The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
6
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Solution Structure of the C-Terminal SH3 Domain of Grb2 Complexed with a Ligand Peptide: A Ligand Exchange Model of the SH3 Domain
rcsb |
| molecule tags |
Signaling protein
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
|
| total genus |
6
|
| structure length |
59
|
| sequence length |
59
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2001-01-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1WYX A; 4LN2 A; 2KBT A; 1GFD A; 4JZ4 A; 5IXF A; 1WX6 A; 5FWC A; 2IIM A; 3GBQ A; 2LCS A; 3VS1 A; 1QCF A; 2NUZ A; 1RLP C; 4OMP A; 1VYT A; 4JJD A; 1HSQ A; 2DMO A; 2XMF A; 4FSS A; 2A08 A; 1MV0 B; 2O9S A; 2W10 A; 4D8K A; 2DLP A; 1GRI A; 3H0I A; 1NEG A; 2DM1 A; 1ZUY A; 2X3W D; 1SHF A; 1G83 A; 1KFZ A; 2K2M A; 2HDA A; 4LUD A; 1AWJ A; 2J6K A; 1GCQ C; 2FO0 A; 1PKS A; 1JXM A; 2DF6 A; 2FG0 A; 4F16 A; 1RI9 A; 2JMA A; 1UDL A; 2DL5 A; 1W70 A; 4WCI A; 2D0N A; 1HJD A; 2KRN A; 4OMM A; 4Z8A A; 2GGR A; 2LJ1 A; 1AWO A; 1YWO A; 2VWF A; 2PZ1 A; 3NPF A; 4J9D A; 2CT3 A; 1ZBJ A; 1SSH A; 1UUE A; 4AFS C; 2LMJ A; 3PVQ A; 2ED1 A; 2L3Q A; 1SRM A; 1AVZ C; 3EG3 A; 2DL3 A; 2HSP A; 2KYB A; 1M3A A; 1UG1 A; 1FMK A; 1CKA A; 2AZS A; 3TVT A; 2V1Q A; 1K0S A; 2L0A A; 1BU1 A; 1GBQ A; 2RQU A; 2BZY A; 2EKH A; 1OOT A; 5IHN A; 4RTZ A; 2KYM A; 2EGA A; 2ABL A; 1ZUU A; 1H3H A; 1Z9Z A; 1AWX A; 2J05 A; 1OPK A; 5GJV B; 2VKN A; 3SHW A; 1ZLM A; 3UA7 A; 3EHR A; 2V1R A; 1E6G A; 4OML A; 2BTT A; 3R6N A; 2CT4 A; 2F2X A; 4DEX A; 1I07 A; 3VS3 A; 2P4R A; 1MUZ A; 1PRL C; 2KT8 A; 1M3B A; 1SPK A; 2SRC A; 1U5S A; 1WIE A; 1OV3 A; 3VS4 A; 1QKW A; 5IH2 A; 4F14 A; 1WDX A; 2CSI A; 2JW4 A; 1BB9 A; 4OMQ A; 1ZSG A; 3REB B; 1M3C A; 1UFF A; 3H0H A; 2FPF A; 1JEG A; 4ESR A; 3M0R A; 2LP5 