1G7EA

Nmr structure of n-domain of erp29 protein
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
LHTKGALPLDTVTFYKVIPKSKFVLVKFDTQYPYGEKQDEFKRLAENSASSDDLLVAEVGISDYGDKLNMELSEKYKLDKESYPVFYLFRDGDFENPVPYSGAVKVGAIQRWLKGQGVYLGM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords ENDOPLASMIC RETICULUM PROTEIN ERP29
publication title Thioredoxin fold as homodimerization module in the putative chaperone ERp29: NMR structures of the domains and experimental model of the 51 kDa dimer.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 38
structure length 122
sequence length 122
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-11-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g7eA00
2C3TA 3PH9A 2B6MA 5FWGA 3CRTA 2C80A 2IN3A 3H1NA 2VOCA 2MMAA 1YEXA 1TK0B 2REMA 2G0FA 4AJ6A 2CZ2A 2LRCA 3MDKA 2IMDA 2L59A 4JR4A 4F9ZA 2KP2A 2DJKA 3L9SA 3RBTA 1ZYEA 1E2YA 3ERFA 4TN8A 2H0GA 1GLPA 5ECKB 4O32A 2LEGA 3IDVA 3MWHA 2X8CA 1Q4JA 2L4QA 14GSA 3H93A 3DMLA 1TRVA 4EL1A 1S3DA 2PU9C 2VLVA 3GTUB 2LRTA 3CBUA 3IV4A 4Q5FA 4LL4B 4NMUA 4DSQA 1TOFA 4MZBA 2CAQA 4TR3A 2HZEB 4KDXA 1SL2B 1GSQA 3FRCA 2FA4A 2CQ9A 5IMDA 1USBA 3GN3A 3GYKA 4O5RA 4Q5QA 3O76A 5DBQA 2AUVA 4BWQA 2CV4A 1OAZA 4MPFA 4XS1A 4AJ8A 1F6MC 1OC3A 3KP9A 1ERTA 1GULA 1NHOA 1W89A 1ACVA 1GSDA 1R5AA 2JADA 3CYNA 4TRXA 1XBSA 1PRXA 1AQXA 3F63A 4BVXA 2PN8A 6GSWA 5DCHA 3EINA 1G6WA 4GLTA 3IPZA 4MABA 5HFIA 1FVJA 1M99A 3QFBC 2P0GA 1KBNA 3E3EA 3HVVA 3WYWA 3F8UA 2LQOA 5CRWA 4KGIA 4I8BA 1BEDA 2FD3A 2C0DA 2B5XA 5AGYA 3RHBA 5J3RA 4RQXA 1WPIA 4RQRA 1GSSA 3G7IA 1O8XA 2B5EA 1WMJA 2YJHA 1Z6MA 3LXZA 4ISDA 4YAPA 1O85A 1E6BA 1JZDA 2GSSA 3CSIA 3LWAA 5E59A 1PA3A 3J7Yk 3D6IA 3KM6A 1A0FA 4FO5A 3CRUA 3F3QA 3GTUA 2NTOA 3KMOA 5ID2A 1NHYA 2VAFA 5ECHB 4KUNA 4BL7A 5INYA 3K8NA 1TP9A 1AQVA 5IOWA 1K0CA 4WF4A 4PQIA 3TRQA 3WT1A 1XVWA 5DAKB 4ULXA 2VL2C 1T7PB 2O85A 2NVLA 2AJQB 1X9SB 3FR3A 2X99A 2G2QA 5HFGA 1MEKA 3FY7A 2L6DA 1FAAA 5B8BA 2LNTA 4OFMA 5CREA 2DBCA 3CXGA 5E4WA 4EVMA 1K0OA 3DIEA 1K0BA 2I81A 1H4OA 5LNKe 1U6TA 1U3IA 