The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
83
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structure length |
83
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Chain Sequence |
AEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKISPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT
|
| publication title |
Crystal structure of P13K SH3 domain at 20 angstroms resolution.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
21
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| structure length |
83
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| sequence length |
83
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-08-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KIK A; 1AZG B; 2RPN A; 3U23 A; 1WFW A; 2EGC A; 2EVR A; 1OEB A; 3EHQ A; 1WYX A; 1AWO A; 1U3O A; 2HEQ A; 1QWF A; 3NPF A; 2L3Q A; 2VKN A; 1PKS A; 3C0C A; 1UE9 A; 4JPB W; 2BTT A; 4LN2 A; 4Z88 A; 2G6F X; 2ROL A; 1I07 A; 2B86 A; 3SHW A; 1FYN A; 1GRI A; 2DL7 A; 2OJ2 A; 4ESR A; 1EFN A; 1WXB A; 4E6R A; 1YCS B; 2LP5 A; 2X3X D; 4JJD A; 4JZ3 A; 1GFC A; 1JO8 A; 2BZY A; 3EGU A; 2EYW A; 1U06 A; 3TVT A; 3VS5 A; 2V1Q A; 4LUE A; 4D8D A; 1Y0M A; 2GBQ A; 2AKK A; 2KRM A; 1WXT A; 2YDL A; 2KR3 A; 4AFS C; 2SRC A; 4J9G A; 3VS1 A; 1OV3 A; 2RNA A; 2DL4 A; 2GGR A; 1A0N B; 1GBR A; 2DBK A; 2CUD A; 2YUP A; 2OI3 A; 2LZ6 B; 1Y57 A; 2DNU A; 4OMN A; 2KXD A; 1B07 A; 4CC7 A; 1QKW A; 1GBQ A; 2LMJ A; 3M0P A; 2ABL A; 2NWM A; 1XOV A; 2DIL A; 4K11 A; 1JQQ A; 3KFV A; 2SEM A; 2KRO A; 3QWX X; 2ECZ A; 5IHK A; 2DL8 A; 2L3S A; 1K1Z A; 2DM1 A; 4RUG A; 2F2W A; 2J05 A; 4GLM A; 1AOJ A; 1X2K A; 4ZNX A; 1OOT A; 4DEY A; 5FWC A; 4RTZ A; 1M27 C; 3LH5 A; 1JEG A; 3UA6 A; 1OPK A; 2YUN A; 2C0T A; 2W10 A; 5GJV B; 2O9S A; 4IIM A; 1ZUY A; 1UDL A; 1QCF A; 2QDL A; 2MCN A; 2D0N A; 2AZV A; 2JMA A; 2GTO A; 2DVJ A; 2KGT A; 3PVL A; 1CKB A; 2A28 A; 1H92 A; 4DEX A; 1PRL C; 2PZ1 A; 3VRZ A; 2JT4 A; 1V1C A; 2CT3 A; 2HSP A; 3UA7 A; 2EYX A; 4OMM A; 1X43 A; 2L2P A; 4J9D A; 3NMZ C; 1PNJ A; 2ESW A; 3VRY A; 1H3H A; 1OPL A; 4Z8A A; 2FEI A; 1AEY A; 4HVW A; 4RTT A; 2YUQ A; 1WIE A; 2FG0 A; 1QWE A; 2KE9 A; 2IIM A; 3O5Z A; 5IHN A; 3UF4 A; 3REA B; 2DL5 A; 3CQT A; 3RBB B; 1K76 A; 1GFD