A; 3EG1 A; 4K11 A; 5FW9 A; 4J9I A; 4LNP A; 2FPD A; 1X43 A; 1KIK A; 4X1V A; 2RF0 A; 2H8H A; 3PVL A; 1CKB A; 2KEA A; 2CH4 W; 1PWT A; 2I0N A; 3I5S A; 2KRM A; 2VVK A; 1H92 A; 2C0O A; 4Y92 A; 2MCN A; 1GBR A; 5I11 A; 2A37 A; 1UJY A; 2K6D A; 4CC3 A; 4CC7 A; 2YDL A; 2CSQ A; 2EYW A; 1GCP A; 1NEB A; 2EVR A; 2ROL A; 3TSZ A; 2YT6 A; 4LUE A; 1V1C A; 2JMC A; 1UEC A; 1RLQ C; 5L23 A; 4AG1 C; 2YUQ A; 2FRW A; 2K79 A; 1X6B A; 4EIK A; 2DA9 A; 1NLO C; 5FWB A; 4AG2 C; 1E7O A; 2JT4 A; 4RTT A; 3ZL7 C; 4ZNX A; 5IXB A; 5HCK A; 4J9C A; 5IHK A; 3VS5 A; 2KRO A; 1VYV A; 2O31 A; 2PNI A; 4RTX A; 2OJ2 A; 2EGC A; 2LZ6 B; 3JV3 A; 1UHF A; 1X27 A; 2K9G A; 4RTY A; 1T0J A; 4JJC A; 3RBB B; 3THK A; 2DIL A; 1X2K A; 1K1Z A; 2A36 A; 2KXC A; 3C0C A; 1EFN A; 3I5R A; 5EC7 A; 1SRL A; 1X2Q A; 3IQL A; 2DBK A; 2YSQ A; 1ABQ A; 2JM9 A; 2E5K A; 3VS0 A; 3LH5 A; 1YNZ A; 3U23 A; 3VRZ A; 2KR3 A; 1JQQ A; 1PKT A; 2FPE A; 1JO8 A; 4A63 B; 1K4U S; 1A0N B; 1X6G A; 3EGU A; 2JTE A; 4KRT A; 2CUD A; 2JS0 A; 2EYZ A; 1UJ0 A; 2QDL A; 4HVU A; 4RTW A; 3NHN A; 1K9A A; 2LJ3 A; 2LX7 A; 3VS6 A; 1I1J A; 1GCQ A; 4J9E A; 1NYG A; 1Y57 A; 4IIO A; 2LQW A; 3FJ5 A; 4E6R A; 3A98 A; 3NGP A; 1NM7 A; 3EG2 A; 1RUW A; 1OEB A; 2AKK A; 4JJB A; 2EPD A; 2PTK A; 1BK2 A; 2RN8 A; 1T3S A; 1M30 A; 2EW3 A; 3M0U A; 1TG0 A; 4M4Z A; 1VA7 A; 3UF4 A; 1UHC A; 1NYF A; 3EG0 A; 2HEQ A; 4J9B A; 3VRY A; 4IIM A; 2AK5 A; 2B86 A; 4GLM A; 1E6H A; 5ECA A; 2L2P A; 1LCK A; 1M8M A; 3O5Z A; 1B07 A; 1VYU A; 2GQI A; 1BBZ A; 2RQV A; 1AOJ A; 2CH4 A; 1QWF A; 2CDT A; 1TUD A; 2M51 A; 1JXO A; 4HXJ A; 2MOX A; 1Y0M A; 2HCK A; 2RQR A; 3RNJ A; 1MV3 A; 1UTI A; 3QWY A; 1KSW A; 1UE9 A; 2ENM A; 2RQT A; 2GNC A; 3M0T A; 2LJ0 A; 2O88 A; 2AZV A; 2RPN A; 1N5Z A; 1AD5 A; 2KGT A; 1GL5 A; 2DVJ A; 2NWM A; 4J9H A; 2MIO A; 1X69 A; 1B3Q A; 5I22 A; 1K0X A; 3EHQ A; 2J06 A; 