3IE3A 3TJBA 4ZL8A 1ZZYA 4IQAA 3FR6A 2EC4A 3KH7A 5ABRA 4WR5A 1ZGNA 3VPTA 3W8JA 4MP4A 5L71A 4F0BA 3WGXA 2ZNMA 1THOA 5GSSA 2PWJA 5D93A 2XBQA 4NXIA 2FA8A 1PL1A 2EIOA 18GSA 2RUFA 2OBKA 5J9CA 1M7TA 2VCVA 2Z9SA 1NSWA 3APOA 5IMAA 1GTBA 1XWCA 4MZWA 5KN3A 4KW6A 4K8MA 4K7NA 4LL1B 1TI3A 3TKRA 3GIXA 5HR0A 1KTEA 3GHAA 5G5FA 1VF2A 4IBPA 4POKA 1DSBA 4MMMA 4TR1A 5B6MA 3FK8A 3D4TA 3NOFA 4PQ1A 2H19A 4FH8A 2KP1A 1Z3EA 4HEA2 2VUPA 3DVWA 5AISA 3LEFA 3LG6A 2E0QA 1K0NA 3RPPA 11GSA 2IMEA 3I69A 5DDLA 1X5DA 3DRNA 1Y6EA 1X5CA 4MJCA 3EURA 3O6TA 2YN1A 1WE0A 3D5JA 2YCDA 4HU9A 2VCZA 2C0EA 3WGDA 5D9WA 1O7UA 6GSYA 2H74A 2AHEA 2KUCA 1EP7A 2TRCP 1DE2A 3PGTA 1I9DA 1SD9A 3GX0A 2X8HA 3ZYWA 4K0NA 5A5KA 1A8LA 4F03A 4K7OA 2VL3A 2YZHA 2H0IA 2H6YA 4GCIA 4TW5A 3HY2A 4N0VA 1MD4A 4ML6A 2M80A 2A4VA 4ZB8A 2HYXA 1MDKA 4OMVA 2LSTA 3Q74A 2WRTA 1QMVA 3TKPA 2L5LA 1J0FA 2YNXA 1XW5A 4PXOA 5J4UA 2BJXA 6GSUA 3ZMKA 3OR5A 4N10A 3FHKA 2QC7A 4EDZA 1TU7A 4V1Ag 4IJ3A 1ZMAA 3M0FA 1SJZA 5ECIB 5AIXA 4YQMA 4TXOB 3HKRA 1PN9A 4L0UA 3WT2A 2HZFA 1N2AA 2YJ7A 3QFAC 2N5AA 1AQWA 3IRAA 4KSMA 1FOVA 2GZZA 4GSSA 2YPMA 5D9XA 4TOPA 4GWRA 4TR4A 3GRXA 4ECBA 4JRRA 2M46A 1JFUA 2IFQA 4WETA 2A2RA 5B6NA 2LJKA 1K3YA 4BPYA 1ERVA 1JHBA 5LD0A 2XHFA 1M9BA 3IK9A 4PQHA 4GTUA 1XZOA 4IP6A 1IYHA 3LYPA 2FWEA 1UC7A 5H5SA 3ERGA 1OKDA 4PUAA 2WFCA 4XRDA 3KH9A 2H76A 4X43A 3AY8A 1ERUA 1FVKA 3GV1A 2FCHA 1KEBA 4ECJA 3IK7A 3L78A 19GSA 1GNEA 4L5LA 3GH6A 1C72A 1OKTA 2I3YA 3M9JA 1YY7A 3EMXA 1Y25A 4RI6A 3P90A 1G7OA 1Z5YE 1XWBA 4KSOA 3GKKA 4V1Ap 1F3BA 2O89A 3F4SA 1XVQA 4JBBA 4K0GA 2HI7A 2TIRA 3FW2A 5JCGA 4GF0A 2GT6A 2K9FA 1GTAA 2GLRA 2MMOA 2LTKA 1YKAA 4F2IA 4TVEA 3HHVA 1QUWA 4BWSA 1QXHA 1IYIA 5G1LA 1EOHA 4TKYA 1X5EA 3E0UA 1BYEA 3VWVA 4HQZA 4KDYA 2WCIA 2MZCA 2WJUA 3LJRA 4JE1A 1FB0A 4MPGA 4G19A 1SKWB 3GL5A 2V1MA 20GSA 4WXTA 2ZCTA 4POMA 5IM9A 3QDNA 4IHUA 4GSTA 1GTUA 3M8NA 3RHCA 4ZB6A 4O7HA 3C7MA 4FYBA 1ZL9A 4WKWA 1JZRA 4GQCA 1OC8A 4BVYA 1YJ6A 1PX7A 4HQSA 2I4AA 1Q98A 3TDGA 2C4JA 2VCQA 4JU5A 1AW9A 3TUEA 1GTIA 4I5QA 4K7IA 3A5WA 4OO4A 