1DIWA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with galactose
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNEESEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium tetani
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
total genus 110
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1diwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1diwA02
1CR7A 1QU0A 1QF3A 4ATEA 4WVVA 1S0DA 4XBLA 2FFVA 1Q8OA 4HA2A 2OW4A 3HMYA 4ZGRB 2K43A 4Q8LA 3B9UA 4XXPA 4YZ5A 5GJ6A 3AJ5A 1V6JA 3ZC8A 4YW4A 4A7ZA 4IQPA 1FV3A 2C9AA 2ES3A 1RZOB 4W65A 3UD7A 3FJDA 2KI6B 4XMAA 5FZZA 3RSJA 2OVUA 2ET2A 3OBRA 2VU9A 5EYYA 1TIEA 4G1RA 4I4QA 1BFFA 3WG3A 3BAVA 4R6UB 4BQ1A 1IRPA 4Z8SB 2WKKA 4X37A 1XHBA 2D1ZA 2HWMA 3IMNA 2EXIA 2ZGQA 4RL7A 1HQLA 1PC8B 3WG2A 1A8DA 1IS3A 1EPWA 3ZSJA 4Y1VA 1O4YA 3N7KA 5BQUC 3BRGC 5GZDA 4GALA 4DPNA 2ZGNA 1AVAC 3BAHA 3O4DA 3S8KA 4FOVA 3AZZA 3W58A 3WO3A 3UJ4A 2FHRA 4J2XA 1ZA4A 2Q3NB 4WVWA 3VWCA 3TC2A 3AJ6A 4FPGA 4KEIA 1Z4SA 2ZQNA 1QNWA 2VXRA 3O0WA 3ZXLA 3A07A 3CA6A 2ZR1B 1W6NB 3ZSLA 4K20A 2C5DA 1DQ6A 1LHNA 2XG3A 5CB7A 1ISXA 2GMPA 4CRQA 1AZDA 3M3EA 1V00A 4PBPA 2PHWA 3T1MA 2Y9XE 2E4MC 4I0YA 1ENQA 4JPZA 5T52A 3FJIA 3NV1A 3V64A 3RMYA 3BIWE 2JECA 5KXCA 3AYAA 1KNMA 2VW0A 1Q8SA 3O44A 2GZBA 1DYKA 1BFBA 1OQLB 5H9RA 5GLWA 3AH4A 1X50A 3WINA 3AJZA 1HIBA 2RSTA 2PHTA 2ZAAA 4LBQA 1AFCA 2DUOA 1G9DA 3BAQA 5DZUA 4R9DA 3L2YA 3OJVA 2LIEA 1A78A 4BPZA 3Q7YA 3V65A 1TFMB 1BLDA 3VKOA 4DQAA 1GYKA 4FOQA 5JOWA 1TP0A 1K5UA 1H30A 4NOTA 2D6MA 4OWJA 1S0IA 4Y26A 3AXEA 4I4OA 2D7IA 3AKHA 2G4IA 2EXJA 1T9FA 4P0JA 4DRVA 1HCDA 1QKQA 3EF2A 2PHUA 4Y1YA 4L4HA 3CRHA 3SNVA 4FOWA 4P6AA 1H9WA 1V6KA 2RQ9A 1G8WA 2D7RA 4LO2A 4EB2B 1AJOA 1B09A 2UWCA 3CA1A 2D23A 4BMBA 2VLCA 1ULDA 1IOAA 3W59A 2NMNA 1KQRA 4D8HA 2GNBA 1UZZA 3A23A 1LU2A 3BAOA 2ZHMA 3I4IA 1HWPB 2J3PA 3ILNA 4I30A 3UJOA 1DZCA 1CVSA 4LBKA 2OUJA 1QOTA 4FP2A 1S0FA 5E8AA 2VW2A 1SLBA 4H04A 1ONAA 2D7FA 1VALA 4U36A 1I3HA 1APNA 1DZDA 