201LA

How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKHPAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 201lA00
1L71A 216LA 2B72A 201LA 2O7AA 3C8QA 244LA 1L60A 151LA 1L41A 1C6DA 1OWYA 3UONA 254LA 1G1WA 3NY8A 1C68A 1L67A 1LW9A 2RB0X 1T97A 115LA 1C6AA 1L91A 3HUKA 174LA 1L44A 130LA 1JTNA 1L29A 2B6ZA 219LA 112LA 1CV3A 1L0JA 3RZEA 3C82A 1CX6A 178LA 220LA 1L0KA 231LA 259LA 3HH4A 1L08A 1QS9A 3DMVA 1KNIA 189LA 2F47A 1P7SA 1L59A 1L19A 3C83A 3NYAA 214LA 1L32A 4S0WA 138LA 1P64A 3GUJA 261LA 1G0GA 1L62A 1L80A 1L03A 1KS3A 1L70A 1L42A 1PQKA 1L83A 104LA 1L63A 4EKSA 2LZMA 3HU8A 1QUHA 1I6SA 1LYGA 4ARMB 1P56A 3CDOA 1PQJA 1P36A 1L76A 1L52A 126LA 1ZWNA 241LA 232LA 1C6QA 3DN1A 2IGCA 1L18A 2OU9A 1G06A 249LA 3JR6A 1C6HA 1L31A 1L97A 3HH6A 1L88A 1L49A 1L79A 3HTGA 235LA 4I7TA 2B6YA 1C6KA 4LDLA 4I7RA 1L93A 119LA 1G0LA 225LA 1CV1A 4EPIA 1QTBA 3DN0A 1LGWA 4ARQB 2RBRA 1LYHA 234LA 4ARMA 1OWZA 253LA 1DYEA 1L13A 128LA 3DMXA 1D3JA 170LA 1ZURA 4K5YA 1G07A 217LA 223LA 4LZMA 4I7NA 1C69A 1L00A 7LZMA 1OV7A 3C7ZA 3HTFA 1DYGA 143LA 142LA 188LA 1L94A 1D9WA 1PQMA 1QT8A 256LA 3GUOA 212LA 1LWGA 229LA 1DYDA 3EMLA 114LA 1CUQA 3PDSA 4W59A 4ARQA 1L54A 3G3WA 190LA 1G0JA 1G0KA 149LA 108LA 1C62A 1L01A 255LA 2NTHA 1EPYA 1XJUA 4W57A 3SB6A 4W56A 1XEPA 1P2LA 173LA 1L98A 1P46A 196LA 251LA 3HH5A 4I7KA 1CU6A 125LA 1L51A 2RB1X 169LA 1C6EA 152LA 1L10A 127LA 1QT4A 2HUKA 1L36A 164LA 150LA 1CTWA 1OVKA 1C64A 248LA 3CDRA 144LA 2OU8A 1L61A 1LWKA 2B6WA 1C6GA 1KY1A 1CV0A 3GUNA 211LA 4I7LA 3HDEA 242LA 1L99A 161LA 1SWYA 218LA 180LA 1QT5A 3DN6A 3ODUA 200LA 172LA 1PQIA 246LA 141LA 1QT7A 4GRVA 236LA 1L55A 3DNAA 167LA 4EXMA 3HT6A 3HUAA 1ZYTA 1D3FA 1L86A 1CU2A 2OU0X 4W55A 3DN2A 1L05A 1L72A 183LA 250LA 2QB0B 3SB9A 3HU9A 2HULA 140LA 2F2QA 3HT9A 157LA 1WTHA 1L92A 3C8SA 3OE0A 2RBQA 1L34A 147LA 4I7SA 160LA 187LA 3GUMA 2CUUA 1D3MA 1L74A 4I7PA 1L16A 1L21A 3FADA 2B6XA 163LA 1QS5A 1L30A 252LA 2ANXA 2B75A 168LA 2L78A 1P5CA 2OEAX 2B7XA 1C6MA 1CU5A 1L26A 3C7YA 4W52A 1L06A 228LA 1KW7A 3V2YA 1T8GA 1C6NA 3F9LA 111LA 1C63A 3G3VA 197LA 2Z6BA 2RBOA 