1FO5A

Solution structure of reduced mj0307
Total Genus 16
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
16
sequence length
85
structure length
85
Chain Sequence
MSKVKIELFTSPMCPHCPAAKRVVEEVANEMPDAVEVEYINVMENPQKAMEYGIMAVPTIVINGDVEFIGAPTKEALVEAIKKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN
publication title Solution nuclear magnetic resonance structure of a protein disulfide oxidoreductase from Methanococcus jannaschii.
pubmed doi rcsb
source organism Methanocaldococcus jannaschii
total genus 16
structure length 85
sequence length 85
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-08-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1fo5A00
4Z7XA 1HNCA 2Z9SA 3DIEA 2IPAA 4J56E 5GZZB 4P3YB 5COHA 4IGJA 4GQCA 3QFBC 4ZB6A 3TUEA 3ED3A 2VCZA 3FK8A 3L78A 1USBA 4MLYA 3FZAA 4IELA 3HDCA 2OKAA 1WIKA 4IP1A 1JZOA 3EYTA 3CXGA 4GF0A 1K0CA 2YCDA 2MZCA 2YPMA 3MAKA 2RLIA 3I69A 3H1NA 4CDOA 3LXTA 3F6FA 5A5KA 1WOUA 4XS1A 5INYA 1PL2A 1ZOFA 1VF2A 4OMVA 4ML6A 4DSRA 3E3EA 3ZFLA 2HXKA 2XHFA 2H8LA 3TJJA 6GSWA 4ZB8A 4L5OA 1E2YA 4MZCA 4AF2A 2NVLA 4ZB9A 2DJ0A 2HLSA 2L4QA 4J57E 4JR6A 1PMTA 4KDUA 4OWYA 2N5BA 3KZQA 1R7HA 4OFTA 2AUVA 4MJCA 4L8EA 2YN1A 3F3QA 3DKSA 5AIXA 7GSSA 2IMKA 1T1VA 1YF0A 5IMZA 1BYEA 2P31A 1DE2A 4HQZA 2OBIA 1XOAA 2MMZA 1FVKA 5ECNB 1Z5YE 1Q4JA 1FOVA 1J08A 3FEUA 4K0GA 1XWAA 4WR5A 3BBYA 3IPZA 3VK9A 2C3NA 1SYRA 4IQAA 3W6GA 4KNDA 1A0FA 5CO3A 1X9SB 2JACA 4E8EA 4GQFA 2OE3A 3LJRA 4N0ZA 2NDOA 4IHUA 4MH3A 5B6NA 3M9KA 1TP9A 1YQ1A 4DEJA 3FRCA 1EOGA 2J23A 2DMLA 2O7KA 2C0FA 2GQLA 2YV9A 3H93A 1QGVA 2O89A 4ZL9A 1XVWA 1ML6A 2JSYA 4WF5A 1XW5A 16GSA 1TRWA 2B5YA 1FHEA 5C00A 2GDRA 3KD0A 3F6DA 4NXIA 1K0AA 1RQMA 5HFKA 1X0RA 2H0HA 1V98A 4MP4A 1S3DA 2GGTA 1EWXA 4TVEA 4EKZA 2FUG2 4JZQA 3NOFA 3LXZA 1OE7A 1UVZA 3D6IA 3EU4A 3GX0A 1QK8A 4HUAA 2CAQA 3UL3A 4PNFA 3KEBA 3HVVA 1AW9A 2HI7A 3F9UA 3QPMA 2YP6A 3D5JA 2IIYA 1XFLA 3IBHA 1GRXA 1KEBA 3WT2A 1TRUA 2LQQA 4WBRD 1Z3EA 3KP9A 5E59A 2H76A 14GSA 1VRSD 2FWFA 1Z6MA 3W8JA 3WT1A 4ACSA 2LSTA 