1WD3A

Crystal structure of arabinofuranosidase
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 154
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd3A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd3A02
3BAQA 1II4A 1MZ5A 2DWRA 3ILNA 5BXRA 1YYNA 2AFGA 2MC2A 2IHOA 1DYPA 1W6QB 1YIFA 1IILA 4X37A 1TWEA 3M3CA 2EXHA 2D1ZA 2CL2A 1BASA 4EFQA 5GLTA 1MVQA 2Y9GA 4GALA 2C5DA 2VW2A 5JMCA 3PHZA 1I1BA 4FP3A 3D5OA 2XG3A 1FMMS 1A8DA 3HSMA 4ATEA 4C1XA 1QU0A 2E4MC 3Q7YA 4ZFWB 3VEQA 2DTWA 1XYFA 4ZFYB 1IS3A 2GMPA 4I4QA 5E89A 3ZSLA 1W0PA 2AH2A 1G9AA 4HANA 3FJ8A 5GZDA 2D6PA 5DSSB 3VV1A 2CY6A 2A71A 1QXMA 1GNHA 2DUQA 3FFZA 1Q04A 5IT6A 4Q26A 4P9WA 3AYEA 4D8HA 3WVJA 1V6KA 4QD2C 2ZKNA 2I1BA 5DG2A 1V6IA 1EVTA 5GM0A 2J3PA 5EYXA 2ZGRA 3SISA 4XJ8A 2EIGA 3NJ5A 3POKA 2HWAA 5F8SA 4FPOB 3FJAA 1SLLA 4FP2A 1DQOA 1M16A 3CAHA 3O0XA 1CR7A 4IQPA 1Q8VA 1LOFA 2DUOA 3UJ0A 1W6PB 5HCFA 1WUVA 4XBNA 9ILBA 3O44A 1FGAA 1C57A 3WMUA 1HKNA 2JE9A 1JLXA 1KRIA 5FRAA 4XFUA 2ENRA 2B7YA 5F8WA 4WZFA 2FMDA 4X38A 1AF9A 1WW4A 1W6NA 2NN8A 4Y20A 4X3AA 1DZCA 4IZXA 5JOYA 4QBVA 1S0IA 1DQ1A 3WUCA 3JUUA 4PBOA 2DURA 3CA4A 3AKIA 5CBLA 3QYDA 2ZGPA 4XBQA 2D3SA 4YW1A 4Z8BA 2P2KA 4HR6C 3LSEA 4P6AA 8I1BA 4YGCA 4USPA 2AAIB 4EFPA 3VSFA 4TYSA 1CPMA 3O0VA 1JBCA 4GKYA 2OW4A 1CN1A 3BAHA 4P0LA 2UUSA 1SBDA 4PQ9A 2ZAAA 4LBQA 2KI4A 4IY8A 2LIEA 3HALA 1MS3A 2DVGA 1UN1A 1QOOA 1C1LA 3CQAA 4LBOA 4AGGA 4OEGA 2WLQA 4P14A 3A22A 4Q8KA 1SLIA 4IHZA 1GANA 4IONA 3H6QA 2SBAA 2GNMA 3AZYA 1LHVA 4DCKC 1HWPB 4Q2FA 4YW5A 1QNYA 1KJRA 4QKRA 5GALA 2ZGNA 1HWNB 4J23B 3R4UA 1MZ6A 4GXLA 4G9NA 1LGCA 2CNAA 3LTQA 5KXEA 4YZ2A 1N1TA 1VIWB 3CA1A 2EXKA 5CAZA 3USUA 1KDMA 2A5ZA 4DENA 1N3QA 4F34A 4DRVA 4Q1RA 1UZYA 1D2SA 4Z8SB 3IM5A 3WLUA 1WBFA 4DRRA 1N3PA 2PHFA 2Y9WC 5DUYA 3VUOA 3ZX7A 1D0HA 1KDKA 4XIOA 4AVVA 1M2TB 4C1WA 3FUQA 3CU1B 1ENSA 3T8SA 3I8TA 5JLVA 1S0DA 3AKHA 4RA0A 2GNDA 4M3CE 1UPSA 1DQ5A 1LENA 1MACA 1ONAA 4G6JA 3WINA 2Z49A 