1D0HA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with n-acetyl-galactosamine
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords PROTEIN (TETANUS TOXIN HC)
total genus 113
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1d0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1d0hA02
1N4KA 2ZMKA 1SBFA 1IT0A 3AH1A 3F1RA 2A6VA 4YW4A 4OZXA 5T55A 1V6MA 5JMCA 1BXHA 3WHTA 1HWOB 1KNMA 3R4SA 4Y1XA 5F9TA 1Q04A 4U36A 3PG0A 2ZZJA 3BRDA 2F2FA 2UUSA 3Q7YA 5T54A 2E7TA 3UJ4A 4XTMA 4LO7B 1F31A 5DUXA 1KQRA 3USUA 2ZGSA 2ZQNA 5SV8A 5H9PA 5GLWA 3DUIA 4R9DA 3WUCA 1WUVA 1JYCA 4GKYA 4OEGA 4I37A 1ENSA 4YGBA 4ZXKA 1LHUA 1Z78A 3C9ZA 3I8TA 3O3QA 3KMVA 1MZ5A 1SLCA 3OYWA 3ZPYA 4XJWA 3AZXA 1CPNA 1OKQA 2Z42A 5CAZA 5E24E 2K4AB 1JT4A 1IOBA 2AR6A 4RA0A 2LTNA 2ZGPA 4G6JA 2ZMNA 4PBOA 1IKPA 1FNYA 4RL7A 2BQPA 4OUJA 4GWNA 1KDMA 5H9QA 2J3PA 1YO8A 2D6LX 2WSUA 2MC2A 2ZGNA 4X37A 2D23A 3HOMA 4M3CA 4JPZA 1XG6A 2Y9WC 4Y20B 4X38A 2BEAA 1NXD1 1S0IA 4R6UB 1LULA 4Y24A 5GZFA 3ZXGA 3ZSKA 1A3KA 3O44A 2DU1A 2E4MC 1FNZA 1BFCA 1W0OA 2P2KA 1UZYA 5EYYA 2ZACA 3ILNA 2GDFA 1RINA 3ZC8A 3UJQA 3D5OA 4ZGRB 3O12A 3T1MA 4A7YA 1LOFA 4K21A 4YW5A 4Q27A 1TP0A 5CB7A 4C1XA 2KH2A 3SH4A 3AZWA 1DGLA 1ULCA 3N7LA 3ASIA 2VXTI 3NBEA 1SR4C 3H6QA 2DU0A 1LOGA 3V0AA 5GZGA 1PZ7A 1RIRA 4P0LA 1AVBA 1ISZA 1CPMA 3NBDA 3FUQA 2KI6B 4W65A 6I1BA 3ZX7A 2ZA9A 1V6JA 1AF9A 1U0AA 1QOSA 3M3CA 3FGMA 3POSA 3IN9A 4FPEA 2WSVA 2PELA 1YXWA 4I4PA 3O5WB 4WBCA 1ITBA 2ZGOA 2Q9XA 4XBNA 4EEEB 2RSTA 2EXJA 2YV8A 1N1TA 2D6PA 4PQ9A 4I96A 4XOGA 3WINC 2D3PA 1W6MB 4XJ8A 4USOA 3NV1A 3RQ0A 2DREA 2R1BA 4AGRA 3RS6A 1GBGA 1NLSA 1JYIA 3O4DA 4WZFA 5BP5C 4ZFYB 3S8KA 3AH4A 2UURA 4IONA 1CIWA 1N47A 1S0FA 4YW2A 4GOYA 5GALA 4XZPA 1I1BA 1RITA 1NZKA 2JE7A 2W39A 2E7QA 3CA0A 5H9SA 1JY0A 4R9CA 4Q2FA 2ZABA 3PVEA 4BM8A 3A0KA 3VV1A 3WOGA 2PHTA 4P9WA 1LEMA 1HCDA 3UL2A 2WT2A 3M3OA 4PC4A 2WBCA 1CE7B 3MALA 4II0A 1BQPA 4LO1A 4H55A 3SH3A 2A3XA 3NV4A 2ESUA 2JDZA 4J2KA 