201LA

How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of t4 lysozyme
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKHPAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title How amino-acid insertions are allowed in an alpha-helix of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 201lA00
1L38A 4I7PA 2ANXA 4PJZA 4ARJA 3HH5A 1D3NA 3DMXA 1QTDA 2OE4X 2B6YA 200LA 4ARQB 1LW9A 1C61A 1QS5A 2LCBA 4W59A 206LA 212LA 184LA 2HUMA 3QAKA 1L30A 1OVHA 1L14A 1L50A 112LA 139LA 3C80A 1LYDA 1G07A 3NY8A 2RBOA 234LA 4EPIA 4GBRB 4EPFA 165LA 155LA 1L25A 3EMLA 1L62A 4I7NA 256LA 1JQUA 4S0WA 1CV6A 1L94A 1PQOA 235LA 143LA 1L60A 1L28A 227LA 2HUKA 4K5YA 249LA 3OE0A 1L44A 3DKEX 122LA 1C6IA 1CV3A 4W58A 5LZMA 4EKQA 1C6HA 113LA 129LA 130LA 1C6KA 215LA 2RAYX 1L29A 4DAJA 1T8GA 1L15A 1LPYA 252LA 2OEAX 3C8SA 237LA 3F9LA 2LC9A 4ARMB 2HULA 1QTHA 1OVKA 3HT9A 1PQIA 3L2XA 1C6GA 1CUQA 4I7JA 195LA 104LA 1LLHA 222LA 1L66A 1G0PA 262LA 2RB0X 1ZWNA 1K28A 1C64A 1LYFA 3SN6R 2B6XA 119LA 1L39A 141LA 127LA 166LA 176LA 1LWGA 3DN6A 2RBRA 1L35A 173LA 3GUKA 1QSQA 3DN3A 3SBAA 1C6CA 229LA 1LI3A 3OE6A 2RBPA 1L68A 1P6YA 183LA 168LA 147LA 3K2RA 3SB8A 3SB6A 250LA 2QARC 1LWKA 2B74A 3G3WA 1JTNA 2O7AA 1L37A 210LA 1G1WA 1C6JA 232LA 1L91A 1QUHA 3CDTA 4ARMA 1QUGA 2OTYX 190LA 1CU6A 3PDSA 1L75A 3G3XA 3DN4A 196LA 2RAZX 4I7KA 3C81A 1L09A 1C6PA 2RBSA 1L00A 1XJUA 3C7WA 120LA 2B75A 2OE9X 4EJ4A 1D9WA 1CX6A 3GUMA 3DN2A 1LGWA 1D2WA 251LA 1D3MA 1LGUA 4LDOA 1SX2A 1L10A 219LA 221LA 1SSYA 3VW7A 186LA 1LI6A 2B6ZA 177LA 1QTBA 1L64A 1QTCA 3HH6A 1T8FA 1L76A 1L67A 1L99A 3HUKA 1OWYA 3HTGA 1L92A 1L13A 3C7YA 191LA 2O4WA 107LA 163LA 1L54A 1G0QA 3FADA 3ODUA 1L45A 110LA 4DKLA 103LA 1L90A 1KY0A 4YXAC 258LA 1P7SA 1PQDA 1LYGA 4W55A 102LA 1L88A 1PQMA 1CV4A 1T97A 2RB1X 1C67A 4YX7C 4LZMA 1L80A 161LA 223LA 1L08A 1SX7A 145LA 240LA 108LA 1L89A 213LA 198LA 236LA 214LA 224LA 4YXCA 3HDFA 149LA 1QSBA 2NTGA 3SB9A 3PBLA 1QT8A 2L78A 3DMZA 1OWZA 3DN1A 1L36A 3V2YA 1WTHA 3GULA 4W56A 1C66A 1P5CA 1CTWA 1G0LA 248LA 1L01A 1T8AA 1L85A 3HTFA 118LA 1L0KA 157LA 3DMVA 1L40A 1L79A 1L72A 242LA 4ARPA 4ARQA 