 1X6O A; 2GFU A; 4PJO C; 1ABQ A; 2D0Q B; 4DBR A; 3GP8 A; 1OOT A; 1HXD A; 4D6W A; 1OEB A; 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1WFW A; 3QWX X; 4CI0 C; 3EG9 A; 1X6B A; 3CXC P; 4X34 A; 3VS5 A; 4R55 A; 3OYE A; 2Y4X A; 2B86 A; 1Y96 A; 2FEI A; 4OF1 A; 2O9S A; 4Q5W A; 1WJR A; 3NPF A; 1TOV A; 5GJW B; 2YLC A; 4OMM A; 3VS0 A; 3A8H B; 5GAN e; 2P4R A; 2WSC E; 2MAM A; 2AZS A; 4AFU C; 2EQJ A; 1BCM A; 5AYF A; 3QBY A; 2HQE A; 2OAW A; 3CCM T; 2PNI A; 2MF2 A; 2GF7 A; 4M78 A; 2QTV A; 1JJ2 A; 4MDX A; 3M9Q A; 2JTE A; 3EFO A; 1JQQ A; 1AWO A; 2FG0 A; 2L0A A; 2LQK A; 1E6G A; 1QCO A; 5J26 A; 4RTT A; 1PD0 A; 4V2S A; 2M0Y A; 2R5A A; 3QDR B; 5GAM j; 1QLY A; 2XU8 A; 2HBP A; 2ECZ A; 3WXM B; 2NYS A; 4FU6 A; 2EPD A; 1W2B P; 2E5Q A; 4EMK B; 3EAE A; 3MEA A; 2GFA A; 2VUB A; 5J3B A; 1R8O B; 3FJP A; 2EYX A; 1RAH B; 4EMG A; 1S72 Q; 1VIE A; 4RCB A; 1OX8 A; 5A0D A; 5IHK A; 3OBY A; 2H8H A; 5DLQ E; 1AOJ A; 2YWW A; 3M53 A; 2FPD A; 3V7C A; 1K8A U; 1QW1 A; 3DLL A; 3O5Z A; 1G5V A; 2ED0 A; 4FW2 A; 4KRT A; 1TWB A; 1WDX A; 2V26 A; 1Q82 C; 1K1Z A; 2CH4 A; 2M16 A; 2L2P A; 1D3B B; 2GCX A; 4XTW A; 3HFO A; 2CP0 A; 2DZC A; 3ASK A; 2RF0 A; 2Z0W A; 1KFZ A; 1NPP A; 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