1HWOB 4ZA3B 4IZEA 1W6OA 4R9BA 4YFZA 1T4QA 5IT6A 1QOSA 3I2AA 4ISRA 4PQ9A 3BODA 3AKIA 3AYDA 1JW6A 3OJ2A 2X2TA 2Z42A 2BFHA 2AR6A 4X39A 4LBMA 1W3GA 4R9CA 3WUCA 2ZKNA 4YW2A 21BIA 3IKWA 4M3CE 1DYPA 1D0HA 1CIWA 1WBLA 4ZXKA 1S0EA 1R1ZA 3POSA 3ZSKA 5F9TA 3AKFA 2YUGA 4I96A 4XHBA 4M3CF 1FV2A 1A3KA 7I1BA 1JLXA 5EC5A 5JLVA 2H0BA 2WSUA 4QKRA 2A71A 3AP9A 5EWSA 1LHVA 3SH3A 3WDTA 2MLLB 2D44A 3ILFA 3FJKA 4CJMA 1N3PA 4UW5A 1AVWB 3AP5A 3WDYA 1JXNA 4M01A 2CNAA 2HWAA 2QN4A 1EV2A 1NXD1 3ZXJA 2AFGA 5GLVA 5H9PA 3VKLA 5DZFA 2VSEA 4JRAA 1VAVA 2VY0A 3HOMA 3RRDA 1ILR1 2DYCA 4XILA 5D62A 2DRYA 3WLUA 1RG8A 3CAHA 2A6WA 3RG0A 2XOAA 5I1BA 4RA0A 3RQ0A 1MS9A 3HALA 5BP5C 2JE9A 1ULFA 1AX1A 3AP6A 1LULA 4L8QA 4C1WA 2AYHA 2AENA 3ZXGA 4XJ9A 4CTEA 3CNAA 4XIKA 1BARA 1QQLA 3WVJA 5GZCA 4LBQB 2E4MA 5JVVA 1TEIA 4I4PA 2P2KA 1WLCA 3A21A 1ZM1A 4PCRA 1BYHA 4GP3A 1SBFA 4DEPA 1JQZA 3W9TA 3D7WB 1GNHA 3B00A 1G82A 5EXOA 4LO7B 5EHAA 4GAIA 5HCAA 3AYEA 2Y9FA 1F9KA 3FUQA 1UPSA 4Y20A 2AXMA 4Q9PA 1ENRA 3O5SA 2XB6C 4LBJA 2DTYA 4XJWA 4YM2A 2ZHKA 2A3WA 3WG4A 1LOFC 3E8LC 1KJRA 3JRRA 3ZX7A 4GKYA 1U0AA 3IIRA 3N35A 2P3KA 1LESA 2JJ6A 4Z9WB 1O4ZA 1UN1A 4YM3A 1KJLA 3FFZA 3CA5A 1AXKA 4KBBA 3FGMA 4EFQA 2WLQA 1E0OA 2FGFA 1UL9A 2L5XA 1DFCA 2WT0A 4I4RA 2D6LX 3HSMA 3O4AA 2CYFA 5IUQA 3ENRA 4LO7C 1S0LA 1J0SA 3IPVB 1WCSA 1C1LA 1YRZA 2BQPA 3R4UA 5KXBA 2D6NA 4P9YA 2D3SA 1N47A 2GO2A 4X3AA 3S8JA 4OWLA 3RTIB 4WV8A 1G7YA 31BIA 1CN1A 2GN3A 1LHWA 3WOGA 3T1LA 5T50A 4FPJA 2FDBM 3VKMA 3AX4A 4JKQA 1JUIA 2KLLA 1N1VA 4GWNA 2NTDA 4LO2C 1GV9A 3ILRA 2FO1A 3PVOA 1DLLA 4EFRA 3NV2A 2ZGSA 5BXTA 3FJBA 5F8SA 2EAKA 1JLYA 4HJJA 3POYA 4XBNA 3KMVA 3Q9OA 4YGDA 4AGRA 1RIRA 1Z0HA 1AVBA 5IK4A 4XIOA 5H9SA 1PZ8A 4OUJA 4JQ0A 2JE7A 2UUSA 2GNMA 4YOLA 1W0PA 4I4UA 3MW2A 1GZ9A 3R4SA 3OY8B 4P9XA 3MW4A 1HDKA 1DQ1A 1GLHA 2F8XC 2YROA 3R05A 1YYNA 2R0HA 4XFTA 1PWAA 4AWDA 1S0GA 4X38A 1YIFA 3FLTA 3CA0A 4H55A 3SITA 2Y9GA 4LO1A 4FPEA 1JHNA 1IRAX 1FYUA 5GZGA 3WHTA 3NJ5A 1JT4A 5JOZA 3M2MA 