1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
4JCKA 3AP9A 5D62A 4XE9A 2RQ9A 1L2HA 3FUQA 1ISYA 1DYPA 2NTDA 3FJ9A 1CVNA 4FGFA 1I1EA 2KH2A 1IHKA 4FQZA 3OGFA 1AFCA 1DQGA 5BXPA 2A6XA 2EAKA 1MACA 1DQ6A 4FPCA 2ZGTA 3AZZA 1W3FA 5E89A 1JN2P 3RMXA 5BVPI 1DZQA 5IT6A 2VW0A 3V0BB 3CA0A 4H55A 3BOPA 4ZOTA 2GMEA 1SACA 2KKIA 4LO3C 2E53A 3NF3A 4XDQA 2QN0A 2J3PA 2Z48A 4QC4A 2D44A 1UZYA 4HEVA 4I4XA 4OWJA 2KI4A 3UK9A 6I1BA 5BQUA 5BQMB 3MW2A 1T9FA 3NBNA 1G9AA 1EPWA 5D61A 1XG6A 3FJCA 4XFUA 4RA0A 2AQZA 5FNXA 3AH1A 2DVAA 3O5WB 3FLPA 1W6MB 1T3CA 5FZUA 4I37A 2H0BA 2NM1A 4Y1YA 1YVGA 4R9DA 4FOWA 5BQNA 3C9ZA 1HQWA 1KDMA 1IOBA 4NOTA 1Z7HA 3OBTA 3ZYRA 3WOGA 3HOMA 1SBEA 1ZL5A 1JYIA 3UD7A 2BQPA 1CONA 1H30A 1ULFA 4YGEA 1RY7A 1DYKA 4Y1XA 1C57A 1W6QA 1TP0A 3IMNA 5JOYA 1WW7A 1WBFA 1LJ7A 3OY8A 1BQPA 4AN7B 3AH4A 1K5VA 4G9NA 4CTEA 2AUYA 1OQLB 4G9MA 2FDBM 5DXDA 5T50A 1V6OA 4ZGRB 3AYCA 2I1BA 2ZKNA 4LBOA 2C5DA 1BJQA 4X39A 1JLYA 1WBCA 3BRGC 2FGFA 2D7FA 1V6WA 2OUHA 4ISRA 1QNYA 2UWAA 3O49A 2NN8A 2GN7A 5T5PA 4YM3A 5KXBA 3DS9A 2P37A 5H9RA 5I1BA 1ZM1A 1HCDA 4GAIA 5F8YA 4F34A 5GZEA 3BAHA 2DS0A 3ZYPA 2Y9WC 3PVEA 1FWVA 1FMMS 3B01A 3V64A 1F31A 3OPZA 3TC2A 1MS4A 1JHNA 2CWMA 1CVSA 3HBWA 1WD4A 2EXJA 2VU9A 2D6MA 5BXRA 1QOSA 1Q8VA 1R8NA 2V5YA 4KTXA 3UJOA 1T4QA 4JC1A 2ZZJA 2K4AB 4X3AA 1BASA 3O0WA 1IS5A 1JT3A 1AVWB 4Q1PA 4LO8B 1XTFA 3WNXA 2V73A 4KS6A 2W52A 1G8WA 1FATA 3IN9A 3BA7A 4I30A 2A97A 1DQOA 1UZZA 4MYEA 3HN1A 4YOLA 1BYHA 4LO7B 3D3XA 3AZWA 3UD8A 2Y9XE 3AJYA 1S0GA 2G7QA 4GAFA 1OKQA 4YG6A 3ZSLA 3Q7XA 1KJRA 4J2YA 3N7MA 3A22A 1LGNA 3H0OA 2ARBA 1V6IA 3OYWB 1SR4A 3NV3A 1YO8A 3O4OA 4ZFWB 3GNEA 2R1BA 3PVNA 1DFQA 1II4A 2GNMA 8I1BA 3ILFA 3UJ0A 2JD4A 2RHPA 4II0A 5EG6C 3IKWA 5DUXA 1W6NB 1WLDA 1HWOB 3BAQA 2G7KA 1DQ4A 3LLPA 1S0JA 4XMAA 3OBRA 4DEPA 4LBNA 4FPLA 3UJQA 4YZ5A 2ZMNA 3GALA 3WDTA 2DWRA 4Q8LA 4GWNA 2NZ9A 