5CA6A 3BAHA 4YM0A 5DG2A 2A3WA 3HBWA 1QQKA 4FPYA 1ISWA 1JW6A 3O0XA 3BA4A 3SH5A 5D61A 5FNXA 3FLTA 3EF2A 3R05A 4AYUA 1AX0A 4Q1RA 3PUBA 3FFZA 5I1BA 1SLIA 1S0EA 4IHZA 2P3JA 2B7YA 2OVUA 4HA2A 2DTWA 4J2SA 3ZXEA 2Q3NB 4KEJA 4FGFA 4Y22A 1YF8B 3WMUA 4I4RA 2FDBM 2OUHA 1DQOA 1IS3A 1N3QA 1QOOA 3FJIA 4JKXB 4YM2A 4CZSA 5JDBA 2ZAAA 3KM5A 2FHRA 2ZKNA 4HJJA 1QGLA 4YLZA 5BXPA 1V00A 1AXYA 4Y20A 2WT1A 2RHPA 1XQNA 1WLWA 5DUYA 3INAA 3VSZA 3IPVA 1AXZA 1H30A 5GZDA 1MVQA 3KQRA 4LBNA 4GAIA 4GALA 2CY6A 1ULFA 2A6ZA 21BIA 2RG9B 1UAIA 3LLPA 1GV9A 1MVEA 4OEEA 3VKFC 4P9XA 3USUB 3MPPG 2ET2A 1Q8VA 5F8WA 1RZOB 1VAMA 1SLAA 3JRRA 5EC5A 5JOWA 3WA1A 4BOWA 5GJ6A 1TWMA 3VKMA 3VT0A 5GZCA 2WNEA 2AGSA 4EFPA 3FJJA 1S1AA 1SACA 1S0GA 3WCRA 4QBCA 4P0KA 1CVNA 3OYWB 1VAVA 3R4UA 1BYHA 1QQLA 5HCAA 4XXPA 5LK5A 2R1DA 2ZGKA 2PHFA 4LO0C 5E89A 1AZDA 1GLHA 3N35A 1AJOA 3ZSLA 5DZEA 2AQZA 3CRIA 1DBNA 4LBMA 5JOYA 5KXBA 3NBNA 5F90A 2GN7A 4OWLA 4Q8KA 2D1ZA 4YFZA 5IUQA 4L4HA 3D6EA 3PVNA 2A3YA 1P63A 2HW9A 1W6MA 4M3CB 1MC9A 1M16A 4YM3A 3N0KA 1JOJA 2R16A 2WT0A 4BQ1A 2A6XA 3MEPA 1G9DA 2ARXA 3FLPA 4JKQA 5DVHA 1AXMA 2TEPA 3NV3A 3AYEA 2AFGA 1G7YA 4FPOB 4UW4A 5IT6A 3FJDA 1W6OB 4OEFA 4FVVA 1OQ1A 2ENRA 4LO2C 1QMJA 1BA7A 2UWAA 4Y26A 5FRAA 3AP9A 1Q1UA 3FJEA 4TYSA 1GSLA 1AVAC 2AH2A 3ZXKA 3IKWA 1C57A 2W52A 3C2UA 2YUGA 5GLZA 1II4A 1Q8SA 2BFHA 1W3AA 1EYLA 1HWNB 1FGAA 3CQAA 1FWUA 4A7KA 4L8QA 1DYPA 2A70A 1JQZA 1N3PA 4BLIA 3AZZA 1F5FA 3CA5A 1IOAA 4KBBA 4XBQA 1X50A 2OW4A 1EV2A 1A8DA 4XE9A 3TC2A 1Z4SA 1N3OA 3U4XA 1MR5A 4Z8BA 3WDYA 1GZ9A 3QYDA 3I2XA 3WV6A 1BFGA 1TWEA 3OBRA 4CTEA 3PHZA 2DVBA 2C9AA 1JT5A 2NMNA 1K5VA 2E53A 1IS6A 1FQ9A 4LO3A 2PHRA 4YZ3A 2PHWA 3WUDA 4XTPA 3BADA 1VIWB 4LBJA 4FPLA 1SLTA 4I30A 4PF5A 4G1RA 3GALA 3WCSA 4MYEA 2E51A 1OQLB 3OBTA 2DYCA 4GXLA 3BAVA 2D7RA 4NO4A 2D20A 5DG1A 3OGGA 1YI7A 2D3SA 2D6NA 5T5JA 3MW4A 4XJUA 1ABRB 4AVTA 4TLPA 2ZGRA 4GKXA 3WDUA 4CRQA 4YM1A 3VUOA 4I4XA 4Y1YA 1BZWA 4ZBVB 3CRHA 1HQLA 2XOAA 