1YDAA

Structural basis of inhibitor affinity to variants of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSETTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of inhibitor affinity to variants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydro-lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ydaA00
4QK3A 5FLSA 4G7AA 5E2KA 4R59A 4YX4A 1CNXA 3KIGA 4QJMA 5EZTX 5FNIA 3S72B 3R17B 3DVCA 1EOUA 5JDVB 1IF7A 1HEDA 4QK2A 3RYZA 1FSNA 3C7PA 1G53A 4KAPA 3P5AA 2WEJA 4QJ0A 4CNWA 5BNLA 3HKUA 1YO1A 4YVYA 2NNGA 4PQ7A 1Z97A 5EH5A 1ZSBA 2IT4A 1UGCA 3OY0A 1CIMA 1CAKA 1CAYA 4KUYA 1A42A 4TWLA 1LG5A 2FW4A 1JCZA 1G46A 2H15A 4Q6EA 3MHIA 3EFTA 3M40A 5DSRA 2EU2A 4Z1JA 4Q6DA 4CA2A 4ZWXA 3DC9A 3FE4A 4TWMA 5E5RA 4Q8YA 1CVHA 3T82A 4KP5A 1HECA 1CNWA 4YGJA 1I9LA 5E2NA 4QJWA 2WD2A 3DVDA 5EH8A 3RYVB 1OKNA 5LMDA 3TVNX 3MNJA 1Z9YA 4YGFA 1ZSCA 1FQRA 3HKQA 5CA2A 2EU3A 1BZMA 2AW1A 2NN7A 5DSQA 3V3GB 1Y7WA 3IEOA 1G52A 3M67A 1ZNCA 3DCWA 1BCDA 4Q0LA 4R5AA 3V2MA 3U3AX 1CAZA 3DAZA 4FRCA 1F2WA 3M2YA 4YHAA 3DVBA 1ZGEA 4KUVA 4YGKA 4HBAA 3JXGA 3K2FA 3T84A 1CVBA 4Q49A 4UOVA 3K7KA 3P3JA 1ZGFA 2ABEA 4E3HA 4PYYA 1CVAA 4XZ5A 3M96A 4WW6A 5FLTA 5BRWA 3JXHC 4Y0JA 4WL4A 3V3FA 3RYJB 5DSIA 1UGAA 2FNKA 2OSFA 5J8ZA 1G48A 1BN4A 4QIZA 5E2SA 4YXUA 3DD0A 3MZCA 1FR4A 1CNIA 1Z93A 3M1JA 5DSLA 4M2RA 4E4AA 3RG4A 2HFWA 1HEAA 1I9PA 3MNUA 4Q9YA 5FLOA 4JS6A 2HNCA 3M3XA 3T85A 3HKNA 4E3FA 1CNGA 2QOAA 3N0NA 4YXIA 1HVAA 2HL4A 4RFCA 2WEHA 2O4ZA 4HU1A 4WR7A 4ZX1A 5CACA 2FOSA 2FOYA 1ZH9A 3KWAA 3M5EA 4XE1A 5FL4A 3B4FA 3M14A 4HT0A 1FQMA 5JEHB 3BETA 4MDMA 3M5TA 1G54A 5SZ6A 3M1WA 5A25A 3MNKA 4FIKA 5G03A 4Z0QA 3P4VA 4Q08A 3CZVA 4E3GA 3B1BA 5EKJA 1KWQA 5JG3B 5G0CA 1G3ZA 1RZDA 4IWZA 4YWPA 4COQA 3JXFA 1LG6A 3OILA 4ITOA 2VVAX 4Q7VA 4FU5A 3T83A 1KOPA 1V9EA 4HEYA 4K0ZA 4HEZA 5EIJA 1BICA 5JGTB 4RH2A 1CALA 1H4NA 1CNJA 1BNVA 2CABA 2X7SA 1CAMA 3D0NA 1IF8A 1TEQX 3M2ZA 3IBUA 1CNCA 4QJPA 1FLJA 2F14A 4WUQA 1AM6A 3P44A 5BYIA 5SZ2A 1V9IC 5JEPB 3S77B 1KEQA 5DOHA 3V7XA 2NXTA 4HF3A 5SZ4A 1RJ5A 2POUA 3DD8A 4KP8A 4MDLA 