4GP3A 2CY6A 2Q3NB 4GOYA 3AP4A 3PHZA 1F82A 3ATGA 3M3QA 5EHAA 1DGLA 4BMBA 4M00A 5CA6A 3FLRA 4WVVA 4Z8SB 1WD3A 4YM2A 4HJJA 1JW6A 5T55A 4L4HA 2GNTA 3AKGA 2IMAA 1PZ7A 1AX2A 2YZ4A 5HPZA 3ASIA 2Y9GA 2SBAA 4XHBA 4FPGA 2DVFA 1XZZA 1Z2VA 2XHLA 1FNYA 5H9SA 2BFHA 4EFRA 1PZZA 1QQKA 5IK8A 3V0AA 2A70A 3N7JA 4I4UA 5GALA 3MPPG 1IJTA 1GBGA 2VXRA 3FJ8A 5DUVA 1PZ9A 1AXMA 4XILA 3WG1A 5JLVA 1RINA 1QNWA 3BAUA 2WKKA 1JT7A 1CIWA 2R49A 1PZ8A 1GKBA 3CA1A 4PF5A 1ENQA 2UWCA 3LSEA 5FRAA 1CESA 1MR5A 5SV8A 2D6OX 2D3PA 2ZGLA 5DUYA 4R9BA 3T8SA 3OGGA 3A0KA 4M3CF 2AFGA 1TWEA 2R16A 4AWDA 2VW1A 2WT2A 4ISQA 1W6PA 4I4QA 1ZL6A 4FPOB 4LBQD 5L73A 4YFWA 3O5SA 3IM5A 3FJHA 1SLBA 1TWMA 2E51A 3ZSJA 4QKRA 4QD2C 3IM7A 3AP7A 4XMIA 2PELA 4PCRA 3QW6A 1SR4C 1LGCA 1C1LA 3FGMA 2A3WA 3AFKA 4JQ0A 1BFBA 3AP5A 3AZXA 1C4RA 2A3XA 1QF3A 2W08A 1SFYA 4DCKC 3WDWA 1LGBA 4ZA3B 4DENA 4BLJA 1TFMB 1QDCA 4DS0A 4A7ZA 4A7KA 3QCWA 4GALA 1AXKA 3FFZA 4YM0A 1HCEA 2ZQOA 1PWAA 4IY8A 2WRYA 1TIEA 4GWMA 3JRRA 3BODA 4EEEB 3CRGA 5JOWA 1W6OB 3MW4A 4FOQA 2QYIB 4OWKA 4I96A 4SLIA 4LO0A 2GALA 2ZGPA 4JRAA 4Q91A 1KITA 2MC2A 1HLCA 2D6PA 4ZXKA 2ZQNA 2Q5TA 3NBCA 1ISVA 1GZWB 3H6RB 4ITCA 5CNAA 4PBOA 1BARA 4WVWA 4WBCA 4FP3A 1O4ZA 4ATEA 2WLQA 4FQ4A 4LBQA 3N0KA 3DUIA 4G1RA 1FMZA 1SBDA 1DLLA 2D22A 5FNWA 2W2DB 4XJAA 2NVHA 3WO3A 3R4SA 1VALA 2PHXA 2GMMA 1RZOB 2GZBA 3CNAA 3SLIA 1FV2A 1N1TA 1HKDA 3NJ5A 3WA1A 2G7PA 3VV1A 1LOBA 3P53A 4YZ1A 2R1DA 5HCAA 3I2XA 2A6YA 2WNEA 4YW1A 3POYA 3D7WB 3POSA 5F8WA 3O3QA 1MS9A 1YI7A 5GLUA 3E8LC 1GZCA 2R0HA 5JOXA 5GLTA 3ZXJA 3KMVA 4I4OA 3QYDA 3WVJA 2Q9XA 1MS8A 2VUAA 2B7YA 3QW5A 2CNAA 3V0BA 3WG2A 2D3SA 3AYEA 3WLUA 3LCPA 1V6VA 1G9DA 4KUFA 1UAIA 2XOAA 4XTMA 3BAOA 1R8OA 4AVVA 5HCFA 4Y1UA 1D2SA 1ITBA 1G9BA 4Q9PA 1V6XA 3HALA 1HKNA 1LHWA 2HWAA 1FWUA 4UW6A 1ISWA 5BQMA 3ILNA 4YG3A 1AX1A 3VKMA 2PHWA 5T52A 3H6SE 3VSZA 1F9KA 3FJBA 4AVTA 