1CQGA

High resolution solution nmr structure of mixed disulfide intermediate between human thioredoxin (c35a, c62a, c69a, c73a) mutant and a 13 residue peptide comprising its target site in human ref-1 (residues 59-71 of the p50 subunit of nfkb), nmr, 31 structures
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDAQDVASEAEVKATPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Complex (electron transport/peptide)
molecule keywords THIOREDOXIN
publication title The solution structure of human thioredoxin complexed with its target from Ref-1 reveals peptide chain reversal.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 23
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1cqgA00
4PNGA 2E7PA 1CQHA 3ZVJA 2OBKA 1EOHA 4NV5A 4KNDA 4MZBA 4ID0A 6GSSA 3L9VA 2H1DA 3CRUA 1T00A 4KX4A 3VURA 1YEPA 3TDGA 4FH8A 2V32A 2C1YA 5B6MA 4ILFA 4ZBBA 2I81A 2IL3A 2IFQB 1TRVA 4WF4A 4EL1A 2GZPA 2YJ7A 1SJ6A 3U5RE 2LJRA 17GSA 1T1VA 3HYPA 4AF2A 3EVIA 2D2ZA 3FZAA 5CRGA 1R26A 4MH3A 2R5GA 4MK3A 2YV7A 1V40A 3EMXA 1GSSA 4EUYA 4NWYA 5DALB 4RQRA 1M2AA 2AHEA 1VF3A 2L6DA 4DSQA 4K7OA 3GKNA 2ALBA 3A2XA 3NIVA 1O8WA 3VPQA 2K8SA 5J9CA 1M2DA 4HQZA 2IMFA 2YPMA 2VUPA 1LBKA 3FYGA 3TKSE 1R5AA 1S3AA 3H93A 1PL2A 4MPGA 3F6FA 1PN9A 1M9AA 1Z6NA 4XS1A 3HZ8A 3V1WA 2AJQB 2ON5A 1EZKA 4TR3A 3PGTA 3TKSC 1NSWA 4TXOA 2FWHA 3IE3A 4XS4B 1Z5YE 1FO5A 1FVJA 4N11A 3UARA 3KTLA 2GZZA 4HU9A 3FK8A 2DJJA 2L5OA 1WE0A 4XHMA 1AQXA 1BYEA 5JWOB 4ECCA 5ECMB 3A2VA 3GL5A 5H5QA 5GZZB 4YQUA 4RUVA 5CAXA 1Z7RA 1SD9A 1HQOA 1Z7PA 2HI7A 1MD4A 2B5XA 1ABAA 3LWAA 2GVPA 2LJKA 3DKSA 3L0HA 2H0IA 4TOPA 1SYRA 2F51A 4EO3A 5JCGA 4K1FA 2R2JA 4K9ZA 1ERWA 4ULXA 3GYKA 3HXSA 4MMMA 2OADA 2O7KA 1XXUA 4MPFA 4JR6A 3ZRDA 5ID2B 3HZ4A 2H6ZA 3FKFA 2FWGA 4TR0A 2XC2A 3UVTA 2V41A 5DQYA 1AC1A 2LRNA 4HDEA 4X1UA 4BWSA 5CRWA 1HNCA 5IO2A 1AXDA 4ZB9A 3IA1A 1ERVA 3FZ9A 4PGTA 1EEMA 1WIKA 6GSWA 2DJ1A 3VWWA 3F3QA 3DGQA 3FRCA 5IMVA 3QOUA 5F8BA 1FG4A 1QQ2A 3E3EA 2EIQA 2FUG2 4XCSA 4K0NA 5G30A 1TDIA 2CA8A 2MMAA 2LUSA 1X9WB 4G10A 3S9FA 