The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
68
|
structure length |
68
|
Chain Sequence |
YHADPSLVSFLTGLGCPNCIEYFTSQGLQSIYHLQNLTIEDLGALKIPEQYRMTIWRGLQDLKQGHDY
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Gene regulation
|
| molecule keywords |
PROTEIN (SECOND SPLICE VARIANT P73)
|
| publication title |
Solution structure of a conserved C-terminal domain of p73 with structural homology to the SAM domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
11
|
| structure length |
68
|
| sequence length |
68
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-05-28 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SV0 C; 1V38 A; 2QB1 A; 2YTU A; 1SXD A; 3H8M A; 1COK A; 2ESE A; 2DL0 A; 2LMR A; 3TAD A; 1X66 A; 2DKX A; 1V85 A; 1RG6 A; 1DXS A; 2KIV A; 3SEN A; 2B6G A; 2F3N A; 2K60 A; 2F44 A; 2Y9U A; 1PK3 A; 5J8Y A; 2GLE A; 1OW5 A; 2KMD A; 1B0X A; 2DKZ A; 4PZO A; 2LPE A; 1KW4 A; 2ES6 A; 3BQ7 A; 2E8O A; 2L5Y A; 2Y9T A; 2EAO A; 1UCV A; 2EAP A; 1Z1V A; 1LKY B; 3KKA A; 1WWV A; 5JRT A; 2EAN A; 3HIL A; 3TAD C; 1X40 A; 3SEI A; 4NL9 A; 2EAM A; 1PK1 B; 2E8N A; 4MHV A; 4NJ8 A; 5J8Y C; 1UQV A; 3IDW A; 2QAR B; 3BS7 A; 1PK1 A; 2JV3 A; 5JTI A; 1SV4 A; 2D3D A; 5L1M A; 4PZN A; 3BS5 B; 1SXE A; 1X9X A; 1SGG A; 5JU5 A; 2K4P A; 3KKA C; 2E8P A; 2QAR A; 4NL9 C; 5F3X B; 2D8C A; 1SV0 A; 2FE9 A; 4RQM A; 3BS5 A; 1LKY A; 2KG5 A; 2F8K A; 3K1R B; 3TAC B; 5KNI A; 2KSO B; 1B4F A; 1OXJ A; 4RQN A; 2E8M A; 1JI7 A; 2QKQ A; 2QB0 B; 1F0M A; 2KE7 A; 2KSO A; 1WWU A; 4IS7 A; 2QB0 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 9ICL A; 1PUZ A; 2ZJ5 A; 2I9G A; 1U9L A; 1KBU A; 4JV1 A; 1QQ7 A; 4ZH4 A; 3PW2 A; 2A1J B; 1COK A; 2HVI A; 4RT3 A; 1COO A; 4FO6 A; 2R8J A; 7ICM A; 5KFJ A; 4X5V A; 4C8L A; 3A0H U; 3RJI A; 3LVW A; 2V4R A; 3OTQ A; 1L7O A; 2A1J A; 4MF2 A; 5ALG A; 1WUD A; 2G06 A; 5AI9 A; 3PX6 A; 1NJZ A; 2J6T A; 3UPQ A; 3F2B A; 3PST A; 2LPE A; 9ICH A; 3C23 A; 9ICI A; 5KFT A; 2Y9T A; 5AM1 A; 4PL2 A; 2H3V A; 5DLF A; 5KFH A; 2PFO