3BBYA 1YZXA 1PMTA 1V2AA 2GTUA 3ZMLA 4WBJA 2OADA 1EEJA 3PINA 2D2ZA 5C04A 1GNWA 5ID2B 2YV7A 2GVPA 4N11A 5ECMB 3UBKA 2KHPA 2VCXA 2LJAA 3F6DA 1K3LA 1F2EA 2MBTA 2M72A 1TRUA 1M2AA 2HLSA 2H73A 4POLA 4YAVA 6GSTA 5FT3A 2C3QA 2QKEA 3TCOA 3D4MA 4RI7A 3FZAA 3ZREA 2EIRA 1EOGA 5CRHA 2DC5A 4DSRA 3SBCA 4FYUA 1NM3A 3HXSA 2PPTA 12GSA 1YF0A 2NBSA 2RLIA 4Q5RA 2FY6A 5GSTA 3H4KA 3HJMA 1AAZA 2FLSA 4Q5NA 2YWIA 3EC3A 1MDIA 2AV4A 3F0IA 1GUMA 4J56E 5D9VA 1GSUA 3IHQA 5IMCA 3LXTA 5IMZA 3H8QA 17GSA 3I43A 2VM1A 3GSSA 4E8EA 2WS2A 3GUSA 2K8VA 5ELGA 3EVIA 3VI5A 3EMPA 3KTLA 3J7Yb 2V32A 3V1WA 2H0HA 2XPDA 2JACA 5DALB 4PURA 4HOJA 1FO5A 4IQ1A 3QPMA 1HNAA 2OE0A 2GQLA 4IVFA 3RPNA 4HU7A 4NHZA 4ZL7A 5A4VA 3ED3A 1S3AA 4I6XA 5ECSA 1RW1A 5D9TA 3WGEA 1XWKA 2FGXA 2OBIA 3H79A 4LMVA 2P5QA 1O8WA 2L6CA 2MYGA 3TB2A 2N5FA 3O3TA 2WDUA 3U5RE 1TU8A 4G2EA 4GRFA 2TRXA 4MJEA 5H5QA 4ZBDA 4MLYA 3LQ7A 2JL4A 3KCMA 3ZL5A 3KP8A 5IO0A 1J08A 1TTZA 5IMFA 3EYTA 4F0CA 1AIUA 5CP1A 2J23A 4NPBA 4TR1B 3ZVJA 1T4ZA 2YWMA 4IS0A 1THXA 1LBKA 1R4WA 1X9WB 4D73A 3CTFA 1OE7A 3KEBA 1SKSB 2XC2A 2LNSA 5FHIA 2K8SA 1R5PA 3VWXA 1A24A 2VM2A 3ZIVA 4TR0A 1G7EA 4DVCA 1SU9A 2IIYA 4ZILA 2B3SA 1W4VA 2CT6A 3C1SA 4X1UA 2LRNA 5DALA 2CVDA 2OA7A 1JZOA 1TRWA 1XOAA 2R2JA 2XBIA 3HDCA 4CHSA 4ID0A 5EL8A 3TOTA 1CQGA 3DD3A 2FWGA 3IAM2 5IPHA 5EY6A 2QGVA 1QQ2A 3KXOA 4G9HA 5HR3A 5G5EA 1JZWA 2VD1A 1PGTA 22GSA 3ME7A 4HZ2A 4MF5A 2H66A 3U6VA 2F3MA 4QL7A 1F3AA 1SK0A 3IAS2 3I6AA 1VF1A 3D21A 2CAIA 2RIIA 2H8LA 4V2MA 3C71A 3C73A 5F06A 4I2UA 3FZ5A 3M3MA 2GT5A 2HSHA 4H86A 2QSIA 2P5RA 1K0AA 1I5GA 4MA9A 5CO3A 1O73A 3KD0A 4YQUA 3VPQA 3FZ4A 3C1RA 1V98A 2DJ0A 1M2BA 2VIMA 4WBRD 2H1GA 1BJXA 3WD6A 3TGZA 3DEXA 1VGLA 2AYTA 4DSSA 4XIHA 1GL8A 1O81A 2JZSA 3GKXA 2IFQB 2YWNA 3G7JA 5HR2A 3ISOA 5CRDA 2IJYA 3M1GA 4OWYA 3US3A 1HNBA 4DEJA 1XWAA 1M9AA 1XFLA 5IQYA 3SWLA 1PX6A 5A4UA 2CX4A 1ILOA 4E8HA 1XOBA 3GKNA 3A2VA 2H30A 1SD8A 3ERWA 3TKSE 1SYXA 1DE1A 4ZBBA 1QGVA 1EWXA 4N30A 4XHMA 1SYRA 5IOXA 4MK3A 2BTOT 2AAWA 2H70A 1WRYA 4OO5A 3LYKA 4V2LA 5F8BA 4PNFA 2CX3A 1TRSA 