1V6VA 3OJ2A 1W6PA 1BKZA 1QF3A 1BLAA 5LK5A 3FGMA 2L5XA 2VU9A 2JJ6A 4OWLA 3UD7A 1LHOA 1UL9A 5I1BA 3HN1A 4AGRA 3HR9A 3VKLA 4R9BA 4YW4A 5IK8A 4YGBA 4I1BA 1AX0A 4CRQA 1AJOA 3APBA 4GAIA 1LHNA 4D69A 2DUPA 2YROA 3WDYA 4I4XA 4OEEA 4M3CB 1F31A 2ZBJA 4JPZA 1WW7A 3ZC9A 2D6MA 2I2SA 1N1VA 4XKIA 5IUQA 3KM5A 2EXIA 1Q1UA 3JU9A 3FBYA 1FWUA 1ITBA 1GNZA 1O4ZA 2R0FA 1GYKA 3AKGA 1LHWA 2ZQOA 4NOTA 1ENRA 2K43A 4XTMA 2GDFA 4LO7B 4J2KA 1LOFC 3PVEA 2D23A 2R49A 2PHWA 4X39A 4QO3A 1TOOA 4A7KA 1J1TA 1LOBA 2ZHKA 2PHUA 1TFMB 3WNXA 2AR6A 1OKQA 1CESA 2WJSA 1HDKA 3ZXFA 1PC8B 1ISZA 1VALA 1QDCA 2D7IA 1FMZA 4LBNA 3V0BB 1KNMA 3BIWE 4I4UA 1HQWA 4XDQA 1KQRA 3ILFA 2A3YA 1N4KA 1AJKA 2AYHA 4FGFA 4Y1UA 5E88A 2XB6C 4YM2A 4FQ4A 1C1FA 2E51A 2YY1A 2P3KA 4PBPA 3SH3A 1N47A 3BAOA 3NV3A 5T5PA 4OWJA 1ENQA 1QOTA 4XIKA 1V6NA 1DIWA 5EXOA 1JTCA 1F9KA 2QN4A 3SNVA 3W58A 1DQ4A 4XYXA 2HW9A 1NLSA 4Y1ZA 1ONKB 1S0GA 2DVAA 4FPEA 4AWDA 1Z4SA 3O4AA 1IKQA 4Y1YA 4YG6A 3AJ5A 3VKOA 3IAGC 1AX1A 3OGGA 2MLLB 4XZPA 4Z9WB 1U0AA 3NV4A 2A6ZA 2HWMA 1NZKA 3MALA 3ENRA 3N35A 1J0SA 3NWKA 5JOZA 2DREA 3JRRA 3O4OA 5FZYA 1UMZA 2VLCA 1UZZA 2NYYA 1Q8OA 1JN2P 3VKMA 5SV8A 2D7FA 2GZBA 1IS5A 1WBLA 3ZSMA 3M3EA 5BQUA 1Q8QA 2KKIA 4FOVA 1FV3A 1IS6A 1MS5A 1IS4A 1RINA 1VAVA 5F9TA 5EHAA 2C9AA 2D3PA 2ZHNA 4DPNA 4NO4A 4YM0A 2LTNA 1W6MB 4P9YA 4DQAA 3FJIA 4BLJA 1P63A 4BPZA 3VT0A 1XG6A 4QBCA 1A3KA 4Q9PA 2JD4A 1SCRA 2ZGOA 4H9WA 4ITCA 2UWCA 3A21A 3RG0A 1QQKA 4QC4A 2E53A 3IN9A 1TIEA 4YFWA 5T5JA 2ZZJA 4JP0A 3ZXDA 4UW6A 3UD9A 2GN3A 4CZSA 4A7ZA 3BRFA 1WCSA 1GBGA 2NMOA 3WINC 1IRPA 4YM1A 2P3JA 1DQ0A 3OJMA 1QGLA 3WA1A 2NMNA 2BFHA 3BOPA 3AJ6A 1CONA 3MW3A 4FPFA 3A0KA 1LU1A 1PZZA 1R1ZA 1JXNA 1WW6A 5BOWA 2ZACA 2DRZA 1CVNA 3UL2A 1L2HA 3V0BA 1NUNA 31BIA 4YW3A 1G7YA 1ISXA 5D62A 4YG0A 4LO0A 3V0AB 5GLVA 3RQ0A 1AVAC 1GZWB 7I1BA 2KM2A 1GSLA 3AP7A 4FPJA 2WT0A 2DVDA 4Y22B 3QLQA 5JVVA 4LBLA 4H55A 1PWAA 3O5WB 1Z78A 4BMEA 4R6UB 1OFSA 3H0OA 4H04A 1FNYA 