3F4TA 7GSSA 4FIWA 3WYWA 3DVXA 5IMDA 3GH6A 1U88A 3TKQA 2LEGA 1X5EA 4IP6A 2LRCA 1VGLA 2MMOA 3BJ5A 1K0AA 5FHIA 2LQQA 3M0FA 2OACA 3QAVA 1UC7A 1BAYA 2OE1A 2AAWA 3F9UA 4GWRA 3UOMA 4J57E 2CZ2A 5CNWA 4V1Ap 3ZTLA 4NHWA 3LQ7A 19GSA 3PH9A 1G7OA 1VF4A 2N5BA 2YP6A 1B9XC 2RUFA 4TVEA 4X43A 2TIRA 3F8UA 5ENUA 3UBLA 2H01A 4DSSA 2EC4A 4N30A 2FLSA 1Y25A 2H75A 1I5GA 5DQSA 1JZOA 5KN1A 1M2BA 3CSHA 2PN8A 3CXGA 2GSRA 1U87A 2HLSA 2EIRA 2HZFA 1JFUA 2P31A 5EY6A 4KB3A 1ZCPA 5LD0A 2FHEA 5J5NA 1XZOA 2H74A 1QGVA 4JU5A 4ACSA 5IQYA 1O6JA 5D96A 4POMA 3VPTA 3KH9A 1PSQA 4POBA 1TTZA 1M0UA 5LNKe 2DMLA 3ME7A 1FHEA 3L9UA 1GTBA 3GN3A 3WT2A 2BMXA 4IBPA 3F4SA 5IMAA 13GSA 1YQ1A 3BCIA 3DMLA 3LXZA 1A23A 1X0RA 2JU5A 1F3AA 1GSUA 1XWAA 3Q6OA 1PRXA 2HZEA 3IXRA 2O89A 3A2WA 10GSA 5ECQB 5HFGA 4HZ4A 1Z9HA 2KLXA 4OMVA 2P0GA 2MMNA 3GKMA 5ECHB 5JWQB 4J56E 3LXTA 1Q4JA 3L9SA 3US3A 3U6VA 1TKDB 1O81A 3H1NA 2WCIA 3OR5A 1ML6A 2TRXA 5DCGA 1LJRA 5IIZA 2IN3A 3TGZA 1UVZA 1K0MA 2FA8A 1GNWA 1O7UA 4I8BA 2VIMA 4N0ZA 4ZB8A 4FO5A 4G19A 2DBCA 2VM2A 4AJ7A 2RIIA 5F0GA 5FWGA 4V2LA 4MCUA 2XHFA 5GSSA 1PX7A 5E59A 5A4WA 2AB6A 4TR4A 4HJMA 2O85A 2HRFA 4MZCA 2X99A 3O3TA 5G1LA 2WJUA 2WS2A 3WD6A 2OBIA 2QGVA 4ZBDA 3G9BA 5CRDA 2HXKA 2WRTA 5ECPB 1ERUA 2PBJA 2C0GA 1E2YA 3EURA 2MYGA 1QUWA 3RHBA 3ZITA 2H71A 3RPPA 1OC8A 4AJ6A 2N5AA 1DE2A 1YDKA 1TJDA 3MSZA 3KGKA 2DLXA 2RLIA 3C1SA 1X5DA 2IPAA 1R5PA 2X8HA 3CSJA 2WZ9A 5G5FA 4NMUA 1NW2A 1YZXA 1V9WA 1EGOA 3HJMA 2H8LA 2YZHA 2GSTA 3Q19A 1YKCA 4ZL7A 4IS0A 3G7YA 3ZL5A 1TW9A 1OC9A 2ZUPA 4XRDA 4HQSA 4I5QA 4KDXA 2ES7A 1PL1A 1U6TA 2L59A 1T8EB 1O85A 1OKTA 5ELAA 3LORA 2PERA 1A2LA 2J9HA 3TRPA 1F9MA 1K3LA 2OKAA 1FVKA 2VCQA 3TJKA 2HT9A 4PQIA 2GZYA 5DCHA 1AW9A 3VK9A 2VCVA 3LSZA 3L78A 3TOUA 4LL4B 3ZIJA 3QAGA 1GTIA 3NOFA 1A8YA 4HEA2 1O8XA 1EP8A 5EL8A 2DJ3A 1XW6A 5H5RA 1NM3A 4JRRA 1CQGA 4EDZA 4GQFA 2L6CA 2CX3A 2VCZA 1XFLA 1TXXA 3EE2A 2YN1A 2I3YA 1YF0A 5HR3A 1FAAA 2HSYA 2K9FA 3QDNA 1XBSA 2F3MA 2VLVA 2H30A 4D73A 3DXBA 3M8NA 2KOKA 1G7EA 1XOBA 5IMFA 1T4YA 3GA4A 1C72A 5IPGA 3UEMA 3KZQA 