138LA 1DYBA 1CU3A 4ZPUA 180LA 255LA 4I7RA 1L07A 1L41A 2A4TA 3NYAA 230LA 1CV0A 1L69A 1L82A 2B73A 1SSWA 261LA 1CU2A 3HTBA 1C63A 1DYEA 4W51A 115LA 125LA 1SWYA 151LA 1C6DA 1KW5A 1XEPA 1L96A 2QB0B 4I7QA 254LA 111LA 1KS3A 1NHBA 1L53A 1L73A 2RH1A 4I7LA 1LYJA 1D3JA 1P64A 3RZEA 152LA 3LZMA 1P2LA 2B6TA 1L31A 1C6TA 1D3FA 243LA 4GRVA 1C6AA 233LA 2B70A 1C69A 1DYCA 172LA 1L11A 4EKPA 1L63A 1KY1A 3HH4A 109LA 1C6NA 123LA 228LA 3FA0A 216LA 1C6EA 1L05A 1C6BA 1G0JA 1L52A 3JR6A 150LA 2O79A 187LA 192LA 1QT7A 1L33A 4LDLA 3CDRA 1G0KA 244LA 1L58A 1P2RA 2B72A 1OVJA 197LA 158LA 2B6WA 146LA 1L93A 3OE8A 1C6FA 3HUQA 131LA 167LA 1ZYTA 1L26A 1L43A 2Q9DA 137LA 181LA 3HT7A 4W57A 2RB2X 3CDOA 2ANVA 1L21A 3UONA 3HU9A 3L64A 4EKSA 4AQNA 3HT8A 3DNAA 1CX7A 1L57A 4PK0A 2Z6BA 1C65A 140LA 4ARLA 1LYIA 1C62A 148LE 241LA 1L55A 4W53A 1DYFA 1QS9A 2F32A 3SB5A 209LA 1LI2A 2OU9A 1CV5A 1XJTA 1L20A 4EKRA 1L47A 1LGXA 3HH3A 4DJHA 1CV1A 1OYUA 2IGCA 126LA 144LA 1QT5A 3GUPA 1D2YA 1L83A 1P3NA 2B7XA 3RUNA 189LA 3HU8A 1L02A 1L46A 3V2WA 128LA 4OO9A 1JTMA 1C6MA 1OV7A 156LA 3SB7A 1CU0A 205LA 2Q9EA 226LA 3SBBC 1T6HA 1DYDA 162LA 3C83A 4IAPA 3GUOA 199LA 1P37A 3HDEA 1L84A 1L18A 3HTDA 3G3VA 1L0JA 1L24A 2F2QA 1DYGA 3HWLA 171LA 2OE7X 1L65A 246LA 1I6SA 1L98A 1L34A 3GUJA 1EPYA 1C6LA 245LA 1L04A 1TLAA 3GUIA 1QT6A 3F8VA 185LA 2OU0X 1L17A 1L48A 1L51A 1CUPA 114LA 169LA 2RBNA 1L70A 5I14A 4W54A 2LZMA 1C68A 1L06A 1C6QA 1G0GA 3DN0A 1L74A 3DN8A 1CVKA 220LA 3HUAA 1L16A 175LA 1B6IA 4W52A 201LA 1L12A 6LZMA 1L77A 188LA 164LA 257LA 178LA 217LA 1L97A 1L49A 1L87A 4EXMA 1L32A 160LA 1G0MA 4I7TA 1PQJA 1LYHA 1SWZA 3OE9A 1L42A 1L61A 1KW7A 1QTVA 3D4SA 4I7MA 1G06A 1PQKA 182LA 3C8QA 1LYEA 1L23A 1L27A 1P46A 3C8RA 1CU5A 2CUUA 225LA 218LA 3HT6A 1L59A 3C82A 1L95A 170LA 1L22A 142LA 4I7OA 1QT4A 1G1VA 1OV5A 1ZURA 253LA 159LA 1L81A 2OU8A 3GUNA 1P36A 231LA 1L19A 1L56A 7LZMA 2F47A 2OTZX 3CDVA 1QTZA 1QT3A 174LA 1QUDA 4LDEA 260LA 211LA 247LA 3NY9A 239LA 1DYAA 1L03A 3C7ZA 3CDQA 1QUOA 4E97A 259LA 3FI5A 2RBQA 4I7SA 1L71A 1L86A 1KNIA 2NTHA 1P56A 1C60A 238LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7PA 5HMJA 