1DFQA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with sialic acid
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 109
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dfqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dfqA02
5CA6A 2D6PA 3KMVA 4I4PA 3D4KA 4DRRA 1LOBA 3ZX7A 5EG6C 3O44A 4ZOTA 4X38A 1SLCA 1XZZA 5L73A 2ZGPA 1BASA 2BFHA 1ISZA 2P37A 3AYDA 3IPVB 4ISRA 4H55A 2A70A 2XG3A 4YZ5A 3PVEA 4A7ZA 2FHRA 1W0OA 3B9UA 1A3KA 4IY9A 5GZDA 1DGLA 5CB7A 1FX5A 1FNZA 2Y9FA 2P3IA 3FBYA 4XE9A 5FREA 2E4MC 1ULGA 2DREA 2R1DA 1HCDA 2ARXA 1LHWA 3BRFA 1SLIA 4AGVA 2AUYA 3IM6A 2ZGRA 4J2YA 5F8YA 4DCKC 1B09A 1BLAA 5T50A 1H9WA 2A7AA 2ES3A 4LO2C 4XFUA 4XYXA 2A75A 1LOFC 2Y9GA 1DZDA 2J3PA 4FOWA 1E0OA 3ZYRA 1WBAA 3WMVA 9ILBA 4JCKA 5H9SA 2A3YA 2ZACA 1AVXB 2GNBA 1SACA 4YGCA 4I1BA 4DRVA 3WG4A 4FOQA 3A0NA 3V0AB 4JKXB 3FGMA 1UZYA 2D20A 4F34A 1AZDA 4P9YA 1FQ9A 3H6SE 2CYFA 2P39A 1X50A 2NYYA 1ENQA 3DGTA 4KEJA 1T9FA 1SBEA 3NWKA 1QQLA 4SLIA 1V6VA 5DZGA 2VU9A 1Q8OA 1JYCA 3C2UA 2E4MA 1Z0HA 1KQRA 3WG3A 4OEEA 5F5QA 3IM0A 4FVVA 1JQZA 1MS0A 1HLCA 5IK4A 2GMPA 3ZYPA 1VAVA 3WINC 2OUHA 2HZ9A 3LCPA 5E89A 3WO2A 1S0JA 4LO2A 3WCSA 3I8TA 3POYA 3WG2A 5EXOA 1O4YA 2WNEA 3W59A 1N1YA 2KM2A 2JDZA 3AXDA 1VAMA 3PMEA 2E51A 5IK7A 4Q8KA 3RS6A 1V6KA 2E53A 3FLRA 1K5VA 2WKKA 1QOOA 1V6IA 3M2MA 4GP0A 3NBEA 4KC3A 4BLIA 2DRZA 3N35A 3NJ5A 3LLPA 2GMEA 4J2SA 2ZABA 4XHBA 4IY8A 1HIBA 3BOPA 4YZ3A 2MC2A 2DUPA 3PVOA 5JLVA 5T52A 2AREA 4XJUA 1Z78A 2H0BA 1LODA 1W6MA 3WUDA 3CRGA 3VT2A 4ZFYB 2EXIA 4ATEA 4I4OA 3AYCA 1GZ9A 4YZ2A 1CVNA 1WBFA 2WQZC 1LOGA 2DYCA 3WCRA 1PC8B 4P9WA 2LALA 2ZGTA 5CBLA 1JT4A 4FPGA 4YM1A 4G1RA 3N7MA 4JC1A 3FUQA 3T2TA 2WT2A 1AVBA 2B7YA 3UD7A 1QU0A 3ZXDA 2UU8A 1V6LA 4AVVA 1AX0A 5G00A 2K8RA 1BZWA 2NP0A 3AKIA 1XG6A 3NV2A 1TEIA 3N36A 4D8HA 3BAQA 1ULEA 2GNTA 1YBIA 4Y22B 4YZ4A 1XQNA 4XZPA 3B01A 6I1BA 4Q9GA 4CZSA 1ABRB 4YM3A 4YG6A 5GLTA 2D24A 4ASMB 4D0TA 4Q1PA 4L4HA 3WMUA 4DEPA 