1SL2 | Genus

Total Genus 28

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	28
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	KIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/electron transport/dna
molecule keywords	5'-D(CPGPAPAPAPAPCPGPAPCPGPGPCPCPAPGPTPGP*
publication title	Nucleotide insertion opposite a cis-syn thymine dimer by a replicative DNA polymerase from bacteriophage T7. pubmed doi rcsb
source organism	Enterobacteria phage t7
total genus	28
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2004-03-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1sl2B00

11GSA 1EEMA 1NHYA 4LA1A 2V6KA 4PNFA 1TOFA 2OKAA 4ZB9A 3LFLA 3FZ9A 4GSSA 3J7Yk 1FOVA 3HKRA 2H66A 2LQQA 3NIVA 2YV7A 1O81A 1XBSA 3TKQA 3ZITA 2ZNMA 4MABA 1TK0B 1WE0A 1T7PB 1K3LA 2FY6A 1T4ZA 4ZXGA 2QSIA 3DWVA 1HD2A 3GN3A 1KBNA 1XOAA 2YN1A 1XCCA 3O76A 2VIMA 3EMPA 3VURA 5B8AA 1NM3A 4ID0A 2XPDA 1YEPA 2MYGA 4KSMA 4ZBDA 2VCXA 2V2GA 3TCOA 2M80A 3UAPA 2GT6A 2CAIA 2XBIA 2VLUA 1CQGA 2R4VA 3ZREA 2DMMA 3UL3A 1TU8A 3GSSA 2LRTA 3Q19A 3QAGA 4MH3A 4IGJA 4MA9A 2C3NA 2P5RA 1SK0A 1THOA 2C8UA 4NHWA 1U6TA 3LXTA 2CVKA 5ELGA 3GNJA 3GA4A 2PVOC 3KXOA 4I2UA 1J9BA 2YJHA 1G6WA 2DBCA 3DMLA 3GH9A 2P0GA 4ULXA 5JWRB 3D21A 2VCTA 1Z9HA 4DSRA 3NOFA 2VAFA 4MPGA 1V57A 1WWJA 2VLTA 4TN8A 3GMFA 1VF1A 7GSSA 4GQFA 4EC0A 1F2EA 1ABAA 4I6XA 4OO5A 3F3QA 5ECQB 1J08A 2LQOA 1GP1A 1ZYEA 3WYWA 3E3EA 2AYTA 1EP7A 12GSA 1QXHA 2DJ0A 5DQYA 1XVWA 1SJIA 4N10A 1TP9A 4XRDA 2VL3A 2WRTA 3RHBA 5ID2A 1A2MA 1T00A 2NBSA 6GSTA 1IYIA 1VRSD 3ZZXA 3QFAC 3TDGA 3GH6A 3DKSA 2CQ9A 5FWGA 1PL1A 3GKMA 4V2NA 4EE0A 2ZUPA 1B9YC 3L9VA 2WS2A 4I2TA 4AGSA 3Q6OA 1Z6MA 3O3TA 4HZ4A 4EDYA 4TW5A 4ZL8A 2VUPA 4O92A 3MSZA 1GTBA 4N11A 2TRCP 3RPPA 2H1AA 1XWKA 2EC4A 1SJZA 3GX8A 5CAXA 2OE1A 3OR5A 2G0FA 1ON4A 4J2FA 2I4AA 5DBQA 5IMVA 4QL7A 4IELA 3IBHA 3KTLA 2ZCTA 1ERTA 2H01A 3EC3A 2VCQA 2F8FA 2J9HA 2H0IA 2DSAA 3QD9A 3HY2A 4D73B 2B1KA 2ALBA 1ZCPA 3KD0A 1Z7PA 1XWBA 2N5BA 4TXOB 2CT6A 2H73A 1ZL9A 4IHUA 5ECPB 3GKKA 4BA7A 4KDUA 