1KIQC 1WVVA 4H1PA 4ARJA 5II3A 1LMCA 200LA 1JJ0A 4DQJA 1QS5A 1QUSA 2LCBA 3RNXA 212LA 1GBZA 1L30A 3LYOA 1NHEA 139LA 3C80A 1LYDA 1G07A 4BAFA 2D4IA 1G7LC 3B6LA 3LYTA 4M4OA 4GBRB 4WMGA 4EPFA 2D6BA 155LA 2LYOA 4S0WA 1L94A 235LA 1L60A 3P64A 4LYTA 3E3DA 5KXLA 3DKEX 1C6IA 1CV3A 1LHMA 4EKQA 1C6HA 2X0AA 130LA 2RAYX 4RLNA 1YKZX 4DAJA 1L15A 1LPYA 252LA 2OEAX 1QTHA 1AT6A 1BB4A 1IC4Y 1JTOL 3P66A 104LA 4H94A 3K3TA 2F30A 1JKAA 2EPEA 1C64A 3A3RX 2Z18A 3SN6R 1RE2A 6LYZA 1HEPA 176LA 1IWZA 4H92A 4LGKA 4BAPA 3GUKA 5I4WA 1C6CA 1B0DA 2RBPA 4TWSA 2FYCA 1REXA 1L68A 1LHLA 2XTHA 4RW1A 1LWKA 1XGRC 3G3WA 4LYCA 4NGIA 1LOZA 1FKVA 1L37A 4ZFPA 2YVBA 3J4GA 1C6JA 1RI8B 5LVIA 1QUHA 1LZTA 1Z55A 1QUGA 4OWAA 1OUGA 3G3XA 3DN4A 4WM4A 196LA 1REZA 1RJCB 1D6PA 120LA 2B75A 4WO9A 3WU9A 4EJ4A 1B5UA 1LGWA 1D3MA 2CJLA 1B5XA 1SX2A 1L10A 2YSSC 4XJFA 1LMNA 5C6JA 3RW8A 4GN4A 1QTBA 3WUAA 3HH6A 1T8FA 1L99A 1WTMA 1VDTA 3HUKA 3HTGA 2MEGA 2O4WA 163LA 1IR8A 110LA 103LA 4MR1A 5LIOA 3WMKA 1KY0A 2HEEA 1HEMA 5F9XA 4HTNA 4DD2A 1NMMA 2RB1X 4YX7C 2XJWA 1IEEA 132LA 223LA 1L08A 1SQ2L 1JTPL 1B5VA 1MLCE 1TEWA 224LA 2BQAA 3HDFA 149LA 1FDLY 3SB9A 1YAQA 2HEFA 3TXFA 1LMTA 1QT8A 2L78A 1WTHA 3HBEX 5DM9A 1CTWA 1V7TA 248LA 4TSBA 1L01A 3WULA 2W1XA 1L40A 4ARPA 1VDQA 180LA 1LJJA 2DBTA 1C43A 2F4AA 1AT5A 2ZQ4A 4KT3A 5KXOA 4YF2A 4D9ZA 115LA 125LA 5L3IA 1C6DA 3TXEA 1NHBA 1L73A 2RH1A 3LYMA 1D3JA 4CGEA 5I4XA 4FDYA 1GFJA 1UIFA 4B4IA 1UCOA 1LJIA 1D3FA 1JPOA 1C69A 4TSCA 1L11A 1LZ5A 1WQNA 4WOAA 1REYA 4PHIA 1HENA 109LA 2HEAA 1C6NA 123LA 228LA 5IELA 1LSDA 1C6EA 1L05A 2BQDA 5L9JA 2YBJA 3A95A 1YL0X 3CDRA 2B72A 1OVJA 5HLLA 3OE8A 2B5ZA 4B4JA 3WL2A 1WQRA 1JSEA 4LT2A 1QSWA 2XBSA 1CJ8A 1TBYA 2DQDY 4EKSA 4AQNA 1L57A 4NHIA 2Z6BA 4WL6A 4ETDA 1C62A 148LE 4HSFA 4W53A 1QS9A 3SB5A 5LYMA 1XJTA 4EKRA 1A4VA 4GCEA 3EO5A 4DJHA 4NSHA 3A90A 4NFVA 1D2YA 1GEZA 1L83A 2B7XA 5B1GA 1NBYC 2A7DA 1WQMA 8LYZA 3AZ6A 4WLDA 1EQ4A 3SB7A 2BPUA 5B06A 2DQJY 1LMOA 1YIKA 1DYDA 3C83A 1F10A 1P37A 1GFHA 1DKKA 1DYGA 171LA 1GE3A 3GUJA 1C6LA 245LA 4AGAA 4DD1A 1D0KA 3F8VA 1BHZA 1ZV5L 1L17A 3IJUA 1GDXA 4GLAA 193LA 3HFMY 3A6BY 1BVKC 1LSZA 2RBNA 5I14A 