The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
69
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sequence length |
193
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structure length |
193
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Chain Sequence |
VSDICQAADRQLYQLIEWAKHIPHFTELPVEDQVILLKSGWNELLIAGFSHRSMSVKDGIMLATGLVVHRNCAHQAGVGAIFDRVLTELVAKMREMKMDKTELGCLRSIVLFNPEAKGLKSTQQVENLREKVYAILEEYCRQTYPDQSGRFAKLLLRLPALRSIGLKCLEHLFFFKLVGNTSIDSFLLSMLES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hormone/growth factor receptor
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| molecule keywords |
Ultraspiracle protein (USP) a homologue of RXR
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| publication title |
The X-ray structure of a hemipteran ecdysone receptor ligand-binding domain: comparison with a lepidopteran ecdysone receptor ligand-binding domain and implications for insecticide design.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Bemisia tabaci
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| total genus |
69
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| structure length |
193
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| sequence length |
193
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2005-03-21 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Retinoid X Receptor | Retinoid X Receptor |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4M8H A; 5KRF A; 2YFE A; 1SR7 A; 2P4Y A; 4JYI A; 3IPQ A; 4WVD A; 2AM9 A; 2AYR A; 3R5M A; 4XUH A; 1Z5X U; 3N00 A; 5KRM A; 2ZXM A; 2ATH A; 1OVL A; 1T65 A; 1XIU A; 4J26 A; 4OEA A; 4FHH A; 5G42 A; 2EWP A; 3CS6 A; 3B0Q A; 2ACL A; 3JZC A; 2VV1 A; 3VRV A; 5ACC A; 3UP0 A; 1E3K A; 3OSA A; 1MV9 A; 1Y9R A; 1YY4 A; 2B1V A; 3CTB A; 3K22 A; 5C4U A; 2Q8S A; 3CQV A; 3V3Q A; 2PIQ A; 2ZY0 A; 5DID A; 3RUT A; 1RKG A; 4B7W A; 5DXG A; 1UPV A; 2AXA A; 3DCU A; 4LNX A; 5DWL A; 3CDP A; 2I4J A; 5ETH A; 4UDB A; 2VV4 A; 4L98 A; 3OMP A; 4LSJ A; 3W0G A; 3GWS X; 1PCG A; 2J7Y A; 2PIN A; 3H52 A; 5IAW A; 1PQC A; 3GD2 A; 4G1Y A; 4PWL A; 1GS4 A; 3W5P A; 4IA1 A; 1I38 A; 2JF9 A; 2R40 D; 5LWP