A; 4X1V A; 2DF6 A; 4WCI A; 1S1N A; 1X6B A; 2H8H A; 4RTY A; 1PHT A; 1TUC A; 2DRM A; 2J6O A; 1I1J A; 1NYF A; 2O9V A; 2ENM A; 4CC4 B; 2J06 A; 3M0U A; 2PTK A; 1VA7 A; 1T3S A; 1K9A A; 2EW3 A; 2KBT A; 2E5K A; 1NYG A; 2KYB A; 2O31 A; 3RNJ A; 3EG2 A; 2FPD A; 3ULR B; 2K3B A; 1TUD A; 3M0T A; 2MOX A; 4AFZ C; 4CC3 A; 2LJ1 A; 4Y92 A; 1BK2 A; 1GCP A; 1YN8 A; 2L0A A; 2F2V A; 2VVK A; 3EHR A; 1X2Q A; 1NG2 A; 1M3B A; 2GQI A; 4QT7 A; 1T0J A; 1UEC A; 1HJD A; 3UAT A; 2EYZ A; 1QKX A; 4ORZ A; 2F2X A; 2K2M A; 2K6D A; 4RTX A; 5FWB A; 2EQI A; 2GNC A; 2PNI A; 1MV3 A; 1NLO C; 5HCK A; 2VWF A; 1CSK A; 1W6X A; 2DBM A; 2C0I A; 4JZ4 A; 1W1F A; 3REB B; 2O2O A; 4FSS A; 3VS0 A; 4A63 B; 2JXB A; 1LCK A; 1GCQ A; 2GTJ A; 3VS4 A; 1ZBJ A; 3TSW A; 2JW4 A; 1KSW A; 1NEG A; 2JM8 A; 4EIK A; 4OMQ A; 1JXM A; 1HD3 A; 5IXF A; 1IO6 A; 3IQL A; 1WX6 A; 2O88 A; 2DL3 A; 1H8K A; 2V1R A; 3EG1 A; 1ABQ A; 1PRM C; 2CH4 W; 2LNH B; 4HVU A; 1T0H A; 2HDA A; 1K4U S; 1X6G A; 4RTW A; 1UJY A; 2NUZ A; 2HBW A; 1BBZ A; 1M30 A; 2JM9 A; 5I11 A; 1M8M A; 1NEB A; 2AZS A; 1MUZ A; 1UG1 A; 1WDX A; 1G83 A; 4J9B A; 4HVV A; 3M0S A; 1MV0 B; 3GBQ A; 4D8K A; 1UUE A; 2EGE A; 2A08 A; 4F17 A; 1RLQ C; 2CDT A; 4F16 A; 1W70 A; 2XMF A; 1PKT A; 2LX7 A; 1J3T A; 2J7I A; 4LNP A; 1N5Z A; 4HXJ A; 3I5S A; 1SEM A; 4OMO A; 1YP5 A; 2RN8 A; 1YWO A; 2YT6 A; 1BB9 A; 1SHG A; 1WXU A; 2DYB A; 4RTV A; 2RMO A; 1X69 A; 2YSQ A; 4AFQ C; 2FO0 A; 1E7O A; 5IH2 A; 2ROT A; 1PWT A; 1NM7 A; 1KJW A; 2LCS A; 2D8J A; 2MIO A; 2X3W D; 4J9H A; 5FW9 A; 3I5R A; 2KXC A; 2M51 A; 5EC7 A; 2DRK A; 2FPF A; 2CT4 A; 2KRS A; 5IXB A; 4J9I A; 2LQN A; 1GL5 A; 1WI7 A; 2EPD A; 1B3Q A; 3M0Q A; 1ZUK A; 1KFZ A; 3ZL7 C; 2BZX A; 2JS0 A; 3EG3 A; 2KEA A; 4RTU A; 1JXO A; 1E6H A; 4JJC A; 4R0K A; 2JTE A; 2A37 A; 4KRT A; 2LJ3 A; 2CRE A; 2LJ0 A; 2KNB B; 1M3A A; 2AK5 A; 2C0O A; 3THK A; 1WLP B; 4OML A; 1ABO A; 1GCQ C; 1UTI A; 2CH4 A; 2J6K A; 2A36 A; 1SHF A; 4J9F A; 5ECA A; 5IHI A; 1G2B A; 2CSQ A; 2DJQ A; 2RQT A; 2K79 A; 1ARK A; 2W0Z A; 1Z9Q A; 1BU1 A; 2RQU A; 4M4Z A; 2EBP A; 2RF0 A; 1AD5 A; 3H41 A; 1X27 A; 2FRW A; 3PVQ A; 3I9Q A; 1JU5 C; 2EKH A; 2KRN A; 3JV3 A; 3VS6 A; 3A98 A; 4F14 A; 2FPE A; 3R6N A; 4HCK A; 2KT8 A; 1VYU A; 1K0X A; 1U5S A; 4CC2 A; 2ED1 A; 1VYV