The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGKALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structures of CO Hemoglobin E (betaE26K) approaching physiological pH (pH 7.5)
rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-02-16 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3D1K B; 1ECD A; 111M A; 1MNH A; 1VXE A; 2BK9 A; 4OF9 A; 5CND A; 3PI1 A; 1DXV B; 2QSS A; 1Y2Z A; 1O1P B; 1FHJ A; 1KD2 A; 3AT6 A; 1UX8 A; 3KUN A; 2HBG A; 1XZ7 A; 1ABW B; 2MGK A; 3UHY A; 3PEL B; 1TES A; 2O58 X; 2DHB B; 3AQ6 A; 3UHD A; 1ABY A; 3A9M A; 1YCA A; 1C7C B; 1MWC A; 3UHR A; 2ZS0 B; 4JYQ A; 1YFF A; 3HXN A; 2ZLX A; 1UC3 A; 4GZG A; 1HBA B; 5HU6 B; 3QZZ A; 1UT0 A; 1Y0D B; 2IG3 A; 1DXT B; 3QJD A; 1SWM A; 1HDA B; 1YHE A; 2GTL B; 1L2K A; 1CBM A; 4ZVB A; 1CP0 A; 3MJP B; 1YGD A; 2VYW A; 1YDZ A; 1V4U B; 3QJE B; 1V4X A; 3MOU A; 1YMA A; 1JY7 A; 3UH5 A; 1OR4 A; 1G08 A; 2AUP A; 1RQ3 B; 3GQP B; 5EYJ A; 1CLS A; 2ZLT A; 3PI8 B; 1IRD A; 1LHS A; 102M A; 3ZOL A; 1OFK A; 3IC2 A; 2AV0 A; 3R0G A; 3D4X A; 4MQK A; 3HEP A; 4N7O B; 2EKT A; 3NL7 B; 1ABS A; 4PQB A; 2PEG A; 1AJH A; 1MWD A; 2HCO B; 5ILP A; 5C6E B; 2AUQ A; 2D2N C; 1YIE B; 2KSC A; 1O1I A; 2HBD A; 3WHM A; 1NS6 A; 2G0S A; 1DWR A; 5ILR A; 1U7S A; 1GZX B; 3K8B A; 1MYH A; 1C40 B; 3WR1 B; 3WCU A; 1MYM A; 4MQI A; 3WCU D; 4JAC A; 4F6B A; 1HBR B; 4HSX A; 1S6A A; 1Y7D A; 3EOK A; 2ZLW B; 2XKH A; 3WCT A; 4O1T A; 3WCT D; 2R4Z A; 4DC7 A; 2LH2 A; 3HHB B; 3K9Z A; 1NEJ B; 1YVQ B; 2BWH A; 1F5P A; 1SDL B; 3QM9 A; 2HBS A; 1M9P B; 1YE2 B; 1VWT A; 1XXT A; 1FDH G; 4O2G A; 4ODC A; 2MGF A; 2GNV A; 2FRJ X; 5HY8 A; 101M A; 1XY0 A; 1JPB A; 1COH B; 1BUW B; 5CNC A; 2RI4 A; 1HJT A; 1F5O A; 4N7P A; 1IWH A; 1YG5 A; 2SPO A; 1YOI A; 3UH6 A; 1RQA A; 2NX0 A; 5E29 B; 1A3O B; 1ECO A; 3VRF B; 1HAC A; 2YRS B; 2VHB A; 3UHS A; 2AUR A; 1S5Y B; 4XDI A; 3A59 B; 2BKM A; 1FN3 B; 1FCS A; 4O4Z A; 1YEU A; 1YEO B; 4HHB B; 2M6Z A; 2ZSS A; 1YZI B; 1U7R A; 2NRL A; 3OO4 A; 1LFY A; 1MLU A; 3ECZ A; 1FDH A; 3IA3 B; 1Y0A A; 4YU3 A; 2G10 A; 5EUI A; 3ZJN A; 1J41 A; 2O5S X; 1LHT A; 1WMU B; 2HZ2 A; 5ILM A; 4ROL B; 2PGH B; 3UGY A; 3MYM A; 1MLL A; 1YEQ B; 2FRK X; 2D5Z A; 2D2N B; 