1TAYA

Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRAWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
publication title Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1tayA00
2YVBA 4NGOA 2IFFY 4B1AA 2LHMA 3IJVA 4H90A 4ET8A 5I53A 1LSNA 5DN5A 1NF5A 1GFAA 1LSMA 4NGYA 5JENB 1YANA 2Z12A 7LYZA 2G4QA 1LSGA 4WOAA 3CB7A 1B7SA 1B7MA 1QTEA 2HEAA 2BQKA 1IP5A 1GF6A 3TXIA 5J7CA 1IX0A 3W3EA 1KXYA 2DQFC 1GHLA 4H8ZA 4NHPA 1GFVA 4W94A 5FSTA 5B07A 3WH1A 5B05A 1GF9A 2A7FA 4GN5C 1OUDA 1HFZA 1REZA 2F30A 1LJHA 4RW2A 5KKIA 1IP1A 5EBHA 4HV2A 1IY4A 4PHIA 5FELA 4DWXA 1YKYX 4KT3A 3EMSA 2FBDA 1B7OA 1A4VA 1AZFA 3AJNA 4PPOA 1AT6A 4CJ2A 1D6QA 2CWIA 4TWSA 4G49A 4UWUA 1B5XA 1LZ8A 4WM2A 1BHZA 3M18B 3B0OA 1DI4A 4H8YA 1N4FA 3EXDA 2LZ2A 1LJ4A 1LZ4A 1ZMYL 3RT5X 2FYCA 1D0KA 2WARA 5A3ZA 1GE2A 1GBZA 4HV1A 1LMNA 2I6ZA 3P64A 4J0LA 4LT0A 4NFVA 3ZEKA 4NWEA 1IWVA 4DDBA 1YL0X 1OUAA 1IP3A 1IWXA 1GB6A 2MECA 1LJJA 1LPIA 2BLYA 1FBIX 3AYQA 1UA6Y 3RNXA 1CKCA 1F6SA 2BQOA 1D0MA 1FDLY 1LZSA 2MEHA 4H93A 2G4PA 4NGIA 1UICA 1LJKA 3J4GA 4YEMA 1LAAA 3A6BY 2W1LA 1RFPA 1QDRA 4CHXA 4ETAA 4QY9A 1GAZA 5E4PA 4WMGA 4XJGA 1B5YA 1BB6A 1YILA 1LCNA 5A3EA 1GB2A 4HJVA 5M1YA 5DN4A 4MSTA 5LVIA 1JHLA 4QDNA 3FI7A 3A95A 4H9CA 1JIYA 3CSZA 4CFPA 2EQLA 4OWHA 4XJFA 4H9IA 1REMA 1GAYA 1LSPA 3P66A 2BQFA 4Z41A 4G4CA 1GE1A 3TXBA 4YENA 3WUMA 4N0JA 3WMKA 3EO5A 208LA 4RW1A 1WVUA 4EOFA 2DQEY 1JJ0A 4TUNA 1GF3A 1LJFA 3A67Y 3A94A 1V7TA 1J1PY 1D0LA 4NSJA 1GB5A 3A34A 3G3AB 2XBRA 1MLCE 3TXDA 1LHJA 4NG8A 4LYCA 4NGWA 1DI5A 1LHIA 1LZNA 1VATA 4NGZA 1GB7A 1GBXA 3N9AA 1IC5Y 1SLYA 5KJ9A 3LYOA 3N9CA 5LYMA 1LZ5A 2Y8PA 5K7OA 3LYZA 3KAMA 4WM6A 5HNCA 4NGLA 4OWAA 1LSBA 4ZIXA 3HFMY 3WU8A 4WM5A 1B7NA 1UIEA 5II3A 4NSGA 5HQ1A 1XFPL 1AKIA 4DD2A 4YOPA 1OQMA 3LYTA 5DM9A 3AW7A 2LZTA 1LHKA 4LFPA 6LYTA 1YL1X 3QY4A 1IP7A 3P65A 1REYA 2A7DA 3B0IA 2HEEA 2YBJA 1P2CC 4M6DA 194LA 4WLDA 5F9XA 1JKCA 4DDAA 4DT3A 4NEBA 4GCBA 1BVXA 2MEAA 1VAUA 1WTMA 1XEKA 4W96A 2XBSA 5I5QA 3WXUA 1OP9B 1DXJA 1G7JC 1LZDA 1NDGC 1TEWA 4GN3A 4RDSA 