1YXWA

A common binding site for disialyllactose and a tri-peptide in the c-fragment of tetanus neurotoxin
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Common binding site for disialyllactose and tri-peptide in C-fragment of tetanus neurotoxin
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Tetanus toxin (Tentoxylysin)
total genus 115
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2005-02-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1yxwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1yxwA02
4XBQA 1D2SA 1QQKA 2A7AA 3LCPA 2E7QA 1DQ4A 4IY8A 3D7WB 1BARA 5H9SA 3AJYA 4G9MA 1N47A 1WW7A 1JYIA 5BXTA 2D7RA 4NO4A 3O49A 4TLPA 4AGRA 3FLPA 2D43A 1KNMA 3UJQA 1XQNA 3AH2A 2CWSA 4YW5A 1IT0A 5GZDA 2RSTA 4OZXA 4EFRA 4Q26A 2V5YA 3M2MA 3AJZA 3RTJB 4G6MA 1BLAA 5BQUC 3W9TA 1V00A 2AXMA 3PG0A 3WINC 3BOPA 4L8QA 3E8LC 3O5WB 3NBDA 3BIWE 3C2UA 5GZGA 1MR5A 2MLLB 4I7IA 5IK4A 4XFSA 3ZSLA 4XZPA 5CB7A 3POKA 2NMOA 1HWNB 3WMUA 2Y9FA 3BRDA 4P0LA 4XJZA 2UWCA 1R8OA 3ILFA 5IK7A 1W6PB 5H9PA 3ZYPA 4M01A 1ISWA 1KJLA 3OJ2A 4Y1YA 1ULDA 5CBLA 1XG6A 3B9UA 1V6LA 2AR6A 1YXWA 4LBQA 1V6WA 2DTWA 4IYBA 2WSVA 3RQ0A 2JECA 3ZXKA 4EKXB 2PHXA 4LBKA 4XJWA 4LBNA 4YLZA 3WMVA 1N1YA 3HSMA 1QKQA 1DQOA 2BEAA 3ZXFA 4PF5A 4YM1A 4DQAA 4QKSA 1Q8VA 4YZ1A 3AH4A 3NV4A 3OJVA 4P6AA 1SZ6B 1Q8OA 4JQ0A 4YFWA 1Z0HA 1LEDA 3BA7A 1L2HA 1MD6A 4XE9A 3A07A 3UDAA 4Y1XA 3FJEA 5B2HA 4JC1A 1FNYA 3M1HA 1SFYA 3WDVA 3O4CA 2A6ZA 2FGFA 2GNMA 3QR5A 1QQLA 3M3OA 3V79C 3Q7YA 2AAIB 3BAVA 4BPZA 3WO3A 1AX1A 1GV9A 3JU9A 5FNXA 5I1BA 3ZX7A 3AZXA 4XDQA 1W6PA 1Z2VA 5T54A 3S8JA 5DXDA 1XHBA 4ZA3B 3CA0A 5E89A 2H0BA 2CWMA 1CN1A 1FAYA 4SLIA 3UD7A 2Z48A 3SH4A 3FJ8A 1GANA 4YW2A 1Q8QA 2ZGMA 1F5FA 4M3CB 2DWRA 3JUTA 3AYCA 4ZLBB 1ENRA 4LO7C 4X3AA 4ENDA 1APNA 1YIFA 1TP0A 3B00A 3IPVB 3UD9A 2HZ9A 4XJUA 4FPYA 2HYKA 1V6MA 2YROA 3SNMA 2NM1A 4D0TA 1R1ZA 1JLXA 4K21A 3AXEA 2VXTI 2A3WA 5DZEA 2KLLA 3QLQA 3LTQA 2AREA 3BRFA 1Q1UA 5DUUA 2VW0A 5DG1A 2ZHNA 1F9KA 3WDYA 2UWAA 2D3RA 1JT3A 