4ARJA 1L28A 1PQOA 4GBRB 113LA 1CVKA 1DYBA 1C66A 239LA 1L73A 1L39A 4EPFA 148LE 1C60A 3SN6R 107LA 4ARPA 1L11A 3HTBA 102LA 3OE6A 1P2RA 191LA 1G0QA 131LA 1XJTA 1L17A 1NHBA 4E97A 1LI2A 1L64A 1L47A 1CX7A 1SX2A 1OV5A 3CDQA 1T8FA 245LA 1B6IA 4EKRA 222LA 1LLHA 129LA 1C6PA 123LA 258LA 1TLAA 184LA 1SSYA 4I7QA 177LA 1C6FA 1L14A 2RBSA 1LGXA 1L23A 4YX7C 3HT7A 1C6TA 1L20A 230LA 2RB2X 166LA 2RH1A 4I7OA 3D4SA 1L45A 1L35A 1L69A 1CV6A 4I7JA 109LA 155LA 3LZMA 3SB7A 1LYJA 1PQDA 4LDOA 1L33A 195LA 1QT3A 3V2WA 260LA 4DAJA 1LYEA 1QSBA 1QTCA 1L09A 1JQUA 1L38A 1L65A 2OE4X 2B6TA 1LI6A 1C65A 110LA 1JTMA 4ARLA 1SWZA 1OVHA 4EJ4A 1LYDA 262LA 3L2XA 4PK0A 5LZMA 227LA 257LA 1L84A 2OE9X 1L95A 137LA 185LA 1LI3A 146LA 3RUNA 1DYAA 1L58A 1L66A 3CDTA 1K28A 2RAYX 1L57A 1C61A 1C67A 3CDVA 3GUIA 238LA 2RAZX 1L96A 247LA 240LA 1L48A 233LA 226LA 2OE7X 3C80A 1T6HA 1G0MA 1QTZA 1L50A 215LA 4EKPA 145LA 1L15A 1C6CA 4EKQA 1L02A 3DN3A 3GUPA 1OYUA 5I14A 1LYFA 1T8AA 1QTHA 2B73A 1LGUA 3C81A 1C6IA 1SSWA 2F32A 205LA 1QSQA 2NTGA 2Q9EA 1CUPA 1L40A 3SBAA 3HTDA 4W54A 4YXCA 1DYCA 221LA 122LA 3C7WA 210LA 1D3NA 3GULA 1KY0A 209LA 237LA 243LA 1QUDA 118LA 1LPYA 3DMZA 1L27A 1C6JA 120LA 2B70A 1L81A 181LA 199LA 176LA 4I7MA 103LA 162LA 224LA 3C8RA 1L89A 156LA 1L07A 4AQNA 1P6YA 2Q9DA 3DKEX 1L90A 182LA 3PBLA 139LA 1G1VA 1DYFA 2QARC 2O79A 158LA 1CV5A 1L75A 1C6BA 1QTDA 3FA0A 4IAPA 3F8VA 1QUGA 3OE8A 1L85A 1L53A 2ANVA 171LA 3DN4A 3VW7A 213LA 2OTZX 4W51A 1KW5A 2LCBA 1CV4A 1L25A 4W58A 198LA 1G0PA 1P37A 4OO9A 3SBBC 1QTVA 1D2WA 4DKLA 4YXAC 1CU3A 1L46A 206LA 1L04A 3GUKA 4LDEA 159LA 1L87A 165LA 1L43A 3HDFA 1L56A 1L68A 3SB8A 3L64A 1LYIA 2B74A 3HH3A 3HWLA 1QUOA 1P3NA 4W53A 2RBPA 192LA 3K2RA 1QT6A 1CU0A 2LC9A 3QAKA 1L24A 3HT8A 4DJHA 1L77A 186LA 3NY9A 175LA 1L22A 2O4WA 2HUMA 2OTYX 3DN8A 1C6LA 1OVJA 3SB5A 4PJZA 1L12A 2A4TA 1D2YA 3FI5A 3OE9A 1SX7A 1L82A 3HUQA 4ZPUA 3G3XA 6LZMA 1L37A 2RBNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BB4A 2O7AA 2BQCA 4WLDA 1L60A 1HNLA 1H6MA 4ETBA 2HU1A 3UONA 1JPOA 3WU8A 1B7PA 115LA 4H1PA 1C6AA 4CGEA 3M18B 5FELA 3HUKA 4U3XB 1AZFA 