1AQXA 1EEJA 2VL2C 1FVJA 4L0WA 4YQMA 2QC7A 2B7JA 2IJYA 4ZXGA 1ZMAA 2K6VA 3VWVA 5JCUA 1NW2A 5B8AA 3EWLA 4I97A 4HOJA 1T00A 1MDKA 5DCHA 1PRXA 2LJAA 1M7TA 1TI3A 3APSA 4KSMA 1T4YA 2GT5A 3GFKA 5CRDA 1GSUA 5ENUA 5DJLA 5CAXA 2H75A 1X5CA 3KH7A 4JE1A 4WR4A 2YOIA 4CW9A 5ECIB 2I9HA 4EVMA 4LL4B 1GTBA 2K8SA 4HZ2A 4LLRA 5GAND 1QMVA 1PGTA 9GSSA 1ERUA 3TKPA 1O73A 3L0HA 3TRXA 2YV7A 2VLUA 3F4RA 1SENA 4MABA 2C0DA 2H70A 4NMUA 1WRYA 1RW1A 4PUAA 2CZ2A 2YWNA 3HXSA 3E9JB 2YZHA 3RAZA 2PUKC 1K0NA 4V2NA 2VCXA 5A4UA 4ZL7A 2M80A 2LTKA 3MWHA 1EV4A 2PU9C 3D4MA 4GCIA 4L0UA 4YAVA 4XRDA 4O92A 3EMPA 1V2AA 4IS0A 2V1MA 4IVFA 1ZCPA 3KMNA 1EGOA 3CBUA 1JZRA 5IPHA 1M9AA 2MBSA 20GSA 1XOBA 4O32A 1VF3A 4I5QA 5AIVA 4EL1A 2AYTA 5KN0A 2VO4A 4I6XA 2HYXA 2RM5A 5G1LA 3O6TA 3ME8A 2KOKA 1QUWA 2E2GA 4MCUA 2CVDA 3HJPA 2DJ1A 1THXA 1F9MA 3G7JA 3IK9A 2C1YA 3Q74A 3WGXA 1K3YA 4PGTA 4PNGA 2H6XA 1GNEA 12GSA 2FLSA 5D9XA 3C7MA 3I6AA 3IRAA 2VUPA 1F37A 1GH2A 4K1FA 2VCQA 5E4WA 4NAXA 3GKXA 3G7YA 3PR8A 4POKA 2KUCA 4DSSA 3M0FA 4ID0A 1M2AA 3EVIA 1PL1A 4ISDA 3QMXA 5G30A 1SYXA 2L4CA 1X9WB 2WULA 1B48A 3L4NA 2AAWA 3BOAA 2X64A 4EDYA 3FY7A 1QQ2A 3EURA 1ERVA 4MF6A 1YJ6A 3TKQA 1TK8B 1TK0B 4K7NA 1FW1A 5EL8A 2YJ7A 4DSSB 4IQ1A 5IM9A 3C1SA 3LORA 4PURA 2V2GA 3ISOA 2YZUA 3ZFBA 2VL2A 5F8BA 3K8NA 2VAFA 3HVXA 2V6OA 5AGYA 6GSYA 3GV1A 5KEJA 5DBQA 1BEDA 1W89A 4KB3A 1SU9A 1SL1B 3G7IA 18GSA 1SKRB 1MD3A 2DIYA 5JWRB 3HVSA 3KCMA 4F0BA 2GVPA 1U3IA 3TRPA 2KP1A 2L5LA 2MMAA 1JZWA 5ECSA 2GSSA 4MJAA 4ULXA 3BCIA 3LYPA 3VPTA 1YKCA 3TKSC 3TJBA 1OE8A 2JZRA 3PGTA 1DBYA 4POLA 4MPGA 1TRSA 2K8VA 4HZ4A 4BWQA 4D73A 1K0DA 3F0IA 4FH8A 2WFCA 5DAKA 4N0VA 13GSA 5D9TA 1FAAA 4TR3A 4YH2A 5J41A 1JZDA 2JU5A 3C73A 2VD0A 1HQOA 2DLXA 2HZFA 3DMLA 2H19A 3ZMKA 2L6CA 5ID2A 1H4OA 4D73B 2DJJA 3IAS2 3GH9A 1BJXA 4MZWA 3TOUA 2WS2A 5DAKB 3GN3A 4EUYA 1F6MC 4RI7A 5DALA 1K0BA 3IV4A 1B9YC 3I43A 2VD1A 2MMNA 3UEMA 3GL3A 5IMCA 2FWEA 2VM1A 4BVXA 2TRCP 3LGCA 4JU5A 3LEFA 1NHOA 5KN2A 2L57A 5FT3A 1M2BA 2GS3A 4KX4A 4POMA 3JCML 1E6BA 3US3A 1TOFA 2HFDA 2OE1A 4K9ZA 