A; 2Q5S A; 2FVJ A; 4OZT U; 1P8D A; 3D6D A; 4IWF A; 5ICK A; 4APU A; 4KZM A; 4CSJ A; 3WT6 A; 1FCZ A; 3CS8 A; 3LMP A; 4S0T A; 4K7A A; 3UUA A; 5KCD A; 4IV2 A; 4JAZ A; 3CS4 A; 1RK3 A; 5FQT A; 3SZ1 A; 4NB6 A; 4UDA A; 4RZF A; 2AB2 A; 3B0W A; 5IZ0 A; 5AAV A; 3AX8 A; 1U9E A; 4MG9 B; 2P1V A; 4RAK A; 3A78 A; 4IA7 A; 2HAM A; 3FS1 A; 5DY8 A; 3HOD A; 3HLV A; 5DXB A; 2QXM A; 1T74 A; 2Q7J A; 5L7G A; 2POB A; 1YOW A; 5HJS A; 2ZK4 A; 2ZVT A; 3CDS A; 3DT3 A; 3OLS A; 3MNE A; 4HLW A; 1SJ0 A; 2Q59 B; 4OFR A; 5A86 A; 3VJH A; 5AZV A; 3ILZ A; 1HJ1 A; 4OHA A; 1FM9 D; 3UVV A; 1PK5 A; 5AYG A; 4RME A; 3W0A A; 3DZY A; 3VT6 A; 5HYR A; 3W5T A; 2Z4J A; 2ZMJ A; 3KPZ A; 3KYT A; 4IA2 A; 2P7Z A; 3P0U A; 3VTC A; 1T76 A; 1KKQ A; 4M8E A; 3OOK A; 4X1F A; 4XHD A; 5G44 A; 5E15 A; 5KRJ A; 2ZMI A; 3A40 X; 1YIM A; 2PIV A; 2G0H A; 2ZBS A; 2OUZ A; 4NY9 A; 3VJI A; 1T73 A; 2O4J A; 2Q6J A; 4PP6 A; 5DYB A; 4K6I A; 4Q0A C; 4ZN7 A; 5GT4 A; 3FUR A; 2Q1H A; 2QNV A; 1T7F A; 2AMA A; 3VT9 A; 2OZ7 A; 1PQ9 A; 3TKC A; 1XV9 A; 3WGP A; 1NQ7 A; 5L7H A; 4YPQ A; 5C4S A; 4CI5 A; 5DMF A; 5DIG A; 4R2U A; 3Q95 A; 1OVL B; 4DMA A; 2PNU A; 2NXX A; 2Q5P A; 3D57 A; 4PRG A; 2ACL B; 1XVP A; 2VV1 B; 1ERE A; 2ZMH A; 4CI4 A; 1U3S A; 1UOM A; 2ZK5 A; 2XYW A; 3IPS A; 1UPW A; 2GPO A; 1FBY A; 2P1T A; 1I7I A; 4YNK A; 3R8A A; 5DWE A; 3W0Y A; 2IHQ A; 2VV4 B; 5DX3 B; 3V9T A; 3IA6 A; 4XI3 A; 4IW6 A; 1DB1 A; 4QM0 A; 5KD9 A; 3F7D A; 1UHL A; 3D24 A; 1LV2 A; 3G8I A; 4F9M A; 2PJL A; 3OSW A; 4Q50 A; 4MGD A; 2ZKC A; 2PIX A; 2E2R A; 4E4Q A; 3E00 A; 2GTK A; 3X36 A; 2QTU A; 3IXP A; 2AX8 A; 2ZXZ A; 3KBA A; 2HC4 A; 5DWG A; 2Q6R A; 5DK9 A; 5DZ3 A; 3L03 A; 5APH A; 2R6Y A; 4J5W A; 5G46 A; 3UUA B; 3DZU D; 3WJ5 A; 4OC7 A; 3V49 A; 2QR9 A; 2YLP A; 3ADW A; 4ITF A; 2HFP A; 5DP0 A; 2ZLC A; 2J14 A; 4ONI A; 1T63 A; 1X7R A; 1XJ7 A; 3UUD A; 5KYJ A; 3OZ0 A; 2I4P A; 3R2A A; 3B67 A; 3OS8 A; 5AAV B; 3G0W A; 1XP1 A; 4G2H A; 4OIU A; 2V7C A; 5DU5 A; 3X1H A; 2J4A A; 3R8I A; 1DKF B; 2ZXN A; 5AZT A; 5DXB B; 1OSH A; 1HG4 A; 1KNU A; 3ADU A; 1K74 A; 3O1D A; 4E4K A; 4RZG A; 3HQ5 A; 2B23 A; 4P6W A; 2Q61 A; 4DM8 A; 3OMM A; 4IA3 A; 2XHS A; 3CJW A; 1R1K A; 2G0G A; 3AFR A; 4PLE A; 5EJV A; 4OZR U; 3L0L A; 1N46 