4UWVA 3A96A 219LA 112LA 3C82A 3RW8A 1GFTA 1L0KA 231LA 259LA 3HH4A 4XJFA 1AT5A 1QS9A 5KKIA 3HBHA 1NMMA 1KNIA 4YEMA 5EBHA 1L19A 4MSTA 3C83A 1IP3A 1JTPL 1LSGA 1L80A 1LZBA 1PQKA 1BB5A 1L63A 3HU8A 1KIRC 5F14A 1NDGC 2Z37A 3CDOA 3WPLA 2FYCA 4QY9A 1ZWNA 2OU9A 2DBTA 249LA 1UIEA 5KXSA 4NGIA 1IP7A 4GN3A 1C6KA 4B4JA 4GCDA 1L93A 1KXWA 1LZDA 1LGWA 1BWIA 2BPUA 4ARQB 4ARMA 4DDBA 1LJFA 1OWZA 253LA 1IWUA 4NSJA 5B59A 1LJNA 1NHEA 217LA 223LA 5I5QA 2Z38A 1RI8B 3AZ7A 4G4BA 7LZMA 1GE4A 2D91A 1GXXA 188LA 2XBSA 4YF2A 1D9WA 1CJ6A 1LWGA 2W1YA 3LZTA 4H8YA 190LA 1G0KA 2NTHA 1N4FA 4DDCA 4FJRA 3ZEKA 1GAZA 173LA 4H9EA 4I7KA 1CU6A 1L51A 4NIJA 1C6EA 152LA 5KXYA 1IP2A 3WU9A 248LA 1L61A 5HQ1A 1IOTA 2EPEA 1HHLA 3CSQA 1D6PA 1CV0A 2BQJA 1IVMA 5HMVA 3RNXA 1GPQC 3F6ZA 3AB6A 1SWYA 218LA 2Q0MX 180LA 1DQJC 1JUGA 1QT5A 3DN6A 200LA 3AGGG 1BB3A 1LJHA 1QT7A 2DKVA 236LA 2Z2EA 4ZEEA 4W55A 3DN2A 4H9FA 2ZILA 3HU9A 1LZNA 140LA 1WTHA 147LA 2MEBA 5E9RA 187LA 4I7PA 1L74A 1GF9A 1GD6A 4YOPA 252LA 2LYZA 3B0KA 1JJ1A 2L78A 1C6MA 4DQ5A 3C7YA 3G3AB 4W52A 1GF7A 1T8GA 1INUA 3TMXA 5A3ZA 2Z6BA 4H94A 113LA 2BAAA 4LYZA 1DYBA 1PZYA 3AW7A 239LA 1L39A 148LE 1C60A 2YDGA 3HTBA 3OE6A 2YSSC 1HFZA 1V7SA 1LI2A 3TXBA 1L47A 1UUZC 4FDYA 5M1YA 1BHZA 1SX2A 1IEEA 1YILA 1TBYA 1NKHA 2XQOA 1LZTA 222LA 129LA 4X3BA 1PS5A 1LZSA 4TTDA 184LA 4I7QA 2RBSA 1EQ5A 1L23A 3TMWA 1LMQA 3HT7A 4QDNA 3TXIA 2DQFC 4WL7A 4HJYA 2BQNA 5D5FA 4LDOA 2ZWBA 195LA 3V2WA 4DAJA 4NFVA 1L09A 1L65A 1JTMA 1CJ8A 1HELA 3WXTA 1HEPA 1OVHA 1IWTA 4WO9A 4PK0A 227LA 2MEDA 3T36A 1LI3A 1QSAA 1IY4A 4DD9A 1K28A 1XEIA 1C61A 3CDVA 1QIOA 1YL0X 2YBHA 4HJVA 1DI4A 5L3HA 3A91A 4LYMA 1LYOA 3DN3A 1GFJA 1YKZX 3FI7A 1C6IA 2F32A 4J1BA 1QSQA 1IC7Y 2G4PA 2Z19A 1IWVA 3SBAA 1WQRA 4IJ4A 4ET8A 3A34A 1DI3A 1EQEA 4YXCA 2H5ZA 210LA 2BQOA 1D3NA 2MEAA 1OUHA 3N9CA 3GULA 4XJGA 3HFMY 3A94A 118LA 4CFOA 1LPYA 1LSPA 2B70A 1B7NA 176LA 4Z46A 103LA 3WUAA 1REZA 156LA 1L07A 1LJJA 2FYDA 4AQNA 1GB2A 3E3DA 1L90A 2NWDX 2EIZC 3PBLA 139LA 158LA 1LSMA 1QTDA 3K3TA 1L85A 1L53A 1IR7A 171LA 3DN4A 3W6BA 213LA 2OTZX 1KW5A 1FKQA 1LMTA 3W6EA 1CV4A 