1HCAA

Unexpected ph-dependent conformation of his-64, the proton shuttle of carbonic anhydrase ii.
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Unexpected Ph-Dependent Conformation of His-64, the Proton Shuttle of Carbonic Anhydrase II.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hcaA00
3OIKA 4KP8A 5JDVB 1ZSBA 3M2XA 1ZNCA 4HT0A 2Q38A 4R59A 3DCCA 4ZX0A 1UGCA 1HUGA 2NNSA 4Z1EA 1CNGA 1HVAA 2X7SA 1MOOA 3DD0A 1BNQA 4Q9YA 4CNRA 1JV0A 4HEWA 2CBEA 4N0XB 4ZX1A 4CNVA 4QJWA 4PQ7A 4FVOA 4E3GA 1CAJA 3D0NA 3U45X 4XFWA 1KWRA 1OQ5A 5EZTX 3RG3A 3CA2A 4CACA 3IAIA 4R5BA 5SZ1A 1CA2A 1G0EA 4BF6A 5HPJA 3HKNA 3M2YA 4HF3A 3MNUA 2POWA 3S74B 3V3GB 1CNHA 5FL5A 5E2MA 3U47A 4Q49A 3ZNCA 1CANA 3ZP9A 8CA2A 3B4FA 3KOIA 4G0CA 5EH7A 4BF1A 5L3OA 2CA2A 1CVAA 4QIYA 3S76A 4Q7PA 1UGBA 12CAA 5EOIA 3TVNX 3T85A 1CVHA 1HUHA 3DCSA 3NI5A 5DSQA 3P4VA 1CNBA 3DBUA 4K1QA 1TEQX 1CRMA 3CYUA 4KP5A 2NXRA 5FDIA 3R17B 1CNIA 2HFWA 1YDDA 3HKTA 4Q87A 5E5UA 3RG4A 3PJJA 2NXSA 5DSMA 3OKUA 4PZHA 3BL1A 3D8WA 4GL1X 1RZBA 1CAIA 4Q8YA 1EOUA 5JEPB 1G3ZA 2WEHA 2NXTA 3OY0A 5JEGB 5DOHA 4CNWA 1G48A 3KWAA 5FLSA 1YDCA 3D92A 4ZAOA 3CZVA 3S97A 3DAZA 3ML2A 2AW1A 2CBBA 3DVDA 3C7PA 1RJ5A 4QSIA 2NWZA 3T5UA 3TMJA 4ZWIA 2HKKA 1YDBA 3F8EA 5E5RA 4CA2A 4HEYA 3P58A 3RYVB 3KONA 2NWYA 1FQRA 2EU2A 3MYQA 4Q08A 1TG3A 4QK3A 5L6KA 4RFDA 4M2RA 4Q83A 4TWMA 2OSMA 3S77B 3IBNA 2FW4A 5FNLA 4Q09A 3S71B 5DSPA 3T84A 1F2WA 3KNEA 5E28A 1CAHA 1G52A 3T83A 5DSJA 3CAJA 2ZNCA 4R5AA 5CACA 1KOPA 3KKXA 3SBHA 2FNKA 3BL0A 3RZ5A 4FIKA 2FMZA 3EFIA 3HS4A 3V3FA 1CAZA 5SZ2A 4WUQA 1H9QA 1CVFA 4K0TA 5E2NA 3IEOA 1HCAA 1Z97A 4E3DA 5EIJA 4KNJA 1AZMA 4E49A 4K0SA 1TTMA 5SZ3A 4K0ZA 5CLUA 1UGAA 5J8ZA 1UGFA 5DSRA 1RJ6A 3JXGA 4Y0JA 3OIMA 4ITPA 1URTA 2HD6A 5DOGA 2Q1QA 2POVA 3GZ0A 4Q6EA 4IDRX 4JSAA 1YO1A 5G01A 1HEDA 4YGFA 2X7UA 1FQLA 1FR4A 1I9NA 3M96A 3DVBA 1CAKA 1CCSA 2HNCA 3MNHA 3P5AA 1HECA 3V2JA 3V2MA 3MHOA 3M1WA 5CJFA 1BNVA 4KUYA 4RH2A 4N16A 4QTLA 1AM6A 2W2JA 4MDMA 2CBCA 4Z1NA 4MO8A 4ZWYA 3RYJB 4KUVA 5EKMA 3P55A 4KNIA 3M1KA 5DSOA 3SAPA 4E3HA 4QEFA 