2CWIA 1GAZA 1GWDA 3TXDA 4ETEA 1L16A 4W52A 201LA 1L77A 188LA 4H9AA 2ZWBA 1OUAA 4UWUA 1LSBA 2G4PA 160LA 1LYHA 2A7FA 1B5ZA 1L42A 1L61A 1AM7A 1KW7A 3D4SA 5F81A 5IDDA 182LA 3C8QA 1L23A 1L27A 2BQKA 1FKQA 3C8RA 2MEBA 3HT6A 218LA 2YDGA 1LZDA 1GE0A 4DQ7A 4BADA 5F14A 1L22A 4RW2A 4WG1A 2OU8A 4LT3A 1WQQA 1L56A 1JTTL 2F47A 3CDVA 4LT0A 1QUDA 4LDEA 260LA 1UIEA 1HSWA 4Z3MA 1HFZA 3CDQA 3W6BA 2CGIA 5KXKA 4DC4A 1NQIA 259LA 1NWGA 3WH1A 1OUHA 238LA 3HH5A 1D3NA 3DMXA 1QTDA 3AGGG 1LW9A 184LA 1GFKA 3AZ4A 3A92A 3LZTA 4NGYA 1OVHA 4XJHA 1WTNA 1L50A 112LA 1IVMA 1LZCA 3WW5A 3NY8A 4EOFA 1LSFA 2ZIKA 3ZEKA 5APFA 1L25A 4I7NA 3CSZA 1JQUA 1LJ4A 1CV6A 1PQOA 2ZYPA 1HFYA 227LA 1QIOA 1FBIX 3EXDA 3OE0A 1L44A 113LA 129LA 1GHLA 5C6IA 4CJ2A 1VDSA 3C8SA 5EBHA 3F9LA 4ARMB 1KXYA 3WU8A 5LVGA 5T3FA 195LA 1JITA 4OOTA 4DD9A 1B9OA 1LKRA 1L66A 5DN5A 3N9EA 3ZVQB 4H9BA 1IR7A 119LA 1L39A 141LA 127LA 4LYMA 2RBRA 1L35A 4GCBA 4GCCA 3AB6A 4NSIA 3DN3A 3SBAA 229LA 1NBZC 1OUDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4I7P A;  5HMJ A;  1KIQ C;  1WVV A;  4H1P A;  4ARJ A;  5II3 A;  1LMC A;  200L A;  1JJ0 A;  4DQJ A;  1QS5 A;  1QUS A;  2LCB A;  3RNX A;  212L A;  1GBZ A;  1L30 A;  3LYO A;  1NHE A;  139L A;  3C80 A;  1LYD A;  1G07 A;  4BAF A;  2D4I A;  1G7L C;  3B6L A;  3LYT A;  4M4O A;  4GBR B;  4WMG A;  4EPF A;  2D6B A;  155L A;  2LYO A;  4S0W A;  1L94 A;  235L A;  1L60 A;  3P64 A;  4LYT A;  3E3D A;  5KXL A;  3DKE X;  1C6I A;  1CV3 A;  1LHM A;  4EKQ A;  1C6H A;  2X0A A;  130L A;  2RAY X;  4RLN A;  1YKZ X;  4DAJ A;  1L15 A;  1LPY A;  252L A;  2OEA X;  1QTH A;  1AT6 A;  1BB4 A;  1IC4 Y;  1JTO L;  3P66 A;  104L A;  4H94 A;  3K3T A;  2F30 A;  1JKA A;  2EPE A;  1C64 A;  3A3R X;  2Z18 A;  3SN6 R;  1RE2 A;  6LYZ A;  1HEP A;  176L A;  1IWZ A;  4H92 A;  4LGK A;  4BAP A;  3GUK A;  5I4W A;  1C6C A;  1B0D A;  2RBP A;  4TWS A;  2FYC A;  1REX A;  1L68 A;  1LHL A;  2XTH A;  4RW1 A;  1LWK A;  1XGR C;  3G3W A;  4LYC A;  4NGI A;  1LOZ A;  1FKV A;  1L37 A;  4ZFP A;  2YVB A;  3J4G A;  1C6J A;  1RI8 B;  5LVI A;  1QUH A;  1LZT A; 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