2CVBA 1A8YA 3IOSA 5IPGA 1FB6A 2L5OA 4PX1A 3LSZA 5G31A 4BA7A 2RM5A 1B8XA 3UARA 1N8JA 1SKRB 3UAPA 3GX8A 4EUYA 4NWYA 5D8IA 5F0GA 4JEDA 1V40A 5IO2A 1YQ1A 3IXRA 2LJRA 1B4PA 3NZNA 5GAPD 3TRPA 1PL2A 2GZPA 1SK2A 3DKSA 1GRXA 3NIVA 1TI1A 3DVXA 4XTSA 2R37A 5ELAA 3DXBA 5KN2A 3LFLA 2KLXA 3P2AA 1BAYA 5KN1A 1B4QA 2O87A 5AIVA 4ZBAA 2I1UA 5ECRB 3ZRDA 1GH2A 1EGOA 5G30A 3BJ5A 1S3CA 3TJKA 4ILFA 5G2ZA 2E2MA 1SL1B 1YDKA 2H1AA 4HJMA 3I9V2 2AB6A 4GXZA 3G9BA 1ABAA 4X0XA 3W6GA 2MMZA 1V9WA 3VLNA 2KOKA 1ST9A 1BQ7A 1SENA 4HDEA 3HA9A 4HJ2A 3LGCA 1A0RP 2VLUA 2OE3A 2LS5A 3F4TA 2IMFA 3C8EA 2LKUA 1Z7PA 4NV2A 4XS4B 3QAGA 3IR4A 1G0TA 1OC9A 4O92A 1UN2A 2H71A 3TKSA 4MJBA 5D73A 4KCAA 5ECOB 1F37A 5J41A 1AC1A 1B48A 1ON4A 3MSZA 1U87A 1FG4A 4QQ7A 3M9KA 3QCPA 1GSEA 3DYRA 2VLTA 3HVXA 4OCEA 2CZ3A 1JLVA 1SJ6A 1J9BA 4EO3A 2YANA 4WEYA 4MJAA 3KIJA 1KNGA 4F82A 1EV4A 3ZIJA 2VCWA 1A23A 1MDJA 3N9JA 2R3XA 5JWQB 1WP0A 4IELA 1K0DA 3UIWA 2IWTA 1TK5B 1XWGA 4L0WA 4EC0A 4OFTA 2N5BA 1LJRA 1M0UA 2C0GA 3UEMA 4YH2A 2JU5A 2H75A 4NV5A 1Z9HA 2YP6A 3TJGA 2RM6A 3UMAA 3F4RA 4ZXGA 5HFKA 2HRFA 4HUAA 2FHEA 2F8AA 3EU3A 4JR6A 4WF5A 2K6VA 4HS1A 4GQFA 1G6YA 4LA1A 4XS4A 4WR4A 4G10A 3UVTA 3RAZA 4XS6A 1Z6NA 3DWVA 2FNOA 1M2DA 2FUG2 1R26A 2LQQA 2L57A 4KDUA 1PKZA 3KJYA 4PUFC 3ZTLA 3BCIA 3UJ1A 2WGRA 3R2QA 3UBLA 1TDIA 4OD7A 5LCZA 2GSQA 1ML6A 2RUEA 4YQVA 3GURA 2H1BA 2CA8A 1WOUA 2J9HA 1TW9A 16GSA 3ME8A 2R4VA 3TKQA 6GSSA 2WZ9A 2X64A 2B7JA 2YWOA 1XXUA 4ECCA 1TJDA 6GSXA 4JZQA 1ZCPA 5G1KA 4KA0A 2LUSA 1SK1A 2GSRA 2K18A 5CRGA 4IKHA 4D73B 2GS3A 1Z7RA 13GSA 3BD2A 2DMMA 4ZL9A 1T1VA 2IMKA 1PD21 5COHA 3TOUA 2DIYA 1T00A 4MH3A 3VWWA 2XPEA 4CDOA 5J9BA 1HYUA 4ZB9A 4KH7A 3BOAA 2VCTA 3QOUA 1VRSD 2HFDA 3QAVA 3GFKA 3L0HA 5EVOA 1R7HA 4PNGA 1AUCA 4K2DA 3VWUA 2LV3A 2VL9A 1H75A 3CSHA 2R5GA 4ML1A 2ALBA 1PSQA 1SL0B 5KN0A 5B7CA 2E2GA 1SJIA 3HJOA 4MCUA 2H1DA 2H6XA 4FYCA 2HZEA 4LLRA 5IMVA 3P7XA 2O8VB 2YV9A 3FZ9A 2H6ZA 2VD0A 5D96A 3BCKA 2ON7A 4AF2A 2C8UA 2WB9A 4Z7XA 2OACA 2PVOC 3EU4A 2JSZA 3TJFA 1X9MB 2YZUA 1U3AA 3HJPA 2ES7A 1A2JA 1RQMA 