1HEDA

Structural consequences of hydrophilic amino-acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSATTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural consequences of hydrophilic amino acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hedA00
2NXTA 2NN1A 3V5GA 3MNHA 3SAPA 3N3JA 4YGNA 5A25A 1I9PA 1FLJA 4ZWXA 1CAZA 2O4ZA 2FOYA 3PO6A 3PYKA 4R5AA 4CNVA 1BNQA 1ZSBA 1CIMA 4FRCA 5DVXA 3EFTA 4PYXA 3K34A 3M2NA 3MHCA 4ZAOA 5FNMA 2NMXA 4QEFA 5JEGB 1ZFKA 3DCWA 1TG9A 4FIKA 1G45A 1CNWA 1THKA 5FNKA 1HEBA 3FW3A 5FLTA 4FL7A 4CQ0A 1OKLA 5SZ3A 5EZTX 5BRWA 2FOQA 4RUYA 3NB5A 4QTLA 3D8WA 3RZ7A 1LUGA 4QSIA 1BNMA 4E49A 1G46A 5SZ6A 2X7TA 2POUA 1DMYA 3M14A 4QJXA 5E2NA 4WUPA 1CAHA 1V9EA 4Q8XA 5DSIA 1BNUA 4Q8YA 4RIVA 4WW8A 1CNHA 1BN4A 1JCZA 4RIUA 1CAOA 1YO1A 4Q78A 4FVNA 3KNEA 4Z0QA 4PYYA 4Q07A 3S76A 2WEJA 4KNNA 4JS6A 5E28A 5DRSA 1TTMA 4Q90A 5G03A 3S8XA 5FDIA 4XE1A 3MHOA 2NWOA 4RFCA 3T5ZA 4UOVA 2NNSA 3ZP9A 1G4OA 4RN4A 1UGDA 3RJ7A 1YDAA 4XZ5A 1AVNA 5JDVB 4JSZA 1TE3X 3RZ8A 7CA2A 4Z1JA 3S74B 6CA2A 4YGKA 3U47A 1KEQA 1CAJA 1RZEA 1CCTA 3BL1A 1LGDA 4Q99A 8CA2A 2QO8A 1KOPA 1CVFA 1UGBA 4YGJA 1KOQA 5JG3B 1FQNA 1G54A 3M1QA 1IF8A 2NN7A 3P5LA 3DA2A 3IEOA 4ILXA 1OQ5A 3MZCA 4HEWA 2HKKA 5EH7A 3EFIA 4FVOA 2VVBX 3BL0A 3MHMA 3CZVA 5BRUA 1RZCA 3F7BA 1CVEA 4TWMA 2EU3A 1IF7A 3OILA 5EOIA 3RZ1B 5EIJA 1F2WA 3DD0A 5FDCA 4QJPA 1TBTX 4E3FA 5JEHB 2VVAX 3DBUA 3NJ9A 5JESB 1YDBA 3M5TA 1ZFQA 3M96A 1IF6A 2OSMA 5DSNA 1DMXA 2HL4A 2Q1BA 1CNYA 1FSQA 3MYQA 3S78B 3DC3A 4ITPA 4KUWA 4R59A 2AW1A 4ITOA 2FMGA 4KP5A 5DSLA 4BF1A 5EHWA 4JSAA 1I9NA 5AMLA 5SZ4A 3S9TA 2EZ7A 4E3DA 3T82A 3DAZA 1CINA 1I9LA 1UGEA 4XFWA 3DVDA 3P4VA 5C8IA 3OIMA 1G0EA 1TH9A 1UGCA 4CNWA 3F8EA 4ZX0A 3D92A 3V2JA 3ZNCA 1J9WA 3SBHA 4DZ9A 3BETA 5JG5B 2HD6A 4ZWYA 1CVBA 1FQLA 4L5UA 2IT4A 4TWLA 3FFPX 3V3GB 5J8ZA 4WR7A 1G3ZA 2QP6A 4MTYA 4FU5A 1RAZA 5JQ0A 5EKHA 4N0XB 4G7AA 3IBIA 4Q7SA 4WUQA 1CRMA 3C7PA 5E2KA 3V3IB 2QOAA 4ZWZA 1OKMA 4QJ0A 2NNVA 3RG4A 3IBLA 3P44A 2X7UA 4Q7WA 5FLQA 4ZWIA 5EH8A 3T83A 1I90A 