4EXJA 2CZ2A 4NMUA 4TR1B 2NVLA 1AAZA 4Q5NA 3GV1A 3C8EA 1TXXA 1GNWA 4FH8A 2B7JA 5EVOA 1B9XC 4BVXA 4K0NA 4XRAA 1U3AA 5B7CA 1SL0B 2TIRA 2VD0A 5CP1A 1OC8A 1PA3A 2GQMA 3VWVA 2GSRA 2IN3A 3K8NA 2G2QA 1AQXA 2H72A 1YQ1A 3EU4A 1TRVA 2PUKC 1I9DA 4IVFA 2MBSA 4KGIA 5IPGA 3GHAA 1GLPA 1SL2B 4EL1A 2LRCA 1N2AA 3LORA 5AGYA 2O7KA 2VM1A 2MZCA 1Y6EA 4QL9A 1TRWA 3LYPA 2GZYA 3D5JA 1GLQA 1OVNA 2CX3A 2HSHA 3W8SA 1PN9A 2L4QA 2IFQA 4WXTA 5B8BA 1M7TA 1QUWA 1SKWB 3IK9A 5D9TA 4LMVA 1X5EA 1F3AA 1QK8A 3ZFBA 2RLIA 3KIJA 16GSA 4PQIA 4TVEA 2L6CA 1Z5YE 4TOPA 2LUSA 5ECOB 4D73A 2E0QA 3F4TA 5A4UA 3LSZA 3EWLA 4WR5A 1JZDA 4TXOA 4J56E 2KHPA 3QOUA 1IYHA 1QMVA 4TKYA 1QQ2A 3U6VA 2REMA 4TR1A 3BBYA 3GIXA 3HHVA 2IMFA 2RIIA 2B7KA 3KGKA 4BWSA 2GVPA 3F8UA 5KN3A 5IPHA 5A4VA 4IJIA 3HJOA 2WJUA 4I5QA 1XWCA 1KNGA 1XZOA 1GNEA 3VFIA 4IN0A 2VD1A 5J41A 1K3OA 3TJBA 4JE1A 3ERGA 4N0VA 5CYYA 4KX4A 1W4VA 4YAPA 2B5XA 1B8XA 3LEFA 5AIXA 3DVWA 4CHSA 4KH7A 3GFKA 1OKDA 2BTOT 2GSSA 5EL8A 1JLVA 5B6NA 3HVXA 2IMIA 4MF6A 2DJ2A 2K9FA 1GH2A 3HZ8A 2J23A 2V32A 1YY7A 1FB6A 1UA5A 3L0HA 3A3TA 2JZSA 1U88A 3KH9A 3M9JA 1R5PA 3LWAA 1OC9B 4EF0A 4O7HA 4HU9A 1T8EB 1U3IA 1V40A 2DIYA 1UC7A 6GSWA 5HR1A 3C7MA 3GKXA 3LQ7A 4PNGA 2L4CA 5HR2A 3IHQA 2CVBA 1GL8A 1SK1A 5D9XA 1XIYA 2IJYA 2DJJA 3D4TA 5LNKe 3GL3A 4F03A 3GSTA 3M0FA 1OKTA 1WMJA 1SD8A 5IM9A 2LV3A 5KN1A 2E2GA 1PX6A 1OYJA 1AXDA 2ON5A 2C0FA 4YQVA 2X64A 1YJ6A 4ZIJA 1T1VA 5J5NA 1HYUA 4AJ6A 10GSA 2H30A 5CREA 4OD7A 2MMZA 3I6AA 5G1LA 3EVIA 4XS4B 1BX9A 3F0IA 3R2QA 4Z7XA 5G1KA 2FGXA 1MDIA 1LU4A 5D96A 1ACVA 1M9AA 1PL2A 2H0HA 3AY8A 4GSTA 3HJPA 2YWOA 1WPIA 3GKNA 1WRYA 5ECNB 4CDOA 1X9WB 3IAM2 3HYPA 3Q74A 5ENUA 2VOCA 2K6VA 3CSJA 4JBBA 5LD0A 4BPYA 3VI7A 2V1MA 2PBJA 4DSSB 4XS6A 4K7NA 5E4WA 3IR4A 4V1Ap 3UARA 2H6ZA 3C1RA 2WFCA 3UVTA 2L6DA 2NPBA 1FVJA 1FAAA 4OFTA 3ZLPA 1ST9A 4I8BA 4IBPA 1M99A 1H4OA 4FYBA 4KB3A 2L5OA 4NAXA 1AUCA 1OC9A 1K0AA 3FZ5A 3KMNA 4GWRA 4G9HA 4JEDA 1TU7A 2HI7A 3GL5A 4CW9A 2HZEB 5FT3A 8GSSA 4KAEA 1A8LA 2B1LA 3PH9A 2O89A 2RM5A 5DAKB 1FO5A 1XOBA 3TJFA 