3OYWA 3PVOA 5DZUA 4GA9A 3OY8B 3I29B 5EC5A 1MR5A 4FOYA 3AK0A 4USOA 3WHUA 3BAUA 3NBEA 2P34A 1ULFA 4FPHA 4AGVA 3K1XA 1HWMB 3HBWA 5FNWA 3SLIA 5F90A 3AFKA 1V6LA 5BXTA 3ZSKA 4U2AA 1MS8A 1DYKA 3WG2A 4YZ4A 4YW2A 1BARA 4GKXA 4XJAA 2WRYA 2ES3A 4HA2A 2V73A 1HCEA 1PUMB 5T54A 1MS0A 1WLWA 1W6OB 1VLNA 3POWA 2NP0A 1Z2VA 2CWSA 1AXYA 2FO1A 5T5LA 4WV8A 4K1ZA 3BA5A 3PUBA 3WCRA 4ZLBB 4K20A 2ZGUA 5EWSA 2PHRA 1N3OA 4YGEA 3WG3A 2CWMA 4I30A 4ISQA 5DUVA 3D6EA 4OWKA 2DVFA 1AVXB 3FJBA 4CJMA 4FPKA 2Y9XE 3AKFA 1O4YA 4I0YA 5B2HA 3UDAA 1EYLA 2ESUA 5FZZA 3QR5A 1XHBA 2Y9FA 5CNAA 1GZCA 4XTPA 2JECA 4Q9GA 3FLRA 4Y24A 4M3CF 4TLPA 3CRGA 3AJYA 1K5VA 2X2SA 2R9KB 1W6QA 1A78A 1YBIA 3FLPA 5KXCA 5BQUC 1T4QA 2IWTB 4F83A 1HKDA 1DQGA 2Q9XA 5DXDA 1DQ2A 1S0EA 5IK7A 2PELA 2W52A 1SBFA 2VSEA 4I1EA 1ZA4A 1MVEA 3CRIA 4AYUA 3RTJB 1BZWA 3HOMA 3WDXA 4IYBA 3V0AA 4D0ZA 3INAA 1GZWA 3ZYPA 2EF6A 4Y1VA 3I2AA 3POYA 3R05A 3VT1A 2LIQA 2RG9B 4YM3A 4II0A 4Y22A 3CA0A 3A0NA 1IRAX 3O5SA 3ILAA 5E24E 1CE7B 3N7JA 2ZMNA 3HMYA 1DGLA 2ZR1B 1FQ9A 1MS1A 1APNA 3T1MA 4CTEA 4EEEB 1Q56A 1E0OA 3TAYA 4DS0A 1GV9A 1JT5A 1BFGA 3GALA 3VKFC 4YZ1A 3IM7A 4J2XA 2ZABA 1SCSA 1WBAA 1PZ8A 2PHTA 5DUUA 4AVSA 2D6LX 5H9PA 4WVVA 4GAFA 1JUIA 2R16A 5FREA 3AP9A 1SFYA 1JT4A 6I1BA 4LO0C 3P6JA 4L8QA 1JHNA 2D6KA 2H0BA 2BEAA 3I2XA 1ILR1 1W6OA 5GLUA 2RQ9A 5GZCA 4K21A 1PUUB 5DZGA 2PHXA 3WDVA 2VXTI 3FJCA 2WT2A 2RHPA 3OBRA 4XE9A 4R9DA 3NV1A 1GGPB 3F1RA 2FFVA 2P37A 5DZFA 3IM6A 3H6SE 2AXMA 1RY7A 3T2TA 4PC4A 2E7QA 2OUJA 3CA3A 1DJSB 1BA7A 3AZXA 4I6IA 3MW2A 3W9TA 1V6OA 4LBMA 1V00A 1IKPA 2GMMA 1SR4A 2ET2A 3LCPA 1W3GA 1CPNA 1AVWB 1H9PA 4BMBA 3AH1A 2YXSA 4GWMA 2XOAA 3L2YA 1MD6A 1LOEA 1LCLA 2DTYA 4P0JA 4XXPA 3WDTA 1H9WA 3ZXGA 1YTOA 5HPZA 1CVSA 1URXA 4GOVA 5AVAA 2A6YA 5GZEA 4FOWA 5T50A 1AZDA 2A6WA 3CRHA 3UJOA 2FHRA 4ZXKA 1B09A 3OJVA 4JKQA 1SBEA 2WSVA 3WG1A 4EKXB 4OUJA 3Q9OA 3IMNA 4KC3A 5GLWA 3EF2A 4GOYA 3POSA 1V6XA 1W3FA 1LGNA 3IPVB 1G86A 2OVUA 2EAKA 