4XBNA 1RG8A 2FFVA 3IM7A 4Z9WB 4XTPA 3NJ5A 4YGEA 3K1XA 1HQWA 1QGLA 3N0KA 4RL7A 5KXCA 4DRRA 4LO0C 1BZWA 1VIWB 3WCRA 3AKHA 1V6UA 4TZDA 4FOWA 2MC2A 1ULGA 4PC4A 3A0NA 41BIA 2FMDA 1IHKA 2CL2A 3OPZA 1JOJA 3FJIA 1QDCA 1A78A 2D3PA 2ERMA 1OQ1A 3MEPA 1I1EA 2P37A 2K43A 2JDZA 4UW4A 1RMLA 1H30A 4XOGA 3P6JA 2D6MA 3ZPYA 4M3CA 1SLAA 3CA3A 1BKZA 5F5QA 4BMBA 2ZHLA 4H55A 1GICA 2M49A 4YW4A 1G9CA 1DLLA 3VT1A 4PQ9A 1KITA 4D0ZA 2ZGLA 4I2SA 2PHUA 1VAVA 2LIQA 4XKIA 5JOXA 4WZFA 3CRIA 2GMPA 4OW4A 4GP0A 2ZMLA 3AK0A 4I4XA 2D24A 4ASMB 4GP3A 4ATEA 3H6QA 3AX4A 4YW1A 1W0PA 3FJKA 1ULFA 2GDFA 5HCFA 4LO1C 2VH9A 4KEJA 2DU0A 5SV8A 4JAWA 3ILRA 1FV2A 5DSSB 5JDBA 1GBGA 3BX1C 2JD4A 1TWEA 3AFKA 1WD3A 4LBOA 4QALA 3O4OA 3O0WA 3DGTA 1LCLA 1LOGA 3U4XA 1AXYA 2DUOA 4X38A 2ZGRA 3TC2A 1LOCA 1AJOA 1MZ6A 4DENA 3VUOA 4XJ9A 5GM0A 4YG6A 5JVVA 2ZGOA 3T8SA 3WZ1A 4I0YA 1IS6A 3FLTA 4XIOA 1JXNA 1LHOA 2A3XA 5F90A 3AYDA 3VSFA 1LOAA 4ZXKA 3SH5A 1WBFA 3HR9A 4FOYA 2DS0A 1FYUA 1G82A 3OYWB 4CZSA 2W08A 2K4AB 3ILAA 1WCSA 1G7YA 3R05A 1LGBA 2R9KB 2R49A 3FJHA 2WLQA 2ZHKA 1WD4A 3OBTA 3O4BA 4Q2FA 2FDBM 1AXMA 5GJ6A 3AH1A 3SNVA 2NTDA 2NYYA 3ZC9A 1QOTA 4XXPA 3VV1A 2D6OX 1AF9A 2Z49A 4LBJA 1BXHA 4XTMA 1LU2A 2KKIA 4XFUA 3S8KA 1IRAX 1DZDA 2GN7A 3OBRA 3OGFA 4Y22B 4OWKA 3CRGA 1DIWA 3RMYA 2KI6B 4FQ4A 2ZGSA 1ULEA 1C57A 3WG3A 31BIA 1H9PA 3VKNA 1LECA 1G9BA 2ZQNA 1W6OB 1G9AA 1GNZA 3INAA 5E24E 3Q9OA 1SLCA 5FRAA 1IKQA 4U36A 2GNBA 2ZA9A 2GNTA 4AWDA 2ZABA 3NV3A 1DYKA 1ILR1 3WG1A 3OYWA 1CPNA 4XMIA 3USUB 3CRHA 1FMZA 1P63A 3AKGA 3GNEA 4LO3C 3VKOA 4DEPA 3CA6A 4AVTA 3N7JA 4AVVA 2NN8A 1YI7A 2Y9WC 1MS0A 1FWUA 4UW6A 1CIWA 1KDMA 4BM8A 1T9FA 3BADA 4WV8A 4KC3A 2I1BA 4GWMA 3V0AA 1B09A 3D4KA 5EYYA 4A7YA 1HCEA 1UZZA 1BJQA 3CU1B 2E53A 3AP5A 1WW4A 3UD8A 2ZAAA 4XYXA 1VLNA 5GLUA 2V73A 1N1VA 3SITA 3WO4A 5BQUA 1EYLA 2C9AA 3POSA 1JLYA 3WINA 3POWA 1RINA 4R9AA 1AVXB 2L5XA 5GAQA 1SR4A 1V6VA 2VSEA 1ISXA 1YF8B 4Y1VA 2KI4A 1S0FA 4P9YA 2MIBA 1KDKA 3HBWA 1UL9A 1JW6A 1LOFC 2WJSA 3JRRA 4XMAA 5FZYA 1TTUA 2ZGNA 