1C1LA 2SLIA 4IZXA 5E8AA 1CVSA 3ZYPA 1UX6A 1MS0A 5DSSB 2ARBA 4M00A 3H6RB 1MS9A 4QD2B 3SISA 1APNA 3T1LA 2NMOA 5T5PA 1KDKA 2VXRA 3AJYA 3BAGA 4JRAA 2D44A 3CA4A 2KLLA 4XDQA 2D24A 4ENDA 2EALA 3V64A 4Q1PA 3Q7WA 3OPZA 4Y22B 1PUMB 1T4QA 3F62B 3ZXFA 3NJ5A 3B00A 4FPGA 4KC3A 1ONAA 2NVHA 1AFCA 5IK4A 2HYKA 4LO8B 5KXDA 1YRZA 2P3KA 4I4QA 3IPVB 3N36A 2FGFA 1T9FA 3VT1A 5JLVA 3FBYA 2YROA 1R8OA 3RTIB 1V6UA 1LU1A 4NOTA 5T5LA 2YY1A 2D6OX 2DVGA 1D0HA 3WDVA 1MZ6A 1SCSA 2AENA 1W6OA 4BMBA 3O0VA 4SLIA 4I1EA 2UU8A 3AJ6A 5KXEA 2DWRA 1PWAA 3W59A 3ZVXA 1SLLA 1XHBA 4AGVA 3UJ0A 3WO4A 3M2MA 2DRZA 4P14A 1GNZA 2VY0A 1N1VA 2ZGUA 2IWTB 3FJAA 3H0OA 2I2SA 2VH9A 1BFBA 3O0WA 4GA9A 3WHUA 4OW4A 5FZZA 1V6OA 1Q8PA 4X39A 4I0YA 3OJMA 4GP0A 2ZR1B 2GNTA 2GMMA 2VU9A 3O49A 3O4CA 4AGGA 1BFFA 5G00A 2JE9A 3FJ9A 2CNAA 3NWKA 4YZ1A 3CA3A 2X2TA 1B09A 1J1TA 1QDCA 3M1HA 4YZ2A 5BXRA 1PUUB 1JT7A 2NN8A 2ZGLA 2G4IA 3IM0A 1SR4A 4EFRA 1KITA 1DFCA 5BOWA 3A07A 1HWMB 4K20A 4LO7C 2JECA 2JJ6A 4LBQB 7I1BA 5GLUA 1S0DA 1KJLA 2A7AA 1FYUA 2LALA 4QALA 4FOYA 5BXSA 1HQWA 2VLCA 4LBKA 2LIEA 3ZXLA 3M3QA 1RMLA 4M3CF 2D7FA 3M3EA 3SNVA 4XMAA 1Q03A 1QNWA 2VUAA 1BLAA 3WINA 3AP6A 3AKFA 2XB6C 3HN1A 2DUPA 3OJ2A 5FZYA 2AYHA 4G9MA 3NV2A 4I4SA 2D7IA 1HCEA 1DQGA 2V5YA 2NYYA 1ULEA 2GMEA 1G9CA 1SZ6B 4QKSA 2A6YA 5HCBA 3LSEA 2DUOA 1ONKB 2RQ9A 4WVWA 3IM5A 1JLXA 5EXOA 3WG1A 3TB0A 3H6RA 3IAGC 1LENA 3BOPA 2P34A 3ILAA 2XG3A 3I4IA 1N1SA 3JUUA 5DZFA 4YZ4A 3BRGC 2WLQA 4IZEA 4Q8LA 3O5SA 5E88A 4HL0A 4D69A 1UKGA 1OFSA 1SBDA 2CYFA 1IILA 4IY9A 3APBA 3OJVA 2PHXA 3POKA 1BJQA 4UW6A 3AX4A 3WLUA 3WZ1A 5BQUC 3TAYA 1IRPA 1IJTA 2ZHNA 4YGEA 2AXMA 4BMEA 1MS8A 5CBLA 2E6VA 3ZSMA 3LSDA 3UDAA 3WNXA 1BARA 4XYXA 1QKQA 3AKIA 1LEDA 1I1EA 3D4KA 3LCPA 3BRFA 1ZA4A 4J23B 4XJ9A 1FX5A 5T52A 1LHNA 3FJCA 1AVWB 1ULGA 1W3GA 4OWJA 3CA1A 3BAQA 1DQ0A 4JAWA 4XILA 4H9WA 1TEIA 3ILFA 3MW2A 2Z48A 3BTAA 1MS5A 1IS5A 2OUJA 1GNHA 2MIBA 1PZZA 4LBQD 1BKZA 4XBLA 4ATFA 1Z2VA 1SFYA 1MS3A 4XIKA 4FQ4A 