2WZ9A 1F3BA 4V1Ap 4G9HA 5DALB 3A2XA 1XWCA 1X5DA 4H86A 2GLRA 5IO2A 2XBQA 2DSAA 1G0TA 3IE3A 5H5QA 1ZZYA 1VGLA 4TOPA 3LYKA 4ZILA 3BCKA 1C72A 2P0GA 4EF0A 2ZCTA 2E2MA 1WMJA 1ZGNA 3GSTA 1SJIA 3CRTA 3IK7A 5J3RA 1TW9A 4ILFA 2HT9A 2GQKA 3ZTLA 5GSSA 1T3BA 3VFIA 4ZBBA 5F06A 4KDYA 2LKUA 1V9WA 1UA5A 1LU4A 2H74A 2R4VA 1K3LA 4XS4A 4TXOA 1I5GA 2FD3A 2VIMA 1Q98A 4KCAA 1BAYA 3GURA 5CP1A 5F05A 1Z7RA 1N2AA 2H71A 1TKDB 5A4VA 2FWHA 4HU9A 2XPEA 3ZYWA 2V6KA 4PQHA 1PKWA 3ZRDA 4KUNA 5DVBA 1XWKA 3GX8A 2IL3A 3A2WA 4GLTA 5ABRA 2CZ3A 1Y6EA 1CQGA 3EINA 5IMVA 3TRQA 3ERGA 3GHAA 1GUMA 4XS4B 3HKRA 4MZBA 3CYNA 2F8AA 2ON7A 2AB6A 3WD6A 4TXOB 3KMOA 4KDXA 4IN0A 1JHBA 3Q6OA 4HI7A 2V32A 1SJ6A 2DBCA 1GUHA 1JLVA 1G7OA 2GT6A 4MH2A 4JRRA 2J9HA 3TKSA 1G6YA 4MF5A 3KTBA 1XCCA 1ACVA 1G6WA 1M99A 4IJIA 4XRAA 3KP8A 1ST9A 1KNGA 2X99A 5DDLA 1ILOA 1TU8A 4K7OA 1B9XC 2A2RA 1H75A 4Q5QA 1RK4A 2A4VA 4HS1A 5D73A 5G31A 1K3OA 2EIQA 5IQYA 4V2LA 1QXHA 4PXOA 2WDUA 5HFGA 1AAZA 4IJ3A 1O8WA 1AIUA 2CVBA 1S3CA 4NPBA 1O6JA 2YNXA 4JR4A 1GP1A 1X5EA 4ECCA 2K9FA 2KHPA 2FCHA 3GTUA 4TR0A 2R6KA 3E0UA 2LS5A 5CNWA 5EPFA 2R2JA 2LQOA 4DVCA 1M9BA 5B7CA 4XHMA 1SK0A 1LJRA 2HSYA 3UARA 5JCWA 5D9WA 4IP6A 2GZPA 2C80A 3FW2A 3UAPA 1T4ZA 1EP7A 4OD7A 3UBKA 5F0GA 2VLVA 4F2IA 3KTLA 2VLTA 5EY6A 1DE1A 5AN1A 2C3TA 1GL8A 3ZZXA 3TB2A 5FHIA 5HR0A 1WJKA 4X0XA 1JFUA 3SBCA 3IA1A 5J5NA 2CVKA 3VI7A 3GTUB 4EC0A 1B8XA 3F4SA 1GLQA 3APQA 2N5AA 2PBJA 3BD2A 3KM6A 2GSRA 1V57A 2C0GA 2N5FA 2QGVA 2M46A 4MJBA 1DSBA 3GKKA 5JCGA 1GTUA 1TJDA 2PMTA 3UBLA 1K0OA 2B3SA 4AJ8A 4IW9A 1ZYQB 1WWJA 2H6ZA 6GSTA 2YANA 4J2FA 5IIZA 1GSQA 1GSYA 5C04A 2XC2A 1AQVA 3D0ZA 3DWVA 1ERTA 4N11A 1U88A 1DUGA 1XVQA 1PQNA 1MDJA 2X8GA 1G7EA 4ECBA 4FYCA 2DMMA 2C4JA 2I3YA 3QAVA 4V1Ag 5GSTA 3GKMA 3KH9A 2FY6A 2H1AA 4TR4A 2ZUPA 3F3RA 4F03A 2G0FA 1GSDA 2VCTA 1YY7A 3HJOA 2OBKA 5EVOA 4IBPA 3RPPA 3FZ9A 2EIRA 2RUEA 5CRGA 1O8XA 1SKWB 3IC4A 4I2TA 1LBKA 2I1UA 4Q5NA 3CSIA 2TRXA 2H1DA 1A2LA 3DRNA 3TDGA 3MNGA 1XWBA 5D9VA 1OC9A 1OAZA 1TK5B 4N30A 4KAEA 4MF7A 3A3TA 3GRXA 3EE2A 4WETA 