1SCSA 3OYWB 3AP9A 3PJQA 3ATGA 3SH5A 1BARA 4R9AA 4K1YA 1AVAC 1LHUA 2QN4A 2DWRA 1VIWB 3WDUA 1MVQA 2R49A 3OBTA 1HKNA 5GLZA 1DQ2A 1DLLA 2FMDA 1MS8A 4TYSA 1EVTA 2LTNA 1TOOA 2DRYA 2D44A 4I4RA 3UJQA 1J1TA 2AAIB 5DUYA 4Q9PA 3ZSLA 1VCLA 2VLCA 1G7YA 3H6RB 1M16A 4XDQA 4YM0A 3LSDA 1W3GA 4I7IA 1ZA4A 4EKXB 5JOYA 2EF6A 2ZGLA 4Z9WB 2I2SA 3AKGA 4X37A 3UK9A 2ZHMA 1S1AA 2ZGNA 2UURA 4EFRA 1RY7A 3Q7YA 4Y20B 3AZWA 4G6MA 1GNHA 1JT5A 1JT3A 2EXHA 4GKYA 1LOAA 2D6MA 2CY6A 3B3QE 2D6LX 4XTMA 3CA4A 1DYPA 2ZBJA 2ERMA 4I4SA 1AX2A 4Y1VA 2UWBA 1N1SA 5GJ6A 1AVUA 3ZXJA 1V6MA 4YW3A 5GALA 2ZZJA 1LHVA 2D7RA 1LGCA 3FJDA 2NMNA 3QR5A 1YO8A 4LBQA 2Q3NB 4FPLA 4U36A 2NM1A 3M3OA 1W6OA 3PUBA 5DUUA 1OKQA 3O4DA 1MZ5A 1AXKA 4M3CB 4YW5A 1IOAA 4DFSA 3AZZA 1JYIA 1V6JA 3POWA 3BRGC 3NV4A 3B00A 7I1BA 1LESA 5GLUA 1QDOA 1A78A 1TFMB 3BRDA 4ZXKA 1HDKA 3HMYA 1RG8A 1APNA 2YMZA 3CA6A 3WZ1A 1TP0A 4YM2A 1WCSA 4UW6A 2DU0A 2VW2A 3RRDA 1CPMA 4HANA 1LOCA 4GWNA 2FGFA 1ENSA 4WV8A 3UL2A 3N7JA 4XMAA 4A7KA 1JY0A 5DZUA 4M00A 1O4ZA 3WVJA 1S0IA 4I4XA 1SFYA 3AP5A 2ZMLA 3CA3A 5H9RA 2P2KA 1OQLB 3MEPA 1UZZA 1MC9A 1YI7A 1WD4A 4WZFA 4XJ8A 1W6QA 4R6UB 1QDCA 1AVWB 5DUXA 4BLJA 1FAYA 1FNYA 2FO1A 3O0XA 1ONAA 3AP7A 4I0YA 3LSEA 1MS4A 1OFSA 1BFFA 3A21A 1AXZA 2MIBA 3S8KA 1UMZA 4M3CF 3I29B 1DIWA 3OJVA 1IJTA 3C9ZA 1BQPA 1S0GA 3AZYA 4BPZA 4LBOA 4DENA 2Y9XE 3L2YA 4ZFUB 2R1BA 41BIA 1G9FA 1UKGA 2DTYA 2CWMA 4C1XA 1RMLA 1PZZA 1URXA 1IILA 1JLYA 1MS5A 1GANA 1W6NB 1QGLA 4Q8LA 1FMMS 1Y7BA 3V79C 2SLIA 3AJ6A 2AR6A 5IUQA 2R0FA 4XBNA 4H04A 3MW3A 1RINA 4YFWA 1FN0A 2XOAA 3WUCA 2ZKNA 2JE7A 4HJJA 1S0BA 2VSEA 4LO7C 4YGDA 5T5OA 3VEQA 3OPZA 5E8AA 1LGBA 3O5WB 2JKBA 4NOTA 1S0FA 3SH3A 1LHOA 4BMBA 1IT0A 1GICA 4GA9A 4Y1YA 3WDTA 5EC5A 5H9QA 1LEDA 4PBPA 4GOYA 1LGNA 1C1FA 4I6IA 1IS3A 4XFTA 4PBOA 1LECA 5H9PA 3VKLA 4Z8BA 3AJYA 1DBNA 4LBJA 1IKPA 4DS0A 1LENA 3IKWA 3UJOA 1N4KA 2ZGUA 2ZMNA 1EPWA 3OGFA 4YFZA 2BQPA 4YGBA 4XJWA 1AXMA 1DQOA 2A5ZA 1IS6A 1VALA 3ZSKA 