3A92A 2DKVA 4LYBA 1IVMA 4H9EA 2YDGA 1UIHA 2W1YA 4OWCA 2BQIA 4XJHA 1HMLA 5DLAA 5F14A 1KXXA 1CJ6A 1FKQA 1HEQA 1JTOL 2YBLA 5F81A 3WW6A 4H9FA 3B72A 1G7HC 1GBOA 1T3PA 1VDTA 1YAMA 3WW5A 4YM8A 5HMVA 3A8ZA 1LZGA 4LT2A 1IC4Y 1LKRA 1GF7A 3IWRA 1LTMA 2DQAA 2ZNXY 4N8ZA 5KXSA 5HLLA 5KY1A 2XJWA 5HNLA 3B6LA 4LT3A 3WU9A 5KXWA 3IJUA 1YROA 1AT5A 1LSYA 4BAFA 1IR7A 1LOZA 5APFA 1PZYA 2MEDA 4LGKA 3HBHA 1BB5A 3WXTA 4HJZA 4X3BA 1BVKC 1JTPL 1KIQC 1LYOA 2D6BA 2MEEA 1IWZA 1LHMA 1LSFA 1JTTL 1IP6A 4KXIA 1HEOA 1XGRC 5C6LA 1YAQA 1RJCB 3W6DA 1LMQA 1QTKA 1HF4A 1QUTA 1HHLA 2XTHA 1C43A 2H9KA 1GFTA 1F0WA 4G9SA 4H92A 1VEDA 4XJDA 1YAOA 3TMVA 1LSDA 4Z3MA 154LA 4DD1A 1D6PA 1GB8A 2C8PA 1OUBA 1LZTA 3A91A 1KIRC 5LVHA 3AGHA 3WPKA 3RU5A 4WLYA 1JEFA 4GLAA 3P4ZA 4MCKA 1WQNA 4IJ4A 4RLMA 5LYTA 1D9UA 1BGIA 1XGUC 1B5VA 2LYMA 4LYMA 3TXHA 2HTXA 5KXZA 1CKGA 2BPUA 3ZVQB 1LJEA 1SQ2L 4GCCA 4LYTA 4HTKA 1YKXX 1LZAA 5B06A 4NIJA 4B49A 1LZRA 1FLYA 4I8SA 2MEBA 5B1FA 4ET9A 1GF0A 4ETBA 3D9AC 4AGAA 1WQQA 1B5UA 3TMUA 1JWRA 1IWWA 1GE3A 3CSRA 4C5FA 1RCMA 4TX7A 5KXNA 1BQLY 4ZEEA 1VDPA 2ZNWY 1HNLA 3CT1A 2YBHA 4J1AA 4ETEA 2B5ZA 1B7RA 1I56A 5IDDA 4DD7A 5KXLA 207LA 1IIZA 3CQLA 1CJ7A 4N9RA 3HBDA 5ILCA 1IOQA 3TXFA 1IP4A 1C45A 1LZEA 1LKSA 1NMMA 2MEGA 3G3BB 1A2YC 1B5WA 4H9AA 4WM3A 1UACY 4NHSA 1GF5A 2YBMA 1INUA 1QSAA 4GCDA 5LIOA 2MEFA 2D91A 3OK0A 4I0CA 5ILFA 1F10A 5F16A 1GFRA 4WL7A 1FKVA 134LA 2DBTA 1TCYA 4DD9A 4Z98A 1E8LA 3WVYA 3ATNA 1JJ3A 1B2KA 1LMCA 4NWHA 4AXTA 2ZYPA 1JITA 2DQJY 4NHIA 4B0DA 1LHLA 3F6ZA 1GFKA 2DQCY 3WPJA 4NG1A 1LYYA 1JPOA 2Z38A 1LJ3A 1G7MC 3AZ7A 3AZ4A 3TXKA 3QE8A 3TMWA 1GD6A 1UIAA 3BKHA 3TMXA 4WM1A 1IR9A 2ZWBA 1QSWA 1HELA 5I4WA 1NKHA 1LYSA 1DPXA 2GV0A 1NQIA 1ZVHL 2AUBA 4PGJB 3EBAB 1GF8A 1WQRA 2I25L 1J1OY 1LZ1A 1FLUA 1LMPA 1B7PA 1IEEA 4UWNA 4PRUA 1BB3A 1C7PA 4TSCA 5KXRA 2DQIY 5LXWA 1HEMA 1OUCA 1HSXA 4OOOA 1LSZA 1LHHA 2BLXA 5E9RA 2H9JA 1OUFA 5C6JA 1XGPC 2BQNA 4WO6A 132LA 2ZYCA 3CSQA 2BQMA 4HTNA 5KXYA 3LYMA 4R6CA 3LZ2A 5KKJA 4WL6A 4CGEA 1DQJC 1BB4A 1FLQA 1LSCA 3A3RX 3OJPA 