A; 4J9N A; 3TAD C; 2AGQ A; 2KK0 A; 4O3P A; 4JMU A; 2ZJA A; 3C28 A; 8ICM A; 1N5X A; 4DL7 A; 4C8K A; 2KFZ A; 5AI5 A; 3IRU A; 2FMS A; 4M2Y A; 7ICS A; 1NJY A; 5ALK A; 1UQV A; 3LDA A; 4ICA A; 2HHV A; 3S6J A; 5L1J A; 4DLG A; 4PZN A; 4CF3 A; 4BDP A; 3OGU A; 2M9N A; 5KT3 A; 3EPG A; 2VAN A; 4KLS A; 2KZZ A; 1NZB A; 2LM4 A; 4QZG A; 3QUQ A; 4UAY A; 3SYZ A; 4QJF B; 2XY5 A; 1URJ A; 2J6U A; 4ECR A; 1LKY A; 2ZUB A; 4KLQ A; 5EE3 A; 5KG7 A; 1B4F A; 2K4E A; 4P0P B; 4J9K A; 4J9Q A; 2KTQ A; 2XC9 A; 2NO4 A; 2F2A B; 3AN1 A; 4O3O A; 2LYB A; 9ICR A; 4CE6 A; 4P0P A; 5KFN A; 8ICF A; 5AK3 A; 4IR9 A; 2YQE A; 3QUT A; 3BJY A; 2YB1 A; 2VJ5 A; 3CW2 C; 4UAW A; 2LI6 A; 3Q8Q B; 1RQL A; 3GII A; 3T3F A; 4RPZ A; 1BPE A; 1XSL A; 4R8U B; 3BQ0 A; 1XC9 A; 4I2C A; 3SAG A; 1FIQ A; 5KFL A; 4GXJ A; 4DO9 A; 4Y2V A; 1B0X A; 1DK2 A; 3H0L B; 4R8U A; 3CNH A; 2A19 A; 1JXL A; 1QSL A; 3M1Y A; 4J9M A; 2ZUC A; 2XGP A; 1NK4 A; 2ZXI A; 1JN3 A; 3SAF A; 3C1Z A; 5BOL A; 2VA2 A; 3BDP A; 2HW3 A; 4YXM A; 1OUQ A; 4IQW A; 5CJ7 A; 4R64 A; 9ICM A; 5AK6 A; 3TQ1 A; 1IXR A; 4K4G A; 4IQU A; 5J8Y C; 5T14 A; 4A8E A; 1ZQG A; 1ZXI A; 2AHO B; 2EDU A; 4ELU A; 2W9A A; 1Z00 B; 2BKE A; 5ALL A; 3ISC A; 2H3I A; 1SGG A; 5KFX A; 4RNM A; 1S9F A; 2RP5 A; 2AGO A; 3Q8L A; 5KFG A; 2GO7 A; 3U26 A; 4LZD A; 1Z00 A; 5IIN A; 3MR3 A; 3I28 A; 2G5I B; 1Q8K A; 1JXE A; 1ZQX A; 1JUD A; 3ED5 A; 5KFS A; 1ZJM A; 4UAT A; 3AQF A; 1GO3 F; 2BQR A; 3AQE A; 2CXY A; 5J0Q A; 4DL3 A; 5G5G A; 4M47 A; 2WFA A; 2W7O A; 4JWM A; 2G08 A; 3WU2 U; 3OPX A; 3SV3 A; 1T8E A; 2AJQ A; 2DQN B; 1TKD A; 2H3Z A; 3V72 A; 1KRP A; 4M9H A; 2GWS A; 5DB8 A; 4DLE A; 5KFQ A; 4PHD A; 8ICG A; 4OD0 A; 3PR4 A; 1S0V A; 4BUG A; 4US8 A; 2W54 A; 4YR0 A; 1KEJ A; 3QU4 A; 5J2D A; 3C2K A; 3KFU F; 2F44 A; 3NAS A; 5ALO A; 4KLJ A; 9ICO A; 2I1Q A; 3MAB A; 1ZQV A; 4B9S A; 3WK7 A; 1SIJ A; 4UB5 A; 4ED0 A; 5KFB A; 2V4Q A; 2PFN A; 4KTQ A; 2H5X A; 4XUS A; 4ED2 A; 2EAP A; 1Z1V A; 3KKA A; 1N60 A; 2KKV A; 4DFK A; 5F9L A; 1SL0 A; 3WKD A; 4DCC A; 2WF7 A; 1L7N A; 2UVU A; 