2WD2A 5EH8A 3S78B 2FOYA 4WW6A 1CILA 1ZGEA 4E4AA 1LGDA 3HKUA 4JSZA 5DSKA 3N2PA 1G4JA 1CNWA 1TG9A 3F4XA 4Q7SA 3TVOX 4MLTA 5CA2A 2FNMA 3HLJA 1Z93A 5EKJA 1RZDA 2NNVA 2H4NA 1DCAA 3D93A 5JESB 1CAOA 5FNGA 4WUPA 2NWPA 3SAXA 4Q7WA 3N3JA 1G1DA 3HKQA 1IF7A 1I91A 3RGEA 4L5UA 3IBLA 1HEAA 3OILA 1ZE8A 2NN7A 4XZ5A 4Z0QA 4RN4A 1OKMA 4QK2A 2QOAA 4QSBA 2HL4A 1G0FA 1BNNA 5FNKA 2QO8A 4UOVA 5DVXA 3V3JA 1V9EA 3KOKA 5E2SA 3V3HB 1IF5A 1HEBA 4Q81A 4CNXA 1CVCA 3OKVA 5EHWA 4DZ9A 4FPTA 2FOQA 2FMGA 1HCBA 1CVDA 4QJOA 3T82A 4PYYA 3RYYA 4C3TA 5FNIA 1ZSCA 1THKA 3MHCA 3DC3A 5A6HA 1CVBA 2X7TA 4FL7A 3P44A 4M2WA 4TWLA 1TE3X 3M98A 3DA2A 4YXOA 3S75B 5JQTA 5JG3B 5JG5B 1OKLA 2WEOA 5G0CA 4L5VA 1CNJA 3KLDB 1KEQA 1I90A 1I9PA 5BRWA 4YGJA 1H4NA 1BN1A 1IF4A 4RUXA 5LMDA 7CA2A 2CBDA 4QJ0A 3ML5A 5EKHA 1H9NA 1OKNA 1J9WA 4KAPA 4Q90A 4RIVA 3M1QA 1ZH9A 3KS3A 2FOVA 2VVAX 4WR7A 5FLRA 1ZFKA 2NWOA 4YVYA 3Q31A 5FNJA 5FLPA 3P3HA 1I9MA 3M04A 5JGSB 1XEVA 1CNXA 2Q1BA 5JQ0A 1IF9A 3F7UA 3D9ZA 4BCWA 3HFPA 5E2RA 1XPZA 3S8XA 5SZ0A 1Y7WA 3M2ZA 3M67A 1CAMA 1UGGA 4Q06A 3JXFA 1G45A 4JS6A 6CA2A 1CNYA 1G6VA 2F14A 1I8ZA 4ZWXA 1G54A 2H15A 4E5QA 1TH9A 4YXUA 4XIXA 4Z1JA 5IPZA 5DSIA 3M5TA 1BCDA 3DCWA 5FL4A 4E3FA 2ILIA 1UGEA 1TB0X 3M1JA 4M2UA 4Q7VA 4IWZA 4KUWA 5FNMA 3S72B 4LHIA 4ITOA 3MWOA 4MTYA 5EHVA 5SZ5A 1FSNA 1BNUA 2EU3A 2HOCA 3VBDA 3K7KA 2VVBX 4X5SA 1FSRA 4G7AA 3T5ZA 1BN3A 1CNCA 1BV3A 1I9LA 1BNWA 3LXEA 3M14A 4YGLA 1CA3A 3BETA 4Z1KA 1TBTX 3N4BA 1YDAA 4MDLA 2NNGA 3DD8A 5SZ6A 1IF8A 4MLXA 1BNTA 1I9QA 4QK1A 5FL6A 3S9TA 4ETQC 1CRAA 4Q07A 3SBIA 2WEGA 1JCZA 3R16A 1CINA 4Q6DA 4XE1A 5FLOA 4RIUA 3W6HA 3M2NA 5DSNA 3KIGA 3S73B 3RYZA 1ZSAA 1LG6A 4JSSA 5JGTB 3K2FA 4YX4A 3MZCA 1DCBA 4YGKA 3PO6A 4KNNA 3M5SA 4FU5A 1RZCA 1BZMA 4PXXA 1LZVA 3FE4A 3RYXB 3M5EA 3NJ9A 5G03A 2GEHA 4QIZA 5EH5A 5BNLA 3L14A 5BRUA 5BYIA 4RUZA 3PYKA 5C8IA 1BICA 2AX2A 1LUGA 1ZFQA 5SZ7A 1DMYA 4LU3A 4YGNA 2FNNA 1CNKA 4ILXA 4JSWA 1G46A 1Z9YA 3V3IB 3V5GA 5DSLA 4DZ7A 5BRVA 4KV0A 3IGPA 5A25A 4Q0LA 1BN4A 3MHLA 1G4OA 4YYTA 2OSFA 1YO0A 3FW3A 3K34A 3P3JA 4HBAA 5JEHB 1AVNA 