1DJSB 3MPPG 5T5JA 3OY8A 1PUMB 5GAQA 2NMOA 2ESUA 1CE7B 4ITCA 4AVTA 2UWAA 3Q7XA 3BA4A 4YGEA 1ENRA 2BEBA 1ULDA 4OEFA 3F62B 5GZGA 5AVAA 1LEMA 1LU1A 1GGPB 1WW7A 2L5XA 1MS9A 1QOSA 3RMYA 4FQ4A 4IONA 5IK8A 3RMXA 1C1LA 2DUQA 1PUUB 2GO2A 2GNDA 1IRPA 1DQGA 4XBQA 2D3RA 1IKQA 4UW3A 4Y24A 2PHFA 3P53A 3E8LC 1DFQA 1WUVA 1ULFA 2P3KA 4DQAA 3V0BB 2DTWA 1SZ6B 1IS4A 1HWOB 3BB2A 4USPA 3A0KA 1YF8B 4L4IA 1GZWB 4R9CA 3FJ8A 2D6KA 5BXPA 4AN7B 5KXEA 2RHPA 4BOWA 2DVDA 1WLDA 3CU1B 5FZZA 3AZVA 1JOJA 1V6XA 1FMZA 3OJ2A 4Q1RA 4ATFA 1HQLA 1Q8QA 3T1MA 1ITBA 2ZGKA 5EWSA 3PVNA 4M01A 4Y1UA 1I1EA 4IQPA 3USUA 1N3OA 4LBKA 4YG0A 3WG1A 3FLTA 3POSA 4OWLA 1W6PA 3BAHA 4HL0A 2A3XA 4OWJA 5FZYA 2YZ4A 4EEEB 4YW1A 4P0LA 1S0LA 3OBRA 3ILNA 4FPFA 2G4IA 4AWDA 1HQWA 4W65A 1JT7A 5JDBA 3HR9A 4XHXA 5F8WA 1R1ZA 2IHOA 1JUIA 4I37A 3TC2A 5FRAA 3POKA 1ISYA 2C9AA 5D63A 2NZ9A 1S0CA 2LIQA 1CIWA 21BIA 4XMIA 3B9CA 4XJZA 5BP5C 2UUSA 1SLTA 1GNZA 3D6EA 2CWSA 2YV8A 4XOGA 4XILA 1R8OA 3CAHA 1HWNB 3IM5A 4FPHA 2PHUA 3FJBA 2BEAA 2VSAA 4CJMA 1J0SA 4LBMA 3ZXFA 1D2SA 2I1BA 2ERFA 2KKIA 3CA1A 3RTJB 1WLWA 3WOGA 1ISVA 2KLLA 2GALA 1SLLA 2P23A 3W9TA 2XB6C 5EYXA 2EIGA 1QOTA 2DU1A 4JPZA 1PWAA 1Q8SA 3WHUA 3BA5A 3AKHA 3Q7WA 2C5DA 1F5FA 2WBCA 4GALA 3IPVA 4XBLA 1KDMA 2AYHA 2WSVA 4C1WA 5BVPI 3N7KA 4JRAA 4K1ZA 3NBNA 2K4AB 3JUTA 3O4BA 3JU9A 2X2SA 2OW4A 1I1BA 3K1XA 4GWMA 4PCRA 4LO1C 1IOBA 1R8NA 4XXPA 4XIOA 4YOLA 5BP5A 3N7LA 3HALA 4Q91A 2ZGQA 1Q56A 5BXTA 2WJSA 1U0AA 5JMCA 3AJZA 3A22A 3ILAA 3VKNA 2YY1A 3TAYA 4I4YA 5DSSB 2ZGOA 4AVSA 3WDWA 5SV8A 1C4RA 4Q27A 5DXDA 5BQUA 2D43A 1JW6A 1T4QA 1M2TB 2EAKA 3MW2A 3D5OA 3V0AA 4QBCA 3ZC9A 2W68A 5JVVA 1C57A 4K21A 1N47A 4LO7B 3SISA 2AFGA 1F31A 1F9KA 2ZA9A 1IRAX 4QD2C 3ZXLA 1UL9A 4WVWA 2P3JA 2D7IA 5BXRA 4XJ9A 1NUNA 1XHBA 3BODA 1QKQA 1G86A 1PZ9A 4YLZA 1ZM1A 2DVAA 4LO1A 4XTPA 3CA5A 1LULA 2HWMA 3GALA 3BADA 3RQ0A 2NVHA 2DVFA 3SNMA 1V00A 2A71A 2D23A 4KBBA 1MVEA 5HPZA 2FFVA 1IS5A 1Q8PA 1BJQA 4FP2A 