1L8O A; 2F76 X; 4XQ8 A; 5C5J A; 5AI4 A; 1BPZ A; 4K4H A; 4TQS A; 3PW5 A; 5ALM A; 1S8O A; 2ZJ8 A; 4O3Q A; 1SXE A; 4KX3 A; 4ECW A; 3RJG A; 3RBE A; 3LVV A; 3RH5 A; 1ZJN A; 1RYS A; 1UHU A; 7ICL A; 1J97 A; 5DDM A; 2BDP A; 2HBM A; 3QUB A; 1NJX A; 4RNN A; 4DQR A; 5AIC A; 4DQP A; 9ICU A; 3Q8R B; 1U49 A; 1ZQY A; 3PW0 A; 2BCR A; 1ZD4 A; 2IOH A; 4Y2Q A; 5CHG A; 1F0M A; 4ED1 A; 2XCP A; 2G09 A; 1UT5 A; 4DFJ A; 2DBY A; 2PI5 A; 3ZD9 A; 8ICA A; 3RB4 A; 4M0A A; 3LWL A; 3PSF A; 3PZP A; 3GV5 B; 1TK8 A; 2WF5 A; 4O5K A; 2G0A A; 3PML A; 4I2E A; 4LZG A; 4M9G A; 4UBC A; 8ICX A; 2C2D A; 4RU9 A; 3OHB A; 5CA7 A; 1N2X A; 1TAQ A; 5HNK A; 2J6S A; 3SMV A; 4KLL A; 5DG9 A; 4MF8 A; 4DL2 A; 2GLE A; 2LYH A; 2KNJ A; 1DRG A; 2ZTC A; 3N7S C; 2KD1 A; 1KLN A; 3N97 B; 1UCV A; 4QZC A; 1SKR A; 4E0D A; 4CGZ A; 1Q46 A; 4Z6D A; 2EAN A; 4RQ3 A; 1X40 A; 5ALN A; 3UMB A; 3SZ2 A; 3K4G A; 2W3S A; 4EEN A; 2HBL A; 3BQT A; 2B21 A; 1FO4 A; 4BGD A; 2EZY A; 2HDO A; 4UB8 U; 2DF4 B; 2O6K A; 1KQQ A; 2BPG A; 8ICO A; 2W8L A; 5L1L A; 4ZOH C; 5ALY A; 4Q45 A; 4ECT A; 5KG1 A; 4Z6C A; 2XY6 A; 2FMQ A; 2W43 A; 1CUK A; 1MA7 A; 3E2E A; 3GZF A; 2LKY A; 5L1K A; 1C7Y A; 5D46 A; 7ICV A; 1N63 A; 2F1H A; 2KG5 A; 2NYV A; 4I2I A; 4PHP A; 4RQN A; 4DL5 A; 4I2G A; 3C1Y A; 2YML A; 8ICR A; 5AK4 A; 1LB2 B; 1DOQ A; 4UW9 A; 3B0Y A; 2OH2 A; 5AKI A; 2G07 A; 2MU2 A; 4I28 A; 4OJO A; 3FC4 A; 3PX0 A; 4J03 A; 1S5L U; 1TVA A; 4JUZ A; 3L3F X; 4NM1 A; 4MEY A; 1LVH A; 3JPN A; 7ICU A; 1L8L A; 4ED3 A; 3GU3 A; 2H3F A; 2MAX A; 4Z6F A; 1X66 A; 1BNP A; 5J0W A; 2LHT A; 3EW9 A; 4QWC A; 3GIM A; 4YN4 A; 5IIO A; 2ASJ A; 5EWF A; 5DLG A; 2C28 A; 2R18 A; 2JEI A; 4B9L A; 2Y9U A; 3MDC A; 2I5H A; 4MEX A; 4F5Q A; 4LVS A; 5AKJ A; 4QZ8 A; 5AHX A; 1SZP A; 3AEV A; 3BQ7 A; 3IN5 A; 2VJ4 A; 3M7D A; 1XO0 A; 2W04 A; 3E0F A; 1QSS A; 3T5H A; 3HIL A; 3PY8 A; 1NKE A; 3ZDA A; 1IM4 A; 1X6I A; 3ALR A; 1ZQL A; 2VA3 A; 4IQV A; 3C21 A; 2YMQ A; 5AM3 A; 2NO5 A; 4OJP A; 4IL6 U; 2Q0Z X; 3RB3 A; 3EUB 2; 1TV9 A; 4O3M A; 1CRX A; 2DFL A; 2OXO A; 4Y2S