A; 5EHJ A; 3UU7 A; 5E14 A; 5GIC A; 3UVV B; 2AX9 A; 1I37 A; 3ET1 A; 4DK8 A; 3SP9 A; 3P8X A; 3WMH A; 3B0R A; 2OVH A; 3OZJ A; 4MG6 A; 3FXV A; 3GYT A; 4XTA A; 3GYU A; 1NQ0 A; 3VT4 A; 5KCF A; 4RFW A; 2PKL A; 3VT5 A; 3K8S A; 2PIR A; 2IOK A; 4JL4 A; 5DKE A; 1R20 A; 3KMG A; 3PLZ A; 4OKB A; 5G45 A; 2Q7K A; 4IQR A; 2Q6S A; 1T5Z A; 2GPV A; 2P54 A; 2YLQ A; 3GN8 A; 5GIE A; 5HYK A; 1A28 A; 1FD0 A; 1QKN A; 1Y0S A; 2JFA A; 3ZRA A; 2J7X A; 1XV9 B; 1LBD A; 1ZAF A; 1ZGY A; 2NV7 A; 2QAB A; 4IUI A; 1YMT A; 3Q95 B; 2R6W A; 2AA2 A; 4OZR E; 4IVY A; 2VST A; 2AAX A; 1X76 A; 3A9E A; 3L1B A; 5DMC A; 1XVP B; 2BAW A; 4XLD A; 3OGT A; 4LNW A; 1Z5X E; 3X31 A; 3F5C A; 4A2J A; 1XQ3 A; 4JYG A; 3ET2 A; 3K6P A; 3E7C A; 3ERT A; 5DLR A; 3RY9 A; 5E1C A; 4RMC A; 1G5Y A; 2XYJ A; 1XLS A; 4ZNS A; 3FC6 A; 5DZH A; 3EYB A; 1P93 A; 3KDU A; 3VRT A; 3A2I A; 1QKT A; 4IWC A; 2Q3Y A; 4MGC A; 1OSV A; 4HEE X; 4DOS A; 2AX7 A; 1UHL B; 4FHI A; 4WHF A; 1FM6 A; 2O9I A; 2ZK6 A; 3VRW A; 2PIP L; 2ZK1 A; 4MGD B; 5JI0 D; 3M7R A; 4G1D A; 1I7G A; 3W0C A; 3O1E A; 4NUF A; 3VSP A; 4OFU A; 2ZLA A; 3ET0 A; 4J5X C; 3VI8 A; 4OIV A; 3VJS A; 3W5Q A; 1K7L A; 1YUC A; 2ZK3 A; 3E94 A; 3FLI A; 2QW4 A; 1N83 A; 2QGW A; 2ZAS A; 4OZT E; 2QH6 A; 3X1I A; 1QKU A; 3UUD B; 5AVI A; 1YA3 A; 4R6S A; 4RUJ A; 3V4A A; 5JY3 A; 5DXP A; 3HM1 A; 5EIT A; 5DXR A; 2P15 A; 3OOF A; 3ZQT A; 1IE8 A; 3P89 A; 3R29 A; 3PCU A; 1Q4X A; 4OKT A; 3ERD A; 3H0A A; 1FCX A; 1VJB A; 2YLO A; 2QPY A; 3UP3 A; 3B1M A; 2QXS A; 1ZUC A; 1NQ1 A; 1RDT A; 3AN4 A; 4Y29 A; 4OEY A; 5DTV A; 1XNN A; 1XNX A; 3G9E A; 3PEQ A; 4IU7 A; 5KRL A; 3UUC A; 4ZJR A; 5B5B A; 1X7E A; 1L2J A; 5DZI A; 3B65 A; 4Q13 A; 4TUZ A; 4PP5 A; 4J5W C; 3UU7 B; 4WQP A; 1GWX A; 4UDC A; 1FCY A; 4R06 A; 3WWR A; 2GL8 A; 4G1Z A; 5KRK A; 1U3R A; 4WPF A; 3S9S A; 1NHZ A; 5HZC A; 2B50 A; 1XAP A; 3OS8 C; 2V0V A; 2PRG A; 3U9Q A; 2ZNQ A; 2QSE A; 3WTQ A; 5KYA A; 5G43 A; 3ADV A; 3OSI A; 1R6G A; 4A4W A; 4EMA A; 1N4H A; 4PPS A; 3A3Z X; 5E7V A; 3VHV A; 4EM9 A; 1XZX X; 4OJ9 A; 4S0S A; 5DXK A; 1KV6 A; 3BEJ A; 1YP0 A; 3B68 A; 4P6X A; 3SP6 A; 5DYD A; 1GWQ A; 1EXA A; 2HCD A; 1OT7 A; 2GWX A; 2G5O A; 2POG A; 3GWX A; 2JFA B; 2ZL9 A; 3OLL A; 4PLD A; 4RUP A; 3VRU