4Q26A 5JOXA 1WBLA 4DENA 3AYAA 2LIQA 2EXKA 1GKBA 1PC8B 1IHKA 3AYCA 4K1YA 4Z9WB 3FJKA 2K8RA 2Y9FA 4F34A 1PZ8A 4PBPA 1LOAA 5HPZA 1LODA 3CNAA 3AJ5A 1YBIA 1CONA 4FOQA 1DZDA 3T8SA 2YMZA 1S0JA 1Z0HA 1AXKA 2D3RA 5EHAA 4KEIA 3AKGA 4LBOA 3ZXDA 3E8LC 2PHUA 1QF3A 3ZSJA 3B9CA 3AH2A 1D2SA 4LO0A 4XMIA 4LBQA 3VKLA 1FMMS 2QN4A 1HKNA 4L4IA 3UK9A 1DLLA 2DVAA 1WBFA 5BXTA 1I3HA 2WJSA 3N7JA 1JLYA 4XHBA 3BA7A 1DQ6A 2A75A 1GZCA 4I7IA 4FP3A 1AJKA 2P39A 1HIBA 5EWSA 1V6XA 2CWMA 3A21A 3SITA 1DFQA 1LOCA 3O4BA 1W6PA 1DYKA 4I8MA 4IY8A 4YGCA 4YG0A 1AX1A 3BAOA 2DVFA 3B3QE 3UD8A 1IS4A 5DUWA 4FP2A 5GLVA 5GZEA 2P23A 2ZQOA 1WLDA 1DQ4A 3PMEA 2EF6A 3AZYA 1SLBA 1WBAA 5GM0A 1NUNA 3K1XA 3OJBA 4XFSA 2AAIB 1O4YA 2R0HA 3I29B 1TFMB 4Q9GA 2A6WA 41BIA 5EYXA 1FAYA 1VALA 2YZ4A 3HMYA 4EFQA 3V0BB 1AVXB 2HZ9A 3WG4A 2ZGTA 1URXA 1A78A 4Y1UA 4I4VA 1Y7BA 4DRVA 2F2FC 5HCFA 1BASA 3AK0A 3H6SE 1LU2A 1V6LA 2EXHA 2D22A 1DHKB 1ISVA 3FLRA 2C5DA 2NTDA 4AVVA 1V6KA 2UWCA 4XKIA 3RRDA 3BB2A 3IMNA 3S8JA 3BAUA 4ZFWB 4HR6C 4XHXA 1KJRA 2FFVA 2NZ9A 4QKRA 1TIEA 4LBLA 3N7MA 4ISQA 1G82A 2DURA 3V79C 2GN3A 1ZM1A 2VW2A 3P6JA 2AUYA 1LECA 4YW3A 4XJZA 2Z49A 2ZGMA 2BEBA 4Y1VA 1QDOA 2R9KB 2Q5TA 4ISRA 1CQ9A 4YOLA 1S0LA 1WLCA 1LOEA 3P6IA 2ZHMA 1JBCA 1GZWA 3B01A 1FATA 1M2TB 4AN6A 1FMZA 3AKHA 2FO1A 4I4YA 3N3HA 3RMXA 4EB2B 1G9BA 1DQ5A 5FNWA 2EAKA 4ATEA 5F5QA 4BPZA 2MLLB 1ISXA 1V6NA 1YYNA 2UWBA 3RG0A 3OY8B 4DRRA 3FJBA 1QXMA 4FOVA 2W68A 4G6MA 1V6IA 4DEPA 2WRYA 5F8YA 2Y9GA 4GAFA 4GOVA 1XYFA 4ZFUB 2KI4A 4FPCA 1LOFC 2VW1A 5DXDA 4Z8SB 2R49A 4D0TA 2VW0A 4FPHA 1ULDA 2GALA 3POWA 3ATGA 3AP7A 2DS0A 1BLDA 3VSFA 3L2YA 5BVPI 4J2YA 2YXSA 1DJSB 1GANA 1IRAX 4I4OA 3IM6A 4XJAA 1E0OA 2SBAA 4TZDA 3Q9OA 4QBVA 4FQZA 1QOTA 3AP4A 4GWMA 5D63A 3VWCA 2DUQA 2GMPA 2HWMA 1W6NA 1GICA 4CJMA 8I1BA 1XZZA 3WG2A 4BLJA 1W6QA 3O4AA 1G9FA 1DZCA 1WD4A 4DS0A 3ZC9A 5DZGA 4D8HA 4I3NA 4Q91A 3W9TA 1MS1A 3LTQA 4ZA3B 5B2HA 4YG6A 4I2SA 3WVJA 4IYBA 1LTEA 4GP3A 2E4MA 3W58A 3WO3A 