A; 1TFR A; 2K4P A; 4O5C A; 4DSK A; 2DUY A; 4CF4 A; 2KJ8 A; 1LV5 A; 2ZXH A; 3RJF A; 1B43 A; 2D8C A; 9ICC A; 4M9L A; 3UM9 A; 2F8K A; 1S0N A; 1TK0 A; 5AKH A; 5KNI A; 3LYS A; 3C2L A; 4QNL A; 4PHA A; 3DEE A; 3H4D A; 3RH4 A; 4TQR A; 2ZTE A; 2YX8 A; 1L3V A; 3N4M B; 1WCN A; 3QNM A; 2KZM A; 1YZ6 A; 4C8M A; 5DB7 A; 4ED7 A; 2W11 A; 2R8H A; 1HJP A; 1A76 A; 3QU2 A; 5KG0 A; 4F4Y A; 1PVR A; 1ECW A; 3IG8 A; 4F5O A; 2V9W A; 4YQW A; 7ICQ A; 1U45 A; 4DQQ A; 5KFF A; 4DF8 A; 2WAQ F; 1JAL A; 2ESE A; 2WTF A; 1SWW A; 1RPL A; 2WAQ C; 5KT6 A; 1UPH A; 2Z7J A; 1Q3U A; 1ZYQ A; 2HMX A; 1NKB A; 1JX4 A; 3FM9 A; 5CRX A; 9ICT A; 1T3Q A; 5KAF U; 4GC7 A; 7ICP A; 3PV8 A; 4J9P A; 1H38 A; 5ALH A; 9ICV A; 5KFK A; 1KW4 A; 4F50 A; 7ICF A; 1ZQZ A; 4DWI A; 1L7P A; 3JPQ A; 1T4G A; 2VKQ A; 4NJ8 A; 4J9L A; 3UQ0 A; 1A0P A; 1RDF A; 7ICJ A; 3KD3 A; 2HHW A; 4Q43 A; 1X2I A; 2FLL A; 4UBB A; 3RFA A; 4P0Q B; 4YXJ A; 2G5H B; 4KIT B; 1SB3 C; 5KFY A; 3F2D A; 2DPI A; 3F53 A; 1N5W A; 2PFQ A; 4M04 A; 4AYB F; 4NL9 C; 4ELV A; 4KLG A; 4UAZ A; 3V6K A; 8ICT A; 2HBJ A; 5ALX A; 4P0Q A; 4FE3 A; 4AYB C; 2C2E A; 4NLZ A; 4ACO A; 2BCV A; 3RJH A; 1KL9 A; 3MDA A; 2HI0 A; 4Y2P A; 1ZQH A; 2HHS A; 5KFO A; 2QKQ A; 2R8K A; 2MSN A; 4U6P A; 1UA0 A; 4F5N A; 2KIC A; 8ICV A; 2E1F A; 3TAN A; 4F93 B; 2FMP A; 3V7L A; 4YMO A; 3OHA A; 4XRH A; 5DB9 A; 4PGX A; 1ZQF A; 2YY6 A; 1YZ7 A; 3H8W A; 2XI9 A; 4RUA A; 1ZQ1 C; 1NJW A; 4GFJ A; 1ED1 A; 4ECS A; 2BQ3 A; 4DL6 A; 4F8R A; 1X6J A; 4YCX A; 4F5R A; 1QH9 A; 2HHQ A; 2W7P A; 5KL8 B; 1MQ2 A; 4EZ9 A; 2LMR A; 5D49 A; 2HHX A; 4YMN A; 4YD2 A; 5J0S A; 4M9J A; 4RQ7 A; 3ZI4 A; 1O03 A; 4Y2X A; 3G6Y A; 2BCU A; 1Z4O A; 4CNQ A; 4NLK A; 7ICO A; 5DQI A; 2Y0S F; 5CWR A; 2ES6 A; 2PKE A; 2PMZ F; 2FI1 A; 1BPB A; 1T3N A; 9ICG A; 1NK9 A; 5ALW A; 5JRT A; 3HPO A; 5KFW A; 4FS1 A; 2JGA A; 2BHN A; 4MFC A; 1UA1 A; 2JEJ A; 1MSW D; 3QZ8 A; 5J2K A; 5KT7 A; 4EYI B; 5ALU A; 1N48 A; 4DFM A; 4RQ4 A; 2F1I A; 1ARO P; 3RJK A; 1MN8 A; 2K89 A; 4U7C A; 4OJ6 A; 1DGJ A; 3DV9 A; 1ZQO A; 3M6K A; 