1QTEA 1FBIX 198LA 1UIDA 2FBDA 1UIGA 3ATOA 3A3RX 3LZ2A 1CU3A 2Z2FA 3A6CY 3W6FA 1L68A 1KIPC 4H9IA 192LA 1QT6A 3CB7A 3QAKA 1CKHA 4DJHA 3NY9A 1GE1A 2OTYX 3DN8A 1XSFA 1QTKA 1L12A 1B2KA 1EQ4A 3AZ6A 4WM4A 4XJIA 1GFRA 5KXNA 3C8QA 244LA 3EXDA 2ZIKA 1L41A 1C6DA 1DPWA 5LYMA 1AKIA 4XENA 4BS7A 254LA 3NY8A 5DM9A 4BAFA 1C68A 1L67A 134LA 2RB0X 1T97A 3AYQA 1OUGA 1TAYA 1JTOL 174LA 1L44A 1LZYA 1SQ2L 4ETAA 2MEGA 130LA 1L29A 1CV3A 3A3QA 1UA6Y 1UIBA 220LA 2H9JA 3D9AC 2ZQ4A 189LA 1BB7A 1P7SA 1T3PA 1G0GA 1L62A 1Z55A 1L42A 1JWRA 1L83A 1EL1A 104LA 1GB9A 4EKSA 2BQHA 1L52A 4H9HA 232LA 3DN1A 1GB0A 2IHLA 3JR6A 3WVXA 1L31A 1VDSA 1L97A 3TXEA 3N9EA 2XBRA 3HBDA 1CJ7A 3DN0A 4WLYA 4HTQA 5IELA 5KXRA 1LYHA 128LA 3DMXA 1D3JA 3AGIA 170LA 5DN5A 1G7JC 1JKCA 1JKAA 5KJ9A 4LZMA 1GFHA 1OV7A 4NEBA 2HEFA 1W6ZA 3T6UA 4TSCA 5LAGA 3GUOA 212LA 229LA 1DYDA 1GB8A 1GE3A 4W59A 4ARQA 4R6CA 149LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BB4 A;  2O7A A;  2BQC A;  4WLD A;  1L60 A;  1HNL A;  1H6M A;  4ETB A;  2HU1 A;  3UON A;  1JPO A;  3WU8 A;  1B7P A;  115L A;  4H1P A;  1C6A A;  4CGE A;  3M18 B;  5FEL A;  3HUK A;  4U3X B;  1AZF A;  4UWV A;  3A96 A;  219L A;  112L A;  3C82 A;  3RW8 A;  1GFT A;  1L0K A;  231L A;  259L A;  3HH4 A;  4XJF A;  1AT5 A;  1QS9 A;  5KKI A;  3HBH A;  1NMM A;  1KNI A;  4YEM A;  5EBH A;  1L19 A;  4MST A;  3C83 A;  1IP3 A;  1JTP L;  1LSG A;  1L80 A;  1LZB A;  1PQK A;  1BB5 A;  1L63 A;  3HU8 A;  1KIR C;  5F14 A;  1NDG C;  2Z37 A;  3CDO A;  3WPL A;  2FYC A;  4QY9 A;  1ZWN A;  2OU9 A;  2DBT A;  249L A;  1UIE A;  5KXS A;  4NGI A;  1IP7 A;  4GN3 A;  1C6K A;  4B4J A;  4GCD A;  1L93 A;  1KXW A;  1LZD A;  1LGW A;  1BWI A;  2BPU A;  4ARQ B;  4ARM A;  4DDB A;  1LJF A;  1OWZ A;  253L A;  1IWU A;  4NSJ A;  5B59 A;  1LJN A;  1NHE A;  217L A;  223L A;  5I5Q A;  2Z38 A;  1RI8 B;  3AZ7 A;  4G4B A;  7LZM A;  1GE4 A;  2D91 A;  1GXX A;  188L A;  2XBS A;  4YF2 A;  1D9W A;  1CJ6 A;  1LWG A;  2W1Y A;  3LZT A;  4H8Y A;  190L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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