4BVYA 4PUFC 1MTCA 3FR6A 5G31A 1H75A 5AIVA 5EPFA 3D22A 2LSTA 5ECNB 1EEJA 1OYJA 2PVOC 1QK8A 9GSSA 5DDLA 4E8HA 2QKEA 4XIHA 2C4JA 4HI7A 4L8EA 5J9BA 1YKAA 2P5QA 6GSTA 2B5YA 2LS5A 2AYTA 3WT1A 1GLPA 2KP2A 2WFCA 3DVWA 1YY7A 3MNGA 2MBTA 4EC0A 1AAZA 2A2RA 3DEXA 2IWTA 1V57A 1URMA 5KEJA 1VF2A 4KCEA 1NHYA 2O8VB 1HD2A 2E2GA 1QFNA 2PUKC 1SL0B 14GSA 5ECOB 4ZBAA 2LNSA 1JHBA 2VOCA 2FGXA 1E6BA 3GMFA 4MF6A 2H19A 1EV4A 5KN3A 1JZDA 3IV4A 4ISDA 5CYYA 4L5LA 2LJAA 1THXA 1XIYA 1SKWB 3TKPA 3LYPA 2L57A 4CHSA 3GX8A 5JWRB 2FWEA 4L0UA 4OFNA 5FT3A 3GHAA 4WBRD 3TUEA 3KM6A 2GT6A 4DEJA 3DIEA 3I6AA 4PXOA 1SYXA 3KJYA 2VLTA 3G7IA 5IOXA 1GWCA 1IYIA 2C0DA 1PKWA 3VI7A 1GSYA 1YF1A 3HA9A 4IKHA 3RPNA 1ZOFA 4IHUA 4J2FA 2BTOT 1ZYEA 2LRTA 3P2AA 1K0NA 1GTAA 5DAKA 1TK5B 1LU4A 4F82A 3KEBA 5IOWA 3KD0A 1SENA 2ZCTA 1SK2A 4DVCA 3GH9A 3IAM2 4X0XA 1DUGA 4WBJA 3D5JA 4JR4A 4GTUA 5E4WA 2F8FA 1OE8A 3EMPA 5AIXA 4YH2A 3HD5A 4IGJA 4GQCA 1MDJA 3GIXA 4LL1B 5HR2A 1BX9A 2GQLA 1K0DA 3VWXA 4WR5A 1QMVA 2XBIA 3GV1A 2DSAA 4PX1A 2WB9A 3Q74A 2DIZA 5JCUA 2OJLA 1BG5A 4TXOB 2C8UA 3ED3A 2H1GA 1G0TA 3CBUA 4K8MA 4KAEA 4XTSA 4OCFA 3GTUA 3FY7A 3H4KA 3M9KA 1KNGA 4TR1A 2CV4A 2PU9C 4EVMA 1GSEA 5F05A 3FR3A 4O92A 2CVDA 2GT5A 1B4PA 4O7HA 1FOVA 3E0UA 3UBKA 4RI6A 1XVQA 3IK7A 8GSSA 1ST9A 4RI7A 4G2EA 3TOTA 1S3DA 1BEDA 2N5FA 1W4VA 3BBYA 1TRWA 2MMZA 3ZVJD 4KA0A 2CVKA 6GSUA 3D4MA 3KIJA 2CZ3A 1A24A 2KP1A 4Q5QA 2M72A 4Q5FA 3KMNA 3IBHA 1FB6A 1G6YA 3GUSA 3EINA 4JEDA 3WGXA 4AJ8A 3LEFA 2YANA 5INYA 3GX0A 2HSHA 18GSA 4Z7XA 4AGSA 4CDOA 5F07A 2FNOA 1SD8A 1BQ7A 3UIWA 2VAFA 5EVOA 16GSA 3M1GA 11GSA 4MP4A 4WXTA 2RM6A 2QC7A 3APOA 2B1LA 4MF5A 3GFKA 3F0IA 1X9SB 1X9MB 2HYXA 1SL1B 2DJKA 3RDWA 22GSA 1SJIA 3HVXA 1PX6A 4ML6A 4MJAA 1GTUA 3J7Yk 3CTGA 1TU7A 2PGTA 3CTFA 1XPVA 2FD3A 3GURA 2DJ0A 4LMWA 1GL8A 2YWIA 2NBSA 3TJBA 4ECBA 4BPYA 4O5RA 2K8VA 2DJ2A 5IM9A 3ZMLA 3CSIA 1GH2A 4TKYA 3ZYWA 2R3XA 3KMOA 3P8WA 4I97A 1ZZYA 1EWXA 1TRSA 4P3YB 1MEKA 4Q5RA 3EYTA 2V6KA 4GF0A 1OC3A 3RBTA 4OO5A 5LCZA 5AISA 3FZ5A 2X8CA 1EP7A 2X8GA 4MJEA 4GSNA 4BA7A 3ERFA 