1XSFA 4GN4A 3ULRA 2Z37A 1VFBC 3D3DA 4II8A 5AMYA 4OOTA 4HPIA 4RLNA 1REXA 4HP0A 1IC7Y 2CJLA 2FYDA 2Z2FA 2HEDA 1ALCA 1CJ8A 2Z19A 1TBYA 3AZ5A 3CT0A 2Q0MX 4IASA 4D9ZA 133LA 5FDJA 4B4JA 3T6UA 2BQCA 4LYOA 3TXGA 5HMJA 4NSHA 3A3QA 1UIGA 4YEOA 3WUAA 4U3XB 3WPLA 1UIBA 1HERA 5L3IA 4DC4A 2CGIA 1GXV2 4WLXA 4XJBA 1HFYA 2BQEA 6LYZA 2W1MA 4OW1A 4XJIA 5LAGA 1YKZX 1HEPA 4B4IA 2D4IA 1GDWA 5L9JA 1BWIA 1I1ZA 1CKDA 1CJ9A 4LYZA 1YQVY 1I20A 1FN5A 4ZFPA 2EKSC 1WQPA 2G4NA 2YBIA 5KXPA 3B0KA 5LINA 1JUGA 4PJ2C 1CKHA 1GB0A 1J1XY 1NDMC 1QUSA 1VDQA 3P68A 3T36A 3ATOA 1IOTA 1IR8A 4HPEA 1ZVYB 1LSAA 4NGKA 1XGQC 5LVKA 2RSCA 4N5RA 2Z39A 5KXOA 3A6CY 4H1PA 4NGJA 4DD3A 1ZV5L 1NHEA 1JISA 2HU1A 4PRQA 4P2EA 2PC2A 1QDTA 4ETDA 5T3FA 2H5ZA 3WU7A 5LVGA 1EL1A 1LZ9A 1RI8B 1GE4A 2CDSA 1F6RA 1IWTA 153LA 4XADA 4ML7A 1NBYC 1GFUA 2F4GA 4G4BA 1H87A 3J6KA 2NWDX 9LYZA 1IP2A 1LJIA 2ZILA 3LZTA 4H91A 3GXRA 3WYHA 4O34A 4BS7A 2DQDY 1JSFA 4C3WA 5I54A 5I4XA 3FE0A 4MR1A 3AGGG 3RW8A 5D5FA 2HUBA 3M3UA 4NHTA 1GB3A 2DQGY 4YF2A 5B59A 1LJGA 2ZQ3A 1GFJA 2Z18A 1IOSA 5F9UA 2BQJA 2YBNA 4NHQA 4M4OA 1LZBA 3A96A 1EQEA 1EQ4A 1KXWA 1NWGA 5FEKA 1B7QA 3VWOA 1WVVA 4Z46A 4NGVA 1B7LA 1G7IC 1WQOA 1B9OA 4A7DA 4H9BA 4N1CC 4KL7A 1JKAA 1JKBA 4XENA 1IY3A 2F2NA 4B4EA 5KXXA 4DYGA 2BQAA 2ZIJA 1CKFA 1GPQC 3HBEX 1GE0A 1LMOA 135LA 4WLTA 1LJNA 1LSEA 1OUJA 5B1GA 2HEFA 4HSFA 2ZIKA 1GB9A 3W6FA 1C10A 2X0AA 3TXEA 4G4HA 4GCEA 4GCFA 1KIPC 3E3DA 1QIOA 2Z2EA 3CT5A 8LYZA 1GFHA 2BQGA 1UIFA 5IELA 5LAFA 1JKDA 1WQMA 1LZCA 3AB6A 1W08A 2BQHA 3WVXA 5APDA 5LA8A 1HSWA 1OUIA 1PS5A 1HENA 1OUGA 1V7SA 4TSBA 1O23A 4XYYA 1UUZC 3SP3A 4ETCA 1NBZC 3WULA 4UWVA 2W1XA 4QEQA 3AGIA 1GWDA 1YAPA 3LHMA 2I26L 1HC0A 1IWYA 1DKJA 1JJ1A 1B0DA 1HFXA 2EIZC 1TDYA 1GBWA 1EQ5A 1W6ZA 1LYZA 2HEBA 4XN6A 4CFOA 1FLWA 4NY5A 5DL9A 2VB1A 3A93A 3QNGA 5KXMA 3W6EA 2BQDA 1GF4A 4E3UA 2DQHY 1H6MA 3AW6A 1TAYA 4LT1A 4OWEA 5L3HA 4BAPA 4DD0A 5FHWA 4WG7A 1RE2A 5LYZA 3GXKA 5LA5A 2LYZA 4OWBA 3W6BA 1LZ6A 1LMTA 2BAAA 1BWHA 1T6VL 4H8XA 1QQYA 4N1EI 3WL2A 1LMAA 4H94A 1C46A 1MELL 