2AKL A; 2D1X A; 1PRM C; 2RNA A; 3M0Q A; 2D8J A; 2K7A A; 2L3P A; 1J3T A; 2SEM A; 4RTV A; 2EYX A; 1XOV A; 2DBM A; 1AEY A; 2DL8 A; 3SEM A; 2HBW A; 4AFQ C; 1KJW A; 2DX1 A; 2EQI A; 2F2W A; 1IO6 A; 1ZUK A; 1T3L A; 4Z88 A; 1AZE A; 4Z89 A; 1WFW A; 5GJW B; 3NMZ C; 1ABO A; 2GTJ A; 2RMO A; 3CQT A; 2EGE A; 3UAT A; 4QT7 A; 2O2O A; 3I9Q A; 2KE9 A; 3TSW A; 4ORZ A; 5IHI A; 4CC2 A; 3KFV A; 1M27 C; 1WXU A; 4LE9 A; 2J6O A; 2DL7 A; 1NLP C; 4CC4 B; 1NG2 A; 2DJQ A; 3VS2 A; 2EYY A; 2CRE A; 1PNJ A; 2J6F A; 1UGV A; 1QWE A; 1WXB A; 2ED0 A; 4OMN A; 4RUG A; 1W1F A; 2W0Z A; 4DEY A; 1Z9Q A; 2GBQ A; 3VS7 A; 3QWX X; 1U3O A; 2D8H A; 2ESW A; 1JU5 C; 3H0F A; 4HVV A; 3REA B; 1TUC A; 1YWP A; 2G6F X; 4J9G A; 1QKX A; 2DRK A; 1YP5 A; 4J9F A; 1ZX6 A; 2F2V A; 2JS2 A; 2GTO A; 2KT1 A; 2YUO A; 2OAW A; 2O9V A; 1SHG A; 2OI3 A; 2CUB A; 2DNU A; 2BZX A; 2DYB A; 1ARK A; 2DRM A; 3H41 A; 1WA7 A; 3ULR B; 1H8K A; 3PE0 A; 4GBQ A; 4HVW A; 1G2B A; 1SEM A; 2LNH B; 2DE0 X; 2KXD A; 2RQW A; 1U06 A; 4AFU C; 2FRY A; 2M0Y A; 2X3X D; 2C0I A; 4OMO A; 1QLY A; 1GFC A; 4D8D A; 1AWW A; 1S1N A; 4F17 A; 4HCK A; 2J7I A; 2KNB B; 1I0C A; 2YUP A; 2ECZ A; 1WXT A; 2DL4 A; 1HD3 A; 2YUN A; 1T0H A; 2BZ8 A; 3I35 A; 2A28 A; 2JM8 A; 1PHT A; 3M0P A; 1WLP B; 4JPB W; 1CSK A; 1K76 A; 4JZ3 A; 1FYN A; 2ROT A; 2FEI A; 1YCS B; 3UA6 A; 2JXB A; 2EBP A; 1AZG B; 2L3S A; 4R0K A; 2C0T A; 4RTU A; 1WI7 A; 2KRS A; 2K3B A; 4AFZ C; 3M0S A; 1OPL A; 2LQN A; 1YN8 A; 1W6X A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1GFD A; 2WSC E; 2M1H A; 3G6E A; 1WX6 A; 5FWC A; 5GAN h; 3CCJ T; 2NUZ A; 4M77 E; 5FU6 B; 4OMP A; 1QCO A; 4JJD A; 4GLK A; 1M1K C; 4DOV A; 2W10 A; 2K3X A; 4C5I A; 3AHU A; 4OGC A; 1NEG A; 2MMP A; 3E2U A; 1SHF A; 1KFZ A; 2X51 A; 1BI1 A; 2ZPF B; 4BE0 A; 2FO0 A; 2FG0 A; 1RI9 A; 4KUL A; 5GAN 7; 3H9N A; 1W70 A; 2E6Z