1K5UA 2EALA 4ENDA 3AH4A 2VUAA 1Z2VA 5DZFA 1GLHA 4FQZA 2FDBM 4XJAA 2D22A 3CA0A 3ZXEA 1WBCA 1MS1A 1V6OA 1DYKA 2D6NA 5KXBA 1W3FA 1UN1A 4BM8A 5JOXA 3AXEA 2ZAAA 2VXTI 3ZPYA 3FFZA 2V73A 3WDVA 1CJPA 3NBDA 3AYAA 2A6VA 3M3CA 3O49A 4P6AA 1LOEA 3R4UA 4Y26A 3VUOA 3U4XA 1ILR1 5IT6A 4M3CE 1SLBA 1W6MB 3O3QA 2HYKA 4LO0A 3ZSMA 1JN2P 2RG9B 2EXKA 4ZFWB 3WV6A 4GKXA 4GXLA 1SR4C 4FP3A 2A6YA 3VKMA 2D3PA 2QYIB 1LTEA 3AP4A 5D61A 2NN8A 3UD8A 1GBGA 4R9DA 2DV9A 4P0KA 5DUVA 4Q26A 1DQ1A 1NXD1 1JBCA 1KJLA 3FJHA 4D0ZA 3Q9OA 1DZCA 1WW6A 2V5YA 4Y1XA 4LO8B 2AENA 2VW1A 1AFCA 4Y22A 1UX6A 4AGGA 1TIEA 4KEKA 1UAIA 4RL7A 3SNVA 3IM7A 4J2KA 4LBNA 3BAVA 1XYFA 3OYWA 3ASIA 1WW5A 3IN9A 1LHNA 1V6NA 4P0JA 3M1HA 4F83A 3BAGA 3WO3A 3T1LA 3JRRA 3CNAA 1G82A 3R4SA 2GN3A 3AFKA 1YRZA 1EV2A 3ZVXA 5HCAA 4OW4A 3P6IA 1SR4A 2E7QA 3ENRA 4QBVA 1YTOA 3TB0A 4I1EA 2R16A 3FJAA 4Q2FA 3ZSJA 4JAWA 1W3AA 4YW4A 1A8DA 3ZC8A 3WDYA 5DVHA 1RZOB 3MW4A 5GLVA 1H30A 2W39A 2GN7A 3MALA 1AF9A 3SLIA 2D3SA 4TZDA 1L2HA 4GP3A 3BTAA 1I3HA 4XIKA 2DVBA 4AYUA 2Q9XA 3H6RA 3WNXA 2Q5TA 3VKFC 2EXJA 1TWEA 2A6ZA 1RIRA 4HR6C 2E7TA 4I4VA 1SBDA 2D1ZA 3FJKA 4EFPA 3I2AA 3FJJA 3VSZA 1CESA 3M3EA 3FJIA 1QXMA 3B69A 1H9PA 4Y20A 4MYEA 3R05A 3W58A 1BFCA 2WLQA 4JQ0A 3GNEA 3KM5A 2F2FC 3FUOA 2ET2A 1PZ7A 1DQ6A 4PF5A 3SH4A 3JUUA 1FV3A 3VT0A 2KI6B 3A23A 3O5SA 1KDKA 3RG0A 3QLQA 5D62A 2PELA 3EF2A 4I8MA 3LTQA 3ZXGA 3UJ0A 5HCBA 4Z8SB 1II4A 3UJ4A 3RSJA 4KEIA 1QNWA 2ZGSA 1ONKB 1CPNA 3N0KA 1G9CA 2FFUA 3QYDA 2ZR1B 1ISXA 4UW5A 4JKQA 3N3HA 4LBQB 2X2TA 1G9BA 4M3CA 2AQZA 1AXYA 4H9WA 3O0VA 1ISWA 1W6OB 3H6QA 4JP0A 3AP6A 2LIEA 4QKRA 2WT0A 3AKFA 4YG3A 2W08A 2W52A 2WT1A 4YZ1A 4IHZA 4AN6A 4FGFA 4AGRA 3UD9A 1LOFA 2F2FA 3AZXA 4QC4A 3WDXA 1MS3A 8I1BA 5I1BA 2HWAA 5BOWA 1WBLA 3O12A 2GZBA 2A6XA 2GDFA 2GNMA 2DVGA 5IK5A 1CN1A 2IWTB 3BAUA 1FATA 4FOYA 31BIA 4GAIA 1FGAA 3INAA 1KJRA 4K20A 2AXMA 3OJBA 3FLPA 1HWMB 4QD2B 2CL2A 4ZLBB 5DG1A 3O4CA 2E6VA 4BMEA 2CNAA 1W6QB 3O0WA 1JHNA 