4XIHA 1ZZYA 4EVMA 3KH7A 2O8VB 5AN1A 3TRXA 5HFKA 2C3TA 5IQYA 1DE1A 2YV9A 4IQAA 2CA8A 1ML6A 1NSWA 3APOA 2IMDA 4IP1A 4OFMA 5EY6A 20GSA 5DALB 6GSSA 3HA9A 5CRGA 1A0RP 3GURA 4HEA2 5J9BA 1PRXA 4XS4A 1THXA 2R2JA 4YQMA 3MNGA 1QFNA 4DEJA 1MD4A 1MD3A 4MH2A 5D93A 5G31A 1HNAA 1YZXA 2LRNA 2VL9A 3LJRA 2BMXA 2AAWA 3CRTA 3P90A 4WETA 4FYUA 4ZBAA 5GAPD 4XTSA 2GZZA 5J4UA 5ECLB 1XW5A 3H79A 1M2BA 2C0DA 2FWEA 4NXIA 3DRNA 4IS0A 2VCZA 3PR8A 5D9WA 4L5LA 3KM6A 4ML6A 3D4MA 1M2DA 2X8HA 4F9ZA 2GDRA 3ZTLA 3P8WA 1A24A 5IMCA 2K8SA 2XC2A 2HZEA 3I69A 4WF5A 2X8GA 5D8IA 3HJMA 2B5YA 2DJKA 4LLRA 1ZMAA 5J9CA 3FW2A 3L4NA 4AJ7A 4ZB6A 2QGVA 4HQZA 4MJCA 5IIZA 1Z3EA 3DYRA 5ECHB 5DCGA 1Q4JA 3J7Yb 1PX7A 2X8CA 2GTUA 2GZPA 4IQ1A 2NTOA 3FRCA 1EOHA 2XBQA 1JZRA 2YCDA 4KDXA 2YANA 2VCWA 1V9WA 1F37A 2R6KA 3KEBA 1ERVA 3PINA 4ACSA 4POMA 1SYRA 4JZQA 2R37A 4QQ7A 2JU5A 1WP0A 3CTGA 3CSIA 5KN2A 4KUNA 2HE3A 1VF4A 1HQOA 4YH2A 1S3AA 3KMOA 3O6TA 2AV4A 2B3SA 4F0CA 1NW2A 1BAYA 3M9KA 5G5FA 1G7EA 1HNBA 5IOXA 2HRNA 3E9JB 1B4PA 1JHBA 3FHKA 3VK9A 3U5RE 3VWXA 2R5GA 5F07A 2GSQA 4OFNA 1PSQA 3DIEA 1K3YA 1R4WA 1GSEA 3GYKA 1E2YA 3MAKA 3FY7A 1TRSA 4FIWA 2WGRA 1VF2A 4JU5A 3ZVJA 3CBUA 2HZFA 2EIQA 2FHEA 2YOIA 2EIOA 4GCIA 2FA4A 2PU9C 5DJMA 5GAND 1Q98A 3SWLA 5A5KA 3N5OA 2PPTA 3BCIA 4PURA 3ZYWA 3F6DA 1A2LA 5HFIA 2AUVA 4GQCA 2LNTA 4JR4A 3TKSA 1K0DA 4GXZA 4EUYA 1O7UA 5ECMB 1X9MB 1N8JA 4JR6A 3F9UA 3ZIJA 1O6JA 1XW9A 4PQHA 4YAVA 4MJAA 1JZWA 2LTKA 4IP6A 3FEUA 4PUAA 2FCHA 1HNCA 2EIRA 3RHCA 3WGEA 1EOGA 1GUHA 4MJEA 4OO4A 3TJKA 1GUKA 3VLNA 5HFGA 4MZWA 1EEJA 3UEMA 1T3BA 2ES7A 5J3RA 2KP2A 4DVCA 3FR3A 1TKDB 3FR6A 3ISOA 2A4VA 3WD6A 3M3MA 3BD2A 1CQHA 3ZRDA 1NHOA 4HOJA 3ERWA 1I5GA 2FWFA 2GSTA 3TRPA 5DQSA 3E0UA 5A4WA 1KTEA 18GSA 2IL3A 1O8XA 4OCEA 2H19A 1OC3A 3G7YA 2B6MA 3D22A 1QGVA 3KP8A 5ECIB 3GX0A 2JZRA 1JLWA 1EP8A 5CRWA 1AC1A 1ERUA 2HNLA 4F2IA 1EZKA 2H70A 4NWYA 1C72A 3HZ4A 3I43A 2HYXA 4TR3A 4ILFA 4OCFA 3D0ZA 1TK5B 4HUAA 5C00A 4K7IA 4LL1B 2RM6A 4TRXA 3IOSA 3GRXA 3SBCA 3QR6A 3ED3A 1B48A 2JL4A 2HLSA 3F3RA 3QFBC 2FNOA 