A; 5LJ3 j; 5A0G A; 1ZSZ C; 4FT4 A; 4OMM A; 3CCS T; 4Z8A A; 2O01 E; 2A3L A; 2VWF A; 2GQV A; 4BI4 A; 2O4X B; 1M2V B; 4F04 B; 2R57 A; 3PVQ A; 2QAS A; 2ED1 A; 3FC3 A; 2FZC B; 2HL3 A; 3HTR A; 3JCM W; 2AT1 B; 5CKH A; 2DPP B; 8AT1 B; 2QG9 B; 2XDD A; 2KYB A; 3OS1 A; 2K3Y A; 2O4X A; 1M2V A; 3CCM T; 3CC2 T; 1CKA A; 1YI2 Q; 2V1Q A; 2QAZ A; 4KH1 B; 1BU1 A; 1GBQ A; 4J8O A; 2ZPH B; 2KVQ G; 4JRQ A; 1VQL Q; 4A4E A; 1R77 A; 3LYI A; 5IHN A; 3UT1 A; 1H3H A; 4IUP A; 3QSU A; 2NUT B; 4FYW B; 4TVR A; 1Q86 U; 3FB9 A; 2VKN A; 3SHW A; 4M78 C; 1ZLM A; 2P0K A; 4C92 F; 1S72 Q; 3JCM P; 4C8Q A; 3EHR A; 2EQU A; 3CCQ Q; 2LT1 A; 1MUZ A; 5A0D A; 4MZP A; 1PRL C; 4B9X A; 3WVD B; 1SPK A; 1TSF A; 2SRC A; 1U5S A; 3M53 A; 1WIE A; 1WDX A; 1NJI C; 4OMQ A; 4M7A C; 4BDY A; 2WSE E; 3H0H A; 2FPF A; 3OQ5 A; 4K11 A; 5FW9 A; 4KUD K; 4LNP A; 3MEU A; 4X1V A; 2RF0 A; 4RMO A; 3CCV Q; 1XNI A; 3L2Q A; 3TQ7 P; 1BI2 A; 2PUK B; 2QQR A; 5KYY B; 1KQS S; 3CD6 Q; 3CCM A; 1ZA1 B; 2CZ7 B; 4LD9 K; 5I2M A; 3I5S A; 2YRV A; 2VVK A; 4X9C A; 5CCA A; 5CQX A; 4WF2 A; 4L59 A; 5KYY A; 2C0O A; 2XDP A; 3QZ5 B; 1WHL A; 4FT2 A; 1YIJ T; 1OQK A; 2K6D A; 1UJY A; 5CKB A; 4PK4 A; 3L2W A; 2EVR A; 2YT6 A; 1F1B B; 2JMC A; 2E6N A; 4XTW A; 1VQ4 A; 1RLQ C; 4ZGD B; 3OYG A; 4KT0 E; 5KE3 A; 2YUQ A; 4CRI A; 1OZ2 A; 2FRW A; 2K79 A; 5DLQ E; 3RIR A; 2CZ0 B; 4BI8 B; 1NLO C; 3CCL A; 3E9G A; 1TUG B; 1E7O A; 4RTT A; 5EG2 A; 4PJO B; 2EFI A; 5HCK A; 4J9C A; 2KRO A; 3VU3 C; 3X28 B; 4RTX A; 1YHQ T; 3C95 A; 3L2Z A; 3V8L A; 2K5F A; 3OW2 P; 2ZAE A; 4JRI A; 4KGV B; 1N9R A; 4PJO A; 1UGQ B; 2D0Q B; 2OTL Q; 3EAE A; 3JCM b; 3QII A; 1I5O B; 4JJC A; 2E12 A; 4FSX A; 4O6J A; 1VQK Q; 1KC8 U; 4XQ3 A; 3ER0 A; 5CR2 A; 4Z02 A; 4V2S A; 3CXC S; 4VUB A; 2QK0 A; 1VQ6 Q; 3EH1 A; 3OYE A; 2F5K A; 1ABQ A; 5GAO p; 3LH5 A; 1YIJ A; 3INZ A; 3PIP A; 1PKT A; 