3UK9A 2A3XA 3A0NA 3BA5A 1SZ6B 1H9PA 4ZBVB 4FQZA 5DVHA 3SLIA 2CTVA 4D69A 4AVTA 4M3CA 1SLAA 3NV3A 4QBCA 1AXZA 1GKBA 3UD9A 2ENRA 4Y24A 4G6JA 1V6LA 1FX5A 1LEDA 1LOBA 2D6PA 3O4BA 5BP5A 1VIWB 2EXHA 1G86A 2RG9B 1GZWA 1UMZA 5IK5A 1BXHA 5E24E 2HYKA 5T54A 1K5VA 3T2TA 3AZYA 4G6MA 5D61A 3B3QE 4Q26A 3I8TA 2QYIB 3I2XA 4QO3A 2R1DA 4AN7B 1UAIA 1SCRA 3VV1A 5SV8A 1MZ6A 2W68A 4FOYA 1QGLA 1BKZA 4QC4A 2ZGUA 3WCSA 3OGGA 4OWKA 5E89A 4XDQA 4USPA 3BTAA 2SLIA 3AH2A 4EFPA 1XG6A 1LGCA 1EVTA 4J2KA 1WBAA 3ASIA 2YXSA 3WDXA 1HLCA 2A6ZA 3FBYA 4FPOB 2AUYA 4I37A 2UWAA 3V0AA 2JDZA 1ULEA 4YW3A 1YO8A 1LOFA 1MACA 4YLZA 4BM8A 1PZZA 4FPKA 3C2UA 3INAA 4ISQA 1QDCA 4FPFA 3AH1A 2OUHA 3LTQA 1BLAA 4ZOTA 1WBCA 3AJYA 5KXDA 1CONA 1V6NA 2ZGRA 4OEFA 4D0TA 1VLNA 1N1TA 4AGGA 4GAFA 9ILBA 4IHZA 1W6QA 4XFSA 3PVEA 3WO2A 4JP0A 2M49A 1CE7B 5FREA 2EALA 1PUMB 3HR9A 3ZXKA 4ZFUB 4QBVA 1RY7A 1JT5A 2DU1A 2P3IA 4GWMA 2PELA 2ZABA 4KEJA 4IONA 1SR4A 1LCLA 3APBA 4AN6A 2CY6A 4LO8B 4I4SA 4DCKC 1CJPA 1FQ9A 4UW6A 2VUAA 1AX0A 1W3AA 1GGPB 1S0CA 3AP7A 3OYWA 3BAGA 5CA6A 3PG0A 3WV6A 3O0XA 1TWEA 2KI4A 3V0BA 3AFKA 1HKNA 1F5FA 3VEQA 2A5ZA 3ZXDA 4PC4A 4XFUA 3IM7A 1SFYA 4AGVA 5T5PA 2NP0A 2ZGLA 1OQ1A 4XBQA 1YTOA 1AJKA 2EF6A 4OEEA 5DSSB 4YW5A 3SH5A 5T5JA 4YGBA 1PZ9A 3AZVA 3VUOA 1PZ7A 5LK5A 2I1BA 3D6EA 1Q04A 3ZPYA 2D6KA 4AVVA 1FNYA 1G9BA 1JOJA 3OGFA 4I6IA 4QALA 4PBOA 4XE9A 1LOAA 4YG3A 4M3CB 2W52A 4EKXB 1URXA 1ULGA 2LALA 4XTPA 4WBCA 1WLDA 1HCEA 2FMDA 2HW9A 1L2HA 1N3OA 2A3YA 1VAMA 1GZWB 2A7AA 1SBEA 2GNDA 4IZXA 4YGEA 5IK7A 1G9CA 4LBOA 4LBNA 1TWMA 5D63A 1GSLA 4Q1PA 3FLRA 4LO1C 3BA7A 4AVSA 2X2SA 41BIA 5DUVA 4F83A 2K4AB 4IY9A 4YZ4A 3NBEA 4ZFYB 1DIWA 3MW3A 4D0ZA 3VT0A 1LTEA 3CRIA 2NVHA 1ITBA 2NMOA 4Q27A 5BVPI 3T8SA 3BA4A 1UZYA 1Z2VA 3OBTA 1IS4A 1V6OA 4GOVA 2AH2A 2ZGMA 1DQ0A 5DG1A 1BFGA 5FNWA 1ISYA 4BMEA 1W6PA 3BX1C 1MC9A 3Q7WA 3ZYRA 2I2SA 4I3NA 1GNZA 2VXTI 3CU1B 1FMZA 3V0AB 2ZMNA 4YZ1A 2AAIB 2ZACA 1TOOA 1D2SA 3OJMA 3K1XA 5BXPA 2GDFA 4YG0A 1HWNB 1MS8A 