4DSRA 2NTOA 3ZMKA 2YNXA 3IDVA 2VD0A 1ZYQB 3TJJA 5AN1A 1XWGA 1R4WA 1GUKA 1Y6EA 2LQOA 5IMZA 1A0RP 3I69A 4DSSB 2VD1A 4IELA 1MDIA 3TKRA 2C0EA 5G5EA 5L71A 3FEUA 4XS6A 2VL9A 4LLRA 1PMTA 4KSMA 3GSSA 5ECRB 1F3BA 3G7JA 1PGTA 2GGTA 1RW1A 2ZNMA 4GSSA 5B8BA 4MJBA 1TRUA 1AQVA 1UA5A 1WWJA 4N0VA 2JZTA 5B7CA 2GSQA 4F9ZA 4JE1A 2HFDA 3C1RA 3DD3A 1AUCA 4JZQA 1SL2B 3N9JA 2OE0A 3C8EA 5ECIB 2GSSA 3D21A 2NDOA 5J41A 1X5CA 4OCEA 1HNAA 1K0OA 1TK0B 4QL9A 5KN0A 4NPBA 1N8JA 2C0FA 3WGEA 3F63A 2RM5A 4KSOA 4LMVA 2HZEB 2GQMA 2H0GA 1M7TA 2YJHA 4V2MA 1A2MA 2VCTA 1FW1A 2CQ9A 3N5OA 2IFQA 4IW9A 4FYBA 4WKWA 4IQ1A 3ZREA 1TI3A 2VL2A 1V98A 4K6XA 2H66A 3F3RA 4YQVA 2B7KA 4OFMA 4YQMA 2R37A 2BJXA 4OD7A 3DWVA 1TI1A 4K7IA 2GDRA 3M9JA 3LJRA 2IMDA 1GRXA 4EE0A 1KTEA 2G0FA 3DRNA 4K7NA 2JSYA 2YZUA 3LG6A 5DALA 4ECJA 1BJXA 5C00A 1EOGA 2CAQA 3QD9A 4KGIA 2JL4A 3E9JB 2JZSA 1V2AA 1XW9A 1JZRA 2C3TA 4EXJA 2E0QA 3HCZA 3LYKA 1B48A 5J3RA 3VWVA 2HE3A 5GSTA 5C04A 2WULA 4O32A 1V58A 5H5SA 4NAXA 2IMIA 1GLQA 2P5RA 4ZL9A 3W8JA 1RK4A 3C7MA 3QFBC 2B6MA 4QL7A 2PMTA 5IPHA 4XS4A 2H6YA 1ZMAA 2WDUA 5CRHA 2PWJA 2IMKA 1G6WA 3L4NA 5A5KA 2PPTA 2GTUA 5HFIA 1F6MC 2GS3A 1YJ6A 1OE7A 2VLUA 2B1KA 3PR8A 3QFAC 4L5OA 1OAZA 3IC4A 3FW2A 1KBNA 4ZIJA 1WRYA 4HS1A 1A2JA 3QAWA 2I1UA 3TJGA 3A3TA 2NPBA 3ME8A 1QXHA 4FYCA 2YV9A 1U3AA 3JCML 3CMIA 4YAPA 4KDYA 3ZZXA 5D8IA 3HY2A 5F06A 5COHA 3TB2A 3NZNA 1OC9B 3UAPA 5ABRA 1AIUA 1PD21 1RQMA 2JACA 4YAVA 5D9VA 3APSA 2HNLA 2FA4A 4PNFA 1ZL9A 5J4UA 5ELGA 4ZL8A 1EV9A 3UJ1A 3C71A 4GCIA 3IHQA 1FB0A 3TRXA 4BWQA 2DMMA 2YWOA 2M46A 3HDCA 3IK9A 1YEXA 2FCHA 4PUAA 2YOIA 5HR1A 5ID2A 2K18A 1EGRA 2GLRA 1GP1A 4Q5NA 1Z6MA 6GSYA 1OVNA 2MZCA 4ZB6A 2REMA 1J9BA 2X64A 3SBCA 4K0GA 2B5EA 2YWNA 1M9BA 2VCWA 4H86A 3WGDA 2C80A 4D73B 4POLA 3ERGA 1SJZA 4I6XA 4ML1A 12GSA 3I43A 3QCPA 3TRQA 3VI5A 2CT6A 1GSQA 4V1Ag 4TRXA 2XPEA 4TW5A 2OE3A 5HR0A 3TKSA 1J0FA 5HQPA 4ECIA 4MJCA 2H0HA 1SK0A 1VRSD 1KEBA 3HHVA 3P90A 3UVHA 1T7PB 4WR4A 3O6TA 3QR6A 4HU7A 2CX4A 2I9HA 1PKZA 3EU4A 1JLWA 1HYUA 3KCMA 2IIYA 1SKSB 1PQNA 1IYHA 1XOAA 