3HRS A; 2LC4 A; 7AT1 B; 3OMG A; 1K4U S; 1AHJ B; 1LOJ A; 1WHK A; 3CC4 Q; 2KQW A; 4C0Z A; 5CKD A; 3MPU B; 2QDL A; 2VUB A; 4RTW A; 2JVV A; 4ANJ A; 1GCQ A; 1V76 A; 3RMS A; 3TEE A; 3M59 A; 4ZN3 A; 1NYG A; 1Y57 A; 2EAY A; 2NUP B; 4MMK A; 3FJ5 A; 1YHQ A; 1QVG P; 3A98 A; 3NGP A; 1NM7 A; 2LRQ A; 3EG2 A; 1M90 U; 4GY5 A; 1OEB A; 2RN8 A; 1RAF B; 2NUP A; 2EW3 A; 4C92 G; 2CP6 A; 5KYN A; 1VA7 A; 2XKO C; 1VQ5 Q; 4LXC A; 3UF4 A; 2MK5 A; 1QVF S; 4IIM A; 4GLM A; 1E6H A; 2L2P A; 1M8M A; 3OS0 A; 4X9D A; 1VYU A; 2XHC A; 2RQV A; 1AOJ A; 1M1F A; 2CH4 A; 1TWB A; 4C5H A; 2RHI A; 1QWF A; 1QP2 A; 1Y0M A; 1KG1 A; 1SKU B; 5FU7 B; 3S3M A; 3PTA A; 1UTI A; 4C0D C; 2KMT A; 2RHY A; 1UE9 A; 2NYS A; 1MND A; 2ENM A; 2AZV A; 2YXY A; 1HK9 A; 2HQE A; 1JJ2 A; 2NLU A; 2RPN A; 2LQK A; 1Q82 R; 3A8O B; 1AD5 A; 2KGT A; 4J9H A; 4BB7 A; 5I22 A; 4M7D E; 3CCE Q; 4A4F A; 2D1X A; 2KSS A; 3MP8 A; 1J3T A; 4F7U F; 4PJO D; 2ZPB B; 3OBY A; 2DBM A; 2VXF A; 2DL8 A; 3OYB A; 2E70 A; 2HBW A; 2EQI A; 2F2W A; 4IKF A; 4PKC C; 4HT9 A; 4HT8 A; 1D0Z A; 1NE8 A; 4A54 A; 2IPO B; 2FB7 A; 2D6F A; 3I56 Q; 2KAF A; 1ABO A; 2RMO A; 2EGE A; 3HP9 A; 4MDX A; 5GAN 5; 2GFU A; 4QT7 A; 3QXE B; 2DK3 A; 4ORZ A; 3G6E Q; 4ZTF A; 4ZGE B; 5CK9 A; 1M27 C; 1WXU A; 1D0X A; 4C8Q C; 2VB6 A; 2DL7 A; 4KBM B; 1NG2 A; 5CKE A; 4Y28 E; 3BY7 A; 2EYY A; 3C94 A; 3MO8 A; 2J6F A; 1UGV A; 1VQP A; 5GMK i; 1QWE A; 2ED0 A; 4OMN A; 4RUG A; 4DEY A; 1VQO A; 2RI5 A; 1U3O A; 2H3J A; 3OYH A; 4HVV A; 3JB9 J; 4BE1 A; 3REA B; 4DBF A; 1JJ2 S; 5LJ5 g; 4M78 G; 1ZX6 A; 2F2V A; 1Q86 C; 2IVW A; 4KH0 B; 4YTL A; 1YJN A; 3HHT B; 1KK7 A; 2DEU A; 3LW5 E; 2DJZ A; 5I21 A; 3H41 A; 1W2B P; 3PE0 A; 4GBQ A; 4M7A G; 4HVW A; 2L8D A; 1G2B A; 3M4Y A; 2RK1 A; 2X4X A; 2HQX A; 4BDZ A; 2OTL T; 4PFO A; 1Q7Y U; 1AWW A; 4M75 E; 1S1N A; 1WPY A; 2QA4 T; 1VOM A; 1K8A R; 3NFC