1GSFA 3F6FA 4MZCA 3G7YA 2BMXA 2HE3A 3N5OA 3CSJA 3W8SA 4DSSB 5ECNB 1UVZA 1EP8A 3GH9A 1T4YA 2VL2A 1YF1A 3ZFBA 3GMFA 1VF4A 3HYPA 4CW9A 1TKDB 2V2GA 1WIKA 3Q6OA 2ZUPA 1YKCA 3Q18A 10GSA 2E7PA 9GSSA 2MMNA 2B5YA 4KB3A 1V58A 1XW9A 1GP1A 1O6JA 2JZRA 4EXJA 2V6OA 5J5NA 2O7KA 1QFNA 2HSYA 2DSAA 2YOIA 2DMLA 4KNDA 2NPBA 4J57E 3VK9A 5A4WA 3HZ4A 2JSYA 2JZTA 2F51A 2H01A 5JWOB 5HR1A 2P31A 1OE8A 4IGJA 1MTCA 4J2FA 4RUVA 1NW2A 1XW6A 5ENUA 2F9SA 2HRNA 5DJMA 1QK8A 2H72A 4TXVA 3Q19A 3DGQA 4OFNA 5DAKA 5GAND 3FEUA 1T3BA 3QR6A 2DJ2A 4MDCA 1XCCA 2WULA 4AGSA 3TRXA 1OYJA 5KEJA 2GSTA 3GL3A 1EZKA 4IN0A 3FR9A 3IA1A 3A3TA 3ZVJD 2PMTA 4K6XA 1XIYA 1UA5A 4FIWA 4ACSA 1DBYA 1MD3A 3E9JB 4AJ7A 3JCML 2DJ1A 3S9FA 8GSSA 3GKMA 2NDOA 4NAXA 3EWLA 2HXKA 1LU4A 1DUGA 1U88A 4L5OA 3QAWA 5DCGA 2FWHA 2MBSA 2PUKC 2VO4A 1URMA 7GSSA 2DJJA 2GGTA 3D22A 1PKWA 4MF6A 3VI7A 4I97A 4KCEA 3L9UA 2GZYA 5DQYA 1YEPA 2B7KA 3KZQA 2IPAA 1TXXA 1XPVA 3PR8A 3UVHA 4XRAA 1CQHA 2GDRA 1EGRA 2F8FA 2X8GA 2L4CA 3IC4A 3ZLPA 1A2LA 1OC9B 4POBA 5ECLB 3KGKA 3FKFA 5C00A 2I9HA 2PVQA 1AXDA 2OJLA 1A2MA 5DVBA 4QL9A 4MF7A 1K3OA 5B8AA 5JCWA 2V41A 2PERA 4IP1A 1OVNA 3QD9A 1GSYA 1T8EB 4ECIA 4IW9A 1V57A 1ERWA 3HD5A 4K1FA 5ECPB 2HT9A 1WJKA 2ON5A 4HZ4A 4PGTA 4EDYA 2V6KA 2DJ3A 3LORA 2R6KA 4XCSA 5GZZB 5DQSA 4OCFA 5IIZA 4EF0A 4NHWA 3A2XA 3CTGA 1FHEA 3QMXA 1F9MA 4KX4A 2IMIA 4ZIJA 1HNCA 2PGTA 5AN1A 3APQA 5JCUA 3VFIA 3MNGA 5CAXA 2B1KA 4EE0A 2OKAA 2DIZA 5F07A 1TK8B 3ZZXA 3TKSC 4KE3A 3GSTA 6GSVA 3UOMA 2B1LA 1HQOA 4V2NA 1ZYQB 3L4NA 2A2SA 3ZFLA 2C0FA 3A2WA 1VF3A 5EPFA 1GLQA 5CYYA 3KTBA 2PBJA 3GNJA 1JLWA 5F05A 3GA4A 2IL3A 1GUHA 5H5RA 1HD2A 3TJJA 3VURA 3FYGA 1ZOFA 2OE1A 1PQNA 4K9ZA 4N0ZA 4P3YB 2DLXA 1X0RA 1GWCA 4GSNA 5JWRB 2CVKA 3CMIA 5HQPA 1K0MA 1WWJA 3KMNA 2GQKA 1GUKA 4I2TA 4KAEA 1BX9A 3P8WA 2GQMA 4HI7A 4TXOA 5CNWA 3APSA 1B9XC 5ECQB 2C3NA 3F9UA 4MH2A 3RDWA 2FWFA 3HVSA 1RK4A 3IBHA 2C1YA 3EE2A 3HZ8A 3D0ZA 1FW1A 3F3RA 3MAKA 1BG5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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