2G4IA 2B7YA 3PVEA 4DRVA 2A5ZA 4ZBVB 2W39A 3Q7WA 1N3PA 3AP6A 1RZOB 2SBAA 3BAGA 1DFCA 4Q1PA 1ONAA 3PHZA 1FMMS 1JT7A 1J1TA 1MZ5A 4IHZA 5IUQA 3C9ZA 5D62A 2W68A 3FJ9A 2ZHMA 4LO7B 3APBA 1Z78A 3ZXLA 2ARBA 2EXKA 2P3KA 1PC8B 4USOA 2AUYA 1Q56A 1DZCA 1DQ2A 3ZVXA 1GSLA 3N7LA 5EXOA 2FHRA 4Y1UA 5JLVA 2ZGQA 3IIRA 1V6JA 2I2SA 5DVHA 4QD2C 4CJMA 1AFCA 4L4IA 1IRPA 4XXAA 1S0LA 4J2KA 3P6IA 4ATFA 3FJDA 1BFFA 2RQ9A 1PWAA 3FJFA 5DUYA 4BLIA 4YM2A 1DFQA 3TB0A 1YRZA 1IJTA 5BP5C 1KRIA 5GZFA 3B3QE 1XYFA 1E0OA 1URXA 4OEEA 1LHVA 1IOAA 1IS4A 4I96A 3LLPA 2LIEA 1CPMA 2P2KA 2Q5TA 4OWLA 4ITCA 3IM5A 4OEGA 4BQ1A 2A71A 2CY6A 1FV3A 2XB6C 5JOWA 5DUXA 3BAQA 2ES3A 4IZEA 1CJPA 1HCDA 1K5VA 4G1RA 2NVHA 4L4HA 2ZBJA 1QNYA 4A7KA 1BLDA 2ZACA 3PVNA 1WW5A 4Y24A 4GOYA 3FUQA 5GALA 5BOWA 1UKGA 3ATGA 5DG2A 4ISQA 5CAZA 2ZR1B 3IN9A 1WLDA 1W0OA 4HANA 4UW3A 3ZXJA 1LOEA 1HDKA 3OY8B 3MW3A 2W52A 1S0CA 4JP0A 1N3QA 2EXJA 4GKYA 4M00A 4F34A 3VKLA 4FOVA 2WRYA 2OUHA 4AN7B 4YGBA 2ZZJA 2D20A 2KH2A 4WBCA 3BTAA 4BMEA 1QDOA 2DVBA 4LBMA 2BFHA 3WUDA 2AH2A 2HWMA 1QOOA 4YG3A 4U2AA 4PCRA 5EC5A 2P23A 2ZMKA 4Y26A 1RIRA 1WLCA 4D8HA 5E8AA 4X37A 3VSZA 3AZYA 3WV6A 3NBNA 5IT6A 1OFSA 3IMNA 1IOBA 2GZBA 2AGSA 3Q7XA 4Q91A 3I8TA 1Q03A 2VLCA 3H0OA 5T5LA 1ISZA 4XIKA 5E88A 4JRAA 2NMNA 3HALA 3FJAA 4JKXB 3MW2A 3OGGA 1D0HA 2D6NA 1IILA 3KM5A 5T55A 3UK9A 2PHTA 1AVAC 1WUVA 4I8MA 4ZKTB 1ULCA 1UPSA 4UW5A 3VEQA 3I4IA 2ZGKA 2X2TA 1Q8SA 4P9XA 1SLLA 1CVSA 4A7ZA 3OJBA 1MS3A 3FUOA 4I4PA 2UURA 3FJJA 4R9DA 1LULA 1HKNA 1SLIA 3WDWA 2E6VA 4LO2C 1LU1A 4FP2A 4WVVA 1V6KA 1TFMB 3H6SE 3SLIA 1CQ9A 3AYAA 3OY8A 1HLCA 1CE7B 3I2XA 3ZSJA 4K20A 3O0XA 4AVSA 3D6EA 2YUGA 5DZFA 4AYUA 3N36A 1QU0A 3VT0A 4YGDA 3NV1A 1MC9A 2AFGA 3M3CA 3ENRA 3SISA 4LO1A 3WVJA 3IPVA 5F8YA 2PHWA 2A70A 5T5JA 3WOGA 1II4A 2DTYA 1MVEA 2Q9XA 1JBCA 2X2SA 1LOBA 1SLTA 4FPJA 1DQ5A 2GNDA 3NWKA 5D61A 1BASA 1S0GA 3NV2A 3T1LA 1A3KA 1JT4A 4YG0A 2VXRA 2Y9GA 2JJ6A 3AJ5A 4G6JA 2WQZC 3I29B 3H6RB 2R0FA 3UJOA 4MYEA 3BA5A 1MS1A 2DREA 4GXLA 5DUWA 1YTOA 5IK8A 