3N7KA 3H6RB 2A6VA 5KXBA 1V6WA 3N36A 4Y1XA 4ZGRB 1PZ9A 5DZEA 2F2FA 2DS0A 4IZEA 2GNTA 4ZOTA 4I4YA 4TZDA 4XFSA 1XZZA 1N1YA 3C2UA 4ATFA 4DFSA 4AN6A 1BJQA 2D43A 1UAIA 4KEIA 4ZA3B 4LBJA 1RMLA 2ZQNA 1FV2A 3O0WA 2X2TA 3SNMA 3LSDA 1OQLB 3IKWA 2V5YA 3U4XA 1TEIA 5GAQA 1BFFA 4I4SA 5BVPI 4OZXA 5GLZA 3OPZA 1HLCA 4XBLA 1FYUA 1ABRB 1QQLA 1DZDA 4M01A 3KMVA 2GALA 2AUYA 1LOGA 2NVHA 5GJ6A 1G8WA 3FLTA 2P39A 3B9UA 3FJKA 3AH2A 1LEDA 5GZGA 3W59A 1KJLA 4MYEA 1DFCA 5BP5A 2R1DA 1LOAA 5HCBA 3FUOA 3WG4A 3O4BA 1VCLA 3FJHA 4PCRA 4I2SA 3ZXJA 1I3HA 1W0OA 3WDWA 3SH5A 2UURA 3AJZA 5IK5A 4XJWA 3WO4A 1AX2A 3AZWA 1S0BA 4EB2B 5EG6C 3UD8A 1W6NB 4Y20B 4IY9A 4QALA 2EXJA 4M3CA 4ISRA 2ARXA 2D7RA 4JC1A 4M00A 4AN7B 4XFTA 3IIRA 1YF8B 3N3HA 1TP0A 4U36A 1ULDA 5BXSA 3T1LA 5IK4A 4Q27A 1ULEA 3B3QE 5L73A 5CB7A 1BFCA 1EV2A 2FDBM 3BAVA 4GP0A 2NTDA 3A07A 3OBTA 1ULCA 1V6JA 3RMXA 4I4VA 3DUIA 4XJUA 4I8MA 2A6XA 1SLTA 2D3RA 5EYYA 3ZVXA 5F5QA 3B9CA 4LBQB 3PMEA 1LU2A 2P3IA 1G9CA 4GP3A 3AP4A 3S8KA 2EALA 1JYCA 3SITA 3P53A 1KITA 4YFZA 3BA4A 1V6UA 3O4DA 3WMVA 3PG0A 3D7WB 4JCKA 1RG8A 2AENA 1S0CA 3AP6A 4UW3A 3VWCA 4JQ0A 4G9MA 1AVBA 3IPVA 2FGFA 4YGDA 5HCAA 3H6RA 1NXD1 2D22A 4J2YA 1SR4C 3AH4A 3Q7WA 1F5FA 2ZGLA 3ZXEA 2CYFA 21BIA 4UW4A 4LO3A 1WW5A 1FAYA 3TC2A 3AXDA 2ERFA 2ZGSA 1JT7A 3USUB 3UJQA 3WOGA 4L4IA 1Q8PA 4XMAA 1LODA 2LALA 1OQ1A 2AQZA 3MEPA 3V64A 1AVUA 3BB2A 1HCDA 1TTUA 3FJ9A 3TB0A 2A75A 3B69A 3RSJA 3RS6A 3CA5A 3PVNA 4FPGA 1WBCA 1WLDA 1N1SA 2D20A 1X50A 4GWNA 1LJ7A 2TEPA 4WBCA 2D6NA 2ZGTA 3ZSJA 2VXRA 4AVTA 3R4SA 3M3OA 1IJTA 1BLDA 2W68A 4LO2A 1FX5A 1WD3A 4FVVA 1JYIA 3ZYRA 2F2FC 2WKKA 3PJQA 4KEJA 4XMIA 4EFRA 3AZVA 3NBDA 2VY0A 3WV6A 1S0JA 2GNBA 1FATA 4P9XA 4I7IA 2UWAA 1SLAA 4YZ5A 2Q5TA 3M1HA 1I1EA 3O3QA 1ISVA 4BM8A 3JUTA 3ASIA 1SZ6B 4G6MA 2QYIB 3DGTA 1GLHA 5GZFA 1LECA 2ZGKA 3QCWA 3C9ZA 1W6MA 2YMZA 3ZPYA 4YLZA 2GN7A 3WUDA 2Q3NB 1YI7A 1DBNA 2DYCA 3CA6A 4XXAA 3VKNA 1V6MA 1LESA 3ZXKA 1IOBA 3GNEA 3CNAA 