2E8P A; 2ZIW B; 4IC9 A; 4PPX A; 4B9T A; 1DK3 A; 1SV0 A; 3D2S A; 1D9D A; 4YR3 A; 2MUT B; 3Q8P B; 5IIL A; 2KIW A; 2RDI A; 2W8K A; 3WK9 A; 2A1A A; 2ODG A; 5HP4 A; 3NTU A; 3HP6 A; 2MUT A; 3KBB A; 4QWD A; 1WWU A; 4IS7 A; 4Y2Y A; 4B9U A; 3F5E A; 1Z19 A; 2HVH A; 1V38 A; 4C4T A; 2NRZ A; 2KV2 A; 2EQY A; 3QUC A; 5JUM A; 4R65 A; 3T5L A; 3N7P D; 5ALD A; 3B9J A; 4HYK A; 5AKX A; 5AI6 A; 5J0U A; 5HR7 A; 1TAM A; 7ICG A; 4Y2R A; 1ZQW A; 3MGH A; 1K1Q A; 3WKE A; 2B6G A; 2ZIV B; 3MR5 A; 3TI0 A; 1RYR A; 4BXO B; 1ZQI A; 3M9O B; 4BX9 C; 4EBE A; 3IV6 A; 5GTI U; 1KTQ A; 2ZIV A; 3KHG A; 4BXO A; 5HMM A; 4ELT A; 2HHT A; 4KX5 A; 4IRD A; 3R9K A; 3CP8 A; 4KLE A; 4QZH A; 5KFD A; 3N28 A; 2ISO A; 5L1M A; 4UB6 U; 8ICN A; 4BWJ A; 1X9X A; 4UB2 A; 4FZN A; 1NI3 A; 4NLB A; 2W55 A; 3V6J A; 3HX0 A; 4UB1 A; 3I1Y A; 4C4S A; 3BQ1 A; 3RRH A; 2FE9 A; 3RB0 A; 1J2N A; 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1RG6 A; 5J2B A; 4I27 A; 5KFE A; 2KOB A; 5HHH A; 5C0Y A; 1Y88 A; 2GOL A; 3QE9 Y; 4F4W A; 2KVC A; 2JH1 A; 2F1J A; 4P4O A; 5KTQ A; 4KN4 A; 2Q4T A; 2KMD A; 4RPY A; 4RQ5 A; 1SL1 A; 4PZO A; 3M9M B; 4HAI A; 5J2G A; 2ZIX B; 2WF9 A; 5HHI A; 3DDH A; 2L5Y A; 4C4R A; 1ZQK A; 4UAU A; 5AIB A; 3MR2 A; 3AU2 A; 4QZA A; 4DOC A; 3NVY A; 5HML A; 2RLT A; 4CDG A; 3RR8 A; 1S10 A; 3H40 A; 1PK1 B; 5J2E A; 4B9N A; 3ORY A; 2XO7 A; 1PVQ A; 1TE2 A; 1N62 A; 1BPY A; 1QSY A; 7ICR A; 1Z3E B; 4USA A; 5G5H A; 4KLT A; 2KHV A; 1PK1 A; 8ICP A; 2KJ9 A; 2D3D A; 4OCZ A; 3MFH A; 1XSN A; 2NRV A; 4C8O A; 3CYM A; 3PW4 A; 4EBD A; 4EEK A; 3OSP A; 3KKA C; 4FBU A; 3PR5 B; 4NY8 A; 2VA8 A; 4M9N A; 1SWV A; 2LBO A; 1RYU A; 2FLP A; 3Q8S B; 4QZ9 A; 4RPX A; 1ZQB A; 3RJJ A; 8ICW A; 9ICB A; 1U4B A; 4I2H A; 2JZB B; 3V7K A; 3SI8 A; 3NRZ A; 2CPR A; 5DKW A; 4QZF A; 1T7P A; 1HUO A; 4UAV A; 2VIX A; 4EBC A; 5DBA A; 4M6W B; 2K8A A; 3KOO A; 2JZB A; 4OJL A; 4IRC A; 4UQG A; 5J2J A; 3Q8K A; 4Y2T A; 2OWO A; 5B5E U; 4M6W A; 5CB1 A; 1XNS A; 3FYH A; 5CR0 A; 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