5DSSB 1XQNA 2A75A 2P3JA 1W0PA 4XIKA 5BOWA 2DUPA 3QR5A 2OUJA 3MW3A 2ZHMA 5AVAA 4BOWA 4LO0C 1DFCA 2DV9A 1IS6A 3QJ0A 2PHFA 5FZZA 2VXTI 4QBVA 2JJ6A 1ZKWA 4R9CA 3W9TA 1OQ1A 4LBJA 1E0OA 3SH5A 2K43A 3T1LA 4J2XA 1VIWB 3S8JA 4YZ2A 2FPQA 3RS6A 3IM6A 2G7NA 1FQ9A 1JT5A 2A6VA 4KBBA 2DU0A 4FPEA 4BM8A 2D43A 3ZXDA 3QIXA 4PQ9A 1RG8A 2E7QA 4P9WA 4LO1A 2E4MA 4M3CA 1S0CA 1SLLA 5H9PA 3I2AA 5DVHA 1LOFA 1J0SA 4ENDA 3DDAA 4GKXA 1MZ6A 5GJ6A 3FLTA 3FBYA 2JDZA 2ZGNA 1GZ9A 3Q7WA 1EVTA 4IONA 5DG2A 4WV8A 3R05A 1CE7B 4G6MA 3LTQA 4ZKTB 3UJ4A 4OUJA 4AGVA 1AXYA 2ERFA 2AENA 1V6UA 3I29B 3RTIB 4J2SA 2K8RA 2F2FA 1MC9A 3BOKA 3OY8B 5DUUA 4KEJA 2EALA 3ZUSA 2X2SA 4ASMB 2IWTB 2FMDA 2PHRA 1YF8B 4AGGA 3M1HA 2HZ9A 3WDYA 2EXIA 1BLAA 2ETFA 2IMBA 4Y1ZA 3A07A 2TEPA 2UUSA 1VLNA 3BAVA 3USUA 4XJ8A 3VUOA 4FPYA 1UKGA 5D63A 2BEAA 5BQUC 1S0DA 3AYAA 3ZSKA 3B9UA 4AGRA 1XTGA 4XJ9A 1WW6A 3WDUA 2E7TA 5FREA 3CA4A 3PG0A 1MS0A 3MEPA 3ZXGA 2A7AA 3WCSA 1S0BA 5EC5A 2ENRA 3CA3A 1MVQA 3BAGA 3CA6A 1S0EA 3BADA 5F90A 1FN0A 4K1YA 5GM0A 3PJQA 3FIEA 1Q8SA 5GZDA 4PC4A 4GA9A 1W0OA 4JAWA 1N1YA 4XBNA 1GNZA 3WDVA 2ZHKA 4XXPA 1FNZA 2ZHNA 4OW4A 1QXMA 4Q1RA 3D6EA 1HIBA 4I4SA 2DVDA 4F83A 5BP5A 4BPZA 1ZB7A 4ZFUB 3WUCA 3IM0A 4D8HA 5BYNA 2AR6A 1BFFA 2D7IA 4AN6A 3VKOA 1V00A 1MZ5A 1G82A 3N7KA 2ZACA 1N1SA 1JQZA 3INAA 4D0ZA 2VSAA 2L5XA 1PUMB 3LSDA 2Z42A 1C1FA 2ZMLA 1OFSA 2UWBA 1SLCA 4YW5A 3T2TA 2ERMA 1N3QA 3O4AA 3S8KA 2DVBA 4QD2B 3SH3A 5DUWA 2D3RA 1HWNB 3C8BA 3CRHA 4K1ZA 3W58A 4XTPA 1KQRA 1XHBA 2XG3A 1AJOA 3B00A 3RSJA 3O12A 1RMLA 1H9WA 1Q04A 3FJAA 1AX0A 3V65A 1QKQA 3IPVA 4Q2FA 3FJJA 2F2FC 1WW5A 4XJZA 4M3CE 3HR9A 4FVVA 1ABRB 2P3KA 2F8XC 1Q8OA 2WJSA 5E8AA 1D0HA 1GICA 4Y22B 2QN4A 4L8QA 1NXD1 4QBCA 2Y9FA 2P39A 1AJKA 3KQRA 4P9YA 3SITA 1ULGA 2P34A 3AK0A 1UN1A 2ZBJA 3N3HA 1JXNA 1AVAC 2AYHA 3CAHA 1LECA 1MVEA 1PC8B 3BB2A 2VSEA 2DREA 3ZX7A 2GN3A 2NMNA 