3MW4A 4XJ9A 1LTEA 5BP5C 2YV8A 4YG3A 2UU8A 4QD2B 41BIA 2DU0A 1MS4A 1JT3A 4RL7A 3B00A 3AYDA 2WSUA 1AXZA 2ZGMA 2K4AB 4FPYA 1DZQA 1DLLA 2OUHA 3B01A 2AREA 2SLIA 2KLLA 4I37A 3UJ4A 5JOXA 1S0LA 2VSAA 3O49A 4I4OA 1JW6A 1UX6A 1CQ9A 2CTVA 1G82A 3N7MA 3AYCA 5H9RA 5H9QA 2G4IA 1QNWA 4UW5A 1JQZA 2Z48A 1GZ9A 4Q8LA 4ZKTB 3D4KA 4XHXA 3WO3A 4HL0A 2VH9A 1CJPA 1MC9A 5JOWA 1C4RA 1YRZA 3V79C 1FNZA 2W39A 4LO7C 5D63A 2YZ4A 1GKBA 4FPCA 2JKBA 3OY8A 1K5UA 3BRDA 3M2MA 1IT0A 4L4HA 2WT1A 3BRGC 1TWMA 1HQLA 1LOCA 2ZHLA 3BADA 1GICA 1H30A 1G9DA 2AGSA 3WDUA 4BQ1A 4LO1A 2P23A 3SH4A 2A7AA 1R8OA 1FN0A 1JOJA 3ZC8A 2ZMKA 2F8XC 4OW4A 1WLCA 1AXKA 4G1RA 4HJJA 1HWOB 3FJEA 4Y26A 2JDZA 2ZA9A 4JRAA 3VT2A 1G9FA 1QKQA 4LO3C 2KI6B 5G00A 3F62B 1JLYA 1EPWA 1Z0HA 2ZGQA 3M3QA 3FJJA 1UKGA 1DHKB 2NZ9A 2VUAA 4XOGA 4R9CA 3E8LC 3MPPG 1RIRA 4YZ3A 1ZM1A 2E4MA 4BLIA 4ASMB 3KQRA 2FFUA 4LO8B 4D0TA 2Z42A 2D44A 2KH2A 2DU1A 4KEKA 1QDOA 3BA7A 3RTIB 2NM1A 3IM0A 1VAMA 2JE7A 4PF5A 4P0KA 5F8YA 5T52A 2DRYA 1T9FA 1WD4A 3AXEA 2R0HA 3O12A 3RMYA 4LO2C 1S0FA 2K8RA 1Y7BA 1BYHA 1RITA 3UK9A 2ARBA 5DG1A 3WO2A 2DV9A 5DVHA 4Q1PA 1SLBA 4W65A 3N0KA 3VSZA 4ENDA 4I4PA 5T55A 1MS9A 5H9SA 1IHKA 1G9BA 4I4RA 3WCSA 3OJBA 1DFQA 1FWVA 1HIBA 2WQZC 2VW0A 3OGFA 4Q91A 3N7LA 1LHUA 1AXMA 2A3WA 3V65A 1XQNA 3NBNA 4J2SA 5T5OA 1BQPA 2WBCA 2DVBA 3ILRA 3A23A 3FJDA 1PZ7A 3A4UA 4BOWA 4DEPA 4I96A 2D24A 4SLIA 1BFBA 1RZOB 1QOSA 1S1AA 3BODA 1ISYA 3Q7XA 3OYWB 4XHBA 1LGBA 1AFCA 3WHTA 1QMJA 5BYNA 5FNXA 4XJZA 2ZMLA 5FZUA 4QKSA 4FPLA 4FOQA 2ERMA 5D61A 4A7YA 1IOAA 2E6VA 2A70A 2W08A 1DQ6A 2HYKA 3BTAA 4KBBA 1Q8SA 4LBQD 1BXHA 4YOLA 3BAGA 3NBCA 4R9AA 3ATGA 2WNEA 2D6OX 1LULA 2M49A 1JY0A 3NV2A 3AZZA 1ISWA 4ZFUB 1LEMA 2UWBA 2MIBA 5E8AA 3P6IA 1YXWA 2RSTA 4ZBVB 3AYAA 1R8NA 2GMEA 1CIWA 3WZ1A 5BXPA 3I4IA 4I3NA 5JDBA 2R1BA 3FJFA 3LLPA 3ZXLA 1SACA 1Q03A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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