3D6IA 1FHEA 3G7JA 1F9MA 2JACA 4WBJA 2OBKA 2Z9SA 1W89A 4LMWA 2M72A 2LSTA 2VL2A 2M46A 1SD9A 4MJBA 3WGXA 2YWMA 4HJMA 1FVKA 3KP9A 1DUGA 1GRXA 2PVQA 1PD21 3TKSC 4BVYA 3FYGA 5IO2A 2AHEA 3TJJA 1SJ6A 2C0GA 17GSA 4WF4A 2C80A 3QMXA 5IMZA 1X5CA 2YZUA 2H0GA 4KCAA 1ERWA 1GTAA 3MWHA 2O85A 3L9UA 4ZBBA 2GS3A 2A2RA 2CAQA 1JFUA 4Q5FA 1SKRB 5CRHA 4XS1A 3IPZA 3FK8A 2LJAA 6GSXA 1O85A 1ZOFA 3F4RA 4POBA 3IDVA 1GSDA 1T4YA 1K0BA 4RQXA 1BQ7A 2OBIA 5IMDA 3MDKA 1B4QA 3DEXA 4O32A 1EV9A 4RQRA 3EU3A 2MMOA 3VWUA 5F0GA 2H1DA 4HDEA 4G19A 2I3YA 4POKA 1RK4A 3UBKA 4L8EA 4F82A 4K0GA 3KCMA 4ML1A 1GSSA 2KLXA 1URMA 1J0FA 5KEJA 4KCEA 6GSVA 3HCZA 2HFDA 3TKSE 2NDOA 3N9JA 5AISA 4X1UA 4PUFC 4G2EA 2JADA 4MZBA 5ABRA 1DBYA 2DJ3A 1EV4A 2VL2C 2LJKA 3IK7A 4K1FA 5JWQB 2FUG2 2AB6A 4N30A 2TRXA 3LGCA 4V2MA 4PGTA 3HDCA 3GTUB 1FB0A 1G0TA 1XWAA 5JCUA 2KP1A 1LJRA 2FWHA 3IV4A 5HQPA 1R7HA 5E59A 1KEBA 3FR9A 3US3A 2DC5A 3ZIVA 4ZILA 2V6OA 1SKSB 1MTCA 5IMAA 5GSSA 2XHFA 4FO5A 4ECJA 1PQNA 4KNDA 5L71A 1H75A 9GSSA 4KDYA 3GUSA 5C04A 2YP6A 1E6BA 1UN2A 2C0EA 3CMIA 3P2AA 3HXSA 1DSBA 5ID2B 2I81A 3C71A 1M0UA 2CV4A 2DIZA 4NV5A 4AF2A 4HS1A 2VM2A 3I9V2 4X0XA 3UBLA 5JCGA 4TR0A 2H6XA 4GRFA 4HI7A 3RDWA 1TI1A 1V98A 2OE0A 2RUEA 5JWOB 4PX1A 2PGTA 4K2DA 1V58A 2I9HA 4AJ8A 2BJXA 1SENA 1GULA 3BOAA 4KSOA 4Q5QA 1TJDA 4RUVA 3A2WA 3LYKA 3TGZA 3DD3A 3ZL5A 3WGDA 1K0CA 1ZYQB 1AIUA 4K7OA 1R5AA 1A23A 2DMLA 1BYEA 5G5EA 2L59A 1X0RA 2OADA 4ECCA 4DSSA 3C73A 2JSYA 1USBA 2WB9A 4OWYA 5LCZA 3QCPA 2OACA 1Y25A 1TDIA 2H71A 3TOTA 3GTUA 2IMEA 1YKAA 1EGOA 3BJ5A 2H1GA 2LJRA 3VWWA 3CYNA 1OE7A 5D9VA 3M1GA 1Z6NA 1F3BA 3F4SA 3FZ4A 2R3XA 3TKPA 5B6MA 2PWJA 2CVDA 4O5RA 3F6FA 2C4JA 4BL7A 4L5OA 2FA8A 4DSQA 3KTBA 4WR4A 5DAKA 3L9SA 3V1WA 1VGLA 5H5RA 3IE3A 1G7OA 4KE3A 2A2SA 3ZVJD 2HSYA 2IWTA 4Q5RA 3TRQA 4K6XA 3TKRA 4IJ3A 1VF3A 3CTFA 3CRUA 2H75A 4L0UA 5AIVA 3S9FA 1MEKA 1GSYA 5ELAA 2V41A 4MF7A 3DVXA 2VO4A 5DALA 4ZL9A 1GSQA 3HVVA 4MLYA 4RI7A 4E8EA 5CRDA 3RBTA 4F0BA 2PN8A 2JZTA 4WBRD 2GQLA 2O87A 4NV2A 2OA7A 2E7PA 2L5LA 1TTZA 4WKWA 1M9BA 