4K1ZA 4ZFWB 1PUMB 2ERFA 1FATA 2IHOA 4I1BA 4FPFA 1FX5A 1ZM1A 1W6MB 1SCRA 2Z42A 2LALA 1DBNA 4FGFA 1QOSA 3W59A 3POYA 4IZXA 3B01A 3N35A 2DUPA 1GZCA 3VKFC 4YW3A 1BFGA 3OJMA 3WDUA 5GLTA 2R16A 1EV2A 3RTIB 4JKQA 3ZXDA 3UJ0A 1TWMA 5LK5A 4IQPA 1YO8A 2WT0A 2Y9XE 3MW4A 4QBCA 2FO1A 2DVGA 4KEKA 2XOAA 1IS3A 1I3HA 1QF3A 4NOTA 4LBQD 4HA2A 2F2FC 5KXBA 5IK5A 1BA7A 1WW6A 4AGVA 2EXHA 2VUAA 5DUVA 1EVTA 1GGPB 4C1WA 1SBFA 3M3QA 3WUCA 3AJ6A 3ZYRA 2DYCA 2YMZA 3O4AA 3CA4A 3EF2A 5T50A 2BEBA 2PHRA 5KXDA 3H6RA 1S0BA 1SBDA 4FPEA 3KMVA 3QCWA 4P14A 1AVBA 2D6LX 4QO3A 4H9WA 4PBOA 1T4QA 2K8RA 4GOVA 1AXZA 1HIBA 3LSDA 1SLBA 3AKIA 2WT1A 1EPWA 3V0BB 2WBCA 3CA1A 1G9DA 4LO3A 4AGGA 2DU1A 1R8NA 2VW1A 3CNAA 3AYEA 1BFBA 4Q9GA 1UAIA 3AP7A 5F8SA 4F83A 1ENSA 3TAYA 4QD2B 6I1BA 4Q27A 3O44A 4I4QA 1HWPB 1IKPA 4WVWA 3ZXEA 2E4MC 3B69A 4YZ3A 1DYPA 3WHUA 2QN4A 3BA4A 1J0SA 3HMYA 4DFSA 1GYKA 5FNWA 3A4UA 2JKBA 1WBAA 2VSAA 1DJSB 3A23A 1ITBA 1I1BA 2WKKA 1CONA 2GMMA 3WG4A 4QKRA 2UUSA 1LOFA 2WT2A 4II0A 3WO2A 1V6IA 1FN0A 4YOLA 4YZ5A 5KXEA 2AYHA 2YV8A 3CAHA 2HW9A 2D23A 4FPGA 2TEPA 3O0VA 1UN1A 3QYDA 1ONKB 1HWOB 4Y22A 1WBLA 2ESUA 5GZCA 2PELA 1LEMA 2UWBA 1TEIA 4EFQA 2KM2A 5F9TA 3V0BA 5L73A 2D22A 2HWAA 5EYXA 1S0DA 4FVVA 1W6OA 3FLRA 3I2AA 2D7IA 3WDXA 4M3CE 1LHUA 3JUUA 1BFCA 2D44A 4Q1RA 3D5OA 3PUBA 3SH3A 2Q3NB 5EG6C 2D7FA 4P0JA 3RS6A 2ET2A 4LBLA 4OUJA 4J2SA 4R6UB 4Y1ZA 1SBEA 2YXSA 3USUA 5HPZA 3O3QA 1SR4C 4HR6C 4ZFYB 3IKWA 3A0KA 9ILBA 4GWNA 1GLHA 4BOWA 2UU8A 4I1EA 2DV9A 5BP5A 1S1AA 2DVFA 3F1RA 5BXPA 3O5SA 5JOZA 1GKBA 3IM6A 4KBBA 4USPA 4R9BA 2YZ4A 5BYNA 1S0EA 4FPKA 3CA5A 3BB2A 3WA1A 5T5PA 4HJJA 2F8XC 5GZEA 1GZ9A 1DQ1A 1F31A 1CR7A 2CYFA 2DRZA 1NLSA 3GALA 5CNAA 1NUNA 5DZUA 3ASIA 4XJ8A 1FNZA 8I1BA 4XJAA 2VU9A 2RHPA 4I6IA 4I4RA 4J2YA 3NBEA 3V65A 3WCSA 1M16A 3WDTA 3LSEA 4AN6A 3B9CA 4FPCA 1W3AA 4P9WA 3WG2A 2C5DA 4FOQA 4Q8LA 4Q8KA 5H9RA 3CQAA 1DQ0A 1TIEA 3RSJA 4IONA 4FQZA 1DQ6A 3IM0A 4M3CF 1KQRA 1W6QB 2DURA 2ZQOA 2YY1A 4DCKC 3BRGC 1NZKA 3ZC8A 4ISRA 3ZXGA 3VT2A 