1DQGA 4TYSA 5BYNA 4OZXA 1LGNA 1OKQA 2ZZJA 4YFWA 1S1AA 4XJUA 4Q91A 1LECA 4IY8A 4BLJA 2DURA 2KH2A 1BQPA 1JY0A 1EYLA 3VSFA 1ONKB 1W6QB 3NV4A 2EIGA 3N7JA 4HANA 5F90A 1IKQA 4WZFA 1UKGA 3VKNA 3NBDA 3AK0A 4XJAA 4FVVA 4P9WA 2D3RA 3CQAA 2SBAA 4I4YA 5JOXA 2Q9XA 5GZFA 4BOWA 2WBCA 4JC1A 5AVAA 3RS6A 2GALA 4EEEB 4I4VA 2P39A 2A6XA 1V6MA 5G00A 3KQRA 3GNEA 2D24A 3O4CA 1RITA 2ZHLA 4J2SA 1WD3A 3LSEA 1M2TB 1AVUA 3PHZA 4FGFA 5DUWA 3ZXFA 3M1HA 4H9WA 2A6YA 4LO3C 5H9QA 2E53A 2ZGKA 5B2HA 3N36A 4I1EA 2PHXA 3POWA 1G9FA 3WO4A 3V0BB 1WUVA 4GA9A 2Y9WC 4QD2C 1FWVA 2ZGTA 2R16A 6I1BA 3DGTA 5F5QA 3F62B 4BLIA 2ARBA 4FPHA 4G9MA 2JKBA 4GOYA 1N1YA 5DUXA 2D20A 1DQ4A 3JUTA 2TEPA 2DVBA 4FPCA 2DV9A 2IHOA 3VKFC 5GM0A 1W6OB 4J23B 1QDOA 2PHRA 1SR4C 3V79C 5DZGA 5HPZA 2UURA 4XYXA 2DREA 1SLLA 3ZXEA 1C4RA 3ZYPA 1AX2A 4GXLA 3IM0A 3OPZA 1KDKA 1IT0A 3POKA 1WW4A 2DVAA 2DU0A 4TLPA 2AGSA 5CAZA 3WHUA 1SLIA 2UU8A 3NBCA 4ATFA 2YY1A 1GICA 3NBNA 2WT2A 1W3FA 3A4UA 4GKXA 1ISZA 1MD6A 1MS3A 1JT3A 3UDAA 2V5YA 1QMJA 4NO4A 3PVNA 2BEBA 2CL2A 1XZZA 1FMMS 2E7TA 2V73A 1LGBA 3H0OA 5GLUA 4HR6C 2IWTB 3N7LA 1MS0A 5E88A 1Q8PA 1LODA 1MS1A 4I8MA 3USUA 2D22A 2WQZC 1MVEA 3FJAA 1V6UA 1W6PB 1HQWA 4YGCA 4K21A 3FLPA 4ITCA 2B7YA 5KXEA 4SLIA 1ISVA 2ERMA 4JAWA 1SBDA 2FFUA 1DJSB 3LLPA 1TTUA 1J1TA 1LHUA 2Z49A 4KEKA 1AXYA 3O0VA 4XMIA 1N3QA 2PHFA 3IM5A 5BXRA 2ZGOA 3D5OA 1QXMA 2YZ4A 2GMEA 4LBLA 1Q1UA 3FUOA 2DWRA 1CVNA 1IKPA 2A75A 1WLWA 3CRGA 1DQ5A 1CQ9A 1IS5A 3TB0A 1WD4A 3P6JA 3IAGC 5T5OA 4GP0A 1PUUB 3QCWA 1FGAA 1QOOA 1GANA 3WDUA 1WW6A 2KKIA 2CWMA 3BRFA 5GZEA 1IHKA 4Y20B 1DHKB 4M00A 1SLCA 3A0KA 3F1RA 3P53A 3O3QA 4Y22A 3WMUA 1GBGA 1YF8B 1CESA 3N7MA 3VT1A 1UX6A 3RTJB 1LHOA 5HCFA 4LO0C 1BASA 3KM5A 5EG6C 3ILAA 3H6QA 2Z48A 1MS5A 4YZ3A 3H6RA 2GN7A 4I4XA 5DZEA 2DVDA 1N1SA 4XOGA 1LJ7A 1LEMA 2E7QA 1CPNA 2RHPA 5GLZA 2R49A 3BRDA 2R1BA 5GALA 1YI7A 4R9AA 2EXKA 4K1YA 2DS0A 3HN1A 1AXMA 2NYYA 1R8NA 1JYIA 4LO3A 1RINA 4Q1RA 3U4XA 1G9AA 2VH9A 2ESUA 2KM2A 1AVXB 3HBWA 