2V1F A; 1CG5 B; 1NAZ A; 3GKT A; 5C6Y A; 3AT5 B; 1J7Y B; 3MJU A; 3IXF A; 3PI3 A; 4MQJ A; 4VHB A; 3OO5 A; 3VRE B; 4O35 A; 1PBX B; 1VRE A; 1BZP A; 1LFL B; 3GLN A; 3GOU B; 1THB A; 1S5X A; 2DN1 A; 1A0U B; 1WVP A; 3H57 A; 1YHR B; 3G4U A; 3ODQ A; 1GCV A; 1BZR A; 1MZ0 A; 104M A; 4NI1 B; 1HRM A; 2G14 A; 3DUT B; 3GYS A; 1MBA A; 5MBN A; 2V1J A; 2FRF A; 2BNL A; 2MGI A; 1CIO A; 1X9F C; 4XS0 B; 1HAB B; 1RPS A; 2LHB A; 2NSR A; 3MN0 A; 2IN4 A; 1YEN A; 1GCW A; 1JEB A; 1NIH B; 1YE0 A; 2D2M C; 2MGH A; 1A6K A; 3PT7 A; 1RSE A; 1Y4V B; 2ZFO A; 3IC0 A; 1JZM A; 1EWA A; 1GBU B; 2ZFO D; 1VHB A; 2QLS B; 3WFT A; 1LFT B; 4H2L B; 1OUT B; 1V4W A; 1VXD A; 1HGA B; 1QXD B; 3FH9 A; 3P5Q A; 1NWN A; 1V5H A; 2D5X B; 1H97 A; 2AA1 A; 4TWV A; 1VXB A; 3A0G A; 3CIU B; 1HCO B; 1HV4 A; 1DWS A; 4M4A A; 5CHQ A; 4NXC A; 2DC3 A; 1Y46 A; 1HBS A; 3D1A B; 1Y5F B; 2B7H A; 1Y8I B; 1YIH A; 1GDJ A; 3R5I B; 1Y4B A; 2QFN A; 1QPW A; 1MLS A; 3HYU B; 2ZSX A; 1O16 A; 3HEN A; 1H1X A; 1ECA A; 1YEV A; 3ONZ B; 2SPM A; 1IBE B; 3DHT B; 1HGB A; 3A5B A; 3MKB A; 2MHB B; 1IT3 A; 1CMY A; 3V2Z A; 5KDQ B; 1K1K A; 1LH7 A; 1Y83 B; 3VRG A; 1HDB A; 2R4W A; 4F4O A; 1G09 B; 2Z6N B; 1Y85 B; 1CH7 A; 1Y7G B; 3WCV C; 2FRI X; 1OBM A; 1V75 B; 2ZFB A; 3BJ1 B; 1LJW A; 1DXU B; 1J7W A; 1VRF A; 1A4F A; 1X9F B; 1RQ4 A; 7HBI A; 2GNW A; 3ZJJ A; 3QJC B; 3VAU A; 1MNK A; 1Y8H A; 2D2M B; 2MGJ A; 2DN2 B; 1MLH A; 5SW7 A; 1X3K A; 3OGB A; 4N7N A; 5CNG A; 1Y4P A; 4TYX A; 3ZJR A; 1LFZ B; 1K0Y B; 1QXE B; 6HBW A; 3HF4 A; 4WCH D; 2ZST A; 2ZLU B; 1O1M A; 3B75 B; 2O5O X; 1CBL A; 1R1Y A; 3NG6 B; 1RTX A; 1MLJ A; 3BA2 A; 2ZS1 C; 2V1E A; 2GRZ A; 2NSS A; 2QSS B; 1Y2Z B; 1BVC A; 105M A; 5CN6 A; 1X46 A; 3AT6 B; 1Y31 B; 1BIJ B; 3ZJH A; 1XZ4 B; 3LQD A; 5HLU A; 4ESA A; 1OUU B; 3WTG B; 1LFV B; 2GL3 A; 1CG8 A; 3HXN B; 1EBC A; 1O1N A; 5JDO E; 3WFW A; 3S65 B; 2VYZ A; 3EDA A; 1LFQ B; 3AQ8 A; 1MCY A; 4HBI A; 3NFE B; 1YHE B; 1NZ3 A; 2MGL A; 5JOM A; 3WCW A; 1DM1 A; 3WCW D; 1XZ5 B; 1DKE B; 1Y7Z B; 2HZ3 A; 1XYE B; 2MYD A; 1A0Z B; 1BIN A; 3GQR B; 2W6X A; 1DUK A; 1IOP A; 1XQ5 B; 1URY A; 4MQC B; 2HHE A; 1Y35 A; 2DXM A; 2EVP A; 1G9V B; 1HGC B; 1LH5 A; 3QJB B; 4G51 A; 1Y8K A; 3BOM A; 