A; 1I0C A; 2JMC A; 2RQV A; 1CKA A; 1RUW A; 1ZX6 A; 1AZE A; 4Z89 A; 2D8H A; 3EG0 A; 4JJB A; 2DMO A; 2K7A A; 5I22 A; 2I0N A; 1ZLM A; 2CUB A; 2OAW A; 4LE9 A; 5GJW B; 2DA9 A; 2KYM A; 1SPK A; 2DLP A; 1UFF A; 1UJ0 A; 2ED0 A; 1RI9 A; 3SEM A; 2J6F A; 2P4R A; 1ZUU A; 3NGP A; 3I35 A; 4GBQ A; 2AKL A; 3TSZ A; 3NHN A; 2K9G A; 1UGV A; 1SRM A; 2EYY A; 2HCK A; 3M0R A; 3VS2 A; 3QWY A; 1K0S A; 2LQW A; 3H0F A; 1TG0 A; 1YNZ A; 1AWX A; 1FMK A; 1NLP C; 3PE0 A; 1AWJ A; 4IIO A; 4OMP A; 2FRY A; 1SRL A; 1UHC A; 2KT1 A; 1T3L A; 3H0I A; 2EGA A; 2M0Y A; 4AG1 C; 1SSH A; 1UHF A; 2BZ8 A; 2YUO A; 3VS3 A; 1QLY A; 2DX1 A; 1YWP A; 3VS7 A; 1E6G A; 3FJ5 A; 1VYT A; 2D1X A; 5L23 A; 2CSI A; 3H0H A; 2RQW A; 1RLP C; 1Z9Z A; 4LUD A; 4AFU C; 1HSQ A; 4J9E A; 2L3P A; 2RQR A; 1WA7 A; 4AG2 C; 1AWW A; 2JS2 A; 1ZSG A; 1M3C A; 1AVZ C; 2DE0 X; 4J9C A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LVM A; 1VQP Q; 3I55 T; 1WHM A; 4JLI A; 3CCL T; 3LGL A; 3RER A; 4OGE A; 2HEQ A; 1IB8 A; 1QWF A; 1NJI U; 1PKS A; 1M2V A; 2CP7 A; 1SG5 A; 2QQ9 A; 4Z88 A; 2QEX T; 2HMA A; 4OVA A; 1Q81 R; 1WXB A; 3J7A F; 2HQH A; 2FHD A; 3LWH A; 1GFC A; 2NUP B; 4QQ6 A; 1YHQ Q; 3OY9 A; 1MNE A; 3MEV A; 3LGF A; 5L8R E; 2RI2 A; 3FLG A; 5GAO m; 3CCQ A; 8ATC B; 1VQ9 A; 2M0O A; 3OA6 A; 1YIJ A; 4D8D A; 2CZ1 B; 1M8V A; 2LQK A; 1Q82 C; 5A2Q E; 3QBY A; 2QQA A; 2DZC A; 5LJ3 j; 2EIF A; 2YDL A; 2YLB A; 2KR3 A; 3CC4 T; 4A53 A; 3SD4 A; 2COY A; 7AT1 B; 1VQ7 T; 2K3Y A; 4PJO E; 2DL4 A; 1YJW T; 2GGR A; 3OYG A; 2K4Y A; 2DBK A; 5D7U A; 2CUD A; 2YUP A; 4PJO F; 2GQV A; 1K73 R; 2QA4 Q; 1Y57 A; 4Z02 A; 2DNU A; 1UGS B; 1B07 A; 5CCA A; 1GBQ A; 2ABL A; 4C92 A; 4DOW A; 3E2U A; 5LJ3 e; 4M7D A; 3CPW A; 4NL2 A; 4PFO A; 3V8L A; 4GLM A; 3CCE T; 2KK4 A; 1OOT A; 5FWC A; 3LH5 A; 1JEG A; 4E7L A; 1OPK A; 5HKC A; 1VQL Q; 3QDF A; 2O9S A; 2O01 E; 3CBO A; 4IIM A; 1VQN Q; 4BUG A; 3S3O A; 1VQ4 A; 1OU9 A; 3E19 A; 4M78 E; 4QQG A; 5HY6 A; 3L2R A; 4ZN1 A; 3PVL A; 2AT1 B; 1PRL C; 2PZ1 A; 4M75 C; 3EFO A; 3P8D A; 1WHK A; 2L2P A; 3RKY A; 3ZEH A; 1JBM A; 1M4Z A; 4Z8A A; 1FMV A; 2FEI A; 1RAD B; 1AEY A; 4RTT A; 4PKC C; 4DBH A; 1WIE A; 2FG0 A; 3M54 A; 5IHN A; 4J5Y A; 4C5E A; 5GAN 4; 2DL5 A; 3CQT A; 1K76 A; 1Q86 U; 4JS5 A; 2R5A A; 2DF6 A; 1VQO