1XGTC 3LN2A 1UCOA 1Z55A 2ZQ4A 4NSIA 2IHLA 1UC0A 4LZTA 5KXTA 1HEWA 1JSEA 4WO9A 3ZVQA 5I4YA 1BB7A 1C08C 2FBBA 2HECA 1BWJA 4HJYA 3K3TA 3W6AA 4DDCA 1GFEA 2F4AA 5C6IA 4BADA 1HMKA 5FCPA 2LYOA 1GDXA 4IATA 4LFXA 1GEVA 2BQLA 2N5ZA 3N9EA 3RZ4A 2C8OA 1IORA 2YSSC 3MGWA 1GFGA 1LZYA 2D4KA 1WTNA 1CNSA 1GBYA 4R0FA 1OUEA 1YIKA 3W6CA 4WG1A 3WUNA 1OUHA 4WM4A 5KXKA 4HTQA 4J1BA 3A90A 4FDYA 2D4JA 3BKVA 3TXJA 1VDSA 5LVJA 1DI3A 1G7LC 1IWUA 1DPWA 4QGZA 1XEJA 1GEZA 5APCA 4ANRA 2BQBA 4J7VA 1AM7A 4H9HA 1GXXA 4EMNA 3AZ6A 4FJRA 1DZBX 5IHGA 5D5CA 4GLVA 5APEA 2EPEA 2HU3A 1IOCA 4L41A 4TTDA 1DKKA 1IO5A 1UIDA 4KPMA 1UBZA 1GBSA 193LA 2MEIA 1XEIA 1B5ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L55A 3NYAA 5DN5A 1GFAA 3SBAA 4NGYA 7LYZA 2G4QA 138LA 1LSGA 4WOAA 3CB7A 1QTEA 220LA 1GF6A 3W3EA 2QARC 5FSTA 5B05A 4GN5C 1OUDA 1REZA 4RW2A 5KKIA 1IP1A 165LA 156LA 3AJNA 4CJ2A 1QTCA 1D6QA 4UWUA 1LZ8A 4WM2A 1BHZA 4H8YA 1N4FA 1L18A 3EXDA 1ZMYL 5A3ZA 3HUAA 4J0LA 4NWEA 1IWVA 3AYQA 1FBIX 1QSQA 1C64A 1LZSA 257LA 1G0LA 1L46A 215LA 4QY9A 1GAZA 4HJVA 5LVIA 3A95A 4H9CA 2EQLA 127LA 4OWHA 4ARQA 4Z41A 1CUPA 3WMKA 1L33A 4EOFA 1JJ0A 1LJFA 1D0LA 2B6TA 4NGZA 5KJ9A 5LYMA 1LZ5A 189LA 1L35A 3LYZA 5HNCA 1QTZA 4WM5A 3DN6A 206LA 3GUKA 3AW7A 3GUIA 2F32A 1IP7A 1REYA 4WLDA 5F9XA 1CV3A 4NEBA 3V2YA 1L64A 1WTMA 4I7KA 1L73A 1XEKA 3WXUA 1DXJA 1LZDA 3A92A 4LYBA 161LA 4OWCA 3CDVA 1CJ6A 178LA 1HEQA 1JTOL 1GBOA 2B6XA 1IC4Y 1L47A 2DQAA 5KY1A 222LA 3B6LA 5KXWA 1YROA 3OE6A 1L85A 1LSYA 1G0PA 259LA 2MEDA 1LI3A 1BB5A 4EJ4A 1KIQC 1LYOA 1JTTL 1IP6A 1B6IA 1QUOA 1L30A 1HF4A 1QUTA 1L45A 4XJDA 4Z3MA 3C7WA 2B6ZA 1OUBA 1LZTA 2B74A 120LA 4MCKA 4GLAA 184LA 4RLMA 1XGUC 1P36A 1EPYA 1L13A 1CKGA 3ZVQB 1OV5A 1LZAA 4I7RA 5B1FA 1C6MA 1QS5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YVB A;  4NGO A;  2IFF Y;  4B1A A;  2LHM A;  3IJV A;  4H90 A;  4ET8 A;  5I53 A;  1LSN A;  5DN5 A;  1NF5 A;  1GFA A;  1LSM A;  4NGY A;  5JEN B;  1YAN A;  2Z12 A;  7LYZ A;  2G4Q A;  1LSG A;  4WOA A;  3CB7 A;  1B7S A;  1B7M A;  