1Q8VA 3TAYA 1II4A 2BEAA 3ZVXA 1FN0A 3Q7XA 1CPMA 3WCRA 3SH4A 4YM1A 2W08A 4DRRA 1DFQA 2JD4A 3FJEA 2R9KB 2DVFA 2AQZA 4JCKA 1JN2P 1I1BA 3AZWA 1XQNA 4LBQD 4CZSA 2WNEA 2ZMKA 1JT7A 4XTMA 3QR5A 2P23A 1JYCA 1LENA 3PUBA 4FQ4A 2UWBA 3B9CA 1ULCA 3PJQA 2F2FA 1IILA 3M3CA 3WZ1A 2A70A 2K8RA 4HL0A 3USUB 5FZYA 1Q8QA 4ZKTB 4FPYA 3QYDA 4KC3A 4C1XA 1Z78A 4UW4A 1JBCA 4Y1XA 1LOCA 3MPPG 2WSVA 5DXDA 3AP4A 3ATGA 2E51A 4P0LA 2ZQOA 3IPVA 5HCBA 3CA3A 1MVQA 2WRYA 5F8WA 1SACA 4XKIA 1NUNA 1KITA 5GLTA 2WT1A 1W6MA 2P34A 4II0A 2DVGA 1BJQA 3IM6A 3NWKA 2HZ9A 1S0JA 2ZBJA 3BADA 3JU9A 2VSAA 5L73A 1M16A 3WA1A 1AF9A 5IK8A 3AZXA 1Y7BA 4ZLBB 4A7KA 5CNAA 1HKDA 4XHXA 1LU1A 2D6OX 1FAYA 3VT2A 4YW1A 5F8YA 3M3OA 4Y22B 1BFCA 3ZC9A 3WDWA 3M3QA 2D43A 3N0KA 4TZDA 1DGLA 2YMZA 3WG1A 3DUIA 3UL2A 1R8OA 5BQUA 3WNXA 4I1BA 2WJSA 3AYCA 3O12A 3H6RB 3OY8A 1YXWA 1NZKA 3SISA 4DFSA 4Q8KA 2ARXA 2DTWA 2W39A 1MZ5A 2DUQA 2NZ9A 4JKXB 1SCSA 5T55A 4F34A 3MALA 3P6IA 4J2YA 5EYXA 1ENSA 4PF5A 1F31A 1JTCA 1Q03A 3UD8A 1MR5A 4XJ8A 4LO0A 3IN9A 3JUUA 5BXSA 1Q56A 3BAUA 4YG6A 2NM1A 4ASMB 8I1BA 3OJBA 3FJ8A 3AKGA 1V6XA 1RMLA 3FJJA 2A6VA 1FATA 2LTNA 4FP3A 1DQ2A 4YM0A 4I7IA 3BB2A 4QD2B 5JMCA 1C1FA 3MEPA 4XJZA 4Q9GA 3UJQA 1FNZA 1IOBA 4MYEA 1IJTA 2GNTA 4DS0A 4A7YA 5JOYA 1BZWA 4ZFWB 3SNMA 1VCLA 4ENDA 4DENA 3CA4A 3WUDA 2ZMLA 4Z8BA 2YV8A 2E6VA 5DUUA 2NN8A 3PMEA 1WW5A 1W6NA 4K1ZA 4I2SA 1ISWA 2P37A 3OYWB 1LOGA 3B01A 4Y1ZA 4P14A 3FJHA 4USOA 3GALA 1V6VA 3LCPA 4YZ2A 3RMXA 1V6IA 1IS6A 1ABRB 1V6WA 3H6SE 1S0BA 3WMVA 2MC2A 3FJFA 3WINC 1QNYA 1WBFA 3N3HA 1N4KA 4Y1UA 2AREA 4P0KA 2P3JA 1SLTA 1WW7A 2LIQA 4U2AA 3O49A 3WDVA 3B69A 1I1EA 5T5LA 2DRZA 2R0FA 1KDMA 5FRAA 2DUPA 4OEGA 5FNXA 2ZA9A 1QQKA 1C57A 3O4OA 2ERFA 1P63A 1NLSA 1BA7A 5JDBA 1GZCA 3FJCA 1YBIA 3AXDA 4XZPA 5FZUA 3O5WB 3LSDA 2MIBA 3ZSMA 1W0OA 3I29B 1KRIA 1W6MB 3A22A 1LOEA 2D3PA 5BOWA 4QKSA 4G9NA 2ZHNA 2ZGPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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