5D93A 1URMA 2RIIA 5HR3A 4F9ZA 4QL7A 6GSUA 2JSZA 1S3AA 2FNOA 2VM2A 1ZL9A 3GH6A 2X8HA 1MTCA 3TOTA 3R2QA 5H5RA 3MDKA 2GQMA 4GSNA 2O85A 4K0NA 11GSA 3GL5A 2H1GA 2AJQB 4ZBDA 3CMIA 2H0IA 4OFNA 2F8FA 1NM3A 1W4VA 4OO5A 1THOA 3DGQA 1HYUA 4AJ7A 4OO4A 5JWQB 5FWGA 4XIHA 4HU7A 2D2ZA 4GSSA 1QFNA 1SK1A 4LA1A 3H79A 3UOMA 3ZL5A 2IMDA 5D96A 1XPVA 4HJ2A 3G9BA 1OYJA 1A2JA 4TR1A 3TJGA 6GSVA 1EP8A 2MYGA 5CRWA 2B1KA 4FO5A 4HJMA 2B6MA 5J9CA 3NZNA 1SKSB 2CX3A 4TKYA 2CT6A 4I2UA 1TI1A 4RQRA 4MMMA 4NHZA 3RHCA 3LSZA 4KE3A 2LRNA 4F0CA 1YZXA 4DSQA 2RUFA 4F82A 4OCFA 1OKTA 1YEXA 4AGSA 1OC3A 2P5RA 2PVQA 2BMXA 3HZ8A 4K6XA 4ZBAA 5HR1A 5LCZA 1J9BA 4EO3A 5B6MA 4GRFA 4X1UA 4MA9A 3V1WA 1PN9A 4RUVA 1HNBA 1B4QA 4KSOA 4XCSA 1AXDA 2O8VB 3BJ5A 2B5XA 3IXRA 1Z6NA 2GTUA 2MBTA 3L9UA 3LFLA 4FYBA 5G1KA 3FR6A 3C8EA 4BVYA 4O5RA 4WEYA 2LEGA 3DVWA 2OADA 3UJ1A 3S9FA 4Q5FA 3HCZA 3I9V2 3D4TA 1ON4A 4RQXA 3C71A 3LG6A 2IMIA 3VWWA 4L5LA 1HD2A 4KW6A 4YQVA 4K2DA 1A23A 2GSQA 2H0GA 2PPTA 3D22A 3RBTA 3J7Yk 2MMOA 1GTAA 2DIZA 3VI5A 2RM6A 3L9VA 5ID2B 3ZIVA 2GSTA 3UIWA 1BG5A 1VF4A 2IWTA 4QQ7A 1IYIA 1M2DA 1GWCA 3QAWA 3VWUA 2DJ2A 3HYPA 1T8EB 2HZEA 2EC4A 2ON5A 5AISA 2PERA 5ECOB 1U6TA 3Q18A 3A2VA 5DCGA 2F51A 3U5RE 5G5FA 4I8BA 1XXUA 1GTIA 3ZITA 1IYHA 4G2EA 1EEMA 2L59A 1TRVA 2ALBA 1XIYA 5LD0A 1U87A 1SD9A 4O7HA 3TGZA 4TN8A 5KN3A 5IOWA 4K7IA 3M1GA 3PH9A 1GULA 4YQUA 1I9DA 2BTOT 2FGXA 5J4UA 2VCVA 1OVNA 2PVOC 2HZEB 2PWJA 2H73A 1SJZA 1GLPA 3C1RA 4TRXA 2K18A 4ECJA 2JZSA 2R5GA 1MD4A 1FG4A 4XTSA 2PN8A 1AQWA 2JL4A 3CSHA 2F9SA 1F3AA 4G10A 3F63A 5ECLB 2WRTA 4YAPA 2XPDA 1EV9A 4MJEA 3WGEA 4MDCA 3TCOA 1Z7PA 3ERWA 2R37A 2YWOA 3QFAC 5LNKe 3UMAA 3ZVJD 3F4TA 1VF1A 2LNSA 2AV4A 2F3MA 4XS6A 3RPNA 2H01A 1JLWA 5GAPD 1AUCA 3VWXA 1A8YA 3HZ4A 3D21A 19GSA 3P7XA 2LJKA 2NTOA 2OACA 2REMA 3L9SA 5G2ZA 4LL1B 3LQ7A 1OKDA 5HQPA 1V58A 2O87A 3IDVA 1O81A 1TDIA 3WGDA 2TIRA 5ELAA 3TKRA 5JWOB 5H5SA 2HE3A 3CTFA 4OFMA 4ZL8A 1XWGA 1U3AA 2L5OA 3WYWA 3IAM2 4QL9A 1SL0B 4AJ6A 2H72A 1TXXA 3J7Yb 3QAGA 3KIJA 4WXTA 4HDEA 2CV4A 3QOUA 2E0QA 3NIVA 