3IBLA 1I9QA 4ZWIA 3N3JA 2HOCA 1RAYA 2QP6A 3M04A 5L3OA 4LU3A 1G1DA 4QK1A 4Q7WA 2NWPA 2OSMA 2EZ7A 4ZWYA 3HKTA 3HLJA 5DOGA 5EHEA 1OQ5A 2CA2A 3UYNA 4K13A 3BL0A 1XEGA 1FSRA 5FNHA 1JV0A 1IF9A 1TG3A 2NWOA 3MYQA 3OYSA 4N0XB 4QIYA 3W6HA 1I9NA 1CRMA 4E3DA 4MDGA 2CBBA 1G45A 4MLXA 3MDZA 3OIMA 3U47A 2CBDA 3RZ8A 4Q90A 4L5UA 6CA2A 2CBCA 1IF5A 1T9NA 3S97A 3P3HA 3NB5A 4Q81A 4XFWA 3GZ0A 3SAXA 5G0BA 5BRVA 3M2XA 1RZEA 1UGFA 2FOVA 1G4JA 3LXEA 4IDRX 4ETQC 1RZAA 1RZCA 4CNXA 3F8EA 1G0EA 1UGGA 5JG5B 1IF6A 1XEVA 1HCBA 1MOOA 1DMXA 3OYQA 5FLPA 2NXSA 5FNGA 4Q7PA 5FNMA 3RGEA 5HPJA 5FL5A 5DSPA 4ITPA 3RZ1B 3DBUA 3SBHA 5A6HA 3M5SA 4JSAA 3RJ7A 1CNHA 2Q1BA 3T5UA 1CAIA 3TMJA 1CNKA 4YGNA 4FPTA 1BN1A 1CVDA 3RYXB 4Z1KA 2VVBX 4QSJA 1AVNA 1YDCA 3S71B 5FNLA 5AMDA 5SZ7A 1UGDA 4G0CA 3V5GA 4XIXA 4JSWA 1XQ0A 1YDBA 5EKMA 1LGDA 2POVA 5DRSA 3R16A 1FQNA 1G6VA 4LP6A 3BL1A 4C3TA 2NMXA 5E2RA 4RFDA 3MNIA 3S78B 3MMFA 1KOQA 2FOQA 4Q8ZA 1HEBA 3P55A 3OIKA 4CQ0A 1CANA 1BNMA 1RZBA 3TVOX 5DSKA 5SZ0A 5CJFA 4E9OX 4ILXA 2CBAA 2X7TA 1H9NA 3U45X 1RJ6A 5G01A 1I90A 4PZHA 1UGBA 3N4BA 4Q8XA 3HS4A 2GEHA 3M2NA 3DC3A 3RZ5A 4QTLA 4N16A 4GL1X 2X7UA 1DCBA 4QJXA 5AMGA 5SZ1A 4BF6A 1FR7A 1TH9A 3QYKA 2NWYA 2NWZA 9CA2A 3D9ZA 3V3JA 2CBEA 1TG9A 1CA2A 4KNIA 4Q78A 2NNSA 4KV0A 3RZ7A 5IPZA 4RUZA 4KNMA 3S9TA 1CINA 3HFPA 3N2PA 5E5UA 1CAOA 1CZMA 5JEGB 1CCSA 3MHCA 3IBNA 4XIWA 2WEGA 3L14A 1YDDA 3FFPX 4QSBA 3T5ZA 1JD0A 4R5BA 4DZ7A 1CCTA 1RAZA 1TBTX 3KLDB 4K0TA 4RIUA 1YDAA 2NXRA 3IGPA 5JGSB 4X5SA 1I91A 4PXXA 5FLQA 4QEFA 2AX2A 3V3HB 4BF1A 4E5QA 3D93A 3F7UA 1BNTA 1CRAA 3UYQA 1HUGA 2POWA 3NI5A 1LUGA 3P58A 3M98A 4ZAOA 1I9OA 3S74B 2Q38A 3CYUA 3MNHA 1G0FA 1YO0A 5EHWA 4JSZA 3V3IB 3KNEA 3ML2A 4Q83A 1ZFKA 3D8WA 4Q99A 5JESB 1URTA 3F4XA 1I8ZA 1LZVA 4MTYA 3KS3A 5FLRA 4M2VA 3W6IA 2ILIA 1UGEA 4JSSA 3RZ0B 1XPZA 3PYKA 4Q87A 4QSIA 3D92A 1BNUA 1FQLA 4RN4A 2NNVA 3MHOA 7CA2A 2FOUA 4WW8A 1CCUA 4Z1EA 3Q31A 3PJJA 4RUYA 1I9MA 3SBIA 4M2WA 3VBDA 1THKA 1CAJA 1IF4A 3RYYA 3FW3A 1BN3A 3DA2A 2H4NA 5FDCA 3S73B 4QJOA 4E49A 3DCSA 1CVCA 3MHLA 3IAIA 4YXOA 