4OWYA 3MAKA 5ECLB 3P7XA 2GQKA 2NVLA 4F0BA 3HVVA 1A0FA 3H79A 1JLVA 3H8QA 1O73A 4HJ2A 2XBQA 4KUNA 5AGYA 3GKXA 2ON7A 2H70A 4LA1A 4IJ3A 2FY6A 2H72A 2EIOA 3ZFLA 4HZ2A 1AQWA 1ERTA 1M99A 3FHKA 4I2TA 1GUMA 1T3BA 1K3OA 4NV2A 1VF1A 1MDKA 3F6DA 2B7JA 3MWHA 2L4QA 2K6VA 4TXVA 3GNJA 3M3MA 5IMCA 4ZXGA 3ISOA 5DJMA 1NHOA 1K0CA 4ZILA 3HJOA 4G9HA 5B6NA 2LKUA 2DC5A 5DJLA 4KDUA 5DAKB 1R7HA 3QMXA 5D73A 2HRNA 4POKA 4PQHA 5CP1A 3IRAA 4OFTA 1XCCA 3PINA 2O87A 1N2AA 2B3SA 4WETA 4IP1A 3CYNA 3R2QA 4GXZA 5DBQA 2M80A 2FWFA 4IQAA 1JZWA 3W6GA 1GUHA 2OA7A 3MDKA 1A8LA 3Q18A 2CAIA 5CREA 5D9TA 3SWLA 2H1BA 5GAPD 1T4ZA 3KP8A 1XWBA 2LNTA 4I2UA 3KP9A 4NXIA 5IO0A 4F03A 4WEYA 2JADA 3IPZA 2G2QA 4RQXA 1OKDA 2AUVA 2V1MA 4EF0A 2IJYA 2A4VA 3IAS2 4XRAA 2IMEA 2TRCP 4HOJA 1H4OA 3APQA 1GSFA 3GTUB 4WF5A 1Z3EA 5G2ZA 3W8SA 2H1AA 4F0CA 2MBSA 4TR1B 1PA3A 3UL3A 2E2MA 2JSZA 1ON4A 5B8AA 3ZFBA 3J7Yb 4E8EA 2R4VA 3BD2A 2VM1A 3D4TA 3F4RA 2A2SA 1WMJA 3FR9A 3KTBA 1UN2A 20GSA 1ACVA 4KW6A 3TCOA 3RAZA 4GSTA 3BOAA 5JCWA 2CVBA 2PVQA 2I4AA 3ZLPA 2R6KA 2Z9SA 5ECKB 2H6XA 3IOSA 4BL7A 4V2NA 1GSDA 5A4VA 3AY8A 4TN8A 1S3CA 3ZIVA 4NHZA 2LTKA 1TOFA 4QQ7A 2V2GA 3KXOA 3IR4A 1J08A 2KUCA 3D6IA 2VCXA 5A4UA 2RUEA 5ECSA 3DYRA 5D9WA 3ERWA 1K3YA 2KHPA 3GSTA 2H73A 1ZGNA 1WOUA 2VO4A 6GSVA 3HJPA 1GNEA 2H76A 5GAND 4MF7A 4PURA 3O76A 4BVXA 3BCKA 4IJIA 1F37A 2QSIA 4MH2A 2JZRA 5DVBA 1DE1A 3RHCA 1U3IA 3K8NA 2DIYA 2YCDA 1ILOA 1TU8A 1I9DA 5CO3A 3EWLA 4EDYA 3EU3A 2V6OA 1Q98A 2VL2C 4MABA 4KCAA 3LGCA 4CW9A 1WPIA 1MD3A 1K0BA 4MA9A 2XPDA 3HKRA 4MDCA 2L5LA 2VL3A 3QPMA 4F2IA 3LFLA 1XVWA 1XWKA 4N10A 4KH7A 1USBA 5D9XA 1DSBA 1B8XA 4HUAA 2C3NA 5G1KA 5HFKA 3VWUA 4PQ1A 3GRXA 3CRTA 1WJKA 3HVSA 4MLYA 3D0ZA 2WGRA 1SK1A 4K2DA 1HNBA 1TK8B 4KE3A 6GSXA 1SU9A 1WP0A 1SKRB 3A5WA 3UMAA 4IN0A 1DBYA 1XW5A 1TP9A 3GKKA 4IVFA 4JBBA 4GLTA 1F2EA 1B9YC 1XWCA 5D93A 3VLNA 2YWMA 5KN2A 2F9SA 4GRFA 3TJFA 2F8AA 3I9V2 3GL3A 3FZ4A 4FYUA 3VFIA 4L0WA 1B4QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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