4GLTA 1XPVA 3DXBA 2IFQB 2CZ3A 3ZFLA 4IW9A 2P31A 3EYTA 4MCUA 1EWXA 3A2VA 3HD5A 1GTUA 4GF0A 1SK2A 3W6GA 3LXZA 3QAWA 1F6MC 4HQSA 1FG4A 2AJQB 1GWCA 3UOMA 5F8BA 2MMAA 1YEXA 1WJKA 2IMKA 1TRUA 3ZMKA 4I97A 4MZCA 5INYA 4E8HA 3EMXA 3APSA 5G2ZA 3TB2A 1XW6A 2LNSA 5EPFA 3IAS2 5HR0A 4N0ZA 2HRFA 2HT9A 2YNXA 2YWIA 3UIWA 1LBKA 2QC7A 5ECKB 3FKFA 3LG6A 3G9BA 2MMNA 5FHIA 1XVQA 2YZHA 2IPAA 3BCKA 2D2ZA 1SYXA 3EE2A 3FZAA 5DDLA 4GSNA 5DCHA 3TUEA 2LKUA 5JCWA 3P7XA 5IOWA 4MF5A 4MDCA 1XXUA 4MPFA 1XWGA 2RUFA 4H86A 2VLVA 3H93A 2H76A 5GSTA 5F06A 2H6YA 2FLSA 2P5QA 3TOUA 3UMAA 3Q18A 2F8AA 2KUCA 1X5DA 5ECSA 3WT1A 1BEDA 3JCML 3PGTA 1YF0A 4HJ2A 3RAZA 2H8LA 3A5WA 1K0OA 4POLA 2FWGA 1PGTA 4TXVA 1M2AA 2HXKA 3G7IA 3IC4A 2F3MA 2WZ9A 1OAZA 3KZQA 19GSA 1U87A 2L57A 3QDNA 5DVBA 3EINA 2GQKA 4V1Ag 4HU7A 1PKZA 3IA1A 1G6YA 3KJYA 2GLRA 13GSA 6GSYA 5ECRB 3DGQA 3H1NA 4ECIA 1SL1B 4K8MA 2C3QA 4EKZA 4MK3A 2F51A 1AQVA 3H4KA 2WCIA 2XPEA 5CO3A 4MP4A 5H5QA 4L0WA 3F63A 1JZOA 3VI5A 1SU9A 2PMTA 1MDJA 1PMTA 2WULA 1UVZA 4KA0A 5H5SA 1A0FA 3VPTA 2K18A 4HZ2A 1ZGNA 1Z7RA 4XCSA 3ME8A 1O73A 2DJ1A 1YDKA 1K0MA 1TK8B 1RW1A 2H1BA 1BJXA 4JRRA 2GT5A 1GSUA 3TJGA 2ON7A 4ZL7A 4OMVA 3UJ1A 1R26A 2YWNA 3C1SA 5DJLA 14GSA 2C1YA 22GSA 3WT2A 4NHZA 1A2JA 1V2AA 2VCVA 1YKCA 2F9SA 1TW9A 2H74A 3CSHA 3QAVA 4WEYA 4PQ1A 3IXRA 2OJLA 4G10A 1ILOA 2OE3A 3NZNA 4FYCA 4XHMA 5IO0A 3IRAA 3QPMA 2LS5A 4ECBA 1TI3A 4K9ZA 4P3YB 1XFLA 4EO3A 1WIKA 1K0NA 1PKWA 1DE2A 3ZMLA 2K8VA 3CXGA 2MBTA 4V2LA 1EGRA 3ERFA 3HVSA 2I1UA 4J57E 3APQA 1YF1A 1S3DA 4ZB8A 2X99A 1GSFA 4PXOA 1AW9A 1MDKA 3EURA 2B5EA 2PERA 4BWQA 5CNWA 4EDZA 2WDUA 3A2XA 2KOKA 1OE8A 1FW1A 2CX4A 2QKEA 3W8JA 2LEGA 5COHA 3RPNA 1A8YA 4GTUA 1S3CA 3L78A 1X9SB 2N5AA 3UVHA 5KN0A 3H8QA 4ISDA 4YQUA 5HR3A 5D73A 4LL4B 2JSZA 1AQWA 2GGTA 1RQMA 5F05A 2N5FA 2DLXA 2FD3A 4NPBA 4MMMA 5IMFA 1O8WA 1BG5A 5GZZB 4RI6A 3VPQA 6GSUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1SL2B

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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