2FHEA 3HHVA 1N8JA 3QDNA 3CRUA 3W8SA 1XW9A 8GSSA 2QKEA 3QCPA 1R26A 2LNTA 2C3QA 3P8WA 2KLXA 2VL3A 4N10A 4G19A 4GSTA 2X8CA 4TXVA 4HEA2 2WB9A 4IKHA 2XBIA 3EC3A 1WPIA 1TTZA 4LMWA 3UVTA 3Q19A 3VLNA 3UVHA 2IFQA 6GSXA 2A2SA 5DQYA 2EIOA 3HA9A 3ZREA 5J9BA 3GMFA 2FWGA 1PX6A 2FA8A 2WCIA 1ERWA 4BL7A 1PX7A 2V41A 4PQ1A 1NHYA 3RDWA 5DJMA 1SL2B 2HSHA 4JEDA 2L6DA 4KH7A 1FB6A 3FR3A 1SD8A 3VURA 4WF4A 1GSFA 3OR5A 4ECIA 1X9MB 2C0EA 5B8BA 1O7UA 3RHBA 3GNJA 2P5QA 3QD9A 2H66A 3M9JA 4PX1A 5ECQB 4BA7A 3TJFA 2G2QA 2JZTA 1SK2A 3ZIJA 2IFQB 2DJKA 22GSA 3P2AA 2CQ9A 3AY8A 4HQSA 4BWSA 3M8NA 1T7PB 5KN1A 1WP0A 3IR4A 4NWYA 2HRNA 4JBBA 2CA8A 2E7PA 4ZIJA 2OA7A 3GIXA 4EE0A 2WJUA 1KTEA 1XZOA 1F2EA 3FYGA 1YF1A 2YWMA 4TW5A 3LWAA 1A0RP 17GSA 2H6YA 2IMEA 3KJYA 1YDKA 3PINA 2R3XA 1OC8A 2I4AA 1MDIA 3FR9A 2QSIA 1A8LA 1GUKA 3IOSA 4GWRA 4FIWA 6GSSA 3DXBA 3APOA 1KBNA 2WGRA 4EDZA 3CTGA 1XBSA 5IMFA 1BX9A 5IOXA 1GSEA 3CSJA 4KCEA 5DQSA 4V2MA 1WE0A 4POBA 5CREA 3VPQA 2PGTA 1FB0A 2GZYA 2HNLA 1NSWA 3DVXA 5HR2A 2IN3A 4X43A 1XW6A 3GSSA 2H1BA 4Q5RA 3FKFA 3A5WA 1BQ7A 2YWIA 5ECRB 1PSQA 4BPYA 4RI6A 5D8IA 5ECHB 5G5EA 2C8UA 3IHQA 4PQIA 1GNWA 1K0MA 1UN2A 3FZ4A 2IMFA 5CYYA 4NHWA 1YKAA 1TU7A 1YEPA 2GZZA 3P90A 5IMDA 3ME7A 2LUSA 3DEXA 2LJRA 1HNAA 2VOCA 5HFIA 2DC5A 2JADA 4MPFA 1OC9B 2DJ3A 1GSSA 3N9JA 3GKNA 1J0FA 2ZNMA 1R5PA 4CHSA 2FA4A 2YJHA 1EOHA 3HY2A 1M0UA 4ML1A 3SWLA 1A24A 2LRTA 3H4KA 4FYUA 1Y25A 3TKSE 1EGRA 2B7KA 3FHKA 1PKZA 3HJMA 4OCEA 3ZLPA 4KA0A 5IMAA 2CX4A 4LMVA 2B5EA 3TJKA 3F8UA 3M3MA 4PUFC 3ZVJA 4WBJA 1FO5A 5CRHA 4WKWA 3HD5A 2H30A 3KGKA 2BJXA 3FZ5A 4KGIA 1PA3A 4GTUA 3ZMLA 2KP2A 3DD3A 1PD21 4E8HA 4K8MA 2OE0A 2NBSA 3KXOA 3EMXA 3EU3A 2M72A 2ES7A 2LV3A 2B1LA 1AC1A 2LRCA 10GSA 2NPBA 2HRFA 3GYKA 5F07A 1A2MA 5ECPB 4TR1B 2VL9A 5A4WA 5IPGA 5L71A 2I81A 2VCWA 3ERFA 3N5OA 1ABAA 2OJLA 3U6VA 3GA4A 1R5AA 4GXZA 3O3TA 1EZKA 1R4WA 4MK3A 3O76A 1MEKA 4NV2A 5ELGA 4NV5A 3MSZA 2CAIA 3DYRA 1ZYEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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