1BNUA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnuA00
4HF3A 5FNMA 1CNBA 5BRUA 3HKNA 1XPZA 3K34A 4PYXA 1FSQA 3N3JA 4TWMA 4WW6A 3D9ZA 1I9LA 2HFWA 4WW8A 1OKLA 1V9IC 4RN4A 4QSBA 3B1BA 3BETA 3MYQA 1UGCA 3V2MA 4E3HA 3KNEA 1BN1A 1G48A 4CNWA 1TH9A 4FU5A 4QJ0A 3P5AA 5DSOA 5J8ZA 3V3IB 4M2VA 4M2UA 3TVNX 1DMYA 1TTMA 4KP8A 1HCAA 3JXHC 5HPJA 4G7AA 5FNJA 1XQ0A 3DCSA 1G53A 3RYJB 1BICA 3OKUA 3SBIA 1ZSCA 2NNVA 1HECA 5E2RA 1BCDA 4LP6A 5DSNA 2FNNA 2POVA 3S74B 3QYKA 4E49A 4M2RA 3RYVB 4RFDA 1CVCA 4CNRA 2FOSA 2EU3A 1YO2A 1RAZA 1RZAA 1ZGFA 4QJPA 4XE1A 3MZCA 5SZ3A 4Z1JA 4RUYA 3F7BA 3IGPA 4E5QA 3RZ8A 3V3GB 3M2ZA 2WEOA 4K1QA 4HBAA 4QTLA 1JCZA 4YVYA 1I90A 5JG3B 2OSMA 3M98A 1KEQA 3OY0A 4CNVA 4E3GA 1FQRA 1CAKA 3V3JA 5JQTA 4JSSA 1UGFA 5EH7A 1UGDA 3V5GA 3KIGA 5FL6A 1CVDA 5E2KA 4JSWA 3HKQA 5FLOA 2QOAA 4IWZA 1ZSAA 1A42A 4Q78A 3BL1A 4K0SA 5AMGA 3S8XA 5EHWA 4HT2A 3RZ7A 2O4ZA 1CNGA 5AMDA 5E2MA 4ZWIA 1CNWA 4RFCA 2HKKA 2QO8A 4K13A 1CZMA 1TB0X 1TG3A 1IF6A 2NNGA 4PYYA 4Q99A 1TEUX 5FNIA 5G0CA 1HEAA 4BCWA 3ML5A 5SZ4A 3MMFA 3M5SA 2NNSA 3F8EA 3DV7A 3M04A 3TVOX 6CA2A 3OYSA 2ABEA 1I9MA 1G3ZA 1G4JA 1KOQA 3OKVA 2QP6A 3UYQA 3IEOA 1CIMA 3SAPA 5JEHB 2FW4A 3M2NA 1CAHA 3GZ0A 3OILA 4IDRX 4E3DA 3DBUA 2HOCA 2VVAX 3IBIA 4Q7PA 5G03A 4Q0LA 2ILIA 3MHMA 3MHIA 4YXUA 3S75B 4QJWA 4FVNA 3M5TA 1BN4A 5AMLA 5FL5A 3U3AX 4L5WA 2HNCA 3P55A 2CA2A 3DVBA 4JS6A 1UGEA 4ZX0A 5DOGA 1CNYA 3PO6A 1G1DA 3TMJA 4YGFA 4YYTA 1DMXA 3F7UA 5JQ0A 1CVAA 3DD8A 1IF5A 5DSJA 5SZ1A 5DSIA 2Q38A 4K0TA 5FNGA 1Z97A 4CNXA 1I9NA 3K7KA 4Z1NA 4CA2A 5IPZA 3W6HA 2FNMA 3OIMA 3VBDA 3ZP9A 1F2WA 1Z9YA 2NWPA 3D8WA 3PYKA 1TEQX 1I9OA 3MNUA 1ZE8A 5DSKA 4PXXA 1YO1A 1CAJA 5E2NA 3EFIA 3CYUA 5DSRA 3U7CA 4FL7A 3DC3A 1BV3A 3NI5A 4HT0A 3HFPA 5G0BA 5LMDA 1AZMA 3M1QA 8CA2A 4XIWA 4QSJA 1CCTA 1FLJA 1I91A 5SZ6A 1TG9A 4QJMA 4LHIA 1YDDA 3M40A 1LG6A 2CBAA 2FMZA 4XZ5A 2VVBX 2X7TA 1FR7A 1MOOA 5JESB 4R5AA 3U47A 4KUYA 1MUAA 3MDZA 4FRCA 4K0ZA 5EH5A 1HVAA 5DOHA 2HD6A 