4Y20B 1G9CA 4LO2A 5DZGA 3BWIA 3NBDA 3C88A 3C89A 3JUTA 1N1VA 1YYNA 1BKZA 2EIGA 2JECA 1LCLA 3FUOA 1WBAA 3WCRA 3SNVA 4XXAA 3V0AB 5IUQA 1IILA 1M16A 1S0FA 1FAYA 2VW2A 2Z49A 1A78A 3P6JA 4HL0A 4ZFYB 1HWPB 1GV9A 3WHUA 7I1BA 5BP5C 2BEBA 1TEIA 2WT1A 3BA5A 1ONKB 5HCBA 1DQ0A 4ZBVB 1Q56A 2D6NA 1W3AA 1YXWA 1DZDA 3PUBA 2KLLA 4QO3A 2CL2A 4YZ3A 3Q7YA 2DURA 2GDFA 3ZVXA 4JPZA 1RIRA 2YXSA 5DZUA 1W6PB 3ZXFA 3VEQA 4EFQA 2UU8A 1HQLA 2GMPA 1W6OA 2ES3A 1FGAA 2RG9B 3ILAA 1DQ2A 4AYUA 4YGCA 21BIA 2GO2A 1WUVA 2OW4A 3NV4A 4YLZA 3U4XA 4KC3A 2P2KA 1APNA 3VKFC 4CRQA 1Z4SA 4X38A 4LO3A 2ZGRA 1CPMA 1AVXB 3H6RA 1HWMB 3O4CA 3KM5A 3BONA 2WSUA 3AH2A 1LTEA 5KXEA 1GGPB 4OEEA 3QIZA 4XFSA 3M2MA 3C8AA 3M3CA 1JUIA 2W2DA 4OZXA 4DFSA 2MIBA 4GP0A 2YY1A 3WUDA 3RTJB 2D7RA 2AAIB 4DQAA 1T3AA 2W68A 2DYCA 3BOOA 1IS4A 2AREA 1SBFA 2YV8A 1VAVA 4FP2A 4U36A 5IK4A 5IK7A 3POWA 1ILR1 5DG1A 3O44A 1ENSA 2KI6B 3ZURA 1K5UA 2LIEA 1QU0A 3AKIA 3WG3A 2IHOA 3EF2A 3F1RA 2ZGUA 1XYFA 5IK5A 4HANA 1IOAA 1N47A 4XZPA 1URXA 3BRFA 3O0XA 5CAZA 2WSVA 3BA4A 1J1TA 2ARXA 3ENRA 2CTVA 5JMCA 5CB7A 2OVUA 1CR7A 1NUNA 3MALA 4LBLA 3HSMA 2D23A 5JVVA 2JKBA 4Y26A 1S0IA 4XIOA 1NZKA 3VT0A 1LESA 1CJPA 3OJVA 5H9QA 5LK5A 1LEDA 1LOCA 1DHKB 3ZXKA 5JOZA 3SNMA 4Q8KA 2ILPA 4YGBA 2ZGSA 2JE9A 4YW3A 3ZUQA 5DZEA 4NO4A 3SISA 3O4DA 4IY9A 3WO2A 4G6JA 3CRIA 5GZCA 3AZVA 4HA2A 2ISHA 1V6NA 4QKSA 1WBLA 1V6KA 3WDXA 2SLIA 3PMEA 5BXTA 2ZGQA 1MD6A 5GLWA 3WZ1A 1EV2A 3FJKA 3FJEA 2JE7A 2CWSA 3ZXLA 4YFZA 4OEGA 5F8SA 1W6MA 3DGTA 1S0LA 3QIYA 5DZFA 3VWCA 2P3IA 3NV1A 4CZSA 4XKIA 4H9WA 4I4PA 1GANA 1G7YA 3AP6A 1DQ1A 2ZMKA 4DRVA 1JY0A 3BX1C 2M49A 1LENA 2RSTA 1CQ9A 4YW2A 2ZGMA 5T5LA 4YG0A 1AZDA 1JYCA 1KNMA 3ZC8A 3A4UA 2WQZC 5FZYA 1EYLA 3AX4A 4KEIA 3UD9A 4FPJA 3BIWE 3FJDA 5GAQA 4U2AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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