2GNBA 1GGPB 1ILR1 1HKDA 1N1YA 3PJQA 4FPKA 3AP5A 2EIGA 5IK7A 2NP0A 1HLCA 5DUVA 1YTOA 2W08A 5IK8A 2DV9A 3V65A 3VKOA 4IQPA 3HR9A 3FJ8A 3QCWA 1LHOA 2D43A 3V0BA 1HDKA 1CJPA 2ES3A 1V6VA 4A7ZA 4R9BA 1UMZA 2L5XA 3DGTA 4JCKA 1DZQA 1WCSA 2P37A 3AXEA 4I6IA 2A5ZA 3AZVA 3A22A 3AYDA 4DPNA 4P0JA 2R0FA 2ZHLA 4I4UA 2ZMLA 1MS4A 1O4ZA 4KEKA 4LO1C 1YIFA 5BYNA 1W3FA 1G9AA 2VSAA 3UD9A 2JD4A 4QD2C 1AVUA 4J2XA 1PZ9A 1H9WA 3WDXA 3BX1C 2ZHKA 1W6PB 1RY7A 1LJ7A 4XFTA 2M49A 3JU9A 3BODA 4H04A 4XXAA 5BP5A 3O4OA 4M3CE 1QU0A 4AWDA 5L73A 3IM7A 5T5OA 2JKBA 3SLIA 1LGCA 1JXNA 3FUOA 3CRGA 2X2SA 3AXDA 1G86A 2DTYA 4AVSA 1IKQA 1UL9A 3HALA 3UD7A 5GLTA 2WKKA 2GNMA 3NBCA 1CN1A 3WMVA 4FPFA 3PVOA 3ILRA 1JT3A 4C1WA 3WDTA 1DIWA 4YW1A 3OY8A 4FPJA 1WBCA 1ISYA 2IHOA 4XIOA 1VCLA 1Q8QA 1WW4A 3RTJB 4UW3A 1S0CA 2ZGQA 1EPWA 4WV8A 1S0BA 4QC4A 2P3IA 5EG6C 2ZBJA 4X3AA 1ENRA 2H0BA 3A0NA 4U2AA 4ITCA 1R1ZA 1UN1A 2F8XC 5AVAA 3WG3A 1LOBA 1DQ2A 1CR7A 5JOZA 5DZUA 5GAQA 2K43A 1LGBA 3VKNA 1SCRA 4DCKC 3A23A 2FFUA 3VEQA 3AFKA 3ZYRA 2V73A 4ASMB 1MD6A 2DRYA 4R9AA 1Q56A 1UPSA 3POYA 2GZBA 2CWSA 5BQUA 3HSMA 3CAHA 3OGFA 4I1BA 5H9RA 1TTUA 4Q9PA 4M01A 1GZWB 31BIA 1LHWA 2QYIB 5T50A 3UJOA 4OWKA 5F8SA 3B9UA 4JP0A 2KKIA 4JQ0A 4WVVA 3B69A 4YGDA 5FZUA 1FV3A 1W0PA 3GNEA 3FJHA 2NM1A 1WD3A 1FN0A 1JUIA 2D6MA 2I1BA 3AJZA 5IK5A 4Y1ZA 1V6WA 4HANA 2HWAA 1LGNA 3N7KA 1K5UA 2DVDA 3RSJA 4XFUA 2FMDA 3IIRA 3QR5A 1MACA 1RG8A 4ZLBB 3D7WB 4P9YA 2CL2A 1AX2A 3A4UA 2D6KA 4DQAA 5DUUA 4K1ZA 1LCLA 5D62A 1H9PA 1WW5A 3VT2A 2AREA 1G8WA 2Y9XE 5JVVA 4YFWA 1HWPB 4EKXB 1ENQA 4ZOTA 1LHVA 3CU1B 1W6NB 1UZZA 1C1FA 1J0SA 3ENRA 1WW6A 9ILBA 5FREA 1W6QB 5CNAA 4USPA 2KM2A 3WDWA 3MW3A 1LESA 1Q8OA 1CESA 2GNDA 3BIWE 3Q7XA 1KRIA 2ERFA 4F83A 3BA5A 1TOOA 4DFSA 4JC1A 2VSEA 1R8NA 1EVTA 1GYKA 1VLNA 3V0AB 4ZKTB 3SNMA 1JTCA 2CTVA 4LO3C 4LO2A 4YG3A 3CA6A 1SBEA 4D0ZA 1JN2P 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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