1CAMA 1CNXA 3NI5A 2CBAA 3U3AX 1CVDA 1CNGA 4K0SA 1FSRA 1XQ0A 1ZSCA 2WEOA 5CJFA 3KLDB 2FMZA 4KP8A 4E5QA 5FL4A 4YXOA 1LG6A 2POVA 5BRVA 5FL6A 3RZ0B 4RUZA 2POWA 3F7UA 1BV3A 4DZ7A 1BNNA 4Q06A 3M2XA 1CNKA 5FNGA 3M2ZA 4M2WA 3DD8A 1BNWA 4YYTA 1MOOA 2OSFA 3M2YA 3V2MA 5E2SA 4QJMA 5SZ2A 4QK1A 5FLSA 1CNJA 4CNRA 3HKUA 3B1BA 3DCCA 1CAIA 4YGLA 3CA2A 2EU2A 1BN1A 3T5UA 3HKNA 4WL4A 5LMDA 4LHIA 1UGFA 4MDMA 1CA2A 1ZNCA 3RLDA 1HCBA 4ETQC 3CAJA 1RZBA 1RAYA 4MDGA 3P58A 3JXHC 5DSRA 4BF6A 4Q87A 3HS4A 2CBBA 3HKTA 2H4NA 1BNTA 5G0CA 4PQ7A 5DSMA 1ZSAA 5A6HA 3M1JA 1I9QA 4Z1EA 4KUVA 1T9NA 5FLPA 4HBAA 3R16A 3RG3A 1AZMA 2WEGA 1CNBA 5DSKA 1I9MA 3GZ0A 5E5UA 2CBDA 3DVBA 3P3HA 4M2UA 3RYYA 4K13A 5DSQA 1IF5A 1CNCA 4HEZA 4LU3A 1MUAA 2GD8A 1G52A 1ZE8A 1CNIA 4R5BA 2HOCA 3M5SA 3N0NA 2X7SA 3IBUA 1G0FA 3N2PA 1HEDA 3P3JA 4X5SA 5L3OA 3KS3A 1CCUA 3MNJA 3W6HA 4MO8A 4Q6DA 3TVOX 1CANA 3CYUA 4KNJA 5FLOA 4QSBA 3IAIA 3KKXA 1BN3A 5SZ7A 1TEQX 4RFDA 1KWRA 4HT0A 2NWYA 3F4XA 1CRAA 5FL5A 2NNOA 2GEHA 4QY3A 3MDZA 3MNKA 4Q81A 1CILA 4WW6A 4K1QA 5JGSB 1XEVA 3UYNA 3OYQA 4IDRX 3RYJB 4COQA 1JV0A 1CAYA 4IWZA 3OIKA 1G53A 1TG3A 3RYXB 4Z1NA 4QSAA 4QJWA 3MNUA 5CA2A 1G1DA 1H9NA 1G48A 3DC9A 3M40A 4CA2A 1CVAA 4RUXA 4Q9YA 3MMFA 2FW4A 1TEUX 1ZH9A 3M1WA 3D93A 4KUYA 1RJ5A 1DCAA 3S71B 3QYKA 3T85A 3UYQA 2NXRA 4YXIA 4N16A 5EH5A 1DCBA 1FQRA 3V3FA 1BCDA 3K2FA 3M04A 4XIWA 5DOHA 4HU1A 5DSPA 1CZMA 3HKQA 1HEAA 3HFPA 5BYIA 1V9IC 4JSWA 4E3GA 5HPJA 5JEPB 3V7XA 3S77B 3W6IA 5IPZA 4YXUA 1TB0X 3M98A 3KIGA 5E5RA 3S97A 1CCSA 1G6VA 3RYZA 3KWAA 4HEYA 3DVCA 5DSOA 5JGTB 4KNMA 4C3TA 4QJOA 3P55A 2HNCA 2Q38A 1ZGFA 5FLRA 3Q31A 1RJ6A 1UGAA 4L5WA 4Q6EA 4Y0JA 1AM6A 4YWPA 1ZGEA 1BNVA 5G0BA 5SZ5A 1IF4A 3ML2A 4QIZA 3IBNA 3OKUA 4RH2A 5EKMA 5CACA 2CA2A 2NNGA 4Q8ZA 4L5VA 4E9OX 3JXGA 1BZMA 1HCAA 5EHVA 3SBIA 5JQTA 1URTA 5AMGA 3KONA 3P5AA 4QK3A 4LP6A 1LG5A 3HLJA 3MHIA 4CNXA 4JSSA 5AMDA 4Q0LA 1HUGA 3S72B 2CBEA 2NXSA 4KNIA 3DCSA 3VBDA 1I9OA 3L14A 3TMJA 1HVAA 4YGFA 4YX4A 4YHAA 2FNKA 5FNJA 5SZ0A 5SZ1A 3SAXA 1A42A 1FR7A 4KV0A 3KOKA 