3GDJ B; 3WCV B; 3D4X B; 1IT2 A; 1JP6 A; 1JL7 A; 2QFK A; 2ZT3 A; 4G1B A; 2H8D A; 2ZSQ A; 1N9F A; 3QM8 A; 2MGD A; 1AJ9 B; 4ILZ A; 3PT8 A; 1MLR A; 3FS4 B; 2CMM A; 4NK2 A; 2G11 A; 1BZ0 A; 2QMB B; 4ROM B; 1UFP A; 3D7O B; 1J7S B; 4N8T B; 1QSI A; 3HRW B; 2JHO A; 1XCH A; 3TM9 A; 4F68 A; 3WFX A; 1JZK A; 1MOB A; 2MGM A; 2QU0 A; 4MU5 A; 3BJ3 A; 3QQR A; 5EOH A; 2R80 A; 2ZS1 B; 3A5A A; 5CNF A; 1MTI A; 2QSP B; 2HBS B; 4C44 A; 2H35 B; 4MQH B; 1S0H A; 1OR6 A; 1MBN A; 5CNB A; 5EYS A; 2RAO A; 108M A; 2Z85 A; 3NMM A; 1MBC A; 1GBV A; 3GQG B; 1MBO A; 4QAU A; 1CO9 A; 3ZJL A; 1XY0 B; 2ZLV A; 3LB4 A; 1G0A A; 3G53 A; 3OZU A; 1CH2 A; 5JGG B; 1Y5J B; 1O1K B; 1J3Y A; 4IRO B; 1SHR A; 1NQP B; 1O1O B; 1Y0W B; 1T1N B; 5EV5 A; 1FSX B; 1SI4 A; 1BAB B; 2G0X A; 3LB1 A; 2VYY A; 1QI8 B; 4U8U C; 1XZ2 B; 4AVD A; 1FAW B; 2VEE A; 1DXV A; 3OO4 B; 1O1P A; 3ZJP A; 5F0B A; 2G0Z A; 2DHB A; 3ARL A; 2W72 C; 1C7C A; 1Y4F B; 3UBC A; 2ZS0 A; 1MLG A; 3WCP B; 1MOA A; 2ZS0 D; 3WFU A; 3DHR B; 1Y0T B; 3MBA A; 2HBC B; 1HBA A; 1YH9 B; 5CN4 A; 3KMF C; 109M A; 5HU6 A; 1Y0D A; 2W31 A; 2MGC A; 4F69 A; 5E6E B; 1DXT A; 1HBI A; 2E2Y A; 2ZSY A; 2GTL A; 3W4U B; 3MJP A; 1JWN A; 1MLF A; 2GTL D; 1DXC A; 2HBF B; 1Y4G B; 2OH9 A; 1CH3 A; 1V4U A; 4B4Y A; 2GRF A; 1YCB A; 3SDH A; 4MAX A; 112M A; 4UUR A; 3PIA B; 3QMA A; 1CQ2 A; 2LH7 A; 1UVX A; 1RQ3 A; 3GQP A; 1GLI B; 1GDK A; 3PI8 A; 2MGA A; 2ZWJ A; 2HHB A; 4F6D A; 1J3F A; 4ZVA A; 1M6C A; 4N7O A; 1XZV B; 3NL7 A; 1VXC A; 3S1I A; 2GRH A; 2ZT1 A; 1MDN A; 2HCO A; 1JW8 A; 5B85 A; 1O1L A; 5C6E A; 1IRC A; 1CH9 A; 1J3Z B; 1YIE A; 1RPS B; 3BJ2 B; 3UGZ A; 1JL6 A; 5EE4 C; 4B3W A; 1GZX A; 1LUE A; 1Y8W B; 3TM3 A; 1C40 A; 3WR1 A; 3PT7 B; 5CN8 A; 2H8F B; 2HHD B; 1MBD A; 1HBR A; 1Q1F A; 2G0V A; 2HBE B; 3E5I A; 1ITH A; 2LH1 A; 4U8U B; 2ZLW A; 3UHH A; 2LH6 A; 2EKU A; 4HRR B; 1Y5K B; 1YVT B; 4HRT A; 1CH4 A; 1BBB B; 3HHB A; 1NEJ A; 3G4R A; 4PQC A; 1YVQ A; 1SDL A; 3D17 B; 2C0K A; 4NS2 A; 1QSH B; 2XKG A; 5JDO C; 1M9P A; 1YE2 A; 1MYZ A; 1A6G A; 3ZJO A; 1Y22 A; 4FC3 B; 4WJG 1; 1HBH B; 1BJE A; 1O1J B; 1YOH A; 5D1V A; 4KMW A; 4NK1 A; 4H07 A; 1A00 B; 1NS9 B; 2W72 B; 3CY5 B; 1COH A; 1Y0C B; 1DUO A; 4M4A B; 