1CAMA 3P3JA 2FMGA 1TBTX 5E2SA 3P58A 4E4AA 5SZ5A 4ETQC 2WEGA 4WL4A 3KKXA 1G0FA 3PJJA 4LU3A 4YXOA 3RZ0B 3S76A 2F14A 4QEFA 3P4VA 1FQMA 2POUA 1FR4A 1G54A 1I9PA 2Q1BA 3M96A 3KS3A 5FNKA 5FLPA 2H4NA 5CLUA 3FE4A 4ZWXA 1AM6A 2FOQA 4RUZA 1CVBA 4Q8XA 4Q83A 1JV0A 3MHLA 4XFWA 1IF4A 1UGGA 1FSRA 5DSQA 1RJ5A 5EKMA 1G45A 4UOVA 2IT4A 3MWOA 2AX2A 4GL1X 1CCSA 5CA2A 4QK3A 3S78B 4BF1A 4RIVA 3S72B 2CBBA 5FNLA 5L3OA 3KONA 1DCBA 1CRMA 1OQ5A 1H9QA 3MNAA 3S97A 4YXIA 5FLQA 5JGTB 3HS4A 3RG4A 4QSAA 4RH2A 4KNMA 1H4NA 5FDIA 1LGDA 1KOPA 1YDAA 1CVHA 4YX4A 1CNCA 1OKNA 1AVNA 4ILXA 1H9NA 4WUQA 2FOYA 4QJOA 2X7SA 5SZ0A 1BNTA 1TE3X 3NB5A 3UYNA 1T9NA 4COQA 1RAYA 1IF8A 1KWQA 4Q87A 3RJ7A 1BNQA 1ZH9A 1CAIA 3RLDA 1I8ZA 2NMXA 3FFPX 4JSAA 5BYIA 4YHAA 3U45X 3DCWA 3IAIA 5FNHA 1HEBA 1RZEA 3RGEA 1LZVA 3RYXB 1CA2A 1CAZA 3M1JA 1CNKA 1UGAA 2GD8A 3EFTA 1HUGA 3DAZA 1LUGA 1ZNCA 1G46A 5A25A 5BRVA 3MNIA 4HEYA 4E9OX 3DVCA 5E5RA 3M2YA 4Q90A 3MNKA 4FVOA 4YGKA 5SZ7A 1OKMA 4FPTA 1G0EA 3DD0A 3IBNA 2HL4A 4KNJA 4YGLA 4N16A 1BNMA 1XEGA 3ML2A 4Q07A 3IBUA 4BF6A 4WR7A 4QIZA 3CZVA 1G4OA 1G52A 2CABA 1HEDA 4PQ7A 5DVXA 5E28A 1CVFA 2NWYA 2W2JA 5FL4A 4E3FA 4Q8YA 1IF7A 4QJXA 4Q6DA 1J9WA 2NN7A 2NXSA 3P3HA 3BL0A 4ZAOA 2EU2A 4MLTA 2AW1A 3B4FA 5JEPB 3D93A 4L5UA 3V3HB 3C7PA 3IBLA 5FLRA 2ZNCA 2NNOA 3RZ5A 4TWLA 4CACA 1CAOA 1G6VA 1URTA 1Y7WA 3M5EA 3OIKA 3JXGA 1BZMA 3MHCA 3N4BA 3V7XA 1FSNA 4M2WA 4WUPA 3MNHA 3M3XA 3Q31A 4ITOA 1FQLA 4MDMA 5A6HA 1Z93A 5CACA 1HUHA 5DSPA 3R16A 3RYYA 1EOUA 4Q06A 3L14A 4Q49A 5G01A 5E5UA 4X5SA 4JSZA 1I9QA 12CAA 2CBDA 4QSIA 1RJ6A 3M14A 3V3FA 1ZFQA 3T5ZA 5JG5B 4MO8A 5C8IA 2NXRA 3KOKA 4KUVA 4Q6EA 3T83A 2WEJA 4KAPA 5EKJA 1YO0A 3OYQA 4R59A 5EOIA 5DSMA 4Q7WA 4Z1KA 3N0NA 1CANA 5EHEA 4Q08A 3CAJA 3RYZA 3D92A 2WD2A 1BNNA 3KOIA 4YGJA 4ZWYA 1YDBA 3S73B 3R17B 4KNNA 4YWPA 3K2FA 4Q9YA 3RG3A 3ZNCA 3RZ1B 3N2PA 3T82A 3DVDA 4FIKA 1JD0A 2WD3A 3P5LA 1BN3A 3NJ9A 1BNUA 4RUXA 3T84A 3KWAA 5BNLA 1CINA 2EZ7A 1CNHA 1ZGEA 1V9EA 3M1KA 