3MNIA 1KWQA 3MNAA 1FQMA 3DV7A 3IBUA 1FLJA 5G0BA 1DMXA 3F7BA 1FSQA 3UYQA 4HT2A 3U7CA 1ZGFA 3DC9A 4Q78A 4L5WA 3UYNA 3MNKA 2EZ7A 3M3XA 3MHMA 2NN1A 4WW8A 4LP6A 1RAYA 1RAZA 3MHIA 1JD0A 4K13A 3QYKA 3MNJA 5EHEA 4Q8XA 4COQA 1KOQA 4QSJA 4FVNA 3FFPX 2FOUA 2CBAA 1CZMA 4KNMA 3RZ0B 5AMLA 5FDCA 5FLTA 1CVEA 3U3AX 5FLQA 9CA2A 1LG5A 1XEGA 5DRSA 1CCTA 2ABEA 3RJ7A 2QP6A 1UGDA 2IT4A 4QJXA 3EFTA 3M40A 4XIWA 4QJPA 5AMGA 1YO2A 4RUYA 4HU1A 1BNMA 3NB5A 3RZ8A 1G53A 4WL4A 2NMXA 2GD8A 1RZAA 4M2VA 3OYQA 3MMFA 3DVCA 4Q99A 5AMDA 1TEUX 5FNHA 3IBIA 4PYXA 1CALA 2POUA 3RZ1B 4ZWZA 4Q8ZA 4YHAA 1V9IC 3RLDA 1RZEA 3W6IA 1MUAA 4RFCA 3JXHC 1IF6A 5SZ4A 4YWPA 2WEJA 4E9OX 2CABA 3N0NA 3P5LA 4CQ0A 1CIMA 1XQ0A 4QJMA 4YXIA 3OYSA 3MDZA 4FRCA 1CCUA 4MDGA 2WD3A 3B1BA 1T9NA 1A42A 2NNOA 3RZ7A 3V7XA 5E2KA 1CAYA 1FQNA 4QY3A 1I9OA 4HEZA 4QSAA 1FR7A 2FOSA 2O4ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OIK A;  4KP8 A;  5JDV B;  1ZSB A;  3M2X A;  1ZNC A;  4HT0 A;  2Q38 A;  4R59 A;  3DCC A;  4ZX0 A;  1UGC A;  1HUG A;  2NNS A;  4Z1E A;  1CNG A;  1HVA A;  2X7S A;  1MOO A;  3DD0 A;  1BNQ A;  4Q9Y A;  4CNR A;  1JV0 A;  4HEW A;  2CBE A;  4N0X B;  4ZX1 A;  4CNV A;  4QJW A;  4PQ7 A;  4FVO A;  4E3G A;  1CAJ A;  3D0N A;  3U45 X;  4XFW A;  1KWR A;  1OQ5 A;  5EZT X;  3RG3 A;  3CA2 A;  4CAC A;  3IAI A;  4R5B A;  5SZ1 A;  1CA2 A;  1G0E A;  4BF6 A;  5HPJ A;  3HKN A;  3M2Y A;  4HF3 A;  3MNU A;  2POW A;  3S74 B;  3V3G B;  1CNH A;  5FL5 A;  5E2M A;  3U47 A;  4Q49 A;  3ZNC A;  1CAN A;  3ZP9 A;  8CA2 A;  3B4F A;  3KOI A;  4G0C A;  5EH7 A;  4BF1 A;  5L3O A;  2CA2 A;  1CVA A;  4QIY A;  3S76 A;  4Q7P A;  1UGB A;  12CA A;  5EOI A;  3TVN X;  3T85 A;  1CVH A;  1HUH A;  3DCS A;  3NI5 A;  5DSQ A;  3P4V A;  1CNB A;  3DBU A;  4K1Q A;  1TEQ X;  1CRM A;  3CYU A;  4KP5 A;  2NXR A;  5FDI A;  3R17 B;  1CNI A;  2HFW A;  1YDD A;  3HKT A;  4Q87 A;  5E5U A;  3RG4 A;  3PJJ A;  2NXS A;  5DSM A;  3OKU A;  4PZH A;  3BL1 A;  3D8W A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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