1JZL A; 1I3D A; 2D60 A; 1Y46 B; 1HBS B; 4LPI A; 1A6N A; 3AQ9 A; 1MGN A; 5E29 A; 1A3O A; 3VRF A; 1F65 A; 2G3H A; 1BZ1 B; 2YRS A; 3A5G A; 3OJ1 A; 1S5Y A; 3A59 A; 2ZT0 A; 3G4V A; 1YHU C; 1YEO A; 1DO7 A; 2MB5 A; 4HHB A; 5HBI A; 3ZH0 A; 1YZI A; 1HGB B; 4L7Y B; 1Y7C B; 3MVC A; 2R1H B; 1DTI A; 4IT8 A; 3G52 A; 2VM0 A; 4F4O B; 3LB2 A; 3RJN B; 2W6V B; 4M4B B; 1A3N B; 1WMU A; 4ROL A; 2PGH A; 1YGF B; 2ZFB B; 1YEQ A; 2VLY A; 3MYN A; 1HBB B; 3PI9 B; 2D2N A; 2DN3 B; 2D2N D; 1RQ4 B; 1NPG A; 1CG5 A; 1S61 A; 3DR9 A; 3AT5 A; 1J7Y A; 3UHU A; 3LR9 A; 1MKO B; 3VRE A; 4N7N B; 2ZSO A; 4KN3 A; 1HHO B; 3S66 B; 1C7B B; 1PBX A; 3HF4 B; 2XYK A; 2GDM A; 1GDI A; 2V1H A; 1B86 B; 3UHT A; 1LFL A; 1Y4Q B; 4F6G A; 3GOU A; 3ARJ A; 3GKV A; 3EU1 B; 1A0U A; 1NZ4 A; 1A01 B; 1Y09 B; 1XZU B; 2D6C A; 3WI8 A; 1C7D B; 1R1Y B; 2NRM A; 4X0L B; 1YHR A; 2OH8 A; 1UIW B; 1I3E A; 3ZJI A; 2LH5 A; 5KER B; 4NI1 A; 4YU4 B; 1SDK B; 2MYC A; 1MLM A; 3G4Y A; 2ZT4 A; 5CNE A; 3ZOM A; 1NGK A; 3BCQ B; 1CP5 A; 2ZSR A; 1MBI A; 4NI0 B; 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2ZLT B; 1IRD B; 2D2M A; 3HEO A; 2D2M D; 2DN2 A; 3IC2 B; 4MQK B; 1LFZ A; 1NWI A; 1QXE A; 1R1X A; 1BZ6 A; 1DTM A; 1MTJ A; 1SHR B; 2PEG B; 3QM7 A; 1YMC A; 2ZLU A; 5AB8 A; 3B75 A; 1O1I B; 2HBD B; 3ZHW A; 3NG6 A; 3WHM B; 1NS6 B; 3UHB A; 5EET A; 4L2M A; 5IKS A; 2GLN A; 3K8B B; 3QQQ A; 3WCU B; 4SDH A; 4MQI B; 4FWY A; 1Y31 A; 1BIJ A; 1XZ4 A; 3OK5 A; 1OUU A; 3ZJM A; 3WTG A; 1LFV A; 1Y7D B; 3EOK B; 3WCT B; 5CN9 A; 3UHQ A; 1LH1 A; 1SPE A; 2EVK A; 3S65 A; 1LFQ A; 1MOC A; 2OIF A; 5MBA A; 3UHE A; 3A2G A; 3ORD A; 1VWT B; 2G12 A; 4FWX A; 1XXT B; 5CN5 A; 3RGK A; 4ODC B; 3UHK A; 1CPW A; 6HBI A; 3NFE A; 5HY8 B; 1GDL A; 1XZ5 A; 3U3E A; 1DKE A; 1V9Q A; 1Y7Z A; 1XYE A; 4FH6 A; 1A0Z A; 2RI4 B; 3GQR A; 1EW6 A; 1XQ5 A; 5HLQ A; 1VXG A; 4N7P B; 1IWH B; 4MQC A; 1YG5 B; 3M39 A; 1DXD A; 5M3S A; 1MLK A; 1RQA B; 1NZ2 A; 1G9V A; 1HGC A; 3HC9 A; 3QJB A; 2ZFO C; 1HAC B; 3GDJ A; 2HHB B; 1EBT A; 3WCV A; 4DC8 A; 3WCV D; 3D1K A; 1YEU B; 2M6Z B; 1DO3 A; 1LFY B; 2MGB A; 1AJ9 A; 3M38 A; 1O1L B; 3FS4 A; 3H58 A; 4ROM A; 2QMB A; 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