A; 2QGF B; 1PHT A; 1TUC A; 3ZBD A; 3R6O A; 1NE8 A; 5KYY A; 5FLX E; 1UB4 A; 2ENM A; 3M0U A; 1N6A A; 2QYZ A; 1X01 A; 1VA7 A; 4V2S A; 1Y07 A; 2EAY A; 2DTI A; 2GCX A; 5KYU A; 2OTL T; 2H3J A; 1BK2 A; 2F2V A; 2EJF A; 3INZ A; 5CAI A; 4QT7 A; 1HJD A; 1UEC A; 3JCM V; 2WSF E; 4OP0 A; 3DB4 A; 2EYZ A; 1ZSZ C; 4JRP A; 3CME Q; 4IUP A; 1S72 Q; 5GMK i; 5FWB A; 1M1G A; 2PNI A; 3CCV Q; 1W4S A; 2DD4 A; 1IGU A; 2YHT A; 3M59 A; 2VWF A; 5LJ5 d; 1CSK A; 3X20 B; 1QCN A; 4KH1 B; 3RMQ A; 4OMF B; 4C8Q B; 3I55 Q; 4PJO D; 2DD5 A; 1EX4 A; 4JZ4 A; 2NLU A; 2K5I A; 1KQ1 A; 3CCL Q; 2DET A; 1VQL A; 4FYV B; 5LJ5 f; 3HP9 A; 2QAZ A; 1MMA A; 2RJF A; 4HT9 A; 5KE2 A; 3I56 T; 4OB0 B; 5GAO l; 2M1H A; 1D1B A; 3RKW A; 2XID A; 2QAS A; 1JXM A; 5DLQ E; 3VJP A; 1IO6 A; 3IQL A; 1NPP A; 2L3R A; 2V8I A; 4C0Z A; 5GAM d; 1YI2 Q; 4M7A B; 1KHC A; 3MJX A; 3M53 A; 2A3L A; 2BIV A; 2MMP A; 2DVE A; 3RES A; 2LNH B; 1OZ2 A; 3O8V A; 1ZBX A; 1W2B S; 4M78 D; 2NUZ A; 2X35 A; 4PJO G; 2HBW A; 1BBZ A; 2G3R A; 3MCA B; 5EG2 A; 3CC4 Q; 4DBQ A; 1NEB A; 4B6M A; 1Q86 C; 1VQ5 A; 3M0S A; 1MV0 B; 2JUF A; 1YJW Q; 4PFP A; 1UUE A; 2EGE A; 3VV0 A; 1RLQ C; 3PIP A; 2K2V A; 4J6W A; 1HYO A; 1W70 A; 2XMF A; 4C0D B; 1J3T A; 4LNP A; 2P84 A; 4HXJ A; 3V7C A; 4XTV A; 1SEM A; 2F69 A; 1YWO A; 2YT6 A; 3JCM Q; 4D6W A; 2DYB A; 2RJE A; 2YSQ A; 4AFQ C; 2FO0 A; 3CCE Q; 3SDZ A; 3CMA A; 3X28 B; 4LDX A; 1FX7 A; 1QMC A; 3OS0 A; 2X3W D; 5FW9 A; 2F5K A; 5EC7 A; 1PC0 A; 4EPC A; 3JCM d; 2FPF A; 1LNX A; 4C0F A; 3MP1 A; 2CZ6 B; 2LQN A; 1XJW B; 1GL5 A; 3M0Q A; 2EPD A; 1D3B A; 2M02 A; 2VXE A; 3ZL7 C; 3EG3 A; 1E6H A; 3I55 A; 4R0K A; 2JTE A; 4BI3 A; 2KNB B; 4LDY A; 1U1T A; 3OB9 A; 2C0O A; 2E1H A; 2RHX A; 3THK A; 2VB6 A; 2QEX A; 2A36 A; 4J9F A; 5IHI A; 3BFM A; 1OX8 A; 4C92 C; 2RQU A; 1BU1 A; 2RF0 A; 5IAY A; 2JOY A; 2CP0 A; 3C4S A; 4OB3 B; 2FRW A; 3I9Q A; 4HCZ A; 5GAN d; 4ANJ A; 3JV3 A; 3L1A A; 4HCK A; 2OTL Q; 3NTK A; 1VYU A; 5FRN A; 1RAC B; 3PIO A; 1N27 A; 1M90 R; 4QQD A; 2VGN A; 4CC2 A; 2ED1 A; 9ATC B; 2YLC A; 4NL3 A; 3OBW A; 3MP6 A; 1W2B A; 1VYV A; 1VQ7 A; 1QVG P; 2VXF A; 2JMC A; 1ZX6 A; 4IUQ A; 4EMK B; 3QDR B; 1JJ2 S; 4L5G A; 2Y4X A; 5KE3 A; 3EG0 A; 2HKQ B; 4JJB A; 4C8Q F; 2V8K A; 2JN0 A; 4N4G A; 2I0N A; 3J80 E; 3QJ6 