4HT2A 1CAHA 1ZFQA 1OKLA 4LHIA 1TE3X 5AMLA 4FL7A 4KUWA 4Q06A 3OKUA 4K1QA 3S8XA 3K34A 2FNMA 2FNNA 1ZE8A 1BV3A 5DVXA 3S75B 3MWOA 5L6KA 4FVNA 3CAJA 4RUXA 4DZ9A 3CA2A 3F7BA 1DMYA 5EH7A 3ML5A 5E2MA 5FL6A 2HKKA 5E28A 1TTMA 2GD8A 2NNOA 2Q1QA 5EOIA 1BNQA 1G4OA 4FVOA 4CACA 4YYTA 4CNVA 4MLTA 4L5VA 1BNWA 4YGLA 1CNYA 3KOIA 5SZ5A 3KOKA 3SAPA 4BCWA 1TEUX 1CNBA 1FSQA 3S76A 1HCAA 1MUAA 2WD3A 5C8IA 1H9QA 1AZMA 4Z1NA 4MO8A 3KKXA 4WUPA 3EFIA 1CVEA 3OKVA 4L5WA 5FDIA 2ZNCA 2HD6A 4KNNA 5DSJA 4RIVA 5BRUA 4Q09A 3ZP9A 4QSAA 3RG3A 3KONA 5EHVA 3M1KA 3U7CA 2QO8A 1KWRA 5JQ0A 1DCAA 5CLUA 2NN1A 2FMGA 1HUHA 4PYXA 4QY3A 3MHMA 4HEWA 4K0SA 2FMZA 1J9WA 3P5LA 3RLDA 5DSNA 1YO2A 4KNJA 1CA3A 5DSOA 3V2JA 1BNNA 1OKMA 1CVFA 1ZSAA 3NJ9A 2WEOA 4M2UA 5DSMA 4ZX0A 4ZWZA 3DCCA 1TB0X 3DV7A 5SZ3A 5FNJA 5FNKA 5EKHA 4Q07A 3M1QA 12CAA 3MNAA 3ZNCA 4CNRA 3IBIA 3PO6A 4Q7SA 8CA2A 2W2JA 1CILA 5JQTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QK3 A;  5FLS A;  4G7A A;  5E2K A;  4R59 A;  4YX4 A;  1CNX A;  3KIG A;  4QJM A;  5EZT X;  5FNI A;  3S72 B;  3R17 B;  3DVC A;  1EOU A;  5JDV B;  1IF7 A;  1HED A;  4QK2 A;  3RYZ A;  1FSN A;  3C7P A;  1G53 A;  4KAP A;  3P5A A;  2WEJ A;  4QJ0 A;  4CNW A;  5BNL A;  3HKU A;  1YO1 A;  4YVY A;  2NNG A;  4PQ7 A;  1Z97 A;  5EH5 A;  1ZSB A;  2IT4 A;  1UGC A;  3OY0 A;  1CIM A;  1CAK A;  1CAY A;  4KUY A;  1A42 A;  4TWL A;  1LG5 A;  2FW4 A;  1JCZ A;  1G46 A;  2H15 A;  4Q6E A;  3MHI A;  3EFT A;  3M40 A;  5DSR A;  2EU2 A;  4Z1J A;  4Q6D A;  4CA2 A;  4ZWX A;  3DC9 A;  3FE4 A;  4TWM A;  5E5R A;  4Q8Y A;  1CVH A;  3T82 A;  4KP5 A;  1HEC A;  1CNW A;  4YGJ A;  1I9L A;  5E2N A;  4QJW A;  2WD2 A;  3DVD A;  5EH8 A;  3RYV B;  1OKN A;  5LMD A;  3TVN X;  3MNJ A;  1Z9Y A;  4YGF A;  1ZSC A;  1FQR A;  3HKQ A;  5CA2 A;  2EU3 A;  1BZM A;  2AW1 A;  2NN7 A;  5DSQ A;  3V3G B;  1Y7W A;  3IEO A;  1G52 A;  3M67 A;  1ZNC A;  3DCW A;  1BCD A;  4Q0L A;  4R5A A;  3V2M A;  3U3A X;  1CAZ A;  3DAZ A;  4FRC A;  1F2W A;  3M2Y A;  4YHA A; 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