A; 2J7I A; 4E7Z A; 4JDS A; 3RKW A; 1WXT A; 4KUI A; 4FYX B; 1T0H A; 3CC7 Q; 3O8V A; 1VQ8 A; 8ATC B; 1VQ7 Q; 1FYN A; 3L2V A; 2VYT A; 2FEI A; 3UA6 A; 2Z0W A; 2EBP A; 4PJO C; 5GAN 6; 2K2V A; 4PFZ A; 4R0K A; 2COW A; 3CBO A; 3CPF A; 3G1J A; 4PNO A; 1PD0 A; 1BIA A; 2KRS A; 3QYG B; 4CI0 C; 2K3B A; 4AFZ C; 2LCC A; 3RKY A; 1K73 U; 1W6X A; 1WYX A; 4LN2 A; 2R5M A; 2JOY A; 3M5A A; 2H3E B; 3RES A; 2DXU A; 2IIM A; 3VS1 A; 2DTO A; 1VQ9 Q; 3OBW A; 3A5Z B; 1IB8 A; 3PGG A; 2DMO A; 2XMF A; 4C8Q F; 3JCM d; 4DOW A; 4XTZ A; 4F7U G; 1GRI A; 2DM1 A; 1ZUY A; 5M9O A; 2QA4 A; 2X3W D; 1M1K R; 3QDR B; 1KC8 C; 3M54 A; 2HDA A; 2EJ9 A; 2J6K A; 1GCQ C; 3QZ9 B; 2RM4 A; 3VKI A; 4F16 A; 4JLI A; 2JMA A; 1AT1 B; 3PNW C; 1VQ4 Q; 2FL7 A; 5GAM d; 3JCM e; 2QGF B; 3QHS A; 2GGR A; 2LJ1 A; 1AWO A; 1ZBJ A; 1SSH A; 1UUE A; 3MHX A; 1N6A A; 3CCL Q; 2LMJ A; 3HSB A; 2L3Q A; 3OYF A; 5GAN e; 1AVZ C; 2CKK A; 1I81 A; 3EG9 B; 2HSP A; 1IGQ A; 2ZPG B; 3MEV A; 1FMK A; 4Y91 A; 3E1S A; 3JB9 F; 2RQU A; 2BZY A; 1OOT A; 4J6X A; 4A53 A; 5LJ5 h; 1M90 C; 1ZUU A; 2QEX Q; 3A8H B; 1Z9Z A; 3G71 T; 1MMA A; 1I5L A; 5GAM f; 1OPK A; 2LNV A; 3CCR T; 2E41 A; 2BE9 B; 3UA7 A; 1ACM B; 4PJO F; 1M8V A; 2F69 A; 2KT8 A; 4L5G A; 1M3B A; 3VYH B; 1KQ1 A; 4OF1 A; 3HKS A; 5GAM j; 1OV3 A; 2YWW A; 5IH2 A; 4EDU A; 1LPL A; 3REB B; 1M3C A; 1UFF A; 1RL2 A; 4BD3 A; 1JEG A; 4ESR A; 3DLL A; 9ATC B; 3PIO A; 1YJW Q; 3L2U A; 1VQN T; 1YBY A; 3OYN A; 3L2R A; 3ME9 A; 1NJI R; 2H8H A; 1OX9 A; 3MP1 A; 3WXM B; 2I0N A; 2KRM A; 3GNG A; 3OYC A; 1OI1 A; 3OYK A; 4PLI A; 2MCN A; 3LWI A; 2A37 A; 5GAN 3; 2YLB A; 2ROL A; 2P84 A; 1IGU A; 3QDF A; 3I55 A; 1IXD A; 1UEC A; 3KBG A; 3Q1J A; 3CCR A; 5L23 A; 2FZG B; 2QYZ A; 2QGG A; 4EIK A; 4N4I A; 1FXX A; 3QBY A; 2CZ6 B; 3URG A; 3ZL7 C; 5DM7 R; 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