1QTE A;  2HEA A;  2BQK A;  1IP5 A;  1GF6 A;  3TXI A;  5J7C A;  1IX0 A;  3W3E A;  1KXY A;  2DQF C;  1GHL A;  4H8Z A;  4NHP A;  1GFV A;  4W94 A;  5FST A;  5B07 A;  3WH1 A;  5B05 A;  1GF9 A;  2A7F A;  4GN5 C;  1OUD A;  1HFZ A;  1REZ A;  2F30 A;  1LJH A;  4RW2 A;  5KKI A;  1IP1 A;  5EBH A;  4HV2 A;  1IY4 A;  4PHI A;  5FEL A;  4DWX A;  1YKY X;  4KT3 A;  3EMS A;  2FBD A;  1B7O A;  1A4V A;  1AZF A;  3AJN A;  4PPO A;  1AT6 A;  4CJ2 A;  1D6Q A;  2CWI A;  4TWS A;  4G49 A;  4UWU A;  1B5X A;  1LZ8 A;  4WM2 A;  1BHZ A;  3M18 B;  3B0O A;  1DI4 A;  4H8Y A;  1N4F A;  3EXD A;  2LZ2 A;  1LJ4 A;  1LZ4 A;  1ZMY L;  3RT5 X;  2FYC A;  1D0K A;  2WAR A;  5A3Z A;  1GE2 A;  1GBZ A;  4HV1 A;  1LMN A;  2I6Z A;  3P64 A;  4J0L A;  4LT0 A;  4NFV A;  3ZEK A;  4NWE A;  1IWV A;  4DDB A;  1YL0 X;  1OUA A; 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 4XN6 A;  4CFO A;  1FLW A;  4NY5 A;  5DL9 A;  2VB1 A;  3A93 A;  3QNG A;  5KXM A;  3W6E A;  2BQD A;  1GF4 A;  4E3U A;  2DQH Y;  1H6M A;  3AW6 A;  1TAY A;  4LT1 A;  4OWE A;  5L3H A;  4BAP A;  4DD0 A;  5FHW A;  4WG7 A;  1RE2 A;  5LYZ A;  3GXK A;  5LA5 A;  2LYZ A;  4OWB A;  3W6B A;  1LZ6 A;  1LMT A;  2BAA A;  1BWH A;  1T6V L;  4H8X A;  1QQY A;  4N1E I;  3WL2 A;  1LMA A;  4H94 A;  1C46 A;  1MEL L;  1XGT C;  3LN2 A;  1UCO A;  1Z55 A;  2ZQ4 A;  4NSI A;  2IHL A;  1UC0 A;  4LZT A;  5KXT A;  1HEW A;  1JSE A;  4WO9 A;  3ZVQ A;  5I4Y A;  1BB7 A;  1C08 C;  2FBB A;  2HEC A;  1BWJ A;  4HJY A;  3K3T A;  3W6A A;  4DDC A;  1GFE A;  2F4A A;  5C6I A;  4BAD A;  1HMK A;  5FCP A;  2LYO A;  1GDX A;  4IAT A;  4LFX A;  1GEV A;  2BQL A;  2N5Z A;  3N9E A;  3RZ4 A;  2C8O A;  1IOR A;  2YSS C;  3MGW A;  1GFG A;  1LZY A;  2D4K A;  1WTN A;  1CNS A;  1GBY A;  4R0F A;  1OUE A;  1YIK A;  3W6C A;  4WG1 A;  3WUN A;  1OUH A;  4WM4 A;  5KXK A;  4HTQ A;  4J1B A;  3A90 A;  4FDY A;  2D4J A;  3BKV A;  3TXJ A;  1VDS A;  5LVJ A;  1DI3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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