A; 5B41 A; 1EXX A; 3BC5 A; 2A3I A; 5G5W A; 5L11 A; 3A2J A; 4QK4 A; 5KCC A; 4RZE A; 3KMR A; 4OKW A; 1S9Q A; 3AZ3 A; 4REF A; 3A9E B; 4J24 A; 4LBD A; 1SKX A; 1MVC A; 2HAR A; 3FAL A; 1R5K A; 2YAT A; 3F5C B; 1S9P A; 2R40 A; 1IE9 A; 3VN2 A; 1ZH7 A; 3DR1 A; 4PF3 A; 3VT3 A; 3FC6 B; 4OLM A; 2ZK0 A; 3DCT A; 4N5G A; 4OJ4 A; 1S19 A; 4PXM A; 3TX7 B; 5KCU A; 5L7E A; 4RWV A; 4POJ A; 1RKH A; 1QKM A; 1ILH A; 1YYE A; 4UDD A; 2B1Z A; 5DRJ A; 5FQP A; 2OM9 A; 5IXK A; 5C4O A; 2Q5G A; 3HC5 A; 1NUO A; 5DVV A; 3HC6 A; 1PDU A; 1X7B A; 3AZ1 A; 4YT1 A; 5KRH A; 5HJP A; 2H77 A; 3HZF A; 1X7J A; 3OLF A; 5DKS A; 1BSX A; 3ADT A; 3DZY D; 2VV0 A; 3HVL A; 3JZB A; 5DRM A; 1XDK A; 1PQ6 A; 2OVM A; 3ZRB A; 5DI7 A; 4L96 A; 2PIT A; 5AWJ A; 1T7M A; 2VV3 A; 5FQR A; 4KZI A; 2AMB A; 5DL4 A; 1M7W A; 2YJD A; 3V9Y A; 1NRL A; 3HO0 A; 4ZNT A; 3DY6 A; 4ZO1 X; 2QGT A; 2VV2 A; 1TFC A; 2HWR A; 3MNP A; 3RLL A; 2QZO A; 4E2J A; 5APK A; 2W8Y A; 5FQS A; 1YOK A; 2FAI A; 4OGH A; 4POH A; 1M13 A; 3VHU A; 2AA7 A; 5AWK A; 2REW A; 2PIO A; 4TUZ B; 1X78 A; 3GZ9 A; 2HAS A; 3PRG A; 3T03 A; 4MGB A; 3OKI A; 5H1E A; 4QJR A; 3P88 A; 4PVU A; 2HBH A; 3B66 A; 5DUG A; 4MG8 A; 2Q60 A; 4FNE A; 3TY0 A; 1S0X A; 5KCT A; 3CWD A; 2O4R A; 4MG7 A; 4QE6 A; 5E0W A; 4MGA A; 2YJA B; 2NPA A; 5AK2 A; 1Y0X X; 5AAU A; 2ZNO A; 4IV4 A; 1NYX A; 3OKH A; 4OH5 A; 5KRO A; 3D5F A; 4S15 A; 5K13 A; 1XLS E; 3IMY A; 4MG5 A; 3NSP A; 3R5N A; 4OKX A; 3A2H A; 5F9B A; 3ZR7 A; 2GP7 A; 5DX3 A; 3WFG A; 3RLJ A; 1NQ2 A; 3IXP D; 3NSQ A; 4IS8 A; 4OH6 A; 1S0Z A; 5DUH A; 4BCR A; 4ZJW A; 5LGA A; 4JGV A; 4XAO A; 4DM6 A; 2Q1V A; 5DKB A; 2Q7L A; 3IPU A; 2IOG A; 2PIU A; 4WLB A; 5DV3 A; 5EGV A; 1T7T A; 3FAL B; 2Q70 A; 4N73 A; 3VJT A; 4OEZ A; 5DVS A; 3B3K A; 1ERR A; 3FEJ A; 4FGY A; 4REE A; 3NOA A; 3VT8 A; 2VSR A; 1NDE A; 3DZU A; 2BJ4 A; 1XPC A; 1XQC A; 3AUR A; 5HCV A; 2LBD A; 3V9V A; 3AUQ A; 1T7R A; 4PPP A; 3VT7 A; 2OAX A; 1K74 D; 3ET3 A; 5AVL A; 4DK7 A; 3AUN A; 4OK1 A; 3OS9 A; 3RUU A; 5E19 A; 3W5R A; 3AZ2 A; 5DXE A; 1DKF A; 2JJ3 A; 2G44 A; 2HWQ A; 3R8D A; 1R1K D; 2QA8 A; 5DZ0 A; 3OMK A; 5HJP B; 5JJM A; 1ZDT A; 1SQN A; 4ZO1 B; 2GIU A; 5DUE A; 1ZKY A; 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