2NZ9A 4I30A 1IS5A 3O4DA 2R0HA 1WBCA 3BAHA 1JY0A 4JPZA 1SCSA 3FJCA 1W3FA 1LHNA 3HN1A 2DUQA 3DUIA 1Q04A 4Z8BA 3F62B 4P0KA 2A6XA 3FBYA 3FGMA 1GNHA 3L2YA 2EAKA 1C1FA 2WSUA 2D1ZA 1QNWA 2D6KA 1UMZA 3N3HA 4EEEB 4R9CA 1JUIA 3BAUA 1G8WA 2A6WA 4CRQA 2CNAA 4FPHA 4I4SA 21BIA 1W3GA 1LGCA 1JTCA 4YM0A 1ENQA 2VW2A 1JQZA 5D63A 5EWSA 5GLWA 1PUUB 2P3IA 1RY7A 2RG9B 4YZ2A 4LO0A 1G86A 1K5UA 1Q8PA 2WNEA 4J2XA 1N1TA 1VAMA 5HCAA 1YBIA 1G9FA 1Z4SA 4GKXA 1MACA 4LO2A 1DGLA 4LO8B 1RITA 3AZZA 4I4VA 1CESA 2DRYA 1W6QA 4TYSA 1LJ7A 4DPNA 1AZDA 1HKDA 2OVUA 4H04A 5JOYA 2A3YA 1PZ9A 3AP9A 4FPLA 2GO2A 2ZGUA 2DVAA 3HOMA 3BODA 4YFZA 3W58A 1AVUA 1DZQA 1C4RA 1CVNA 2XG3A 2GALA 1LTEA 2ZKNA 5DZGA 3AP4A 1OQLB 2AQZA 2OW4A 1VALA 3T1MA 2EXIA 2GN3A 1C1LA 4IY9A 3BAOA 3AZVA 1W6NB 2PHFA 1LGNA 1O4YA 1VCLA 4KEIA 4I4YA 4D69A 3NBCA 1MS8A 2FFUA 4ZFUB 2GMEA 3UL2A 4XBLA 4DS0A 3AKFA 1BYHA 5F8WA 3PJQA 2ZMNA 1AJKA 4I4UA 2R1BA 4GAIA 1O4ZA 2SLIA 4OWJA 3V64A 2QYIB 5BXSA 1JN2P 2P3JA 1KJRA 1SACA 1NXD1 1FGAA 3RRDA 5AVAA 1OKQA 5GLZA 1MS9A 3ZSMA 3ILNA 1AX2A 1V6XA 1A8DA 4ZOTA 2A6VA 4JCKA 2ENRA 1LENA 5FZUA 2D6PA 3UJ4A 2ARXA 3M3EA 4X39A 2DVDA 1XZZA 3VWCA 1YYNA 2JE9A 2OUJA 1JT5A 4Z8SB 1N1SA 4PBPA 3PMEA 1ABRB 5BXRA 1WLWA 3IAGC 1V6OA 3RMXA 2F2FA 1JHNA 2IWTB 1PZZA 2J3PA 1MS5A 1W6NA 2A6YA 5CA6A 1GZWB 3R4UA 4XHBA 1MVQA 1DQGA 2AENA 1PZ7A 3VKMA 3WLUA 1M2TB 2ZGTA 3AZWA 4GA9A 4XFTA 2LTNA 2CTVA 4W65A 5BVPI 4I4OA 1FWVA 1Y7BA 1LODA 4Y20B 2A75A 2JE7A 4QBVA 4Q9PA 1N3OA 2EF6A 1ZA4A 4J23B 4QC4A 2P39A 5GLVA 1ISYA 1BQPA 4HL0A 3MPPG 5HCBA 3AXDA 5FZZA 3WHTA 1H9WA 3N7KA 1ISVA 1V6NA 3A21A 2P34A 3FJBA 3V0AB 3FFZA 5T52A 1U0AA 3WNXA 4I3NA 3KQRA 4GAFA 4CTEA 1MS4A 1PZ8A 1N4KA 1QMJA 2NP0A 5T5OA 4YZ4A 4YM3A 2E51A 3R4SA 4K1YA 1FQ9A 1W6MA 3T2TA 1AXKA 2VY0A 3P53A 4GALA 5JMCA 2E4MA 4XILA 4EB2B 5H9QA 4FP3A 4BLJA 4ZGRB 2D3SA 1AX0A 5FREA 3ZSKA 4OEFA 1GZWA 1HQLA 1HWMB 4FPOB 2ZGPA 2EIGA 4RA0A 3PVOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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