4MLTA 3MHLA 4E3HA 4HF3A 2W2JA 1YO2A 3D0NA 2FNNA 4HT2A 5DOGA 3IGPA 1EOUA 2HFWA 4YVYA 1FQMA 3OKVA 3T84A 3KOIA 2AX2A 5DSJA 3RGEA 2CBCA 4Q09A 4Q08A 1JD0A 4QSJA 1I91A 1UGGA 4Z1KA 2CABA 9CA2A 3LXEA 1HUHA 3U7CA 4PXXA 3DV7A 1FR4A 3M3XA 2ILIA 2ABEA 2Q1QA 3FE4A 1G4JA 1RZDA 5BNLA 1YDCA 1XEGA 4BCWA 5L6KA 3K7KA 1HECA 4MLXA 4KAPA 2FOVA 1BICA 3OY0A 1CVHA 2WD2A 4Q49A 2ZNCA 5E2RA 3OYSA 5FNIA 1CALA 4Q7VA 1KWQA 1OKNA 4G0CA 2WEHA 5CLUA 2FNMA 3RZ5A 1CAKA 1LZVA 1YDDA 1RZAA 5FNHA 4QK2A 3RYVB 3M67A 3S75B 3D9ZA 3M5EA 3S73B 2WD3A 2NWPA 3PJJA 4ZX1A 1Y7WA 4PZHA 1CVCA 4K0TA 5FNLA 4M2VA 2FOUA 5EKJA 1Z97A 4M2RA 3R17B 4XIXA 3M1KA 3N4BA 1H9QA 4Q83A 1I8ZA 2F14A 1CA3A 3B4FA 5EHEA 3MNAA 4FPTA 2FOSA 1Z93A 3MNIA 4K0ZA 3TVNX 3U45X 1Z9YA 5E2MA 4GL1X 1FSNA 4E4AA 2NWZA 1YO0A 4CACA 4QIYA 3ML5A 1IF9A 3MWOA 1H4NA 3V3JA 1XPZA 3V3HB 4MDLA 12CAA 3JXFA 4Q7PA 2H15A 5G01A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NXT A;  2NN1 A;  3V5G A;  3MNH A;  3SAP A;  3N3J A;  4YGN A;  5A25 A;  1I9P A;  1FLJ A;  4ZWX A;  1CAZ A;  2O4Z A;  2FOY A;  3PO6 A;  3PYK A;  4R5A A;  4CNV A;  1BNQ A;  1ZSB A;  1CIM A;  4FRC A;  5DVX A;  3EFT A;  4PYX A;  3K34 A;  3M2N A;  3MHC A;  4ZAO A;  5FNM A;  2NMX A;  4QEF A;  5JEG B;  1ZFK A;  3DCW A;  1TG9 A;  4FIK A;  1G45 A;  1CNW A;  1THK A;  5FNK A;  1HEB A;  3FW3 A;  5FLT A;  4FL7 A;  4CQ0 A;  1OKL A;  5SZ3 A;  5EZT X;  5BRW A;  2FOQ A;  4RUY A;  3NB5 A;  4QTL A;  3D8W A;  3RZ7 A;  1LUG A;  4QSI A;  1BNM A;  4E49 A;  1G46 A;  5SZ6 A;  2X7T A;  2POU A;  1DMY A;  3M14 A;  4QJX A;  5E2N A;  4WUP A;  1CAH A;  1V9E A;  4Q8X A;  5DSI A;  1BNU A;  4Q8Y A;  4RIV A;  4WW8 A;  1CNH A;  1BN4 A;  1JCZ A;  4RIU A;  1CAO A;  1YO1 A;  4Q78 A;  4FVN A;  3KNE A;  4Z0Q A;  4PYY A;  4Q07 A;  3S76 A;  2WEJ A;  4KNN A;  4JS6 A;  5E28 A;  5DRS A;  1TTM A;  4Q90 A;  5G03 A;  3S8X A;  5FDI A;  4XE1 A;  3MHO A;  2NWO A;  4RFC A;  3T5Z A;  4UOV A;  2NNS A;  3ZP9 A;  1G4O A;  4RN4 A;  1UGD A;  3RJ7 A; 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