1MR5A 4U2AA 1AX1A 1WLCA 3WHTA 4P9XA 1FWUA 4FPJA 3V64A 2JD4A 1BLDA 3WINA 5KXDA 1KNMA 2A3WA 1RITA 1NZKA 2K43A 2Z42A 4CRQA 5F9TA 3AK0A 4OZXA 3O4AA 2ZGMA 3D7WB 4XKIA 3BA7A 1SLAA 2AGSA 4PQ9A 1W6NA 1DQ4A 1BKZA 1D0HA 2GMMA 3H0OA 4EB2B 2ENRA 3O4OA 3WO4A 2DURA 1KRIA 1OQ1A 4Y1ZA 3VWCA 5CNAA 1YIFA 3KQRA 1BYHA 1JTCA 4J23B 4ZGRB 1GV9A 4L8QA 1GSLA 4I30A 1G9AA 4FPCA 4OEGA 1FWVA 5BQUC 4I4QA 4ISQA 3FJEA 2VXRA 1MACA 4GOVA 2Z48A 5GZEA 1G8WA 1LJ7A 3RTIB 3PHZA 2PHRA 3WLUA 4UW4A 3NBCA 4I4UA 5T55A 4R9BA 2ZHNA 1Q04A 2JECA 1SBFA 1Q03A 1YXWA 4LBLA 4FPEA 5GLWA 1HWPB 4II0A 5B2HA 4FPOB 5T5LA 1JLXA 4X3AA 2ZQOA 4G9MA 3UDAA 1S0EA 4IZXA 1TWMA 5T5PA 1QQKA 2R0HA 2HW9A 4P14A 1YYNA 2P34A 3FJFA 1AJKA 2VH9A 4I96A 3VKOA 3CRIA 5FNWA 4XXAA 3FJ9A 4FOVA 1Q1UA 1FYUA 1LU2A 5BYNA 2NTDA 1JXNA 3AH1A 4QO3A 4PC4A 4WBCA 1SCRA 3M3QA 4BQ1A 5GZCA 1MD6A 4HA2A 1DFCA 4GAFA 3AJ5A 3VSFA 4OWKA 3OY8B 1MZ6A 2WRYA 2AH2A 2A6WA 3ILFA 2PHXA 3V65A 2R9KB 4G6JA 4ZA3B 5F90A 1BFGA 3WA1A 1NLSA 3I4IA 2DUOA 4QALA 3NV1A 4LO0C 4X39A 1LCLA 2JJ6A 1N1TA 4OUJA 4QKSA 1DHKB 3VV1A 5BXSA 2ARBA 1Q8VA 3QCWA 2M49A 4USOA 3AX4A 2PHWA 1EYLA 2KH2A 1CVSA 5KXCA 3BIWE 1BFBA 2RSTA 5FZUA 5T54A 3V0BA 4LBQD 1V6UA 4ZBVB 2D7FA 2YUGA 3OJMA 1CR7A 4IYBA 1DQ0A 2ZHLA 1GZWA 5LK5A 4LO3C 5JOZA 4I2SA 2SBAA 3APBA 1DQ5A 4DPNA 1WW4A 3SITA 1GZCA 3A07A 3OGGA 1W0PA 5GM0A 2WSUA 2RQ9A 5DG2A 5EYYA 4J2XA 1FV2A 3F1RA 1BXHA 1QNYA 5JOWA 5F8SA 5E88A 3HOMA 3CQAA 1P63A 1QF3A 4ZKTB 2JE9A 1GKBA 3FJCA 1Z4SA 2ZQNA 3HBWA 3IIRA 2VW0A 3A4UA 1PZ8A 4EFQA 5GZFA 1CONA 5DZEA 2D6OX 3S8JA 2Z49A 4D69A 3USUB 3HSMA 3CRHA 1TTUA 1ULCA 1W6PB 3T8SA 1BA7A 1UPSA 4TLPA 1N1VA 2OVUA 2VY0A 4WVVA 4XFSA 3NV3A 5E24E 4I3NA 3IMNA 1N3PA 2OUJA 1G9DA 3ZXKA 2YXSA 2ZMKA 3PG0A 1GYKA 5DUWA 1KITA 2YROA 4FPYA 2MLLB 3AH2A 4LO3A 3ILRA 3I2XA 4G9NA 1QMJA 4NO4A 1DZQA 1CQ9A 2F8XC 5FNXA 3BAOA 1IHKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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