1CCUA 2FOVA 7CA2A 2NWOA 3SBHA 2CBEA 3P44A 3T85A 3V2JA 2GEHA 3DA2A 4QK2A 1UGBA 3JXFA 4ZX1A 5EHVA 1CNXA 3HLJA 4KUWA 4ITPA 4Q7SA 4Q81A 1YDCA 4QIYA 5L6KA 4G0CA 3D0NA 5JDVB 4ZWZA 3S77B 1RZBA 3F4XA 5JEGB 3LXEA 4KNIA 3S9TA 5FLSA 4RIUA 4MDGA 3T5UA 4Q7VA 2Q1QA 3SAXA 1CA3A 4HU1A 4MTYA 3DC9A 3M67A 1BNWA 5DSLA 1CRAA 2WEHA 1CILA 4Y0JA 1LG5A 3HKTA 1ZFKA 2NWZA 3S71B 4CQ0A 1IF9A 5BRWA 4R5BA 2POWA 5EZTX 2NN1A 4HEZA 3FW3A 4KP5A 4YGNA 5SZ2A 3KLDB 5FLTA 5CJFA 4MDLA 1CAYA 4HEWA 4PZHA 2OSFA 4QY3A 1ZSBA 1THKA 4Q8ZA 4Z0QA 3W6IA 3HKUA 2H15A 3MNJA 3CA2A 1RZDA 1RZCA 2X7UA 5EIJA 9CA2A 4QK1A 2CBCA 4N0XB 5FDCA 4DZ9A 1KWRA 3M2XA 4Z1EA 1CNJA 5JGSB 4DZ7A 3DCCA 2FNKA 4Q09A 4MLXA 1XEVA 2FOUA 1DCAA 1BNVA 5EKHA 4KV0A 1HCBA 5DRSA 5EH8A 1CALA 1CNIA 1CVEA 4L5VA 2NXTA 3M1WA 4C3TA 3MHOA 1FQNA 4XIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HF3 A;  5FNM A;  1CNB A;  5BRU A;  3HKN A;  1XPZ A;  3K34 A;  4PYX A;  1FSQ A;  3N3J A;  4TWM A;  4WW6 A;  3D9Z A;  1I9L A;  2HFW A;  4WW8 A;  1OKL A;  1V9I C;  4RN4 A;  4QSB A;  3B1B A;  3BET A;  3MYQ A;  1UGC A;  3V2M A;  4E3H A;  3KNE A;  1BN1 A;  1G48 A;  4CNW A;  1TH9 A;  4FU5 A;  4QJ0 A;  3P5A A;  5DSO A;  5J8Z A;  3V3I B;  4M2V A;  4M2U A;  3TVN X;  1DMY A;  1TTM A;  4KP8 A;  1HCA A;  3JXH C;  5HPJ A;  4G7A A;  5FNJ A;  1XQ0 A;  3DCS A;  1G53 A;  3RYJ B;  1BIC A;  3OKU A;  3SBI A;  1ZSC A;  2NNV A;  1HEC A;  5E2R A;  1BCD A;  4LP6 A;  5DSN A;  2FNN A;  2POV A;  3S74 B;  3QYK A;  4E49 A;  4M2R A;  3RYV B;  4RFD A;  1CVC A;  4CNR A;  2FOS A;  2EU3 A;  1YO2 A;  1RAZ A;  1RZA A;  1ZGF A;  4QJP A;  4XE1 A;  3MZC A;  5SZ3 A;  4Z1J A;  4RUY A;  3F7B A;  3IGP A;  4E5Q A;  3RZ8 A;  3V3G B;  3M2Z A;  2WEO A;  4K1Q A;  4HBA A;  4QTL A;  1JCZ A;  4YVY A;  1I90 A;  5JG3 B;  2OSM A;  3M98 A;  1KEQ A;  3OY0 A;  4CNV A;  4E3G A;  1FQR A;  1CAK A;  3V3J A;  5JQT A;  4JSS A;  1UGF A;  5EH7 A;  1UGD A; 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