A; 2XG8 D; 4PLL A; 2RJD A; 1VQ4 T; 1WNL A; 5KYW A; 2VAS A; 1N8R U; 3CCE A; 2RHI A; 3G7Z A; 4XTU A; 3C12 A; 1ZUU A; 3EAE A; 1OI1 A; 4M77 B; 3CC2 A; 2EQJ A; 4M7A E; 1G3Y A; 3NHN A; 2K9G A; 1UGV A; 1V76 A; 4M7A F; 2H3E B; 3CCU Q; 2RI3 A; 3HFN A; 3M0R A; 2FL7 A; 3VS2 A; 3I56 Q; 1K0S A; 2O4X A; 1TG0 A; 4BY6 B; 1O9S A; 1AWJ A; 2LCL A; 3MKD A; 4IIO A; 1UHC A; 2E5Q A; 1C6V X; 2DJZ A; 3OW2 P; 1M2O A; 1VQO T; 2KQW A; 1NZ9 A; 3MPU B; 1QVF S; 2EGA A; 4AG1 C; 2X9H A; 5IT9 E; 3VS7 A; 1E6G A; 2EKO A; 4RCC A; 4XAX B; 2D1X A; 5L23 A; 5GAM j; 3QZ5 B; 5LJ5 e; 3H0H A; 3OYE A; 1X6O A; 2B8A A; 4R55 A; 3LW5 E; 3GIB A; 2JS2 A; 4WF2 A; 4HA8 A; 4J9C A; 1KIK A; 1BKB A; 1ZA2 B; 4E7Z A; 1M1F A; 1AZG B; 2P0P A; 2RPN A; 1K9M U; 5GMK m; 4BAC A; 2JZ2 A; 1SKU B; 4HKE A; 4EMG A; 1WFW A; 2OTL A; 3H9N A; 3EHQ A; 2FYK A; 1AWO A; 3QXE B; 1U3O A; 5GAM e; 3CD6 A; 1Q7Y R; 3WVD B; 4A4G A; 1UE9 A; 2C06 A; 2G6F X; 1D1A A; 1K8A U; 1FYN A; 5LL6 S; 4ATO A; 4ESR A; 4KGV B; 3JCM X; 4JJD A; 4JZ3 A; 4E2F B; 2HNI A; 1JO8 A; 1YJ9 A; 3TCJ A; 2EYW A; 3P8H A; 1U06 A; 3A8L B; 3TVT A; 3OYF A; 5DM7 R; 4LUE A; 4P5N A; 4FSX A; 2KVQ G; 3OYM A; 5CKF A; 2BKD N; 4MZT A; 2GBQ A; 2KRM A; 4JJN K; 3BY7 A; 3OYH A; 4DBF A; 3HSB A; 1TWB A; 3CCJ T; 2SRC A; 2X4J A; 4J9G A; 4F7U E; 4QVZ A; 4XTW A; 3VS1 A; 1N9S A; 1OV3 A; 1N8R C; 2WSE E; 1QQJ A; 1U8R A; 2OAU A; 3I56 A; 1VQ9 Q; 4M78 B; 4OMN A; 3L2W A; 1YIJ Q; 3EGX A; 4CC7 A; 3M0P A; 2NWM A; 3EFS A; 1XOV A; 4K11 A; 3KFV A; 2SEM A; 2ZGW A; 3PNW C; 3D7S B; 4XK8 E; 2HQE A; 4RUG A; 3JCM e; 1RI0 A; 1VQ5 T; 4M7A D; 3VU3 C; 1M27 C; 4QW2 A; 3SWN C; 3UA6 A; 1UEB A; 1WGS A; 1RAH B; 1FMW A; 1IGQ A; 3S6W A; 2X51 A; 1IXD A; 2W10 A; 5GJV B; 4KT0 E; 2E64 A; 4L59 A; 1QVF A; 3BDU A; 3GNF B; 1KD1 U; 2WAC A; 1RAB B; 3L2V A; 4C8Q G; 4PFZ A; 5GAN j; 4DEX A; 2RK2 A; 1QVG A; 3VRZ A; 2V26 A; 1V1C A; 3QG1 A; 4EMH A; 2DXC A; 1PNJ A; 3OBY A; 4FYY B; 4M77 E; 3CMA T; 1RAG B; 1KQS P; 4HVW A; 4M77 F; 2YUQ A; 1N9R A; 1QWE A; 1K9M C; 2DFU A; 2IIM A; 5GMK h; 2QQS A; 4JRQ A; 1VQ4 Q; 4II1 A; 3REA B; 1BCM A; 4X1V A; 4M7A G; 3BW1 A; 4RTY A; 2J6O A; 5GAN e; 3JB9 J; 2NUT A; 2FB7 A; 2BE7 D; 1M1K R; 5CQX A; 2BUD A; 1T3S A; 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